BtaINT0052350 @ bosTau6
Intron Retention
Gene
ENSBTAG00000005235 | DPP10
Description
Bos taurus dipeptidyl-peptidase 10 (non-functional) (DPP10), mRNA. [Source:RefSeq mRNA;Acc:NM_001078070]
Coordinates
chr2:68073363-68089196:+
Coord C1 exon
chr2:68073363-68073432
Coord A exon
chr2:68073433-68089001
Coord C2 exon
chr2:68089002-68089196
Length
15569 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AATGTAAGT
5' ss Score
8.62
3' ss Seq
CAATGTATCGGTATTTTCAGGGA
3' ss Score
5.43
Exon sequences
Seq C1 exon
AACTTCCTTTACAGTTGTCCTTTCCCAAAGATTTTACGGACCGAAACCAGTATGCTCTTCTGTTAATAAT
Seq A exon
GTAAGTATTTTATTTGTTTTTGAAATAAAGGAATCTAAAAAGTTTAGTTTTTTTTTATGTCTCACATGCCAATATTCTGATTAAAAAACAACAGAAGAAATCCCATGTGTGTAGTTAAGCAGGACAGCTGTCAGTTGTGTGAGTTCCTCAAGGACACCACCGCTAAATAATATGGAAGTGTGTATAATTGTTTTTGCTTCTTGCATCCCAAACTGAACTCAGTGTTACTCCTGGGAATAATGACTCATACATTTAGTTTATGGATGTCTGATTAGCAATTACTCAAGCTCTACCTTCCCTTTGTTTTTTTCTTTTTTTTTTAACTTTACAATATTGTATTGGTTTTGCCGTACACTGACATGAATCCGCCACAGGTGTACATGTGTTCCCCATCCTGAACCTCCCACCCACCTCCCTCCCCATCCCATCCCTCTGGGTCGTCCCAGTGCACCAGCCCCAAGCACCCTGTATCATGCATTGAACCTGGACTGGCAATGTGTTTCACATATGGTAATATACATGTTTCAATGCCATTCTCTCATATCATCCCACTCTTGCCCTCTCCCACAGAGTCCACAAGACTGTTCTATATATCTGCGTCTCTTTTGCTGTCTCGTATACAGGGTTATCGTTATCATCTTTCTAAATTCCATATATATGCGTTAGATACTGTATTGGTGTTTTTCTTTCTGGCTTACTTCACTCTGTATAATAGGCTTCAGTTTTCACCTCATTAGAACTGATTCAAATGTTTTTTTTTTCCTTAATAAATGATACTGGTCTATACTTTTTTTTCTTTGTGATATCATATCAAAGTTATGCTAAATTTTTAAAAGTCATTTAAAAAAATTGTGGTGAGAGCACTTAAAGTGAGATCTACCCCCTGAACAAAATGTTAGGTATGTAATACAATGTTGTTAATTATAGGCACAAGGTTGTACAGCAGATCTCTAGAACTATTCCTCTTGCATGATTGAAACTCTGCGCTCATTAAACAGCTACTCTGCCTTCCTCCCCCTACCAGTCCCCATCCTGCTCTCTGCTTCTAGGAATCTATTTTAGATACCTCACTTAGGTGGAATCATGCAATATTTGTCGCCTTCTGTGATCAGTTATTTTAGTTAGCATAAAGGTACATCCGTGTTTTCACATCTAAGCCTTTTACTTTTTATCAGTTCTTTTGCAACATTGAGGAAGCGTTTATTTCCCCTGCCAAAACAGTCAGTTAAATTTGAATCATTCTTATCAGTTTTCCTTCTTGGATTTAAGACCAGCAGGAAGCCCTTCCCATCCTTAGAAAAACCTGACTCTTAGGTTTTTCCAACTTTGGAATTGACTATGGAATTGAAGGCATCCATACTTTCTGTGAGACTATGCTGTGACTACATAGTATTGGGCACAGAGGCCTCTAACACCTATTGGTTAACCAACTTGATATTGATGTAGAATTGTTTTCCTGAGCGTAATTATTAATAGTTATTTTCGTTATTGAGAACCCAGCTAACATTGCTTTGACAGCACTTAAAAAAAGAGTAGAAATGAAAATAGCATTACTTGTTATGACTACTGAATGTGAACAATAAGTCTGTGTAATCAAACTGTCGGAGTTCAAATCCCAGTTTTGTCATTCATTAACAGTGTATCCTTGAAAACGTTGCTTAACCTTTTTTAAGGCTTAGTTTATCCAAATATAAAATGAGAATTATAGTTTATCTTATGTTTTAAGGCTGCTTTTTAGATTAAATGAATTAGCATATAAAGTGTCTAGTACAAATGACTTTTATAACTATTGTGATTATAATTCATTATTTTTATGCAGATTGCATTAATTTAGATATTTTGATACATAGAAACAATTTATCATTTCATTTTAATAAGTCAGATAATACAGAAAATGCAATAGTCAATGGTTTTACTTCCTCTATTGTTTATTCCTAACTGTGATACCATGACCTAACTTTCTCCTTTGTCATTTATGGCCAGAGGCCCTGAAAGTTCTTGACGTCTTCCTGAAGAAGTTGTTATTTGCTCTTATGTTAACTCCTTCTTCTGTAACTTCTCTTTCATTTAGTTCTTTTTAATTTTCTCTTTTTTTATTGAAGTATAGTTGATTTACATGTCATGTATACAGCAAAGCTTTATATATGTTCTTTTTCAGGTTCTTTTCCATTAGGGATTATTAGAAGATATTTACTGTAGTTCCCTGTGTTCCTTGTTGCTTATCTATTTTATATATAGTAGTATGTATATGTTAATCCTAAACTCTTAATCTATGCTTCTTCACCCCACTTTCCTCTTTGGTAACTATAAATTTGTTTTCTGTGAGTCTATTTCTCTTTTGTAAATAAATTGATTTGTATCATTTTTTTAAGATTCCACATATAAGTGATATCATATGACATTTTTGTCTTTCTCTGGCTTACTTCATTTAGTATGATAATCTCTATTTGCATTCATGATGCTACAAATGGCATTATTTCATTCCTTTCTGTGGCTGAATATTCAATTCTTATTTGAATTATATGTGTGATTTATTGGGGAAAATATCTCAGGCACTAAAATGAGAACAAAATGAAAAAAAAAAATTCTCACCCTCATCTTCTGTCTCATTATACCTCCTTTTGGGAAAAGAAATTGTTCTTTGTAGTCACTGAGAAATAAGGCTTCTCAGGGGAAAGAACCCTAGTAGGCATCTTTCCTTGAAGCATGACTAAACATATGCAGGGGGACATATTGGCAGTTCTTCCCATTGGTATATCCTCTGGTTCCAAAGTGTAACAACACTTTGGGGGAAAATGTAGACAAGAGTTCTAATTCTCTTTGCAGCTTTGAGTCAAAGAATCCAGCTAGCTTGTCCTACCATCAGATTTGTGCTTTGGTCTGAGTGATTTTTAGTTCATGAGAGGAATATGAAGAATAACCCAAGACTCAACTCTCTTATTAGAAAGAGTTAAGTCTTTTTTTAGAGGCAGGAGAGTAAAGATAGTGGTTTAGGAATAAGGTAGCCTTTAGGTTCTAATCTGAGTTCAAAGATTTACCAGTATATTGTTTAATTTTTTAAGCTTCAGTTTCCTTATAAATAAATTGAAGACAATAACATGGAATAGTTTACATAAACATGTCACCATAGTGTCTGGAAGAGCATAAACATTTGTACTTAGTGTTTAATAAATTTTAACCATAAATATAATTATTATTAGTAGTAATAGTCTTTTTAATATTTAGAAGTATCACTATAGATATTTAATACTATATTTTAGCATCCATAAAATTAGTTAATAGACATTATTAAAGCAGATAAGATAATATAGTTAGGCCTGTAGAGTTTACTTTGCTCCTGTTTTTGTTAATGAAAAAATAAAAATGAGTATTAATTCATTATTTTTCATTTGTTTTCATATGCTGACTACACTAAATATTAATTTACATTATCCAAACTCCTTGATTTTCAGAGGTAAATTCTCAGAAATTTCACATAATATAACTTACAAAGCCCAACTGAGGAGTTTTTTATTTTATATTTAAAAAATGATCTATTGCTTTGAGCTGCATGATAATTCCTAAAATATTTAAGTTTGGAAATCCATATAGGTCAGAATGGTTTTAAGTGTTTTTTAAGTGTTATTAGATAAAGTGTTGGAGAAGGAAACGGCAACCCACTCCAGTATTCTTGCCTAGAGAATCCTGTGGACAGATGAGCCTGGTGGCTGCCATCTATTGGGTTGCACAGAGTCATACACGACTGAAGCGACTTAGAAGCAGCATGAATGTAAAGGCTTATAGCCTGGGAAGAAGCAGTGTAAACAGATGTACTATTTATTAGAGAACATTTTTTTTTTTCTTTGTTTGCTGTGTTCCTGAAGACAAGTATAGCAAGCTAAGGAGTTTCATACAGTACCAAGAAATCATCATGTCTTCCTATTTTCTTTTTTTTTTTTAATATATATAATTATTTTATTTATGTTAACTTGCAGTGGGTTTATTGTGATTATTTTTATTTATGTCTTCCCATTTTCTACTTTTTCATGTTCAGCTTGTCCATGCCACCCTTGATAAAGGTCTAATGCAGGGAGACAGTGACTATTCAACAAATTACATTAATTTCCAGAATGCAACATACTCTCTCATGCTCTTATGACTTAGTTCCATCTCACTGAATTCATCTTCCTTGAAATTATAATGAAATCTTGTTCACCTATCATCTTATCTTCCTGAAGCTTTCTTTCACCATGCTCATCAGCCCATCTAACAATCTCAAATCTATACCTCCTCCTACAGTGACAGCTTTCTGTTCAAAGTTTTCACATATATCTTAAACAATGTTGATCCAGCAGTTACTTTTCCAGCTCACCCTAATTTTATGAGGATATTTTTAACATAGTATTTAGAGAATTTCTGACTCCCATTAGATTTTGCACCAATGTTTCTGAATGAAAATCTACAATCTAGAAGTAAATATTCAGATAAATAATTTGTAAAATGAAATTATTATATCATGAAATATTTTAGCATCTTGAGAGAGATGTTAAAATTTTTATTTTACATATTCCATATATTAAATGGAATTTAATATTTAATTTAATTTTATTTTATTTTATTTAATATTTAATTAAATGGAATTTAATATTTAATATTAAATAACCTTACTTATTTGTATATTTCTCCTAGCAGCTAGTTTTGCAGTCACTACTCAAGCATGCATTGAATGAGTAGATAAATAATGTCCAGAAACCAGATAAATATGGTTATTACCACAGTGCCCCACTGTGTCATTTTAATTTGAGAGTACTACTCTTTTTTATCTAGTATTTGTATCATTTAATCAATGGTATTCATATCAGAGTCCTACAACTTTGTCATCTTAATGGAACTGAGTTGTTTGTCAGCTCTTTTGTATAGTTAATCTGTTAAAAAAGCAGGATATAATTAATTGACACATTGGATAATCCAGCTACTCATCTCCAGTAGTCAAGATAATATCACTACTTTTTTCATACACACATTTTCCTTTCAATAAACAATACAGATATTGTTTAAAATGTTGAATACCAGAGGTACCTTGTTTTGAGTTTTGAACCTATGGGATCATCCAAGGGCCCACAATCTTCTTCAAGTCCCACACCAGGAAGATGGTATATCTGGACTAGTCAATTCTAATCTGCCACCCTGCTCTCTACCTATACTTCCTTTTCTGTGATTAAGTGCTATATCATCTCCTAGCTAGTTTTTGGGAGACCGCAATGGCACCCTACTCCAGTACTCTTGCCTGGCAAATCCCATGGACGGAGAAGCCTGGTGGGCTGCAGTCCATTGGGTCGCAAAGAGTGGGACACGACTGCGCGACTTCACTTTCACTTTTCACTTTCATGCATTGGAGAAGGAAATGGCAACCCACTCCAGTGTTCTTGCCTAGAGAATCCCAGGGACGGGGGAGCCTGGTGGGCTGCCGTCTCTGGGGTCACACAGAGTCGGACACGACTGAAGTGACTTAGCAGCAGCAACTAGTTTTTATTCCACTGATGCTGGTATGAATTTTCTGAGATCCATATCTGAAAATGTGGCTCTCCTGGGTAAAATACTCTCACTATTATTCTTCAGTTGATTTAAAGTTCATATTTCCTAACACAGCATACAAAACAATCTTCATCTGATTTCCACTTAACTCTCCATCTCATTCTGACTCCATCCACCTCTAAAGAGAGATTCACTGCTCTAGATATTTTTGAAAACTGCTTTATTATGGGAAATACTAGCTTCTCAATCATTTCTCTCTATATTTTCCCACAGTTTTCCAGTACCTTTAGTTTCCTTTTCCAACTGGAAAACTTCTATTAATATTCCAAGCAATACTTTTATATAACTCTATGTACACCTCTGTCGTAACATGAAACCACACTAGGTTACAATATTTGCTTTGCTGTCTCTTCTTTTAAACTATAAACTCATTCATGATAACAGCTCTTTTTGTATTGTCTTGCCTTAACACAGTGTTTGGAGCATTTATGTTCATAAAATATTGATTGACTGAATGGGTATATGAATGAAGGAACACATGAATTAGAATAAACAAAGAAATTAATCAACCCTAAGTTAGTCATCAGGAATGACTGATGTCATAGTAGAGAAAAAGAGAGAAATAAATGATCTGAGAGTTTATAATGTGTTACAATTAGACTTTTGGTTGAGTAAATTTCTCTGCAGTTGTAGTTTCCCTCTCAGAAAAACATGAGGTGAGCTTCTCATTTCCCTTACAATCTTTTTGCATAAAGCTAAATAATTGGTTTCTGTACTATCTTTTCACTGTTTCTCTTTTGATTATTGAGCTTATCTTCTTAAAGTAATAGGATTTAATAATAGCTACTATTTATTGCTTACTGTACAAGGGACATCATGCTAAGGATGTATAAATACCATCTTTAATCCTTATAGAAACCAAGTGAGATAAATATAGTTGTCCTCAGTTTAACACAAGGAAACCATGAATTTATATAATATATAAATCCAAGATCATGAACAGGACAAAATTAGGGTTTGAACTCAAGGTGTTTTTAATTTTCTTTTCAGACCAGAAAGCTCTGCTTTTTTTTTTTAATTACATAATAGTCTACCTAGATATTCTATTATATGATAATTATCATTGGAAGATTATCAAGAATGCTGTCCAGAATCAATAAAGACTTCTCTAAAACCCAAATCATATGACCTTTTGTGCCTTCCACTTAACAGTTTATAATAACCTCTGGAATGTAATATTTTCCAGCTGCCTCATGTTAATGGTTTGGTGTAAAGTAAAAATTCCAAACATCTTGAGTAAGTTCCTAGAAGGTCCACAAGAAAGATCAAATACTCAGTCCGCATTATTTCATATAATTCCAAATTCTGATCAAAGAATTCACTTTATGGGACTTCTTTCTATTTATTATTTATCCTTTTATTCTTTTTATTTATTATGTGGCTTCATAGACTTTTGAGCAGATGAGATTGTTAGAAGTAAGCTTGTTTCACTTTCCAAGAAAAAGACATATATTTTCAAAATTTCTATAACATTATTTAAATATGCACTTGTTCATGCCAAGTACATACCTATTTCACTTAAAGATAGCACATTTACTGAAAGTATTTGGACAAGAGAGGTAGCTAATACTTCTCTCAAAAAATCGTTATTACTGCTTTGCTGTGTAAGGAGAGTCAAATTTAAGTTACTGCTTTTCTTCATTCTTGTTCTTGTTCCTCATTTAGGTGGATGTAAAATGTACTCACATTGTAATACCCATGAAATAATTAGAAGTCAGTGGCATTTAATCTTGATAATGGAAATGGAGAAGGTGATCATTGCTTTTTATATTATTCTTGAACAGATTAGACCTTGTTCTTCACAATCTATAAGTAATATGTCTTAATGTCAATATTAAATTCTAGAGTCAGTCAGTTCAGTTGCTCAGTCATGTCTGAATTGTTGCAACCCCATTTCTGCCACACGCCAGGCCTCCCTAACCATCACAAACTCCCAGAGTTTACTCAAACTCATGTCGATTGAGTTGGTGCTGCCATTCAGCCACCTCATCCTCTGTTGTCCCCTTCTCCTGCCTTCAATCTTTCCCACCATCAGGGTCTTTTCAAATGAGTCAGCTCTTCGCATCAGGTGGCCAAAGCATTGGAGTTTCAGCTTCAATATCAGTCCTTCTAATGAATATTCAGCACTGATTTATTTTAGGATGGACTGGGTGGATCTTCTTGCAGTCAGGGGACTTAAAAGAGTCTTCTCCAACACCACAGTTCAAAAGCATCAATTCTTCAGTGCTCAGCTTTCTTTATACTCCAACTCTCACATCCATACATGACTACTGGAAAAACCAAAGCTTTAACTAGATGGACCTTTGTTGGCAAAGTAATGTCTCTGCTTTTGAATATGTTGTCTAGGTTAGTCATAACTTTTCTTCCAAGGAGTAAGTGTCTTTTAATATCATGGCTGCAGTCACAATCTGCAGTGATTTGGGGGCCCAAAAAAATAAAGTCTACCACTGTCTCCACTGGTTCCCCATCTATTTGCTAGGAAGTAATGGGACCAGATGCCATGATCTTAGTTTTCTGAATGTTGAGCTTTAAGCCAACTTTTTCACTCTCCTCTTTCACTTTCATCAAGAGGCTCTTAAGTTTTTCTTTACCTTCTGCCATAAGGGTGGTGTCATCTACATATATGAATTTAATGATATTTCTTCCAGTAATATACTCACCAGCAGAAACACAGGCTTTGAAACTGTAAGAAGGAGTCTGGTTAGATGCATAAATAAACTTGTCCATATCAAACAGCTAGAGTAACAGGCAAATTTGGCCTCGGAGCAGAGAATGAAGCAGGGCAAAGGCTAATAGAGTTTTGGCAAGAGAACACACTGGTCACACAAACACCATCTTCCAACAACACAAGAGAAGACTCGACACATGGAGATCACCAGATGGTCAATACTGAAATCAGATTGATTATATTCTTTGCAGCCAAAAATGGAAAGGCTCTATACGGTCAGCAAAAACAAAACTGGGAGCTGACTGTGGCTCAGATCATGAAGTCCTTAATGCCAAATTCAGACTTAAATTGAAGAAAGTAGGGAAAACCACTAGACCATTCAGGTATGACCTAAATCAAATTCTTAACGATTATACAGAGGAAGTGAGAGAGAGATTTAAGGGATTAGATCTGATAGACAGAGTGCCTGATGAAATATGGACGGAGATTCATGAAATTGTACAGGAGACAGGGATCAAGACCATCCCCAAGGAAAAGAAATGCAAAAAAGCAAAATGGCTCTCTGAGGAGGCCTTACAAATATCTGTGAAAAGAAGAGAAGTGAAAAGCAAAGGAGAAAAGGAACGATATACCCATTTGAATGCAGAGTTCCAAAGAATAGCAAGGAAAGATAAGAAAGCCTTCCCCAGTGATCAGTGCAAAGAAATAGAGGAACACAATAGAATGGGAAAGACTAGCGATCTCTGCAAGAAAATGAGATACCAAGGGAATATTTCATGCAAAGATGGGCTCAATAAAGGAGAGAAATGGTATGAACCTAACAGCAGTAGAAGATACTAAGAAGTCGCAAGAATATACAGAGGAACTGTACAAAAAAGATCTTCATGGCCCAGATCATCATGATGGTGTGATCACTCACCTAGAGCCAGACATCCTGGAAAGTGAAGTAAAGTGGGCCTTAGGAATAATCACTATGAACAAACTTAGTGGAGGTGATGGAATTCCAGTTGAGCTATTTCAAATCCTTAAAAGATGATGCTGTGAAAGTGCTGCACTCAATATGCCCTCACATTTGGAAAACTCAGCAGTGGCCACACGACTGGAAAAAGGTCAGTTTTCATTCCAATCCCAAAGAAAGGCAATGCCAAAGAATGCTCAAACTATGGCACAATTGCACTCATCTCACACGCTAGTAGAGAGATGCTCAAAATTCTCCAAGCCAGGCTTCAACAGTACATGAACTGTGAAATTCCAGATGTTCAAGCTGGCTTTAGAAAAGGCCAGGGAACCAGAAATCAAATTGCCAACATCTGCTGGATCATGGAAAAACAAGAGAGTTCCAGAAAAACATCTATTTCTGTTTTATGACTATGCCAAAGCCTTTGACTGTGTGGATTACAATAAACTCTGGGAAATTTGAAGGAGATGGGAATACCAGACCACCTGACCTGCCTCTTGAGAAATCTGTATGCAGGTCAAGAAGGAACATTTAGGACTGGCCATGGAACAGCAGACTGGTTCCAAATAGGAAAGGAGTATGTCACCTTTCCAAATAGGAAAGGTGTATTGTCACCCTGCTTATTTAACTTATATGCAGAGTACATCACGAGAAACACTGGGCTGGAAGAAGCACAAGCTGGAATCAAGATTGCCAGGAGAAATATCAATAACCTCAGATATGCAGATGACACCACCCTTATGGCAGAAAATGAAGAACTAAAGAGCCTCTTGATGAAAGTGAGAGAGGAGAGTCAAAAAGTTGGCTTAAAGCTCAACATTCTGAAAACGAAGATCATGGCATCCGGTCCCATCACTTCAAGGCAAATAGATAGAGAACAGTGGAAACAATGGCATACTTTATTTTCTTGGGCTACAAAATCACTGCTGATTGTGATTGCAGCCATGATATTAAAAGATGCTTACTCCTTGGAAGAAAAGCTATGACCAACTTAGACAGCATATTAAAAAGCAGAGACATTACTTTGCCAACAAAGGTCTGTCTAGTCAAGGATATGGTTTTTCCAGTAGTCATGTATGGATGTGAGTGTTGGACTATAACGAAAGCTGAGCGCTGAAGAATTGGTGCTTTTGAACTGTGGCGTTGGAGAAGACTCTTGAGAGTCCCTTGGACTATAAGGAGATCCAGCCAGTCCATCCTAAAGGAAATCAGTCCTGAATATTCATTGGAAGGACTGATGTTGGAACTGAAACTCCAGTACTTTGGCCACCTGATGTGAAGAGCTGACTCATTTGAAAAGAGCCTGATGTTGGATAAGATTGAAGGAGGGAGGAGAATGGGATGACAGAGGATGAGATATTTGGATGGCATCACTGACTCATTGGACATGAGTTTGGTTAAACTCTGGCAGTTGGTGATGGACAGGGAGGCCTGGCCTGCTGCAGTCCATGGGGTCGCAAAGAGTTGTGAGTGACTGAACTGAACTGAAAACTGAATATCAAACGCTCCCCTAGTTGTAACTCCAGGACACGTAATTCAATGAAAAATTATTTGTAAACGAACAAGTGATCAGAAATATGAAGGTTATATTATTATTTTCCTAATGGAAGAAGATAGGAATGTGGACAAGAAACAGTTCTCTGACATAAAAATATTCTTTTTTCTTATATGATGTAATGACTATTGGAGAAAACTCGTTCTGCCAAACTGCGTATTGGATAGTCCTTCCATCCGAGGAAATCTATGGATGACAAAGTCAGAAATAGAAGTAACTCACCAAGAAGCCCTTGACCAATGGGTGTATTTTCATGTATATATTGCTTGAAAAAGTACAAATTTCATTAGCTTTTAGATATACTTACATTGCAACTGTATCATCACAGACTATAAATTTCTATAACATAAATTTCAGATTAAGACAAGACAAAATTGTTTCACTCTAGTTTACTCCTATATTAAACTCATGTTCTATTGTACAATGAGTTCTCTCCCAAAGAACAAAATCAAAAGTCTTGACAATTCATCTTCCCTAAGAATTTACTGTGACATATCACAGCATCATTTTCCTTTCTCTTATCATGTGTTCCATTCTGTTCTTTATCCTTCTTTTCACACTCTTTTTTATTTTACTATATCTAAAATAAAAATGCAACCCAGCTCACAGTGAACCCACTCTAATCTAGCACTTATGCAGCTCAAGTGGATATATTCTATGCCTAGAAAGAGAAAAGAACTAAGAAGACTACAAGCAATTTTTCCTGTGTTCCTTTCTTCCACGACCCAGTAGATACAGATACCCTGATGTCCGTGTAGCAGTTTTGAAATTCCGTGGTGTAGGAAAAAAAAAAAAAATTCTGCCATTCAATAGATCTCTTGTGGAAAGTACTCTCACTGGTAAATATTTGCCTTTTATTTATTCTAGCCAAAGGTTTAGTGGTAAGGAAAAGGCTTTTTAAAATGTACTCTACATGATATTAACTATTTACAAACCTGGTGGCTCAGATGGTAAAGAGTCTGCTTCCAGTGTGGGAGACTCGGGTTCGATCCCTGGGTTGGGAAGATCTCCTGGAGAAGGAAACGGCAACCCACTCCAGTATTCTTTCCTGGAAAATCCCACGGATGTAGGAGCCTGGCAGGCTACAGTCCATGGGGTCGCAAAGAGTTGGATATGACTGAGTGACCTCAGTTTCCTTCCTTCTATTCTATAATATAATTGCCAGGGTTAACTGGTAAAAAAGTCAGGACCAAAATCTATCTCTCCTGAATATAAATTCACCTCTTTTCATGAATTCAAATAGCACCATGTGAACCTGACAGACGTGTGCTCTGAACAAATCTCTTCACTTTAATTCAGGTTTTGTTATAGATGATGTTTTGTTATGTTATGAAGAAGTGGTTTGTTTTGCCATTTTAAAGGTCTATTGAATTTTATGTGTTTTGCTTAGCTTTTTTATTATTTACTCATATTGTGTATTTTTCATCTAAACAGACACCACTGATTGATTGTTCAATGTATTAATATTAAAACAGATGCCAAAGTCTGCCTTTGAAGACCTTAACTTGTAAGAAAACTTTAATCTTAATTTGATTTTGCTTCCTGTGTTAGGAAGTGGACACATTTAGTATTGCTATGGACTTTTCACTAGTTAAAACAGATTGAATTTTTCTTTTCATTAAACTTTCAACAAAAATATGTGCCCGTATTCTCAACCTTGAAGCGCTGTTCTTTATATGAGTCCCCGGGGATTTCTGAGACAGAAAGTAAAACAAAAATGTCAGGAAAAAAGATGTGGCATACAGAAAAAAAGCAAAGAGGAAGCAAATGCAACTTACCAATTCTGTGTGGCCAACACAGTTGCAAGTTGTAATACCCATTTATTATATGATAGGTGATTTGGTCTATGGTACATTCCTATGGTCATCCCTACCACCACATATCTTGCTATTGCTGCCTCCTCAAATAAGTAATATTTTCTTGCCTTAATTTGTATTAAAAAAAATCTACTATTTTCTGGTCCACATTTTGTGAAAAATTTTCCCTTTGCTCCTGCAAGCCTCTGACTTGTTCCTTATACTGACGATGCTTACCATCATAATCCATGTCCTTTTATAATTAATCTTGAAATAGATATACCTGTATTCTGCACCAAAAAAGAAAGAACAACACACCCAGTTAGAGCAATGTGTTAAAATTATTGACTGATAATGGATTGATAACATTTTGTGTTCAAACATTAAAAGCAGGTGCAGCAAGGTTGAAGTTAAAAATGGCAACTGAGAAAACAGAGCAGAGGAGGAAACTGTATTTTCTTGATATTGCAAGCATGAGTAAGGAATTGAGTTTTTGCCTTGAAAAATCTTCAATCATTTGTTAATCATAAGTTTGAAAAATGTTCAATAAATCACATAGTAATTTTGTATTGCTTGCTATATTTCAAAAAGTATTTTTCAAGTACATTATGCCACTTAATGCTTAAAAATTCCTTGAGGAAAGCACAGCAGATTTTACTATTATTAAAGATAAGGAAACTAAGTCTTAGTGTTTTAGTATCTTTCCTATCTATGTTCAGAGTGAAGTTGGGACTTAAACTGTCATGTACTTACTAAGCTTAAATGTTAAAGTTAATCCTTGTATCTTGTTCTCTGTGAATCATATTTTGCTTTCTAAAGTTCTCAATAAATCTCCAAGCTTCAAAATGCAGGATTTATGAAGCTTTTCAAGGTCCTTTCATTTTAAACTTTACACGAGTCTACTTTCCCTGAAAGCATCTAGTTCAGCAAGCATTTTCTATGTTCTCCATGCACCAGAAAGTGTGCTACGCATGATGATTCATGCCATTTCTCAACTGGTAGGCAAGTTATATCAGTACCATCTGGAAATGTGGAAAAAAATACCAATTTTAGACTTCATTCTGAATTAGGCAATTGAATTTCTAGGGAAAAGAATGTGGAGATGTTTAGCCATAATTCCTAATAATCTGACCAAGACCTAACTGTGCAAAAAATAAAATGAATTTAAAAATTTTTAATTAAATTTTATAAAAGAGATCAAGATTGTAAACATTGCAGAAGGACAAAACAGATCTAGGTTTGGATCATGTAATCACTCTGAAATGTGTGATTTACAAAGGAATGGAGTAGGTCATAATTAAAACCCATCCATAGTGCTTGTTATTTAAAATGTAGGAATTAGAACACATGCAGTAAGTCGTCATTCAACAGACAGCTACCTCCCCGAAAAGATTAAGTAACTCTTGATAGTTTATAGTAAGTTAGTTAAAGGATCCTAAGTGGTTAGGTCTCAAAGGTCTTTGCATTAATTTACTAGGGCTGACATATAAAATACCAGCCTGGGGTATCTGAAACAACAGAAATTTATTTCGTCATAATTCTAGAGGCTAGACCTCCAAAAGCTAGGGTTCAGCAGGCTCTGTTTCTTCTGAGACCGCTCCTTGGCTTGCAGATGGCTGCCTTCTCGGATCCTCTTCTCATGTTCTTTTCCTTGTGCGTGCCCACCCCTAGGGTCTCTGTGTGTCCTAATTTCCTGCTGCAAGGACACAGGTCAGATTAGATTAGGGTTCAGCCTAATAGCCTCATTTCAATTTAATCACTGCTGGAAAAGCACTATCTCCAAATACATTCAGATTCTGAGGTGGTACACATTACAGATTCAACATACAGTTTTTGAGACACAGTTCATCCCATAATAGCATTCAATGCATTTTAGTTGTCTGACATTTTGCCCTATTCCCTGTTTCCTCTTTAGGTCCCACTCAACCTCTGCATCTACTCAGTTCCACTTGCTGCTCAGAAGTTTTTTCTTTAGCAAACCTGATAACCTCAGAGCTTGTTAATGAGGATTAGTTTGTGCATTGGTATATTTTAGTGCTTCTAAGCAATATATTTGCATAGACTTGAAGGCAAGTTTGGTGTCTTTACAAGGGAGTGTGTAGGGTGAAATTTTCTGGTACGTAGCCTATGAATCTGCACCTCCTGCACTGCAGGCAGTTTCTTTACTTCTGAGCCATTGGACCACTGGAGAAGCCATTGGACCTAGATAATCTGTGTGATTTTTATGAGAGTCTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAACCTTTCTGTATTCCAAAGAGAATAAGTTATAAATACCACTGTAATGTGACATTTTAAAATTGTATCACCTTTTCCCTCTGGAGAGAATGTTCATGCTTTATAATCGGTGTGTCCTTCTTTACTTCTAGCTTTCGAATTTTTCAAACGTATGTGTCTCTGCTTCCTTTTCTTGCTGTCAGCCTTAGGGATGAGAAATATCTTTTTCTCACTCTTTGCTTAAATTCTTCTCAGTGAGAATTCTGTCACAAGAAACAATTCAGGAAATATTAATGCAGTGTTTCTTTTTAAATCTGATATGCTTTAGGATTGCACATCTCTTGTTAAATTATTTTTAAGCCTCCACGACTGATCCTTCTTTCTATCAGATCTCTAACCCCTTGTATACCCTCTGTAAGACATTTTGAAAACACTGTGAGAAATCCAGTAAAGTAGGGCCTGTATGTCAACTTCATGATCATCCTTTAGAAATGTCTATGAAAGGTGTGTGTATTTTTCTTTGTTCTCTTTTCAAAATGAATTAAAATAGTTTCTCATGGATAGTTTTAAGTTCTGTTTTATATTTTCATTTCATTCAAGAGTTTTCCATTCAAAAGTTTACAAAGGGAAATGACATATTTTTCAGGCTAATATCAAGAATTAACTGAAATTTTAATAATCAAAATGGGTCTTTTCCATAATTTTTAACTAATAAGTAAGAAAACTTAGATTTCTACTGCATTATTAATTGCTCTTGTATTGAGTCAATGTATCGGTATTTTCAG
Seq C2 exon
GGATGAAGAACCAGGAGGCCAGCTGGTAACAGATAAGTTCCATATAGACTGGGATTCAGTGCTTGTCGACACGGATAACATCATCATTGCACGGTTTGATGGCAGAGGAAGTGGATTTCAGGGCCTGAAAATTTTGCAAGAGATTCATCGAAGATTAGGCTCAGTGGAAGTAAAGGACCAAATAGCAGCTGTGAA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSBTAG00000005235:ENSBTAT00000006894:14
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
PF0032616=Peptidase_S9=PU(25.4=78.8)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]