BtaINT0005182 @ bosTau6
Intron Retention
Description
Uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:F1N6N4]
Coordinates
chr26:16234562-16258451:+
Coord C1 exon
chr26:16234562-16234711
Coord A exon
chr26:16234712-16258290
Coord C2 exon
chr26:16258291-16258451
Length
23579 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
ATGGTGAGC
5' ss Score
8.27
3' ss Seq
AATTGTTTGTTATTCTTTAGGGT
3' ss Score
9.28
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Associated events
Conservation
Human
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Rat
(rn6)
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Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]