DreINT0013157 @ danRer10
Intron Retention
Gene
ENSDARG00000062687 | KCNH7
Description
potassium channel, voltage gated eag related subfamily H, member 7 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:18863]
Coordinates
chr6:10254826-10277882:+
Coord C1 exon
chr6:10254826-10254981
Coord A exon
chr6:10254982-10277420
Coord C2 exon
chr6:10277421-10277882
Length
22439 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAAGTGAGG
5' ss Score
4.44
3' ss Seq
TCTCCATCTCTTCTTTGCAGAAA
3' ss Score
11.07
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Seq C2 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
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Mappability confidence:
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Protein Impact
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Features
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A:
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Main Inclusion Isoform:
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Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]