MmuINT0097503 @ mm9
Intron Retention
Gene
ENSMUSG00000026799 | Med27
Description
mediator complex subunit 27 [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:1916225]
Coordinates
chr2:29205366-29269038:+
Coord C1 exon
chr2:29205366-29205510
Coord A exon
chr2:29205511-29268907
Coord C2 exon
chr2:29268908-29269038
Length
63397 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTAAGG
5' ss Score
10.51
3' ss Seq
TCTTCCTCTTGTCTCTGCAGCTG
3' ss Score
12.35
Exon sequences
Seq C1 exon
TGAACTGGAACGTTTGAGCAACCTGGTAGGCAAGCCGTCTGAGAACCACCCTCTTCATAACAGTGGGCTGCTAAGCCTGGATCCTGTGCAGGACAAAACCCCACTCTACAGCCAGCTTCTGCAAGCATACAAATGGTCCAACAAG
Seq A exon
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Vast-tools module Information
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Protein Impact
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Other Skipping Isoforms:
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Pre-implantation embryo development
Other AS DBs: