MmuINT1026682 @ mm10
Intron Retention
Gene
ENSMUSG00000030228 | Pik3c2g
Description
phosphatidylinositol 3-kinase, C2 domain containing, gamma polypeptide [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:1203730]
Coordinates
chr6:139957706-139969284:+
Coord C1 exon
chr6:139957706-139957831
Coord A exon
chr6:139957832-139967790
Coord C2 exon
chr6:139967791-139969284
Length
9959 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
ATTGTAAGT
5' ss Score
8.54
3' ss Seq
CCTTCTCTCTCCATTTTCAGGTG
3' ss Score
14.38
Exon sequences
Seq C1 exon
CATCTCCCAGATGGCTCTGTGCCCAGTGCACATGTTGAAATTTATCTTCTACCACATCCCAGTGAAGTTCGGAGAAAGAAAACAAAGTGTGTTCCAAAATGCACTGACCCAACTTACAATGAAATT
Seq A exon
GTAAGTATACGTTATCGCCTGTCCAGGTAGTTTGTATTTTTCTTACCAGTTTTTTTTTTCTATTCTTTTTTTTTTCCTTCCTTTTTTCAGCTTCACAACCAAATATGGAGAATTTTCAGTAATTGGAAGCATTGTTCCATAAAGGCATGATGTTGCCCAAAATAGTACCAGCATGCTGAACACTGTTCTAGATGCTATGGGAACTGGAAAATACAGACTATCAAAGCTCTGACAGGCCAACCTCCAGCAGGCATGGGAGGGTTGCTTTGCATACTAACAATTTCCCTGACTCTATTGTATTCTCTACCGTGTTCACCTTATTTTCTTTAACCTTGTTCTAGCACATGCGAGTTTTTCTCACCTAACCATTTTATCACAAGCCTAAAAGCTATTAAAAAAAAAAAAACCCACTAATCAGAGCTACAGCATTCTGCAAATAGCTCTCCTACAAGGTTTCAAGATCCAATCTTTCCAGTCTTCTGGTTTCTCTCTAAAGCAACCTGCCTTTGTTGTTTCTTACCTCTTTCACCTCCTGACTCAAGTTTTTCACCTGTTTATTCTTGCTGTGTCATCTAGAAGAGGCCAACAAGAAACAAAGGCATCATCCCATGTTATTTCAGCTGTGTGTTTGTTAGGACAGGGTCTTCCTGGGCATCCCAGGGTTCACACAAGCAGGATCCTCCTGGCTCAGCCTCCCCCTGGTGTGGTGCAGAGCAAAGCCTGTTGACTCCTATCTCAGCTTTTCTGAGCAAGCTTTCTTCCCCACACCACCAGCCCCAGCTCATTAATCAAATCACACAAGCTGCTCTCACTTCTGCTTCCCTTCACCCTTGGATGCTGTGCAGTGTAGATTCTCACCTTTCCTGGTAGGGCTTCACTCAAGTGGTATCAGCAGGCTCCTAATTGCTAAATGCAATGAGCCCTCAGGCTCTCTCCCTGCTGCAGGTGCAAACTGACAACCAGACACCCTGATCCTTTGAAACCTCTGTGTGCCTAAATTTCACCTTTTCTTAATTTGTTCCCTTCTCCTATAACCTCCATTTTGTTTTAATGCATTGCTATCCTTCCTCTTAAAATGCTATTTGCTGAAGCTCTATGGTCCACCCTGGCCTGCTTCCCCTTCAAAAAGCATCCCTCCCTAGGCAAAGGGTCTGCACGCAGAAATTCAAACAACCTCTGATTTAGAAAAAAACAAAAACAAAACAAAAAAGCCAACATCAAAACAAACAAACAAAAAATGCAAATGCCTTAAAACTATCTGAGTAGTGACTCTGAGTTCCTCCTTTTGTCTGCACTCCCCTAAGAATCCCTGAGAACCCCTGCGTTTCTTGAGGAATCAGGAATAAGCTGCAGAGGAGAACGCCCAAGGTGAAGCTCTCAGTCTATACGTAAACCCTGAATGTTTTATTTCCTTGACATCTTTGGACTTGGATGTCAGGAGCTCTGCTTCACTCTGCTGGACAATGAAGTATGATGACAGAGACTGGATACATTCGCACGTTTTCTGTCCCATCTCAGTGTAAGCTTACATTCCCCTAAGGTCCAGCTAGTCATATAACCCAAGCTGATCTGGAACTCGTGTTTGTAGCCAAGGATGACTTTGTGCCTCTGCTCCTCCTGCCTCTTCTTCAAGTGTCGGGATTATAGGTGTGCACACCACACCTGGTTAACTCAAGGTTTTGACCTTTGACCCCTCTTCCTCATTGCTACAGCATGCCATTTAAACTTCTCCCAGCCACTTGGAAGGTAGGCTTGCTTCTTTGCCATCTCAAAAGAGACCTTCTCTTTTGAGGGGGATGGAGGATTAGTTTGTATGCATTGGCAGCATCACACGCATACATTTTATAGCTCAGTTTTCCAGTTACTGTGGTTTGCATGTTCCAGGTGTATGTCTATCCACTACAGTGATTACAACCCCAAAGGGAAATGACTCCCCTTCTGTGTGAATATCCTCTCAGCTAGGGGTGAAGCCACCTGAAGCCCTTCCTCATCCCTGCTAGAATGTTGGCTGGCTTAATTTTGTGCAAATTCAAAATAACACCTTTAATGACACAGTCTTTCTCTGTCACATGTCCAACAACCAAGCTCTACCGTTTCTACTAGAACACCATCAGACTCCTAAATCCAGTCTTCCTTCTCCTGGTCTAATTCTGTCTGAGGTCCCTGTCTCTTAAGCCATTACACAGCTGTTATCCAACTCATGTGGACTATTTTTTGTTTGTTTGTTTTGAGATGGGATTTCTTTATGTAACCTCAACTGACCTAGGATTGACTATGTAGATCAGGCTAGATTTGAACTCACAGAGATCTATCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGAGGTTATATATCTATACATACATATACATATACCATCAGGACCATCTCTGTGAAATCGTTTTATTAAATCTTTTATATTTTTATCCAGAGTGTCACTCAGACATATTGATTATTATTCCATTTACATTGTTTGAAGGGTCCTCATTGCCAAGTGTCAACCTACAATTTTAAATGTGGCATTAATATCCCTTAAGTTTTAACTCAGTAACTTTCCTTGGTTCCCTCTTGGATGAATAACATTGAGTATTTTCTTTTCTTAGATTCATGTGCAGTTAGAAAAAATAACATAGATTCCAATGGCTCTCAAGCTCTTTCCCCCAGTGTAATAGCTGATGTAGCTTTAGTTACCTAGCTACTTTAGTACCAACACTAGGAAGCTGACATGGGTCTGATCCAAATAGCTCATTCTGATTTTAGAAGTCCTGAGAACCCCCTTGTGTAGATGTGTAGCTCTGAACATTGGTGTTACCTACTTGATACCCAGTCAATGTACAGAACAAAACCATCTCATGGTTTACAAGGATAACCCAACTGTAGCCAAAACTTTCTGCTTTTGGATGGTATTAGATCTCTATCCCTACAAATTTATCATTTTTAATGTTACACAGCTGGAATTGCATACTTTATGATAATTGAAATTGCCTTTTGTCTCAGTTACTTTTTCTCATGGCTGTAACAAAATATCTAGAAAGAGCAACTGAAGACAGAATTTGTTTTGGCTCACAGTTTGAGGGTGCCAGTCTATCATGGTGGGGCAGGTGTGGGAGCAGAAACTCCAGACAGATGCCCATGGCGTTGTTCACATTAGGGGCATCTTCTTACCTCGAGAAACCTAAACTCCTTCACAAGCATGTTAGATGTTTGTTTCATGGTGATTCTGAATCCCATCAAGTTAGAGACCAAGATTCACCATCAATCCTTTTTAGGAACTGCAGTGTCTTATTTATTCCCCTAAAGTGCTGCATATGGTCCTGATGACTCTTCAGACCCACAGTCCCACTCTGCCTTCTCTGCTGCTGTGACCTAGGAGTCCTGGTACCTCCTGCTTCACGCATCTTTGTAACCTTTAGACCTAGAGTAAATTTTCTGACAATAAAGGGAATGTCTCCTCTCCCCAGATATCTTTAACACTTAGTGTTAGTAATATTTAAAACTGTCTTTAAATGTTTCAGGAAGTTTTATAAATGATACATGCATGCCTATAAAGGATTATCTAAACTGGTAGAGGTATTTTAATGTCTTATTACTCATTAAAATGCCCATTCATAGCTAGAGATACACAGCCAATAATATGAAACCTGCTCTCTTTCCTTGCATACAAGCCATTCAACCTCACTATCAAGAAACTTTGTAGAGATTCTGTATCAAAAGAGAAGAGACAGGCTGCTGAGATGGCTCAGGAGTCAGGAGCACTGCCTGCTCTTGCAGAGGGTCCAGATTTGTGTCCTTGCACCCACATGGTAGCTCGCAATGGTCTGAAACTCCAGCCACAAGGGATATGACACCCTCTTTTGTCCTCCTTAAGCAATACACACATGTGATGCATACACATACACTCAGACACACATACACATAAAATAAGTTTCTTTAAATAAATGGATTAGGTAGATGGTGCCTAAAAAACATTATTTGAGTTGGCCACATAAGTAACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGAATCTATAGCTGTTGCAATAGAAAGGAAGAAAGAAAGATAGGAAGAAAAGAAGGAAGGAAGAAAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGTTTCAGTCCCTATAAGGAAATTAAGTGTTGATAATATAAGGAAACAATGAATGTCACCAGCAGTCAGTATTATTTTAATAAGTTGAAAGTTAAATCATCAAAAGCTTAATGGATTATGAAATCAGCGGTAAGTATGCATGCATGAAGCTTATTTTACAATTCTTGGTATGGACATAAATTTTCTGACGGCTTTAGAAATCCCAAGTCTTCCTAAATCCACGACCTAGTAATCCAGATTCCTACAATTCCTTCTCGGCCGAAGCCTTCTTGAGGAACAGACACACACTGTTCATATTTTATACACATTTCAAAAGGCCAACAAATAATGAAGTCCATACTTATACAATCCCAGTCTGCATGGAGTCCAAAGCAGGACTGTGGGTATCAGAGAGGAGATTGAGACTGACTGGAGATGCGGGGAGGGGCGGGGGCTGGGGTGGGACAGGGAGGCCAGTTGAAATCAGAGGACCATGAGACGAAAATCCAGCACAAAATTCTGAGTCTATATCAATGCAGCAATGCTTATAAAAGATTGTAGAGAGATCATCCTGTGTATTATGTGGATGCCTCACCTGTCAATTAAAAAGCCTATGGCCTATGGCTTATGCGGGAAATAGAGGTGGGACATCGGGAGGAGAAAGAATTCTGGGAGTCAAGGAGGCAGGAAGAAGAGCCCAAAAAGAGGTGAGGAGACTGATACATGGTAACCAGCCACACGGCAAAATGTAGGTCAAAATAAATGGGTTATCTTTAGTTATAATCTAGTCAAGGTAGAGCCCAGCTATGTGGCTAAGGTATTTGAGTCTGAGTCTTATTTCTGGGAGCACAAAGCTGGGAGGCAGAACCAGGCCTAACTTCAAGAAAACCATGTCCCACGGTAGGCACCATTTTGTTGTTGGAAAATTTAATCCCAACCCAGTGTTTCTATCCCACCTTTAACCATTTAGTTCCTGGATAAAACACACATACAATCTTTATACTTATAATAACCCTTAATCAGCACACAAGCTGGGCAGAGATCTATCTATCCTCTATTCTTTTATGTCTATTTCCCAGCCAATAATTCCATTATATGAGTTCCTGTGTTTTGTCTGGGCTGCTCTTAACTCCAGTTGGCCAGCCCACCTGGGCATTATTTTACGACTCACCTAACCCATGGCGGCTTCCTTCTCCCTCTACCTTCTTTCCCTCTCGTGGTTATTCCCTGATGCCAGGGAAGTCTTGGAGTTCTAAACCCTGCCTATGTCTTTTCTGCCAAGGTATTGGCTGTCAGCATCTTTATTCACCAATCAAAAATCACTTGGGGTCAAGATCACATAGTGTCATTTGAGACTACATGCAGACTCTCTCGTCTGTGGGGCGACCAGGTCTTGGCGGTCTGCACTTAGCATTACGATCAAAGCAACAGACCAAACCTCAACAAAAGATGCACAAAATGTACACTTGACTTTGTATCTGACTTATTTTCTCTTGTCTTCAACACTGATATGGGGGATTGCATTTCTACAATAACCCTCTGCTTTATTTCTGTGAGACTTTAAGGGCTCCCTAATAGGGGACCCGTTGCTTATTAAAGAGCTCAGAGCCTTATCACATGGCATCCCTGGGTATTAAACAGCTCTGTTTTTCCACCTCTGACGCATGCTCACTATGAACATTCCTCACTATGGTGGGATTCCTCGAACTGCCAAGGCCTTGCAGCATACTGTGAGGTGAGAGAGAAAGACCTGGTTCCTATCTATGAGTAAAGCTCTGAGACATACAAAGGGATAAGATGTTGCATATCAATGTCTTACCAAATTTTTCACTAAAACAATTCTCCCCGTTTTTATTCACAGGTCCCTCTGAGGGAGGGGTAGTTCCAGGACTCTGTCCAGTGGCAGAGACTCCACCCTTCAATTGCCAAAGCTTTGGTACAGGGCCCAGCTTGTCTATTTGACTCTTCCCAGTGTGCATCTCGGTGGGGTTTCCCAGCTGTCTCTCAGAATTCTGCTGGCATACAGAAATCCCATGGTGCACCTGGGTCAGGAACAGAATGTTCAGGGCATCATCTTTCAGCTTTGAGAAACAGCTGTGATTTCAGCCCTCACACCACTGTTCTTTGTGCTCGGCTACCTCTAACATCTGGTTGAAAACATGGTTAAAGGATTCATAATGAAGGAAGAATTTCTCCCTTGTAACAGGATTACATTGTTATTGCATTGTTCCTTCACTGTCCTTTGCTTGGGTTATTATCCAGGAAAATTCTAAAGAAAACACCAGAGCGAAAGGACACACACATGGTGCATGCTTTACCTGCCTAAAGCTCCCTTGCAAAGTTCTTCATGGGCAATGAGGATGCAAGGACTGTGCTCTAGGTCTAGCCAGCAAGCTGGAGACACCTGACACTTGCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTACTTGTGTGCTTTGTGTATGCAGATCTGAATGTGTGTATATGGAAAGCAAAGGTCATCATTAGGTGTGTTGTTTCTCAGATTTTGTATCTTCACTAGATATTTTGTTTTGTTTTGCTTTGCTTTGTTTGAGACAGGGTCTCACACTATGTAGTATAGGCTAGCCTTGGATTCACAGAGGTCCTACAGCCTCCTGCCTCTGCCTCCTGCCTTCTGCTTCCAAGTCTTGGCATTAAAGATATGCACCACTACTCCTAGCTTTTTTTCACATGGTATCAAACTCAGGGCCTTGTCCTTTACTGCTGTCTCCCAAGCCTGAACTCTTCTGGTGTTCACAAGATGAGAAAGCTTACTCGGTCGGCCATGCACTACAAGTTGCAGAGGCCTGGTCCAGTGCAAGACAGTGTTGCCCTAACACTCGGTCACCTGCAACATTGCAGCCATCTTCACAAGAGGACAGAGGGCACCAAATATCGATGTGTCAGGACACATCTTCTCATTAAATAACAGATGCCTATATATGTACATGATATCCAGGCCCAGAGGGTGCACAAGGTATTCAAGCTCAGAACTAACCCATCCCAAAGCCCAAGTCCCCCAGGACACTCTTCTCCTTCCAATTCTCTGTGCTTGTGTGTGCTGAGCCTGCCCTCACCCCGCCCTTAATATGCTTCCCACCACCACAGACTCGCTGATCTCCTGCTTATTACTCTCCCACTGCAATCATGAAAATGTACTTTAGCCTTATTTATTAGCCCCTTGTGTCAAATAATGTCCAGTGAATGCCTATGTGTGAGTTAATAGATAGTCATTACACTCAAGTCTTTCTATTTGAGGTGCCAATTCCAAGCCCACAAATTCTGCATGTGTCAGGCTGACTGAAGATTTGCCTCACGCTTATCGGTAAAAATGGATGAATACACTATAAACTTAATTAAGAGAAATATTCCTTATTCTACTTATATAAAGACATATTATGTCATTTGATGAAAACACCACAAAGAATACATCTACCTATCTTCTTCTCCAGCATGACCCAACAACTACTTGTTGCATGGTAAAGGAGTTTTTTTGGTTTTTTTTGGTTTTTGTTTTTTTGGTTTTTTTTGTTTTTAATCACTATAGGTGCACAGAACAATTAAGAGCTATATAACACCAATATTTTAGCTTTGGTCACTTTAAGAAAATCATTTGCATTATTCAAGAACAGGTTAAAAATCTACCAAGGAACACAGGTTTAGAAATCCTAATGTTTACATTTGCCACAGGAAAATAATAATAAATTTCAAAGTGACTTCCTGAGACTTCCTACTTTCTGGGTGCTTGAGGAAATCGCTTTTGTCAGGAAGCGTATTCCTCAGCCAAGTGCAAAAAACATCCCCTATTTGTGTATTTGATGAATATTTAAAGTTGATTTATGAGTGTTGAATATTCGGCATAAAGCTTGAATTAGTCTCTCACTAATTCCTTTTCACGATGCTATAGGTTAGCATTCTTATTCCCAACATGCAAAGGCTCACAGGCGAAGACAGATCCGCGTGAATGTGAATATAAGTTATTGATGTGTTTTGTTGAAAATCTTCCTTTTGGAATTGATTGGTGCAATTCACAGAGTTCCTGAGCCAGACCTTTCCAGGACCCACATCTTGAAAGTGTGCCACTCTCCTCCTCCTGGGTATCATTTTGAAAGCTCTGTCGTCTGTCTTCTCTGTGGGACAGGGGAGGAATTCACTGTGGACAATGTTATCGGCAGGAAAGGGGAGGAGAAGGCAGGAGGTTGAAGGTGGCCACTGTGGAGGAAATAACAGGGAGATCACCCTGAGGTTCTAGATGGCTTTCTGGGCAGCACCAGGCATCCAGCAACCGTGAGATAACATGAGTTACAGGGACTGAATTTGGGGCTGTTTGATGCATTCTCTAAAGCCCTTTATTATCCCCTGAACCCCACACCTGACTTGGGATACTTTAAAAAGGCAATCCTAGAAAATCAACGGTAATTTTCTTTGTGGTGCTGAAGCAAGAGTAGCTGGATAGAGTAGACTAGATAGCATTGCAGATCATGCACCTTGATTGAGTTAGCTTTTTAACTTGCTAATTAATTTTTGCCTATGGCAGAGAACCAAATGTCATTGATCAGCTTGCATTTCTTCGGTGCTGGGGGAGTACTCATGGGCACACATGCTCGGCAAAGAGTTAACTTCAGGGGCTTCAACTCCAGTCCTCACCGATGGAAGGCGTCAGAGGGAGATAAATAGATGCAGACAATGTGAACTGCTCAGATACCCCATCCTTACTCACAGAGGCGGCCACCCAGCTGTCTGGGGTCTTTCCTTTCAAGCTGCCTCCTATTTTGCATATACTGAGAGCCCTCCATTCTCCCTTGTAATGTGGCTGTAAATAGCAAATATGTATCACTGTGTGAAATTCCGGCTTCTAAATGTGTTCTAACACGTTTCCCTGGCAACCATGTCAACTTTCCATGCATGCCTCTCTTTCTTTCACATCTCATAACTAACATCTTCACCCATCCCCCACTGCCAATCTCTCTCACCCTCAACAGGCCTATCATTGTCATGACCGTAATGCCCAGAATATTAGAAGCCAAAGTGGAACAAGATCCACTGGGGAAAAAAAAATAAATCACACGAACAACCCATACATATATATGCATATGCATATATGCATATGTATACACACACACACACAAGTCAGATCTTTGAGAAGAAAAAGCAAACATTGCATATATAAGACCAAAGAACGTCAATATTTTAGCTGTGAGTGGAAAGGCAGATTTCTTTCCCGTTTTTGATTTGTTTGTATTATATGTTTAATTGGCTAGACATATTTTCATGATTAAAAGTCATGCAGTTTTAAGTAAAAGAAGTGATCACAAACTGATTCCATTGACTGTGCAAGGACATATTACCTTCCCCATTTAAGCAGCACTGGCCTGTCATTCTTCATGGACCTGCAACACAAGGATGTGGTACCCAAGCTCCTGTGACAGGTTCAAGGATGGTTAGAGGCAGACGATTGGATTCTATTCCTAGTGGATATCTGATTGAATCACTGAATTTGAAGTGGGAAATTTTAATGAAACCAGTAACACTAAGATTCTTGAAGAAATAGTCACTGAATTCTGTTATATCAGTAGAGCCTTGACTCTTCAGGGTTAACACTGGAAATAAAATATTTTGACATGAGCCTCTCCCCTCCAAGGTATAAGTTGTTAGCATCATTTTAAAATTTTAAATCCGTATTAAAAAGAAAGATGCATTCAAGCATATCTGATTCACACGTTCCTTCTCTCTCCATTTTCAG
