MmuINT1021604 @ mm10
Intron Retention
Gene
ENSMUSG00000062609 | Kcnj15
Description
potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 15 [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:1310000]
Coordinates
chr16:95258853-95291896:+
Coord C1 exon
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Coord A exon
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Coord C2 exon
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Length
32854 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AGTGTACGT
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Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Protein Impact
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No structure available
Features
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Domain overlap (PFAM):
C1:
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A:
NA
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NO
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NA
Main Skipping Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
Associated events
Conservation
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Ribosome-engaged transcriptomes of neuronal types
- Neural differentiation time course
- Muscular differentiation time course
- Spermatogenesis cell types
- Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
- Hematopoietic precursors and cell types