RnoINT0163614 @ rn6
Intron Retention
Gene
ENSRNOG00000001086 | Vps37b
Description
VPS37B, ESCRT-I subunit [Source:RGD Symbol;Acc:1304576]
Coordinates
chr12:37984790-37999693:+
Coord C1 exon
chr12:37984790-37984941
Coord A exon
chr12:37984942-37999521
Coord C2 exon
chr12:37999522-37999693
Length
14580 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GAGGTGAGC
5' ss Score
8.7
3' ss Seq
AGCCTGTGTGTTTCTTGCAGACG
3' ss Score
9.68
Exon sequences
Seq C1 exon
GAGCTTGGCGGCCGGAGCGGCGGCGGCGGCCGAGTGGCGGGATGGCGGGCGCCGTGAGCGAGGCGCGCTTCGCGGGGCTGTCGCTGATGCAGCTGCACGAGCTGCTGGAGGACGATGCCCAGCTCGGCGACATGGTGCGGGGGATGGAGGAG
Seq A exon
GTGAGCGTCTTGGGACCGGGAAAAGGGGGTGCTGGACGGCGCGCTGGCAGCCAGAGTGGGGCCCTGACGCGAGATTCGGGGGCACCGAGGGCCCCAGGCCGGTTTGAGTCGTGGATCGGACTCTTGAACCGAGACACGGGGTCTTTGGGGCCGGGGCTGGGGTCGGGAGAGGGAGTGAAGGCGCTGAGATTGGCTTGGTAAGGGCGGAGGTGACTGCCGTTGAGTCTCCTAAGGACTCTAGGGAACCAAAGCAGGTAGATTAGGCATGGGTTTGGGAAGGTTTTGAAGGGAATGGTTGGAAAATCGTAGGGGCACTGAAGCCAGTAAAAGCGGATCGGATCTGGGGACTAGCTCGAGTTGTCGGACCGTTCAAAGATGGGCTTGTGGGAAGCAGAGATCTGTAGCTAAGTCTCGGTTGGGATTCTGAGAGGGGTTCTCGAAGTTCAGAGGCTCCGGATCACAGACAGCAAGGGTGAGGTGGGAAGGGGCCCAGTGAATGCCGGCTCTCCAAAAGGCCCTTTCCCGTGAAAGTGGCTTTAGGAGAGTTGACTCAAGAGTTCCTTCCTTTGGTTCTGTGAACGGTCTGTGAGTAGCAAGAGGATCCCTTTCCCCAAGCATCCTGGCCTTCGTGTAAAGAAAGGATTGAGGGAATTCTAGTATGGCTGGCTCTGCCCCACGGCTGTCTTGCCCACCTCTCTGGGCTCCTTCTGGCAACAGAGTTAAAGGGGGCTGGGAGCTGACTGCTGACCCCCCCTTTCTCGATAGTCCAAAGCCAGCCCAGCCTCTGGAAGGCATGCGCCCGCCCTTGTTTCTGGTTATCTTCCTCCACACCTCGCCTGTGGTTTGCTTTGAGGAGCGACTGACTTCACCCTTGCAGATCTGCCCTGAGTACTTCCCCTTTTCCTTCTCTCCCAACTGGTCCTGACATTGACGCTAGAATCGGGAGCTGTCTGATCTCTGGCCCACTCACTACCTCCTTTGTCTGGGAAGTCTGAGCTTCTCTAAGCCTGCTTTGCCTCCTGCCAGAAGCTGGTATAGGGGGGCTTTTTTTGGCTTGCTTTCCGAAGAGGAATTGTACAGCACCCAGCCGGCTCCCTTCCAAGGGGGCTTGTAAGAAGGTTGTACATTCAGAATCCCTGGAAAACCCTCAGCAGATCATTGTCTGCCGCTACAGAGGGACCACTGTAGTAAGATGGTATCAGTGTTTCCATTAATACAACCCCTTGTATTCACGGGCTTTGCAGCTTGGCACATAGACCGTTGCCCTGAGATGCAATTTACCCAGTTTGTGGTTCCCATGTGGCACTGTCCATTTTCAGAGAATAATAAGAGACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCTCCATCTCTCTTGACTGAATGAGAATTCCGTGCCTTGCACAAGAAAGGACAATCCTTGCTTGGCTTCTCGGCGGTTTCTGAGAGACGTTTTGTTGACTGCGTGCGGAGTGTCTTTCTAGCTTAATAATAAAATGATAGGTGTGTTTCTCAGCATGTGGTCCTGCCTGCAGGCTGCCACTCTGCTGTCTGTGACTATTCAGTTCCAGTGAGAACAGCTACTGGAAGTCCGTTAAGTGGAACGTTTAATAGCTTAAACTCTTGCTCAGCGGAGATCGGTGGGGAGCGAGTCAAATGGCCTGTGACTCCAACCTCCCCCTCCTCCCCCTAGAAACCTAGAGATCGGTTTGCTGTTGATGTTTTTGTTCTGTTTTTGAGACAGGGTTCCTCTGTGAGGCCGTGGCTGTCCTGGGACTCAGTCTGTAGACCAGGTTGGCTTTGAATGCACGGAGGTCCACCTGGTTCTGCCTCCCCGGGTGCTGAGATTAAAAGGCATGCTTCCATCCCTGGCTTATAACTGGAGATTATTCAAAGAAGAGAAGGGCACAGGAGACCTCATAGTGTTACTGAAGTTACTTAGCAGTACTTTGTCTCTGACTGTGTCCAGCTTTTAAAACAGGGAGGCAGATGCTCGTTCACAGCCAACCACTGGACTGAGCACAGGGTCCCCAATGGAGGAGTTAGAGAAAGGACGGAAGGAGTTGAAGGGGTTTGCAACCTATAGGAAGAACAATATCAAGCAACCAGACCCCTCAGGGCTCCCAGGGAGTAAACCACCAACCAGAGTCCACATGGAGGGACCCCATGGCTCCAGCCGCATATGTAGCAGAGGATGGCATTGTCAGGCACCAATGGGAGGAGAGGCCCTTGGTCCTGGGAAGGCTTGATGCCCCAGTGTAGCCAAATGCCAGGCTGGGGTGACAGGAGTGGATGGGTGGGTGGGGGGGAAGACCCTCATGGAAGAGGGGAGGGAGGGATGGGATAGGTGGTTTCCAGAGAGGAAATCAGGAAAGGGGATATCATTTGAAATGTAAGTAAATAAAACATCCAATTAAAAAAATAAAGAGACATAGAATGAAAGAAAAAAAAAAAAAAACCAGGGAAGCAACTTGAAAACCAAAACACCTGGTCTGCACACCCGTTTCCTTAGGTTATGGACAGTGTTTTCTAAAGGAATGGGTGGGGCTCTGACAGCGGTTTTTATTTTATTTTTTGGTTGTGAAAGTTTCCCTCCCCTGGCCATGTCGCACGTTTGTTTATTTTGGGATGGTTTCAAGAGAGAGAAGAGGAGTCTGTGAACCATCCTGAACCATCCACTCCTGACCAAATGAGGTATTGTGTGAAAGCGTTAAGGAGCTTTGGGGCTTAGGAATGGTAGACTGCGGGGTGGACTTGGCTGCTTTCGTGCTGTGTGACTGTAGGCAGATTACTGCACCTCTCTGAACGGCTCTCGGGAAGGGCAGTGTGATGTTTCATAGAGTTGATAAGGGTCAGGTGAGATGGTGAAGTTTAAACACCAAACACAGTTCATGGTTAGTTTCAGTAATGAATAATAATAAAGGAATAATAATTGCTGGAGCCAGAGCGGTAGCAGGGTTGGCAAGATTTCTGCTGTGGAAGCGTGAAGATCTCAGTCCAACCCCCAGAGCCCACATAAAGAGCCAGGAATGGTGATGCACAATTGTCATCCACTTGTCTCCCCCAGGACAGGGAGACAGGAGGTTCCCTGGGGCACTGGCCAGCCAGTCTAGCCTAGTGGGGGAGCTACAGAGACCCTGTCTCAGAAAACAAGGTGGACTGGACCTGAAGGAGGCAAGGAACGCCTCAGGTTTCCCTCTGGCCTGCATACTCTGGTATGCATGCTGCCCTGTGTGCCCCTGTATATAGTGGATGAGAGCTGGAGAGATGGCTCAGTGGTTAAGAGCCCTGGCTGCTTTTCCAGAGGACCTGAGTCTAGTTCCCAGCACCCACTTGGTGGCTCACAACCATCTGTAATGGAATGCAATGCCTTCTTCTGTGCAGTCGTACCGGCAAATAGAGCACTCGTATATAAGCAAATAAATCTTTAGGAAAAGAAAGAACTAGCCGATGTCACCCTAACAGATGAATAGGGTCTTGTTTTTTCAAATTTTAAGATAAATCTTGACTTGCCATTAGCCTCAAACATTTGACCTTTCTACAGTCAGAGGGGTTATGTGACTCAGTGGTTCCAGAAAACACTGGGGAGTGGAGTGGGCCTTTCACAGCACAGACTCCTCTCATAAGCTGGAACGAAGCCCAATGCTCGTTCATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAACTGGCAGAAGGAAGTGTTTGAAATTGCAGGGTGAGGCTTCTCACAGCCGGAGGGGATATTTTGTGGCTGCTGTCAAGTGTGGCTTGTTGAAGGCCTTCACTGTTAGGCTTAACTGCTGTGGGCATTGTCTTCTCTATTTTAATTGCCGAGTGTGAGTTTTAGCACAGCTCCAGGCATTAGCATGATGTGGGTGCACCGGGTCCTGTGTGTTTTCTCTTCTCCTGTCTCCCGTCCAGTATACTGCTCCCTAAATGCAGACACTATTAGTGGGTCTTCTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTGGGGAAAAAAATGGTGGTGTGGGTGGGTGGGGAGGTGGGGACAGGGATGGGAAGATGACACAGGGGTTGGGACAGGGTCTCCCTGCATAGCTCTGACTACCCTGGAATTCATTTTGTAGATCAGGTTGACCTAGGTAGATCCACCTGCCTCTGCCCCTGCCCCTGCCCCTGCCCCTGCCCCTGCCCCTGCCCCTGCCCCTGCCTCCCACGTGCTAGGATTAAAGGGCCTGCCTGTACCACCACGCCTGGCTGAGTTTGTTTTGTGTACACATGGGTGTTGATGCTGGAGTGGGGTTCTGAGACCAACTTTGAAGAGGAGGTTCTTCCTTCCTCAGTGGGGCGGAGGGATTGAACTCAGGCTTGAGCAACAAAGGGCCTTTACCACCCAAACCAACAGTTCTCCACCTGTGGGTCTCCACCCCTTTGGAGGTTGAACAGCCCTTCCACTGACTACATGTAAGGCCATTGGAAAACACAGATATTTACATTACAGTTCACAACAGTAGCAGAGTTACAGTTATGAAGTAGCAGTGAGATAACTTCATTGTTGGAGGTCACAGCGACATGGTTAAATGGTCGCAGCATTAGGAAGGTTGAGACCCACTGACTTAAACCGTCTCTTACTGGCCTTCTTTCTTACTTTATTTTTGCCTGGCAGTGGAATGCACCTTTATCTGGCCACATGAACCCCATTGACTGGCAAGGCACTGCCATAAAAGGAACGGTTGCTTGGGGGATTAGGCAAGTACACCAGAGCGCTTGGGTCACTTCTCCCTGTATGTCTTCTATGGAAATGCTGGTCTGCAGGCTAACGGTTTCAGAGAATTCAAATTCTACAGCTTTGTTCCTGTGGGAATCAAAGTGCCAGCACACAGAACTGTGGAGAGGGAGCCTGAAAAGACAGTGTTTTGTGGAGAGCGAAGAACTCTGGCCTGGAAGAAGCGGCTTCCTTGAGGCCTGTTGGGCTGTGACTTGTGTGTGACTGCAGCCACTGCTCCAGTCATAATGGCTCATTGACATGGAGCGCTAGCCTGGGACTCCTTTGGAACACGCAGGCTGAATCATTGCTGGTGGGAGTCTGGTTTTCAGAAGCCAAGAATTCGAACTTGTTGAGGTTAGGCAGTGGGGTCTCACTCCGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTGACTATAAACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAGCTCCTCCTCCTTTTGCCTCCTGAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGAGCCATCACACCTGGGTTTTCCTTTTTTAACAGTAATGCTACAGTCTTAATAGAAGACGATTGGTAAGAGTCACGTGACTGGGTCACTGCCTTTAAGTTACTTAAAGTCTGTGCCCTTCAGTTTTTTCATCCTTTAGAGAATGGTGGTGGTGCCTACCTTTTTAGGGTTTTATGCAACCCAGAGGGAGTGGTCCCCAGAGGCCACACACACACACACACACACACACCTGTTTCTTAGAGCTATTCTGAGCTGATAGATTGAAACAGCTGGACTGTCACAAACTTGAGACCAGACTGGGCTCGATTGTGTTGGTCTCAGAACCCCACTCCAGCATCAACACCCATATGTACACAAAACAAACTCAGCCAGGCGTGGTGGTACAGGCAGGCCCTTTAATCCTAGCACGTTAACAAGAGGCTCCACCCACCAATCTAGATGTCTCATTCACAGCCCTTCCCCGGCCCCAACCAAAACCTCGTTCTCTCCCATCTTGATACCTGAGACGACTGCATGCGGGGAATCGGATATGTGGACCCTCTGGGGTTGGCCTTTCTACCACCCGTGATTCTCTGGGAGGTTTATTCAAGTTGCTTGTCTGTGTGAATCATGCTCTCCCGTTTAATTCCATGGTATTGGATTCGTCATAGCTGTACTGTTCTTGTGAAGGATACACGGGTCGCTTCAAGTTTTAGATGATTTTTAACAAATCCAGAGGAAATTTAAGTGCAGGGGGTGGCATGTGTGCAGAGCAGATCTTGTTTCTCTGGAAGAATGCTCACAAGTACAGTTCTCCTGGTCAAATGATCTCTCCATGTTTAGTTTCCTAAGACCTGCCAGAGGCTTAACAATGGCAGGAAAGACTCGTGCAGCCATTAGGCCATTGGTCACGAAGCTCACAAAGGCCTCTTGCCCCTGCCCCTGCCTCCTCACCACTGTGCAGGATTAAAGGGGCCTGCCTGTACCACCACGCATGGCCTGAGTTTTTTGTGTACATTATGGGTGTTGACTGCTGGAGTGGGGTTCTGAGACCCACACATTCGAGCCAGTCTGGTCATCAGTTTTGGTGCAGTCCAGCCTGTTCAATCTATCAGCTCAGAATCAGCTTCGTAAGAAACAGGTGTGTGTGGTGTTGTGTTGTGTTGTGCCTCTGGGAACCACCTCCCTCTGGGGTTGCATAAAACCCTAAAAAGGTAGGCACCCACCACCATTCTCTAGAAGGATGAAAAAACTGAAAGGCCCAGACTTTAAGTAACTAAGGCAGTACCCAGTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATGGCGGGTAGGCCGGCAGTGAACCTAAAGGGGTATCCTGGGGGGCAGGGTATTCGGTGCTCTGAGGCCCGTCTGCTCCACGAGACTGCCCTGAACTAGTGGGAGGAGGCAGGGCAGGGGCAGGAGCAGAGGCAGAGGCAGAGGCAGGTGGATCTACCTAGGTCAACCTGATCTACAAAATGAATTCCAGGGTTGTCCAGAGCTATGCATGTGTGCCTGTCACCCCTGTGTCATCTTTTTATCTGTTTCCTCATTGTCTCTTATTGAAAGAGGGACTAGGGGTCTGTGTGTGTGTGTTTTACCCCTCCCGGTCACCCATGGATACAACTTCAACGTAGGAGTTCTCCAGGCTCCTCTTAGTCACAGACAGATCCGTTCCCTTAGCTTTTCATCTGTGTCACCTGTGGCATTTGCTACTCATGTTATTAATCTGGTCTTCACTTCTGTGGCCCCGTGGGCTCATTCTGTCACATGTGTGTTTTCCACACCGAGCTTGTGTGTTCAGTTGCCCTGGGCTTTCAGTGAATGGAGAGTGTCCTGGATGAGTGCTGTGTGAGATGTAGGGTGTGTGTAGTGTTGTGTGTAGGGAGAAATGTTTCCTGTGGTTATATGGAGGCTCCAGCAGGGTCATGTGTGTGTGTAAGTTGTGTGGGGGCTGTTTGAGTGTGTGTCGTGTTCTTGTAAGTGTGTGTGAAATCAATAGGGTTCTATAAGTTTGCATGACTACCAGGTAATTAGTTGTGTTCTTTTCATGGTCAGAGGTGACCATCAAATTGTGTAAGAAGTTCCTTGGGAATTGAGGTGGCTGTTTCAGGACTGGCTGTGTCTGTATGTGTATAGTGACCGTTTGCACCCTGATCTGCAGTTGGGCTGTGCCCTGAGGCTAGGGTGGTGTGTTGTTCGATGTGCCCCTGTGTTATTTGGAGGTAGATGTTGCCATGGGTGATTGTGCCGTGAGAGTTCAGGGCAGCTCTGGAGCAGACGGGCCTCAGAGCCCTACCTGCCTCCCAGGATCCCCCTTAGAGTTCATCCGGCCTCCCCACTTGCTTAAGCAGCAGAGAGAAATGAAAGTGTCTCCGCGCCACCAGCCGTGGAGAGAAATGAAAGCATCTCCGCGCCACCAGCCGTGGACATGTGTCTGGCTCTTGTTTTACAGTGTTGAGCCGGGGGTTTAAGTGGCTTTGTGACTGAGGTCCCCGATGGTTGGTTTCGGCTGAGTGTGGTCTTTAGGGCCTTGTGTATCTGCTAAACAAATGCCTCTGGCGTGGTGGGGTTTCCAATATCCAGGGCTTTTCTTTTACTCTGGGGGTTCCCCTGGTCTCTGCTGTGTGCGTCCCATGTGTGTGGATGCTGGGAGCACCATCTAGGGCATGGTGGGAGGTGGGGGAGCAGAGGACTATATACAGAATACAGAGGAAGGAAGTCATAGCAAAAAATAGCCTGGGTGGGGCAGCAGAAAAATATTAAAGGGAAAATGGATGGCTGGGCAGGGTCAAAGAGCCACTGGAAGAGGTGTAGTCTGCCGCCTTGGGGGAGGGTTGAACTTACAACCCAGAGATGGAGGTAATGGTGGGCCGGCCATGTAGGGGAAGTTGTCACGAGTGGGGAAATAGGGAACCAGAAGGCAAATGTTCTGGTTTTTCTCTTTGAACACACGTGGCCAAGCTTTGTCCCATTCACGACCTCCCCCTCGAAGGTCCACACCGTCAGCCTTCAATACCTGTCAGATAGCCTTGCCTCTCGAGTGGAACCATTGTCCGCCACAGCCAGCCCCTCTGCCTTTGGGTCAGCTTTGCTAATGGCACCATGCGGGAGAGCTAGTGGGCGTGAGAAAGGATGGGAGAAGCGGTCACTGTAAACATAACTCACTCTCTGAGCCCCTGCTGGGCTCTTTTGATCTGAGGCTGACCATGGAGCGCACACTGGCATCCTGCCGACAACAGAGCACGAGCACCCTCTGATAAGCGGGGCTGCGATTTCCTCTGCAGCGACAGAGCTCACTCTGAGCAGTCCAGCCCTGTGCGTTCACAGATGTTTGCAGCTGTGCAGAACTCAAGTCCCAGTGCATCCATGGAAGCCAAAGCCCCGTGTGTCACCATCGGGAGGGAATTGGGCCTCATCCTTTGTGAATGGGGGAGTGCTCACAAGAAGGGGAGGAGCAGGAGTCTCTGCTTAGCCTGTCTGCCCAGCGTGTAGGCCAGCTGGGAGACCAGGGAGGGGCATGGCCTTCTGCGTTCCCCCATGCAGAACTTGCCTGGGAACCAACACACCAGCCGGGGTCTCACCAGCCTGTGTGTTTCTTGCAG
Seq C2 exon
ACGCAGACTGTTCAGCATAACAAAGAGATGACACTGGCTAGCAACCGGAGCCTGGCAGAGGGAAACCTTTTGTACCAGCCCCAACTGGATGCTCAGAAGGCGCGCCTGACCCAAAAATACCAGGAACTCCAGGTTCTCTTTGAGGCCTATCAGATAAAGAAGACCAAACTAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSRNOG00000001086:ENSRNOT00000001445:1
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion (1st CDS intron)
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.176 A=NA C2=0.235
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF072008=Mod_r=PU(18.0=73.0)
A:
NA
C2:
PF072008=Mod_r=FE(38.0=100),PF101464=zf-C4H2=PU(16.2=62.1)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]