BtaINT0111723 @ bosTau6
Intron Retention
Gene
ENSBTAG00000020715 | PIK3C2G
Description
phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase, catalytic subunit type 2 gamma [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:8973]
Coordinates
chr5:91835146-91848005:-
Coord C1 exon
chr5:91847880-91848005
Coord A exon
chr5:91835661-91847879
Coord C2 exon
chr5:91835146-91835660
Length
12219 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
ATTGTAAGT
5' ss Score
8.54
3' ss Seq
AAAATTCTCTCCCTTTTCAGGTA
3' ss Score
12.04
Exon sequences
Seq C1 exon
CATCTCCCAGATGGCTCCGCGCCCAGCGCACATGTTGAATTTTATCTTTTACCGTATCCCAGTGAAGCCCGGAGGAGGAAAACAAAATCTGTTCCAAAATGTACTGACCCCACTTACAATGAGATT
Seq A exon
GTAAGTATGATTCATCTCTTGTCCAGTCACTTTGTATTTTTTCTTACCATTTTTCAGCTTCACAATGAAATATGGAAAATCTGTAGTAATTGGCAGCATTATTTCATAAAGGGAAGATGTTTCCCAAAATAGCCACTGTGTGCCACTCACTGTTCTTGATGCTATAGGAATAGGAAAATACAGCTTTCAAAGTGCTTATGAACCAATTTTCAAATTGTGGCTAGCTTACAGCAAGAGCCCAAGACTTTATGGCATTTGTTTCGCCTCCTAACATTATCCCTGACTCCATCTTGTTTTCTCTAATAAGCTTTTCTTTCCCTCATTTTCCTTACCTGATAACTTTATCATAGTCTAATCTATTGTAAACATTATAAAATCTCCTTTGAAAAACTGAAAAAAAAATAAGTACAAAGCACAAATTATATTAAAGTTAATTTATATTATATTCAGCTCTCTAATTCCTTTGTAGTATACAATCTGAACATCCGATCCTCTCTTTTTTTCTATGGCAAACCCTACATTTCCCTCTTGATTCCATCCTTTCCCATCTCCTCTGTAGCTTGCTCACTTGATTCTTTGCTTACCTTTCCAGTGGGTTGTCTTACCCACTGGATCCTCAACTCCAAAATCTTAAAAAAAAAAGTCTTCAACTCAGCTTTTATAAAGCATCAATTTTTTCTTCTCTTGCTATCACCTCCACACTTTAGCAAACTTGGCATATTTCCCGCTCTCTGTTCATCGCCTCCTTCTCACCACTTAATCCTTTGCAATATGGATTCTACCTTGACCAATGCTGCTTTGTTCAAAGGGCACCAGAAGACTCCTGATTGTTCAGTCCAGTGATCCAATGGGCTGTCCTCTCCTGAGCACTTAGACAGCAACTCTATTAACTTCTTTCTCTTTCTTGACACCTCCCTTTTGCTTCTTGAGCTCTGCCTTTTAAGTCCCTTGTTTTCTTTAACCACTCTCTCATTTTCCTTCATTGCCATTCTTCCCCTGAAAATATTTATTTACTGGAGTTCCATGATGTGACCTCATCTCTTCTTGATGTATACACTCAAAATGATCTTATGGATCTACAGATTTTTATTTATTACCTACTTGAAGCTTGCATCTCAATTATTTCCTCAAACTCTAGCTTCTTTCCTAAGCTCTAAACCTGTGTGTGCATGTTCAGTCGTGTCTGAGTCTTTGTGACCCTGTGGACCCACCAGGCTGCTCTGTCCATGGGGATTCTCCAGGAAAGAATACTGGATTGGTTTGCCATGCCCTCCTCCAGGGGATCTTCCCAACCTAGGGATTGAACCCAGGTCTCCAGATGGCAGGCAGATTCTTTATCACTAAGCCACCAGGGGAGCCCTTTAAACCTGTAATTTTACCTGATTATTGAAGAGCCCCTGAGATGTCAGGGAGGGTGGGAGGGAAGCTGAAGATGAAGGGGATACATGTATACTTATAGCTGAATTCACATTGTACGGCAGAAATCAACACAAGATTGTAAAGCAATTACAAGAGTAAGTTAACAGTTAGTGACTCAGTTGTGACCGACTCTTTGCAACCCCATGGACTGTAGCCCACCAGGCTCCTCTATCCATGGAATTCTCCAGGCAAGAGTAGTGGAATGGATAGCCATTCCTTTCTCCAGGGGATCTTCCTGATCCAGGGATTGACTAGGGCTGCCAGAGTCCTTTCTGAGTTGACTCAGATGCTCATCTGGCCTCACTTCTCTCTGGCTGTTGGAGGAGGTCTCAGGTGTTAGCCACATGTGTGCTTGATGTTCTTTACCACATGCTGCTGGCTTCCCAAACAGCAACTTATCCAAGACAGAGACAAAGATGCCACACTACTTTCTGAGCCACCAGGGAAGCCCAAAGCAATTATACTCCAATTAAAAAAGAAAGAGCCCCTTTAGGATGCCTCCTAGGCCCTTTTAAACCAGGTTTCCCTCCACTGTCATCTCAGAAGATACTAATGACATCACTCTCTTCCTCACTCACAAGTCCAGTTAATCCCCAAGTTTTGTCAGTTTCACTTGGGCAGTCGTCTGTCTCTTCAATCCATCTTCTCCTCTGTGTCCCATAACTGTGTCTCTGGTGAAAGGCCTCATAACTTTGGCTAATATAATAGCTTCCTATCTGCCCGTCTTGCGCTTTTCAATTAAATCATTCAAATTTCTATCTAAAGTGTCAAAAACTACTCATTTTTATTGCTCTCCTACATAACTTTTTCCAAATGTTCCTTACTACCTACTGGATAATATCCAAAATCCTAAGTGTGGCATTCACAGCCCTTCAAATTTGACTCAGTAATTTTCCAAAGTTGTCTCTGGAGCAGTATCATCCTTATATACCTTTAAAATTTTTTTTGTTTTGAGATAATCGTAGATTCACAAGCAGTTAGAAGAAACAATATAGAGAGAATTCAAATACCCTTCAACCACTTTTCCTAAAATGGTAACACTTTGCCTGACTATTGACAATATCATAATCAGGAAATTAACATTGGTACAATTCACTGACCTTATTAGGATTTCTCGTTTTACACGTGTTCTTATGTATGCATATATTTAGTTCTGTACATTTATATCACATGTATAGGTTTGTGTGATCACCACAATCAACCAAGGTCTAGGCCATTCCATCACAATGATTCCTGGTGCTGTCGGAGTAAAGCCACAGTCACTCTTCCCACTCTAACACTCCACGCCCAACTCTGGCAATGCTTAATATATTCACTATCTCTATAATTTTGTCATTTCAAATGTTATATAAATGGAATCATACAGTTTGTAACATTTTGAGGTTGGCTTTTTTCTTTTACTATACATCTCACGAGAGATCCATCCAAGTAGCTGCATGTATCAACAGTTTGTTTTCGCTGCTGAGCAGTAGTCACGGCAGGGAGGTATGAAAGTTTAACTATTTACCAATTAAAGGACATTTGGGTTGTTTCTGACTGGGGACTACTGCAATACAAAGCTGTTCTGAACGCTGATGTATAGATTTTCGTGTAAATATAAGTTGTAATTTCTCTAAGAGAGATGCTCAAGATGTAATTACAGGGGTATATGGTAATGCCACATATAGTTTTTTCTTTTTTTTAATTTTATTTTATTTAACTTTACAATATTGTATTGGTTTTGCCATATATCAAAATGAATCTGCCACAGGTATACATGTGTTCCCCATCCTGAACCCTCCTCCCTCCTCCCTCCCCATACCATCCCTCTGGGTCGTCCCAGCGTATAGTTTTCCAAAGAAATTGTCATACTCTTTTTCCACACCATTTTACACTCCCAATGCAATATTTGTGCTAGTTTCGCTGCATCTCTGCCAGCATTTGGTATCATTTTTATTTTATCAAATAAAAATATCACTTTTTAATTTTAGTTCATTTGACAAGTAATGAGTGATAGCTCACTGTGGTTTTAATTTGCATGTATCTAGTAGCTAATGATCAGAGAATGAATGGCACCCCACTCCAGTACTCTTGCCTGGAAAATCCCATGGACGGAGGAGCCTGGTGGGCTGCAGTCCATGGGGTCGCTAAGAGTTGGACACGACTGAGCGACTTCACTTTCACTTTTCACTTTCATGCATTGGAGAAGGAAATGGCAGTCCACTCCAGTGTTCTTGCCTGGAGAATCCCAGGGACGGAGGAGCCTGGTGGGCTGCCGTCTATGGGGTCGCACAGAATCGGACACGACTGAAGCGACTTAGCAGTAGCAGCAGCAGTAGCTAATGATGCAAATTTCTTTTCATGTGCTTATTTACTATCTACATATCTTCTTTGGTGAAATATGTCTGTGTGTCTTTGTTCATTTTCTAATTAGAGAGTCTACATTTTTACTTATGTTTACTATTGACTTTTGAGATTCTTTATATATTATCAATAACCTTTGTCAGATATGTGGTTTGCAAATATTTTCTCCAAGTCTGTAGCTTGACTTTCCATCCTTTTCTCAGGGTCTTTCACAAGTAAAAGTTTTTAATCTTGATGAGGTCCAATTCATCAGTTGTTTTTCTCTTATAGACTGCATATTTGGTGGAAAGTCTAAGAACTCTTCACCTAGCACTTTCTAAAGATTTTCTCCCATAGAAAGTGAGTCACTCAGTCGTGTCCGACTCTTTGCGATCCCATGGACTGTAGTCTACCAGGCTTCTCTGTCCATGGGATTTTCCAGGCAAGAGTACTGGAGTGGGTTGCCATTTCCTTCTCCAGGGGATCTTCCTGACCCAGGGATCGAACCCAGGTCTCCTACATTGCCGGCAGACACTTTACCCTCTGAGCCACCAGGGAAATATTTTATAGTTTTATATTTTACATCTAAGTCCATTATTCATTTTGAGTTGACTTTTCAATAAAGTGTGTATTTTAGGTTAAAGTTCACTTTTCTTTTGCCTATGAATGCCAATTATTCCAGCACCATCTATTGAAAAAGCAATTCTTCCTACATTTAATGTCTTTTGCACCTTTCAGCACCTTTAACAAAAATAAGTCAGGAACATTTGCTTGCTCATGCCCTTCCACTGCCCCACACTTAGTCATATTCTCCAGTCACATTACACAGCTTGTCACTTCCTGAATAATCCGTGACCTCTGTGACTGAGCTCATGAGGCTGTTCACCCTCCTGCCCTTTTCTGCCAACTTTGAGGTTCCCCTCAAATATGGACTCTGTGAACCACTCTTTCCTCCCTGACTCTTATACCACATTTACCATCTCTTGTTCAGTCCTACATAATTATTTTTTTCTTTTAGTACACTGAAAACTTCTTGAGGACAAAGAAAAAGTTTTATCTTTCTTAGTATCTCTGAAACTTAGCTATTTCTTTTTTTTTTTAACTTTACAATATTGTATTGGTTTTGCCATATATCAAAATGAGTCCACCACAGGTATACATGCGTTCCCCATCCTGAACCCTCCTCCCTCCTCCCTCCCCATACCACCCCTCTGGGTTGTCCCAGTGGTTCGATGCACAATACTGAAACTTAGCTATTTCTTAAAAGATTTGTGGAATTAAATATTTGGGGTAATTCCATAAGTGACACTTTTTGTGTATGTGGAAAAATGTAAAACCAGCAAACATTTATATATATTCAACTGTATGTATAATTTAGTAAGGAAAGATACTTTGACATTTTATTATTTGCCATGATGTCAACCACTAGAGATATATGTACATGCTCAGTTGCATCCAACTGTTTGCAACCCTATGGGCCATAGCCTGCCAGGCTCCTCTGTCCATGGGATTCTCCAGGCAAAGATACTGGAGTGGGTTGCCATGCCCTCCTCCAGGGCATCTTCCTGACCCAGGGATCAAACCCACATCTCTTAAATCTCCTGTATTGGCAGGTGAATTATTTAGCACTAGCACCACCTGGGAAGCCCATAAGTCTATGCATAGCAAACTCCAATTCATACATAATCCGAATGAGCAGGAAGATGAATTCATGCGTGAGTAAGTGACTGCCTTAATAGTAACGATCATCATGTAAACAAATTTGTCAAGGAAGTGGTTGAATTTAGAAAGCCATGAGAAGAAAAAGACATCTTTTTTAGGAGTCCTTGTTAATATTTTAATAAGTATTCTTTCTGAATTATGTCTCTTTCTCTCAACAGACACATTCTCTAACAAAAATGGGATCATATTGTACCTATTAATTTGTTACCTGCTTTATTCAATAAGCATATAAGACTACAGTATTTTAATTTTTCTCCCATTATGCTGTGTCTGTATCAATACAAGAATATTTCTAAGAAATATCCCACAAAAGGGTACCAGTTTTAACTGTGGTTTTATTTTCTCTCCCCTTCAGCTATACTATAGGCTCCCATCTCTTTGCTAAGTCCCCTCTATTATTTCTGTGCATTCTTAGCAACACCTTATACAGACGTCCTCATCCCTTCGTATCTGCAGGGGAGGTTAGCTCCAGGACTCCTGAGCATACCAAAATTCTTGGGTGCCCAAGTTCTTTCTATAAAATGGCATATTTGCATATAACCTATACACATCCCCCATTTACATTAAATTGTCTCTAGGTGACTCATAAGAGTTGATACAATGTATATGTCATGCAAATAGTAGCTGGTAGGCAACCTATTCAAATTTGCTTTCTAGAACTTTGGAAATATTTTTCCCTGAATATTTTTTGATATGTGGTTGATTGAGTCCATGACTGCAGAGCTCATGGCTACAGAGGGCCAACCATTTGTGTTTTCTGAGGAGCCTGGTAATTATCACATGGCATCTACCTTGTATTTAACTTCTCCCGTTTGCTTCCTGAGGGCTGCTATATCAGGGACTTTGGGATTTCTCAAACTGCCAAAGCCAGGCAGAGATCTGGGGAGTGGGAGAGAATGACTTCACTCCCCTTCTTATATAAACCTCTTAGAGGAATTCAAAGGGAATATCATATTGCATCACTTCAGAAAGCTTTTCAGGAAAATAGTTCTTTGAGGTGTTATTCACAAGCCTCTTTCTCCCTAATACTCAGACCTGAGAGAGGCTGGGTCAGGACCACTGCCAAGTGTCCCTTCAGCATCCACCCTTCAGATACTAAAGCTCTGATACAAGGCCAAGTTTGTCACCTTGATGCTCTCCAGAGTGGCTCCCAACAGGACTGCCTGCAGCCTTCCTGAAAACCCTTCTCACATACAGAGCCCTGTGGTGGACACGACTGGGCTCAGGACAGGGTGGGGCTGGTGGTCGGAGTGCCCCCAGAAGTTCCCTCCAAGTCTTTCAGAAGCAGAGTGGGCTGCTAACGCCGCTGCCACTGCTCTTTCTACTCTACTGTCTTTGTTATCTGGTTGAGAACCATCATTTTCCAATACAATATTGTAAAGTAATTAACCTCCAATTAAAATAAATAAATTTATATTAAAAATAAATAAATAAAAAGTAAAAAAAAGAACCATCATTTTTAATGACTCATTAGAAATAGATTCAATTTTAAAAATTAATTATATTGTTATAGTCCATGTATCTTGCACATTGTATTCCTTTTTTTTTTAATTGAAATATAATTGATTTACAGTGTTGTGCCAATCACTGGGCATATAGACTCACTTATACATATAGAGACATTCTTTTTATATTCTTTCCCATTCTGGTTATGACAGGATATTGAATATAGTTCTCTATGCTATACAGTAAGGCCTTGTGGTTTATCCATCCTGTATCTAGTAACTGACATTACATTCCTTTCTTAGACATTATCCTAGAGGAGATATTAGAAAGGACAGAATAAGAATGTTCTATGTAGTTCACGTGCCTTAAAATATCCAGCATGTGCATGAATATCTAGCATAGAACGCGGTGAATGGTACACTCAGTAAGCAATGGTTATTGTTGTCTATAGCATCCTCTCATTCCATACTCATAAAGTAATGATAATTCTTTTTGTAGAGGAAGACCCTGAGGCCCTGAGGTAGATATTTTGATCAGGGTTAGGTAACTAAATTTCAAGCCCAGAAGTGCCTGATTCCAAAGCTCTGACTGACCCCATTAAACTTTCTGTGCTGTCCCTCCCTCGCTCTACCCGCAGAGTCCTGGCTTTCAACTCTGCCTTTCACAGTCACCTCTCCACTCCTTCTCTCACCAGCCCTAAGCACAATTCGGCAGAGTCCTGGCTTTCAACTCTGCCTTTCACAGTCACCTCTCCACTCCTTCTCTCACCAGCCCTAAGCACAATTCGGCAGAGTCCTGGCTTTCAACTCTGCCTTTCACAGTCACCTCTCCACTCCTTCTCTCACCAGCCCTAAGCACAATTCGGCAGAGTCCTGGCTTTCAACTCTGCCTTTCACAGTCACCTCTCCACTCCTTCTCTCACCAGCCCTAAGCACAATTCGGCAGAGTCCTGGCTTTCAACTCTGCCTTTCACAGTCACCTCTCCACTCCTTCTCTCACCAGCCCTAAGCACAATTCGGCAGAGTCCTGGCTTTCAACTCTGCCTTTCACAGTCACCTCTCCACTCCTTCTCTCACCAGCCCTAAGCACAATTCGGTTCCCATACTATTTTCCTCCCCTTGCAATCCTTCAAACACTCTTTAGAATTATTTACTAGAACTTGGTGTCAAATGACATAGTGAATGCTTGCATATAAGTTAGTAGATACTAAATTACCCTAAACAGTGTTCTACTTGATATAACAGTTTCAAACTTACACATTCAGTGTTTGTCAGAAGGCAGTGAAGACTTGACACATGCCTCAATGGCACCCCACTCCAGTACTCTTGCCTGGAGAATCCCATGGGCAGAGGAGCCTGGTAGGCTACAGTCCATGGGGTCGCTAGGAGTCGGACATGACTGAGCGACTTCACTTTCACTTTCCGCTTTCATGCATTGGAGAAGGAAATGGCAACCCACTCCAGTGTTCTTGCCTGGAGAATCCCAGGGACAGGGAGCCTGGTCGGCTGCCGTCTATGGGGTCACACAGAGTCGGACACGACTGAAGTGACTTAGCAGCAGCAGCATGGGTAAAAAGTATTACAAAGTGAAATTAAAAGAGCTGTGTATTTTTGGTTCTGTTTATATTAAGGCAGAATACATATTAAATCATTTGGTGAAAAGTCTCAAAGAATATAGTCATCTGCATACATCTCTAGCATTACACACTAATTATTCATTGCAATGAAGAAAAAAGTGCTTATTTTTAAAATGTTACAGATGAAGTAAAGCAATTAGAATATATGTATATATCATCTATGATGTGCAATGATTACATGTTATAAAACAGTCACTTTCAAGAAAAATAGCTTTTACATAATAAAGCATAGGAAAAAAATCCATAGTAATATAAACTTTGGAGTTTAAATGTTTGCATTTTAACCAGGAAGGCAATTAATTCCTAGCATCGAATATTAGAGAAATTCTGCTTGCTAAATAGCTGGAGACTCAACTTTGTCTACCACTGTTATTTCCTGTCAGCTAAGGTAAAATGGGCTTCCCTGGTGCCTCAGCTGGTATAGAATCTGCCTGCAATGAGGGAGACCCAGGTTCGATCCCTAGTTGGGAAGATCCCCTAGAGAAGGGAATAGCCCTCACTCCACTATTCTTGCCTGGAGAATTCCATGGACAGAGGAGCCTGATGGGCTACAGTCCATGGGGTCACAAAGAGTCGGCCATGACTGAGCAACTAACAGTTTCACTTTTCAAGTCAAAAATACCAAGAAATGACTGTTCTTTTTTTGTGTATTTGATGGATCTTTTTTGGTTATAATTCATTAGTGTTTACTATGTACCAGGTTTTGCACCAAGGCTAATTATATTCATTCTCTCATTTTATTCTTCTTCACAATACTAAAAGGTAAATATTATCACCATATTCAAATAAGAAAGTTCATTCAGATGGCCCCCAACTTGGGCTGGTTCAACCTGAAATTTTTTGAACTTACAGTGGTGCAAAAGCAGTATGCATTCAGTAGAACCTGTACTACAAATTCTGATCTTCTCCCAGCTTATCAGTGCGTGGTAGAATATTCTCTCCTGATGCTGGGCAGTGGCAGTGAGCCACAAGTCTCAGTCAGTCACGCAATCATGAGAGTAAACAACCAATACTCTCACAACCATTTTGTACCCAGCCAGCCATTCTGCTTTTCACTTTCAGTACTGTATCCAATAAATTATATGAGACATACACACATTGTTATAGAAGAGGCTTTGTGTTAGATGATTTTGTCTAACTGTAGGCTGACATAAGTGTCCTGAATGCATTTAAGGTAGATGAGGCTAAGCTATGATGTTCGACGGGTTAAGTGTGTGTGTGCTCAGTTGCTCAGTTGTCTCCGACTCTGCAACCTCATGGACAGTAGCCCTCTAGGCTCCTCTGTCCATGGAATTTCCCCAGGCAAGAATACTGGAGTGGGTTGCCATGCCCTCCTCCAGGGGATCTTCCCAACCCAGGGATCGAACCCGGGTCTCTTATGTCTCCTGTATGGGCAGGCAGGTTCTACCACTAGCGCCATCTGTTCAGTTTACCATGGGTTTATAAGCCCATCAGGATGTAACCCCATTGTAAATGGAGGAAGAACTATCAGATCAGATCAGTCCCTCAGTCGTGTCCGACTCTTTGCGACCCCATGAATCACAGCACGCCAGGCCTCCCTGTCCATCCACCAACTCCCGGACTTCACTCAGACTCACGTCCATCGAGTCAGTGATGCCATCCAGCCATCTCATCCTCTGTCGTCCCCTTCTTCTCTTGCCCCCAATCCCTCCCAGCATCAGAGTCTTTTCTAATGAGTCAACTCTTTGCATGAGGTGGCCAAAGAACTGGAGTTTCAGCTTTAGCATCATTCCTTCCAAAGAAATCCCAGGGCTGATTCCTTCAGAATGGACTGGTTGGATCTCCTTGCAGTCATAGTGACAACAGATTTAAATAAATATGTATCATAGATATGTTTCTTAGAAAGTTACATCTTTAGCACTAATTTATAAGATTCCCAGTGTTCTGAAACCAGATTTTCCAAAAGCCTAATGGTCAGAGCTATTCCATTTTTTTTTATACACTTTGAAGAGCCCTTTGTCTATTTCCTCTGTAAAATAGGAATTGAGTGTATCTGCCGAATGTGTTGTGGGGAGGAAAATGGAGGATAATTTAGACAGTTCAAAATAACCACCATAGAGAAGAGGAAAAGGAGCTTACTCTGAAGTCCTGGAAAAATAGGTGTTCAGGAGATAAGAGTGATTCAGAGTCCACGTTAGACTTCTCTTTGCCATTAAAGATGAATTACATCAGTAAGACTTTGAAATTTTTAAGGCAGCCCTTAAAATCCTTTACTATCTGGGGGAACTCAAGAACTTAAGTGGAATAACTTGAATAAGCAGTTCTGCCCTGAGAATCCCATGGACAGAGGAGTCTGGCAGGCTACAGTCCATGGGGTCTCAAAGAGTCGGACACAGCTGAGGTGACTTAGTACGCACACACAAGAATTTAAAAGGTAATCTCCTGCCTGGAATGGGAGCAAGATAATAGAAGAGTAGGTAGCCAGGAGCTGTCACAAGAAGTAATATAGACTGCATCAACATCCTGTATTGTATGTCATATCCCTTAATTGAATTATTATTTTTTTGATAAATAAATCACTGCTCAGAGCTGCTGGTAGATTCTTTAGTGGAATTTCATTGATATCTTAAGATGGCCAGAAATCACATCCATACACACTGAGCAGGCTTCCTAGAAGATTCAAGGCTTTCCTCTCAATTTGTTTCCTCTGATTCTTCTTTGCATATAAAGCACTTCTTTCTATCTTGTAGCTTCACTATAAAAAGCAAGCACATTTGTAGCATCATATGAGACTCCTCTAAATGTGTTATAAGGAGTTTCCTTGGCAACCACTTTGGGTTTATACACAGCAATCTCCTCCTTTTATGATGTACAACTAACTTCTTGATCCTGCAGTTTTTAAAGTTTCTTTACCACTGCAGGAACACAGTGATAATGCCTGTAACTTACTTCTTGGATATTATAAATCGCAGTTGAATAGCTCTCTCTCCTTAAAAATAGTTCCATGACTAGTAAATGAAAAGAAGAAAGACACAAAACTGTACACACAACATAATCATAGCTCAGAATCTAAAAATTGATTATATATAGAAAACAAAAAGCACAGCAAAATGTTAACTATAATTATCTCCTAATGGTAGAAATATAAAAATGTTCTTTTATATTCATTTCTGTTTCATCCCCATATTTTACTTAATGAGCATATATTTTCATAACTAAATATTAAACAATTTTAAATTAAAGTAACCATAGTATGACTGCTTCACATGGAGAAGGAAATATTGTTGGACTACATTAACACAAGGAAATCATGGAGATTGGTCTGATTTCCTCATTAGCCTTCAACAAAGAAAAATAGTGTTCAAGGCTCCATGCTGCACATAAATTCAAGGACAGTTAAAAGGTGGTAAGTATTTAAATTTCTTCCTAGAGAATGATTTGCAACCTTATTAAATTTGGGATAGACAATTATTAATGGAATCAGAGTAAATTTTAAGCTTCTTAAGAAATACTTTGTCATTAAACTCCTTCATGTTAGCAGAACCTTTAGCTCTTCAGAATTAAGAGTTAGAAATGAAAGATTCTAACAACATTAACCTGTCCATTCCAAGGTACAAAATATGAGATGCAATTATTTTGTTAAAAGAAATATTTTTTAAAAGATGCATTTAAGCATATCTAATTTATATTTTCAAAATTCTCTCCCTTTTCAG
Seq C2 exon
GTAGTATATGATGAAGTCACAGAGCTCCAAGGACATGTCTTAATGCTTATTGTAAAGAGCAAAACCACGTTTGTAGGAGCAATTAACATCCAACTCTGCAGTGTCACACTCAATGAAGAAAAATGGTATCCACTAGGTAACAGTATAATTTGAGCATTGCTTTGAACATACAGATTCATTAACTACTCATATTTTTTTCACTTTTGGGCCTCTCTATCACAAGATCAGGACATTTTTTTAATCAAAGGTAGTGTGGTAAATTAAGGACACAGAGAAAAGAAATCAGAATCAATGTTTTTAGTTATTTATTCTCTGTGTATTTCACTGTTTTCTTAGAACCATTTCTCCAATTGATTGTGTAAATTCAATATGTAAAATAATAAAAGGATATTTTAGTGTATCTTTTAAATCAAACATGCGTGCACTTTATAATTATGTGCCTATAGTTAAAAGCAATACTTTTAATGTAGTTTTCAAAAAAAACCAAAGCAAATAAATCTTATCACTTCAAGACC
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSBTAG00000020715:ENSBTAT00000043102:31
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.095 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0016825=C2=FE(49.4=100)
A:
NA
C2:
PF0016825=C2=PD(34.9=56.9)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]