BtaINT0097766 @ bosTau6
Intron Retention
Gene
ENSBTAG00000018237 | MYO16
Description
myosin XVI [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:29822]
Coordinates
chr12:88294693-88313548:+
Coord C1 exon
chr12:88294693-88294778
Coord A exon
chr12:88294779-88313338
Coord C2 exon
chr12:88313339-88313548
Length
18560 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAAGG
5' ss Score
11.08
3' ss Seq
TTCCTGCGTTCCTCCCCCAGGTT
3' ss Score
12.2
Exon sequences
Seq C1 exon
GATTACCTGAAGAGGACGGATTCTCCAGGCTGTCTGGGGGTGGGGCCTCCTCCTTTCAGAGACACAGAGAGAGTCACACCACTCAG
Seq A exon
GTAAGGACCCCTCGATGTTCTGATGCTCACCTTTGCTGTGATAACTGGAGCTAAAAGACAAGAAGAGTTTCGTGAAGGTGTGACCAAGAGCGTTTGTTCCCGCTGGACTAGGAACACAGTTTTTTCCAACTCTGCCTTAAGTTTCTTCTCAACATTCTCGCTCCTTTTGTATTGGCTGACTCCTATTTATTTTCTGCTCCTTTGCTGGTAGCTCGGGCAGTAAAGAATCCGGCTGCGGTGTGGGAGACCCAGGTTCGATACCTGGGTCGGGAAGATCCAGTATTCTTGTCTGGAAAATCCCGTGGACAGAGGAGCCTGGGGGGTTACAGTCCATAGGGTCGCAAAGAGTTGGACATGACTGAGTGAATAACATTTAAAAGAAGAATGTCCAAAACGCATAAAACTTAACAAATGGTCTTAAATGAAGCATTATAGACATACTTTATCTGTGGCATTATAGAGTCACCGTCAGGTGACGAGAACATTGCAGTCACTGAAGGTCTTCATATTTCCTGCATTTGACCTCAGCTGAAGTAAGAAGGCTTTAAGTGACATCTTGGACATAAAATGCTTGAGGCCCATGTAGTTTTATGGCCATTATCTCTCAGTTAGCACCTCAAATCCCACATAATCCAAATGCATCTACAAACTATCCCATCATCAGAACACTGCAGAATCAAAATGAGTTTACAGCTCACAAAACTGTTTTGCTATGCTTCAGTGATTTCACATGTATTCATAATGTGTTTGGCCTCAAAAAGTTTGCCAAAAGAAAGAGGATTATCACTTAAAAATAAACTCTAGCATTTGTAGAAAGAAAAAGGATTTATATCAATAGTTTAGTGTGCTTTTTATGTTCAGTTTTAAAATAAAGTCTTTAAAAAATATGACTTTGCTTTGAAGGTGGTACACAACCAAAAATGTATTACAGATTTTACTGTTGATATATTAAAGATCATTGCTTTAGCAACAAGATTATCTTGTATGAAGTTGCATTACAACTTTTGCTATGTCAGATATCTACACTAAAATTATCTAAAGTCAAGTATCTAGATGTTTCCATGAAACCAGCTAGCCAGCTAAGGATCCAGTTTCCATCAGAATATTTGACATTATATAGGCACAGTTATATTATCAACTGAGATTTTTCTAAATAACACTGATGAGGTAGTGAGAAAAATCAATAATTTTAATCTTAAAGATAAATCTTACAGTAGGCAATATACTGAAATCACTTACGCTGATATATAGACATTGAAATAGAAAAAAAATGCTGATTGCTTGCAATAATAGATTGTGCTGATCTCCCCTCTGTTCCTCAGAGATGCACTTATTTTACCTTGTAAACATCACAGATGCTTTATCTACGGTAAGTCACGGGGGACCTGCTTGCAAAGAACAGAACATCGGCTTGATTTTTGTCAAAGGGTTGACTCCTATGTGCTGGAGCACAGCAATAGAGACGCCCTTCCCAGGGCTTCCACTGTGCTGTGGGTCACAGAGAAGAGGGTTCATCTGGAAAGAAGGTGCATTAACAGAGGCATCTTGGCAATTTCCCTCTGGTCTTCCATTGATTTGGTTGTCAAGAGAGATGGGAGAGGTCACCAGGACTAATTTTCTGTTTTGTCTTTTTTTTTTTAAGAGTTTTTTTGATGTGGGCCATTTTTAAAATCTTTATGGAATTTGTTACAATACTACTTTTGTTTTATGTGTGTGTTTTCTTTTGGCCACAAAGCATGTAGGATTTAGCTCCCTAACCAAGGACTGAAGCTGCACCCGCTGCATTGGAAGGCAGCGTCTTACCCACTGGACCCCAAGGAAGTCCTGGGAATACTTTTCCATTCCCAGCTTTCACTGAGAGCTTATTTTCAAAGGCAGGCAACCCCCAGTTATCTCATAGTACTTTTTTTTTTTTAAGGAAATGGAAAACCAAGCTCATTTTCTTGCATGCCTGGTGCAGGCTTTCTCTTGGCAAGACATGTGGGTCAGTGCTAGATGCCCAGCACGGTTAGGCGGAGCTCTGCCTTGAATGACCACACATATCTCAGCACAAATGCCTCTTGGGTGACGTTTATAGAGGAAATATAAACACGTCAGGCATCTTGCATTCTAGATTTTCTAGTAAAGCAATTAAGTAAGAATTCTATAAAATCTGCCTTGAACCGACTGGGCATGCCACAATAAAATTAAATGCTGACTAAAAATTGAATTCCTCTTTGAGGATGTCTGTATTTTAATTAACATCATCAGTGATTTTAATGAAATCCCTTTAAGGAAGATAAAATGTCTGGACATTATTGCAGATAAAGAAATCAAGAAATAGATTTAGTAGCTTGCCAGAGATCATAGGGAAAATGCAGAGTCCAGGGTTTGAATGGACGTCAAGATCCTCTGTGTTGTTTCTGAGAAGAAACTTGCCATAACTCACTAAAAGTGATGGGGGTGGCATCTGGCTTTTACGTAAATTTGGAAGGCAAAGTCTTCCGAAAGACTTGGGTCAAGATCAAACCGAAAGTGGTTTGGATCAAGGTAAAAGTCTTAACTGGCTGTAGTGGCCATCTGTGGCTGTGTTTTCAGCTGCTCACTGACCACAGTGACAATTTAAGGAGAGAGGTTTCACCTTCCTCCCCTCCTTGGAGAGCTGGACAGATCCTTGTGACACGCACTCAGTCTGTCCACTGCGGATTATGAGTTACCAGACATACAACGGAAGGGTCGAGGATAGATGTCACCCCTGGGGGGCCACCTGGGGGTGGTGGCTCCCTCCAGGGGCCATAGCCGTTAGCCCGTGTCTGTGACCACAAGCCACTGCGGTCGCCTTGGGTCCCGCCCGCCAAAACTGCCCTTCTTAAATTCATGCCCAGTTACTTTGCTTTCCAGTAACACTTCTGCCTGTGAGAGTTAGTTTCTGTTGCTTACAAAGAAGAATTTTGACTGGCACACAAATTTGATTTTATTCTCCTTATCTATAAAATTTACTTTAGAGCCACAAGTTTCTTTTTTAATTTTATTTTTCTATTCTCTATTTTGTTTAAATTGAAGTATAGTTGATTTCCAATGCTGTGCTAATTTCTGCTGTGCAGAAAAGTGATTCAGTTATACACATACATACTTTTTGAAATTTTCTTTTCCATTATGGTTTATCCCAGGAGCTGGGATAGGGTCCCTGTACTAGCCAGTAGGAATTTGTTTTTTATCCATTCTTTATATGAGGGTTTTCATCTACTAACCCCACACTCCTAGTCCATCTCTTTCCTTCCCTCACAGTGATATGCCATGGTTTACAATCTGTAATTTTCATTCCATTTATCGTATTTCTTGCCAAGGCTTCTGTTATATCCTTTAGCTTTTATAAAGAGCACTAAAAGTTGTTCTTACTATCTGATGTATTCAGATATTCACTGTAAGAAATTGTAGATGGTTTCTGATAGAATAGTGGCCATCCAGTGCCTGAGAGCTTAATAAATATCTACTGCCTCTCGACACAGCCTCCAATGAAAGCCCGAACAGAATCAATATGCAATTGATCCACATCAAGAAACAAATTGTTATGTGGTTTGTTTTACTGAACCATCAAAGGAACCTTTTTGTAATGTCACATATCAAAGAAATGAAGAGCTGCAGACCACTCAATAAACCCAATGCCTTCTTTCTTTATCCATTTTATTTGTCACACGGACTGCTTGAAATGTATTGTGGCAGGGAAAAGAATCAGTGTGGTAGATAAAACAGTAAAATGTAGACACCTTTCGTTTTAATTGTTAAGGCGTGATTCTAAAACACATGCTGGGAATTAGAAATTAGACAACCATTTCAAATGGAATCATATGTATCTCACTGATAAGCTACTAACCAAGGGAGACCTAACATAGAGCATGCTTCCACACAGCTGAGGTTTCAGGAAATCTGTATGCACACCTCATGACTTCCAGATTATGTGCAAGAAATGAAGGCAGTAAATTAATTGGATGGTAGAAGTTTAAACGGCAGCACTTTCAACAGAAGGAACATGTCCTGTAGAGATATATAGAAACTTGGAAAATAACGAAAATAAATTCCATATTTTACATGTTTCCTTCATAGAATTGTACCATATGTGTAACCTAGATGTTTCGAATGCATGATGTTTTTATCCGGTGAAGACATTGACTGTCATCAAAGAGGAAAATTCAGTTTTAAGAAGTATGAAAAGGATGAGAGAGCAGAATTGTGACTGTGCTTTTGGACATTTTACAATGTACAGAATTGTACATTGTACAGCGGGAGTTGGTGATGGACAGGGAGGCCTGGCCCACTGCAGTCCATGGGGTCGCAAAGAGTCAGACACGACTGAGCGACTGAACCAAACTGAACTATTGAAGGACACTTGGTGACTGTGTTTTTAAAAGGAGAAAGATCTCATGATGTCTCTGCAGGTCACCTTTCTCCTTTTTAAACACTTGGTCACGGGACTTCCCTGGTGGTCAAGGGGTCTAGACTCTTCTTTCACTGCAGGGGGGTACGGGTGCGATCCCTCGTCAGGGAACTAAGATCCCACGTGTGGCATGGCCAAAGATTATAAAAACATAGTCATGATTCTGATTTCTCATTCCTTCAATATTTTTTTTTTTTTAAAGAAAGAAGCCAGGATAAGCAGGGCTGGGAGTGACAAGAGTGGTGTGGAGGAAGGTTGGGTTGGGTTGCAATTTTAAATCAGATGACAAAACAAAAACCTTGCTGAGCAGAGATAAAGTAGAAAGTCAGAGTGTCAGCCAGGCTGGGGTCAGGGGAGCCCTTCAGGTGGGAAGGAGCAGAGACCCTGCGTACAACCAGCCTGGACCTTGAGATGGTCAGCGAGGCTGCAAGGGAATAAATCTACATATTACTCCATGTTTTAATGAAGAGCAATAGAAATTACCATGAGTTACATGTTAGTGCTAGAAAAGGGGAGCTGTTAAGTTACATACTCTAGCAAGAGGCTAAATGTAAAATACCAGTTATGATCGTATTGCATTGTCTTTCTTTAAAACAATTAACCAGCTTTGGAAACCTTGGTCTGCTCAGAAAATAAGTAAAGGGCAAGTATTTTCATTTTCTGTAAGTGGGAGATACAAGACAAATAATTCCACTCCTCCCAAAATAACAGAGAATTGGAATATTGACCCCTGGGAACCTGGGCCCCAGATGTTCTGACTTGTTAATTGTTCAGTCAGTTCAGTTCAGTCGCTCAGTTGTGTCCGACATTTGCAACCCCATGGACTGCAGCGTGCCAGGCTTCCCTGTCCATCACCAACTCCCAGAGCTTGCTCAAACTCATGTCCATCGAGTCAGGGATGCAATCCCACCATCTCATCCTCTGTCACCCCCTTCTCCTCCTGCCTTCAATCTTTCCCAGCATCACGGTCTTTCCAAGGAGTCAGTTCTTCACATCAGGTGGCCAAAGTATTGGAGTTTCAGCTTCAGCATCAGTCCTTCCAATGAATATTCAGGACTGATCTCCTTTAGGATGGACTGGCTGGACCTCCTTGCAGTCCAAGGGACTCTCAGGAGTCTTCAACACCACAGTTCAAAAGCATCAATTCTTCGGCACTCAGCTTTCTTTATAGTCCAACTCTCATCCATACATGACCACTGGAAAAACCATAGCCTTGACTAGACGGACCTTTGTTGGCAAAGTAATGTCTCTGCTTTTTAATATGCTGTCTAGCTTGGTCATAGCTTTTCTTCCAAGGAGCACACATCTTTTAATTTCATGGCCGCAATTACCATATGCAGTGATTTTGGAGCCCCCCGAAATAAAGTCTCTCACTATTTCCATTGTTTCCCCATCTATTTGCCATGAAGTAATGGGACCAGATGCCATGATCTTACATTGCCATGATCAACATTTTCTGAATGTTGAGCTTTAAGCCAACTTTTTCACTCTCCTCCCTCACTTTGATCAAGAGGCTCTTTAGTTTTTATTTGCTTTCTGCCATAGGGTGGTGTCTTCTGCGTATCTGAGGTTATCAATGCTTTGTATATTAATGGGATCTGACAACTTTGAAAGAAAAATTTAGGCTAAAGGAACAGAAAGTTTTCCATGGTGCTAAAACGTAATCAGCCCACATCAGTGAAGGAATTTATTTTATGACCTTAGAAGACCTCCAGGGCCTGATTCTTTGCTGATCTCTTTGATTACACTATTATTTGAAACTGTCATTTCGTATTTCTGACTCTGCTAGAAATAGGTTCTAAAACAGATGAACTATGATATTGGGAAGAAGTTTCATGAAGTCAATGATATAAAAAGCCTAAATTTTGAAGCCCTAGTGGATTTAAATTAATTTTATACACTTGCAGGTGATTTTTATTATCTATTTTGGGAAGGAAGTCTCAATTAAAGAGATTTGCTCTCTTATGTTGCCAACTTTGGCAAAATCTTGTCTCTTTTTCTTCCTACTGCTTCCTGACATCTGGTTTCCTTTCCCTATTTTCTCTAGCGTCTGTACCCAGTGGTTTGCCATGATTATATCTTAAAGACGCTGTCACTCACCCCAGACATCGCACCCTGGCAGACCTAATGCCCACCTAATCCATTTCTTTTGAGGCACCTGGCTAGACTACATTTCCCAGCATCCTTGTGGTTGGGAACAGTCATGTGACTGAGTTCTAGCCAATGGAAAGGGAGCCACAGTGATATGCACTCTGTCCAGGCATGACTCCTACAAACCTCCCTTCAGCTATGAGTGTTCCATTTCCTTTCCCATCCAAAAGCTGGCTGCACAATATTCCAAGACCCTGGAAGATGCAAAGTACAGTCACAACAATGTAGAAGGTCATTTACTGAGCAGAAATACCCATTTTAGCCTTAACATGAGCAATATACTTCTTTGGGGTCATCCATTGGTATTTGTGGTTTGCCAGTTACAGATAGCAGCTTGAGTAAAAGACATTGATACCTTTTTTTAAAAAATTATTATTTTTTCAATTGAAGGATAATTGCTTTACAGAATTTTGTTGTTTTCTGTCAAACATCAGATAGATACCTTTTATCATTTATTTGGCCTAATGTTTTACATGTTGCTACTGAGAATTATTTATGGTGCTTAATTAAGTTTCGGAGAAGGCAATGGCACCCCACTCCAGTACTCTTGCCTGGAAACTCCCATGGACAGAGGAGCCTGGTAGGCTGCAGTCCATGGGGTCCCTAAGAGTCGGACACAACTGAGCGACTTCACTTCCACTTTTCACTTTCATGCATTGGAGAAGGAAATGGCAACCCACTCCAGTGTTCTTGCCTGGAGAATCCCAGGGATGGGGGAGCCTGGTAGGCTGCCGTCTATGGGGTTGCACAGAGTCAGACACGACTGAAGTGACTTAGCATTAATTAAGTTTAACCTAATTCAGTTCAGTTCAGTCACTCAGTCGTGTCCGATTCTTTGCGACCCCATGGACTGCAGCACGCCAGGCCTCCCTGTCCATCACCAACTCCCGGAGTTTACTCAAACTCATATGCATCGAGTCGGTGATGCCATCCAGCCATCTCATCCTCTGTCGTCCCCTTCTCCTCTTGCTGCCAATCCCTCCCAGCATCAGAGTCTTTTCCAATGAGTCAACTCTTTGCATGAAGCAGCCAAAGTATTGGCGTTTCAGCTTTAACATCAGTCCTTCCAAAGTACACCCAGGACTGATCTCCTTTAGAATGGACTGGTTGGATCTCCTTGCAGTCCAAAGGACTCTCAAGCGTCTTTTCCAACAGCACAGTTCAAAAGCATCAATTCTTTGGCATTCAGCTTTCTTCACAGTCCAACTCTCACATCCATACATGACCACTGGAAAAACCATAGCCTTGACTAGACAGACCTAACCTAATTAAGCACTATAAATAATTAGTTTAACCTAATCTTTATAAGGTTAAATATTATAAAGTTAAATAATAAGTTTAACCTCCATTATTTAGCAATCTTTATTATTTAAGATAGTAAAAAAAATGCCTGTTGATATCTTCTGATAATAGAATTGCTGGGATGTTACTTATCAGACATTTTAATACAAAATAATAATCATTAGTGCCCCCACCAAGTCATACATATGTAAAACAGAAGCTTGCAGTTCTTAACAACTGGTCACTTAGAAATCCCTCAAAATCAATAGACTTGATTTTAATCAGGGACAAAATCAGCCCCTGTAATACACTGGGTGCCCTGGAGAAACGGTCTAATGTTTTCGGGACCTGTTTGTGCATTTCATGATTAGAAAGGATTGCCTGTCTTCTCTCTCATTCTCACGTGGGCGGCTCTGGTGGGCAGCTAGACTTGGGAGGGAGACTCGAGGTTGAGGACAGAGATCATTCCCCCATGCACTAAGTTCACAGTCCATGGAGTTGCTAAACTGTACCCTTTGGCTAATTATAGTTGATTTAAAAAATCTATTGGAATTGGGCTAAAGGTTTTATTAGCATTCAGTTTCATGAAGTGGTTTTTCTCACTCTTATTTAATAATGTTTAATATTATGACACACAGATTGTAATTGTTTGCAGAAAAAATATTTTCAGAAATGAATAACTTGTCAGGTGAGCTGTGCCCTACGAACTGTTGCAAGTGGGGGTGCTGGCTGTTTGGACAGTGGGGGTGAGCGTCCTTGGACGTGAACCTCGTCGTCTGGAGGCTGTGGAGTACTTAGCTGCCGTGGTTGAGACCCTTGCTTTGCTTACTTTCACACCGGCATCTTGCCTCCCTTCTGATTTCCCTCTCCACTGCTAGCTTGGAGCTAAGTCTCAAGCTGCATACCATATGGCAGAGTGCTTCGCTGTCTCCTGTGTTTCTGGGTCATTGTCAGTGTAGATGTGAACAAAAGGATGGACGGGGTTCCTGATTCACTTGACTCAAGTAGCCTTTCTTCTTTTAGTGTCTGACTCATCCTTTCATTCCAATACAAATCCCGCAGCCCAGTAGATATTTCTTGGCCATGCTGCCTTGAAATGAGTGGCATCTCTGCAGTCTTGCAGCCACAGTCACTGTATCTGCAATTTATTGGCCAATTAATGCTATGGTTCCTCATGTGGTTTTTGCGTTGATGTCCTGTTTACGCATGTTTGTTCATCTAACTCTCTGAGTTTTACATCTTATCACTCACTTTGAATGAAAGCCTCTTGAGGGAGCTGGTCATATTGTGTGCTTCTAAGTCCTGTAAACCCATCACAGCACTTTCTGTCTCGTAATTGTTGAAAGTATGTGCATTCATTGACTAGCAGACAGGAAAAACTTGGAAGTCAGTGTGGTTAAGAAGGTTGACTAAACTCAATGTACTTGAATTTGAATCCAGATTCTACCACTGATTGGCGAAGTGAGTTTGGGCTTTAAAGATGAATTTCAACATCTATGAAAAGAGGGCTAACAATCCTTAACCTGCTTATTTCACATGGTTATGAGATTTTTTACTAGGATAACATGTGACTCTGTGATGACCGAGAGTGGTGGGATCGGAGGTGGGAGGAAGTCTCAAGGGGAAGGGGCCATATGTACACATACAGACGGTTCACACAGTTGTATAGCAGAGACTAACACAACATTGTAAATATTCCAATTTATTTTTTTTTAATTTTTAAAAGTTAAAAAAAGAATATACAACAAGATCACAAAGTTGATGTTTGGAATGGGCTTTTGAGAACTGCAGAGCTTTCTGTATTTGGGTGTACAGACTGGGGCTGTTACAGAGAAGATACGTCGGGTTACAGAGCATGTTCTGTAATCGGACGGGCGCCTCTCATTAGACTGGCACAGAGTCTGTGTGAAGATGAGCGATGATGAAGCTGCAGTGATTAGTGTGGTCAGGAGATACAGGGCTCTCTGTGACACGCTAAGGCAGGTGCACTTGGCTGTTTAGTGCACCTACTAAAGTAGGTGCTAGGGAAAGGCAGTGGCTTGGAAGATTTTTGAACAAGCCAAGTGTATAAACAGACGTCCTTTGGAGAGAAAATCCAACAGATTGTTTGTCCTTAATAATGCCTCCTGGGCCCTCCAGTGAGTCTCCCATTTAATCCCAGGAAAAATATTTTTAAAGGAATTGTGGCACTCTTACTTTCTCTGCTTCCAATAACATGGATTTATGGTTTTCCATATATTCTCAGTTCTTGAACCCATTACTATATGTCATCACTGTAAATGTGCACTAAATATATGTTATTAATTTTTGCTACAATCTTAGAGCAGTTATACTGGTGCTGCCGTGTTTTTTCAGTGAATTGAGGTAAGAGACTAGAGCTCATATAAAATCCATATTCTGAAATGTCACAGATTAATTATCTCATGAGATGTATAGTCATGAATTTCTATTTCATAACTTTCCATCAGTAGGAACAAAACATGCATCTGGTCATCAGAGTCCATTTTTATTCTTAGCTATAAACTTAAAATCAGCTGCAAAATGCAAATAAATGTCTGTTTAAATTATATTAAGTGTGCTCCAATATAATATTACTACTACTACTACTAAGTCGCTTCAGTTGTGTCCGACTCTGTGTGACCCCATAGACGGCAGCCCACCAGGCTCTCCAGTCCCTGGGATTCTCCAGGCAAGAACACTGGAGTGGGTTGCCATTCCCTTCTCCATAATAGACGTTACTGCTGCTAAGTCGCTTCAGTCGTGTCCAACTCTGTGTGACCCCATAGACAGGAGCCCACCAGGCTCCCCTGTCCCTGGGATTCTCCAGGCAAGAACACTGGAGTGGGTTGCCATTCCCTTCTCCATAATAGACGTTACTGCTGCTAAGTCGCTTCAGTCGTGTCCGACTCTGTGTGACCCCATAGACAGGAGCCCACCAGGCTCCCCTGTCCCTGGGATTCTCCAGGCAAGAACACTGGAGTGGGTTGCCATTTCCTTTTCCAATGCATGAAAGTGAAAAGTGAAAGTGAAGTCCATCAGTCATGTCTGACTCCTAGTGACTCCATGGACTGCAGGCTCTTCCGTCCATGGGATTTGCCAGGGTTAGGTACTGCAGTGGGTTGCCATTGCCTTCTCCGAATATAATGTTACTTATTATAAAAGTAAAGGAGAGTGGTTAATTTTTTTAAGAGGTCAACATGCACGACTAAGGTAAAAAGTTAAAAGCCTCTGCTCCCTCACTGCCTGCTGTCCAGACACACTCTTATTTCCAATAGAATTCTTTCCTTGGAAGAGTAGTTTTCCTTTTTTAACCCTTAGGCAAAAACAGGAAACAAGATAGCAAGAATGAGCTTAATTGGATTGCTGTATAAATGACCATTTCTGAATTAAGAAGGATCAACTCTTTTTCTGCCTGAAGGAGAAATGCTGTTTCGATTTCAGATTTTTTTTTTAATTTTTTCAAAATGTATGGAGATATACACCCCTTTAATCAAAGACTTTTTAAAGGGCATTTCATTTTAAGCCATATCATTGGGGTCTATTTAGGTAAACTTTGGTTTTACAAACTGATTTTTGAATTTCATTCTGTACTGTTTTTCTCCTCCAACATCTTGTTAGCATGAGTGGAAATGGGATTTGCATTTGAAACGCTAATATTCGGTATTCAGTCAGCCAAGCCGCTTCCTTCTCTTAATTTCCATAAATGTCAGTAAATGCCTCTTTTCACCTTTGGGTGAACAGTCAATAGGAAAATCAATTCTGTGACAAATGAACAGCAACATGATTTTACATATGAATTATTTAACAAAGATTATTTTTATCCTAGAAGGGGAAGACTTAAGGTAAAAATCAGCAGCAAATTATTAATTTACATTTATTAGTATTATTCATAAAAATGCATAGCCACAGGAAGTGAAGAAAATTTGAATCTCATTTTGTAATTAGTTCATGTCACAGGACTCTGTTAATGACACAATAGAAAACCATTAGAAATTAGTAAGTAGATATATATGTAATAAACCTCATTAAGCCTTTCCATCGTGTTGTGTTTCCCTCTGAGTTGTGAGAGATTTTGTGAGTTTTTTTAACCCTTGACAGTAAGTGAACAAATTATAAATCTCCTACTTAGGGATGCAAAAACTTGCAAGAAGTCAGTCTTTATATCACTTACATTCCGTCTTCATATCTAATTGGTGTCTGCTATACAAAAATGGGCACAATAAAGGACAGAAATGGTAGGGACCTAACAGAAGCAGAAGATATTAAGAAGAGGTGGCAAGAATACACAGAAGAATTATACAAAAAGATCTTCATGACCCAGATAATCACGATGGTGTGATCACTCACCTGGAGCCAGACATCCTGGAATGTGAAGTCAAGTGGGCCTTAGAAAGCATCACTACAAACAAAGCTAGTGGAGGTGGTGGAATTCCAGTTGTGCTATTTCAAATCCTAAAAGACGATGCCGTGAAAGTGCTGCACTCAATATGCCAGCAAATTTGGAAAACTCAGCAGTGGCCACAGGACTGGAAAAGGTCAGTATTCATTCCAATCCCAAAGAAAGGCAATGCCAAAGAATGCTCAAACTACTGCACAATTGCACTCATCTCACACACTAGTAAAATAATGCTCAAAATTCTCCAAGTCAGACTTCAAAAATACGTGAACCGTGAACTTCCAGATGTTCAAGCTGGTTTTAGAAAAGGCAGAGGAACCAGAGACCAAATTGTCAACATGCACTGGATCATCGAAAAAGCAAGAGAGTTCCAGACAAACATCTATTTCTGCTTTATTTATTTACTATGCCAAAGCCTTTGACTGTGTGGATCACAATAAACTGTGGAAAATTCTGAAAGAGATGGGAATTCCAGACCACCTGACCTGCCTCTTGAGAAATCTGTAAGCAGGTCAGGAAGCAACAGTTAGAACTGGACATGGAACAACAGACTGGTTCCAAATAGGAAAAGGAGTACGTCAAGGCTACATATTGTCACCCTGCTTATTTAACTTATATGCAGAGTACATCATGTGAAACGCTGGGCTGGAAGAAGCACAAGCTGGAATCAAGATTGCTGGGAGAAATATCAATAACCTCAGATATGCAGATGACACCACCCTGATGATAGAAAGCAAAGAAGAACTAAAGAGCCTCTTAATGAAACTGAAAGTGGAGAGTGAAAAAGTTGGCTTATAGTTCAACATTCAGGAAACTAAGATCAGGGCATCTGGTCCCATCACTTCATGGGAAATAGATGGGGAAACATTAGACACAGTGGCAGACTTTATTTTTCTGGGCTCCAAAATCGCTGCAGATGGTGACTGCAGCCATGAAATTAAAAGATGCTTACTCCTTGGAAGGAAAGTTAAGACCAACATAGATAGTATATTAAAAAGCAGAGACATTACTTTGCCAACAAAGATCCATCTTGTTAAGGCTATGGTTTTTCTAGTAATCATGTATGGATGTGAGAGTTGGACTATAAAGAAAGCTGAGCACCAAAGAATTGATGCTTTTGAACTGTGGTCTTGGGGAAGACTCTTGAGAGTCCCTTGGACTCCAAGGAGATCCAACCAGTCCATCCTAAAGGAAATCAGTCTGGAATATTTATTGGAAGGACTGATATTGAAGCTGAAACTCCAGTACTTTGGCCACCTGATGTGAAGAGCTGACTCCTTGGAAAAGACCATGATGCTGGGAAAGATTGAACGCAGGAGGAGAAGGGGACAACAGAGGATGAGATGGTTGGATGGCATCACCAACTCAATGGACATAAGTTTAAATAGGCTCCGGGAGTTGGTGATGGACAGGGAGGCCTGGCGTGCTGCAGTCCATAGGGTCATAAAGAGTCGGACATGACTGAGCCACTGAGCTAACTGAACTGATACATTCTTTGTTGCTTCGCTGATGGCTCAGCTGGTAGTGAACCTGCCTGACAATGCAGGAGACCCAAGAGACACAGGTTTGATTCCAGGGTGTAGAAGATCCGCTGCAGAAGGAAATGATAACCCGCTGCAGTGTTCTTGCTTAGAAAATTTCATGGATAGAGCAGCCTGGTGAGCTACAGTCCCTGGAGTCGCAAAGTGTCCAGCACGATTATGTGCACACATACACACAAGCATGGCCTTGTGTCTGTTGTTTGTCTTAGTCGCTCGGTCGTGTCCGACTCTTTTGTGACCCCGTGGACTGTAGCCCACCAGGCTCCTCTGTCCATGGGATTTCCCAAGCAAGAGTACTGAAGAGGGTTGCCATTTCCTTCTCCAGGGGATCTTCCTGACCCAGGGATCAAACCCTTGTCTCCTGCGTTGGCAGGCAGATTCTTTACCACCGAGCCACCAGGGAAGACATTAGAGGACACAAAACAGTTTATAATTCTGGAGTTGGGGGTGGGGGGATTGAGTCTCTATTCATGTCTTAAACTTTTAAATACCTAATAAGCAAGATTTTCTCAAAAATGGGAAGAAAACATTATTTCTAACCCCCTATACCAAACTCTCCAGGTCCTATTCACCAGTGTCTTAGTTAACACTATTTTCTTTTTTTTTTTTCTGTTGAAATTTTAGCTGGGAACTTTAGATTTGCATGCAGTTGTCAGAAAGACTGGAGAGAGCCCAGTTTCTCCCCGTGGTGTTTTTTTGGCTTTACCTGAAATGCAGTTGACTTACTACACTGTGTTAGTGTCAAGGCTAATTATTTGCTATTTGCATATGTTAGGAAAGGATCACCATGTTAAGTCTAGCAACCATCTGTTCCCCATATAAAGTTATTAGTGTCATTTTCTAAGGATTTGTTTCAGTGAAGAAATCTTCTGAAAAACCTGCTGAAATGAAAAGATTTCGTTCAAGGATGAGGATCCCAGCCCACAGGGAAATGGCTTCAGAATATGATCATTCATGTGTCAGTTTAGAGTCCTGTATGTCACAGTTATGTTATAAATCCAGAGTGTTGCTCTTATTTTGAGATCTTATGAATAAGGAAGGAGAAGACTACTTTATATTGTTTTCCTTGTTAGTCACGCAGTTCTGTCCAACTCTGCATCCCCACGGACTGTAGCCCGCCAACCTCCTCTGTCCATGGTATTCTCCAGGCAAGAACACTGGAGTGGGTTGCCGTTCCCTTCTCCAGGGCATCTTCCTAACCCAAGAGTTGTACCTGGGTCCCCTACATTGCAGGCAGATTCTTTACCGTTTGAGCTGGGCCACAAATTATTTTCGTGTAACATTATCTGACTGAGTCATGAGGATAACCATAAACCAGAAAGTTTAGGGATTTTCTCAAGTCAAGCAGTTATTAGTAGCAATGACACAGTCATAACAGCTCACATTCACAGAGCACTCATTACATTTTTAGGGCACTGGAGTAGCCCACACCTGTCCTTTTGAGGTGTGATTACTGGAATCCACTTACAGATGAGGAAGCCAACGCACTTGCTCCAGGTTACACAGTCATCAGGCAGCAGATTCAGGATTCCAGTCCAGACACCTTGGCTGCAGAGTCCTGGTTGGTCAACCATCACATCCCTGCTCATACCAGAGTCCAAATCCCCGTGGATTTGTGACTCCCTGTTAGAGAAGGACATTCAGTGTCATAAACGGTGCTTGTCTGCGTCGGCCGTGTGAAAATGCCTCCCCCAGTCTTTTCTTCCCCTGTTCTACTGATGCCCCTCTCGTTTATTCAAAATTCAGATTGAAAGTTCCCACCTCTGTGAAGTCTCTCCAGACCTTCCTTCATAGAGCCCCTTTTCCCAGGTAAATGGTAAAAACAAAGAAAGGAAAACTTAATAACAAGAATCAAACTCTTGTTGACTCCTCCGTCTCCATGCCACATGCAGCGTGTTAAGACGCTTACGTGACTGACGTGTCTAGAAGTTTCTTTAAAAACAGGGCGTTGGTCATTTTCATGCAGCCCAGGGGTGGTGCCACGTGGAACGCAGAGGTCGCTGGGTGTGGAACCGTTCTTACTTCCACAGCTACAACTCTTACCTTCCGGTTCTGGGAAAGAGAATGATTGTCTGTGCAAACACTATTCTATAAAACATGCCAGATAAGAAAATAAGTAAGGAAGTAGCTGTCTGAAGTGGTGGCGTGGGTTGGAGATATGTCTTTTACAGCAATGAGAAGATATTTAAAGGACACCAATATGCCATCCTTTATCCTCCACGTGTCAGGATCAGTGAGGCCTGGGGTGATGCCAGCTGACTCCAGGTTCCCAGAAACATCAACATCCTTAACCCCCAGGGTCACTTCTCCTCCTGGAAAGAAATGGTTTCCTTTCAACACTGAAGCCAAAATTTTACAAAGCCATTATTGGCTTTGTAATGATAATACGTGTATTATTCTGTGTCATTAATGATGTTACTTAACTTGTGGAATATCAAATAATGATAAGAGAAGTTGTAAGAGTTTTTGTTACTACCAATAGGGCATGAAATTTAAAGAATGATAAAAGTGATTTAGATGTTTTTACCGTGCTGGATAACGTTGCAGATACTTTTTATTCTTCACGTATTGCTTGGCCACCATTTAAATAACATTCATAGTTGCATGTGCTCGCTATTCTAAAATATTAAAGCTCCTTCACTGTGACACATACAGCCTTTGTGCCTCATAGCCTGATACATTTAATAAATCTAAATAAATCAGGTTAGGGATCATTAGGCACAGTGTCCCGTTCTCGCCTTCTGATCGTCTGTTTCTTGTCTCACGGGTCATCGTTTTAAAACGCCCTCTGAACTTCACTGTGTTGACAGCAGTGACCTGTCACTTGTCCTTACACGGAATTTTAACCTTCGTGTAAGATATAACCTGTGAAGATTTGTTGTGTATGTTTTTTTAAAATGAAGATCAATAATGTTAATATTTTAGTATCCCATTTATGCCATTCTGGCAACTTTCTATACCTATTAGATTTTACTCAATACCTATTAATCTCTGTGATACAGAATCAAGTTTCATGGGATCTCTCAATAAGAGGGTTTATTCTGAGCATTAGTTGATTATTGCAAACATCAGTCCGATTTTTTGCTTATCAAGGAAGCATAGAAAGCTCTTGGTGGTTGATTCAAAGATGATGTTCTTCTGTACCCACTACATTATTCAAGACATCGATATACTCGTTAAGAAAGTGCTTTCTAATGCCTTGTGTGTATAGGTTTCACCTTTTATAATGTGCTTGGGAAATCAGATATTTTTAGTAAACGTTGAGAAGCTTTGAAAGGATAGAGAGCTTTTTTTGTTTTCCGCAGTGAAGCAATGACTCAGGGGATTTAGGACATTTTTTTGTCAAAATCCCTCCCACAAGCCTCATTCAGATCAGCAGCTGCGGCAAGTCACTCCCTGCAGGTCAGGGTGTGTCTGGAGTGACTCAGTCTCCCGGTCTTCCCTGTTACGAAGGTCTCAGCCGAGGGTCACACCTTGCCCAGCTCGTCTGTATTTGTGGTCATTGTGAAAAGCTGTTGAAAAGAGTTTCGCATGGAGATGAGCTGTAGAATGGAGGTATTTTGTGCTCGATAGGAGGAGGGGTGTGTGGTCACACCAGCGTGGAAGCAAGCACAGCACACGCCAGCCGGCCGCAGAGGAGGAGCAGCACCAGCTGCTGGGTGGGGATTTGGATCCTGTTCTGCTCAACTCCGTTTCATGAGGACTTGGCCTTCATTTATATATATGTTCACCTAGATATATATTCACCTGTATGTCCATGTATGCATTCACCTATATATATAATGTTCACCTAGATATATATATAGCTTCTCCTGTATATATGTATTCATATACACACATATTTTTCTGCATATATATATCGCACCTTACTTTCTTTTAGGTTAATTGAAATTTATTATTTCATATTAATTTGTTAATTACACATTCTATCATTATTCTTTTTGTACATTCACTAGGAAATAAAGCATGAATCTTCATTTATTTCATCATCGTTGTTGTTTTTCTGACGCTTTTGCGACCCCATGGACTGTAGCCCACCAGGCTCCTCTGTCCATGGGATTCTCCGGGCAACAATACTGGAGTGGGTTGCCATGCCCTCCTCCAGGGGATCTTCCTGACCCTGGGATCAAACCCTCATTACAGGTGGATTCTTTACCACTGAGCCACCAGGGAAACCCTAATTTCATCTTAAATTGTTTTAATTTTGTCTTTTTCCTAATACTGCTAGAACCTCAGAGCCTCTGAGCTCCACGTGACCCCTCCTGACTTTTGCAGCTATTGTTGGTGTGTTGTTCTATGTACAACTTAAAGTCTGTAACATTCCCAACACATAACTTACGTTTACCCATGTATTCAATTCCAGGGTCCTCACTTCCCTCTTGAATTTCCATTTTTTTCCATCATGCCTGTTTTGTTGAGGTTCACACAACAGGCAAGACTTGTGATAGCGAAACTTCCTAGTTCTCGTTTGTCCAAAAACATTTTTTATTTCACCTTCAGTTTTGAGGGACATTTGTATTGAGTCTAGAATCCGAGGTTGAATTTTTTTCTGTACTTGAACCTGTGATGCATTGCTTTCTGGCTTCCAGGTTGCTGTTTAGAAGTCAGCTTCTCGTAGGATGCCACTTCCCAGGGCAGGAGAGCTGGGATGGTCTCGGGGGGTGCTCAAAATCTCTCCCCAGCCAGCGGAGCCCCAGCGTCTGACGCTGACCCTGCCCTCTGTCTCACTCTTGCGCTGTGTCTGATGCTCCTCTTTCTTCCTGCGTTCCTCCCCCAG
Seq C2 exon
GTTATCCACCAGCTGAGGCTGTCGGAGAATGAGAGCGTGGCCCTGCGGGAGCTCCTGGACTGGAGACGGAGACTCTGCGAGGAGCGGGGGGACTGGCCCCGGATCCTGCCCCCCGGGGAGCCCCGGGCGCCTCCCCCACCTCCGTGCAGGAAGCCCGAGGGGGCCCCCTGCCGCAGGCTGCCCCCCGAGTTCTGGGACTCCACCCTGTGA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSBTAG00000018237:ENSBTAT00000024275:50
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=1.000 A=NA C2=0.565
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Pre-implantation embryo development