BtaINT0164951 @ bosTau6
Intron Retention
Gene
ENSBTAG00000005017 | ZNF169
Description
zinc finger protein 169 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:12957]
Coordinates
chr8:86956457-86974921:+
Coord C1 exon
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Coord A exon
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Coord C2 exon
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Length
16837 bp
Sequences
Splice sites
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Exon sequences
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
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Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.030 A=NA C2=0.114
Domain overlap (PFAM):
C1:
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A:
NA
C2:
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Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Chicken
(galGal4)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]