RnoINT0123956 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000016910 | Ralgps1
Description
Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1 [Source:RGD Symbol;Acc:2319500]
Coordinates
chr3:12364818-12377216:-
Coord C1 exon
chr3:12377109-12377216
Coord A exon
chr3:12364869-12377108
Coord C2 exon
chr3:12364818-12364868
Length
12240 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GCCGTAAGT
5' ss Score
10.11
3' ss Seq
GTATCCCTATTCTCTTTTAGAGT
3' ss Score
9.54
Exon sequences
Seq C1 exon
GGCAGCAGCAGCTCCGACTCACTGGAGGGCCAGAGCTGCGACCATGCCAGCAAGAGCTACGATGCTGTCGTCTTCGACGTTCTGAAAGTGACTCCTGAGGAGTTTGCC
Seq A exon
GTAAGTGACATGGAACTGGTGGGGACAGTGATGCTGTCACAGGGTGCAAAGGGAGTCACAGGTTGGGAATGCCACATATGGACACAGTAGGAGAGCACGTGATGGATAAGGGATGCTTTTGGTTTACCGTTGGCCACTTTGGGAAGCACACAGAGCAAGACAAGGAGCAGGGCTCAGCCCAGTTTACAGAGCACACACAGCACATTTGGTGAAGATTTAGACCTGCTGCTGACATGTCTACAAAGCCAGCCACATTGCTCACTACACTCTCCAGCTGTGGACACAGCGTGTGTGATGAGTTTCCCTCCTTTCTGTTTACTCCCACCGTCTGTATGTTTACGTACCTTCTCCTGCAGCCTGTATTTGGCTGCTGGTCTGACAAGACATGATCCCTTAGTGGAGCAGAGCTGGCCTCCCATGATGCTTCCATCCCTTGGGGAATGCTGACACTGGGTGACTTCCAGCCTGACTCTGAGCACTGTTCAAGGGCCGTGTTTCTCTGCAGACCCATGGCTGTTCCCTGACAAGCCCACTTCTTCCTGGTCTCCCACCATACGGAGGGTCCATGTCAACTACAGGGCCGTGCCATGCAGCTGTGCCATCCTGGGCTTCCATATTCATTTAGTCGGGTTCTGCAGGGCCTCAGTATGTCTAAAAGTTTAGAGTGACAGCTCAGTAGTGAAGAGGGTAAAGTGTGTATTGCTCTTGTAGAGGATCCAAGTTCTGTTCCCATACCCATGTCAAGTGGCTAGTTCACAACTCTCTGTAACCAGAGTCCCAGGGAATCCAGCTCGGGCTTCTGTAGGAACGTCCTCTATGCTGCCCACACAATACTTTAAAGCGAATCCTCAGCAAGAGTCCATTCTCATTCCAGTGGCTCCTTGCTCCAGCTTTCCTCCTGATGCCCACAGTGCCCTACCCCAGAGTCTGGCCATGCTTTCTCCTGCCCCTTCCCCTGCCTCCGCAGCTATATTCTAGCCACCTTTTCAAACCACTCTCAGAGCCTCTGGCCTCAGCCTAGTTGTGCCCTCAGCCTTTGGTCACATTAGTCCTCTGCGAGGGCTTGCCTTGGGCTAGCAGGGCCTTCATCTCTCTCTCCTTCTGCTTGTTCTTTTCAGAACAGCAGTTATTACTTGATGTAACATTGATGTGTGACCTGATTTATCACTTGTGTTTCCTGCACTGGAGGATGAACTTAGGGACAAGGCCTGACTTGTCTTTCAATTTTTGTGTCCAAAATGTGCTGATGGGAGGTGCTTACTAAACATATGGACTGAAAGAATTCAGTCCTCACAGCAGTGAGGTGAAGCATCCTGTCTGACCTCCTGTGGTGGTTTGAATGAGAATGGCCCCAATAAGCTCATATATTTGAATATTTGGCTGAGTCAGTGGAACTGTTTAGGAAGTATTAGGAGGTGTGGCCTTGTTTAGAGGGGGTGTGTCACTAGGGATGGCAGTGAGGTTTCAAAAGCCCTTGCCAGGCCTTGTCTCTCTCTGCTTGCTGCCTGAGGTTCAGGCTACTGCTCCATAGCATGCTTACCTGCCACCATGTTCCCCACCACGATAATCAGGACAGTCAGTGACTAACCATCTGAAACTATAACTAAGTCCTCCCAAGTAAATGTTTCTTTTTTTATAAGTTGCCTTGGTCATGGTATCTCCTCAGAGCAATAGAACAGTAACAGAGTTGGCACCCAGGCACTGGGGTATTACTGTGATGTTGTGAGGTATCCACCGAGAAGGTCACTTGGACACAGTGGTTCAAACCAATGGAACGTCTTTATTAGCTGGCCTGCCTAGGCGTTTGGGACCTGAGTACAGTCCCAAGTCTTCTCAAGGTGAGATTTGAAGCACAAAAGTTAGATCTTGGGTTGACATATTCAGTTAACAAGATCAGTTAGCCAGAAGCAGAATTACAGAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGGTTAGTACATTCAGGGACTTTCCCAGGACTTTGATGGATTAGGTCTTTGTTCTTGATTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTGTTTTCATCGTTGGTATTTTGTTGGTTTTGTTTGGTAGGGTTGCTGTCTACGTGCAGATTCCCAGGTCCAAATGATACTTCTGCCATGGCGTCAGTTGTGCTGAAGTCTGGGAGCCTGGCTTAGGATACTGATTTTGGAGAAATTTGAAAGACCTTGTGACTTGGGACTAGAAAGCTATAAGAAGGCTCAGTGAACCATCCTGGGGGAGCATGGGAGGCACAGCAGTGTGGGCTGTGGAGGCCTGGCATGTGAGAGACTTCAGAGGGGATAAGAGCACTGAGACCTTTCTTCTGATTTTGCCAAAGAATGTGGCCACTTTTTGCCCTTGTCCAGAATTTTGCCAGGTGCAAAATTGAAGAGTTTTGGATAAATGTTGGCAGAGATTTTAAGACAGCTTAGTGTACTGACTGTGTCACATGGTTATTAGTGGTCACTTGTCCAGATGTACAACGAAAAGGAGCAAATGTGGCAAAAAGACATACAAAATGTCCAGTTTGGGGAGAAAAAGAGATGTTGGAGCTACATCCTGTGCTCAGGAGATGAGAAGTTTAAAGAAAGGCCCCAAGCTAACTAGGCTAGAAGGGCAGCACCTCTGGGTAAGACCCGCTCAGCTGATCCTGCAGCTGCTAAGAAGGAGTTTTGTAGGGAAGGAAACCTTCAACTGGTGAGAGTTTATGCCAGATTCCCTCCCTGGCAAACTAAAGGATCTGGCAGCTTTGACCTTGTGGTTCTGGATTTAGTCAAGAAGGATACCAGAAAGGGGTTATGAAATCTTCCTCCCAGGTTAGGGGAATCCTCTGAGGCCAGGCATGTGTCAGAGTAGTTCCTTCCTGGAGGCCAGAGAGGCCATTGCATGAAGCTGTGAAGGTTTAGCCTCGATTGCATTAGAGACCCTGCTGGATGCTGGAGGTGCCAGAGTTGTGGGCTACCTGGCAGAGGGCAGACAGAGTGTGGAACAGGAGTGGAGAGATGTCAAAAGTCATCTAAGCCTTGGACACCTGATATGGAGATGTAGAATCTGAAGTTTCCTATGCTGGTTTTCAGTCTCGTTTTGGTTCAGTATTTCCTATCTTTCTTTTCGGAATGGTAATGTATATGCTATGCCATTGTACGTTGGCAGTCTGTGATCTGCTTTTGGATTTTCCAGTGGTTACAGTTAAGAGGTTGCCTTGAGTCTCAGAAGAGACTTTGGGCTCTGGACTTTTAAACAATGTTAAAACCACGGAAGTCTGTGGGGACTTTTGAAGTTGAACTAAATGCATTTTGTATTGTGTGGCTACAAGCCCGTGGAATTAGAATGTGGTGGTTTGAACAAGAATGCCCCTCCCCACCAAACCAGGTCATGTATTGAAAGTTTTGTTTCCAGTTCATAAAGGATTAGGAAGTGTGGCCTGTTGGAAGAGGCATATTGCTGGAGGTGGTCTTTGAGGTTTCAAAAGCCCATGCCAGCCCCAGTCTCTCTCTGCCTGTTGTCTGAGGACCAGGTTGTAAGCGCGGAGGTAAGTGGAGGTACTGTTCCAGTGTCATGCCCGCCTGCCCGCCTGCTACCCTATTCCCTACATTACAGTCATAGACTAACCCTCTGAAACTGTAAGCAAGCCCCTTGTTGTGGGCTTTTAATAATAAGTTGCCTTCATTTGTCATGGTGTTTTGTCACATCAATAGAACCATAGCTGACGCTCTTATAGAGAGACTGAAGCCCTAGGGGTCAGTGTTCTTTTGTACATCATCCGGCCAGCGCTAGCTCGAAGCCATCGCCCATGATGTCCACTACAGTGGGTTAATCTGTCTGTGATGGCACCTGACTTCACAGGTGCATAAGCTTTTCCCAGTTTCCTTTTCCCAAAGGCCTTGTACACCAGTGCCATTGTTTTTCCAGTCCGCTTTGTTATCCTGGTCTACTAAGGAGTCAGCACCTGGAGAGGAAGCTCCCTTTCTGCATGTGCTGTGGCTAACTACACCAGAGCCGCACCGCTAGTTACTCAGGAGATATTACCCAGACTAGCTATGTCTTGTTTTTCCTCTCCTCTCCTCTCCTCCCCACCCCTTCCTCTTTCTCCTTCTTCATTTTGGTTGGTCTTAGTTAGAGGTTGGGACTAGGGGTTAAGGATTAGGGTGTTATGCCCAAGTTTCAGGTACCCAAACACCACCAAGGAGCCAATTCCTATAGAAAACGCACAAGGGTCTTTACTAGGAGCTTGTGAACTAGACCTAAACTCCCACCATTGCAGCAGGTTAAAATGAGAGCCCCCAGTCTAGGGTTCAGGGTTTTTTATTGTGGTTACAACAAACATGGGCAGTTTCCATATTGGTCAGCAAGTTAATATTTTAACATAATCTGCAGGAATCCAACAGGGGGAGAAAACACCTGACAAACAGGACGGCTAAGTTATCTATGTACCTCGACCCTTCTCTTGTAGTTTGACTGACTGTTGCTAAGCGGGGTGGGTTGCCACAGGAGACTTGCTCAGAAAGACTCTAATTTTCTAGCTGGGATTGGAGTTTAGCCCCAAATGGAGTTTCCTCAAAAACAGACTTGGTTGGTATGATGGTTTGTATATACTTAGCCCAGGAAGTGTTATTATTAGAAGGTGTGTCCTTGTTGGAGTAGGTGTGTCACTGTGGGCATGGGCTTTAATACCCTGTCTTAGCTGCCTGGAAGTCAGTATTCTGCTAGCGGCCTTCAGATGAAGATGTAGAACTCAGCTCCTCCTGCACCATGCCTGCCTGGATGCTGCCATGCTCCTGCCTCAATGATAATGGACTGAATCTCTGAACCTGTAAGCCAGTCCCAATTAAATGTTGTCCTTCTGAGAGTTGCCTTGGTCATGGTGTCTCTTCACAGCAGTAAAACCCTAACCAAGACAGTTGTTTTGGTTTGTTCATTTTCAAATCTCCAGGAACCATGTTTTAAAAGAGAGTTGAGGGTTGGGGATTTAGCTCAGTGGTAGAGCACTTGCCTAGGAAGCGCAAGGCCCTGGGTTCGGTCCCCAGCTCCGGAAAAAAAAAACAAAAAACAAAAAAAACAAAACAAAAAAAAAGAGAGTTGAATTAATTCTCTTTAATTAAAAGTGTACATGAGAAATCTCAAAACCACTGACATGTTTTTGACATGTCATGACATGTGACATAATTGCTACATGCTGCTAATACATAAGCCAGCCACAGAGTTAGAAAAAGTTCCCTGGAGCTGGCAGAGTGGAGCACACTTTAAATCTTTACTCTCGGGAGGCAGAGGCAGACAGATCCCTGTGAGTTGGAGGACAGCTTGGTCTCCATAGTAAGTTTCAGGACAGCCGGGCTACACAGTGAGACTGGATCTAAATAACAGAAAGAAAGGGTCCATGAAAGTGTGGGGGTCCACGTAACAGTTACAGGGGGTGTGTGTACATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCACATGACAGCAGCATGTGAATCCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACATGACATGAGCATGTGGATCCTCAGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTACATGATAGAAGCACAGCACGTGGATCTTTTGAATATATGTGTGTACATGTTGTGTGTCTGTACATATGACATGAACATGTGGATCCACAGAGTATGTGTGTGTGTGCACATGACAGAGCATGTTGACCCACAGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGCGCACATGACAGCAGCATGTGGATCCTCAGAGTGTGTGTGTGCACATGATAAGTGCACGTGGAGTCACAGAATGTGTGTTTGTGTGTGCATATGTGTGCACGTGACAGCAGCATGTTGACCCACAGAATGACAGTGTGTGCGTGTATGTGGACATGACAGTAACATGTGGATCTACAGAATGTGTGTGTGTGTGTCTGCGTGCCCATGTGTGTGCACGTGCACATGGCAGGAGCATGTGGATCCTCAGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATATGACAGCAGTATTTGAATCCTCAGAGTGTGTGGCTGTTGTGTACATGACAGCAGCTGCAGCCCGCATTCTGGAAGGACACAACAGTCATTAGAACACAAATGCTTTAGTGGAGGAAACTTTTGTCAGAGTATGTGAAGAGATCAAATAACCTAAGTAGAATGACAGAAATGTCAGGAGGAAATCCAGCATTAGCAGGAATTAGTTGTCCCTGGCCAACCTTAACTTTTTCTATTTTTTTAAAAGTCAGGCACTTAATGTATAGTCCTGGTTTTCCTGTAACTCACTCTGTAGACCAGGCTTCGAAATCACCTGCCTCTCTCCCAAGTGCTGGAATTAAAGGTGTGAGCTACTCTGCCCATCTCCATTCACTACTTTTAATAGATGTATATGTAACATTCAGATGTTTGAAGAACCATGATTTTAAATCAAATCCATATTTCAAAATTTTGCTGCTATAGCCTTTGGTCCAATATCTAGCCACACTTGTGTGTGTGTCTCTGTTGTGTGTGTTGTCTCTGTCGTGGATGTGTCTCTGTTGTGTGTGTCTCTGTTGTGTGTGTCTCTGTTGTGTATGTGTTGTGGTTTGCCCTGAAGTTATCTGTATTTTGATGCTAATTCCACTGCCCCAAGGACTGCTGCCTAGTCTCCTACTCTGGAATCAGGTGACTTCACCAGAACCTTCTTCCCATTGAATTTGTAAAGTACTGGTGAGAGGCAGGTACAGGATAGAAGGAGGCCTGTCATTGGAGGAGAAGGAAGGATGGGCGGGAGATAAGTTTGAAGGAAGAGGAGGAGACGAGAGAGAAAGGAGAGACAGGAGGGAGAGGGGAGAGAAGCCGTGGCAGGACAAGATGGCAGGTGATGTTAAGATTCTGCTCTGTGTATTTACAGGTTGTTATTAATGTTCCTAAGGGATGGATGGTACCGGGTTTTGTATGTTTAAGTGGGCAATTATATCTTATCAACTGGATCTAAGATTATTGTGTTGTGTGTTCTTTTATGTGAGGGTTTGAGTGTAGGGAAGTGTGCGGCTGGGATGTGTTTCCGCCAAGATACCTAGCAGATATCTTGGGGCACCGCAGTGCGGACCTAGCAGGGGAAAAAGACAACTAAACCTTTTTTATTTTTATATTTTTACAACAACATGTATGTGTCTCTGTTGTGTTGTCACCTCGGTCTCTGTGAAAGTTCTGCATGACTGTGCTTCTCCTGCATCTCTCAGGGTCCTGTCAGTGATGCGATCATTCTCTCTCTAGGAGATAATGTGTAAACCTAGGACGTGACCCAAGGCTGAGGGGAGCGCACTGTTTAGCAGGATGGGAATAGTAGCAGCGTCATGCTCTGTGCGTCAGGTTGTGTTTCCTGAACTCAGTCGTTTTGCTCTGAATTTAATGTTAGGGAAGGGAGGGTCCTCATTGCTGTTAGTTGTAACTTCCATGGTCAAGACCGCCCATGGCTGTGTTCACCATGGTTCTAATTACAGCTTCAGTGGCTGTAGTTTGGGGTTTGTGTGACTGTGGTTCTGACCTCCTGTGTCTCCTATGGCTTGGGTTGTGGCTCCAGTAGCTCTGGTCATAGATCTTGTGGCTGTGGCTGTGACTGTGGCTGTGGCTCTGGCCATGACTACCATTGCTTCAGTGGTGACCTCCCTTGGCTCCTGTGAGCTCTTAACTCAGGGGTACTATCGGAATTGACTGCTTAGTGTTCTGTGAGTGCTAGAAGCATCTAATGGCAGCCATCAGTTGGGTTCAACTGTACAGTAAGTAGTACCCAGCAGCTTTTGTTTGCTTATTATGGTCATGAGACAGCTTTAGTGTGGTGCTGTTAGGAATCTGTATATTCATTAAAATTTTTTTCTTTTTGGCTAACCAGTTAGTTCCCATGTCATACCACTTTTTCTTGGGGGTGTGGGGGTGTACGGTGCTCTGATAGGTCCCATCCAGACTGTAACATTCATCCCAGCAGTGGTGTCATGTAGTGTGTGATTACTGGCTATTTCTCTTCAGAGCCTGGCTCAGTGTTGAGTGGCTCTGAGGATGAGACAAAGCACAGCAGGTGTGGCCAGTTGACCTGAGTTCTGATGAATGCTTCCTCTTCAGGTCCTCTACTGGGTGAATTGGTGCCTGGAAACAAGTGGGGAATGGCCCCTGGCCTCACCTTGCAGGCCCCTAGCTCCTTGGCTATAACTGCCAACTCTGGAGTCCTCACCACTGGGGAAGGATTGCTCAGCAGCAGCCTTTGAACAAGTTTGGTAGTAAAGGATTGTGGGGTTGGCGACTTGGTGAGCTTTTCTTGGGAATTTGTCTTATTAGAGGCTTGTCCTGGACTTTGCATCCATTCTAGTCAGAGTAGAGAGGTAGAACTGGATCAGGTCTCTGAAACACAGGTTCTCTGTGTTAGGAACTAACAGGCCCCATCTTGGGATCAGCTCTGTTAATATTTTTGTTGTTATTGTTTTGTTTTCTTCTTTGTGTGTACATGTGCACTTGGTGTGCATGGGTATAGAGGCCAGAGGTCAGTGCCGTAGGTGTCCTTCCCTATGGCTCTCCATCTTATGTTTTGAGACAGGGTCTCTCATTGGCCTGGGGCTCACACACTAGGCTAGTCTGCTGGCCAGGAGTCCTCGTCCCTGCCTCCCAGCACTGAGATTAAAAACACATACTGCCTGCCATGGCCAGCACTTTATGAGCATGCTGGGCATCCACACGTAGGTCCTTGTGCTTGAACAGCAATCGTTTTACCCATCAGCCTGTGTCCACATCCACTGATGTGCCTGAGGAGACCATCTGAGCACAGTTTCAGTCTGACAGCCTGAGCTGGCTTCAGGATGTGGAACAGACCATTCAAAGAGACATGGCTGGTATGTGGTCATTGCCTGGACATTCTGTAGTAGACCTGCAAGCAAATGGCTGGAGGAGAGAACATCTTATTTTCCCATCGGCCTGACTTGGGTCTTCTCCTGAGTGGTCATTGCACATACTCTGCTGGTCCTCACTCGACAAAAGCACAGGGGAGGTTTTCAATGTTCCCTAAGCTCTTGACTTCAAATCTCCTGTTTTCAAAGGGTCTTTCTGTTCCCTGTGTGGAACAATTGAGCCAAGTGTGGTAGCACATGGCTAATAATCCCGGTGCATATATAACAGAAAAGCTGGCAGTTGTCTGCACTGCCCAGGATGGAGCTCTGTGATCTGTGGGCCTACAGTACTCACTAGCCACTCTCCCTACATCATGAGGACTGACCTATCTTAGTTAGGGTTTTACCTCTGTGAACAGACACCATGACCAAGGCAACTCTTAGAAGGACAACATTTCGCTGGGGCTGGCTTACAGTTTCAGAGGCTCAGTCCATTATCATCAAGGCAGGAGCATGGCAGGATCCAGGCAGGCATGGTGCAGGAGGAGCTGAGAGTTCTACTCTTCATCTGAAGGCTGCTAAAAGACTGGCTTCCAGGTAGCTAGGATGAGGGTCTTAAGCCCACACCCACAGTGACATGCCTACTCCAACAAGGCCGCAACTTCTAATCCTGCCACTCCCTGGGCCGAGCATATACAAACCATCACAAGGGCCCAAGGTATGCAGATGCCACACAACCCTAGCCACCATGGGGAAAGCCCAGGAACTGGGATTCTGTCAGGTACCTCGTTGTTCTTGGTACCATTAGTGGCAGTGTTTCCCCTCTGTGTCTTGGGAGGGACAGGCTGCGCTGCTTACTGTCCTGTCCTGCTCATTTCCCTCCTGTTCGATTCTCAGGATGCTATGCTGTGGTCAGTTGTTCTGTGCTTTTCAGCAACCCAGTAACTTCAGAACACCTTTAAATTGTGCCAGGAACTGGCTATAGCTCTATGCATATGCCCTGCCTTTGGTCACAGCTAACATGTTGCTGTTTTTCTCCAGTGTTTTCTTGGTATAAGACTTTTTGGTGGCTCAGTATAACAGTCTCTGTTTCCTTCTCTCTAGAGCAACTTTGGCATGTGAATGTTCAGCCAAAACAGTTGGCCTTATGTCCAGGCGTTTGGGCTGTACATGCATGTGCTAGTACACGAGTCTTTCTGTGTATCTGCATTAGCTATATTTGTCATTACCCCCTCACTACATGCATGCACACACAATGTATTGTCACATCAGACATTCTGCATCTCTTATTTTGAATTTCTACCATGTGGACTGCAGGCTCTGAGTGGATTCCACTGGGTAGGTTGAGTAGACCAAGTGTCACAAAGGTCCATGGCCCTCTTCCCTGTCTCAGAGGCACCTGGCTCCCATATGGGTATGTCACGAAGTGACCTTGGCCCTGGTCCCCAAATGAGCATCTGCTTTTGATCCCAGCAGCCTGTGTGCTGTTGTGAGAGGACCCTGTCTTTGCTTTTCAGTTTGTGCAAGAGGCAGTAGAGATGGGGTGGCCATGCCACACTGCCTGCGAGTTCCTAGAGCTGCCTCATAGCTTCTGCTCTGATTTCACCGAGGGCCAGTGGTGAGAAGCAGCTCAGGGTCTCAGGCGTGTCCCTAGACACATCTACAGTAGTTCTCTGCCATGCAAGTCTGGAGGTAGAGACTTCAGAAGAGAAGTCAAATTTTGTTTAAATTTGAATAGTGGGGTTGGGGATTTAGCTCAGTGGTAGAGCGCTTGCCTAGCAATCGCAAGGCCCTGGGTTCGGTCCCCAGCTCTGAAAAATAGAAAAGAAAAAAAAATTTGAATAGTAGTGTCTCTATCTTGCAAATTTTAAAAATTGTATCTAGAAGTTTTTAAAATTAGAAAAATAATTCATAGTTGAAACAGAAACCCAAATAGCATAAATATCTCCAAACTAAAATGTTCCTCTTACTCCCTGCCTCACCTTCCAAACGACTCTGATCAGTTCTGCGGCGTAAGTTCATCATGTACTCAAAGGGAAGGGCATGGTCAGAGAGTTATAAGGAGGTATGTGGTAGGGTGGGCAGCACAGAAATCTATCCTGTCTCTCATCAGTAATAAAAAGTCACTCTGGGACTGGAGAGACGGCTCAGCCGTTAAGAGCACTGACTGCTCTTCCAGAGGTCCTGAGTTCAATTCCCAGTAACCACATGGTGGCTCACAACCATCTGTAATGGGATCCGAAGCCCTCTTCTGGTGTGTCTGAAGACAGCTACAGTGTGTTTATATATAATAAATAAATCTTTTTTAAAAAAGCAATTCTGAACATCGTAAGGCGAAATCCCCCAGGATGAGAGAAACACTTGCAAACCCATACATTCAGAAAACTCACTAGCAAAAAGCACAAATGAAACCAAAATAAAAAGAGATGATGGGATTCACGACTGAGTAGTCACCTGGTGGGCTTGCCAGAGAAGGCATGCAGAAGGCTATGGAATGTGGAAGGTTGCCCAGAAGTTACCAGAAAAAGGCAGCTCAAATCCAGAAGAGCTCATTAACTCCAGGAAATTGGCTGCTACCACAGAGTTGAGGGGCGGCACCCACTGATGAAGATGCAGAGAAAGGAACACCTGTGTGTGCGGTGGCTGGGCATGCACGTTAGTGTAACTGTTACAGGAAACAGTGAAGTTGTTTCTCAGAAACCCCAGAGAACTGCCTCTGTGCTGCAGCAGCCCAGCAGGCTGGCTGTATCTCCAAAGCCAGCCAGTCTATACTTCTATACTTCTGCATATAGAAGCCATGTCTGCAATGCTGAGACATAGAGACAAACGCAGCGGGTAAACCATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGTGGGTTATTATTCAACCATAAAAAAGAATGAAATCTTGTCATTTGAGACAACACAGGTAGAACCAGAAAGTATTCTGTTAGGTGAAGCAAGCCAGGCTCAGACATGTGCCACATGATCTCTCTTGTATGTTGCATATATGGAGAGGTGGCTTCTTGAAGTGAGGGAGTCTGGGAAGAGGGATGGGGTAGGGAGGGACTGATCCATGGAGAAAGAAGTCCCAGCCTGTGGTTGTGCAGAGGGTGAACTCTGGCTGCAGAGAGCTTGGAGGATTTTAAGTGTTTTATCATGAAGAAATGACGATAGCTCCAAGAAGACAGATATATCAAACCGATTTAAATGCTACCCATTGTACATGGTTGTTCAGCCGTCACGTGGTACCCCATGAATACTGAAGACTTCTGTTTTTCAAGTATCAGTTTGAAAGCCTCTAACCCAGTATCCCTATTCTCTTTTAG
Seq C2 exon
AGTCAGATCACATTGATGGACATCCCCGTGTTCAAAGCCATCCAGCCAGAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSRNOG00000016910:ENSRNOT00000022755:3
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.172 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0061714=RasGEF=PU(11.6=22.2)
A:
NA
C2:
PF0061714=RasGEF=FE(23.2=100)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Human
(hg19)
No conservation detected
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]