DreINT0038126 @ danRer10
Intron Retention
Gene
ENSDARG00000100129 | brd3b
Description
bromodomain containing 3b [Source:ZFIN;Acc:ZDB-GENE-030131-5316]
Coordinates
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Coord C1 exon
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Length
6401 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
TACGTAAGT
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Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq C2 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSDARG00000100129:ENSDART00000168030:10
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
Alternative protein isoforms
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.955 A=NA C2=1.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF122803=BSMAP=PD(43.5=48.5)
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]