BtaINT0079601 @ bosTau6
Intron Retention
Gene
ENSBTAG00000011379 | KCNH5
Description
Bos taurus potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 5 (KCNH5), mRNA. [Source:RefSeq mRNA;Acc:NM_001192989]
Coordinates
chr10:75314162-75336497:-
Coord C1 exon
chr10:75336245-75336497
Coord A exon
chr10:75314359-75336244
Coord C2 exon
chr10:75314162-75314358
Length
21886 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
TAGGTACTG
5' ss Score
5.9
3' ss Seq
GTATCTTAACTATTTTCCAGGGA
3' ss Score
7.1
Exon sequences
Seq C1 exon
GTCCTCTCCATCTGTCCCAAGGACATGAGAGCTGATATCTGTGTTCATCTAAACCGGAAGGTTTTTAATGAACATCCTGCTTTTCGATTGGCCAGCGATGGGTGTCTGCGAGCCTTGGCAGTAGAATTCCAAACTATTCACTGTGCTCCTGGGGACCTCATTTACCATGCTGGAGAAAGTGTGGATGCCCTCTGCTTTGTGGTGTCAGGATCCTTGGAAGTCATCCAGGATGATGAGGTGGTGGCTATTTTAG
Seq A exon
GTACTGTGAACTTTCCTAATGTAGTAGCAAACGTGTAACAGTTTTAGAGGTTTTTACTTCTCAGGTTTCTTAAGAGAAATTTCCTTTGCTGGGTGACTTTGGAAATTGGGTCACTAATGAGATGATGAATCTCAGTGAAAACTAGTAATGCCATTTCAGCAAGGAACATTAGTATTGGTCATAGCTTAATGGGCTGCACTGGGTTTGATTAAACTTTCTTTGGCAACAATACGACAGTGCCTTTTAAACGAGAGGTGATCACAGCCTAGGGTGACTGAACTTCCATGTTGGTAAGTGTGAAAATGGCTTGTGAAATGATTGTTAGGTTAGTAACCTACAGTATTTGTCTCAGAGGGACAACAGAACCTTTGCAGATCAACACTTCCCTTTAGAGATGTATAAACTGAGGCTTTATACATTCAACAACAGCCAACCAGTTCAGTGGCTGGTTCAGCTAGCTACCTGAGAATTAGTACTTGAGTACAGATCATCTTTCCCCAGATCTTTCTGCTTGCTTGCAATGGACCTAAGTAATGAGCAGAAAGTAATGAGGAGATATTTGAATTTGACCTGTTATATTGAAATGATCACAATGCAAGTAAACTTAGGTTTTTAAAGCTGGTTCTACCCATCTATATTTATGAGTGAGAAAAATTATTCAGCTAGTAATAAATTTGTTCTAAAATTCAGAGACCTGATATAGTTGTGCTAATGAAAAAAGGCAGTGACAGTACATGTGAGTGAAAAATTTTTTTAAAAAATTGCATGTTTGGGGACAGTGTAATCCATTTTATACTTTATCTTGGTAAAAATTGCTAAATGATATGTTAGATCATTTTCTGATCAAATATCTGCAGCATGAAGTCCACATAGATAAAAAAGGAAGCAATAATGAGGCCAGAGGAGAATAATTTCTTGTGTTTTTTCAAGTAAAATAAGTTAGAATTGTAGGATGTCAGCTCTCTTTTGATCACATTTTTCATGGCTTCTGTCTCATGAAAAATGAGCTCAATTTTTAAGCTATTGGATTTTTTAGCTACTGAGGTCAACCTACCATAACTTGAATGCTACTTATTCTTATAAGTAAAAGATTGACTGGTGTATTTTAGAAACTGCAAAAGCAAAATCCAGCCCCCAAATGAAGGATTGATTCAAAAAGCACAATTACCTGAAAAAGACAGAATCGAGAATTGAGAAACTATGACTCTTCCTAAGAAAATAGGTTCAGTAAATTTGTAAGGGTTACAAAAATTAGTTCAAGGATGCAAATGACTGAACACTATTGTTTGTAAAACTTTCTTTAACTGTTGAGAAATAATATTACATTTATGCGTAAATTTCTTTTAGAAGCTATTTTTATTTATTTTTTTGTTTGGTTGGAAAAATGCATGTAGCTCTTAGAATCAGCACTCTGGGTGTGTTTAATGTTGCTTAGTGTGTGTTCTGCTTTGTTTCCTGGAGCATAAAGGAGTTATGTAATACTTCATAAAAAGTGTACTTTTCACTAGAACAATCCTTTGTGGTAAAATGTAGCATATACACACTACAACAATTCTTGTTTGCTTAAAGAAGATGTTAAAACACAAGCCCAAAACAGGCGTATTTTTTCCTACATGTTCATGTCAATGGTGGGTGGTATAGCAGACATCAAATATAATAAAACGAGTACTGTTGTGATAAATTTCCTAGACTGTGCACTCATTGTCATTTGTTTTGCCCCATTTTCTTCATTGCAGCTTCACCTTGCTAGTTTCTTTTCTAAAAAGATGGATTGAGAAAGCCCTGAGTGCAGTGCCTCTGGGCTAGGTCTGCTAAGCTGGAATCATTTGCTCAGTGAAACAGACAAAATGCATTTTCTTTTCATTTTAAAATAAAATGGTAGCTAGTTTTGCCCAATGACACAGTAAAAATGAACACAGGGCCTCTGGGTATTGGTCCAGTCTCATTATATATCTGTCATATTTTATTTCTTTGAATGAATGCTTTTTGTTTATCCTCCTCAAAAATCTGAACATTTCAGAGACTTTTCATCTCTTGGTTTAATGAGTTAAATTACATGTATACCTCTCTGGCAATTTTTCTTCCCTTTATTCTGTGGGTCTCTAACAAAGATTAGCTCAGCCAAAAGGCGATCAAAAGTTTCTGTTTAAAAAAAAATTTTTGCACTGAAAGTGATCTTCCAAGAAAGAGATAAGTGCGGGGGCGGGGTGTGGGAAGGCATGACGCTGGAGAGGCTCACAGGGTCGCCTAGGTGCCCTGCTACTGCTAAGTCGCTTCAGTCGTGTCCGACTCTGTGCGACCCCATAGATGGCAGCCCACTAGGCTCCTCCGTTCCTGGGATTCTCCAGGCAAGAACAGTGGAGTGGGTTGCCATTTCCTTCTCCAATGCATGAAAGTGAAAAGGGAAAGTAAAGTCGCTCAGTCGTGCCTAACTCTTAGCGACCCCATGGACTGCAGCCTACCAGGCTCCTCTGTCCATGGGATTTTCCAGGCAAGAGTACTGGAGTGGGTTGCCATTGCCTTGTGCTGGCCAAAGTCACATCCTCATGGTGTCTGTGATTTGAATCATCAATGACAAGATAGTTGTGGATAAAAACTTTGAGAACTCTGCCCTGGTGTTGCACCTTCTACCAATCTGGCAGGAAGGCAGTCTGAGGAGATTGTGGAGTAGGAGTGTGGACTCATAGTGAATTTCTGCAGGAGACAGTGTGTGATGTCACATGTGAGAGATGTTTGCACCACATGCCCCAAGGAGTGTGTCTGCCATGGTCCAGATATGCTCTTGTGCTCATATGGCTTATAGGTTCCATCTATGAGCTTGTTGAAGCTTGTCTGTTGCCACCTGTGCTTCATCTAAGGGGTATGGAACCTGCTAGAAGGATCTTTCTTAATGAACCAGCTTCTTGACTTGTAGATTGTCTCGCCAGCTCTGTTGTGTGACTTCACAGTGTGAATTCCACCCAGGATGCATGTTTTCAGACTTTTCTAAGCCAGCAATACTTTCTTTCATAACTAAAAAGGATTTTTATTTTTCATTTAACACTTAAGATGTTTAACTATGTTTTAGGATAGGGAGGGAAAAGGAGTAACTCATCCACATCACTTCTGACACTGTGCTGACTGTTCATTCTTTTTATAATCCTATTTTTTTCTTATTTCTAATTTTTTTGTAGCCTAATTTTGAAATAATTGCAAACTTAATGAAAAGTTGTAAAAGTTATCAGCACATGAAGTTTGGCATATATCAAGGTTTTCTATCTTATTGAGTAAGTTAATTAGGTTTTCTGTATCTTTACTTATTTTTTTTCCTCTTGATCTATACTGGAACTGAGAGTGACGTGTTATTTTATTATTAATGTGTTGTATCTATGTCTCTTTGTATTTCCCATAGTTTGCTATTTATACTGTTTATTACTGTGTTATTTGGTACACAGATATTTGTAACTACTATATCTTCAGCTGAATTGTGACTTTTAGCATTGAACTCTTTTCTATTATATCACAACCCTTGTAAGGGTCAGACAGAAACAGCATCCCCTCCCCCATCTGCATATACCTCAGAAAAATGGATTTGTCTAAGTTGATCTGATAGGAGAAATAAGTAGGCCTTGCTCTCTCTTATGCTGATTTATTTGCCAGTTGAAAAGTAGAGGTGAGGTCATTTTAAAATTAATTAAAATCTCTGAATCCAAAAACCAGGTGCAGTTCATTCCCTTGGATCTTTGCCTCTCAACGGTCTCTTGGTAGCTCCATAATTCTTTAGGGTGTCAAAAGTGTTAAGGTGTTTAATGAATAAGTTCTGAAGCAGAACTAATTAATGGAAAGATAAAAATATAGTCAATAAATACCTTCTCTTTTAACATGGAGAGGTGGCTTCAAGATGTTTTCTAAATAGGGCACATGAAGATAATTGCAGTTCATGTCTTTTTCTAAATTGAAGTTCTTTCAGTTCTTACACCTCCACTTTTTTTTCTTTTGACCTTCCCACTTTTTATAAAACACAAAGAATTCCAAATTAAGTTCATGATGCATACATAATATTGTATGTGCTTTAATATCTTCTTGCATTTTTGTTTTTACCCTGTAATTACTTAATGTGAACAGATTTATTGGTATGCCTAAAATAGCCAGGTTACTTTTAAGTGTCTGACAAAGTATACTGTACCTTATAGAGACTATACAAATGTCATTTCCCCACTAACTTTAGACCCATCTTGTAAAATAGTTGATTTGCTGCATTCACATTTTGACTTTTCTCTTTTCACTGATTATTAAAATCATATGGTTAGAATTATTAATCTAAGGCAATCTATATCTAAGTCTGTTAACTGTAACTTTAAGTTCCCAAGAGAACCATGCTTATTTATGTGGAGTTTAAATAGAGGCCTAGATGTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTGTTTCATACATGATATTTTACATGTTTCAATGCCATTTTCCCAAATCTTCCCACCCTCTCCCTCTCCCATAGAGTCCATTGAAGGAAGAAGGCATAAGAGAAGACGAAAGAGACAGAATTAAATGAACTTAATAAAATAAAATGGCTTCCCAGGTGGCACAGTGATAAAGAATCTGCCTCCAATACAGGAGACATACGTTCAATCTCTGGGTGAGGAAGATCCCCTGGAGTAGTAAATGGCAACCTGACTGAAGTATCCTTGCCTGGAAAACTCCATGGACTTAGGAACCTGGTGGTCTATAGTCCATGGAGTCCACAGAGAGTTGAGCAAGACTGAGCGCACACACACAACACAACACAGCAATATGAAAACTGTAATTTCTATTACCTGGGTAAAGACTCCATTTTAATTAGAATCGTTATTTAGAATCAGTTCATCTCTTATAAACATTTGTCAATTATCAAAGAAAACATGAATTCTTCAAAGAATTTGAAAATTTCTCTCAAAGAAAACATAAGAACTCAAAATCTGCTTCTTATTTTTATCCCCCGCCCACCCCCCCAAAAAAAACCCCAGAAACCTGAGATGTGAATGAATAATATTCTTCTATTTTGAGAATCTGTGAAAATGTTACTTTAGTGTTGTGGCTTAGATTTCTTCCCATATACTTGTTGAAAGTCAAGTGTTTCACACTTAAATTCTTTAAAGGGCTTTTCCCAAGCTCCAGAAAATTATTTTCCTTTGTATCCACATTTCTTTGTTTTGAGATGCTGTACTGTGAACCAGGTATATTTGCTCTACATATTGTGATGATGATGAGCTTAGTTAATTTAGACATTTTTATGAAAGTAAACCAGTTATTTGCTTTAAAAAACTCATGCCTGTCTTCTTTTAAATTTTCTAAGTAGTGAGTAAAACATTGTTTGTCTATAGCTTATGTTATACACTTTAGAATTCCTCAGTATGTAGATTTTAGGGTAAAATATAGTCTATTATCTGGTAATTTAGACTTAGGGGGTTCTGTGCTGCCTTAGCAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAAAGAAAGGAAAAAAGTCCTGCTGCCAGTGCTGGATACCTGGGTTTGATCTCTGGGTTGGGAAGATATCGAGGAGAAGGAAATGGCAACTCACTCCACTATTCTTGCCTAAGAAATCCCATGAACAGAGGAACCTGGTGGGCTACAGTCCATGGGGTCACCAAGAGTTGGACATGACTTAGTGACTAAACAACAAAACAAAGTTTAGACTTAACTTCACACCCTTTCCCTGCTATCCTTCAAAACTGATCTTGTTCATTCTATTTTCTTGGTGTCTCTTTAACCTATACGTAATGTACTTTCTATGGAGGGCCACCCAAGATGGATGGGTCATGGTGGGGATTTCTGACAAAATGAGGTCTACTGGAGAAGGGAATGGCAAACCACTTCAGTATTATTGCCTTGAGTACCCCATGAACAGTATGAAAAGGCAAAAAGATGGGACACTGAAAGATGAACTCCCCAGGTTGGTAGTTGCCCAATATACTACTGGAGATCAGTGGAGAAATAACTCCAGAAAGAATGAAGAGATGGAGCCAAAGCAAAAACAACACCCAGGTGTGGTAGTGACTGGTGATGGAAGCAAGGTCCGATGCTGTAAAGAGCAATATTGCATAGGAACCTGAAATGTTAGGTCCATGAATCAAGGCAAAATGGAAGTGGTCAAACAGGAGATGGCAAGAGTGAATGTCAACATTTTAGGAATCAGTGAATTAAAATGGACTGGAATGGGTGAATTTAACTCAGATGACCATTATATCTACTACTGTGGGCAAGAATCCCTTAGAAGAAATGGAGTAGCCATCATAGTCAACAAAAGAGTCTATAAATGCAGTATTTGGATGCAATCTCAAAAAACAACAGAATGATCTCTGTTCCTTCCCAAGGCAAACCATTCAATATCATGGTAATGCAAGTCTATGCGCCGATCAGTAATGCTGAAGAAGCTGAGGTTGAATGGTTCTATGAAGACCTGCAAGACCTTCTAGAACTAACACCCAAAAAAGATGTCCTTTTCATTATAGGGGACTGGAACACAAAAGTAGGAAGTCAAGAAACACCTGGAGTAACAGGCAAATTTGACCTTTGAGTACAGAATGAAGCAGGGCAAAGGCTAATAGAGTTTTGCCAAGAGAACACACTGGTCATAGCAAACACCCTCTTCCAAAAACACAAGAGAAGACTCTACACATAGACATCACCAGATGGTCAACACTGAAATCAGATTGATTATATTCTTTGCAGCCAAAGATGGAGAAGCTCTATACAGTCAGAAAAAACAAGACTGGGAGCTGACTGTGGCTCAGATCATGAACTCCTTATTGCCAAATTCAGACTTAAATTGAAGAAAGTATGAAAAACCACTGGGCCATTCAAGTATGACCTAAATCAAATCCCTAACAATTATACAGTGGAAGTGAGAAATAGATTTAAGGGACTAGATCTGATAGACAGAATTCCTGATGAACTATGGACAGAGGCTCGTGACATTGTACAGGAGACAGGGATCAAGATCATTCCCAAGAAAAAGAAATGCAAAAAACCAAAATGGCTGTCTGAGGAGGCCTTACAAATAGCTGTGAAAAGAAGAGAAGCAAAAGGCAAAGGAGAAAAGGAGAGATATACCCATTTGAATGCAGAGTTCCAAAGAATAGCAAGGAGAGATTAGAAAGCCTTCCTCAGTGATCAATGCAAAGAAATAGAGGAAAACAACAGAATGGGAAAGACTAGAGATCTCTTCAAGAAAATTAGAGATACAAAGGGAACATTTCATGCAAAGATGGGCTCGGTAAAGGGCAGAAATGGTATGGACCTAACAGAAGCAGAAGATATTAAGAAGAGGTGGCAAGAATACACAGAAGAACTGTACAAAAAAGATCTTCACAATCCATATAATCACCATGATGTAATCACTCACCTAGAGCCAGACATCCTGGAATGTGAAGTCATGTAGGCCTTAGGAAGCATCACTGTAAACACAGCTAGCAGAGGTGATGGAATTACAGTTGAGCTATTTCAAATCCTAAAGGATGATGCTGTGAAAGTGCTACACACAATATGTCAGCAAATTTGGACTGGAATGGGTGAATTCAGCAGTGGCCGCAAGACTGAAAAAGGTCAGTTTTCATTCCAACTCCATAGAAAGGCAATGCCAAAGAATGCTCAAACTACCACACAATTGCACTCATCTCACATGCTAGTAAAGGATTGCTCAAAATTCTCCAAGCCAGGCTTCAACAATATGTGACCCATGAACTTCCAGGTGTACAAGCTGGTTTTAGAAAAGGCAGAGGAACCAGAGATCAAATTGCCAACATCTGCTGGATCATCAAAAAAAGGCCCGAGAGTTCCAGAAAAACATCTATTTCTGCTTTATTGGCTATGCCAAAGCCTTTGACTGTGTGGATCACAACAAACTGTGGAAAATTCTGAAAGAGATGGGAATACAAGACCACCTGACCTGCCTTTTGAGAAACCTATATGCAGGTCAGGAGGCAACAGTTAGAACTGGACATGGAACAACAGACTGGTTCCAAATAAGAAAAGGAATACTTCAAGGCTGTATACTATCACCATGCTTATTTAAATTATATGCAGAGGATATCATGAGAAACGCTGGGCAGGAGGAAGTACAAGCTGGAATCAAGATTGCTGGGAGAAATATCAATAACCTCAGATATGCAGATGACACCACCCTTATGGCAGAAATTAAAGAAGAACTAAAAAGCCTCTTATGAAAGTGAAAGAGGAGAGTGAAAAAGTTGCCTAAAACTGAACATTCCAAAATCTAAGATCATGGCATCTGGTCCCATCACCTCATGGCAAATAGATGGATAAACTGTGGAAACAGTGGCAGACTTTATTTTTGGGGCTCCAAAATCACTGCAGTCATAAAACAGGAGAGATAAGAAAGCCTTCCTCAGTGATCAATGCAAAGAAATAGAGGAAAACAACAGAATGGGAAAGACTAGAGATCTCTTCAAGAAAATTAGAGATACCAAGGGAACATTTCATGCAAAGATGGGCTCGGTAAAGGGCAGAAATGGTATGGACCTAACAGAAGCAGAAGATATTAAGAAGAGGTGGCAAGAATACACAGAAGAACTGTACAAAAAAGATCTTCATGATCCAGATAATCACCATGATGTGATCACTCACCTAGAGCCAGACATCCTGGAATGTGAAGTCAAGTGGGCCTTCAAAGCATCACTATGAACAAAGCTAGTGGAGGTGATAGAATTCCAGTTGAGCTGTTTCAAATCCTGAAAGATGAAGCTGTGAAAGTGCTGCACTCAATATGCCGGCAAATTTGGAAAACTCAGCAGTGGCCACAGGACTGGAAAAGGTCAGTTTTCATTCCAATCCCAAAGAAAGGCAATGCCAACGAATGCTCAAACTACTGCACAATTGCACTCATCTCACATGCTAGTAAAGTAATGCTCAAAATTCTCCAAGCCAGGCTTCAGCAATATGTGAACCGTGAACTTCGAGGTGTCCAAGCTGGTTTTAGAAAAGGCAGAGGAACCAGAGATCAAATTGCCAACATCCTCTGGATCATGGAAAAAGCAAGAGAGTTCCAGAAAAACATCTATTTCTGCTTTATTGTCTATGCTAAAGCCTTTGACTGTGTGGTATTGGAGAAGACTCCTGAGAGTCCCTTGGACTGAAAGGAGATCCAGCCAGTCTGTGCTAAAGGAAATCAGTCCTGGGTGTTCATTGGAAGGACTGATGTTGAAGCTGAAACTCCAATACTTTGGCCACCTGATGGGAAGAGGTGACTCATTTGAAAAGACCCAGATGCTGGGAAAGATTGAGGACAGGAAGAGAAGGGGACAACAGAGGATGAGATGGTTGGATGGCATCACTGACTCAGTGGACTTGAATTTGAGCAAACTTTGGGAGTTGGTGATGGACAGGGAGGCCTGGCATGCTGCAGTCCATGGGGTCGCAAAAAGTCAGACATGACTGAGCAACTGAACTGAACTGCACTGCTCTTGGAAGAAAAGCTATGACCAACTGCAAGAGCAGATTACAAAGTAGAGACATTACTTTGCCAACAAAGGTCCATCTAGTCAAAGCTATGGTTTTTCCAGTAGTCATGTATGGATGTGAGAGTTGGACTGAAAGCTGTCACCGAAGAATTGATGCTTTTGAATTGTGGTGTTTGGAGAAGACACGTAAGGGTTCTTTAGACTGCAGATTCAAAGCAGTCGATCTTAAAATGAAATCAGTCCTGAATATTCATTGGAAAGACTGATGCTTTGGCCACCTGAAACGAAGAACTGACTCATTTGAAAAGACCCTGACACTGGGAAAGACTGAAGGCAGGAGGAGTAGGGGACATCAGAGGATGAGATGGTTGTATGATATCACTGATTCGATGGACATGGGTTTGATTCAGCTCTGGGAGTTGGTGATAGACAGGGAAGCCTGGAGTGCTGCAGTCCATGGGGTTGCAGATTCGCACATGACTGAGTGACTGAACTGAACTGAATGTCCTTTCCCATGACCTCTGCTCTTAATATTTTGGTTCTGGGTCATGGCTACCATCTGAAAGTCCTATCTGTTTGCTATCTGTTGTCAACTTGAATCCAATTCTATGTTATGCTGTCATCAGAATAATTTTTCTAAAATATAAAATATCTTTTTAGTTTTAGTTAGGATTGGCTTTTTAGCCCCTTTAGGATAAAAACATGACTTTTAGCCTGGACTGTGAGGCCGTTTCGGTTCAGGTCTGTGCCCTGCTTTCCAGCCTGATTTGTGCCATTCCCTATTCCTACTCTCTTTTCACCATATTGAATTACAGGAAATTTTCTAAGCACCAAGCTCTCTCTTCCTGGCAAGCTATTGCATACACTGCTTCTTTGTTTAAAACATCTTTTCTCCTCTTTTTGTCTGACTCTTGCTTCTTCATCTTCTTTTACTCTCTCCCTTTTTTCCCTGGTCTGGACTAAATACCTCTATTCTGGGCTTCCATTACATGCCTAGGGTTCTTCATCTGTCTTTTACTTGTTTATTCTTCTACTGTGTTGTGAGTACTTGAAAGGTCTTACTCATTTTTGTCTCTGTGTCATATGCGATAAGGACCTCTTTAATAGGTTCTCAGATAGCATATTGAAAAGCAGAGACATTACTTTGCCAACAAAGATCCATCTAGTCAAGGCTATGGTTTTTCCAATGGTCATGTATGGATGTAAGAGTTGGACTGTGAAGGAAGCTGAGTGCGAAGAGTTGATGCTTTTGAACTGTGGTGTTGGAGAAGACTCTTGAGAGTCCCTTGGACTGCAAGGAGATCCAACCAATCCATCCTGAAGGAGATCAGCCCTGGGATTTCTTTGGAAGGAATGATGCTAAAGCTGAAACTCCAGTACACCTCATGCGAAGAATTGACTCATTGGAAAAGACTCTGATGCTGGGAGGGATTGGGGGCAGGAGGAGAAGGGGACGACAGAGGTTGAGATGACTGGATGGCATCACTGACTCAATGGACGTGAGTCTCAGTGAACTCTGGGAGTTGGTAATGGACAGGGAGGCCTGGTGTGCTGCAATTCATGGGGTCGCAAAGAGTCGGACACGACTGAGCAACTGAACTGAACTGAAAGGTTAGGAGAAGGCAAGGGCAACACACTCCAGTACTCTTGCCTGGAAAATCCCATGGGCGAGGAGCCTGGTAGGCTACAGTCCATGGGGTTGCGAAGAGTCGAACACGACTGAGCGACTTCACTTTGACTTTTCACTTTCATGCATTGGAGAAGGAAATGGCAACCCACTCCAGTATTCTTGCCTGGAGAATCCCATGGACGGAGGAGCCTGGTGGGTTATAGTCCATGGGGTCGCAAAGAGTGGGACACGACTGAGTGACTTCACTTTACAGTTGTTTTTTTTTTTTTTACTCAGGTGCAAGATGTTTAATCAGCTACTAAATGCCTACAAATATGGCCCTCCTCCAAGAGACTAGTTTACCCCATAAAGGTGTTTAGGTCTGAGGAGAACTGACATGAGCCCTCAGAACATAAGATGAGGATATTAAGTTCTGTCTTTCATGTGGGTATTGGAAAATTTCAGAGTCCATCTAGTTGGTAGGTATTAGTGTGGAGGAGGCATCATGATCGCAAGAATGGCTACAAATCTTTTCAGTTTCTTCCATGAAGATGTGGAGTCTATTTTTCCACTCCTTAAACTTGTACTGGTCTTGTGACTTGTCTCGGTTCCTATGCTTAATCCTCCACTCTTCCCTTAAGTGCTAGCAGTTTCTGGATAGAGTTGGAAGGCTTGTCTTTCTTTTCTCATTGCTCTTCTGTTTTCCTGAAGTCATGGCATCCATGTATAGAAAGCTTCATCTTTATTTTTCTAGATTCCTTATACCTGCCTACATATCAATGTCTTGCTCCCACTGTGCTCCTCTACTCTGCCTTCCCTTAGCCAAGCCCATTATTTCATATTTTGTCAAAAAGTATCAAGTGTGCTTTTGTCTTTAAGAAATTGAAAGTTTAACTAATTACAAGTTTAATCAGTTGGTTTTGTTTTGTCACTAAGGAGATCAAAGCTAGTAAATTGTAGGTGTTGGTTGACTTGCTCTGTGAATGGCATTGAGAAGTCAGTCTTCTTTTTGGTATATGGAGGTGGAGGTGTTAGTGAGTAGGTGCACGTCAAAACTACTAGAATTTTTTAATTTGTAAACAAAAAAACAGGTTCATAAAGTATAACACATATAACCTAATGAAGCTCTGTAGTTCAAAGATCCTGTAATGGTTTCACAGGTCAAGTGAAAGACCTTTTACAATCTCCATCCACCCGGGAGAAGTTACACCTTGTGATCCATTCTAAACACCAAGTTTAATTCACCTATTTCTGAATTTGATCTATCATTTAAATCTACAAGTTCCTCCTTTACCCCTTTCTTTATAATTATTTGCTGAAGACCCTGAGCCCTTTGTCCTGCAGAGTTCCCACAGTCTGGACTCTGCTGATTGTATCCTGACTGTCATTTAGCAGGTTTCTCCATCCTCTCTATTTCCTGTCAACTAGCAGCTGGATCCAGAGGCCTGATCAGACTTAGGTTCAATCCCTTCGCAAGATTATAAGTGGGTCAGTGTTCTTTCATCAGATGACACATATTTTTGTCTCTAGCTGTATTTTTTTTTTTTGTTAGCAACTGTCAATACTCAATGCCTAGCTCCATTAACTCATTGGAAGTTGCAAAAGGGAAGTATTCTAGTTTATATTTTTGTTTTTGATTGGAATGCTTTTATAGAGAGTTACCTCTCAACTACTATTTGGTTACCCAGTATGCAGTTCACAGGAGAAGGAAATGGCAACCCACTTCAGTATTCTTGCCTGGAGAATCCCAGGGACAGAGGAGCCTGGTGGGCTGCCGTCCATGGCAGAGTCAGACACGACTGAAGTGACTTAGCTGCAGCATGCAGTTCACATAGGGGTGACTGCACATATACTTAATATTTTTCCATTATTTACCAACTTTTAAGATAGCCAGTTGGTTTCTTGTCCTTTAAGGGTACCTAGATAGTTCCTTAAAAATATCTTTATGCACTAATGAATTTAAACAAATGATGAATTTTAGTGCATTACAGTTTTGACCACTATTGAAGTGCCAATTTCCTGTCTTTGCCAAGTTAGAGCCCCTTCAAGTTGGCTCCTATGTCTTTTTGATACAGTAGTCTTTGATGACTTCATTGCTATGTAGTATGAGCAGATCCTCATCTTGTATAATTCTGCCTCACACCTCAGGCATTTCTCCAAGAAGCTTGAATTCATTTTTGTGAAATTTATTTCACAGTTTTGGTCCTACAGATATTCACAGCTACTGAGTCATTGTTTCTTGGTCCATTTAATAAATAGAATGAGGAGAAAGATATATCTGTGTCTGTGTCTCTGTATATATGTGTATATATACCCATATATATATATAGATGAATAAAAATAAAATTTCTAATGAGTTAATACAGATTATATTTAACTAAAATTCAGTATACTAGGGCTTTATTTATTCGCTTCTATATTACATCTTCAACTACTTCTTCCATATTTGAGACTGCTGGGGATGATCAAATTAAAGTATTGCATAAATGTTCCATTGCTTTATGTGACATTACAAATATAGCAACCTCAGAATAACAATACTAATGCCATTACCACCAGTATAATTACTGAAAATACATATAAAGATTTTTGCATATGCTTGTTTTCCCATTCTTCCCCACCCATCATTATTTTTAGCAGCCATTCTAGCTCTATATTTTCAGAGCCTATAGCATAGCATACTGTACCCTTTCCCTTTCACCTTCATTTAGTCTTAATTCTGCAAGTAACTATATAGTTAGGGCTACCACTAATCTGTATCAGTGTCTCTCTAGGTAATTTAGTTGTCTAAAGGATATTCACTAATCTTGGGAAAAATCCATAGGAGCAAAATCCCTGAGTTCTTTTATATTAGTGATATAGTTTGCATCCTTTATTTTTGAAAATCAGTTTTGCTGGGTATGGAATTCTTGGTTCATATTTCTTCTTAGAGTATTTTAAATATGTTACTCCCTCGATCTCACTCGAGTCAATAGACAAATCATGGAGCTTTTGTTTTCTACTATCAAGTCCTTTATATCTTTCTTTCCTCTTTAATCTTGTCACTGTCTTAACTTGTGATGAGGTGATTGTGAGGCAAGGTGAAGTCATGCATCTGTAATCTCTGAAATATCATACGGTTGTCTCACAGTGATGTAACGGTACTTCCTTTGACACTCTTCATACCATCGCTAGTTCTGGTACTAAAGCACTGAATAGGCCATGACTGTCTTTACTTGAAACACTTCTGGTGGTTCTCTCTTTCAAACAGGGTGAAGCAGACTGTTGCACAGCACTAAAGTTTCTCCCTCTTGGATGCTCTTTTTTCCCTCTAGACATGGCCTTCTCTCTACATCCCATAGGTTTCCAGTATTGGGGTAACACTGCTTATCATGCCCTGGGCAGATCATGTTCATGCTGCTCTTTCACAAAAAAATACTGCTCTTCTCTCAAAGACTCCACTGTGATTAAACTCAAACACTGTTTTACTTGTAAGGTCTTAACGAAACTCCCTTGAATTAAAAATAAACATTTTCTCGTATGTACTTTGTCATTCCTGATCCTACAGTACTTATCTTTTCCTATATTTTTTGGACGTGTCTCTCGTATTATATACTTAAAAATTCTTGAGAGCAGGAGTTCTATTTTCTGCATGTTTTTCCCCCCATGGTATAAAACACATGTTCTAACTTAAGTGTAGTGCTAGAGTTAGGGTTAGGATGCTGGATGCATTCACTGAATGGGGTGAAGTGGACAGCCATCATTTCTCCCATTTGACAGATGTGAAAGTTATAAGACTTAGTTATAGTATGAAATTATAATAAGTCTCAACTCTGAATGCTTTCTTTGAAAGAGAAAATAGAATTTTAAGACTTAACTACATTTTAATTTAGTCTCTTTCTTAGACTTTTTAAAAAATAATGTGCTACTAACTTTCTTGATTTGGACACATGTTTAGATTTCTGTATACAACAAATTTGTTCTTAATAATAATAGTGCCAAATTCAGGATTATCAACCTGCTTATTACCACATCGTCTACCTCTGCAAAGGTAGCCACCATTGTCCTTCACTTATTCATCAGAATACTTTCTGTTTTTATACATCCACTTAATGAGAACTATTTGGCTCATTCTTTGTGCATGTCAATAAAAATTCACAAGCTAAATCAGTAGTTTTTAGGTAGAGAAGAATTATTTGCTTCTCTCAAGGTGTCAGATTTGCATCTGTTATAATTTTTCAACAAGATAACTTTGAAGATCAATCACTAAAGACCGGCAGGCATCAGTTCTAAATGTTTCAAAAACTCTATTCTAACACACCTATATAAGCTTTAAGTTTTAGTGCTCATCATGTTCTTTTCCTTCAAAATATTTCTTTATGACATTTGCTATTTATAAAGTCAAAGTCAATTTAAAATCACACAATTTAACAACTCTTAGCTTTGTTAATTTATAAATGAATTTTTGTGCATATGAATTTACAATAAAGTTTATGAGCCGACTACAACAATCTGTTATAGTGAAGAGCTGACTAATAAAAGTAAATAGGTGAATTAAGTCCATTCTATAGAAGAATTGTTAAATAGAGCTATCCCTGTATCACATATAGTCACAGAAAACTACCTAAGTAAGCCTCAAGCACTCTATTTTTAGGAATTCATTGGCTATAGTGGATCGCTGTACTCATTGATGAATAACTGAGATAATTTATATGAATTCATTTTATCTATATCATTAACTCATCAAATGATGTGTTTCACATTAAAATAAAAACACTGTAAAGTCAGCACCTCAGGGGACTGGTATACTATGATCTGTATTACTCCTTTAATTATGTTGTAACTATTTGACTCTATTTTGTCTTAAATTTTCCAGTTTTCTGCTATATGAATTGTTAATATCTTCTTCTATTTTACAATCCAGTTTCCTGTGGCTTGGAAGTGAAATGCTTCATAAGACTTGATGCAAAGAACTGAGAAAATATAAGTAGACCAAACAACAACTTTCATGTCGAGTGTGAGCTTTTCTACTAATTTTAGCACTTTGGGGGAAGGTTAGTTTTCTCAAACTCTAAAATGTTTATAGCTGAAACTATTTGCACCCAGTGGGAGCTGACCTAAAAACTAACATCAAATATTCTGTAGTTAAGAGGATGAACAGGATTTCCCAGTTCTAAAAGTATGCAAAGCCTTTGTGATGAAAAAAGGGCGCTTTTCTATTTGACAGTCCATACATAACCCTGTGTCTTCAGTGCTGTGATTCCTGCATGTTATTCAGCGTAAATGTGCATGATATTTCCTGAGGAACATTAATCAGGTTGTAAATTTATTAGTTATGTGACAACCATCTTCCCACAAGTGCCTTAAAAGTTGTGAATTGAGTGACTATTAGGTGATATGGAAAACTGGATAAAGAAAAATAGTTTGATTAATGTCTGATTGATATATTGTATATCCTAATGGAAATTCTGTATTATAAAACAATCAGTATTGCTTATATGTAACATGAATTCTCATGTTTGGAGCAGGATAATCTATATTTATTAATATTGCTATGCTTCTCTAGACATTTTTTAGGGAGAGGACCAGAGGGTAATTTTACTTTGGTTGAGTCAGTTAACTTCCCGTGTTACTTTTCAGCCTCATAGACTTTTTGTTTCCCCATGATACTAAAAAAGATAAAGAATTTAAATTTTAAAATGTTGATAGAAATATGTTGAGAATTTTAATTTCATCAATTTAGGTAAAATAAAACATATAACAGACATTTGAATACCTCCACAATTTAAAATGATCTATATTGGCAGGGGAAATTTATGTATATATTGAATATCTTTTATCTATTGATGATACATTTATTTATTACTGGATATTTATTTACTGTTCTTCAGATATATGTACCTACTTTATTAATTCAGTCCCACTAAAAAGTATAAGGAAAAACATCTGTGAAAATAATTTGTTATTTTTAAATAAAAAATTCATTAGAAAAAAATTTAGAAAATAAAAAGTAGAGAGAAGAAAAACAATAAATGTATCACTTGAAGCCAATTTTTATAATAGTTATGTGCATTTTATTTTGTCTTATCTCCCTTTTGATTTTTAACACAATTTATTATCAATTGATAAATAATAGTAACCTATAATATACCATATAGACTAACATAAAATAATAAAACATAATAATTTTGTGTCCATCAAGGTTATTCTTCTATAAGAAATTAAGGAATAGGAAATGGCAACCCACTCCAGTGTTCTTGCCTGGAGAATTCCAGGGACGGGGGAGCCTGGTGGGCTGCCGTCTCTGGGGTTGCACAGAGTTGGACATGACTGAAGTGACTTAGCAGCAGCAGCAGAAGTTTTATTGGAGGATAATTGCTTTACAATGTTGTGTTGTTTTCTGCTGTATAACATCATGAATCAGTCATAACTATATATTTATATCTCCTCCCTCTTGAGCGTCCCTTGCACCCCACCCCTCTTCCTCCCCTCCAGGTCATCACAGAGTGCCAGGTTGCCTCCCTCTGTTACATAGCGGCTTCCCACTAGCTAGCTATTTTTACACATGATAGTATATATATGTCAAAGCTACTTTCTCAGTTCATTCCACCCTTTCCTTCCCCCTCTGTGTCCACAAGTCTGTCCTCTATATCTGTTTCTCTATTCCTTCTTCCTTGCAAATAGTTTCATGAGTACTATTTTTCTAGATTCCATATATATGCTTTAATATATTCTATTTATTTTTATCTTTCTGTCTTACTTCACTCTGTATTACAGGCTCTAGGTTTTTCCAGCTCACTACAACTGACTAAAATTTGTTCCTTTTTATGGCTGAGTAATATTCCATTATATATATGTACCATACTTTTATTTATTCATCTGTTGATAGACATCTAGGTTGCTTCTATGTCCTGGTTATTGTAAATAGTGCTGCAATGAACACTGTGGTACCTGTGTCTTTTTGAATTCCTGTTTTTCTCAGCATATACACCCAGCATATATCTCAGCAGTTGGGATGCCTGGGTCATATGGTAGTTTTAGGTTTAGTTTTTTCAGGAATCTCCATTCTGTTCTCCATAGTGGCTTTATCAATTTACATTCCACTAACAGTGCAAGAGGGTTCCCTTTCCTCCATGTCCTCTTTAGAATTTATTGTTTGTAGATTTTATTGCTGATGGCCATTATGACTGGCGTGATGTGTATCTCACTGTAGTTTTGATTTACATTTCTCTAATAATGACTTTGGCCACCTGATGCAAAGAGTTGACTCATTTGAAAAGACCCTGATGCTGGGAAAGATTGAGGGCAGGAGGAGAAGGGACGACAGAGGATGAGATGGTTGGATGGCACCACTGACTCAAAGGACATGGGTTTGGGTGGACTCCGGGAGTTGGTGATGGACAGGGAGGCCTGGGGTACTGTGGTTCATGGGGTCGCAGAGTCGAACACGACTGAGTAACTGAACTGAACTGAATAATGAGTGATGTTGAGATCTTTTCATGTGTTTATTGGCCATCTGTATGTCTTCTTTGGAGAAGTGTCAAGAGATAGACTTTTAATAGAAAATTCTACTGAAGTTTCAGTTTAATTTTTGTGTACTTTACTATAGCTGTAACCATAATTGTATCTTTATTTTTTACTTAACATTATGAGATGTGCACTTTTGCATGGAATTTCTGAAACTAGTTTTAATTCTTATGAATTAATATATACATAGCTATAGATTTCTGTTCTTTGGATATTTTTATTTATTTTTGCCAATCTGAGGTTATAATTAATAGCACTGCAGTGGATATTATATGCGTTTGTTTTAAATCTTTTGATTGAGTCCCAGAAGCAAAATTACTGAGTCAAAGACACTAATAGTTATTGTTGTTGCTATACATGAAAATCAAATAGTTGAAAATTAATGAATATTTATAAATAGGTCAGAGCTTGTATTATAAGTGATAACTTGAGAAAACATTTCAGAAATGATTCAGAAAGAAATGTAATCATTTGTCTCTCTTCAATGTAAAACCCAGTATAGAAAGAGTAACAATGACAAGAGGGGAAAAGGAATCATAATAGTGGCTCAAAGCAGCCCTTTAAAAGTCCTGTTATTTCCATAACACTGGGGACTATAATAATATAATAGTTGATTTCTTCTGGTTAAAAAATTAAAAGATGTAGTAAAACTGATCCATTATCTTGATGTGAAGAGCCAACTCTTTTCCTGATGCTGGAAAAGATTGAGAGTAAGATGAGAAGGGAGCCACAGAGAATGAGGTGGTTGGATGACATCACTGACTTGATGGATATTAGTCTGAGTAAACGTGCTGCTAAGTAACTTCAGTCGTGTCCAACTCTGTGCAATCCCATAGACGGCAGCCCCTCAGGCTCCACTGTCCCTGGGATTCTGCAGGCAAGAACACTGGAGTGGGTTGCCATTTCCTTCTCTAATGCATGAAAGTGAAAAGTGAAAGTGAAGATGCCCAGTCGTGTTCGACTCCCAGCGACCCCATGGACTGCAGCCCACCAGGCTCCTCGATCCAGGGGACCCTCCAGGCAAGAGTGCCAGAGTGGGCTAGTAAAGGACAGGGAAGCCTGGCGTGCTGCAGTTCATGGGGTCACAAAGAGTGGGACACGACTTTGCGACTGAACAACAACAATTATCCTTTTACAAGAAAACCTACTATTTGATACATTTGCTTTGTGTGTGTTTCTGGGAAGAAGAGGGTGCCTAAAATGAGATAGTACTGTATGTATGATTTAATATTCTGCTTTTATTATTTCACATAATGTGAACATTTCTCTGTCATTTTTATGAGACTGACACACTGACTCCAGTGTTGAGGCAAATTCGCTGTCACTTAAAAAAGTTATGATATTTAGTGGCTGCATAATAATCCATCAGTTATTTATTTATTTATTTTATTTTTTTTAAACTTCATATAAACTTTATTTGCATTAAGGAAATCAATATTTACTTAATAAATCATCATTTTAAAGAGGGAAAAGTACATTTCTTTGACCATAGGCCTTTCTTTTTTATTTATTTATTTATTTAGTTTTACTCACATTTATCTTGTTTATACCCTTTCTGGCAATTATAAATATCACTTCAGTGAACTCGGTACTTCAGATAATGCAATTGGAATAAATACCTATAATTGGAATTGCTAGTTTAAAGAAAATGGAGCTCTAAAATTCATCTGTGTTGATGGGAGGTAAGGTTTATCTTTTAAATTTCTATGGCTAAAGTCTCCCTGGATTGTTTTGATGCTGTATCACCCCAGACATCTTATTTGGCTCTCAGGTCCCTAATCTTTCCTTGAACAAATATATGACTGTCATACAGTTAAGCTGTCATCAGCAGCTTAAAAGGTCATCATCACTAACTAAAAAGGAAGTGTTGCGAGAATCTGGAAACAAATGAGACTGCTCAATATTTATTAAATACCTATTATGGTTGTTTTATGATGATCATTTTATCACATAGTGGTTTTAACTACCCCCTCAGTGATATATATGTTTTCTCTCTCCATCCCAGAGTGGCTCTAGGTTCTATAAGGATTTCCAAACTTTCTGTGTGGGGTGGTCAAAGAATCCATAATCTCACTTAACCTCAGCCTCTCTTTCTGTCTCTCTTATTCTCGCTCTCTCTTTTTCTCTTATTTTTATCTGGTTGCATGCTATCTTTTCTCTCTGCTGGTCTGACACCTGAAGTGTTATAAGGCATCTTTCTTCTTCCTTAGTTCCTGTCAGTTCTAACTTTAAACTTCATGATAAGAGCTTTTTAATCTTCACTTATCTCTGTGGTTAGGGTACATAAGGAATAAATCTTTGGAAGAGTGACTGTAGAAAGATTTTTTTTTCCCTTCCTGGATATATTCCCCATCTTTTCCACTTTAAAACTTTCTCTTTCCTGCAGAAGAATGGAGAACACAGTTGATGGCCCTTCACAAGCCGGGGGCACTTATGGAACTGCCTCAGCAGGAAAACCTTTTAGCACTTATTCTGATGCTTCCTTGTTTCCCTGTGTTTGGGCAACTGAGTACTCCTGACTCAGGATGGTGAACTGTTGATTTCAGATCACCAGTGGGTGTTGCTCTGAAGTAAACAGTTGATTTCTGTGTTCTATTATTTTAACATCCACATTTGACTACAGTGCAGCACTCTTCATGGAACTGTTTATGGCATAGCAAATCTGGGCCTCTGTGTTTTACCCAGCCTAGTTTCTTAGGCTCCGTGATTGTGAACTGGAGCTCTCTCCAGGGGCTCTGAAGTTGCCCATGAGGTTTAGCTGTGTGAAGAGGGAGAGGCATCCTTGGAGAATCAGTCTTGGTGAGCTTTTGTTTGCCTCCAGCACAAGCCCTAGGTGCTGAATAATTTATGCTTAATACGTGTCGAGTCAGTTCCAGATTTGTAAAGCTATAACAGGAGGTTCTTGCATATTGCATTTTACTGTCATTTCTACCAGAAGGAGCAGAAGAAAAGATGAAACTGAGAAGTCACCTTTGCTTCTTTTAGTGAGAATGGGAAAAGTTAAGGCGGCAGAAAGTAATGAAACTATTTCTTAAAATGAGGTTCTTGGCTTCTCTGTTGGATTTCATTTATTCACGTCACTCTAGATTTCCATCAAAGACTGAATCTAGGATGATGTTACTTTACATATTATATCAAAGTGTTGTACGTTGTTGTATGTACACATGCGGTGTTGCATACTTAGACCTTAAATTATGTTCTGTGATCAGTAACACATGAAACTGATTTAGAAAAAAGAACATGACGAGGATAAAAAAAACTAGTGTAGATACTTGAATGTATGTATCTTAACTATTTTCCAG
Seq C2 exon
GGAAAGGGGATGTGTTTGGAGACATCTTCTGGAAGGAAACTACCCTTGCTCACGCGTGTGCCAACGTCCGAGCACTGACATACTGTGACCTCCACATCATCAAGCGAGAAGCCTTGCTTAAAGTCCTGGACTTTTATACAGCTTTTGCAAACTCGTTCTCAAGGAATCTCACTCTCACTTGCAATCTAAGAAAACGG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSBTAG00000011379:ENSBTAT00000015122:9
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF078836=Cupin_2=PU(64.1=48.2),PF0002724=cNMP_binding=PU(45.5=47.1)
A:
NA
C2:
PF078836=Cupin_2=PD(34.4=33.3),PF0002724=cNMP_binding=PD(53.4=71.2)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Rat
(rn6)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Pre-implantation embryo development