HsaINT1047716 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000167232 | ZNF91
Description
zinc finger protein 91 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:13166]
Coordinates
chr19:23357696-23373837:-
Coord C1 exon
chr19:23373742-23373837
Coord A exon
chr19:23362726-23373741
Coord C2 exon
chr19:23357696-23362725
Length
11016 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAGGT
5' ss Score
10.28
3' ss Seq
TTTTAGTTTTTTTTTTTCAGGTA
3' ss Score
10.29
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Seq C2 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000167232:ENST00000300619:3
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.205 A=NA C2=0.031
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0135222=KRAB=PD(0.1=0.0)
A:
NA
C2:
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Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Cow
(bosTau6)
No conservation detected
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains