RnoINT0081453 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000001466 | LOC100361492
Description
cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 55-like [Source:RGD Symbol;Acc:2320073]
Coordinates
chr1:258210344-258234479:+
Coord C1 exon
chr1:258210344-258210511
Coord A exon
chr1:258210512-258234322
Coord C2 exon
chr1:258234323-258234479
Length
23811 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAAGTAAGT
5' ss Score
9.72
3' ss Seq
ATAATTTTTCTTATTTCTAGTTC
3' ss Score
7.91
Exon sequences
Seq C1 exon
ATGGATGCAGTCCTGGTTCTGGTGCTCATTCTCTCTAGTCTGCTTCTCCTCTCATTCTGGAGACAGAACTCTGAGAGAAGGAAGCTCCCTCCTGGTCCCACTCCTCTCCCAATCATTGGAAACATCCTTCAGATAGATGTGAAGGACATCAGCAAATCTATTAAAAAA
Seq A exon
GTAAGTGCTTTTAAAACTTCTTCATTATGTTAAAAAAGATAACTAATCACTTCTATTATTTAACTGTATAATTGTAATGTAAATATTCCCATAGGTTTTTATACTTAGAGTGGCATCGTCAGAAACAGTGGAATTCTATAGTGTATGTAAATTCTTTCTCTGAGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGAGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGGTGTTTGCATGTGTGGGTGAAGATGTCCAATATTGAATTTGAGTGTCTGTTTTAATTGGTTTTCTACATTTCCCTATATCTTCCAGAGAAAGCAATTTTTTGACACATACTTGCAAGGTAATATGTTGTGTATGTCTACACATGTATTCCATACATGGCCTCAGTTTTCATTAAAGGAGTTCCTTTTTTCAGTGGATAGTGATTATGGCAGAAATTCACAACTGGTCAAAATGCAGAGAGTAAGAGACTGTAGGGTACTCTGCCACAAATGTGACATCTATATCACCTGTGACTATTCACTGGGACATACCCTTAAAGAAAATTAACTCTCCAAAAGATGCTCCACCATATAACAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCTAGAAGCTGGAAACAACCCAAATGTCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTACACAATGGAATACTACTCAGCTATTAAAAAATGACTTTATGAAATTCATAGGCAAATGGATGAAACTAGAAAATATCCTGAGTGAGGTAACCCAATCACAAAAAAACCACAAACGGTATGCACTCACTAATAAGTGGATATTAGCCCAAAAGCTCGGAATACTCAAGGTACAATACACAGACCACATGAAACTCAGGAAGAAGGAAGACCAAAGTGCGGATGCTTCAGTCCTTCTTAGAAGGGGGAACAAAAATATTAATAGGAGGAGATATGGAGACAAAATTTAGAGCAGAGACTGAAGGAATGGCCATTCAAAGTCTGCCCCACCTGGGGATCCAGTGCATATACATACAGCCACCAAACCCAGTCATTATTGGGGATGCCAAGAGGTGCATGCTAACAGGAGCCTCGTATAGTTGTCTGCTGAGAGGCTCTGCCTGAGTATGACAAATTCAGAGGCAGATGCTCGCAGACAACCATTGAACTGAGAACAGAGTCCCCAATGGAGGAGTTAAAGAAAGGATTGAAGGAGATGAAGGAGCTTGCAATCCCATAAGAACAACGATATCAACCAACCAGAGCTCCCAGGGCCTAAACAACCATCCAAAGATTATACATGGACAGACCCATGGCTCCAGCTGCCTATGTAGCAGAGGATGGCCTTGTGGGGCATCAGTGGGAGGAGAATCCCTTGGTCCTGCCAAGGCTTGATGCAGCAGTGTAAGGGAATGTCAGGTCAGGGAGGTGGGAAGGGGGTGAGTGTGTATGGGGGTACACCCTCATAGAAGAAGGGGGAGGGGGAATGAGTTGGTGGGTTTATGGACAGGAAACAGAGAAAGGGGATAACATTTGAAATGTAAATAAATAAAAATCCAATAAAAAAGACATCAAAAGAGAAAGAGAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAATTAACTCTTTTTCCCAGCAGTTAACAGTTGCCAATAGCTCCTAGGCTAGGTGTGGGACTTTAGGACCAACTCTACACTTGGAATTTGTCTGGCTAGAGATTGCACATGTCTTGTGCATGCTGCCACAACTGCTCTCATTTAATATGTACAACTGCTCTACTGTGTTGAAAAGCACCATTTCCCTGTTACCATTTATAGTGTTTGGGTTTTAGAATCTTTCTATGAGGGTCCCTGAACTTTGGGAGGAAGGAAGTGTCATACAGGTGTCCAATTTAGAGATGATCACTCCATACTGTCTTATCCTCTTCACTTTAACCAGCTGTGGGTCTATGTCTTAATCATTTTCTATTGAAAAAAGAAATGTCTCGGTTCTGGATCCAAGCAGAAAGCGGTTGGTTACTCACGATGTTTGTGCCACTATTGCTCCATTTGGTGTGTCTTATAAGACTGATTGCTAATATTTCTTGTAGAGTCCCAGTTGAGTGAGATTGATGATTTCTTTTCTCCTTCAAAATGGTACATAGCACCTTCCAACACTATAGAAGCTATTATTTATAATGAAATAGGTCAATATTGTTTGTCACCTAGAAAAGCAAAGAACTCAGAGTTCTGTGATCTATCTGTCAGAGGTACTTAAGATCAGTTTGATTACTTAGAAACATCGAATAAGCTCAAGTCAATGGGTATGTTTTATAAACATTGGGGTATTCTTTTAGGGAATGTCAAAGTCATAGAATTATGGAAAGATTAGTATGACTGAGGTTATATGACAAATTTTGTAACACGATGATGGATTATGAACCTAGTATCAGTGGAGCATGATAAATATCTTTAGGGTTTAGAACAGCATTGAGAATGAGGAATTACCAATATTATTTCTTTTCCATGTTGACTTGAGAAACGTTACACAGGAATGTAACTGTGAATGTGATGTGACTAGGAGTTTGAATTTCCTTCCTTCATATATCCACTAGGATGAACTGTAAGCTGGGCTATAAACTGAAATAAATATCCTCTCTCCTAAGAATGTTTTGGTCAGGGTATGTATGTATATATGTATATATATATATATGTATATATATAATCATAGCAGTAGAACTGAAAATAAAGTAGCTAATGAGTTTTTTTATTCATAACTTTACGGCCTAGTAAAAGCTATAGGTTTGGATCAAAATTCATGGGACATTCTTTTATTCGGTCCAGAAAGTTAGATATAGAAATTGAAGAGATGTTTTCAGCATGATGAGAAGCACCTTTAAGTCTATATTTAGAAGACAGATAAAAGGGAATTTAAAATTTTGAGCTTTTGACTTAATTGTAAGCAGCCAGTCCTCCATTAGCTTTTCAAAACTCCATTTAGCAATGTTAAAATTACGCTCTTTGAGATCTTAGTATATCACTAGCATGCTGATGGGTTGTGGAGGGGGGCGAAATTTGAAGCCTTTTCATTTCTTTCTTCCTTTTCATGTCTGAAAACTTTTTCTTATCCCTCTATAACTTGCATTTATATACTTTAAATATCTTCTTAGATCCTTCAATCTTAAACATCATTTTAGAATCTCCAACATTTATAACCTGTATATATTAACTTTAAACATGTTTTCCTCTGTGTGGAACAGTGAACCATGAGAGAAAGCCTGGTCCTCAGTTCAGCTAAAAGCTTGAAACCCCAGAGACCCTGAAGAGATGGTAGGAGCTTCGTCTGATCCAAGTACCAAGTCCCTGTCATATAGACACAACCCCTCATAGATTTGTAAGGGCAATACCCTAAAATTCCTTCCACATGTAGATGAGGCATCCCTAACATTTCAGACCAAGACGATAGGAAAAGAGATGTGACCTGTGGTTACATAGGCTCAAGACAGAGATCTCCACGCTAATGAGGTAACTAGAGGACCAGAGGGTGTTGTCAATATGATTCATTTCCAGACATTCCTCCCTGCAAAAGGTATTTAATCTCAGGCCAACTCTGAGAAGTAGGGTCCGGTTTTACACATCTACTGTCTGCCATGGCAATTACTGATTGGAATCACAGATTGTCTCTTTTTATTGGGATCGGTCATGGGGAGACATGAAGAAGGCCTTTGCTTAGAGACCCGCAGCCTCGTCTCCCTTGGAAGGTCTCTCTGTACTTCCGACCGCAACTGTCACCAAGTTTGCTACTGGCCAAGCCAAGGACTCTCCCAGTGGGACTGACTAGTCAGAGCTCCCTTTCCCCCCAACCCCCAAGCCCCGGGTTAGACACAACCCTTGGGCCTCCAACTCTGTTTTCAGATTTTCCTTGACTCCCGAGTGGTGCCTAGATGACCAAGAGCCTGAGAACTCCACAGCCCTGGTGTTGTCAAATGCTCAAGGACCCCCGAAGCAGCTCTGGCTTTCCCACATCTCAGACTGCCTTCCCACCCTCAGAGATATGCCTCAGCGCTCCATTAGAGCCCAGCATACCCTGCCCTGTCCCTGCTCCCCATGGAGGCATGGGATAAGCATAGTCAAACTCTTGTGTTCTGTCTCCCCAGTAGCCATGCACTATGGCAGAGCAGATACGAGACCACAACCCTATACCTCTGAAGCATTTTTATTTATATTCCTAAATTATTTTCCTCTTAACATCCAAGTTTTATTTTTAACATACTCTAACTTGCATACTTTATCACTTGCATTTGTCAATCTCAAACATTTTCCTAACCCTACAAACATATTTTAGATCATCAGACCTTAAGTTAATTTTACATTTTTATTTATTTATTGTGAGATTTGGGTAGGTGATTATTGAGAGCATTCATGTAAATGAAGGAATTGTAAAAGTTCCATCCTTTAACATGAAGTCTGTGAGCAAGGCAAACCTCTTTGACTTTCTTAAAAAGAGACCTAGTAGCTTTAACTAATGAATTGACTAATGAACTAACACAACAGAGGATTATCTTGAGGTAAGAGCTAGTTGCCTGTTGTTTATTAGCTGTCAATCTACAATTAGCTCAGCTGTCAGTATGATCAGAGACCTGATGAGGATAAATTGTTACCGAAATGACTATGTATCAGTTAAAATGAGAGTACAGAGAGTAGTCCATATATTATTACCTAGAATTAGGGAAGGCTAGAGGAATCTGATGAGTAGGGTGACCCCATAGGAAAACCAGTGTTCTCAACAAACCCGAACCCCTGAGATCTCTCAGACACTTATCTCCCAACCAGGCAATATACACTGGCTGGTCCAAGGCCCCTGACACATACACAGCAGAGGACTGACTGTTCTGCTCTCAATGAGAGAAGATGCACCTAATCCTGGAGAGACTTGAGGTCCCAGTG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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTGTTTGCTTTGGTGGGAGAATTGGGCTCTGATGATGCCATGTAGTCTTGGTTTCTGTTGCTTGGGTTCCTGGGCTTTCCTCTCGCCATCAGATCATCTGTAGTGTTACTTTGTTCTGCTCTTTCTGACAGTGGCTAGACTGTCCTATAAGCCTGTGTGTCAGGAGTGCTGTAGACCTGTTTTCTTTCAGCCAGTTATGGGGACAGAGTGTTCTGCGTTTGGGCATGTAGGTTTTCCTATGTACAGGTCTTCATCTGTTCCTGGGGGCCTGTGTCTTGAGTTCACCAGGCAGGTCGCTTGCAGCAGAAAATTTGGTCTTACCTGTGGTCCTGAGGCTCAAGTTTGCTCGTGGGGTGTTGTTTATGAGCTCTCTGTGGCGGCCGCAACCAGGAAGATCTGTGCCACCCTTTCCGGGAGCTTCCGTGCACCAGGGTTCCAGATGGCATTTGGTGTTTTCCTCTGGAATCAGTAATGTGTGCAGAGTGCAGTCTCTTCTGGTTTTCCAGGCGTGTCTGCCTCTCTGAAGGTTTAGTTTTCCCTCCCACGGGATTTGGGTGCAGAGAACTGTTTATCCGGTCGGTCCCTTTAGGTTCTGTCGGTGTCTCAGACGCAGGGGACCTGCTGCTCCTGTGCCCTTATCCAAGGGAACCCAGAGGCCATATACAGTTTCCTCTTGGGCCAGGGATGTGGGCAGGGGTGGGCAGTGTTAGTGGTCCCGCTCTGCAGTCTCAGGAGTGCCCACCTGACCAGGCGGTGAGGGCTCTCTCCCACCTGGTTTGGGAGCAGTGAGCTGCAGGCAGGGATCTGCAGGTTTGGGACTCCTGCTAAATCTCTTTGTTTGTTTTTAACGTGGGTCTCTACATATTGAAATATCCTTGCATCCTTGAAAAGAAGCCAATTGATCATGATGGATGATCGTTTTGATGTGTTCTTGGATTTGGTTTATGAGAATTTTACTGAGTATTTTTGCATCAATATTCATAAGGGAAATTGGTCTGAAGTTCCCTTTGTTTGTTGGGTCTTTGTGTGATTTTGGTGTAAATGTAATTGTGGCTTCATAGAAGGAATTGGGTAGTGCTCCCTCTGTTTCTATTTTGTGGAATAGTTTGGACAGTATTGGTATGAGGTCTTCTATGAAGGTCTGATAGAATTCTGCACTAAACCCATTAGGTTCTCGGCTGTTTTTGGTTGGGAGACTCCCCCCCCCATCTTTATTAAATTGGGTATTTCTTATTTGCATTTCAATTGTTATTCCCTTTCCTGGTTTCCAAGTAAACATCCCCCTAACCCCTCTCCTTCTCTTCTATATGGGTGTTCCCCTCCCCATCTTCCCCCCATTAACGCCCTCCCCCCCAACAATCACGTTCACTGGGGGTTCAGTCTTGGCAGGACCAAGGGCTTCCCCTTCCACTGGTGCTCTTACTAGGCTATTCATTGTTACCGATGCAGTTGGAGCCCAGGGTCAGCCCATGTATACTCTTTGGGGAGTGGCTCAGTCCCTGGAAGCTCTGGTTGTTTGGCATTGTTGTTCATATGGGGTCTCATGCCCCTTCAAGCTCTTTCAGTCCTTTCTCTGAATCTTCAACAGAGGTCATGTTCTCAGTTCGGTGGTTTGCTGCTGGCATTTGCCTATGTATTTGCTGTATTCTGGCTCTGTCTCCCAGGAGAGATCTACATCCAGTTCCTGTCAGCTTGCACTACTTTGCTTCATCCATCTTATCTAGTTTGGTGGCTGTAGATGTATGGGCCACATGTGGGGCAGGCTCTGAATGGGTGTTCCTTCAGCCTCTGTTCTAAACTTTGCCTCCCTATTCTCTGGTTGGGAGACTTTTAAAAACTTCTTCTCTTTCTCTAGGAGTTATGGGTTTGTTCAGATGGTTTATCTGATTTTGATTTGACTTTGGTACCTCTTATTTGTTTACAAAATTGTCCTTTTTCTCCAGATTTACCAGTTTTGTTGAATATAGACTTTTGTAGTAGGATCTGATTTTTTGATTTTCCTCAGGATCTGTTTTGTCTCCCTTTTCATTTCTGATTTTGTTAAGTTGGTCACACTCTCTGTGCCCTCTGGTTAGTCTGGCTAAAGATTTATCTATCTTGTTGATTTTCTCAAAGTACCAGCTACTGGTTTTGTTGATTCTTTGTATAGCCCTTTTTGTTTCTACTCGGTTGATTTCAGCTCTGATTTTGATTATTTCCTGCCTTCTACTCCTCTTGGGTGCATTTGCTTCTCTTTGTTCTAGAGCTTTAGGTGTGCTGTCCAGCTGCTGACATATGCTCTCTCTTGTTTCTTTTTCGAGGCACTCAGAGGTATGAATTCTCCTCTTAGCACTGCTTTTATTGTGTCCCATAAGTTGGGTATGTTGTACCTTCATTTTCATTAAATTCTAAGAAGTCTTTAATTTCTTTATTTCTTCCTTGACCAAGTTATCATTGAGTAGAGCATTTTTCAGCTTCCATGTATATGTGGGCATTCTTTCCTTATTGAAGACCAGCCTTAGTATGTGGTGAACTGATAGGATGCATGGGATTACTTCTATCTTTCTGTATCTGTTGAGGCCTGTTTTGTAACTGAGTATATGGTCAGTTTTGGAGAAAGTACCATGAGGTGGTGAGAAGGAGGTATATCCTTTTGTTTTAGGATGGAATGTTCTATAAATATCTGTTAAGTCCATTTGGTTTATAACTTGTGGTAGTCTGCCTATGTATCTGTTTAATTTCTGTTTCCCTAATTTGTCCACTGATAACAGTGGGGTGTTTAAATCTCCTACTATTATTGTGTGAGGTGCAATGTGTGCTTTAAGCTTTAATAAGGTTTCTTTTATGAATGTAGGTACTCTTGCATTTGGAGCACAGACATTTAGGACTGAGAGTTCATCTTGGCAGATTTTTCCTTTGATGAATATGAACTGTCCCTCCTTATCATTTTAGATAACTTTTGTTTGAAAGTCAATTTTATTTGATATTAGAATGGCTAGTCCAGCTTGTTTCTTGGGACCACTTGCTTGGAAAAATTTTTTTCCTAGCTTTTTAGTCTGAGGAAGTGTCTGTCTTTGTCACTTTGGTGCATTTCCTGTATGTAGCAAAATACTGCGTCCTCTTTAAGCATCCAGTCTGTTAGTCTATGTTTTTTTGGGGGGGAATTGAGTCTATTGATATTAACAGATGTTAAGGAGTAGTGATTGTTACTTCCTGTTATTTTTGTTGTTAGAGGTGGAATTATATTTGTGTGTCTCTCTTTTTGTTTCATTGCAAGGAGATTACTTTCTTGCTTTTTCTAGGGTGTAGTTTACCTCCTTGTGTTGGGCTTTTCCATTTATCTCTTATGGTCTGTATGACATCTGCTCAGGATCTTCTGGCTTTCATAGTCTCTGGTGAGAAGTCTGGTGTAATTCTGATAGGTCTGCCTTTATATGTTACTTGACTTTTCCCCTGACTGCTTTTAGCGTTCTTTCTTTGTTTTGTGCAATTGGTGTTTTGACTACTATGTGAAGGTAGGAATTTCTCTTGTGGTCCAATCTATTTTGAATTTTGTAAGCTCCTTGTATGTTTATAGGCATCTCTTTCTTTAGGTCAGGGAAGTTTTCTTCTATAATTTTGTTGAATATATTTACTGTCCCTTTAATTTGGGAGTCTTCACTCTCTTCTATACCTATTATCTTTAGGTTTGATCTTCTCATTGTGTCTTGGATTTCCTGGATATTTTGGGCCAGGAGCTTTTCCTATTTTACATTATCTTTGACAGTTGTGTCAATGTTTTCTATGGTATCTTTTGCCCCTGAGATTCTGTCTTTTATCTCTTGTATTCTGTTTTTGATACTTGAAGCTATGACTCTAGATCTCTTCCCTAGGTTTTCTATCTCCAGTGTTGTCTCCCTTTGTACTCTCTTTATTGTTTCTATTTCCATTTTTAAATCCTGGATGGTTTTGTTCAATTCCTTCACCTGTTTGTTTATGTTTTCCCATACATCTTTATGGATTTTTCTCTTATATGCTTCTACCTGTTTATTTGTGTTGTTTTCTATTTCTTTAAGGGAGTTATTTATTTCCTTCTTACAATCCTCAATCATCATCATGAAATGTGATTTTAAATTCAGATCTTCATTTTCTGGTGTGTTTGGATATCCAGTATTTGCTTTTGTGGGGGAACTGGGCTTTGATGATGCCAAGTAGTCTTACTTTCTGTTGCTTAGGTTCCTGTGCTTGCCTCTTGCCATCAGGTTCTCTCTGGTGTTAGCTTGTCTTGGTGTCTCTCTGAGTGGCTTGACCCTCCTCTTGACCTGTGTCATCACTCCTGTAGACCAGTTTTCTTTCCACTTGATCTGGGAACAGAGAGTTGCTCCTGGGTTTGTGTGACCTGAAGCCTCCAGCTAGGTTGCTTGGTAAGAAGACTTCATCTTACCTCTGCTCTCAGGTGTGTAGGTACTCCTGGTGACTGGTTCTTAGCTCTAGGCCAGGCAGAAACCTGAAGGGTCCTGTCTCTAACTACTCCTAGGTCCCTCTGCACAAATGGCACAGATGACATTAGGTTATTTCCTGCTGGCTCAGGAATGTGGGCAGAAAGTAATTGTCTCCTCTGAGTTCTCAGGACTGTCCTCACTTCTGAGGGTCAAGCTCTCTCCCTCTTGGGATTTGGATGCAGGGAGCTGTGGGATCAGTTCAGTTCAGGAGACTTCCACTCTTTCCCCACGGTATTTGGCTACAGAGAATCATGGGACTCATTCATCTCCTGGTGCAGGTGGAAACCAGAAGGATTTATTAATTAATTTTAACATCCCAAATGATACCCCTTCCCAGTCCCTCCTCACAGAATTCCTCCTTCCAGGCTCCCTCCCCTTTGCATCTGAAATGATGCCCCTCCTGGGTATCCCTGCACTATGCTGCATCAAATTTCTGCAGGATTAGGTGCATCTTCTACCACTGAGGCCAGACAATTCAGCTCTCTGTTATATATGTACTGGATCCATTGGGCTAGCTTTTTGGTTGGTTTCTTATTCTCTGGGAGTTTCCAGAGGTCCAGATTAGTTGACACTATTGGTCTTCCTGTGTGATTGCCACCCCAGTCAGGGCCTTTAAGCCTCTCACTCACTCTTCCATTAGGGGTCAGTCCAGTGCTTGTCTGTGAGTACCTGCATCTGTCTCAATGACCTGCTGTGTAGAGCCTCTCAGATGACAGCTATGTTAAGCTTCTGTCTGCATACCATAGTACCAATACTTGTGTCAGAGATTGATTTCCTACCCATGGGATTCGTCTCAAGTTTGGCCAGTTGCTGGTCAGCCATTTCTTCAGTCTCTGTTACATCTTGTCTCTGAATTTCTTTAGACAGGACCAACTTTGAGTTGAGAGTTTTGTAGGTAGTTCGATGTCTCCATCCTTCCACTGGGGAACCATTTCTGGCTATGGGATGTGGTCTTTTCAGGTTCCATATCCCCAATGTTTGGCATTTTGACTAAGGTTATCCATATTGATTCTTAGGAGCTTCCTAGGTAGAGTTTTCAAATGATATGTTTCCAGGATTTATCATGGGGTGGCTGAGTGACCCTGTGAGAAGAGCTCAGCAGAATCCTGAAGCAGAGTCTTACATAGTTGAGTATTCATTTTAGTGTGAACATCAGGTATTGGTTCATTGCCCAAATATCAGAGGTCCACTGAGAAGGGTTCAAATCTGAGTCTTGAATTTTTACCCGTAGGAAAGTAAAATAAAATTAAGATTCTTCCAACCTCATTCACTTTATCTGCAAACATACTTCAAAGTGTCAGAGTTCTGGCAGTTTGCACACTGATTTGACTGGAAATCTTCTGGTAAACAAGACACATGCTGCAGAAGAAAGTGATAGAAAACAGCTTTTTATGTATTGAATCTAAATTTGAATTTGTGATTAGCACACTACAGATGTGGTCAGTAAGATGCTCACATCAGTCTAGATATTTCTTCTGCTACTTATAATTTTTCTTATTTCTAG
Seq C2 exon
TTCTCAGAAGTCTATGGCCCTGTATTCACTCTGTACTTTGGACTGAAGCCTACTGTGGTAGTATATGGATATGAAGTGGTAAAGGAAGTCCTGGATGGAGAGGAGTTTTCTGGTCGGGGTGTCTTCCCAATTGTTACAAAAGTGAATAATGACCTTG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSRNOG00000001466:ENSRNOT00000001990:1
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion (1st CDS intron)
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.018 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0006717=p450=PU(5.7=46.4)
A:
NA
C2:
PF0006717=p450=FE(11.4=100)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Human
(hg19)
No conservation detected
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]