Seq C2 exon
GTGGTATATGATGAAGTCTTGGGGCTCCAGGGCCATGTTTTAATGCTTATCGTGAAGAGCAAAACTGTATTTGTGGGAGCAGTTAACATCCAGCTCTGCAGTGTACCCCTCAATGAAGAAAAGTGGTACCCACTAGGAAACAGTATCATCTGACTAACGCCACGAGCGTATGCATTACTGCTTAAGTACTTGTATGTTTTCAGCTTCTACTTGCCTCTGTCACATATGCAAGGCATCTTTCTCCTGGGAGATAGCTTCGAGCAGTGGCTCTCAGCCTTCCTAAAGCTGTGGCCCTTTAATATAGCTCCTGGTGGTTGTAGTGACCCAAACCATAAAATTACTTTAGTTGCTACTTCATAATTGTAATTTTGATACTGTTGTGAATTGCAATGTAATTATCTGATATACAGGATCTCTACTATGTGACCCATGTGATAAAAGGGACATTTGACTCCCCCAAAGGGCCGTGGCCTATGGGTTGAGAACCATAGAATGTGAAGGTTACAAAAGAACCAGATCAAAATCTGCCTTTTGTAGCTATTTCTTCCCTATCTTGTCCTTATTTTCTTATCATATTTTCTCCTTGGAATATCCATCATGTAAAATTCCATATGCAAAGTAATCAAAGAGTGATTATTTTCAATATGCATTTTGAAAGCAACGTAAGTTCACATTTTGTCTTAATTGCTTGTTGAGGTCAAAAATTATATTTTCAAGGTGTTTCTCTAAAGCTGGGAGAAGTTCATGAATGAATCTAAAGGCTAAGAATACCTGCAATATATTCCAAGCTTAAATATGTGTACAAACCACATGTCTAGTCATGAGTGGATTTACTGAGAGAACTGGTGATCTCCCACCATATGCTATAATTTTTCTATCAAGAAAAGGCCTAAGATTTTCTATTACATAGATTTTTTTCTTTAAGAATTTCATGCCTATATATAATGCCTTTCATTACTCTAGTTTCTCTCTGTTTTTGTTGCTCCCACACCCATCAACAACTGTTCTTCTCAAAAAAATCCTGTATTCCTATAGGAAATTTTGTTTTTAAGATGGGAATCTTGCTATATATCCTAGCTGACCTAGAACTTACTATGTAGACCAAGCTGGGCCCAAAATCACAGTGGTCCTCCTGCCTCTGTTTCCCTATGGCTGGGACTCCAAATCATTGGTCCTGATCTGTAATCTTTAAATTCAGTTCTTAGAATTTGATGTTGACTAATCCATTGTCATTGTGTCTCCCAGCCTCCAATGTGCTCACACCTTAAGTCTTACTAATCCCAAACTCAGAATGTCAGACTTTCAAGTTCACTGTTTATAACTCTTTTTCACTTGTTAAATGCTATCATTGCACTCGAACCTACCCCCTGTTCTCACCATGAACAGAGTAGATGATCTTACAGAGTGTTACCAGCATAGTAGACAAACCCAGAGTAGTGCGCCTTCAAGATAATCAAACTGGAGGTTCTAAAAATAAAACATCTACCATGTAAA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSMUSG00000030228:ENSMUST00000111868:23
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.024 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0016825=C2=FE(49.4=100)
A:
NA
C2:
PF0016825=C2=PD(34.9=56.9)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Ribosome-engaged transcriptomes of neuronal types
- Neural differentiation time course
- Muscular differentiation time course
- Spermatogenesis cell types
- Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
- Hematopoietic precursors and cell types