BtaINT0122622 @ bosTau6
Intron Retention
Gene
ENSBTAG00000015537 | RASAL2
Description
RAS protein activator like 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9874]
Coordinates
chr16:61215816-61255058:+
Coord C1 exon
chr16:61215816-61215922
Coord A exon
chr16:61215923-61254948
Coord C2 exon
chr16:61254949-61255058
Length
39026 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CCAGTAAGT
5' ss Score
9.09
3' ss Seq
CTTCTGCCTTTTCATTCTAGGGG
3' ss Score
10.9
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Features
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A:
NA
C2:
PF0016924=PH=PU(30.5=97.3)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Pre-implantation embryo development