RnoINT0077788 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000007528 | Kcnh7
Description
potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 [Source:RGD Symbol;Acc:621112]
Coordinates
chr3:48814702-48831417:-
Coord C1 exon
chr3:48831261-48831417
Coord A exon
chr3:48815131-48831260
Coord C2 exon
chr3:48814702-48815130
Length
16130 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
ATCGTAAGT
5' ss Score
10.44
3' ss Seq
TTTTCTGTCTTCTTTTGTAGGGA
3' ss Score
12.73
Exon sequences
Seq C1 exon
GGTTCCACTTTTATTTGTAACACTCACATAATCCCAGTAAAGAACCAAGAGGGTGTGGCTATGATGTTCATCATTAACTTTGAGTATGTGACAGATGAAGACAATGCTGCCTCCCCAGAGAGAGTCAACCCAATATTGCCAGTCAAATCTGTAAATC
Seq A exon
GTAAGTAAAAGGACTCACGTCTATAAAGTCATGGCATTCCATGGCTTCTGTAGTTATCCGCATGTCAATTCTTAAAATGTATTCACAGGGGAAATATAAACATTTTATACTAGAAAGACATAGCTGTTGTTATTATTCTTTGACACTTTACAAAATTTTTCATCCTCTTTGAAAGCCATATGACTTGGGAATAGCATGATATACTTTACCAATGCCTTTTTTAAGGACAGGGTCATACTGTATAGCTCTGGATGGTCCCTGAACTCAGTGTGTAGACCAGGTTGGCCTTGAACTCACTGCACCTTCTTCCACAGTACTGAACTTAAAGGTGTGCCCCACCATGCTGATACTGAAAACACTTAGGTTGTTTTGAAGTATTAGATATTCAAAATAATACTTCATATGAGGTACACAAAGAACTTGTATTGCTTGATAAACTCTTGGCTTATACATTTAAAAATTTATCTCAGCTTAAAATTATGGACCAATAAACTTATAAAAACGCTTTAAAAAAACAACTTTATATCGATAAATCAAGGTAGTTCATACAGTTAGAGGATATTTTGTTTGTTCTGTTTAATACTTTTCCAACTTCATCTCATATACTTTAATTCATGACATAATGAACCTTTTTCTCTTTGACTGTTGCATTTTAAAATAAATTTTAAGATTTGTCTCAGTTGTATCACCTGATACGATTTGATATTGGCATTTTGAGACTCGTGAGGAAATTATACATTCTTTTTATTTGGATACATCTCTACTGGGAATGCATGGTTATTGATGTAATTGACTGTTTTCTATTGTGCCGACAAATTCTGGGTTGACTATTCCTTGTTATTGTATTAATGTTTGGTTGTCTCTGTCTACCTACAGCTCTTTTTATATTTGGTAACATTTTTACGATTCTAATAGTTGTTTTTATAAAATAGTTTATTAGATGACACATCTCTGCAATTATATAGTTTGATGAATTTATAGTTTTGGTCCTGATCCTTAATTTTTTCTAATCATGGATTTCTTTCTTTGAACAAGAAGACAATTATCTCAAAGATCTTTTGCTACCCTTCCCACCATACAATTTTATTAATAATATATTATTTTGAGCTTGTCATTGTGTTCCTAAATATCTTTAATAGTCTACTATTTGGTTTATTAGTTTGGATTATATCATTAGACTCCTAGAGTTTGACAAGTCACTCAAACTTAATCTGTCTCACTATCTTTTTTTCTCCCTGCCCAATGCTCTTTCTTTTTTGGTGTTAGTGTCAGTTATGGGACACTTTTAAATTTCTCATTTTTGTTTCCATCTTAAATTTCTAATTAAATATAATCAGTATTCACACAATCTTCCTCAGTATCCTCAGAACTTACTCTCCTCAATTCTTGCAAAGTGTTTTCAGAACCCCTTCTTATTTAACATGGTAGTAGTTTGAATGATAACTGTCCTCCAAAGCCTAGCACATTTAAATATTAACTCACCAGTTGGTGGTGCTATTTGGATAAGTTTCAGGGTATGGTCATACTGTAGTAATTATGTCTTGGGGAATAAACGTTGAGAGTCTAAAGACTCAGGTCATTTCTAGTTTACATTCTCTACTTTGTGCTTGTGGTTCAATATTTGAACTTGTTGCTCGAGCTACCATGCCTGTTTCTTCCCCTCAATGATGAACTGATTTCCCTCTAGTACCACAAGCTTAGATAATCCTTTTCTCTGATAAGTTGCCTTGGTCTTGATATTTTCTCATAACAAGAAGAGTCGCAAATAAAGACACTATTCTTCTGTAGCCATAATGCTTGAATAACAGCATTGGTAGATGGTACCAATTTGGGCATTGCCTTGCATTTGTGTTGTCCTATGCCCCCCAGTTATCTATTCATTCTTTTCTTCCTTTAAGTGTTGCTGACAAGGAGCCAATGCCAACCTCCTTGACTACAATAGTGTTTTGGGATCCATGGTCTTATATAACTAGCCATCTGGCCGTTTTCATCATGCACTTCCTATTTCTTCTCCTGTGTGGACACTCCTCTGCAAGGGACCTCTTCTGAGTGCAGTTAACCATTCCAAGATGTGTGCCTCCACTTTTTCCACATAGACTCTGTGTGGTTCTATTCTCAGTATTACCCTGTGTTCTGCTTGGCAAATTCTTTGCTCTCGTCATAAGTGATCATTTCTAGGTTTACATGACCATTAAAGTCTGAAGAGATCCCACTAAAAAATGTTGTACCTGTCCTTTATGGGTACATTGATTTGACCTCTCCCTTATTGATTTCTATGGGTTAGAGAGGATTAATATGAAAATTGGACTTATATCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTTCGCTCACCCTAAAATGTATAGGGGGTTTTAAACAATCACCACACCCTCCGTTCCTGTCCTCTCGTCCTCTGCTGCCACGTCACTATCTCCTTCTTGCTTCCCCCCTCTCATTACAACCATTTGTGATGTTTCCCCCAACATCCCTTAGACAATATAAGCTTCGCTCACCCTAAAATGTATAGGGGGTTTTAAACAATCACCACACCCTCCGTTCCTGTCCTCTCGTCCTCTGCTGCCACGTCACTATCTCCTTCTTGCTTCCCCCCTCTCATTACAACCATTTGTGATGTTTCCCCCAACATCCCTTAGACAATATAAGGCTTGACTAGGTAGCCTGCTGGCCCTAGTGATCTGCCTCTGTCTCTTTGAGTGCTGAGACTGCAACGGCTATCATGCCCACCTGTTTCTCACACCGTTTCTGGGGGTCAGAATTCAGGTCTTCAAGCTTACACGTCAAAAAGTTATTCATAAAGCTGTTTCCCTAGTTCTTACACCTAGATTTTTCACATGGATTCTGGGGTGGACCTCAAGCCCTCATTCGTTTGTGTGTGCAGTTCACTGAATGAGTCATCATCTTAAATCCACATGCAAACTCTCAGCATTATAATTCAGCACTGTTATCTACAAAGTTCAAGCTTGACAACCTCATGATGGATCTTTTTAAATTCCATACACACATATGTGTACACAGACACACAGATCACAGATGCATGCACACATACCACCACCACCAATTAAAAACAATCAAACAAAGCATAATGCTGTATGGCAGGTTTTATTCCTTGCTATCCTGGCTGCATAATGCTTGTGGTCCATGAATTACAGCATGTTCCTCCCTGTAAGGATAAACCTAAGCTTAAAACTAAATAGAACAATTAAACATTTATTATAGTATCAATTACTTCCTTTGCCTAGTCTAAATAGCAGTACAAATTAAAATTCCTCATAAAGCAAAGAAGGAAGAAAAATATTAATGCAACATAATACCAGTATCCTTAATTTTTACCCTTAAAAAATACCACATTTTNNCAGAAATTTTCTTGCAACAATCAGTAATTAATCAGTTTCCAAAATATATGTTTTGAAATAAATGAAAATACAATAAAACAAAGTCTAATTCAAAATTGTTCCTTTAAGGTAATAGCCACTTCAACTTATCTCCTCTGCTTCTCCCATTCAGTCACTACCGAATGGTCTCTGAGAGTAAATTTCAATGATACCCACCTCTATCTGCCATTAATATCTATATTTATGACTATCCATGAACATCAGGTTGCCCACATTGAGATTGAATGCCTACTCTATTTTTTTAACCATTTTCTCAAATACTTCATTTTACCAATGGAATAGTGTCTGGTGTGACCTTTCATCTGAATGGAAGTAAAAAAATAGAGGGCATACCTACACCAGAGCAGGATAGGACTTGAAAAAAAAGATAATGCATTCATTTAAAACTGAAATGCAAATATTGAATTGACACATAGGTTTCTTAAATAGAATTCTATGTAACAGTTCCCAGAGTACAAACATGGTCTATGACACTTTATTTTCTGTTCAATTGGCATTTCATGGAAAAATCCCAGCAAGGCCAGTAGAGATTTTGCTCCTTATCTTATGAATATGTGTGGTTCTCCTATGATATCACTGTCATGCACACAAGGAATCACTGGAGAGTGTAAAAGATATGCAGACACAGTTGTTTCTATGGCTTTTCAAAGTCTGATTATTTACAGCCAGTGCACTGGTTTCACTCATAGCCTTTGTCATTTTGTCCTTCATTTCCCTTAACTTTGTGTCAGACTTTGAAGAATTGATTGTTAAATCAAGCAGAAAAGTTCAAAAGACCAAAATTTTGCTTGATAACTTTACATATTAGGTCTCATCTCTGACAAACCCTAATGATCTATTTCTTAATGAGTAAAATTTTACTGTCAGTACAAAATAATGGCTTTGGCTCTTTCAAACATCTTTGGATAGAAAGACAGAAAAAATAGGGAGAAGGGAGTCATGGAAGAAATAGGAAAGAGTGGAAGGAAAGAACTAAGCAAGGAAGGGAGGGAGGGAGGAAGGAAGGAAAGAAGATGAGATTTGAATACTTTTCTGCTTGATTTAACAAGCAGATCTCTTTGGAAAAACATGTTATTACAGGGATCCCACTAGAGATGTGTACTCAAGCATAGTTTGTAGCCAATTAAAACACATCATTCCAGCAAGGTGGGACTGAAGTATAGCCCAAGCATTTAGGTCAAGGTACTTTAAAGCTAAAAAACCACATCCTGGTATCTTCCTCTTCATCTACTGTAGGAGGTTTTGTACAAGCAAACAGTTTATCAGAAGCTAAGATAAACAGCTGGAAGAGAACATTTGCACAAGTAGACAGTTTAATAGGAGCCAAGATAAGTTAGGTAGAGCATCTTGACTTTGGGTTCCTTGAATAGAATAGGATAATTTTCCTTGTAACTTTCCATCAAGAAGATTAAATTCTAGTTAAACATGAAAAGATCTCAACAAGTATCTGAGATGGTAGAACCTATATACTTCTTTACTTAGTACAATGTTAATTCCCAACATAGTAAGATTGTTAGGTTGAAGCCTACAATCCAGTCGCCAACATGTGGGTCAATGAAACTGGCCATAAAGTGTAGTTACACTGACATATATGGTAAGCACACTAAAATATATTTAAAACTCATATTTTTCTTGTGTAAATGCTTAATTTTCTTATAAAAATATGGTGAATATAATTATGAGAGAAAGAATGGAAGAGAAGAGAAAAGGAGAAAATCGTTCATTTACTATTTATTAAAGACATATATATCTGTAAATTATTTGTCTTCTTAAAAGTGACATATGTGTAGATTTTATTAAATTGAGATTATTAAGAGTAAGAAACAATGTTATCTGTACAATAGAAAAGAGAGGTTGTAAAAGGGGAGACTTCTTTATGGACTGGGGCAATAAATATTCTCAGGAAACAAATATTGACTTTAGATTCTAGAGCCCCAACATATGAAAAGCAAGCATATCTCAAGAATAAGTAAATGTTCACAATATTATTTGTGAAAGATACAGAATCAAGCACAAATAGATTACTCATGTTCCCCAATAAAACATGTGGATAAGGAAGTTATTTTATTAGCGAGTATACCTATCAAATTAGCAACTATTGTACAATGCATCAATTTAAAGAATCAATGCCAATAATAATAAAAGACAAAGTTAATTTTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTCCGGAGCTGGGGACCAAACCCAAGGCCTTGCGCTCGCTAGGCAAGCGCTCTACCGCTGAGCTAAATCCCCAACCCCCAAAGTTAATTTTTTATTTTAGGTATTGTATGTAAAATATTCTTTAAAGGTTGAAATGATATAACTTGCTAAAACTTTCTTGAGAACATTCAGGAAAACTAAAATTGAATAAAATTCTTGATTGTGATAGTTAATCTCAGTTGTAAAATTAATGTGAGCTAGAACCCACAGGGAACCAGGTCTTGGGCATGTCTGGAGCATGCTATCCCTGTATTATCTACGTCAGGTTAATTAAGTTGAGGAGACCTGCCCACTGTGGGTGGCATCATTCCCTGTGATAGGATCTGAACTAAAAGGAGAAAATGAGCTGACACATGCACTCAGTGCTGCCTGCTTTCTTATTATACATGACTTCCCATTGTTCAAGATTGCACCCTTGAGAAGTGGGCCAGAACAAAAAATCTTTCCATTCTTAACTTTTATCAGAGTATTTTGTTGTAGCAACAGGAAAATAAACTAATCTAATATTTAAACAAAAATTAGTGCATATATTTTTACCTTGTGTGATCAACTCTAAACTTTTCTCTGCTTATCTTACCAGACAAATCTCAGGCACTTTCAATCTTTCATCAATATAATATTGTGGGTCTCCACTTAAATCTTCATCACTCACTGTCAAATGATGTATTGAATTTATGCCATAATTTGGGTATATTTTCTAAGAAACTACAAGCTCCAGTTTTCTTTATTCTTAGAAAAATTATCTGATCGAGGTACTAATTGACTACACGTCTTACAACTCTATTTGAGATGCCTTATTTTTTTTCCTTTCTTTCTCCCATTTCTCCAATTACCTAGAGAAGGCACTTCCAGCCTTCTCTATAGTCTTTATGACCCTGACCTCAAATCCTTTCCTGTGTTGCAAGCTTGTGCCACAGCAGGGGTGAAGGAGGTCATTGAGTGGAAATTCCTCAGCAACCACAGGCCACCTTTGGTGGACAAATCCTAAGTGAAACTTACATAATACCCCAAGGATCTGTACTATCCTGCTCCTTCAAAACCATCTTCCCCAGTCTCCCTCCCATGCCAATGTTTTCTCCTGGCCCCTTCCTCTGTTGCTCATACTCACGCTGCTGAGAATAAATAGCCTGCACTTCAACAGACACATTTTGTTTATATCACATCATGTTTTTTTAAAAGTTTTAATTAGTTGAATTTGTTGCCAACATTTAAAAATTGGATATTGCACATTAAAATTAGGATATCTGGCTGTCTCTCTTTTGAGTAGCTTGCTACACACCCCAAATGTTCCTTATAAGCCAGCACAGAATACTAGCCATCCTTTTGACAGGGCCTGTGGTATTCTATTCACTGTGTTCTGCGCACCTTTCCTTGAGTTTTGCGTGTAATTGTGGTTTCTTGGTTTCTATTATTTGCCTCTCGCTGTAGGTGTTCGAGCCGCACACGTGTTACTGTTTCCACTTTACTCTCCATTCCACAGAGCAACGTAACTGAGCTCTCTATTTACTCCCTAGATGGTCTGCTACATAGATGAGTTAGATTCCCTTCTTGTCTTTTTATTTCTAGACTACCATACTCACTGCATCTTTAAAGTCAACAGTTGTTTCAACAGCTTATGCTCACTTCCTTAATGGCCTTAGGTGACCCTTGTGAAAGGGTCATTCAGCACCTCTCAAAAGGTTGAGAACCCATAGTTTGAGAACCACTATCTTAGAGCTTCATCTATCCACTAAGCATTGGGTAAGTTCTTGGGAATATTTTGGTACTTCTGAAGTTTTACCCTTTCAAGTCAAATGTGTCTTAACATCTCTTGTCTCTCTCACTTGATCATCAGAGATGTCATGAACTAATCATCCAAAATTTCCTTCCATTGAATCTTCTTGTTTCTTACCAAAAGAGTGGACCAAATACATTTATCATGTATTTCAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTCCTTAATGGCCTTAGGTGACCCTTGTGAAAGGGTCATTCAGCACCTCTCAAAAGGTTGAGAACCCATAGTTTGAGAACCACTATCTTAGAGCTTCATCTATCCACTAAGCATTGGGTAAGTTCTTGGGAATATTTTGGTACTTCTGAAGTTTTACCCTTTCAAGTCAAATGTGTCTTAACATCTCTTGTCTCTCTCACTTGATCATCAGAGATGTCATGAACTAATCATCCAAAATTTCCTTCCATTGAATCTTCTTGTTTCTTACCAAAAGAGTGGACCAAATACATTTATCATGTATTTCAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCCACTACAATAATTCTACTCAGAACTCTGACACATCTTATTTGAGCTAATGTAGTGATTTCATTCTTGTAATTCCTTCTTCCAGCTTCTTTTCTCCAAATCTACACAAAACACTGTTGCATGCAGATTACAGTCATCTGCTGTTTCTCTCCTTTACAAATCATTCTGTTGCCTAAAACATAAAACTCCAAATTACTATATGTATGCAAAACAAAGATCTAAATCAGAGTAGCTTCCATGACTGCATTAACTTCATCTTCTACAGCTTCTCATATTTTGTAGAGTTTAACTGGAATATCCCTTGTCTAGTTGGATATTGCATTTTTTGTAGCATATCTATTTCAAAAGACTTGTTCCTGTGGAAATTGCACTTCTTGCAAGCATATCTACATGGTCCTACTCTTGTGAGAGCAAAGCACTTCTCACTTTGGTCTACTGTCACATTGAATACATCTGTTTGCCCAATAGACCATAATAAAAATTAATCATACTACAATTGTAATGTTTAAAAAATACACAAAAATGAATTTGAAAAGTCAGTACTAAAAGAAAGATGGGGACTGTAGAAATTGAAGAATATTTATCTAATTTAATGTAGCCAGAGACCTTTAAGCTTAATTTCAAAGCAGCAACATGTTCTTTCTTATACCACTACAAATCCTTTACCAGTAATAAGTATCTGTGTATGTTTGTGCAACAATAGTGCATGCATATGTTTTTAACACGCAACTATTAATTTATTTTCTACTGTCTGGACATCAACAAGATTGCTCTGGTCACAACTTTCCATTTGGTAAGATCATTACTATGAAATATGTGACATGCTTGGAAACACAAGTTTTTTACTTCTGCACCAGAACTGTTGACTCAAAAATCAAAATTCAATACTCTGTATATATCAAATACGTCATTCTCATACTATGGTTTAAGTTGACTAATATTCAAATAAAATGATTTTAGGTGAAGTCAAATGTAAATCATTTAATAAAATAACCTAAAATGTCTAAGGAGTTTATTATAACAACAACTTTCAGAAGTGAATTTTTTCACTTAAATCACGTTTAAAAGATCCTGTAATCTTTAAAAAGATTAACATTATATCTTATTTTACTATTTTTCTTATTGAAAGTTTGAGTTGTCCTAAAAGCCTCAACCAAAACTAAATGTATAAATACAAAGTACCATTTGATAACTTAGGCACTTATCTGTTTAATTTAAGCCACTAAAACCATATTCATATGTTTTGGACTCACTCAAGATAATTAACACATAAAGCATATGTTTGTCTCAACTGCTATATTACCTCCTCAAATTTGTGTCTGTTTTCTAACCCCAAGCAAGTAAGAAACAAAGAAATGCTTCACGTACTTCACTTGCAGAAAGGCTTCCACCATGCTTTCACTTGTCTCCACTGGAGCTGAAAGTCATTCTTTAATTCAATGATGAGAAGCTGCAATTTTGATACAGAATTCCCTAACCAGCACACATTACTATAGAAACCATCTGTTATTCAGTGGAATTCAATTAAAGGTTTTACAATGTAACTAATGTTTATTTTCATCTTTCCTTTGAAAGTCTCTTCCTTAAGGACTACATTTAATATAGGAAAAAAAGAATCATGACATTGTTGCAAAAACAGAGAACTTTAATTAAATTTTGCCATTGTCTCCCTATTATATAGACAAAAACATATATCTAAGATCAATGGAAGTCCTTGTGATTGAAAAAATATGTCCTTTGTTAAGAATAGATATTGATCAGCATTCAGGTCAAATAAAGTATACCCTCCTAGGGGTTCCTTATGAGCATCCTATGGATTATTTTGTTACCTAGCAACATGAAAATTAGGGGCAGTCTGTAGTCATACAGTTTTTGGGAAACTGGACTATCTCTCATTCATGTTTTGAGCATTCTAGTTAGAGCTTCCATCAGCATGACGGCTGCATGATCACCCAGAATCAATATAAGTTAAGATGTTATCACTTCCAGGAGACCTGAATTGATTCTTTAACTTGGCATTTGGAGAGGGGGAAATATATATATATACCTGAGAGAGACTAAATAATGGAATGGTAAAATCATGCCCCTATTGACTTAGTGGTTATTTTAAGCACATGGAAACCTAATCAAGCACATGCAATGTTGGTGTATTCCGTTCATTCCCCATGTCTCCTTACCGAATGATTTTAACCTTGAGTGGTTAAAAGCAGTCCATCTCATTACCCTGTCTCCCTGCTTATCTCCCTTGACCAAATCTGTTCACTGCCTCCTTTGCTGTCATGATGATGTGGCCGGACTGGAAGCAGGGCTTTACAGAATACCAGCAGCAATTTTAACCTGTTCAGAGAGGAGTGTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCAGCTGCTGCTGAGACTGTTCTCATGCCTTGCTGCAGCCTAGGCTGCCCCCTGATCCTCACACAGCATACTGAGACTCACATTACTACAAGATCCCAGTTTGCCCGTGGCTCATTGCTCTTTCCTTTGTAAGATGATACATGGAGTTTTTGGTTTGTTCGTTTTGCTTTTTCCTAGTGTTACCTGTCTTTATTAATCATATCTACTCCTTTAAAGGGCCCCACTTTTAACTTCAGCTTTAATGTCTGCCAATAGATTCTGGGGTCTGGAAAACGTTTTGTTTTGTTTTAATAATTAATGCTAAAACTGCACTGGCTATACTTGTCCATTTATCATTCATTACTCAGGATACCTAGTTGATTGGTACTAAGTACATTTGAAAATTATTTCTTCCCAATCTAGCTGCGAAAGAAAGTCTTCCTTGTCAATAGTCTGGCTTGTTCTCACATCCCCTCAATGCCATAATATACCACATCCCTCACTTAACAGTAGGAAAAACCCCTCATATTCTTTCAAGATGTTTCTAACCCAGGTCTCTCCATAAAAAGGAAAAGCTGATTGATATGTCAGACATTTTCTGTTTCTCCCATCAAATTTGATCTTTTACTGTATTTATCTGGATTAAATTCATGTCCCTCTATGTATCCACGCTGCAGAATTGTTCACACTGGCTTTAAGGCTTTCAACTCAAGTGTTATGTGTATGAATACCGTGAATTTACAAAAACCCATTCATTCCTTGCATTCAATAATTAACAATAGAATTTATTTATGACAACTTTTTTCAGAAAAAAAAAAAACCTCTTTTTCTCCCTTTTTGTACTGAACATTGTGACAAAAATTCTGAAAGTGATGAACTTTCACATACACCAAACAGCCCCTTGGGAGGTCTGACTCTTCTATTCATTGGCAGGGATGGAATTAGACAGAGTTATCACCTTTCCCAAGGGATGGTGACAGTCAGTGACTGGGTGATGCAGAGACACAAGAAGCTTCAAATGAGCACCAGAGAGTTTAAGATTACACTGGAATCCTGAAGCCTTGAGTCTTAAGGTAGTATATGGAGGTTAGGGGGAAGTTAGAAATGAATTAAGACCTGAGAGCAATGTACTGAAATCAAAAGCAACAATTCTAAATGTAGCTGGAGCTTCACCTCCAACTTCTCTACGAAGATTCAGCTGAAGATTCAGGTCCATTTGCCATTTAGACAATGGACTTTAGCTCTTTCCAGTCCATCGTGACAGTTAGCTCCTGAGTATATTCCCTTGAAAATAGTTATACAATCTCTTTTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTTCTTCCTTTCTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCCTTTGTCTCTTTCTTTCTTCCTTCCCTCTGTTGTTTTTTCTGTTGACTTATTTGTTGGTTTTTAGACAGGGTTTCTCTATGTAGCCCCAACTGTCCTGAAACTCACTTTATAGACCAGGCTGGCCTCAAACTCATAGAGATTCATCTGTCTCTGTCACCAGAGGGCTGGGATTAAAGGCTTGCTCCAGCACTGCCCAGCAACAGCCTATTTTCAATGATGCAGTCTCATCCACCCCAGTCCTCCACTAAGGGAAATCTACACTGGCAGCCTTCACTGCTTCTCCCTGCCCACTTCCCTCCCCACTCTCAAGACACCTTGGACTCTCTCCATTTGCATAACCATTTATACTTAAGAATATCTCCTCTTGGGGTTTAACTCAACTGGGAACAACCAGGCAAGAGGTACATATTGTTAAGCCACATACTGGTTTTTTATTATACTTTAAATTAAATTACTTTAATTTCAATGCACTAAAAGTTTGTAAAACGATAATAAATGGAATGAAGGAAACAAGAACTTGCAATTGAAAGAAAAATCAATGATTAAAAGCTAGGTAGACCCAATCAGGTAGCATACACTAGTTGATATGAGGCCCCGACACATAGACAGCAGAGGACTTCCTGGTCTGGCCTCAGTGAGAAAAGATGCACCTAACCATGGAGAGATTTGAGGTCCCAGGTAATGGGGAGGCTTGGTGGAGTGGGGATGGGGATATCCTTTTGGAGATGGGTAAAGGAGGAGTGGGATGAGAAACTGTCGGAGGAGTCCAATAATGACTGGACAAAATAAAAGATAAAGACAAAATAAAAGACAATTTTAAAAATCTAGGTGGACATTTTTGTAGTATTCATTTTTTCCCCAAGAAAAACTTTTTCCAATCTTCGTAGCCACCAGCATTACTTACTGCTTAAATTATGTATGTAAACTAAAGTACATCCATGGAGGTAGTTTATCAGTGTCTTTCTTTATTTCTAACGATGTGTGAGTTGTGAAAAAAAATATTGAGTTTTTTCTTCTTATTTCAGGTTTACTATTTTGGTAGACAGGAGACTAAAGAGAATCTAATTATTCAAGTAAGAAAGTAAGTTTAATATAATCTGAAGACTTAGCAAGATGTTTTACAGAGTCAAAAGCCACAACAGTTACACTTACCTATGTTCTATGATCCCTTAAGGAAGTATAGCGGGGCACAAATTTCTCAACGTGCATTCTTTCTGCATGAACTGCACGGAGACAACTGAATCTGTAATCCAATACAACGTGGTCATATTAACCTAGTGGTGCAGAAAAGACCATCTGTACCACCTTCGATGGGACTAAAACGCAGCAGAGAAATAAATGCCTGTGCGATCATTAATTTAAGAGAGCTACTGGGTGTTCTTAGGAAGGAGAGAGCGATGCAGCTGATGAAAAAATGAGTAAAAGTAGGCACTGAACTTCGGTGCATTGTAATAAAACTTGCAAAATTGATTTGTAAACTGTAACTCAATTTCATGTACATTAAAAACTAATCAAATGATTTTGATGCAGCTCACCGATTTTTAACTTGGCAATTTGTGTGAGCATATAAAAAAGGTTTGGAGAAATATGTAAAGATGCTTTCAAAACCCTTATAATGCTTTCCAACCATATTTAATCTTGTTTGTGCAGATTGCTTGCACTCGTCTTTGTGTATTAATCCACAATATAATGTTCAATACACTTACATTATATCATAATATTTTACCAGGAAAAATAAATCCTATTTTAGTTATTTTTAACATTACTTACTATTAAACTACAAGTGAAAAGTTGACATAATAAATTTGCCTGCTTAATTCTAAATTGTTCTCCAACAAGCATTTTGTCTATATCCTCTAGATGATAAAGGGCATCAGAACTCTTCTGTGTAATCTTAATGATCAAAATGGATGCCATTTAAACCATGTCTAAAAGGGTGAAATTGATAAGATTTGATCAGGTAGACAAGACATAGTATAGAGTTGCCACGATTTGTCTAGTTCTACTCAATTGTACAGTACATAAGAGCCAACACCATTCCAGGATGCTGAGATTACACAACTACAATGACCAGAGTAATTATATATTCTAATCCAAACTAAATACATTATAACTCAGTTTATTATGTGCTTGTATAACTCTATTAGCCATATTCAGGCATTCTGTCAGAACCAAAGCAAAATAAACAAGGCCTTTCTTATAGGGGTGTAGAAAAATGTTAATCGGGGAATCACTGTGTGTATTATTATCTTCTAGGGTGGAAACTGTGAAGAGATGTCCACCTTAGTTCAGAGGGAAGGACAATCCTCGCAAAGGGAGCTAATCTTGGCTCTACCTAAAGGATAAACCAAGTAGGCAGCAGAACAGGATCTTCTATGAGGGTGCTCCCCATCCCACCCACCCACTCCCACCTCACTGCCCTGGCATTTCCCTACACTGGGGAAATGGAGCCATCACAGGACCAAGGGCTTCTTCTACTATTGATGACAGACAATGCCATCCTCTGCTAGATATGTGGCTGGAGCCAAGGGTCCCTCCATACATACTCTTTGGTTGGTGGTTTAGTCCCTGGGAGTTCTGGGCTGTCTGGTTGGTTGATATTATTGTTCTTCCTACGGGGTTGCAAACCCTTTCAGCTCCTTCAGTCCTTTCTCTAACTCCCCCATTGGGGATCTGGTTCTCAGTCTACTATTGATGACAGACAATGCCATCCTCTGCTAGATATGTGGCTGGAGCCAAGGGTCCCTCCATACATACTCTTTGGTTGGTGGTTTAGTCCCTGGGAGTTCTGGGCTGTCTGGTTGGTTGATATTATTGTTCTTCCTACGGGGTTGCAAACCCTTTCAGCTCCTTCAGTCCTTTCTCTAACTCCCCCATTGGGGATCTGGTTCTCAGTCCAATGGTTGGCTGTGAGCATCTGCCTCTGTATTTGTCAGGCTCTGCAAGAGCCCCTCAGGAGATAGCTATAACAGGCTCCTATCAGCAAGCACTTCTTGGCATCCACAATATTATCTGGGTTTGGTGTTTGTATATGGGATCCCCAGGTGGGACAATCTCTGGATGGCCTTTTCTTCAGTTTCTGCTCCACATTTTGCCTCTGTATTTTTTTAAACAGGAACCCTTCTGGGTTTGAAGATGAGTGGGTGGTCCCATCCCCAAAACGGGGACCTTGTCTAATCTCCGGGTTTGATCTCTAAAGGTTCTACCTCCCCTTTGTTGGGCATTTCAGATAATCTCATCCCTGTCAGGTCCTGGGAGCCTCTTGCTTTCCTGGTATCTGGGACTTGCTGGTGCCTACCCCCAGGTCTCCATCTCCCATTGCTACACACCTCTGTTCAAATTCTTGACCTTTTGTATATCATCCCTGTCTCCTCTCATACCTGATCCTGCCCCTCTTTATCGCCCTCTCCCTCCTCTCTTCCTCCCAAGTCCCTCCCATCCTCTACCTCTATGAATATTTTGTTCCCCCTTCTAAGGACTGAAGAAGTATCCACAGTATGGTCTTCCTTCTTCTTGAGCTTCATGTGGCCTGTGGATTATATCTTGGGTAATCCAAGCTTCTGGGTTTATCAGTGAGTGCATACCATGTGTGTTCTTTTATGACTGGGTTACCTCACTCAGGATATTTTCTAGTTCCAACTCTTTGGCAGCCTATAACTTTTCAAGACTTCCAAGTGAATTGAAAAACCATTGGAATATAATCTATCTCCCTTTTTACTACCCAAACAGAACTTACAGAACTGTTAAAGACAAAATACTGTTTGGTTGCAGTACTATTAAATTACAATTACAATTACAACACTGTTAATTAAAAGACTGCTAAAGATATCTTCAAGTGTATCAAGTCCACTTCAAGCTCCTGTCTTTCTCTATTACTATCAATACCTTTTCAATCCCGTATATATTCTCATTCATTTCTCTGTCTAACCCTTGAGATAAGATGTTGGTTCTATTTTTATATGTAAATTGTGGGTGTTTACTGAATACATGTTTTTGATCTGTAAAAGCTAAAGGTCCTGTGTCATGTAAATAATATTTTCATGTCACTTGTGGTTTTTGTGATTATCAAAAGGAAAGTATATATGTGCATGTGTAAATATATATATATATATATAATTGTTCTTTTACAATATTTCTTACTAAAGCAGAATTAATTAAATATATATTTCAGTTTTTGTATAGCACTTAAATGTGAGTTGATTGTGTTCATTAATTTTATAGTATATGTGCGTAGTGTAAGAATACTCTTTTCTGTCTTCTTTTGTAG
Seq C2 exon
GGAAACTTTTTGGGTTCAAATTTCCTGGTCTGAGAGTTCTAACATACAGAAAGCAGTCCTTGCCGCAGGAAGACCCGGACGTGGTAGTCATTGATTCTTCTAAGCACAGCGATGACTCTGTGGCTATGAAGCACTTTAAGTCTCCCACGAAAGAAAGCTGCAGTCCCTCTGAAGCAGATGATACGAAGGCCTTGATACAGCCTAGCCAGTGTTCTCCCTTAGTGAACATATCAGGACCTCTGGACCATTCCTCTCCCAAAAGGCAATGGGACCGCCTCTACCCTGACATGCTGCAGTCAAGTTCCCAACTAACACACTCCAGGTCAAGGGAGAGCCTCTGTAGCATACGGAGAGCATCTTCAGTTCATGATATAGAAGGGTTCAATGTCCACCCCAAGAACATATTTAGAGATCGACATGCCAGTGAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSRNOG00000007528:ENSRNOT00000009920:1
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion (1st CDS intron)
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.120 A=NA C2=0.569
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]