MmuINT0010603 @ mm9
Intron Retention
Gene
ENSMUSG00000026834 | Acvr1c
Description
activin A receptor, type IC [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:2661081]
Coordinates
chr2:58148337-58168434:-
Coord C1 exon
chr2:58168204-58168434
Coord A exon
chr2:58148577-58168203
Coord C2 exon
chr2:58148337-58148576
Length
19627 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAAGA
5' ss Score
10.77
3' ss Seq
TCTTTCCTTTTAAACGGCAGCAT
3' ss Score
4.89
Exon sequences
Seq C1 exon
GACTGAAGTGTGTGTGTCTTTTGTGTGATTCTTCAAACTTCACCTGCCAAACGGAAGGAGCATGTTGGGCCTCCGTCATGCTAACCAACGGGAAAGAGCAGGTGATCAAATCGTGTGTGTCCCTCCCGGAACTAAATGCTCAGGTCTTCTGTCACAGTTCCAACAACGTGACCAAAACCGAATGTTGCTTCACAGACTTCTGCAACAATATCACACTGCACCTTCCCACAG
Seq A exon
GTAAGACAGTTGCTTAACCACACTCTTTCCTAATCACATTTCAGTTTGGCTTTGGAAGATGATAGCATGGCAGAAAACAAACTGTCTAATGTTTCCTAAGATAAAAAATGTGTGTTTTGCAGCTCTTCTCGTTTTCAGCTGGTGGAATTCTCTAGAGTCTAGCTTAGGTTGATTTTTTTTTTTAAAACAATTTATTTTTAAAATTGCACATCACTTGTCAAAATGGTGACAACAGTGTCATAATCTTGGGGAAATTTGACCAAATGAGTTATGGTTTCTTGACATAATTAATGGACCTAAACTAAAATCTAAGTTTCTGTGAATTCTTTTTATCAAAGAAAGAAAAAGAAACTATCTAACCTACAGTGATAGAAGACCATTGGCATACCCCAGTAGAAGGGAAGGAACCGGGAGAGTGGTTAGAATGACAGCCGTGTCATGGTCATATACCACTTAGGCTTCATCCAACTGCACTTCTAGAGCATGCAGGCTTTATTATGTTAAAAAATCACCCCTCACGAACACTGCAATGTGAAAAAAATGAAAGACTAGTTCCTGACTGAGAAGCCTAACAAGGTATATTCTATCCACCCAAGACCCTTTGATTGACCAAGTGCATGGCAACATCTTGTCCTGGAAGAGATGTTGTTAGGGTCCTGTCCTGTCCTCATGCTTACTGACCAACCTTGGCCTTAGGATAGGCTACTGCTATAGCCAATGGACTTCCCTCTTCAGACCCTGTACCTTTTGGATCTTGTCACTGATAAGACCATCAGTAAATATAAAGTCTCACTTTAGGATGCCTCTGGATCTCAGGTAAACTAAGGAAGGGCATGTCCATAACCATTCAGATCATCACCAAGTCCAGGAAAGCTATGTATAAGACAGGGAGAGGAAATACCATCTAAACCCACACTATGGGGCTTTAGCACATGACATGGGCCAACTATAACTTACCAGGTTGAATGATGTGAAGTTATACTTGGAATAGTGTTCCCTAAAGCATGAAATAGGTACCATAGTAGTACTTTTGAGAATTTTTAGCTAACTATTAAAGTGGTAACCATGATATTGAAGTTCATCTGTGCGCAAATAGGTATGCACTGAAATACCACAATGAACTTTGTTAGTGTGTACAACTCATTTATGTTGATCCAAAACACTTAAAAAACAAACTATATTGAATAATATTGAATTATATAATTGGTTTTTCTAATTCATTTAGTTACTTTTTATCAAGAAGTCTTGTTTGTTTCTTTGTTTAGTTTGTCTTTCAAGAAAGGGTTTCTCTGTGTAACCTGGCGGTCCTGGAACTCAAAGATTTGCCTGCCTCTGCCTCCTGAGTGTTAGGACTAAAGGGATGCACTGCTACTGACTGGCTCTTTTTAGTTTTTACATTAAACATTATGTTCAGTTTCAATTTGTGTAAAATGACACAGCACATAATAGTGAGGGAAAAGTATAATTTAATTTATTTTTTCCCATGTGGTAAAAAGTTGATTCAACAACCAGCACAGGTTGTTAAAAGCTCTGGCCTTTGGGTTGGAGAGATGGCTCATGGGTTAAGAGAATTGGCTGTTCTTCCTGAAGACCCTGATTTGTTTCCTAGCATCGACAGAGCAACCTATATATCCCTCTATAACTCTATTTCAAAAGGCTCTTCTGACTTTTCTGTCTCCTGTGAGCATTGTACATACTTAGTGAACACATGAAAGTAAACATCTCTATTTATAACAATGTTTTTAAAATCTCTATCCTTTCTGTATAGAGTTTTTTGATATTTAAGTTGAAAATAAGGTAGATTCATGTGTATATGTGTATATATGAATATATATTTAAGTGGGCACATTTATGGATGCTTTGTGCTATGTAGTTGCTATGTGGCATAGGCTACAACTGAACTGTCTTAATTATTACAGGTTTTTAATGAATATTGAAATTGGGATGTATGACTCTTCTAACTTGTTTTAAAAAACTTATTTGAGTATTATACATAATTTTCATTGAGTCAGTTTGATTATTTCTACAAAACACATACTGAGATTTTGATTAATTCGGTTGAATGGATAGAAAAATGTGGAGAAAATAGTCATGCTAACAATGTTGATCTATGAACATAGTATGTTTTCCCATTGATCTTGTTCTCCAGTTACTCTTAGTCATGCTTCATAGTTGTCAGGGAATATATCTTAGGAATATTTCATCAAGTTTACTAAACTCTTCAATGTGATTGTGAATGTCATTAAAAAAATATTTACTCTCATACAATATATCCCCAGCGCAGCTCTGCCTCTCTCCATTCCTCTCAGCCCCCGCCCCCATTTTCTTTTCCTCCAAATCCATTCCCCTACTCCTGTCTGCCCCCAGAAAAGAGCAAGTCTTCCAGGGGCTTGCTGGAACTTGGTACAATAAGAGCAGGCACAAACATTCACATCAGGACTGGGTGAGGCAACCTAGTAGGTGGAAAAGGAGCCCAAGAGTAGGGGAAAGAGTCACAGACACCCTGAGTCTGACAGTCAGGAGTCTCCCTGAAGACCAAACCAACAACCATAACATACATGCAGAGGACCGAGCACAAACCTACGCAAGCTCTGCTGTAGCAGCTTCAGTCCCTGTGAGCCCCTGTGAGCCCCTATGAGCCCTGCTCAGTTGATTCTTAAGACTGAGGCTATGATCTCCCTGTGACCTCGACCCCTCTTGCTCCTACAATTCTTCCTCATCTTAAGTAGGGTTTCACTTAACCCTCAAGAGACTGGAGGCCTCAGGGAGTTTAAAGGCGGGGGGTGGGCTGGGGGTGGGGGTGCAGGGTAGGGACATCCTCCTGGAGACAGGGGGTGGGGAGGAGGTATGAGATGTGGAAAAGTTGAAGGGTAGACAGGGGGCGGGGGGAATAAAATCTGGAGTGTAAATAAATACATAAATAAATAAATACATAAATAAATAAATAAGTTAAAACAGAAAAAAACCCACCATTATGCTTACTACCAAAAAGAAAATAATAATAATAAAAAGGAGGGTGCCCAGACCTCCAAGGGGAGGGACTTGATGGAGACCTCCAAGCTAGACTCTCCCCTGATTAGTGTTTGTCTGTGGGTGTCCGCATTGCTCCTAACAGTTGCTGTGGGCATCTGCTCTGACGGTGACTGAACTACATGAGTCTATGAATACATCAGAACATTGGAATGATTTCATTGATTTTTTTTTAATGCCAGTCATATTTGGTTCTACTCTGGGATATCCTGGCTTCACTTCCTGATCACTGAGGCAGTATAGGACCTGGGCCTTCAGGTGTGGGTGTGTGGGACTCCAACTAGACCAGACATTGCTTGGCATGAATGGCATTTTAATATCTCAGTTTGTAAATGTTGATTTCTCCAATGTGAAAAAGTAAATTTTGTTAATTGATCTTACATCAGGATTGTGTAGACCGTGTATTAGTTCTAGTGTCCTATAGTCATTTTGAAATTCTACATTCTGACTTGTGTTCATTTAGTTTCTCTTTCTTGTGTTTTTACACAGCTGGGAACCAGTTAATTAATACTGTTAACATAATAATTGGATACAATTCTGTAAACCTCAGTATTTTGGAATCTGGAGACACAAAGATAGCCGTGCACCATTTTCATGTCATCAGAGAGTGTGGTCGGTAACCATGCTCTGCCTATTCCGGAGATGTCAGTTTCAAATGTGATCATGTACATATTGATCACGTACATAATGTTTTGGTTAACATTTGGAGGTTGTGGAAGAAAAGACTTGCTGTCTCCAAGGAAAGTGCTTTGCCCCTTTTTACTTTTTACTTTGTTTATATATTTGCTGGCGGTTCTGGCTTGAGATATAGCTTGTTCCTACTCACTTTGTAGCTCAAGCTGCTCTCAAATTCACGGCTATCTTTGTGTCTCCAGATTCCAAAATACTGAGGTTTACAGAATTGTGTCAAATTATTATGTTAACAGTATTAATGGAAAGATTTCTCTGTTATTTTTCATTTAGGTGAAACATTTTTTTAATTATTAAGTGTATATTCATTTTTGCCCAAGCATTTTCATGACTTTATTAAGATTACTCTATGACAATAGGTTGCCGTAATTGAGTTCTAAACATTATCCATAGAAGAGGAAATGTATGTTTTGTACCCATTAACTATTATGTCTACAAGAAATGCTGTGTACGTCATTGAATTCCAACCCCTTTATTGAAACTAAGGATTCGTACCATCTAGTGGCAGTTTATGGTAAATGGGGATTAAATTGAATAGGGCTACTTGTAGGACATGTAGAGTCTTTCTATGGTGCTGTTCTGGTCGGGATGGGAGTAAAGGGGTGGGGGAGGAGCTAAAAATGGCTATTAGCAATTCATGGGCCAGTAGCTATATGAAGAAAGGCTAAAAACTGTAAGCTAAACATCCGCACAACTGGTGCCAACAATTGCACCATTTTCATGTCATCAGAGAGTATGGTCGGTAACCATGCTTTGCCTATTCCGGAGATGTCAGTTTCAAATGTGATCATGTACATATTGAAATATAGAAAAGCACTCTGAAAAGCAGGGTGCTATCTCTGCAGTACTTGACAGCGAGATTCATGTCCATGGTCAGCTCTGCAGAAAGAGTCAGGAGCTGACCAGAAGCTGTTGTGTAGATGTGGAACCTCTCTTTAGGATTGTGAAAGGATCTTTGCCCCCATGCTTCCTACCTTTCATCCATCACCCTACAGGCCATTTGTGGATGGGTGATTTGATGAAGAACCAGGTGGCCCTCTTTTTTTTCCTCAGGTCTTGTTTGTAGTACCTGACCTCTTGGTTCCTTTCTTTGTGACAAAATTTCGACATTGAATAAAGCTTGTGCCTCCTCCACCCCATTTGCACACTGCTGTGGTCCTAGTAACACACAGCTGGAAACTGCTGGTGCTTACTTTCTTCCTTCTTCAAAATGCTTTTTAAATGTTTGATGCTAATTCCTAACAGCTTATAGGGGCTTTCATGAAGCTTCTATTGTGACACAGAAAGACACTCATTTTGTATAATTTGTTTCACCTCACATGGACATAGAACAAGATTTTTACAAAACAAATCTTTAAAATGTATAAGGTACTTCAATCATTGCTATTTCCTTAAAAAAAAAAAGTGCCCGTCGGCTCCCATGGATAGGCTTTTTCACAGCTTAAGAAACACCGCTTTTTAACTGATGTTAAAGGGTAGAATTTGTAAATGGAGCAAGGGCATTTATTATTTTAATTCATGAGTATAAAAAAAACTATTCAAAATGTTAGTTACTATTTTAACTTCACACATTTTTTCTTTTAAATGGCCTAAAATTGATTAGATTTCAGACAAATTAATTCACATCACTAAGACTGAAATTTAATTTAGATCATATTTAAATTGAATCATTTGCTCTTAAAATGTACCTTCTGGTTTAATTTTACACATGGGTATAATTTTCAGGAGTTAGCAGTTTTATTTGATAGAAATAAGCTTATATTTTGGTAGAAGTATAATACTAGGAAATTTTCTCTCTTTCTTGAAGTTTATTAAAACAGTTATTGTTGAGATGTTGTTGAAGAAAGAAATAATTTTCCAAGTTCAATATGAGCACAAATATAAGTGTTTTTTTTTTTTTAATTTGGAAAGCAACAACCATTTCACAAACTAACCTTTTTTTGGACTAGTACTTAAGTTCGTGCCTTTACAAACAGCAAACATGTCAAGCCCACAAAACAAATGTGGAATCATATGTTTAAAATTTTAATATAGATTATGCAAATTAATTAAGCAAGAGAAACTCATGTTTTCTAGAGCTTTCTCTGTCTAATCTCTTTTTCGTGTCTACTTTTAGAGCAGAAGGAAAAACCTGTATTACTCACTGCCTCTTCCTGGAGTTGTGCTTCTCATTTTGACCCTGTGCCCTTCCACCTAGTAGTCCTCCCTACAGATATGACAGTTACAGGCTGTTCATTCTCAGTTCCTCTGAAATACGGAGAGATGATATTTTGGCTAGAATATTTTACTTTCAGAAGTAAAAGAAGTAATCCTAGCCCTTCAAGAATATTTCTAGTTCAAAGGGAATATATTGATTTGCATATGTTAGTATGCACGGAGGCAAACATCTGTGTAGAGCAAACAAATAATAGGCAAACATTTTCTATACCTAGGGTATATTTGTCCCCACAATAACTTCTTTGAGTTCCATAGTCCATTCCCCTCATTTTTTCTCACATTCCTTTACGAATGTTACCACAAAAGCACAGCTCTCACCTCAAAGGGCATCACTGGTCCTTTGATTGATGAGGAATATTATCTAAAGCTTTTTTTTTTTAAATCTGTTTATCAGGATGTTCAGTTCGGCTTTATCTGCTAGCTCCCTGATGTTAGGTCTGCCACAGAGGGAAGCAAAGATTGGCTCTAAAGATATTTCAGAGTAAATTGACTTTAGACTCGGACCTGTGACTTCCAAACTTCTCTGTGTCATTGATATTGTAACGGGTCTGTCAGCTAGAGAAGCACAGCTCCCTTCCAGGAATTCTTCTCTACTCCGACTTGGTATAAACTGGACTTTATAAACTCCGCCCTCCTTCCACCCCCCACCCCCCCACTTTTGACATTTAACCACTTCAGCGTCTACAGCTTCTGTGGGCTGAAGTCTGCAGCTTTGGGGACTGCTGATTCATGCTTCCTGGCTTAATTCCTTGTTTGTGATTTTTGTATGTGCGTTTGTTTTGGCATCCTTAGCTGGAGAAATGGTAAAATCCTAGCTTAAATGAATTTCCTCAGAAAAGACTGAGATTAATTTTTGTCAAGTGTCTCAGGGTGCCGTCCACCCAAATCCGTTCCATGTTGTAATTAACTATTTTGGGTGAATATAGAGAGTGAGTTCTAAGCCTGCTTTTCCTTCCTTCCCTCCCCTACTCTTTCTCCTTCTCTTCTTCCTTCCACTTGTCTTTCTCTTCCCCTCCTCTTCCCTTCCCCTTCTTTTCCTCCCCTTTCCACTTCTTTTTCCCTTTCCCCTTCCCTGTCCATTCCTTCTCTTTCTGTTCTACTGAAAACAATGGTTGAGAGAGAAGACTATACTCTGTCATCCTCTGTTGAATATTTTTGTTTCCTTTGTTTTCAAGGCAGTGTCACCTGTAGCTGCCTGTTTCACCTAGGCATCTCAGGCCTGACTTTTCGTTGTTTCTGGACTATGTTTTTATCTCCTGTCTTTGTACAGTAAGCACTTGGCCACCACGACAGGGCAGACAATTCCAGGGTACATTGGCAGATCTTCCCATACTTTAAGCACGGTCTGGATTTTCACTGTAAGTTTGGCAGCTGAGCAATTCATCCCCCATCTTCCCCCCCTCCCCCACCTCCTGTCCCAACCATGAAACAGAAGAAAATCATTTCTATTTTACTTAGCATTTCAATGTATACAATACGAGAAAGCGTGCCCGTGGCCATCTAAAGAGGAGCTTGGCAAAGATGGAAAACTCTAGAATGACTTAGTTTTGAAAGGATACTGGCATAAATATCTATCCATCTGGAAGAAAACAGGGTTGTATCAAGTGTCACATCATATACAAAAATAAATTACAGCTTGATCAAATATCTAATTGTGACATACAGAACAATTTTAAATGTCAGAGGCAAATTTAGAAGAAAAGAGTGTATGACTTTATAGTATGGAAACTGTTCCTAAATAAGACAGGAAACTTAGATCTATAAAAGGAAAAGACAAATATAATTGAGTACATGAAAACTAAAATAAAGTGAATGAGAAAAGAACATAAATAATACTAAAAGATAAATATCGGGTAGAACTATTTGTAGTATATATGACTGAGAAAAAAGTGACATAGATTTATTTAGAAAATGCTTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCACACGCCTGTGTGCTCTGTGTGAGTGACTAAAGAAAGGAAGAGAGAAGGATTCTAAAGGGAAAATCCAGGAAAGAGCAAGGGATGTGACTAGAAAATTTACAATAGAGGTCGAGAAGTTCCAAAGCAATCAAGTACGGAGCTAGTGCTCAACCTCACTAATAGCTAAAGAGATGCTCATTAATGTGGCCATATACAATTTTCTACCCATGAGATTAGTCAAGATGTTTTCAACTAAGAGGCATCAGAAAATTAGATAATAACACCATAAGTGATAAAAAAGAGGTTCATTGAACATGATAATAAGAAATTGGGATGTAATAGAATCTGTGGTTTCTTTTTTTAAACTTTAAACAATTTTTTAGTATTTTCTTCAGTTACATTTAAAATGCTATCCCAAAGCCCCCTATACCCTCTCCCCCCCTGCTCCCCAACCTACCCACTCCTGCTTCCTGGCCCTGGCATTCCCCTGTACTGGGACATATAATCTTTGCAAGACCAAGGGCCTCTCCTCCCAATGATGGCCGACTAGGCCATCTTCTGCTACATATGCAGCTAGAGACACGAGCTCTGGGGATACTGGTTAGTTCATATTGTTGTTCCTCCTATAGGGCTACAGACCCCTTCAGCTCCTTGGGTATTTTCTCTAGCTCCTACATTGGAGGCCTTGTGTTCCATCCAATAGATGACTATGAGCATCAACTTCTGTATTTGTCAGACACTGGCATAGACTCACAAGAGACAGCTATATCAGGGTCCTGTCGGCAAAATCTTGCTGGCATATGCAATAGTGTCTGCGTTTGATGGCTGATTATGGGATGGATCTCCGGGTGGGGCAGTCTCTGGATGGTCCTTCCTTCCATCTCAGCTCCAAACTTTGTCTCTGTAATTCCTTCCACGGGTATTTTGTTCCCCCATTCTAGGGAGGAATGAAGTGTGCACACCTTGGTCTTTCTTCTTCTTGAGATTCATGTGTTTTGCAAATTGTATCTTGGGTATTCTAAGTTTCTGGGCTAATATCTACTTATCAGTGAGTGCATATCATGTGAGTTCTTTTGTGGTTTCTTAAGTAATGGAACTGAATGATGCCGCTGTCCTGTGAGTATCTTGACCAGTGAGGACATTCTTACTAAACTTTCTGATCTGTCTATTTGCTGTCTTCTGGCTCACGTGGATCTCCCATTGTTAATGAAGCAAATGCATTTTGTTATTAGGGTGTTCAAGTTTCAAGAGTGATAAATGTCAGGAAGCATAGTTTGCCAAATTAGGCAATCTAATAGAAGCTGACAATATGCAAATGAAATATTAAGTTTCTTTCTTTGATGTAAGTTTAAACCAATCATATAATCTCACCCCCTTCTTACCCTATGTAAGACCTTTAGTTTAGTCCTACATAGAGCAGAAAAAAAAGAAATGCTACCATTCCTGATAGACTGTAAGCAGGGACTGGCTATCTTGCAGACTTCAGGATCTTGTTAGTATGTTGGAGTGATACAGGACCCTCCAGATATAAAAAAAAACTTTCTTGTGTTTCAGAAAACTTCAACCATGCCAACTGCCTCCTGGCAGGAAGTGTACATGTGCTCAGGATGAAGGTACTTCAACATCAGGCCTTCAGGTGGCAGAGAAGCACATGACCAGTGCGTAGTGCAGAATAATTAACACAGGGGAGTATAAGAAAGCAAAAGGAAGAACCAGGCTCTTGAGAGATGGCTCAGCAATTAAGAGACATATTCTTGTAGGGAACTGGGGTTCAGTTCTTAGCATCCTTATGGTGGTTCATAACTGTCTATAACTCCAATTCTGTGTGATCTTATTCCCTCTTCTGGCCCTCATGGGTACCAGGTATGCAGGTGTACAATATATCCTTGCAGGCAAGGACTCATATCCATTAAAAGTTAAATAAGTCTTAGAAACATAGAAACCAGTATAGAAAAATGCATGTACAGGGAACTAACAGGATGACTATAGACTCAGTGCTCTCCTTAGTTTAAGGAAACAAAGAGCAAATTTGAAAATAAGTATAGAGAATGAAAAGCCATAAAATAGTGATCTAGTAGATGTGAGTAGTAGCAGAAGAAAACATTAATAAAAATATACAATTGAAATTAAAAGCTGAAGAAATAGGCTTAACAACTGAAGAGCTATAAATCTAAGATTCAGGCTAAATGAAATTGATTCCTGTGTACTGTATAGATAATAAATGATGGAAAAAGTTAAGAGAGGTGACAAAGTAACAAAAAGACAAGTATAGAAAAGATTAACACCAGGTAGGCCTTACATAATGGTACAAAAGAGCAGAGAGAAAACAAAACAAAAGAAAGGAAAACAAATATCTTTGAGAAGAAGAGCTGTCTACACAACTAATAGTTCAACATGGAGGAAGAACATGAGTCCAAGAATCTCAGAAATTCAAAAATATCACCAGGACAAGTGAGAAGAAAGCCCTGACATATTGTATAACTAACTGTTGGATACCAACACAAAGGGAAATGCTTACATTTTTCAGAGGTAAAAAGGTAAACTAAACTCAGAAGAGACATAGGGAAGATGGACATTATCCTCTCAATAGTGAAGAGCAAGGTAGAAGACTTGCTTACACAAACATTAAAAATTATTCTTATAGAGAAGATATAACATATACATTAAATGAAGATAATTTACTTTTGCTAAGTAAATTAGCATATTTAGCAGACAGAATAAACATTAATGCAGAAGAGTTGCTAGAGTTTAAAAATGGTTTGTTCAAACACTGTAGCACTGTGGGCTTGCACTTCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGAAGAAAAAGAATCAAATTGTGTACAATCCAGAGCATAATCTCTTTTTCTTGTGTGTATAAGTGCATTACCAAGCATAAGGAAATATAAGACATGTCTACAATCTCAGAGGGAGAATTTAACAAATAAAGCACAATATAATCAATCAATTAATATTATTTAACTTAATATTAATTAATAGACCCTGCAATAGGGAGATAATTGTCTGTAAAATTACAGTTTACCAATGAGCATAGTCCTGTGGTATTAAAGAACTTGAGTCAGTAATTTAAAGACACTCCTTTAGAGAAAGTTTCCCTAGAGGATCCACCAGAAAACCCTGCCAAGCTTCCAAGGACAGGTAGTTCCAACCTAGACTCTTCAAAGCACAGACTCAGAGGAAATAGCCCATAACTCATTTTATGTTTGTTTCAAGAGACTAATCTGAAAGGATTACTGGGGTGTGGGGCCTTTGAGGAAGTAATTATGTCAGGAGGGTGGAGTCTTCAGGAGTGGGATCAATGTCCTTATAAAGGATGTCTGAGGCAGTTCGTTTGAAACATATGAAATATTTGAAAACAGACGAAGGTGTCAGCATGAGCCAGAACACAGGTTTTCAGCAAACACAAGATCTGATGGCAATTTGGCTCTGGACTTCCGAGCCTCCAGAACTAACTATGAGACAGAATTTATGCTGCTTATAAGCCACACATAATTCCTCAAATCAACAGGTTAGCATAATATATTTCATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAATGTATGAGTGCTCTATCTGCACACTTGCATGCCAGAAGAGGGCGTCAGATCTCTCACACACACATTTTTGCGAGCCACCATGTGTTTTCTGGGAATTGAATTCACAGGATTTCTGAAAGAGCAGCTAGTGCTCTTAATCACTGAGCCATCTCTTCATCCCCTATATTTCTTATTTTAATATATCGAATTGTTCAGGTTAGTACAATTTCATATCTTACTTTTTTCCTTAATATCTAAGAAAATCTTTTCCTATGGGAACAAACATACTTAGTTTTAGATTCCCTCCCACCAACCCCCCCCCCCCCCCACCCCATAGCTAGCCTGCATTTCAGTTTCTAACAAATGTTTTCTGGTGACTCTCAGTACTGATATCGAGAACACCTAGAGAAATAGTTGTGCTATCAAGGCATGTCAAAAGCACTCTACAGTCTGTGAAAACTCAAGCAGCACACAGCGAGGCCGCTTGGGCTAGAGGAGTCAGTTTATAGGGTTCATTGGGGGAGGAACTGCTTACACTAATTACAGCTAATCATATGGAAATAGACTATTCACCACCAACAACCTTCAAGCTATACAATCTTTATTTCTAGTCTGCTACCAAAATATAGTGCCGCATAAAGGCAATGGAACTGTGATGTCTCACTTCCCCCTTCTACCTTACAACGTACTACTTTAAAACAACTACCTTATTTTTCACTAATTTAAGTAGTCATTTTAAATTAAAAAAAGTACTAGGTACAACAGTAAAAGGGGTGTGCTTCGATAATTTTTTGACCAAAGCTTATTCCCTGTCCTATTTTTAATTGTGTAAAGAAAAAATAAAAGACTTATTTGTATCAGTCCTGTGAGGTGTGTGACACCCACTCATAAGGGACATGTCTAAATGAGACTTTTCGTGAAATGAAAGGTTTTTATCTGAAGACAGAGAAACTGTCCAAAAGGTCAATTTTTATTAAATATCAATTATTTGAAAATATACTCTGATTTGTGAAAAATGAAGATGTTCCTAGAGAATGTGCTACGTCCATCATTGTCTTCTGACTTTGGCTTTCTGCTTGAGACACAAATTCGTTGCTTATAATCAGAATGAGGTCACGTGTGCATGAGAAACCACTCCTGGTCCCTTATGGGATTGCTCCACCATCTCAGGAATGAGTCCCTTCACAGCTCTCCTGAAGGGCGTGGTGCACACCTGACAGCTGCGCCAGGCAGGATCCCCCCACCTCACACCAGAAAGTGAAAGGTGCTATCTTTTACTTTTTTTCTAAGTTCAATTAACTCTAACATTCCAAGAAATCAAACTTGTGTTTTGGAGATTGAATAGAAGAAACATTTCTAGCTTCCAGAAACAAGTACACTGATTTAAATGAGAAACATTTCTTCAGAAGGATGAAACGGGAGATTGAACATAAAATTTATAACCAATTTTAAATTGAGTATTCTGTACGATGCAAGGCTCTATGCATGTAAATACCTCTATGCCTCACTCAAATCTGTTTTGGTAACATGGATGAGACCTTCAACGAGGTCAAAATGTGTTTCTTAATCTTTTCCAAGCAAGCAAAGCTGCTTTGTGGAATACATTAGAGCTTACCCCAGTGAAGACGTTGGGACAAAGACATGTAGCTTGTCCTTCGTCATCAATTTGTTAAGAACCTTTGCCTGAGCAAGGCTGTCTGCTGTGAGCTAGGGAGACTTTCATCTTTCTAACAGAAAGGACTCCCTTTGGTGGAAGATAGCCTAGACGATATTTTGAAGAACTGGCATCTAATGTCCTCATAGACACACACCACTGGCGTAGATCTTGACTGCAGAGATGAAAGATGAGTGATTGTCCTTTGCTGGCCTGAAGTGAAGGAAAATGAATTTTGAAACCTATTTGGGTTTTCTTCCAATATTTTATGTTTTTAATGATCCAAAGATTTTGTATCCTTATGTGCATATCTGTGTGATTGTATATCATATGTAAGTCGGTACCCGTTGAGATCAGAAGAGGGCATTGGAACCCTGGGATCTGGAGTCATAGGTGTTGGGAGCTGTGGCCATTTCCCATCATGACTGCTGGCTTTCTGGACTAGCAAGAAGCACTTTCAAACAGTGAGCATTTTTTTCTCCATCTTCCAACAGTCTATGAATCTCATCTCTCCTTGAGTGAAGGATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATAAATACTCTTAGGTCAATAATTGTAATCTTTCAGCCCAGTGCTCTTATTTCCTTAAAACATAAAAGCATTGGGGAAGAGTTTGCAGCCTTTTGGCATTCTGTACATAAGCCCTCCCCAAACCAGATGCACCACGTAAAGCTGTTCAGGAAATATATTTTAATGTGTCACCTGCCTACAAAAAAATTCATAAAATTTGGCCAGATTATAATAGTGTATATAAGAAGAGCTTTTCTAGACAGAGTACCAGAGCAGTGAAACTTGCTTTCATCTATGTAGTCTTCAGGCATTTCTCTATATTGCCTCATTGTACATCTTCATTTTAGTCACGGTAATACCATTTCAAGGTGGGAGAGAAATGAGTTTGCAATGAATTGAATGTAGACTTAGACTAAGATTTTCAAGGCAAGAGCAATGTGGATTTATTTTTTTTTTTTTTTGAAATACTTAATCAAATGCATTTAACCACACTCACTTAACCATAATTCTACTTAGTCCTAATCAATTTCCTATAGCATCCCACCAAGCAATCTCAATATATACCAAGGGAATGTAAAATTGGTAAGCTGGGGCCATATACATCTAATGAATACCAATAAATTTTGTCCCTCTGATAAAAGACACAAGGTCAGCGGGGGTTGAGAAACCATGAGAATCATGTCCATGTTGTCTCCTCTATTTCTTTGCAACTTGTTGAGTTTGCTTCCCAAAGCAAGAGATGGGAAGTGGTGCATGGGAGCTGACCATGGGCAGCAGTTCAGGGAGAGGGTGACAGAGCTGCTCTCTCTCTGCTACAGGTCCTGGTGACTTTCACCACCAGCTCGACCTGGCATTGAAAGATGCAAATTCACAAGTGAAATTCCTTCCTTCCTTCCTCCCTTCCTTGCTTCCTCCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTTACCTCCCTCCTTATCTGCTTACTTCCCTCCCCCCTCCCTCCCTTCTTCACAACCTCTCTTCCCCCCTTCTTCTCTGGTTGCTCTTCCTTTTCCCTTCCTCTATCTTGTTAATCCCTCTAGCCCTCCATACCTATGAATTCTGCGTCCACAGATTCAGTCAACTGCACACTGAAAATATCTAGGGGGAAAATATGTTTAAACACGTCTCTACAGGCTTTTTCTTTCATATTATCTTTTACACAATGTGACCATGACATAGCATTTACATTGTATTAGTTTTTAGAAGTAATCTAGAGACAAATTGAAGCGTGTGGAGGAGTGAGTGGTGTGTGGGTTATGTAAAAGTCCTATTGCATTTTATATAAGGGATTTGAGTGTGAATTTTAAATGACTCCCCATAAATACCACAAGAGACTTGTATTTGTCTTCCAAGTTCAAGGGATTTCAGAGCCTTGGAGAGATGCTGAGAGCTGGTTTTTCACACACCTGGGCTAGTACTTTTGCATTTCCATTCTCTTTCATCTGATTGGCTGAGGAAGTAAGTGCTTTGACTTAGTGATGCAGCGTTCACCAGATGTCACTTGTGCCCTCATAGTCAATGCACTCCGCCCCCCAGGCACCAAAGTATCATCTTCACTAGCAACTGTCAAATAATAACTTCTCCTGTGAACTCATTATTGTTCCAAAAGTAGTGTTTGTATCAAAGCTATCTTCTACCATGGTCTTCTATCCAAACTCATTGGCTGTAGGTATACACTTGCTTCCCCGCCCTCCACTTTCGCATTAGGATTACAGGGAACATTTAGTTTAAGGCAAGGGCTTACAAACATTTGCTTTTAGAATTGCTCAGTGTTTAAGGAATCCTTTCTGATTGGTGTTGCTAGCCTGTTTCTAGCTGAGTAATCTTTTTTTGTCCCTTACTAACTCGTATCAGTAGATCTGTTCGCAAAGGGAGAAACATTGGCCATCCACAGTAAACATCTCTGAGAGCATTTGCTGGCGCCCTGGCAGGTGACTGATCTCACGTTTGCTGACCTTTTGTCTCTATTAGTTGCCATAGTGATGAGCTGAGCTCTGCTTAATAGAGCTTTACCCAAATGGAGACAATCAATAGCTTTTAAAGGCTAATGTTTATGTTGGTGGCTCCTAACAGGAGATATCAAAATTAAATGTAGCTATATGAATGGCTCTGATGACAGAGCTGAAGGTAAAAGATGTTATCACGTGGGTATTTTAAAAAACCTTAATTCAGAAGATGAATGTACCCAGTGGCTTTTTTTTTGAACACCTACGATCCTCTGTGAGGATACAGAAAAATAGAATGATCATTGTAGAATAGGCAGGTATGTTATTTTACAATAGCAAGCTTCAAACGTCACAAGGACTTGGTTAAGGGTTTCTGAAACCTAGTTGTCAGAGAACACTTTTTAGCACCCCTTGGAGAATATTCCAGGCTAAGCTCTGGCCACTCTTCTGCACAGCTGCTAATGATCCCAGAGGAGTCCTGAGACACACAGATATGTGGTGGGCAGTTCACGTGTACTGTGGAAGCACAAGAGAATGGACTGAGCCCCAGAGCCCTTTACCTGCTGACAGCTGACAGGCAGCTGGTGGGTCTATGGAGCACACCAGGGAGGAAGTTGATGTCTTTCTGTCAAACCTAATTGTTCTCAAAGGTTTTGCGTATACTTTTGCCATATCCTGAATGAAATACAAGTATCAGTAGTGCACGTATTGTCCACTTTTGACAGCACAAGGGTAGCATGATTCACAAAGTTCATTGTCCGTTTGAACTCTCTACACAGGCACTGTGCCCTCGGTGGGCTGTCCCTAAGCTTTTCCTAGCCAGGCTGAAGTGAGCCTTGGATGTGGAGGGAGGGGGTGATGATCTCCAGATTCAGGATGCCAAGGAGGTTACCCACAACTGAGCAGGACTCACCTTTCTCCAGGAGTTTGAGATGTTTGAGAACTCAAATCTCCTAAATTCTGTTGTAACAGTTTGACAAACACATCTCAAGGCGGTTTAAAAACAAAAATCCTGCGATGAAGAGATGGCCCCATCAGTGGTTAAGAGTGTGTAACGTTCTTGCAAAGAACCTGCATTCGGTTCACAACTGTCTGTACCTCCAGTTCCAGGAGTTCCCACATCCTTTTCTGGCCTCCATAGGCACCTGCTTGCATACGGTACAAATACAGACAAACAGACATACGTATAAATAAACATAAATAAAAGTTTAAAACAAAACCAAAACAGCAGAAATCAGAAGCCCTGGGGATAAGACATGACTATAAAATTAGATTGGCGCAGAGGCAATCTTCAGTGAACCAAAAGGAGGCAAGCAACACACCAACTTAAAGGGAGACATTAACTTAAATAGAGAGAGTGTCTGTCATCATGAACCTTTCATGCATCACTGCTTTTGTAAATTTGTAAAAGAAAAATCTGAAGTGCAGGATTAATGTTCTATTAAGAGGATGGCCACAAACATAATTATATCTTTTTTCCTTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTATGAAGCCAAAGGTTGGTATCGTGTGTCCTCTGTGATTGATCTCCGCCTTATGCATTGAGGTAGCATGTCTTCGGAATTCAGACCTTGGCTATTTGGCTAGTCCAGGTAGGCAGCCTGCTCAGAAGATCCCATCTCTGTCCCTTGATACAAGGATTACAGACAGGCCTCCATGCCCTCTTGAACTCTGGTCCTTACACTTGTGAAGTGAGTGTTTGTCCCACTGAGCCAGTGGTTCTCAACCTTCCTAATGCTGAAATCTTTTAATACAGTTGTGATGAACCCCAACCATAAAATTATTCTGTTGCTACTTCATAACTGTAATTTTGCTCCAGTGGAGAATCATAATGTAAATATCTGTGCTTTTAGATGGTCTTAAGTGACCCCTGTGAAAGGGTCATTTGACCCCCAAAAGGGTTGTGACCCACAAGTTGAGAACCATTGCACTAAACCATCTCCCCTTCTCCTAATCGTGTCTTAGTATTATTTGATTTCAGTGACCACATCAACATTTCGGAAGGAGAGATTTCTTATTTATCAGGAATAAAATGTTTCAGTAACCCAACAGTTAAGAACTCGTTACTGGTGAATCGCTGTAAGTAGGGCACTGTTGTAAACACTGGGGACTCAGCTAGGAATATCACAGGCAGTTTCCTCCTGTTACAAAGCTCATGGTCCTCAGAGAAAGTCAGATAATAGATGAACAGGCAAAATGTCAACTAACGGGCAAATGGTGATCTTAGCCAGGAATTGAAGCATCGCGGGTTCCCAGGAAGTGAGTGGAAACTGGGATGGAATTCTTTTAAAATCTCTACACGTTCTATTTATTTATTTTTATTTTGAGAAGTTTAAATTATGTAGTTGAAGGTGGCATTGGGTTTTCAATCCGACTGTGCCTGGGATTGTAAGTATGTTTCTCTGGGCCCGGCTTCCTGAAAGCACTTTTTGGTGCGGTTGTTAGCTGAGACCATCACTCTCTACCAGGCTTATTGATCCAGGCTTCTGGCCGTTCTTCATTTTCTTTCTTCCGGCTCTAGCATCTGTTGACACAGTGGCTACTCAGAATAAAACTTCAGACATATCCCAAAACCTTACATCTGCCTCTGTGTGAAACGAAACTCATATTGCTTCCCTTAGCCTTCAACACACGGCACAAGGTTTCCCTTCAATTCCCTGATCTCATTTCCTCCTGCTCCCCATTTCCTGCCCTCTAGGACGTGTTTTCAAACTGACCAGTCAGTCCCTTATGTGTATGATACCCGTGGGTCGTGACCCCCTTGGGGGCTCAATGACCCTTTTACAGGGTGTGCCTAAGACTATCAGAAAGCACAGGGACATTATGACTCATAGCAGTGGCAAAACTGTACTTATGAAGTAGCAATGGAAATAAATGAGTCCCTTGCACTGGCTCCCCCCTCTCCCGTGCTGGCATCAAGAAACTCTGCCTGCCATTCCTTCTTTGTCTGTGTCATTGTCTCCAGGACACTTCCTCAGAGGACCTTTCAAGGTCCACTCAATCTAAAGTGACATTTCACTCTCATGATGTGTTTCCTGCTGATTCATCCTTCAGAACTCTCATCCCATCTTCTGTCCGTGCTACTATGCAGTGGTCTGCTTAGCTGTCTATGTTTATGAGAGCATGCATGCTCGGAGAGTAAGGCCTGGCCTCTTCACTCCTTAATTTCCAGCACCCAGACTAATGGAGTCATATTCCAAGAGCACGAGGATTATTTGTGAAATGAGTGAATGGATGGACAGGTTTTCTCTAAGGACGAGACTGTTGAATAACAAGGAGAAAATGATAAAAATAAAAGTATCAAATATTTTGGAGGATTTTTCAAATTTTCCCAGCCTTTGCATCCATATCCTTACCTCTGGCTCCCAAGGCCATTGTCACAGTAGTAGCCAGCTCACATCTTGCTCTTATCTTTGCTTGCATTGTGGCCTTTGGCAATGAATTTAAATCTATATTTTAGCGGCTGTATAGTCTACTATAGTCACCAATATCATATTGGTGACAGTATTTGGATATCTGAAACATTTTTCAATGTTAGTACTTTTAAACCATTGTTTTCAACTTTCATATAAAGTAATTAATGGATTTTGTTGAGAAAATTTCATATGCATATATCATTATGCCTTGTGGCACATGCCTATAATCCCAGTGCTGGTGAGATGGAAGCAGGAAGATTAATTAAGAGTTCAAGGCCATCTTTGTCTGCATAGTTTTGGGCTAACCTGTGCCAATGAGACCCTGTCTCAAAAATATAATAATCTTTGGTTTTAGAGTTACTAAAAATCTCTCCACTAATCACTGTAAACAAATTCTAACAATATATAGACAGAATAAGAGTTGATTTATGGTTTCTTCCATCTTTCCTTTTAAACGGCAG
Seq C2 exon
CATCGCCAAATGCCCCTCGACTTGGTCCCACAGAGCTGACGGTTGTTATCACCGTGCCGGTTTGCCTCCTGTCCATAGCCGCCATGCTAACAATATGGGCGTGCCAGGACCGCCAGTGCACATACAGGAAGACTAAGAGACACAACGTGGAGGAAGCGCTGGCTGAGTACAGCCTTGTGAATGCAGGAAAAACACTCAAGGATCTGATCTACGATGCTACTGCCTCTGGCTCAGGCTCTG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSMUSG00000026834-Acvr1c:NM_001111030:2
Average complexity
IR-C
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.028
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0106418=Activin_recp=WD(100=96.2),PF085157=TGF_beta_GS=PU(7.7=1.9)
A:
NA
C2:
PF085157=TGF_beta_GS=PU(58.6=21.0)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Pre-implantation embryo development
- Muscular differentiation time course
- Spermatogenesis cell types
- Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
- Hematopoietic precursors and cell types
Other AS DBs: