RnoINT0048868 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000052688 | Dnah2
Description
dynein, axonemal, heavy chain 2 [Source:RGD Symbol;Acc:1565087]
Coordinates
chr10:56139393-56152140:-
Coord C1 exon
chr10:56151958-56152140
Coord A exon
chr10:56139449-56151957
Coord C2 exon
chr10:56139393-56139448
Length
12509 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CTGGTGAGT
5' ss Score
10.1
3' ss Seq
CTGTTTGACGTTCTCCTCAGAGC
3' ss Score
9.39
Exon sequences
Seq C1 exon
GTTTTGCCTTCAAGATGGCAAGCAAAGCGGAGAAGAAGCGAAAAGTGGGTGGCCGGGGAGGCCCCCGGGCAGGCCGACCTGGCCGACCTCCTCAGTCCACTGTGGCCCCAGGAGTTGAGAAGGAGACTTCTCAGCTGCCTATCATTCCGGAGCCAGAGTACGAGCCCATGAAGGAGGAGTCTG
Seq A exon
GTGAGTACTTGCTGAGACAGAGGCTGCCTAGAAATGGACGGCGGGGAAAATTAGAGAGGCTTTATGAGTGCTATTTTTTTTTCTTTTTTCCTGAGACAGGGTCTCTCTGTGTAGCTCTGGGTGGTCTCAAACTGGCTAGGTACACCAGGCGGGCCTGGAATTCAATGGGCGTCTGCCTGCCATTGCCTCACAAGCCCTGGGATTGAAGGGGGCACCACCATGCCCACCTCGGTGTCAGGGAGCAGGACCAAGAAGCAGGATGGCTGTGATATTGTATCTGAAAGGCTTTCCACGGAGCCTCTGCCCTTCTCTCTTTTCTTTTTATATGTGCACGTGTCTACTTCCTGGCTAGCCTGCTATTTATTCTCTCTTAAAAATTTCCCATCCATGTGCCAGCCAATTCTTCCTCTAGCTTCTTCCTCATTTCAAGTGTTCCTGGTTGTTCCCACCCCACCGTAGAGGGTTTGCTCTCTTCCTTTTTCCCTATTTTCACCCTGGGTGGCAAAACAAATAGTGTTTTTCTTCCATTAAGCCCATCACCATGGAGACCCAGCCTGCTCTGCCACCCTTTGATTCCTAAGCCCGGCTGATGCTTGCTACCATCTGTTGAAAGCTCCTGTATTTTCCTCCTCATCTTGGCAGAGACTTGGTCGGTTGTGGAGGTTCAGGTTCAGGGTGACAGGAAGAGAAGCCTACATGGAGAGAACAAAGAGCTGCCTCTTGTGGCGTTGATCCCGGAGCCACCGTGGTTGGAGGGGTTGGGGGTCTTGGTTGCTGTCAGTTGCTTTTCATTTAGATCCTGTCCAGTGGCCTGAGGCGGTGAGCCAGGTGTAGACCTCACCTTTAAAGCCCGACTTGCTGGTATTGCTAGTCCTGTAATGATGAAGAGAAATATAATCTTCTGTTGACCTTTAAACTTTTATTTAATAAGTATCTTACTACTCCTACTACTTCTCTTCTTCTGTTATACGTATTGGTGTTTTGCCTGAGTTCGTCTGAGCACCACATGCATATATCTGGTGGAGGCCAGAGGGTCAGACCCAGCCTCCCCTAAAACGCCAGTACAGATGGTGAGCTCCCATGTGGCTGCTGAAGTCAAACCTAAGTTCTCTGGAAGAGAAGCCAGTGCTCTCAACCACTGAGTGATCTCTCCAGCCCCTAATTATTTAATTATTTACTTACTTGTTTAGTGTTTGCATGCAAATGGAGGGGTGTGCCTGCTCATATCACGAATACTAGAGGTCAGAGGACAACTTTCGGGGAGTTGGTTCTTTCCTTTCACCACATGGGTTGTAGGAATGACACTCATGTGGTCAGGCTTGGTGCTAAACACCCTCATGTGCTGATCCCTCCCCATCCGCTCTTTTTTCCTTCAGTGTTGAGGAGGGTTGAATCCTAGGCCTCATGCATGCTACGCAAGTGCTCTACCACACTGTAATGGGACATTGGGAATAGGCTTAGGGCTGTGGGTGTGCTAGCCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTGAGATGGGTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTTTTTTTCGGAACTGGGGACCGAACCCAGGGCCTTGTGCTTGCTAGGCAAGCGCTCTACCACTGAGCTAAATCCCCAACCCCGATGGGGTTTTCTTATGTATCTCAGGAGGGCTTTGAACTCTTGTTCTTGCATTGAATTCTTTTTTTAATTTTTTTATTAATTTTTATTTATATTGGTATACTGTAGCTGTCTTCAGACACACCAGAAGAGGGCATCAGATCTCATTATAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGAGTTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGCCAGTGTTCTTAACCACTGAGCCATCTCTCCAGCCCTTGCTTTGAATTCTTGACCTTTCAGTTTTAGTTTTCCAAATTCTGGGACTGTAGACCTGAGCCTTTGCTGGATCCTCGCTGGTATTACTAGTAAGGGGTAGGAGGTGAAGTGCAGGCCTAGTCTTCTAGAAATGCGTAACATTACCATCTCTGATGTCTCATGTGCCCAGGTCAAATCAGTTTAAAATTGACTTGCTCCAAGGAGCCTGGTACCAGGAGGAGTTGGGGGATGCAGCAGGGAAGGTTTGGCTTGGAGAAACTTCTGAGAGACAAATAGAAAATGTTTCAGAATGGGTGCACCAATCTTCAGGTACCACAGAAAACCTATCTCTCTTTTTTTCTTTCTACCCTCCCCAAGACAGGATTTCTCTATGTAGTTCTAACTATCCTTGAAATTGCTCTCAACTTCAGGCCAGGCTGGCCTTGAACTCACAAAGATCTACCTGCTTCTGCCTCCAAGGTGCTGTTATTAAAGGGGTGTGCCACCACCACCTGGCTTTTTTTTTTCTCCAAACTTTTTTATTTCCTTTTTTTACTGGTTAGTTTTGAAACAGGGTATCCTATGTAGTCCTACCTGTCCTGGAGCTTGCTATGTAGACCAGGCTGTCCTGAACTCACAGAGATCTTCCTGCTGGGATTAAAGGCATGTGACGTCATGCCTGACCCTGAAAAACCCTTACCTGGGGCTGGAGAGATGGCTCAGCGGTTAAGAGCACTGACTGCTCTTCCAAAGGACCAGAATTCAATTCCCAGCAACCACATGGTGGTTCACAAGCATCTGTAATGGGATCTGATACCCTCTTCTGGTCTGTCCAAAGACAGTGACAGTGTGCTCACATACATGGAATAAATAAATCTTTAAAAAAAAAACCCTTACCTGTTAAAGAAATATTTATTTGTAAAGGTTTCTAATTGTGGGTGTGTGAGAGAGTGTGGATTTGTGCACATGAATGTAGTGTCAAAGGAAGCCCGAAGAAGAATGTGTTGTTGTTCTCTGGAGTTGGATTATAGGGGTTGTAGGCCATTTGGTGTGGGAGCTGGGAACTGTGAAGAGCTTGGGTCCTCTGCAAGAGCAGTGCGTTCTCCTAACTGATGAGTTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTTGCACACTTGCAGACGTACATGAATGAGGAAACCAGAGGCTGACACTGGGTGTCTTTCTCAGTCAATCTTATTTTGTCTTAGACAAGGTCTTTCACTGAGCCTGGAGTTTGCTGATTGGCTAGACTGGCTGTACAGCGAGCCCCAGAGGTTTTCTCATCTCTGTTTTCCCAGCAGTGAAGTATAGGAATACGCACCCAGCTCTTCACATGGGTGCTGGGGGTCCAAATTCAGGTTTGCACAGCAAGCACTTACTGGCTGAACCAGCTCCCAGCTCCCAGCTCCCAGACCATCTTTTTAGATTTCTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGCGTATTAAGAGCACTGATTGTTCTTCCAGAGGACTGGGTTTGATTCCCAGCACCCAGATGGTAGCTTACATTTGCCTGTTACTCCAGCCAGTTCAAGGGCGTCTGATGCCTTCTGTTTTCCACAGGCCCCAGGTATACAGACATATATGCAGGCAAAAATACACACATTAAATAAAGGCTTAAACATTAAATTTTCTTTTTCGTAGCACTGGGAGGTGAGCCCTGGGCTTTAAGTGTTGATCCTACCTTTGAGCTGCACACGGAGCCCTCCTGACCTTTGCCCTACATTCTATTCTGTTACCATTAGAAGAAAAATTATAGTCAGGCCTTCTCTGCATTTCTCAAAACTCTAGCCAGGCATGGTGGCTTGAGCCTTTGATCCCAGCACTTGAGAAGCAGAGACAAGAAGATCTCTATGAGTCTGAGGTCTGCCTGATCCACAAATTGAGCCCAGGATAGCACCAGGGCTTGTTATACTGAGGAATCTTGTCTCAAACCCCCACCCTCCAAACCAACAGACCAAGGAATCCTGCCCTGTTTGATTTCCTAACAAGGGCAAGTCAGGTGACTAAGGGGTTAAAGGTACCTGCTTCCAAGTCTGATGACCTGAGTTCTATACTTGGAACACACATGAGAGAAAGCAAGAACTGACTCCTATAAGCTGTAGTCTGACAGCCACATGCACACGGTGGCACCTTTGTGACTGCTCCCACCCTGACACAACGTATTTAAAAAGATCCTGAAACCTCTAGCTTGCAAGTTCCCGCCCCTATAAAGTCTGGCGTATAAACTTATTTGGTGGCAAAATCTAACCTAAGCTGACACAAAGGTATTTATGGTCTGTTCAAGCCATTTACTATAAATATTCATATATTTTACTGCAGAAATATGGTAATAAAGTGTGGTCGTTAACTATTGCTCTAGAGCTCTCTGGAACGGGACCAAGGATTTCATGCTAAACAATGTTACATTACTTTTGTTTTTTTGAGACAGGATCTCATATAAGCCAACTTGGCCTTCAATCTCCTGTGTAGCCAAAATTGATCTTCGTCTTAGGGTCTCTACTGAACAATGAAACACCATTCCCAAATAGCGAGTCGGAGAGGAAAGGGTTTATTTGGCTTACACTTCCACAGTCCTGTTCACCAATGAAGGAAGTCAGGATAGGAACTCAAACAGGGCAGGATCCTGGAGGCAGGAGCTGATGGTCTTGATGGTCTTGGAGGGGTGCTGCTTACTGGCTTGCTTTCCCTGGCTTGCTCAGCCTGCTTTCTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAGCTGGGGACCGAACCCAGGGCCTTGCGCTTGCTAGGCAAGCGCTCTACCACTGAGCTAAATCCCCAACCCCCTCAGCCTGCTTTCTTAAAGAACCCAGGACCACCAGCCCAGGGATAGCTCCACCCACAATGGGCTGGGTCCTCCTCCATTGATTATTAATTGAGAAAAATGCCTTACAGCTGGATCTCATAGAGGCATTTCCTCAGCTGAAGCTCCTTCCTCGTTGATGACTCTAGCCTGCATCAAGTTGACACACAAAGCCAGCCAGTATAACCTTCAACTCCTGATCCCCCTGCCTCCATCTTCGGGGTGTTGGGATTGCAGGCGTGGCTGGCTGGAGCTTGACCTCGGAGCTTCATGCATGCGTGGCTAACACCTCAGCTGCATCCCAGCCCCTGGGTCACACACGATGTCACACATGGCATCACAACCTTAAATCTTATTCTGTCCTGTTCTAGAGCTGGATCTTGCTCTGGTAAGCACAGGCTCTCCCTCTGGCCTACACTCTAAGCTCCATACAGTTCTGACTTCAGAGTATTTCTGATATCAAGAATGTGGATAAGGGATCATAGGCGGAACAGAAAACTGTGAGGTTAACACATCTCTGTTCACCATCCCTAGGCTTTCTTCTTCCTCAGAGGCCACTGCTGTCTCAAAGCGGGATGTATTTTCTACTGTTGCTCAGTTTTCTCCATAGATCCATGAATGTTGTATACTGTTGTGGCATTGCATGTCTTTTTAAGATAGGGTTTCTCTGGCTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGGGTGGCCTTGAACTCACAGCTTCTGCTTCCCAGTGCTGGAATGAAAGGGGTGTGCCAGCACAAATGCCTTGGTCTCAATTGTGTTAGAGTTTCCACTCGGTCTCCTGTAGCTAAAATTTCTTCTCTTGGGGAGATGTCAGCAATGTCTCCCTCCATGGTCCTAACACAATCCGCAGATATATATATATATATATATATATGGTTTAGTGGTCTGTCTTACCGAGCATAAGTGAGGGGCTCCTTACAGGAGTAGGAGTCCTCCATCTGGGGATGTCTTTACTCAGCAGGGATAGTATTTTTCCCATAACAGCATAGATAGAACCCCTCTCCCCCTTAGCTCTTCTTCATCTGTATACACTCTAGCCTTGCCCCGAGACCCCCAGGCCATATGCAGTTAGGGCAGAATGGCAAACAAGTGGTTAAAGGAGGTGGGAGATGCTTAGGTGAGGCTTCCCACCTCTCCTTCCCTGTTTTTATGAGTGAAGGGCACAGGTCAACAGCCCCAGCTGGGGTAATGTTGTGGGAGCAAGCCCAGCTGAGCTCTTGAAGAGGATGGTGGCCATTTGGCCATTTGGCCATTCGGCTCAGAGGATGGTCCTGAGTGAAAAATGGAGAGCCATTAGTTCCCCAGGAGCTCAGCATCTGCAAATCATTCATTTCATTTTCTCATCTTTTCCTTCTTTGTCCCCATCCCTTCTTTCTGGCGGACAGGGCGTCCTACCCCCCCCCCAGGCCTTCAGTTCTGTCTAGTTTGTCCCTTCCTCTCTCCAGTCCCCAACAGTGGGGAACCTACTGGTTTTGTCCTGTCTCTAGCATGAGCAGAAAGTGCCGAGGCAGAGGCAATGTGGGTTTGTGGGACCCCAGAGCAGATGAGGCAGAGTGGGAGAAGGGCCAACATCTGTGGGCCCCTCCTTCCCCCTGCGGGAGGAGCCTGCTGGAGTGGAGAACCTAAATGTTGGGATAGTCCTAGTTCTAATTTCTCATTCCCCGAACCACTTGCATCTTGCTCTGGCTAGCTTTAACGTTATTTTTATTCGTTAGTGTTATTTTATAACACTATCAACATCATCATCATTATTATTATTGTTATTGTTACTGTTATTGTTATTATGCATGTGTGCCTGTGTATGTGCACAAGTGTTGTGGTGCATGTGCACAGGGCCATTCTCTCCCTCCACTGTGGGTTCCTGGGACTGAACTCAGATTGTCAACCCCAAGGGCAAACGCTTTTACCTGTTTAGTTATCTTGCTACCACCAGCACCAGCTTTTTAAAAAGATATTTATTTTCTTTGTAATGATTGGTATGTGAGTGTGTGAATGTGTGTGTGCGCCTGTGTGTGCCTGTGTTTCTGTGTGTGTCTGTGTCTCTGTGTGTGGTGTGTGGGTGTGTGTGTCTCTGTGTGTGGTGTGTGTGTCTCTGTGTGTGTGTCTCTGTGTGTGGTGTGTGTGTCTGTGTCTATGTGTGTTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTCTATATGTGTGGGTGTATGGGTGTGGGTGTTGGTATTGTTTATCTTGTGACTGTGTGTGCTGGAGGAGACCAGAGCTGTAGGAAGTCCCTAAAGCTGGAGTTACAGGCTATTGTGAGCCATCTGACATGCGTGCTGGGCATCAAACTCTGCAAGAACAGTATGTTATTTGTATGTTGTTTGTATGTTGTTTGTATGCTTGTCTGTTTATATTTTGAGACAGGGTCTCACTATGTGGCCCTGACTGTTTTGGAACTCACTATGTAGACAAGGCTGGCCTCGAACCCACAGAGACTCACCATGCCCTGACTCCTGAGTGCTATTGTGTGTGCTTTTAAGGTGATTTTATGCAGCTCAGCTGGCCTGGAATTGATTCTCCCACCTCTGCTCTCCCTCCACTGGGCCGTGTAAATATGTGTGCACTACCACACCGAGATTTCAAACAGCAATTTTAAAAATCAAACATGTTAATACAACACGATCCAAAGACACACTAATTTGATACTTACATGCTGAGGAGGGATGCCAGGAAAATATTAAGGTCTTTGTTTTCTATAATTAAACCATTATGTTTTTATAAGAACAGAAAACTTGGTGTGTACAGTAAAAACCCTGCAGTTCATAACATACAATAGTGTCCAATCTGAGCTGAGGTGTTTCAGGAGGTATTTGTTGGCGATGTGTTGGTGGTTTGTGCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTTTATGTGCTTAGGATCAAGGCCATGATGAACTTACAGAATATGGTGATGGGTGATGGCTGCCAGGCGTACCTCGGGCTCATTATGAGTTTGATTTTTTAATTTTTTAAAAAAGATTTTATTACATTTTATTTTTATTTATTCTCCGAGTGTACATGTGCTGTGCAGGTGCCACAGTGTTTAAGTGAGGTCAGAGGACAGCTTGTTGGAGTCCGTTCTCTCCTTCCACCATGTGGGTCCCAGAATCAAACTCAGAGCCCCAGGCTTGGCAGCCTAAGCCTGTACCCACTGAGCCCTCCTGTCAGCCCCTTACATTCATTTTCATCAAAAACCTCTTACTGTTGTCAAAAATGTCCAATGCCCATGTTCTGTTATGCAATCCCATATGGGGCTGCAACCCACATTGAAGAACCTGGACCCCGATGCATACAACCCACTGTTTTTTGACATATTTAATAGCTGTGCAAGCATCAGTACTACCCAATTTTAGAACATTTTTACTCTCCAAAAGAAAGCCACTTTAAGTACCCTGGCAAATTGGTGCCAGATGATTCCTGGGTCTATCTCTTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCTCCTCCACCTAGTGTATACGTATGTGCATACATATGCATATATATCTAACATAAGTAATGTATGTATTATGCATATATGTATGTGTTTTGGTTTGACTTTTGTTGCTGTGATAAAACACTGGCCAAAAACAACCCAGGGAGGGAAGGGCCCATCATTGAGAGATGCGAAGCAGATCAGGAACCTGGAGGCAGGATCAGAGCATAGACCATGGGGGAATGATGTTTACTGGCTGTTCACCATGGCTCACTCAGCTTGCTTGCGTGTGTATGTATATATGTGTGTGTGTATGTATGTATATATGTGTGTGTATGTATGTATATATGTGTGTGTATGTATGTATGTGTGTATGTATGTATGTGTGTATGTGTGTATGTGTGTATGTATGCGTGTATGTATGTATGTGTGTATGTATGTATGTGTGTGTATGTATGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTATGTGTGTATGTATGTGTGTGTATGTATATATGTGTGTATGTATGTGTATGTATGTATGTATGTATGCGTGTATGTATGTGTGTGTATGTATGTATGTATATGTGTGTATGTATGTGTGTATGTGTGTGTATGTATGTGTGTATGTATGTGTGTATGTATATATGTGTGTGTATGTATATATGTGTGTGTATGTATATATGTGTGTGTATGTGTGTATGTATGTATGTGTGTATGTCTATATGTGTGTGTATGTATGTATGCGTGTATGTATGCGTGTGTGTATGTATGTATGTATATGTGTGTGTATGTATGTGTGTATGTATGTGTGTGTATGTATGTGTGTGTATGTATGTATGTGTGTACATATGTGTGTATGTATGTGTATGTATGTATGTATGCGTGTATGTATGTGTATGCGTGTATGTATGTGTATGTATGTATATGTGTGTATGTATGTGTGTGTATGTATGTGTGTGTATGTATATATGTGTGTGTATGTATATATGTGTGTGTATGTGTGTATGTGTGTATGTGTGTGTATGTATATATGTGTGTGTATGTATGTATGCGTGTATGTATGCGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTATGTATATGTGTGTGTATGTATGTGTGTGTATGTATGTGTGTATGTATGTATGTGTGTATGTATGTATGTATATGTGTGTGTATGTATGTGTGTGTATGTATGTGTGTATGTATGTATGTATGTATGTGTTTATTGTGGAGGTGTTGCTTGCTCATATGTCTAGTTACTTACTACACAGGGGTCAGAAGAAAGTGTCATCCTGGAACTAGAGTTACAGATGAATGTGAGCACAATGTGGATGCAGGGAATCGAACTCGGGTCCTCTGGAAGAACAGCCAGTGCTCTTAATGCTGACCTATCTATCACCTTAGCCTCTTGACTTGCTTTTTTCATACAACCTAGAATCACCTGTCTAGGAGTGGCTGCCCACTATTGGTACTGCGGGCTGGTACTGCCTGGCATCAATCAACAAAATGCTCTCACACACTTTCCTACAGGCCAATATGGTGGCAGCATTTTTTAAAAAAAGATTTATTTACTTATTTACTATGCATACAGTCTTCTGCCTGCATATATGCCTGCAGGCTGGAAGAGGGCACCAGTTCTCATTATAGATGGTTATGAGCGACTATGTGGTTGTTGGGAATTGAACTTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTCTCTTTCCCCCCTCTTATTGGATATTTTATTTATTTACATTTCAAATGTTATCCCTTTCTTGGTTTCCCCTCTGGCAACCCCTTATCCCATCCTCCCTCCTGTTTCTATAAGGGTGCTCCCTCACCTACCCACCCACTCCCTCACTCCTCCCTGCCCTGGCATTCCCCTATACCTGGGCATCCAGCCTTCACAGGACTAAGGTCCTCTCCTCCCATTGATGCCCGACAAGGCCATCCTCTGTAGAAGTCCAGTGCGCTATCCATTGCGCCACAGAAGCAGGTCAGACAGTGCTCTGAACCTCTGAGCCATCTCTCCAGCCCCTAGAAGCATTTTTTTTTTTAAATTAAGATTCCATCTCTCCAGGTGACTCTAGCATGTGTCAACTTGACAAAAAAGCTAACCAGAGCAATGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGCGCGCGCGCGCAGTGTGTGTTGTATTTGGATATGTAATTGCAATGGTGGTTAGAGGCCCACCCAAGGTGTTGGTCCTTGTCGCCCACCTTGTTCTCTTTGTTGTCTTTTGGTTGCACCCACCACACTAACTGCTCCGTGAGCCTCTGGGATGCTCCTGTCTCTGTTTTGTTTGTTCATTTTGTTTTTTAAAAGCTGGGATTGGGGCTGGGGATTTAACTCAGCGGTAGAGCGCTTGCCTAGGAAGCGCAAGGCCCTGGGTTCGGTCCCCAGCTCCGAAAAAAAGAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTGGGATTACAGAAGCTTGGACTTCATTGTTCTGCTTTTATGTGGGTTCTAGAGACTCATATTTAGATCTTCATGCTTGTATGCAAACACCCACTCATTCATCTCCTGAGACCCCCTTTTTATTGTATTCATTTATTTAATTATTTTTTGAGACAAGGTCTCACCTAGTGCTTAAAATTGTATCATTCCCCAGGATTCCAGGCATGATCCACTGTGCCCCGTATTTGTTTATTTGGAGACAGGGACTTACTTTGTAGTCTAGGTTGGGCTGAAGTCAGGGCAATCCTCCTGTCTAAACCTCTCTATTACTTGGATTTCAAGCAAGAGCCACACATCTGGTTTAAATGATTGATCATTGGGTTCACTGTCTTATGGTGCTGGGCATGAAACCCACAGCCTTGAATGTAAAAGTCTGTCTTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCATCTATCTATCTATTCATCCATCCATCTGTGCATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATAGAGCATTGGAGTTTTGCCTGCATGTAGGTCTGTATGAGGGTGTCTGATCCCCTGGATCTGGAGTTACAGAAAATTGTTACAGACAGTTGTAGGCTGCCATGTGGGTGCTGGGAATAGAACTGAGTTCTCTGGAAGAACTCTCACGAGAGTTGGACATATCCTATTCTGTCATATTTTTCTCTGATTCATCACTTTGTCAGCTACTCAATTAGATATCACTTTTCAAACATGAATGCTTCCTTCTACAAGCTAACTTTTCCTTTACTGTTTGGGATTAAAGATGGGTATTAGGGGCAGGTCTGTATTCCAGCCAGAGGGATTTAAGGTGTGTGCTAAGGGCTGAGCCTCACCCTAATACAGTTTCAAATATCCTGTAACCTTGTCTATACTAGGGAAGAACTGGACCCTGTGCTCAGAACCTTGATTTTACAGCTTTCTCTCAGATCCTGAAGTGACTCATCTATATTCTCTTTATAGATCTTCTATGCAGGCCACTTCATGGGAATGGAATCACACACTGATGTGATGTCTTATGTCTGACTTCTTAAATTAAGAAATTAAGAATTAAGAATTAAGAATAGGGGTTGGGGATTTGGCTCAGTGGTAGAGTGCTTGCCTAGGAAGCACAAGGTCCTGGGTTCGGTCCCCAGCCCCGAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAGAATTAAGAATAAGAATAATATAGAAGAAAGTTTTCAAGGTTCAACCATATTGTAGCACGAGTCTTACCTTCCTTTTCTTATACTGAATAATAGTCCATTGTACATGTATACCAATATTTTGTTTATTCAGCCATAGCTTTAATGGACACAGTCTGTTCCTGCACCATCTTACCATCTGCCCTTCCTCCTTCCTCCTCCTTCCTCAGGGAGGGAACCCAGGGCCTTTTGTGTGCTAGGCAACTAATGGACCACTGAGCGAGCTATACCAGGGTTTCTCTGTGTGGCTCTATCCGTCCCCTGGAACTGCCTTTGTAGATCAGGCTGGCCTTGAACTCACAGAGATCCCAGAGATCTGCCTCCCCACACCCATACTGGGAACAACGCTGCTGCAGTCTTGTTCTCAAGCCACTTGGGTACTAGAAGTGGGATTGCTGGGTAATATGGCTCCTCTGTTTGACGTTCTCCTCAG
Seq C2 exon
AGCAAGATCTGGAGGAACCTGAAGAACCTAAAGAACCGGACCTTTCGACGGACGTG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSRNOG00000052688:ENSRNOT00000090809:2
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion (1st CDS intron)
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=1.000 A=NA C2=0.947
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Mouse
(mm9)
No conservation detected
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]