HsaINT1012038 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000077380 | DYNC1I2
Description
dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:2964]
Coordinates
chr2:171729709-171744189:+
Coord C1 exon
chr2:171729709-171729853
Coord A exon
chr2:171729854-171744048
Coord C2 exon
chr2:171744049-171744189
Length
14195 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTATCT
5' ss Score
7.56
3' ss Seq
AATCAACTTTTCTCTTTCAGAAT
3' ss Score
10.53
Exon sequences
Seq C1 exon
CAAAGCTGGAATCAGTGAGATGTTTGAGGGGCATCAAGGACCAATCACTGGCATCCATTGTCATGCAGCTGTTGGAGCAGTAGACTTCTCACATCTTTTTGTCACTTCATCGTTTGACTGGACAGTAAAGCTTTGGACAACTAAG
Seq A exon
GTATCTAAAATATAGATGTCTGCTATTTGCTCAGGTTTCTGACACAAGGTGGTGATCTAATACTACATAGGAATGATGAAAACCTTTTAAATCATAATTGTTTGCTAATAGATGAAGCCTGCTAGGAAGTTACACAGAGCATGAGTGAACTACTAGATGTTGTAATTTTTATAAAAATATGCTAACAAGTATGGTAACCCTACGCAGAATCAAGGACCAGTCTTCCCACCACTTCAGTCTTTTCGAGCATGTAACTGTTTACCCTGAACTGCACTGGGAAAAAAGCCCTGAGTATCTCGCATAGCACCTCATACAGTTGTCATTCAGCTCAGCACAAAAGCTATGCATTTGCTCTTTGGAGAGTTTTTAACAGGTTATTCATAACTACAGTGGCTCACAGAGTTGATGGGAAATAGGGAAAAGAGAGAGAGAAACTGATTTACAATAAGTCCTGTATAATATGGCTATATGTAGTAAACTGGAATCCTTAGGAAAGCATTGTGTAAAAGCATGGATGCATATATTTTTTGTTATTCTATGATAAGCAGTTTAAATCATTTATTTTGGTTTTAATAAACTTCAGTATTTTAAAAACCCATTCATGTGATAAAATGATTCTTGATCCTCCAGCAATTCCAGATAAATGTGACATTGTCTTGACCTGTTGAAAGTCTCAAGACAAATCCAAGTAGGCAACATTACCTCCTGTGATAGACTTGTAATTTCATTTAATCTCATTTTATAATTAAAGTGCCTTAACTTTGCTGTCTAGTTTTTCTGCGGTATTAACATTATTGCTGAGAAAATGCATACCCAGCATCTGATTCTATTTAAATTAAATTCTAAGGTGTTTTTTTTTCTGTTTCTATCTGCCTTATCCTAAATATTGACTTTTTAAATAATTCATCATGAGACAAAGTTTAGAGATCTTTGGTTCTTCAGTTTCTGTAAGAAAACCTAATGTAAGAGATGTTCTTCACTATTTTAGTGAACTCCTAGTTATTTATCAAGTGTTGGCCTTAGAAGTCTGGGATGAACTCATTATTCATTCTTGTCCTTTCTTGATGCCTCCTTTCTGTCTGATAATGAAACAGGTTAGAAAACTTTGCCTCTAAAAGCTTGCCTTTTAAAATTGAGCATTTTCAGGTTTGTCATTAGCAGATATAAAAATAGTGTTTACCTGAACTCTAATAAAGGAAACAGATGCTTAACACAGTGTCCAGCAAATAATAGGCACTTACCAATGTTTAGTTTCTCTTTTACCTCTTAATGGGGATCGGACAGAGCCTGAATACATTTAATAAGTCATCTCTTTCCTTTCTTGGATTGTTCTTGAATTTTTATTCTTCTAGTGAAATTTATACAGTGGGAAAAGGTAGAAGAAGATTCTCAAAGCTCACAAGCAAAGAAATGCGTAATCTAGCTAGCACAGGCTGAGCATCCCTAATCTGTAATGCTCCAGAATTCAAAACTCTTTGAGCGCAGGCATGACACTCAAAGGAAACATTCATTGGAGCATGGATTTTTGGATTAGAGATGTATAACCATAAGTATAACACAAATACAGCAGGTCATCAAATAGTGTGTTTTGTCATAAAATTGACAAGAAAAAACATTGGCCGGGCTCAGTGGCTCACTCCTGTAATCCCAGTGCTTTAGGAGGCCGAGGCAGAAGGATTACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGTTTGGGTAACACAAGGAGACCCCATGTTTACAAAAAATTTAAAAATTAGCCATGCATGGTGGTGCGCACCTGTGGTCCTAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGCTCAACTGGCATGTCTAAATTGTCCCAGTCTGAATGAGTGTGGGTGTGTCTGAGTGTGCCCTGCGATAGAATAGCATCCTGTCCATGGTGGGTTCTTGTCTTGTGCTCTGACCAGCTGTGACCTTGAACTGGGAAAAGCAAGTTGGAAAATGAATGAATGAATACAAATTGTCGTAAAATAAAAATTTGTAAGATACATAGTAATCATACAAAGGCAAGACAGTTAAAGGATGCAGTATGAAACCGCTCAGTGAGCCTTCCGTCTTTGTCATTGTTTTAGAACTGCCTGGTGATAGGGTGTGCTCCTTACAATTTTCACTTTGCAAAACATTTATTCCTTGATTTAACCCACCACCTCTTCACCAAAAATTGGGTTAATAATTATCTTGTTTTTATGATTCTTTCTCAAATGTGACCGGGCAGGGTGGCTTACGCCTGTAATCTCAGCGCTTTGGGAGTCCAAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCCAGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCACTGAAAATACAAAAATGAGCTGGGCATGGTAGCGGGCACCTGTATTCCTAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCAGCAGGAGGTTGCAGCAAGCCGAGATTGTGCCATTGCACTACAGCCTGGGTGACGAGCAAAACTCCACCTGAAAAAGTAATGATAATCTTTCTAAATTGTATGTATAGCTCACATTTTATTTCAGTGCTTAATATTTGAAGTGTTTAGGGTCATTATTTAGAAATTTGATGATGTTTTTATCACCAGATAAATGCCACAGGGATTTAACTCTTGTTTGTATCAATTAGCCTGTGGTAAAACTGGTTTTGTTTTATGTTGTTTTGCTTAACGTCACAGTTTCCAAGAACCTATAAATGATGTTAAGTGAGGACTTACTGTATTCTAAAATCTGAAAAAGTCCAAAATCTCAAATGCTTCTGGTTCCAAGTATTTCAGATAAACCTATAAAACCAAAGCAAGATGCAGAATTGGTGAGATGAAGCCAACTATTTCTCCAAAGGCTTCATACAGCCATGTAAGTTGCTAGATTTTTAGATGTGCTTTCATCTTAGTAATCCCATGTATAGTCACAGGAGACACATTTTTGTTAGATTGTTGGCCAACTTCCTTTTCGGTAATTGAAAGTAATCTTTTTTTTAAAACTTTTATTTTACATTCGAAGGTACAGGTAAAGGATGTGTGGGTTTGTTATGCAGATTATTGTATCACCCAGGTATTAAGCCTACTATCCATTAGTTATTTTTCCTGAGCCTCTCCCTCCTCCCACGCTCACCCTTCGATAGGCCCCAGTATGAGTTGTTCTCCTCTATGTGTCTACATGTATGTTCATTGTTTAGCTCCCATTTATAAGTGAGAACATGTGGTATTTGGTTTTCTGTTCCTGCATTGGTTTGCTAAGGATAATGGCCTCCAGCTTCATCAGTGTCCCCACATAGGACATGATCTCATTCCTTCTTATGGCTTCGTAGTATTCTGTGGTGTATATGTACCACATTTTCTTTATCCCATCTACCATTAATTGGCATTTAGGCTGATTCCATGTCTTTGCTAGTGTCTTTATAATAGAGTGATTGATACTCCTTTGGGTATATACCCAGTAATGGGATTGCCTGGTCAAAAGGTATGTCTGTCTCTGGGTCTTTGAGGAATCACCACACTGTCTTCCATAATGGTTGATACTCCCACCAACAGTGTAAAAACGTTCCTTTTTCTCCACAACCTTGCCAGCATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTTTTAATAATAGTCATTCTGACTGGTGTGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATGATCAGTGATATATGTCTTCTTTTGAGAAATGTTTGTTCATGTCCTTTGCCCTCTTTCTAATGGGGTTGTTTTCTTGTAAATTTAAGTTCCTTATAGATGCCGGATATTAGATCTTCGTCAGATTCATAGATTGTAGAATTTTTCTCCCTTTCTGTAAGTTGTCTGTTTACTCAATAGTTTTTTTTGTTTTTTAGGGGTTTTTTTGTTTTTGTTTTTTGCTGTGTAGAAGCTCTTTAATTGGATCCCATTCGTCAAATTTTGCTTTTGTTGCAATTGCTTTGGGCCTCTTCATCATGAAATTTTTGCCCATGGCTATGTACTGAATGGTATTGTCTAGGTTTTCTTCTAAGTTTTTTGTAGTTTGGGGTTTTACATTTAAGTCTTTAATCCATCTTGAGTTAATTTTTGTATAAGATGTAAGGAAGGGGTCTAGTTTCAGTTTTCTACATATGGCTAGCCAGTTCTCCCAGCACCATTGTTAAACAGGGAATCTATTCCCCATTGCTTGTTTTTTTGTCAGGTTTGTCAAAGATGATGATTGTAGGTGTGCGGTCTTATTTCTGGGTTCCCTATTCTGTTCCCAGTCTGTGTGTGAAAGAATCTTTTATCTATTTCTAGTTTGTTTTTTACTCTCTCAGGGTGTCAGTTTGCCAGCATCCTTTGGCTTTAAATTTGAGGCTTCCATCCTTATATACGTTAATAATAGGATTTGAAAATAAAGAGTTCATCTTGACTAATCAAGGACAGAACTTATCTTGTGATAGCAGACTGATTGATACTTGCTTTTGTGGTACTACACAGCTAGTTGAGGGGCGGTTGATATTTTTATTCTTGTATTTTAATGTGTTTCAACATAGAAGTGCCTTCTGAATAAGAATGACAAGTGGGCATATCTCTTTCTTTGCCAATTAGGCTAGGCATTGCTTCCTTCCTTGGGCCTTATATAGAAGACTCATTTATTCATTCAATTGGGATACATGCCTCTCACCCTGCCCCCAACATCCCTCCAGTGTTACTGTACAAAGGATGGGCCACCATAGAACATGGTGTTTTTATAAATGCCTAAGGACCCTCTGAAACTTTATCAGAAGAATTACCCTTCATTCTAACTTTTCTGCACACAAGTAGTTCTACTCTGTGAAGGGTAGAGAAGAAACAGTCTGTTAAGTGAATACTTTTATATTTGGCCATACTGTGGCTCCAGTGTCAATTTACACTTCCTGGTTAATTGTGTTGCTGGTATTTATTTCTGCCCTGCTGAAAAACTGATAGAGCCTCTATGCTGTAATAATGACTGATGGGCAATGTTAATTAATAATGAATGGTAAAGAATAATAGGCAGTGTTTTTAAATAATCTCTCTTTAAACACCTTGTTCCAATTTCATTTTAAACTTTTAAACCAGAGTCTTCACACTCATGAATTTAACAGACTTTAAATGTTTTGCTTCTCTTCCTCTACTTTTTAAGTGCTCTTTGACTCCAGGAATTGAGTCCTCATAAATTGGAAGACTGAATCGTGAGATATTGCTGTACTTTTGTGTCCTTAAGATCTGGCTCTGCCCTGATAGCAAAACAAGATTTCTTCCTTTTCTCTCTTTCTATGATAAAAATCCCTGGGAATCTCAATTTGGCACAGCCTCAAATTTAGTTTAAAGCAATCTACTTCTACAGCTAGCCACTAATCTTCGCCTAGCCAGAGATTTATAATTCAGTCACATAGTTCTGGTTCATTGACTTGTTTTCATTACTTTATTGAACTCAACTATTTTTAAGACAGGCTGAGCACCCTAATCTGAAAATTCAAAGTCTGAAATGCTCCAGAATTCAAAACTTTTTGACCACTAATGTGACACTCAAAGGAAATGTTCATTGAAGCATTTCACATTTCATATTAGGAACGCTCAACCATAAGTATAATGCAGGTATTCAAAAATCCAAAAATATTTGAAATCTGAAACACTTCTGGTTCCAAGCATTTCTGATAAGGGATATTCAACCTGTATAGAAGACAAACAGATTATTTTCCGTGTATGGAAGTTTAAACCAGTAAAGACAGGGCTTCTAATATATTTAAAAGACTCTGTTGCCATCTCAAAATACCAAATTTTAAATTCACAACCGAAGCACTTTGGCAGGTCTGAAAAATGGCTGGGAGAATAAGGAGTGAAAGCTTCTGCAGGGTAACAAGGATTCTAGAAGAGTTTGATTATGGGTAGACCTGGTAGATTCACTAAATGTTCTACCACATTTAACCATACTTGTTACAGATTACTGTTAAAACATAAGAATTATTTACTTGGGACAAGATGGATTTTGAGATGTGTGCACAAATTCTTATCAGAACCATATTTACCATAAAATGACGAAGTTAAGATTGTTAATGTGGTAATTTCTTGGAAGGGGGAGTTTTCACACTTTTGTAGTCCATACACATCTTGAAATTATTCACACTTTCTGATAAGTCTTAGAACCCCTCCTTATATTAATAGCTTACTTAGTTAACTCTCAGAGGGCACCAGCATTAAAACAGGGTTAAAAGTTCATACTAGTCCTTAGAATAACAACTATGCATATTTAGACAAGTTAAGATGAAAAAATGCTTTGAAGTTGGGTGTTCTTAGGGAAGGCTGCCTATTCATCTGGACCGAGGCCTGCGCAGCAGCATTTGCCTCAGTAACTTGCTACTGGCCAATGTCCAGCCTCTCCTTTGCATATTCAGAAACTCAGTTTAATCAGTATACTAGAGTTGATTAGACAGGGAGTGCTAACCGGAACTAACAGGCTCCTAAGACACTGGTACATTGGAGAATGTCAATTTATTAATTTACAATGAAAAACATAACTGCCAGAAGGCCCAGATACTCCTGTGAGCCTGACCAGCTCATTGTTTCCCTGTAGACAATCCACATGGGAAGCCAAATTATAATCAGAAGATTGCTTGGTGAGTAAGGAGTTGGAACAAAAGAAGTTTTATAATTTGAATGTTTAATGGCACCAAGCTAAGATAGCCTGATTCATTCTAGCCTTGCCATGGGGTAGTAATTCTCAAAATCCATTGGTTGAGACTCCCTTTCTCCTGGACGATGCTTGAATGGGTACTGTCTTCATTTTCCTTGTAAGACTGTTTCTTTGTATTTCTATTTTAATAGACACATTTGGTCTCAAAAAGTTAATATATTCAGTCAAGTTATATAGAAAGATATTTCTGACCTTGGAATCCATTTCTTTGGAAGAGAATTCATTTATTTCTCTTCTGATCCAAATTGATGACATATTTATTTCCCAGTTCTCTAGGAAGCATCTCACTATTATCTTCACGTGTTTAATGTAGGGACTATCTTTGTTATTAATCTAGAACTCCCCGCTTACCCCAGCTTTGAAAAATAATCTATATTCTTTTCCCAAAGCTGCCATAACAAATTACCACAAACTGGGTGGCTTAAAATGACAGAAATTTATTCTTTCACATTTCTGGAGGCCAGAAGTCCAAAATCAAGGTGTTGACAGGCTAGTTACTTTTGGAGGTTCTGAAGGAGAATCTGTTTCTTGTCTCTCTCCCGGCTTCTGATGGTTGCCAGCAATCCTTGCTGTTTCATTGACTTGCAGCTACCATCATTCCAGCCTCTGCCTCTGTCATCAGATGGCATTCTACCTGTTTGTGTCCGAATTTTTCTCTTTTTTTAAGGATACCAATCATGCTAGATTTAGGACCTACCCTAATTCAATATGACCTCATCTTAACTTGATTACATCTGCAAAGGCCCTGTTTCCAAATAAGGTCACATTTACAGATACCAGGTAGACACGAATTTTGGGAAGACACTATTCAACTCAGCGTACAACCTTAAAGAGCTTAGGAAAAATATGGCTTGACTCGTGACCATACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGCGCAGTGGGGTGATCTCGGTTCATTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCGATTATCATGCCCCAGCCTCCCAAACAGCTGGGATTATAGGCATGTGCCACCATGCCCAATTAATTTTTGCATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGCTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCTGCCTGCCTCGGGCTCCCAAAGTGGTTGGGTTATAGTGTGAGCCACCACACCCAGCCTTGTTTTTCTTTTTATTGTAATCTTTTACCCAGTTACAGTGCATCCTGTTTTTGTCTCTGGCTGCATATTCGTCCACTGAGTAGATGATTTTTTTTTTTTAACTTTTAGGTTCAGGGGTACGTTTGCAGGTTTGTTATATAGGTAAAATCATGTCACGGGGGTTTGTTGTACAGATTATTCCATCACCCAGGTGCTCAGCCTAGTAACCATTTCCTGATACATTTAGCAATCTTTTATATTATAAATACAAGTAAGTTTTAATCTAGTTTGCATGTAGCTTTTTTCATATTTTGTATCATATAAAAATGGAATCATAGAGTAGAAAATACTCAGCCAGGCGCAGTAGCTAACGACTGTAATTCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGATCATCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCTTGGCCAACGTGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCACACACCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCCAGAACCCGAGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCATTGCACTCCAGCCTGGGAGACAAGAACGAAACTCCAGCTCAAAAGAAAAAAAAAAGAAAAAAAGATACTCATTTGTGTCTGGCTTCTTTTGCTCAACATTATGTTTGTGAGATTGATTCATATTTGTTAGTGTAGTTGTAGATTATTCATTCTCTCTGCTGTATACTATTCCATTATGTAAATATACCATAATTTATCCATTCTACTGCTGATGGTATTTGCATTAATTCCAGTTGAGGGCCATTACAAATAGTGTTGTGAGCATAATTGTAGATGTCTTTTGATGGCCATAAGCACTCATTTCTTTTGGGTATATACCTAGAGTGGAATTACTTGGTCTTTGATGGAAGACATAACATTGCCTAAAAATAAGCTGTTTTTGAAGAAGTACACTATCACCTCAGGAGTCAGAGGCCTTAGCACAGTGGTTCTTAATCATTGGTGTGCATCAGAATCACTAGTGGAGCAACAGCAGAGATACCGATGAAGTGCATCTGGAGTTGAGCCCTGCATTTGTATTTTTCAAAAGCTCTGCAGATGATTGTGCACATCCTAGGTTGAAAACCACCTTCTCGGCCAGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGATCACCGGAGGTCAGGAGTTCGAGGCCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCATGTGTGGTGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCTCCTCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCACACCATTGCACTCTAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAACCACCTTCTCAGAGTGAGACTTCATTTGGTGGTGTTATCAGGGAGAGTGACAGATAGTGATTGTAAAAGAAAAAGGCTTTTAATTTTTGTGTTTACCTTAGTTTTAAGTTTTATTAAAATTTTGGTTTTTAAATTAAAAACAAACATTTTGGCTATTAAAATGATCATGCTGTTGACATTTACTATCATATCTGAAAATTTTTAATTCACAATTTTAAAACATTTTATTATGGAAAATCTCAGATACAAAAGCAGAGGGAATAATATAATGAAGCCATTATTGTTCCCAGCTTCCATAGTTAACACATGACCAATCTTGTCTATACATAACCTCTGCAATATTAAAATCAAGCCTATACATACCATTTCAACTATAAATATTCATTATGTATTTCTAAAAAATAAAACCTCTTTAAAAAATACTACCATATCATTATTAAATGCCCCAAAATGAACATTGGCTCCTTATTTTCGTCAAATGGCCTATCAGTGTTCAATTTTTTTTTTCTTTTTACTATTTATTTGAAGCAGGATCCAAAGGAGGGCCATCCATTTGCGATTGACATATCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACCGAATCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGTCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTTATGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATCACAGGCGCCCGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTATATTTTTTGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCGCCTGCCTCAGCCCTCCTCGGCTTTCCAAAGTCCTGGGATTTTGAGCCACCAAGCCCAGCCACAATTGACATACCTTTTAAGTTCCTCTTTAAAGTAGGGCTTGCATCCCTCTTTTTTTTCTTGCTGTTTTATTCTTGAGGAAGAAACCAGGTTGGTGTCTGTCAAGTTGGTCCTGTAGGGTTTCTCAGTCTCGATTTTGCATTCCTGTGGTGTCATTCATATTAATGTGTGTGGTTGCAGATAGTTTATGTTTCTGTAATGAGACGTTTACCCTCATAAATGATTTGGTTATCCACCAGACCTTACGTTAACGTCTCTTCAGTCTTTTTGGTCATCTGAAGCTCATTCTATAGTACGTGATGCAGAAGGTGCCCACAGGTGCATTATTCCCATATTCCACAAAAGTACATGATTATGAAGATTAGTTTGATTGTTTATAAAATCCATGACTTACGTTTTCTTTCTTTGCATACCTTAGTTACTCTGTGGACTTCTGGAAAAAAGCATTGCTGTCACAAAATCTGATCACAATCTGATTTTCTTTTTCCTACTTGCGATTTGGTCTTTTTAAAAAATGTGGGTGATCAAATGATTTTTTCCCTTTTCTTTAGAGGGTCAGTGTTCCTAGATACACAGGATATCCTTTCAATATGTAGTTTCAAGCTGTCTTTCATTTTAGGAGAGTTCTTTTGAGTTGTTTTTGGTATTTGTTCTGTATTACTGCTTTGGTTTTCTTCTTCAGGACCTGCCATTGTAGATGTACTTTTGCTGATCTTCTTTATCACTTTTTTTTTTAGATCACCTTATCTCTTCTTTTAAAATAAGTTTCTTTTTAAGTAACAGTTTTATTGAGCAAAACCCTTATACCATGAAATTCACCCTTTTAAAGTATACAATTCAGTGGTTCTTAGTATATTCACAGAGGCACGCCTAATTGCCAGTATCTAATTTTAGAACATTTTCAAATTTTAGAAAGAAAAATTATGCCCATTAGCAGTCACTCCACATTCTCCCCTACCCCCACAGCTCCTGGAAACCACTAATCAATCTACTTTCTATCTCTTTGGGTCTGCCTGTTATGGACAGTTCATGGACATTTCATGGAATCTTGCAATTGTGTACTGGCTTCTCTCACTTTGCATAATGTTTTCAAGGGTCATCCTTCATATTGATACTTCTTGTATCAATGTATTGTTCCTTTTATAGCTGAATGATACCCCATTGTATAGATATACCACTTTTTGTTTATACATTCATCAGATGAACACTTCAGTTGCTTCTGCTTTTTGGCTATTATGAATCATGCTGCTGTGAATGTGCAAGTTTTTATTTCTCTCGGGTATATACCTAGGAGTGGGATTGTTGGGTCACATGGTAACTAATTAGCATTTTGAGGAGCTGCCAAACTGTTTTTCAAGTGGCAGCACCATTTTACATTCCCCAGCAAGGTATGAAGGTTCTGATTTCCTGTATCTTCACCAACATTTGTTACTTTTTTATACTAGCTATCCTAGTGGTATGAAGTGATACCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTCCTCTCACGACTAATGATGTTGAACATCTTTTCATGTACTTATAGGCTATTGTAAGCACTGTGGACACAGTGATGTATCAGATACATGGTTTGCAAATATTTTCTCCCATTGTGTAGGTTCTCTTTTCACTTTCTTGATATCATTTGAAGCCCAAAAGTATTTAATTTTGATGTAGCTCAGTTTACCTACTTTTTCTTTTATCATTGTGCTTTTGGCTTCTCAACTGAGAAATCATTGCTGAGTTCAAGGTCACAAAGATTTACTTGTATGCTTCCTTTAAGAGTTTCATAGTTTTGGCCAGGCACGGTGGCTCACGCTTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGATCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCTTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGAGCATGGTGGTGCACGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCATGAACCCAGTGAGCTGAGATCATGCCACTGCACTCCAACCTGGGCGACAGAGCGAGACGCGGTCTCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTCATAGTTTTACTTTCCATTTAGATCTGTGATACATTTAATTTTTCTATATGATGTAAGGAAGGAGGGATCCAACTTTATTTTTTTTATTTTTTTATTTTTTGAGACAAGGTCTCACTCCCATCGCCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATTTCAGCTCACTGCAGCCTCGACATCCTGGGCTCAAACCATCCACCCATCTCAGCCCCCAGGGTGGCTGAGACTATAGGTGCATGCCACCATGCTCAGCTAATTTTTGTATTTTTTGTGGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCTCATGTGATCCACCCACCTTGGCTTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATGGCACCTGGGCCAGCTTTATTCTTTTGCATATGTATATCTAGTTTTCCCAGCACCATTTCTTGAAAAGACTATTCCTTTCCTATCTAATTTTCTTGACACCACAATAACTTTTATGGAATCTGACTGAGATCCTTTTCTTTGCTATTGTCTACTAGTGAAATGAATTTTTGTGTATTTTTAGGAGGGAGGGAATGGGCAAGGATAACTTTCCTAGTTCATTTTCTAGGTTAAAGCTGTCTCTTCTCTGGCTTTTGCAAAGTGAGAATACATGTACCTTGTGCTTTCTGAGATGTGCCTTTTCTGCTTCTCTCCACCACTTCTGTCTGAACTTACTGCTTTGTCTCTTTTGTCTGGCATTCTACAACTTGGATTCTACTCCCAGCAGTTTCTCTTCTGTGAGACTTTGTCTTGGAAAGGAACTTTGATTTGTTAATTTTGAGAGTTTATAGCACCCAGACTGTACCATGAGAACTTACTTATACTGCACTGTAGTCTGCTTGCATTTACAGTTGACCCTTGAATAATGCAGGGCTTAGGGGTGCCAACGCCTATCCCAGCAGTTCAAAATCCACATATAACTTCTGACTTCCAAAAAACTTAACTACTAATAGCCTACTACTGACCAGAAACCTTTCTGACAACATAAATTGTTGATTAACACATATTTTTTATGTTATATGTATTATATACTGTCATCTTAAGGGCAAGCTAAAGAAATGAAGATGTTAAGAAAATCATAAAGAAGAGAAAATATATTTACTATGCATTAAGTGGATGTGGATCATCATAAAGGTCTTCATCCTTATCATCTTCACAGTTGAGTAGGCTGAGGAGGAAAAGAAAGAGGAAGGGTTGGTTGTGCTGTCCCAGGGGTGGCAGAGGCAGAAGAAAATATGAGTATAAGTGGATCTCTGCAGTTCAAACCTATATGGTTCAAGGGTCAAATGTATTTATAAATGGAATTGTGCCAAACTGCCCCCTAGTTTTTGCTGCTGTTCTCAGATTAGCCCACCACACTGTCCAGTGAGCATCTGCTATGACTGTGAGGTTCTGTTCTCCACCTGTCAGAAGTTCTCGTGCCTTCCTTCATCTTCTTCCCACACAGATACTGATACCATGCAAGTCTTGTAGTTGTGAGAGGTTTGTTTCCACCTGATTTTATTTGGAAGTTTGTCTCCTGATTCTGCTGTAGATGCTGTCTGTGAATCTTTGCTCTTCCTGCCCTCATTGCTTTATCTGAGTTTATGGGGAGAACTAGAGGAGATTTAAAAAGTACACTGCTATTGCTGTTATCTTCCCAGAATCTTCTCATTGACAGATGTTCTTGAAGCATGTTCTATTTCTTTTTTTAAACAGTATGGCATCTACAAGTTAAAAAGAAAATGCAATCAATAGTTGATTCTTAGTTTACAATACCAGGTAATTCTGTAGTGAAACAAATTGTAGGAACTTTTTCTAGGCTGAGTTAAATATCATAAAATGTTATCATACCTGTTGAATGTATGTCATTTTTTTCCCAGTGATAAGTAGTTTAATGATTTGTATGTCATATATGGACTGTGCTAAGAATCAACTTTTCTCTTTCAG
Seq C2 exon
AATAACAAGCCTTTGTATTCATTTGAAGATAATGCAGACTATGTTTATGATGTTATGTGGTCACCTACCCACCCAGCCCTGTTTGCCTGTGTGGATGGCATGGGGAGATTGGATTTGTGGAATCTCAATAATGACACAGAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000077380:ENST00000397119:15
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0040027=WD40=WD(100=85.7)
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains