RnoINT0077808 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000058626 | Kcnh8
Description
potassium voltage-gated channel subfamily H member 8 [Source:RGD Symbol;Acc:2549]
Coordinates
chr9:3461635-3510054:-
Coord C1 exon
chr9:3509821-3510054
Coord A exon
chr9:3461767-3509820
Coord C2 exon
chr9:3461635-3461766
Length
48054 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
ATGGTAAGT
5' ss Score
11.01
3' ss Seq
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9.19
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
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Mappability confidence:
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Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
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Features
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Main Inclusion Isoform:
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Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]