DreINT0057151 @ danRer10
Intron Retention
Gene
ENSDARG00000078058 | dip2a
Description
DIP2 disco-interacting protein 2 homolog A [Source:ZFIN;Acc:ZDB-GENE-091204-2]
Coordinates
chr9:636788-695564:-
Coord C1 exon
chr9:695250-695564
Coord A exon
chr9:636860-695249
Coord C2 exon
chr9:636788-636859
Length
58390 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AGGGTGAGT
5' ss Score
9.25
3' ss Seq
CTCTCTCTCTCTCTTTATAGGTG
3' ss Score
14.82
Exon sequences
Seq C1 exon
AGTTTCTCTTTGTTTCTCGGAGAATCAGACGGAAATCTGCCGGCATGAGTCCGGCTTGAAGAAGGGAAGGGTGTGGTGTGGTGTGGACCCGCACCAGCGCGCGTCTCCGGCGGTCTGTATGCGCGCGCCCCGCCGCTCCGCTCCGCACATCTGCCCGCGGTGAGAGACGCGACGCCCCGAGCCGCAGCAGCAGCAGCATGGCCGAGCGCGGATCCGGAGTGCTGATGATGCTGCTGGAGCCCCCGGCCCTCGCCATGACCCTGCCGGCGGAGGTGCGCGAGAGGCTGGCGGAGCTGGAGCTGGAGCTGTCCGAGG
Seq A exon
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PF064646=DMAP_binding=FE(20.9=100),PF051207=GvpG=PD(47.6=80.0)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]