RnoINT0144179 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000013934 | St5
Description
suppression of tumorigenicity 5 [Source:RGD Symbol;Acc:1308995]
Coordinates
chr1:174173000-174187728:-
Coord C1 exon
chr1:174187624-174187728
Coord A exon
chr1:174174251-174187623
Coord C2 exon
chr1:174173000-174174250
Length
13373 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAGGT
5' ss Score
10.28
3' ss Seq
TTCCTCCTTTTTGCTCTTAGGTC
3' ss Score
11.33
Exon sequences
Seq C1 exon
GGCTCTGGGCTTGCAGAGAGCCGAAATGACCATGACTGCCAACAAGAACTCCAGTATCACTCATGGAGCCGGAGGCACTAAGGCCCCTCGGGAGACGCTGAGCAG
Seq A exon
GTAGGTAGAGGCATACTTCTGGGAATGGCGTCAAGAGCTGGTAAATGGTCTGGGACCCAGGTAGGATCTCTGCCAAAGTATAAATAATCGCCATGACTGTTGATCATCCCATTTGCTTGTTTGGGCCCAGTTTGTGCTGACACATACATAAAAATTCCCTATTCAGGATGGTAGCTAGAAGCATTAAAACAAGTTCTGCCTTGTCCTGGGAAGCCCTGGCATTCCAGGAACAGGACAGTAATGAGCAGCTTAGAGAAGATGGGGACATCTTGGAGACATACTGTTGTGAGGAAATTGGGACATTGGGGTAGAGGTGAGGAGGGTAGACAGTTACATTCATTAGCATAAGCTCCAAGGAGAAGTCTAGGTTCTCTAACAACTTAGGCCTGGCCGTGAAGAAAACAACGTGGATGAATCTTAGCCAGTGTCTGCGATTACCCACGCTTCTGTTCTTTTAATCTTCTGCAAAGGTAAGAATATAAGACTATAGAAAAATGAAAGAATCTGGAATCTCTACAGAACTGCGTTCAAATTTAATCTCTGAAAATTTTTTGTTTGTTTTGGTTTTGTTTTTGTTTTTTTGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTAATGGAACTAATCTGTAGACCAGACTGACATTGAATTCACATGGGTCCGCCTGGCTTTACCTCCTAGATGCTGGGATTAAAGGTGTGCCACCAGCGCCTGGCAAGCTCTAAATTCTTTAACCAGAGAGAGATCTCAGGACATTTCCTGGTGTTCTCTAAAGCCTGCTGCCTCCGCTGCAAAGTCGCAGTGATAATGGTACCCAAGTGTCGAGGGTTGCCGTGAGGGTGAAATGGGACATGGCAGCTCTTAGCACAGGGGCTGCGGTGAAGCTTCCAGAACTGGCATGTAGATATGTAGCCCTCTCCAGCACTTCTCCTGACTTGTCCAAGGCTGCATGCTGTTGCCCTGGAAGTACTTTCAGACTTTTAATAAAGCCATAGGTGTTTTCACAGCCTTTTCTGTGGTGTGACAGATTTGTCTGGTAGGCTCTGAGTCACTAGGTATGAGAATGCTAAGGTATGCTTGGAGTAGGACTAGCCCTTTCCTAATGTCTGGGCTGAGCCCAGTGGGGTGTGGTACCTCAGGTTTGGACTGAGATGGTGGTAGATGTTTAGTTCACTCAGAGCTGGTGTCCAGATGTGGCTAGTTGGATAAGACCCAAGATGTAGCATGACTGGTTTGAATGAGACAGGTGTTTCCCCAAATTGTACAGACAAGACTTGGTCCTGGTTCAGTCTAATGGACTGTGTCAATCACACAGGACCTGGTAAGCTGTGTCTTCTTAAGCTTTGAATTTAACCAAAAGTTGAGTCTTACTTATAGCAAGACCAGTAAGAACTCGAGAACTCTGAACTCTTCTAGAACATTAGGTGACTGAGATATTCTGCCTCTGGGAACCACTTTGCTGGGCCCAAACCACACAGATGGCAAGTCTTACTTCTCTGTGTGTGCACATGTTTGTAGTCCTGATATACAGCCCAAACCCTCCCTTCTCACTCAAAACGCACGTGGTTTGCATGTGCAGTCCTCCTGGTGCTAGGATTACTAGCTTGCATCACTACACACAAACCTACTTTTAAAACCTACTGACTATAGGAATGGAATAAACACCTATAACTTTAATGCTATTCCTACATGTATCTGTGCCACGTGCATGCCTGGCACACACAAAACCAGAAGAGGACATTAGATTCCCTGGAACTAGAGTTATTGACAGTTGTGAACTCATAGGTACAAGGAACTAAATCCCAGTCCTCTGCAAGATCATCCAGTGCTCTAACCACATCCCGTATCCCCAGACTCCTGTGTATATGTGTCTTTGTATTAGGTGTACACGTGATGTGGGTGCCTATGGAGGCCAGAAGAGGACATTAAACCCCACAGAACTAGAGTTACAGGAGGCTATGAGCTTGCAGATGTGGGTGCAGAGAACCAAACTCTGATCATCTGGAAGAACAAGTGCTCTTAACCACTGAGCTAGCTCTCTGACTTTTTCTTTCTAACTCCTACTATGTTAGGGTTCCAGAGGTACAGGATGTGTAGTATTTATATTAAGTTGCAAAGCCAAACCAGGATTGCTGACACATTCTCCAGTTTCTATTTGGAATACACGCCTACACGTTTCTAAATGTTCTCAGGAATTGCTTTTTCCTTCAATGTCTCAGCACGATTGTTATCCAAACATGAGAGCAGTGTTTGTAAATAGCTGAGCTTGAGATGTACCTTTAAAGAAGCATCTCTCTGGCCTCCCTACTGTGGCTTCACTTCCTTCCTTTCACATTTCCGCTCCCCTCCCTCCCTCCCCGCCCTCCCTTCCTTCCTTTCTCCCTCCATTTCTGGGAACCTGAACCTCAGAGGCCACTCCTGGGCTATAGGTATTACTCGGACACTGTGATCTGGTGGTTTCTGTGATTGGCTTCACCTTAGCCACTACCACTGAGTATTTGGACTGAATGAAAAGGAGGTCACTGGTTCACTTAGGAAATCACTGTCAGTGAACTCAACATCTCTTGGGTGCCAGGATCTAGGATGAACACTAGGAAGCAATGAAGGGATGATCCACTCTCACACAAGGTGTTTACAAGGTGTGATGATCTCAACATTTGCATATAGTAAAGTAGTCTGACTTTTCAATAATTGTTGGTAGTGCGTTGGGGCCCTTCTATTGTTGCCAGCTCAAGAGTCCAAGGAAGGGAGCATGTTGGTGTAGGCAGAATTTGATTGCAGGGTGCAGGGGTACATGCCTTTCAAAGCTGAGTGTTGATACCCTGGCTGTTTTGGGAAACATGAATGCAGTAGAACCTAATAGTACTAAGAAGCATCTGGATGGGGGCTGGAGAGGTGGCTCAGCGGTTAAGAACACCCGACTACTCTTCCAGAGGTCCTGAGCTCAATTCCCAGCAACCACATGGTGACTCACAACCATCTGTAACGGGATCCGATACCCTCTTCTGGTGTGCCTGAAGACAGCTACAGTGTATTCATATATAATAAGTAAATAAATAAATAAGAAACATTTGGATGGGGGTGAGGGATGGGAGGCTATCTTTTGGAAATAGAAAACTAGAAGGGCTGGGCATGTGGGACCTCAATGCTACTGTTCAAATCTGTTTTTCATTGCTTAATCTTTGGTTTGCTTGAGGCTGGACCTGATGCTCCCCCAGCCATTCTGAGGTAAAGATCCTAGATCCTATTACCAAAGTTTTAATTAGGTCTTTTGCAAATTTATTCCCTTTTGACACCTTTGAAGCCCAGACTTGATTTAGCAGGAGCATATAGGAGGAAGAAACTTAAGCTTTGCCCTTTGCTGTGTCCTGGCTTACTGGAATAGATTTCCTTTTCTCTACACGAGTGAGGCCAGGGAACACACTGCCTCACATCATCTGACAGGTTGTGTACACTCTGTCTCTACAGTGTGATGTCCAACCCAGCAGGAGCAGGTAGAGGTTCTCGAAGCTCCTTTGAATTGCAGAGATTGTACTGTGTTGGTGCTGGTGTCCTGGGGTGGGATCGGAAGCAGCTTGGTAACTTGCAAATAGGTGACACTTCTAACTAAAGGATTCTAGTTTAGAGGTCGTTTGGTTGCTCTCAGAATTCACTTGTGCAGTAGGACCTGTGTTTTTCTACTAGAAAGTCTAGTACTTGGGTCATAGCAATGTAGAAATTAAGTCTGGTGTTTGGTAGCCTTCATTCTGGTTGTGGGTTATAAGAAACCTGGGTATCTGTAAGAAATGTCAATGTCTTGAAGACAAGGACTTTGACTTCCATCTGGGTTCCCAGAACCTAGGACATTTCCTGGTTTACAGAAGGCGCTGCCTATTTGTAAGTCACCCCATTAGGTAAGGTAGCCTCCTTTATGGGGCATAGTCTGCTGGTAAGGTCTTGATGGTTCTTCTCAACTTTGCTCACTCTTCCCATCCACTCTGTAGATTTTTAGAAAGTCAGAACTGAAAAGGGGGCTTGGAGTCATTGAGGCCCCTACTTGACTTATGTACTGGAAAACTGAGGCACAGAGATGAAGTGTCTGCAACATTGGGCTGGAGAGATGGCTCAGTAGTTAAGAGGACCTGAGTTCAGTTTCTAACATCACTGTGATTCACAGTCATCTGTAATTCCGGTTCTAGGTGCTCTGACACCTCTTCTGATCTCCGTGGTCACCAAGCATTCATGCATACGGTGCACATGCATACAGGCAAAACACTCATACACATTCAACAAACAAACAAACAATTGAGGATAATAGGGTAAAAGTGTTGCAAAGACTTCCACATAGAGGGACCTGCAGCCTCAGCCACTCCGCTACTTGAGATGCTTTCCCAAATCTGAGATAGTCTATTTATTTATTGGTTGTTGTATAACAAATGACCACAAACTTAGTGTCTTGAAACAGTAGGTCATTATTTTGTTCATAAATTGTAAATTGCATAGGGCTCATCCCATAAAGTTTATCCCTATTGCAGCTTCAGTTAGGTTAGCCTAAAGGTTAGAGATGATGAAGCAAGCAGTTGGAGTGATCTGAAATGACAGTCAGTGGGACCTCAGCTAGGAATAAGCCCCATCACTTAATGTCTTGGCATGGTTACCGAGAGTAAGAATGCTAAAAGAGCAAGACAGGGATATGTGATATTTTATGTGTTTAGCCTAAGAAGCCACTGGGTCTTATACTTTTGTTTTAGTATGTTTGTTTGCTTGATACCCCACCCCCCAACCCCCATAGTCTGGAGGATAGAACCCAGGGCCAGGTTTGAATAAGAATGATAGGCTTTTGTATTCAAATGTTTAATTATCTGGGAGTGGCACTAGTTGAGGAGGCTGAGGAGGTGTGGCTTTATTCCCTTTCTCAGCTACTTCTCAGCACTGTGTCTGCCTGTGTGCCACCATGCTGATAATTGATGGAACCGCTGAAACTGTAAGCAAGACACAGTCAAATGCTTTCCTTTTTGTAAGAGTTGCTGAGGTCACTCCTGTTGTGATTCCTTGATTAGATCTTGTCCCGTTGCCTGGACATCTTATTTCTACCTCATCCCCTTGGCCTTTTGATTCTGCCCTCTGAGTTGTTGTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGCTGGGGACCGAACCCAGGGCCTTGTGCTTGCTAGGCAAGCGCTCTACCACTGAGCTAAAGCCAACCCGAGTTATTTATTTATTTTTTTTAAACTGGTTTTTTGAGACAGGGTTTCTCTGTATAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCGCTCTGTAGACCAAGCCATCCTGGAACTCACAGAGATCTGCCTGCCTTGTGTACTACCAGACCTTAGTTACCTGTGTTTTGATTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTGAATAAAAGGTAACTCATTGTGTGCTCAGCACTAAATGAACCACTTTATCACTTCCTCCAAGGCTCAAGGAACATAGTGTAGGAGCAGGTGGAAGATATGTAAGAGCTGGAGGACCAGAAGAAGCACGGGAAATGCTGGCTTCTAGATGGGCGTGGCTATTGCACTCAGGAGCTCACAGCATCTGTGGTTCCCTGCATAGACCTAGGCAAGATTGAACCATTAACACCTGCCATGGATGGGGAGGAGCTCAGGGTCCCCACTTCCCTAGGTAGTGGGTGGCTGCTGGGGTAGGGAAGTTATTTTTTCTTCTGCAGTGTAAATAATCCCATACCCATGCTTATGCAGGCAGCCCTAATTAATCTCAGTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTATGAAAGTAGGAGGGTAACTTGTAAGGAAGAAGGGATTCAAAGGGGTGGAGTATGATGAGAGAAGGCAGTGGGCAGGGGAATATGACAAAATGCAAACAATTTACATATACTTTTATATGAAAAAGTAGTTCATTCTGGTCAGCTAGGTGCCTCTGAGAGTAAAGGAACTTGCCACCAAGCTCAGACCTGAACGACCTGAGTTTAATCATCCCTGAGACTCACATGGTGGAAGGAGAGAAATAACTCCTGCAAGCATACATGAGAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAATAAAGTAAAAAAGTATCTCATTCTTACAGATGATTTTCTCAGCTGATTTATAATATTTCAGAGTCCAAAGTTTTCTTTTCATTTCTTAGTGTCCTCTGCTCTTTTCTGTCCAAACTGATGAACAACCTTCTGCCTTCCTTCCAAGACCAAGCCGGGCACAGATATGGCTTGGATGTGTTTTGTGGAAGTAAAAAGGACAGTTTGTTCATAGACCCACAGCAGCCTTTGCTTAGATTGACCTTGAGAGTCTCCTTAGACCACAACCTGCTTGTAGCTTCACTGGAAGGCTGAGGCTTTTAGGACCCTTAAGGTTCCTAGTCCTCTGAGAGGGGATTGACTGGGGAGCAGGAAAGGCAAGTTCTGTTACCCGCTCTTGGAGTGGGTTGTCAACAGAATTTTTTGAGCTTTTAGGCTAAGGAACAAAATACTCATCTTGCTGATAGGCCCCAGGCTGCGTTCCTCCTGTTTTTTCTTCCCCTGTGTTCACAGGACAGGGTAGCACACTGAGAGTGCCGTTCCCAGAGTTGATGCCGTCACTGAGTTGTGGGAGTTAGCAGCCCACCTCAGTTGAGCAGCCCTAGAATGGCTAATGACCAACTAACTCCAAGGCAGTTTTTTCTGAAGCACGCTAAACACCAATGGAGTAGTAGCTCCTCCCCCAAAGAAGGCTCACTTTCTTGTGTTCACAACACATCCTGATGCCTCTCAGGGTATGTGGGCACCTAGGACTTCCTCCCAAATGCTTCCTTCCAACTTGACCTTTTCCTTTCTTACAGTATTCCCCCTGGCTATCCCTCAAGTCCCCCACTCCCAAGTCTACCTGCAACTTCAAGGAAGTGAGTTTAGAAGTGCACTAACAGCCTTCCCAAAAAAGTTCTGGGTGTACTTAGTAAATATGTAGGCCATTTTTTGACACAAATGCTTCCTGCCATTAAGAGAATCAGGTTTGCATGTCTGTAATCTCAGCACTTGTAAAATGGAGGCAGGAGGATCAGGAATTGAAGGTCAACCTCAACTGTATAGGGAGTTCAAGGTCAGCCAGGGATACAAGAGACCCCGTCCTCAGGAAAGAGAAGGAAAAAAAGAAAGAAGAGAAGGGAGGAAAGAGGGCCCACACTAGGAGTGGGTTATATGACAGCATAGGGAATAGTTTGCATTTTAAGGCACTTCTGTCTGCATGGGTGGAAGCATACACACATTGCTTTCTCTTTAAATTTGTTCTATTTCCATACCTCAGTTCATACACTTAAAAAAAATTACTTACTTGTCTTAAATATTTATCTCCATGCATGTGTGTTTATATTCTTACATTCTTTTAAATTTCCTGTGTACATTCCCCCACCCCCTTTGCTTTTATCTGTTTTTCTAACTCCCTGTCTCCTGAAAATGTTTATTTTGGCAAGTCATATGCCATGGTGTTGGCATCTGTGTCCGTGTCAAGCAATAGAACTGGCTGCTGCTGACAAGCTGTGGCACATACGGTACCCAGTTCCACAGTGGCTGCCTCCCACAGGCCAGGCTCTGGGACTGAGAACAGAGTAGGCTGTCAAAGAGCACCATCTTGGGAGTGGATTAGCTGCTTTGTGTTTGCTTTTGTCTTATACTTCTCGTATAAGGGTGTTCGGGAATTATTCATAGTGTTCACTTTTATAATTTGATACCGTCTTAGTCATATAAGTAGTGCCTGGAGATAATTAGAGAAAGTGTTTTATAAAGAACTCAGGATTTAGAGAAGATAGCTGACCTGCCAGTAAGCAAAACAAGGAAGTTGGCAGAACCAGATTCAGGTATCTAGGCGGTTGGTCTGGTCTACAGTTGTTGCTGTGTGGGGGAGGGCTTTGGGCTGACAACCTTACAAGTACACTAGATGTTTTGTGTGTCTTTCTGTGTTGAACACGGACATTTATAGACAAAGGCTAGGGCAGGCATAAAGGAAACTAAGGTTTTTCACTGCTTATCTTTTCATTCATTAATTCATTCATTCACTCACTCAATATAAAAAAAAATTACATTTAGGTACAGGGGATAGCAAGATCTAATAGGATAGTGTCATAACTTTCAAGTAAGTCCATTTGTGACTAGTTAGGGAGATATGTTGGGAAACAGTCTGATATAGGCATGTCCAGCCTGCAGCTTATAATCCACATTCATCCCAGGATACTTATGAATGTGGCCTAGTATATTTGTAAATGACAGCATCGTGTTGTAATGTCAAGGTTGGACACCCTTGTAAGTATTATACCATAATAGATATTTTTCTAGCCAAGTGGAGGGATTAAAAATTGGCCACCTGGGTGAAGCATGTAGGGTTAAGGAAATCTAGGAGCTTGGAGTGCCTTTGGATGGATGCAGGATTGGTATGGAAGGAAATACAGTGTGAGGTGAGGAAAGCAAACTAAGTAGAAACCATGGGGACCTTGTCAGCCTTGCTTTTAGTCTGCAGATAGTAGGGGATTTCAGCAAGGTGAGAAGATGGACTAGAACAGGGTCAAGACTGAGGCAAAGGGAAATCAAGAGAATATTTCCAGTCCTGGTGCAAAATAAAAGAAAGATCTTAACAAAGGAAGTAGCAGCAGCAGTGGGGATTGGGGTGGGGCTGTGAGAGGTGTTAGGGAGCAGAATTGATGAGATGTAGTCATGGAGTAGGTATGTATGTTGGGGAGCAAGATGGATCCAGATGTGTGGAGGAGGGGGAAACAGACCTTTTGTCCTTTATCTATAATGATAAAACCAAAGATAAGGAAGCATAAAACAGCATAGGAATGGCCTAGATTGATGGCCAAGGAAGGCCAACTCTTTTTGGTGGCACATACAGAAAGAGAGAGAAGTGTGTGGACATTGTCTTTTTGATCTCTGTTGATTCTTAATGCCTACTTATAGTACTTGGAGCATACCTGCTATACAGTATACCACATGAGTAAAGGGCCAAGCTGTGCCTCAAGCTTGAGGTTTGTACAAATACACATGGAGGGCACTAGGGAAGCTCTTAGCTAACCTTCTCTGAATCTGAACCAAGCGGGGCACTGGTTACAGCGTGCCTGAAGAATGAAAGCACCAGAGTGGGAGACCAGAAACCAAAGAAGGGTTTGCTTAGAGCGTTGGCTTTGTGAGCACCTCTGGATCCAGGTCCTGTCATCATCTTAGCCATCATTTTCTCTCACCTGACAGGCAAGGAAATGTCTTACTTTCTCTCTCACTGTGTTTAAGGATAAAAGATAACTAAATGAAACAGAAGACCAAGGCTGAGTGTTATCCCATGTCAGTGATGCTATCTGATGTGCAAACTCCTTTCACAAAGATCCAAGCATCCAGACATCTGTCCACAGTGTTGTATCTTTCTTTAAGCCTTCTGTGAGAAATGACCAATTCTTCTGCGCCTGTCCCTACCCTGGGAGCAGAAACCTGCAGAGGCACTTCTCCCATCTCCAGCTAAGAATCACCGAAACAGAGTCCTCTGTGGAGCCCAATGACTTATCTTTGTAGGGACCTGGATTAATCCCCCCCCCTTCTTTTTAGGTGCAGCAAACTTTCTTGATGGTATTCAAGAGAGTAGGGAGGGCTCCCTAGGCCCCTCCTCTTATTATGGGGGTCTGGGATGAAATTGTGAGGGAGATGCTCAGTATTGGGGGCTGAGTTGGGATGGGGACTCCTCAGCAACTGAGGGCCTCTCTCTTTCTCTCAGTATCCTTGCTGGACTGGGGTGGGTGGTCCAGGGTTTCTTGCTCCTTGGAGGCCATGTAGGCCATGAGGTCCACCACCCTGTTGCTGTAGCTGTATTCATTGTCATACCAGGAAATGAGCTTTACAAAGTTGTCATCGAGAGCTATGCCAGCCCCAGCATCAAAGGTGGAAGAGTGGGAGTTGCTGTTGAAGTTACAGGAGACAACCTGGTTCTCAGTGTAGCCCAGGATGCCCTTTAGAGGGCCCTCGGATGCCTGCTTCACCACCGTCTTGCTGTCATCATACTTGGTAGGTTTCTCCAGGCGGCATGTCAGATCCACAATGGATACATTGGGGGTAGGAACATGAAAGGCCATGCCAGTGAGTTTCCCATTCAGTTCTGGGATGACCTCGCCCACAGACTTGGCAGCACCAGTGGATGCAGGGATGATGTTCTGGGCTGCCCCACAGCCATCACACCACAGCTTTCCAGAGAGGCCATTCACAGTCTTCTGAGTGGCAGTGATGGCATGGACTGTGGTCATGTGCCCTTCCACGATGCCAAAGTTGTCATGGATGATCTTGGCTAGGGGGGCTAAGCAGTTGGTGGTACAGGATGATTGCTGACAGTCTTGAGCGAGTTGCCATATTTCTCATGGGGGTGTCGGCCGAAGGGGCAGAGATGATGATCCTTTTGGCCCCAGCCTTCAAATGGGCCCTGGCCTTCTCCATCATGGTGAAGATGCCAGTAGACTCCATGACATACTTAGCACCAGCATAACCATTTGATATTAGCAGGATCTCGCTCCTGCAGATGGTGATAGGCTTCCTGTTGATGACAAGCTTTCTATTCTCAGCCTTGACGTGCTGTTGAGTTTGCCATGGGTAGAGTCATACTGGAACATGTAGACCATGTAGTTGAGGTCAATGAAGGGGTGGTTGATGGCAACAATCTCTATTTGCCAGATGCAGAAAAGGCAGCCCTGGTAACCAGGCGCCCAATACAGCCAAATCCATTTACACCGACCTTCACCATCTTGTCTGTGGGACGAGGCTGGCATAGCACAGGAAGATGCGGCTGTCTCTGGAACAGGGAGGAGCAAAGAGCCTAATCCCATTTTTAAATCTGTGGCTTTATAAAACAAGAGAGACTAGGGACCCCTGACCATTGTACGTAAGCTGGGGTCTCCTTAAGCTCATTGCTCTGCTAGTGCCTACTACAGAGAATTGAGGCTTCTGTTCCCACTTCTCATTGAGCAGGCTTTTTGATCATGAGCTTGGCTATACACTGCAGTTCTCTCGTCTGTGCCTATGTGCAGTACCATGTGCCTATGTACATGTGCAGTGCCTGTGTGCAGTGGCTCCTGTTTGACTTGCCCTTTTTAAAACAACTGAACCCATGTGAGGTTTCCTGTTGATCAGGTCAGTCAGAGGCTGTGACCCAACAGGGAATTGTCAGCCAATCCTTGAGTCACCAGAGCTCCCGTTTTGTATGTGAGCAAGTGGTGACAGCCACTGGCACAGGAGCAGCTGGCCGCCGTCCTGGAGATGGCATGATATTTTGGAGGCTGTGATGCCAGACAGCCCAGTTTCTAATCAGTCAAACCTTCCGTGGGTTCACTGTTAGCAAAATCCTACAACCTTTGAACTAATATTGTTCAAAAGGAACTCGTAAGGTTGACAAGTGATTATCATAGTAGACATCAGAAAAATGTGCTGAAGAGGAGGCTTGCTCATAGCTCTCCTCAGTAAGCTCACTTACCTTTCCCTTCGCCTCTCATTCTTGTCAACACTCATCCAGGGCTTTATAGATGCTGACCGCATGGCTTAGACAGGATCTCTAGCAGAGAAATCCTCTGAGTCTTATAAATGTTGTGTTGTAGACTGGGCTGTGTCCAGTGCCGTGGAGGACTCTGGTGGAGCTATGTTTGGTGGATGAGGCTACTGTTTACTGGTTGCTGTTTTTTATTTCTTCTCCAGTACAAAGTTTTAAAATAAACATATAATTTGATTATAGAGTTTGAACAGATACATGCTTTCTATTACCATTTCTTTCTACCCTAAACCTATGTTTTCACTTTCAGAGTCCCTCTTCTAGTTTCATGACCCCCATAGTATATATAATATATGTGAATGTATGTGTAATCTTGGATCTGTATATGAAGCGAACATGGGTCCATATCTAGGTCACTTTGCTTAACAGAAAAATTTCAAACAACAAAATATTAAGCCACGTGTGGTGGGACAACGCCTTTGATCCTAACACCTGGGAGGCAGAGGCAGGTGGATCTCTGTGAGGTTGAAGCCATTCTGGTCTTTAGAGTGAGTTTCACAACAGCAGGGCTCTGTTACACAGAGAAACCCCATCTCAAAAAACAAGCAAAACGACAGCAAACTTCTAATTCCATTTGATTTCCTGCAGATGCCATGATTTCATTTTTTTTATGGCTGAGTAAAACCCCATTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGTTTTACATTGCTGTAGTCTGTTCCTCGTTGGTGAATATCTAAGTTATTTCTACTTTTTAGTTATAAACAGTGCAGCAACAAGTGTGGATGTACAAGTATCTCTGTGCTAGGACTTAGAGTCCTTTGGTACTCTCTTTAGAGAAAAACTTGGTGTAGTGTAAATTCACATTGTGGCTTCACTACTTAACATCTAAGGGACCTTGGGTGCGAGATGTAATTTCTCTAAGTCTTTTTATTTGCATAATGGAGGATAATAATATATAATAATGACCTAATAGAATTTTAATGAAAGTAAATTGAGTTCATGTGTTTGCTGAGATCTGTGTATGGATTTCAAGTGGAAAGGACTCTTTCTTGAGGAGCCTGACTAACCTTTGTAAAGCCATTGGGAATCATAATTCTGGTCAGGATAGTGGGATCTTGTATCAGTAACACAGTCTTAGGGGCAATAACCAAGGGTTAAAGACCAAAAGTTTTGGCATATATATTTGGCATACTTTAGAAAGTAATGTGTTGGGCTTGTTTTGCTGCAGTTTATGGAAGTTGTTCATTAGCATCTCTTCTCAGCTGCTCATTCGCTGATGTATTGATAATTGAGGACCATTTTTAATGTAAAAAGCACTGTCTGTTTTCTTCTAAGAGAGCCGGTTGGCCATGTAGCAGCACATCGCTGTTCTTACTGCTCTCTAGTTGACAGATGCAGATTCTTGGATTTCTCTGGTCTATTGAGGAATAGGCTTCTGCTCTGCACATTACTCAGGCTCCTGAGGATGAGCTAGACAGAAAGACTCATGGAGGTTGCTAAAGAGCTATTCTCTACTTGAGGACAGCCTTAAAGATGTATATTAAATGAGGAATTTTTTTCTTTGTTTTGGACATACAAACCCAGGCTGGCCTCAGACTCCCTGTGTAGCCAGTGATGACCTTGAACTCACAGTCCTCCTGCCTCCCTTTCTCGAGTGATGGGATTGGTGTGGAAGGGAGCACTTAGAGTATTTTTGAGACTTCTATAGAAGCACACCATCAGAATGAAACATCCCTCTGGTTTTTAGACCATTCACTGTTTTCTTTTTCCTCCTTTTTGCTCTTAG
Seq C2 exon
GTCTCAGTCAGTTTCTCCGCCTCCAGTTTTATACCCACCAAGAAGTCCCATCTACCCACTCAGTGATAGTGAAACCTCAGCCTGCAGGTATCCCAGCCACTCTAAATCCCAGGTGCTTCTCAAGGACCGGCACTCCCGAAATCCTTCACCTCTAGGTCAAGACCCCTCCCCAGACACTTCACCACCCATCTGTACCCTCAAGGCTACCAGCTTCAGCTACTTGGACAGAACCCCTTCATTACGCAGAAGAGAGGACCAGAGGGAGAGCGTTCAAGGTGCAGTCCAGGATGTAGAGGGTGTGGCTGCTTGCCTTCCCCTTGCCCAGAGCACCCCATTCCTAGGGTCTGGCCCACGGAGTGTCTTGCTGAGTTGCACTGGTACCCGAGCCCACAACCTGGGTATCCGAGAGAAGATTTCAGCATGGGAAGGTCGCCGAGAGGCTTCACCCAGGATGAATCTGTGTGGAGAGAAGCGGGAGGGCCCTGGGAGCGAGAGATCGGTCAGTGAGGGCTGCCCTAGCGTGGGCTGCCCCAGTGTGGTGCCATCCCCTTGCAGCTCAGAAAAGACCTTTGATTTCAAAGGCCTCCGGAGGATGAGCAGGACCTTATCTGAGTGTTCCTACCCTGAGACAGAGGAGGAGTCAGAGGCACTTCCTGTACGGGACTCTTTATACCGGCTGGAGAAGCGTCCAAGCCGGACTGAGCCCAGTGCCTTGCTCAGGGGCCATGGCATCAGGAAAGAGAGCTCAGCAGTGCTGAGCCGGATCCAGAAAATTGAACAAGCCCTAAAGGAGCAGCCTGGCTGTGGTCTCCCCCAGCTCCCTAGCAGCTGCTACAGTGTAGACCATGGGAGGAGGAAGACTGGAACCTTGGGCACCTCGGAGGAGCCAGCAGGAACTGCAAGTGTAAGCTCCAGCAGCAGGGCAGGAGGAGCCACCGGAGTTGCCAGGGAGGCAGGCCCACCCCTGGACAGGGAAGGCAGTGGTTCCATGAAGTCAGAGACTCCTGGAAATAGCTCTAGTCCCCAGCTGCTGCCTTCAAAGAGCTCCCCTGATCCCGCTGTGAACCCTGTTCCCAAACCCAAGCGTACCTTTGAGTACGAGGCTGACAAGAATCCCAAGCCGAAGCCAAGCAATGGTCTACCTCCTTCACCCACACCTGCTGCTCCACCTCCCTTACCTTCCACCCCAGCCCCACCAGTCACCCGGAGGCCAAAGAAGGATATTCGTGGTCACCGGAAGTCACAGAACAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSRNOG00000013934:ENSRNOT00000064902:3
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion (1st CDS intron)
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=1.000 A=NA C2=0.778
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]