DreINT0033733 @ danRer10
Intron Retention
Gene
ENSDARG00000061688 | arvcfb
Description
armadillo repeat gene deleted in velocardiofacial syndrome b [Source:ZFIN;Acc:ZDB-GENE-060526-60]
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Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.995 A=NA C2=0.302
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
PF0051418=Arm=WD(100=24.3),PF0051418=Arm=PU(81.0=20.1)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Mouse
(mm10)
No conservation detected
Mouse
(mm9)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]