BtaINT0082645 @ bosTau6
Intron Retention
Gene
ENSBTAG00000001093 | KLHL23
Description
Bos taurus kelch-like 23 (Drosophila) (KLHL23), mRNA. [Source:RefSeq mRNA;Acc:NM_001205507]
Coordinates
chr2:26619585-26631710:-
Coord C1 exon
chr2:26631558-26631710
Coord A exon
chr2:26619899-26631557
Coord C2 exon
chr2:26619585-26619898
Length
11659 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAACA
5' ss Score
8.88
3' ss Seq
GCTTTCTTTTTTCTTTTTAATAG
3' ss Score
-0.16
Exon sequences
Seq C1 exon
GCGTAGGAAATGCTACTGCCTGTGTCTTACATGAAGTTATCTACGTCATTGGCGGCCACTGCGGATACAGAGGCAGCTGCACCTATGACAAGGTCCAGAGCTACAATTCAGATATCAATGAATGGAGTCTCATCACCTCCAGTCCACATCCAG
Seq A exon
GTAACAAATTACTGTCTCAAATAGTACGTGTTGTGATGCCACTTATCAACATAAAAGAGGGCTAAGAATATGCTGGAACTAGACAGTACTAAATTTATAGTACACTACACTTGGATATAATTAAAAGGCCCCAAATAGTCACATGTTCATCTGACAACAATCACAATTAACTTATTCCAATTCGAGGACATCTACAGATACTTTCCCTGATGTCTTTACATGACAAATATTTTAAGCCTGTGTGGTTAAAAGTATTAGTTCTTTTAAAATTTTTTTTACAAAGATTCTGTTCTTCCATTTCCTATTCCTTAGTTGTATGCTTTTTTTCATTTACTACCTGTGTTACAGAAAACAGAATTTTTATGGACAGGTAAAAACATTAGTCTGTCAAGTAGGTGGGAAGGATATCTGTTAATTCCTTTTAGGAGGTGATTTTTTTTTTTTAAAGAAGCATGTTCTTTGTGGGTTTCAATAGGTGTGAAGCACTTACTCCTGTGATTGCAGGGCTCTTTGTCGGCCTTAACAGTCATCACAGGAGCTTGTCTGCCCACAAAGGGTGGCCTGCCTTCTGTGGTGTCCTTTGTTCTTTGGCTTGTCTCTTTGGGTAAGGCTCAGGGGAAAGCATAAACCTCTTACAGTTATGCCATCTGGTTAAGATTCTTTTCATTAGGAAAGTTTCATGTCACCGTATCACTATACTACTTTGAATCATTTTCCATATGGCATCAGGCCATATGTCAGTCCATATGTCCATATGTCAGTCACTGGAGAGCATAATCAAAATTCACAAGCTTGACCCATCTGAGAAGAAGAATAATAGCTAACCTTCTTGAGCACTTTCTATAGGTCAAGTACTGCCTAAGCACTTGGCATGAAATACTACCTTAAATTCTAACTACAGCCCTGTGAGTTGGTATTGTTTACCCCTCTTTTACCCCATATTTGAAAATGGAGGCTTAGAAAGGGTAAGTAGCTGTGCCAAGGTCACGGTTTGGAAGTGGTGGGTCAGGATTCAAAGTCAGGAAGTTTGAGTGCATTAACCTGTGGCATAACCAGCAAGTAGTCTTCCTCTCTGGAAGGGAGCAGGCTCTGCTGCTTTTAACCAATGCAGCTAGTTTGCCCGTGCGTCATGTGTGTTGTGTCATCTCACAGTTCAGGGCGAGCACACCTGAAGCTGGGTCTGTGTCTCCATGTACAGGACTTCCACAACAATCAGCCAGATGCTGTCCTGGCTCTTGAAGACATCACGGAGGCAGTCATCCGTCTTCTAGTAGTTCAGATGTATTATCCTAGAATCCCCACAACGTTCTGTTATAACTAGTGAAATTATGGTAGAGAAAAACAGTAACAGTCATATTGAATGCAGGCATGCCTTGTTGTTTTGTGCTTTGTAGACATTGCATTTTGTACACACTGAAGGTTTGTGGCAACCCTGCCTTGAGAATTCTGTCAGTGCCATTTTCCCAACAGCCTTTGCTCACTGTGTCCTGTCCCATTTTGGTAATTCTCACAATGTTTTCAAACTTTTTCATAATTGTTATATTTGTTCTGGTGATCTTTGATCAGCAGTCTTTGATACTCTATTCTAATTGAACTGGCATTTTTAGCAATAAAATATTTAAAAATTAACATATATCTATTGTTTTTCTAGACATAAAACATTATGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTCACTTCAGTTGTGTCCGACTCTGTGCGACCCCATAGACAGCAGCCCACCAGGCTCCCCCATCCCTGGGATTCTCCAGGCAAGAACACTGGAGTGTGTTGCCATTTCCTTCTCCAGTGCATGAAAGTGAAAAGTGAAAGTGAAGTTGCTCAGTCGTATCCGACTCTTAGTGACCCCATGGACTGCAGTCTACCAGGCTCCTCCATCCATGGGATTTTCCAAGCAAGAGTACTGGAGTGGGGTGCCATTGCCTTCTCCAATAGACTACAGTATAGTGTAACCATAACTTTTTATGCCCTGGGAAACCAGAAAATTTGTGTGGACCCTTTATTGTGATGCTCACTTTATTACTATGTTCTGACCGAACTTCAGTTTCTTCAAGGTATGCCTGTAATAGCTAAGATTAGACGCTTTACCCTCTGAGCCACCAGGGAAGCCTAAGTATGTGCCAGGCACTAACTTTTCCAGTACTTTCACATGTATTAATCCAGTGAAAGTGTTAATCACTGAGTCATGTGCGACTCTTTGCAAACCCACGGACTGTAGCCCATCAAGCTCCTCTATCCATGGGATTCTCCAGGCAAGAATACTGGAGTGGGTTGCCATGCCCTCTCCAGGGGATCTTCCCAACCCAGGGCTCAAACCCAGGTCTCCTGCATTGCAGGCAGATTCTTTACCATCTGAGCCACAGCAGTCCTGTGAACTAGATACTGCTACTGTTTTATAGGTCACTGATGCACACAGACAGTGAAGAGGTTGCCCGTGGTCAGCTAGCTCAGGCTGTTGTGAGTTTCAGATCCAGGCAGCCTGGCTGGAAGCCCACGCTCTGAACAACTACGTTGTTACTTCATTTGATCCTCATGTTAACCTAAGTTAGATATTATTCTGACTTATCTTTACAAAGAAGATCCAATATATGAAAAGTCAGATCAACAAATCAGAGGGCAGTTGTCCACACTAGAAGCTTAATTTATATTTCATAAAGGGATTGCTTTAAAAATAAATCTTCCATAACACACTTAAACTGGATATGGCTTGTTGACTGATGGAGAGCCACTGCAGGTGGCTTAGTAAGACTTAAGCCAAAGGATGTAAAGCCATGGCAAATTGAAAAATCAGTCAGAAATGAATATTAAATTACATTATCAATCCCTGGGAACATAGAATTCCACATGGAGCATTTTGATTCATGTTGAACATAAAATGAGAAATGAAGATATATTATCACCTATGTTGTATATCTTCTGTTTGGCTCTCACAGTGTTCAAAATATTTTTTAACTGGCTTGTTATCAATATTTAAAATTCAGGAGATTTCAAATAAAAATCATTATTTCTGGCCTTTAGGAAAATTGCAAGATCTGTCATCATATTCCTTCCTGGCAACAATCACTGGGGCCAGGTAGTGGCTATTCCCTTCAGATGAGGCTTCCATTTCACCACAGACTATTCCATGCTTCTCACATCATAGAGCTTGAGGGGGGCTGCTGTATTTCTTACCCCTGCCTGGAGAATCCCAGGGACAGAGGAGCCTGATAGGCTGCTGTCTATGGGGTTGCAGAGTCGGACACGACTGAAGCGACTTAACAGCAGCAGCAGCCTGCTTCATTCGGCTAATCTGTTATCTCCTTGGCCCTGGGAAGCGTTTGGATCTACATCCTCTGAATTATGGCAACTTAGGCTTCCTATGGGGCTTCCTAGGTGACTCAGTGGTAAAGAATCCGCCTGCCAATGTAGGAGATGCAGTTCGATCCCTGGGTTGGGAAGATCTCCAGGAGAAGGAAATGGCAACCCACCCCAGTATTCTTGACTGGGAAATCTCATGGACAGAGGAGGACTACTGGGGTCGCAGAAGAGTCAGACGTGACTTAGTAACTGAACAACAACATGCTTCCTATATGTTTTAGGAGCACCTCCTGAGAAGCGTAAAATGCCAGTCGTGAGTCTACCTTATAGATATGTAGCTTAGACTGCAAATAAATGACTATTATTATTTTTTAAAGGTAATATAAATGTTATCTTTTTTCTTAATGCTTTTAAGGGTGATTGCTTTGTATAGTTGAAAGACAGGGGAGTATAATTCCATCAAATTCAAGATAACATTTATTGAGACCTTACCTTGGGAAAGATACCATTGTATTGATAGTTATTACATGAGACATTAAAGATGATTAATTTTACTGCCACAGGAAGTCAGAATATAGTAGTAAATACACATACATAACAGGAACACAATCTTACAAATAGATGCTATTGAAATTGAGGGCAGAGAGAGCATCAGTCTGATTAAGGGGATCTGACAATCTTAGGAGGCTTCCAGGAGTAGGTTGTTACGATTTAGGCTTTCTGGCAGAAAGTTAGCCAATGAAGGAATGCTAATGGGAAAATTCCAGGTTTACTCCAGTTCTTGGGAGTAGAAGTGTGAGTGAGATGCAAGAGGGAAGAATGAGAGACCAAATGACAAAGTTTATTTGAAAATCATGTCACGGAGGGCTTTGAATGGCCTCCATAAATTTTAAAAATAGAGAAGTACCAAAGTTTTCAGAGCAAGAGAATGCTGCATTGTCAGTTTTAGTTTTAAGAAAAGAGTTCCTTTGAGAGTAGACTGGGAGAAAGATGGCAGGGAGGCCTACTCAAGCTATAATATGCCAGGTAAGAAATACTAAAAGCCTGCAGTGGCAGGAGTAGAAAACAGGCAGGTGTGAGGAATAGTGTAGGTTCATCATTGATTGAATGGTAGTGATCACCCCCTTGGGTGATTGGACATTGGGGATAAGGGCAAGACTCTCTGGCTTATTGACTGGCAGCATTGAAGTAGCAACCAATGGGAGGGGAGAAGTGGAGGGATGATAAGCTCAGTTTTGAGTGAAATGTCAAGAACTAGTTACTCAGACAGTAAAGAATCTGCCTGCAATGCAGGAGATCAGGGTTCAATCCCTGGGTTGGGAAGATCCCCTGGAGAAGGGAATGGTAACCTGTTTCAGTACTCTTGCCTGGAGAATTCCATGGACAGAGGAGCCTGCTGGGCTAGAGCCCATGGGGTTGCAAAGAGTTGGGCATGACTAGACAACTAACCAGAGAAGGCAATGGCACCCCACTCCAGTACTCTTGCCTGGAAAATCCCACGGACAGAGGGGCCTGGTAGGCTGCAGTCCATGGGGTCGCTAGAAGTCGGACACGACTGAGCGACTTCCCTTTATTTTCTCACTTTCATGCATTGGAGAAGGAAATGGCAACCCACTCCAGGGTTCTTGCCTGGAGAATCCCAGGGACAGGGGAGCCTGGTAGGCTGCCGTCTATGGGGTCGCACAGAATCGGACACGACTGAAGCGACGTAGCAGCAGCAGCAGCAGGACAACTAACACAACTTAGAAGAGCTGTCCAGAAAGCAATGGGAAGTGTGGTTCTGCAGTAGGAGGAAGAACGTGGGTAAATACAGAGACCTGGGCATTGTTTGCTTAGAGATGATGGCCAGGTGTGGAGGTGAATAAGATGCCTTGGGAGGTTGGGACTAACAACACATAAATGAGCAGAATCTTGAGAAACAGCATTAGTTAAAGGAGGAGCTGAGAAAGAAAGAAGAATGTGTGAAGAACCCAGGAGAAGCAATAAGTGATAGGGAAGAAAAATCCGTGGAGAGCTTTGTCCAGTGGGGAGAATGTTCTCTCTTGGCTCTGCCCTTTATTTACTTATCTAATCTTGGGCAGCAGCTTAAGCTCTTGGGTCTTACTTTCGAGCAAAATAAGGATGTTAGATTAGATAAGCTTTACAGTTCTTTTCAGTGAGAAAAAAAATCTTAAGTAAAATTTTTAAAGCATTTTTTAAAAAGTGGATATTGAATACATGAAAATATTATGGTTGTTTCTGAATGCCTGCATGGCTTTGTTCCGATCACTCTTGTAAAACTGAATATCGACTGCCATGTTTTTATAGTGAACATTTGTGTGTAAACTCTGAGCTGTTTTCATACTGGGTTTGAAATTGCTCATTCATTCATTTGTCCAACAGATATTTGCTGAGTGCTTTCTAATGCTGTGTACAGTGCTAGGAACTCGATAAACAAGATACAGTACCTTAGCCTCAGTAGCTTCATAGAGTGACCAATAAGAAAAAAGTCAGTTACAGCTGAGCAGGTTTCCACCAACTAAAACAGAACATTATGTTGCATTTGGGTAATGGGAAAAAATACCAGGAATCATTTTATTTTTATACTTTTTAAAAACTGAGATGTAGTTTATGTACAATATAAGTTCTAGATGTATAATATAGTGATTTACAATTAAAAATTTTTTATACTCTATAGTTATTATAAAATATTGGCTGTATTCCCTGTGTTTTACAATATATCCTTCTAGCCTATTTATTTTATACATAATAGTTGGTACTTTCTTAATCTCCTACCCCATCTTGCCCGCCCCCCCCCCCCCCCCGCCCATTCCCTCTCCCCACTGGTAGCCACCAGTTTGTTCTCTAGATCTGTGAGTCTGGTTCTTTTTTGTTGTATTCACTAGCTTGTTTTATATTTTAGATTCCACATATAAGTGATTCATGCAATATTTGTCTTTCTCTGTCTGCCTTGTTTCACTTAGCACAATATTCTCCATGTGTGCTAAATTGCTTCAGTCCTATCTGACTCTTTGAGACCCTATGGACCATGGCCCACCAGGCTCCTCTGTCCATGGGATTCTCCAGGCAAGAATACTGGTGTGAGTTGCCATGCCCGCCTCCAGGGGATCGTCCCAACTCAGGGATCGAACCTGCGTCTCTTATGTTTACCTGCATTGGTGGGAGAGTTCTTTACCATTAGTGCTACCTGGGAAGCCCTAATACTTTCCAAATCCATCCATTGTTGCCAATGGCAAAGTTTCATTCTTTTTATTGTGGAATAGTATTCCTTTTTATTTATATATATATATACACACACACACACACACACACACACATATATATACACACCATATCTTTTTTATCTGTTCATCCATTGTGTTTTTTTGCTTTGTCATTTAAAAAAAGTTTATTTGTTCATTTTTATTGAAGTTTAATTGATTTACAATATTGTGTTAGTTTCAGGTATACAGCAAAGTGAACCAGTTATATACATGTATGTCTCCAGTCTCATTTAGATTCTTTTCCCATATAGACCATTTATAGAGTATTGAGTAGAGTTCCCTGTGCTATACAATAAGTCCATTGTTCACCTGTTTTATATATGGTAGTATGTTTATGTTAATCCCCAAACTCCTAATTATCTCCCTACCACACTACCCACTTTGGTAACCATAGTGTGTTTTCTGTCTGTGAGTCTATTTCTATTTTGTAAATAAGTTCGTTTCTATCATTTTTTAAGATTCTACATGTAAGTGATATCACATGGTATTTGTCTTTGTCTACTTTCCTTCACTTAATATGATTATCTCTAGATCTATGTTGCATTATTTTATTCCTTTTTATGGCTAATATTCTATTGTATAAATATATCACATCTTTATTCATTCATGTCTCCATAGACATTACATTGCTTCTATGTCTTGGCTATTGTAAATAGTGCTACAATGAACATTGGGGTGCATGTATCTTTTCAAATCATGGTTTTCTCCAGATGTATGCTTAGGAATGGGATTTCTGGAAGATAGGATAGTTCTATGATTAGTTTTTTAAGGACCTCCATACTGTTTTCCGTAGTTGCTATACCAATTTGCATTCTCACCAACAGTATAGGAAGGTTCTATTTCTTCCACATCTTTGTCAGCATTTATTGTTTGTAGATTTTTTGATGATAGCTATTCTGACCAGTGTGAGGTAATACTGCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTAATAATTGGCCACCTCATGCGAAGAGTTGACTCATTGGAAAAGACCCTGATGCTGGGAGGGATTGGGGGCAGGAGGAGAAGGGGACGACAGAGGATGAGATGGCTGGATGGCATCACCGCCTCGATGGACAGGGTTTGAGTGAACTCCGGGAGATGGTGATGGACAGGGTTTGAGTGAACTCCGGGAGATGGTGATGGACAGGAGATGGTGATGGACAGGCCTGGCGTGCTGCGATTCATGGGGTCACAAAGAGTTGGACACGACTGAGCGACTGAACTGAGCTGAATAATTGGTGATAATGAACATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTCATTTTCTTTTTTTTTTAATTAAAAAAATTTCAGGTATACACGTGCTCCCCATCCTGAACCCTCCTCCCACCCCCCTCCCCATACCATCCCCCTGGGCCATCCCAGCGCACCAGCCCCAAGCATCCAGCATCATGCACTGAACCTGGACTGGCATCTCGTTTCATACATGACATTTCACGTGTTTCAATGCCATTCTCCCAAATCTTCCCACCCTCTCCCTCTCCCACAGAGTCCATAAGACTGCTCCATACATCAGTGTCTCTTTTGCTGTCTCGTATACAGGGTTATCATTACCATCTTTCTAAATTCCATATATATGCGTTAGTATACTGTATTTATGTTTTTCCTTCTGGCTTACTTCACTCTGTATAATAGGCTCCAGTTTCATCCACCTCATTAGAACTGATTCAAATGTATTCTTTTTAATGGCTGAGTAATACTCCATTGTGTATATGTACCACAGCTTTCTTATCCATTCATCTGCTGATGGACATCTAGGTAGCTTCCATGTCCTGGCTATTATAAACAGTGCTGCGATGAACATTGGGGTACACATGTCTCTTTCCCTTCTGGTTTCCTCAGTGTGTATGCCAAGCAGTGGGATTGCTGGATCATAAGGCAGTTCTATTTCCAGTTTTTTAAGGAATCTCCACACTGTTCTCCATAGTGGCTGTACTAGTTTGCATTCCCACCAACAGTGTAAGAGGGTTCCCTTTTCTCCACACCCTCTCCAGCATTTATTATTTGTAGACTTTTGGATCGCAGCCATTCTGACTGGCGTGAAATGGTACCTCATAGTGGTTTTGATTTGCATGAACATCTTTTTATATGCTTTTTAGCCATATGTCTTCTTTGGAGAAATGTCTGTTTAGATCTTCTGCCCATTTTTTGATTAGGTTGTTTGTTTATTTGATATTGAGTCACACAAGCTCTTTATGTATTTTGGAGATTAATCTTTTGTAAGTTGCTTCATTTGCATATACTTTCTCCCATTCTGAGGGTTGTCTTTGCATTTTGTTTATGCTTCCTTTGCTGTGCAAAAGCTTTTAAGTTTAGTTAGGTCCCATTTGTTTATTTTTGTTTTTATTTTCATTACTCTAAGTGGTTGCAAAGAGTCGGACACGACTGAGCAACTGAACTGATCTCTAAGTGGTGGATTGAAAAAGATCTTGATGCAATTTATGTTAAAGAGTGTTCTGCTTATGTTTTAAGAGTTTTATAGTAAATAGCCTTACATTTAAGTCTTTACTGTATTTTGAGTTTATTTTTGTATATGGTGTGAGGCAGTGTTCTGATTTCATTCTTTTCCATGTAGCTGTCCAGTTTTCCCAGCACAACACTTATTGAAGAGACTTTTTTTTCTCCATTGTATATTCTTGGCTCCTTTCTTGTAGAATAATTGATTATAAGGATACAGGATTAACATACAGAAATCTATTGCATTTCTATACACGAACAATGAAAGAGAAAATAAACAAACAATCTCATTTACCATAGCATCAAAAAATAAAATGGCTGGGAATAAACCTGCCTAAGGAGGTAAAGACCTGTACTCAGAAAACTAAAGCACTGATGAAAGCAATTGAAGATGACGCAAACAGATGGAAAGATATACTGTGTTCATGGATTGGAAGAATTAATATTTTTAAAATGACCACATCATCCTGAGGCAATCTACAGATTCAGTGCAATCCCTATCAAAACACCAAGGGTATTTTTCATAGAACTAGAACAAATAACTTTAAAATTTGCATGGAAAGACAGAAAACCCTGAATAGTCAAAACACTTTTGAAAAAGAACAGAGTTGGAGGAATCAGTGACTTTGGTCTATACTACAAAACTGCATTAATCAAAAGAGTATAGTACTGGCACAAAACAGATACATACATCAATGAATCAGAATAGAGAGCCAGGAGTCACTTTATTTTGGACATTTTTGTTGCTATGGAAAGATTGAGATTCTTCTTTAACATGAGTCACAAAATGATGATTTTTTTGGTAAGATTTGAATAATTAAAAAATAGCCTACAAACCTCACTGTTGAATCATTTATACCAACTGATAAAATTTTTGTATCATCATTAATTTTCACAGTAACCATTTAACAGAATGACTCATAATTTATATAAATAACATGTCACAAGTACTCAAAAAACAATGAAATCCTATAAAAATTATAGATTTATTTAACTGAAAAGGAATAAATGGGTTTTCAGAGGTGGGATAATTCTTGGATGTCAGAAACTGGAGAACATCAGCATGTGGACTCAAAGCAGAAATACCAATCTTCTCAGAATTTTCCTTATGCTTTGAAGCCTAAATAGCAACAGCTTTACTGAGAAGAACCTGTCTTCCCTACTTACAGGGAAATCAAAGAATGATTGTGCATTCTTTCTAAAGAAAGCCTTTAAGTTTTTTTTCCATCAAGTATTGGGAGTGCATATTTGGGCACAGAGGGTACAAGGTACAATTCATTCATTGATCCAACAAGCGTTTACTGAGTCCTTACAAGGTGCCAGACATTTGCCATCCTCCAAATAGGATGGATTGGGCAGGACACAGGTCCTGCACTGCTGGAAGGAAGAGAGAGACTATAAACAGGAAGCACATCAGATCGTAAGACGCGCTACAGAGAGAATTAAAGTAGGGTGGTGTGGTAGAGACAGCTGACTGGTTCCTGCAGGTTGGATGACAGGAGAAGGCCCAGTGAGGAGTTGACAGATGAGAACTGAATGACGAGAAGCAGGCAGCTATGCAAAGACCTGGGAAAAGAAAAGACTTCCAGACGGAAGGAACAGCTCAGCAATGGAAAGCTAACTCTTCATTTATTTGCTGTAATAGTCATCCCACTGACAACTCCTGCTCTTCCTCAGGTCTGTAGTTGATATTCCATAGAATGAACTCCCAGGCTGGGAGTGATGTGAGCACTACGACCTGGGATGTTAGAAACAGGGCTGGGACTAGCGTCAGGCAAGCGAGACACCTGAGGCACAAAACGGAAGGAGAAACTTGGAGAGGAAGCACCTCATCATGGTTTGTGCTCTAGGCACATCACTTGCCTCATCCTAGTCACAGCCCTGGGAAGAAGGGAGAGGAAGTGAAGTTGCCAGAGATCCCAGTGCCTTGAACAGCCAGCAGGTTTGGATGTGGAGGGGGGAGATAAAATGGAAGAAATTAAAACAGCCTGGAAGGCTGAACCCCAAGAAGTGGACTCCCAGCTCCAGGACACAGACCTCATACAGCAGCCCTCTGCCTTTGAGCACCTTCCACAGCTTCTAAAGGTCACAGACTGTAGTTCCCCCAGTAAACTGGCTTGTGTTTCTCTAACTTCTTGTGTCTTTAACTTAACCAGCAGTATGAGAGAGGCAAGCATCTGTGGCAGCACGTACCAGCTCAGGGTTAGCTGCTAAGACCCGAAGGATCCTACACCAGTTACCTAGGACGTGTTCATGGCAGAGGGACTCTGCTGCTACACCTTTTACACACAGGCGTAGAGAAAAGGTGCCTGTGCTGGGAAGTTCCCAGAAGGGTAGTGGTCTGAGGATGAGTTCTTCCCAGCACCCTGAGAAGTCAGTTTAAGGATAATCTGAAAGACAGTGGCAGTCATCTGAACTTGATGACTGGAAGTGGATTTTAAGGGTCCGTGTTGCAGTAGTGTGTGCTGGAATCAAAATGTCACAACTACTCTATTTTTGTAAGCCAAATTGTAAAGCATTATTACATCACTACCCTAAGGTTTCTCTTCTGTTTGTTGACTCTAATAAAAATGTGCTTTCTTTTTTCTTTTTAA
Seq C2 exon
TAGAATATGGATTGTGTTCAGTTCCATTTGAAAATAAGCTCTATCTAGTTGGTGGACAAACTACAATCGCAGAATGCTATGACCCTGAACAGAATGAATGGAGAGAGATCGCTCCCATGATGGAAAGGAGGATGGAGTGTGGTGCCGTCATCATGAATGGATGCATTTATGTCACTGGGGGCTATTCCTACTCGAAGGGGACGTATCTTCAGAGCATTGAGAAATACGATCCAGATCTTAATAAGTGGGAAATTGTGGGTAATCTTCCAAGTGCCATGAGGTCCCATGGGTGTGTTTGTGTGTATAACGTCTGA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSBTAG00000001093:ENSBTAT00000001447:2
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0134420=Kelch_1=WD(100=90.4)
A:
NA
C2:
PF0134420=Kelch_1=WD(100=37.1),PF0134420=Kelch_1=WD(100=45.7)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Rat
(rn6)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]