GgaINT0079293 @ galGal4
Intron Retention
Gene
ENSGALG00000016289 | DST
Description
dystonin [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:1090]
Coordinates
chr3:86420003-86430843:+
Coord C1 exon
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Length
10607 bp
Sequences
Splice sites
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Seq C2 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSGALG00000016289:ENSGALT00000026264:36
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.094 A=NA C2=0.601
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
PF0068115=Plectin=PD(9.5=16.7)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]