HsaINT0051742 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000175497 | DPP10
Description
dipeptidyl peptidase like 10 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:20823]
Coordinates
chr2:115791287-115814987:+
Coord C1 exon
chr2:115791287-115791356
Coord A exon
chr2:115791357-115814792
Coord C2 exon
chr2:115814793-115814987
Length
23436 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AATGTAAGT
5' ss Score
8.62
3' ss Seq
CAATATGTTGGTATTTGCAGGGA
3' ss Score
5.85
Exon sequences
Seq C1 exon
AACTTCCTTTACAGTTGTCCCTTCCCAAAGATTTTATGGACCGAAACCAGTATGCTCTTCTGTTAATAAT
Seq A exon
GTAAGTATTTTATTTGTTTTTAAAATAAAGGAATCTAAAGATTTTATATTTTTGTGTCTCACATGACAACATTTGATTCAATAAAGAAGAGAAGTCCTATGTGTGTAGTTAATCAGGACAGCTGTCTGTTGTCTAAATTCCTCTAGAAGTCCATCACTAAATCATGTATAAAGATGTGTAAATTTTTTTGAACTTCTTGCATCCCACATGGAGTTTGGTGCTACTGCCAGGAATAGTGACACTAAATAGTTTGATTTGTGGGTGTCTGCTTAGCAATTACTCAAGCCCTGCGCTCTTTATCAGTTGTTTATGCAACATTGTGGAACATGTAATTCCACTGCTAAAACAATGGGTTATGTTTGTATCACTCCTATTGATTTTTCCTCCTGCATGCATGGCCTGCAGTAAGCTGCTCCTATGCTCAGAAAACTTGACTCAAGTTTTTTTCATCTTGAAATTGACTTTGAAGTTAAATATCTTTATACATTTTGTAAGGCTATATCATGACTATATAGTATTAGGCACCGAGGCCCCTAACATCTAATGCGTAACTAACTTGATATTGATTTAGCATTGTATTCCTGAGAGTTATAAGTTATTTCCCTTATTAATATGATCAGGTAGCATATTGATATAATAGTGCTTAAAACAGTCTAAAATTATATCTTTAGATACAATAATTTCTTCAGATATAATATTTAGAAATAGTAAATATGAAAATAACATTGCTTATTATGATCACTGAGTATAGTGGATAAGTATTCAGTCTGTGGAATCGGATTTCCTGGGTTCATATTCTAGTTTTGCTATTTATTAGCTGTGTGTCCTTGGGCAAGTTCCTTAACCTCCTACAAGGCTAAGTTTCTCTAAATATAAAACAATCATTACAATACAACCTGTGTTTTAAGACTGCTTTGTAGACTGAGTGAAATACAACATATAAAGTCCCTTAAACAGTGCCTAACACATATGATTCTTATAATTATTGCGATTATAATTCTTTTTTGTATAGACTGCATTTATTTTATTTAGATATTTTAATATATACAAGCAATTTGTCCCTTTATTTTAACAAACCACATAATACAGAAATAATATAATATTTAATTTTCTCTCTCACTCTAGTGTTCATTTCTAATTCTAATTATTGAGCTTTATATAGTTTCTCATATCCAAACTTTTCTCCCTTGTCCCTAAAAGCCAGAAAGCTCTGAAAGTTCTTAATGTCTCCTTGAGGAAGTTCTTATTTGCTGTTTCTTAATTCATTGTTTTTTTTTCTTGTCTTTTTTACCTAGTTTCTTCTGGTCTATTTTAACTGTATGTATGATTTACTGAGGAAAAATGTTTAAGGCACTAAAACGAGACAAAAAGAAAGCAAAAATCAAACCCATCTTCTATCTCAGTCACGTCTCCCTTTGGTAAAAGGAAATGTTCTTTTGATTCACTGAAAAATAAACTTTCTCAAGGAAGGGACATCCCTCAGGCACATCCTAGGCATCCCTCAGTATGTGATGACCTTCAAAATGGAAGATAAAAGAACTGACTGCCCTTGAAGCATGATATTTATGCAGACGAATGTGTAGATAATTATGCCCACTTGCGTATCCACCTGCTGTAGGGCAGTGTCACACATAGGGGGAAAACCGAATAAGAGTTAACAGAATCTCTTTGTTTTCTGAAACAGATAAGCTAACTGGCTCATCTTGGCATCAGACTTGTGTTTTGTTCTGGTTGATTTTTAGTTTATAAGAGGAATATAAGGACCTACACAAGAAACCAATTTGAAGACTTCTCTTATTGGCAAGGGGCACTTGGGGTTTTTTTTGAGAAGTGGGATTTTGGAGCAAAATGCTGGTTTTGGAGTCAGGTAGGACTGGGTTCAAGTTGGAGTGCTGAGATTTAACAATACACTGCTGAATTTTTTGAATCTTCTGTTGCCTTATAAATAAATTGGGGAAAATAACATGGGATAATATTTCTATTTAAATATATTACCATAGTTTTTGGTAGAGCATAAGCACTTGCAGATAGTCTTTAATAAATCATAAGCAGAATTATAATTATTATTAGTATGGTGCAAAAGTAATTGCAGTCATTATAAATGGCAAAATTATAAGTAATTGCATTACTTATAAATGCAAAAACTGCAATTGCTTTTCTGCCAACCTAATATGGATAATAGTATTTTAAAGTATTTAATGTGATTAATATAAATATTTAATGTGTAATTTAATGCCCATAAAGTTATTCAATAGACAGACACTACTAAAATAGATAAAATAGTGCCGTCAGACCCATGGAATTTACTTTGCTACTTTTTTGGTTGATACAGGAAGAATGAATGAAAATGAGTATAAAATCATTTCTAGTTATACTTTGTTATATATAGTTATATATTGTTTATACTAAATATTAATTGACATTATCCACACTTTTGGGTTTTAGAGGGAAATTATCGAAAGCGTCACAGAATGTGACTTACAAAATCCAAAAGGAGAATTTCTTTTTTTTTAAATTTATACTTACAATATGATCTATTCTTTTAAATTGCATGATTATTTCTAAAACACTATGCTTGAAAACATATAAGGGTCAGAATAGCAAAAGTAGAAAGTGTTTTTTAAGAATTTTAAAAACTGCCCATGATTTAAAGCCATATTTTTTCTCAAGCTTAAAAACTGTTTTCAGTGACAAATTGACTTCCCATTCTAAAAGTAATAATAATTATTATTTTTTTCGCAAATGAGCAATTAGACAGTGATAAACAATAGAGCGACTATTATTTAAATGAGTCTAAGAGGTCATTCAGTGATTTTGGTGTCAGTACTTTATTGCAATTTTGTGCCATATATCTGGTAGCCAACAGAATATGAGCCATTTCTTGATCTGTAGTGATGGGTTTACATCCAAGGAATTATATAATGAATGCATGAGTTAGCGTCAGGCTGCAGCAAGCACCTGAGTGGCTGAAAGAAAGACTGCCCTGGAAGAAAGTGGCCTCTGGCAATTTGGAAACCCAGTTCTGCTCAATCTTCATTATGGATCTTCAAAAGAAATGGTCCTCTGACCTCCCTTGCTTGGTCATATGTTTTGAAACTCAAACTTAATCTCGTAACATTTAAAATGTAAGTGAATCAAAGATCAATGTCAATGTCACATTAAAAAGAGTATGCGGGATGGAGTACATACCACATTAATATTTTTACTGTAGAATATTTTTACCATAATGGAAAAATCTAAGAAGCATTGGCACCATAGATGGATCTCAGTGACCTGAGTTTGCTGTGGTCTCTACGGAGTCATGATCCCCTTTTTCTGAACAACTCCTCCAATTCTCCCTTCAAGTGCCTATTTGTTTTACTCCTGCCTTTCTGTTTAACATTATAGGGAGCCCTTAAGGACCCGGAGTCCTTATTCATTTTTAAACTTATTCTATACACATCTGTATTCATTCCAGCTCTTATAACCTCGTATTGTTCTTTTTTAATATTATTCTTACTTCCTACTCATGTTTATGTAATTTAATACCATACACGTCTACCACATTGCTTTTACATATGAGAAGCCGTGTTAATGGCTATGGGGAGATAACAAGATTGCAAGCATCTTGAAGTCTATAATAGTTATTTGGGTTTGTTCAGTCTATCTCCGCAATGCCTAATACACAGAACTTACTGACTATCCTGTAATTACCAAATAGTGCCAAGACTGAAGGTGTTGTGGAAAATGCCCTGCACTTGCAGACGTTCATTTGGTAAACAAACAAATATGAATCTAATATACTTAGATGCTGATAAAAGCAATCCAGAAGGTTGTACTGTTATTTAAAAAGAAGGGATTTTTGTTTTTGTTTTTATTTTCTGTCCCTCTGAAGAGGAGCAGCATCAGCTCAGGAGTTTATTTCAGTACCAAGGGCCCGTCATCTCTTCCCATTTTCTACTTTTTCATGCTCAAGTTATCTTGCCACACTCGTTAAAGGTCTAATAAGGGAGGCAGTAAATGTTCAACAGATTATATTAACTTCCAGAATGCAACATATGCTATCTTGCCTCCATGACTTTCTTTCCTTTCTCTGAATTCACCTTCCTTGAAATCCCAAGAAATTCATGGTCATCCATCAAGTCTTATCTTCCTGGAGCTTTCTTCCATTCTCCTCCTCTGTCAGCCTATGGATCAGGTCATTCTAACCGGAGAGCATTATTCATTTTTATCTAGAGTCTCATCACTGAATGTTCTGTGTATCAGAATCCTATAATTGGGTCATCTTGGTAGAAGTGATCTGTTTTCTATATAAGTATTCTTTCAAACAGCATGATATAAGTAACTGATCATTCACAATGAGGGAATATATTCAGTTATTCATATCCAACAGTCAAGATAACATCATTGCTGGTTTGTTATACACACATTTCATTTCCTCAAACAACTTGAAATATTGTTTAATATTTTAATTAGCATCAAGCTTCAGACAAGTCAGACATCCTATCTGGATGACTGAACTCTAACCTGCTATACTATTCTCTACTTACACTTCCTTTCTTTAGTTTATTGCTTTTTGCTCTCTCTCTCTTTTAGTTGCTTTTCCACTCTGCTGCTAGGTTGAACTTGGCAAAATCCATATCTGAGAATGTAGCCCTCCTATCTAAAATCTTCTCATTATTCATTCATCATTGATTAAAGCTCTGCGTTTTCCCTCACACTACGTAACAGTCTTCATGATATATTTTCTATTTTTCTCTTCGTTTTTATCTCACATCAGCCACCCCCAAAGAGAAATCCCATCCTTTAGACAGACTGCTTTGTTCTGGGGAACACCACCACTTCAATCATCACTTGTGTTTTCACATAGCCTCCCAGTGCCCTGAGTTTGCCTGCCCACCTGGAGAAGTTCTCTTAAGACTTCCAGACACACTTCCAGATAACTTTATGCACACCGCTATTACAAACATGTAACCATACCAGATTACAACATTTACTTTGCTTTCTCTCCTGTTAAACTG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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
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Average complexity
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Mappability confidence:
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Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
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Features
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A:
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Main Inclusion Isoform:
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Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development