DreINT0059466 @ danRer10
Intron Retention
Gene
ENSDARG00000075818 | dok2
Description
docking protein 2 [Source:ZFIN;Acc:ZDB-GENE-080721-4]
Coordinates
chr8:42545765-42565407:-
Coord C1 exon
chr8:42565305-42565407
Coord A exon
chr8:42545941-42565304
Coord C2 exon
chr8:42545765-42545940
Length
19364 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAAGTAAGA
5' ss Score
7.61
3' ss Seq
TTCTTCTCTGTTGTCTGCAGCAA
3' ss Score
9.88
Exon sequences
Seq C1 exon
ATGAACTGGCCAGAGAAAGGTACGATGAGAGGAAACAGTTTACATAGTGAACCTGATGATGCCACGATGGCAGACAACACATTGTACTGCAGCAGAGAAACAA
Seq A exon
GTAAGAGCCTACAGCAAACACATCTTGATCTCACGAAACAACAAAAACAAAAAAACAAGCATTGTATGTACTGTCAAGACTAATTCATAATAAACTGCACAACAGGATGTGTGCCCCTAAAACCACACCACCTAACCCTGCACTTCTTTGGGGGGGTGAATGATGTAGGAACGAGACTGTGCAAATTATGAATTCAAAAAGTTACAAATTGCCATGAGATAGCATTGTCAAAAACACAAGTTACTCAGCAGAATATTCCCAGAACTGCTACAGTCACAAAGCCAGAATGTCACTGACCTGTTAAGTCCCATTACTTACACTAAAGGCAAACAAAAGATTCATTAGTGTTTTTTTCTTCAGTCATATGTACAGACAATATCCAAAATACACATTTAAGTCCATTAAGTGTTACACTTCATTGATTTTGTCAGTTAAAAACAATGGTAATACAGGTTTTTAAAGGCAGTTTTCTTCAAATTTCTCGTGTACTGAGCTGTAAATAGTAAAATGTTTTATTCATATTTGCTTTCTTAAGGTTTTAACAGAGGGTTCATTCCTATTTTATGTCTTCATACATATTTTGAGAGATTATATGCAACATTTTGTTGTACACTTTTTTTTCTCGTGGCTATTTGCTGTTCGCCTTCTTAAACGGTTAGTTCATTAAAAAAATGAAAAGCTCTCTGACACCCTCATGTCATTCCATTACCTTTGGTCTTAGAGCACAAATTAAGATATTTTAGATTCAAGAGCTCTCTGACTGCCCATGGACAGCAAGGATCCTGAGACAAGTCCAGAACTAAAACATTGTCAAGCATTCAATGTGACTTTAGTGATTAAATAGTAATCATATAAAGCTCCAAGAGCACTTTTTGTCGCCAATAAACTGAAAACAGAGGACATCAGGCCATTAGGACATACATTTACTATGGAGTCATTCTCATGGGGTATTGTGGTTAACGCTTGATGGAGGGTATGTCTAAAGCTTTACACTGATGAGATCATCAGCCAATCGCATCCAGCTTGACCGCGACACAAAAAAGCACAGTAGTAGTAGTAGTGTATAAAGATATATACTCATCTGCCACTTTATTAGGTACACCTTACTAGTATTGGTTGGACCCTTTTGCTTTCAGAACTGCCTTATTACTTTGTGGCATAAATTCAACAAGGTACTGAAAAGATTCCTCAGAGATTTTGGTCAATATTGACATGAAAGCTTTATGCAGTTTCTGCAGATTTGTTGGCTGCACATCCATGATGCGAATCTCCCGTTCCACCACATCCCAAAAGTGCTCTATTGGATTGAGTTCTGGTGACTGTGGAGGCCATTTGAGTCCAGTGAACTCATTGTCATGTTCAAGAAATCAATCTTACATGATTCGCGCTTTATGACATGGTGTGTTACCCTGCTGGAAGTAGCCATCAGAGGATGGATACACTGTGGTCATAAAGGAACGGACATGGTCAGCAACAATACTCAGGTAGGCTGTGGCGTTGACATTATGCTCAATTGGTACTACTAGGCCCAAAATGAACCAAGAGAAAATCCTTAGCACAATTACACCACCACCCGCAGCCTGAACCGTTGATACAAGGCAGGATGGATCCATGCTTTTATGGTGTCGACTCCAAATTCTGAACCTACCATCTGAATGTCACAGCAAAAACTGTGACTCATCACACCAGGCAACATTTTTCCAATCTTCTATTTCCAATTGTGGTGAGCCTGTTTAAATTGTAGCCTCAGTTTTCTGTTCCTGTACATGTCTAAATGCATTGAGTTGCTGTCATATGATTGACTAACTAGAAATTTGCTTGAACATGCAGTTGGACAGGTGTACCTAATAAAGTGGCAGGTTAGTGTACAGTATAAAGATTGATCATAAAGCACAGTGTGATTACCAGCTGTCATTATAAAAGCTTTACACAAATGTGATTGGCCAACATCTGCACTGTTATTTGCATAAAATAATTGGATTAGCAGTGATACAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAATATCCCCAATATTACCTGTAAACAGACACCCCAATTCTCCCGGCAGTTTCAGGAATCTCCCGCATATGCACAGAGACTCCCAAATGTCCGTAAAAAAAAATTATAATCTCCCGGAAATTGACCCCAACCCCCCATCCCCACTCTACCAAATGTTCTGATTTTTGTGCTAGAAATGTCTGCACATTATTGAATTAAACAACCATATACATATTTAAACATAACACATGTAATACAACAATGCAGTTCTTAATGCAATCAGTCAACTGAAGGGATAGTGATAAATATCTGTAAATTTCCACCATTAATATTCACCTTAAAAGGTAACCCAGCTCATCTGAGAAAGTGGAGGCAGAAAAAAATGCTGATTACTGTATGTACACTGCCATGATCGCTTGGTGTTTACACTGAAAAAATGATTCATTTTATGAACTTTTTTTATTTAAGGTAAGTGGTTGCAAACTAAATATATGGGCTGCATTTAAACAAACAAATAAAATTCAGTAATGTTCCACTTATTATTATTATTTTGTCTAAATTCAGCCCATATAAATTGCTTACAACCCCTTAATAACATCCAATGAACTACTCTTTTCAGTGTAGTTCATTTTGTGTTGAGAGTATTGCAAAGCAAAACAGTCAACTTCTTCATTCCTCTATTACGTAGTGGAAAGTCGTGGCTCGTTTTAGTTCACTTGTGGTGGAAAAAAACATCACACAAGTGTCCGCCTTGTTTGCAGATTGACCACCTAAGTGTGTAAATGCGCAATATCCTGCTGTTCTCAGAGATGCTTCAGTACCCTCTTTGACTTCCTTTCTATCAATTGTCTATTTTTAACTCTTCATTAATGATGGGTAAGTGTTGTTGTTTTATAATTGATGTGGTGCACTTGGTCTTTGTAAATTGGGAATTTAGAATCACATTTTATTTGATGGTGTCATAGTTGCAGTGTTATTGTCTGTTTAAATGTAGAGGAATATAATTATACAATATGCTTAATGTAGTAGATGAGTATAGTTGACAAGTTTATTTTTATATCACTTTTAACAATGCAGGTTATATCAAAGCAGCATAACATAGATTAAAAAGCCAAGAGATTGAAAAGCCAGAACAAGATTTCAACACTACTGGGGTTATTACATATATTTTGGATAGTTTACTGGTATTGTAAGTATACTGTATACTTACAACATGTACAAAGGACAGTAGAAAAGAAAGTGTTACGTGAAAAGTTTGTGTTGTGAAATTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATATATATTCACGTTATTTTTTATTATTACTATTTTTATTTATTAATGTTTTTTTTTTTATAATATAACCTCTTTTCTCACAAAACCGGCAATGTTTGATCAAACATACATTAGAAATATACATTATAAATTTTTAAAATAAAAATAAATGTCTATTTTATATTTTATCATTTACATTTTAATGTTTAAATAGGACAAAACACCTCAGATTGCGTAAATTTGCTTGAGTGCACGATGAATCAATCAAACACTCTGTTCAAACACATTCTATCACACACACTATTTTCTATAGTCTTGCTTCGTGTTTCTTCTTTCATCTATTCAGTTGTATTGAGTAAATGGAAAAAGAGGCCAACAGACCATGAAACAAATGCAGAACCACATAACCAAAAACACTTCCTCAAAGATGAAAAATGCAGATAAAAGTCCTCAGTGGACACATTTCACTTTGTGTCTCTTAGCAAGATGACAGGAGGAGGAAGTATGAAAAAACACACATCGGTGATGCAGCACAGGTGCCAGACAATCTGACAACACAGGCCATTTAAAGGGCTAGTTAATCTAAATATGAATATCCTGTGTTAATTTACTCATCCTTCACTTGTTCCAAACCTGCTTGAGTTTCTGCTAACACTTTATTTTGATGTCTACTTGAGTATTAGTAGACATTAGAGTATTAGTGGTTAATATCTGTGATACCTTCAACAGACATTTATTTTGATTATAAGAAACTTTGCAAGTACATGTCACCTTACATTAACCCCAACCCCAACAGTCTACTTATAATCTAATAAGAATTAGTTGACATGTAGATACTTAGGGTGCTTTCACACCTAGACTTTTGTTTCGGAAGCTGTCTCGTTTGCCCAGTTAGAGCGATTCGTTTGGCATATGTGAATCCCCCAGTCGTGCTCAGATCTGCGCCAAAACAATCGCTCCGAAATCGTTTAAATGAGGTGGTCTCGGCTCAGTTGAAAAGAACTCTGGAGCGGATCGATTGTAGTGAGAAAGCGATATGATCCGAGCCTGGTTATATCACAGTGTTTTATGGGTGTATAATAGGCATACAGCTATATAAAGTAGGGCGGGAGGTCTTTCAACAGACATCCCAAGTCTCCTGGAAGTTTCGGGAGTCTCCTGCAAATGCACAGATTTTCCCCCGGAAATCGCGCGTCTTCCTCCTGGTCCTCAAATACACCGCGCACCCTTCTAGCCCCTCCCCACCGCATCCCTTCTCGCTCTTCAGACACATCCCATGCACCCTGTCAATCACCACCAAACCACCACCCCCCCTGACAGCTGAGCAGGACTCTGCAAAATAAACCGTGAAACTCTGACCAATGTGAGGAGAGTTTACTCACACGTGACTTGTTTTTAGCTCTTTTGGTCCGTTTAGAAACTTTGCCATGTGAAAGCTAACCGCACCAAGAAAAAAGAGCAACATTGTAACAATTTTAATCCCTGTTTAGGAATAACTGAATTGATTCACAGGTTTGAAAGCACCCTTAATTTCTTTCTTCCTCTGAATACCAAAGAAGATATTTTGAAAGGTATTGTAAAGCAGTAGCTATTAACTGTCACTGCATTTGTTTTCCACTAGAAAAAGTCAATGTCTGTTGGTCTGCAACATTCTTCTGAATATCTTGTTTTGAGTTAAAAAGAAGAGAAAAAAAAAGAATTAATGGAGATGAATTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTGGTGAACTACACCTTTAAATGCAACCTTGATTGATCGTTGGTGAAATTAATAATTAATTAATTGATTATTGTTTCAATAATTAGTAATTGATTAAATGATTTAATCATGTTAGACGTCTACTTCATTTACTGCATAACAGTTTGGCGTGCACCTTAATGTCAAAACAACATTAAAAAAAAATAATTTCAAAATGCAAATAAATTGTATGCCCTTTTGACCACTAAAAGTATTACAATATAAGAAAAAATTTAGTAATCAAAAAGCTTCTTTCCAAATTATAAATTTACAGTGGATTTTGCATCTCTACAATGCATATAAACTACATTAAAGAGCCCCTACTATGCATTATAAAAGGTCATATTTTGGTTTTGTGGGTCTCCAACAACAGTTCATGCAGGGTCAAAAAAGCTATTTCATTCTCTTATAATATGCATTTGTTTTACCTAATTATCCCAATGACTCCTATTTGATTTGTTCAGTGATTCATTTGTTCCCAAACCCCTCCTTAGCGTGAAGCTAATCTGCACTTCTTGGTCCGATGGCCCAGTCTATTGTCATTGGTCGACTGCTTTCAGTGTGAGACAGAAAAAAAAATGTTGTTAGACAGAGAGAATAATGTTTAACACCAGCATATTGCTCTATTTTAGTCACGACACACATTCAGTTTTAATCCACACAGTGGCAAAAGCTGAACTACTTTGAAGCTTGACTGCTGCACATGTGTGAACAGGAACAGGTACAGGAAACGCTGACGGTGGCCATAGCAATGACAAACAGTAGTGAATTGCGAGCTCACAAGCACATTTAAATCGGTAAACAAAGCTGCATAACGCCATTTCAACATTGTTTTAGACGCAATATATGAGTATAACGAGTTAACCAGATGCAGTACAAGCTGCGTAGAGCAGTGCAAGCTAGAAAAAACAAGGAGGCAACCATTTTTTTTCCCCATACATCGATAGTCTTTTCTGATCCTTCCTTTAACAAATGGCCAACAAATCCCCCGTTGTAAGCATGTAGATTGCTGAAGCACTTGTCAGGAAAATGATGGAAACACAGCACAAGGCTGGGGCTATAATGCTGAGGTATTTTTGCAAAAATAAACTTCAACCACTGACTCTGCACAGCCTCATCTTCGGGTAGGGAAAGTAACATTAACTTTCCCTCACACTTTAGAGCACAGCGTCTTCGCGACTTCAACCAGAAAATTCAACTGGGATCTGCTTCAGTGCTTGTCTTCCTCTTTTTTCTTTCTAAAGTGTTTGTGGGTGGGGCTGAGGGTTTAAATTTTCCTGGGTTTGCGTGCGCAACAGATGGGCGGGGCTTGAGTTCTATATCAATATCACGCCTATAGGGCTAAAGATTTGTCCACGATTCATTTCAACCACTATGAGTCGACTCTTTTATATATGAATCAGTAGTTTTAAACACAGTGCACTTTCAAATTTAAGCCTTAGCTGGATATTTCACTTCACTTAGAGCTGTATTACACTGCATGGAAGGTCATTTTCAAAAACCCATAATATGGGCTCTTTAATGTCAAAATGACATCAAATTGATACCTAATAACAAAATTTGTTGCCGTATCATGATGACAACAGATGTAATGTTTTCACACAGGGATGTTACCAAGCTGGGGCTAATTTTCAAGCATTGGATAATATAATTGCACCGGCTGTAGCCATGGTACAGCAGCAAAACTCCTTGATCATTAACACACAATGTAATTGCAGAAGAGTAAAGCTTTAAATCTGAAAATTATCTAAACACCTTTGTTGAATTCTTTTGAGGGGGATGCTAATGGTCTAATCTGATTCAATGATTTATGTTAAGCAAACAAAAGTTCTTTAGCCAAACCCAGAGAATGGATTCCAAAATTTATAAAGAATTGTAAAATGAGCCTATTTGCAAATAAATAAATAAATAAAAAAGGTGTCACGATGGTGAAGTGGGTAGCACAATCACCTCACAGCAAGAAGGTCGCTGGTTCGAGCTCGGCCGGGTCAGTGGGCATTTCTGTGTGGAGTTTGTATGTTCTCCCTGTGCTGGCAAGGGTTTCCGGGTGCTCCGGTTTTCCCCCACACTCCAAAGACATGCGGTATAGGTGAAAGGGGTAAGCTAAATTGGCCATAGTGTATGTGTGTGAATGAGAGTGTATGAGTGTTTCCCAGTGTTGGGGTGTAGCTGGAAAGGCATCCGCTGTCATATTAATAAAAAGTCTCATTTCCATGAGATGCTGGGGATATGTCAACACAACAGAACATCCGATGGTAAACTTGCATTCAGAAATAGCACATAAAATCTCATTACAGTAACTGCCTTAATCCACTATGCAAAAAGTTGGACCATATGTCTGAGCTACTGCTTTCTTTTCTCTGTGGAATGTGCTGAGCTTGTGTGAATTTCAGATTCCGACAATTGATCAAATCCATCTGTTTCAGTTTTAATATCAGAAGGCCTTGTTCTGTCGAGCGACAGCAGGGAAACAGGAAGCATGAGGAATTAAATGATCTGAAGGGAACTGTAAAACTACAGCTTTATTTACATTATATGCAAATATTCAAGGCAGGATTTTAACTACAACACAAAAAAACATCAATGAATCAATGAAAAATACCCACTGGTGGAATTAGTGATACCCAAGAAAAAAAAAAATGTTAAAACCACAACAAAAAGAAGCAGAACATGTAGTCACTGAAACCACATGGTGGGTAAATAAATCATTAGTGCTGGCTCACAGTCAAAGTTGGATTGGTGTATGAAATATATACTGCAGATTGTATATATCTCAGATATAATGGCAGCTGTGGACCACTTTGATATTTTGAATAAATTAAGCATACCATTATTTTTTCAATGCAATATTACAACATTTAGAATTTTCCTCCAATAAAAATATTATCATTACCATATCCAATACAGCAAACTCCTGTATACAGACCCTGCATCATAGTGTTGGTAATGTTGTATTGTTTGAAAGTATGGCCACAGAATAATTTAGTAGCACTTCATAATAACACCATATTAATAATTAGTTAAGCATTAGGAATTAGTTAATTTATTATCTGTTAAGCATTACCTCCACATTAACAGATGTTAGTAAGCAGTTGTAGATACAAATGCTCCATTCTTGACTTCTAAGCACATATATAATGTGCTTACTGACTGTATTTTCAATGATTGTCTTTTCGGCTCAGTCCCTTTATTAATCTGGGGTTGCCACAGCGGAATGAACGGCCAACTTATCCAGCACATGTTTTAAGCAGTGGATGCCCTTTTAGCTGCAACCCATCACTGGGAAACATCCAGACTCATTCACACACATACAGAATGGTAAATTTTGAAAGAAAGGCCTTTGGACTTGTGGGGGAAACAGGATCACCTGGAGGAAACCCACGCGAACACTGGGAGAACTTGCAAACTCCACACAGAAATGCCAACTGGGGCTCAAACCAGCGACCTTCTTTCTTTGTGGCGATCGTGCTACTCACTGCACCACCTTGATGCACCAAAGATTAAAATGTAAAAGATTATTATTGTCCATAATATTTTTTTTTTCATCTAGTTCCTTACAAGGTTTTCTCACTTTAAAGGGATATGAAACCACCCTGTCTTAGGAGGGTGTTTTCACACCTGTAGTTTAAAAAAAGTAAGGGAAGTGGGTGAGTGCAGCTTTGTTTAGGTGGGAGTGTCCAGCGGCAAAAGAAGGAAGGGTTTGCATGTAAAGGGGAGTTTCATTACATGCGGCAACCAAAACACAGACGCAGTGTAGACGGACAGCAATTTATAGAGCAGCGTTTACAGATCTGAGAGCTGTGTGGAAGTGGAGGATTTCTCCCCAGCAGATTATCCTCTGTCACGTTATCTGGTTGATGACAGTGCAAGTCCACTGCCTTATCATTTTAACCTTTCAACACAAACACACCCATGCATGCAAGGGAAAATGCTCATTACGAGGCGAATATTGAAGTCTCGCAGTGGTAGTTATTGTTCCCAATTGTATTTGTTGAAATAAACAAATAACTATTAAATACAATCGTAATCGTAATTGTCTCTGTTGTAATCTTAGCATGCTACATCTGTTGTGAAAACATCAGTCTGACACCACACTTCAGAGTTCAGAGGACAACCAGTTGTACAACCATTTAAAAAGACACCAAACAAATAATTTTTGGTCCATAAAATTATAGTAATATTACTGTAAACTACTTAGTAACTTCAGTCATTTCACTAAGTAATCTTCAAAAACTGAAAGAGTATTGTTGGCGATACAATCTAACTTTGCAATCTGAATAGTATAGTGATATTACTGTAAACTTAGTAACTAGATTCATTTTGACTAAGGTACTGTTTGTCTTCAAAAACTAAAAGAGTATTGATGACGATACTAACTATCTTTGCCATCTAGAGAGGCAGGACAATCAACACAAACTAGAACATCGTCTTTTTTTAAAAGAAGATGAGTGGCAAATCTGGATTTCACCATTTCCAGATTTGAAAAGGTCTTGGGTAAAAAATGTTTTTTACAAACATATATTTGTCGCCTGTTAGCAGACCACAGTTATCCAACTGCTTGGGTCTAGACGCGAGCTGAGCTCTCATCGTAGGAAAATGAAAACAAAACTTTTGTTTTGGCACATTTAAAAATGGAACCCTAACAGTCCCTGTCTCCAAACAATTCTTCTTACACTTTTTTAATTAAGGCTGGCAACACAGGATGGCGTCTCTCTGAACACTGTAACAAGTAAAAGTCCTTGAAGCTATATCATGCATATTAATGATGTTGCATATCATTCACAATAGAGTGCGCTGATTGGTTCAAACCAAGTTTTTCTCATGTATTAAAGCTGAAACACGGCCGGTACAGACATTCAGTCTCCACACTGGAATTTACACAATGATTTCATTGCCCTGCCATAGCCTCAAAATTTATTTTCATACCATAAGAACGAATTTACTCAAAACAATGCAAAAACAACCAATTTTCACTTGTTAGCTTAATATATGTGTCCCAATAGTGTTTTTAGCAACATGGAACATATTAGATTAGATTCAACTTTACTGTCATTACACATGTACAAGTACAATGCAACAAAATGCAGCTTATTGTAGTTGCACCAAGTGGCCAGATGCTGTATCTCCTCCTTGTAGGCCGTCTCATTATTGTTGCTGATTAGACCAATCACTGTAGTGTCATCTGCATATTTGATAATGGTGTTGGATCTGTTCATAGGCCTACAGTCGATGGTAAAAGGGAGTAGAAAAAGGGGCTCAGCACACAGCCCTGTGGTACACCAGTGTTGAGTGTGATCGTAGTGGAGCAGATGTGGCCTTATCTAACATTATAAGGTCTGTTGGTCAGAAAGTCCATAACCCAGGTGCAGAAAGTCGTGTCGATATCCAGGTCTCTAAGTTTGATCATTAACTTGGAGGATATGACAGTGTTGAATGCTGAGCTGAAGTCAACAGCATTCGTGCATAAGTGTTTTTATTGTCCACATGTGTGAGTACAGAGTGCAGTGCTACGGAGACTGCATCTTCTGTGCTCCTGTTGCCATGGTAGGCAAACTGATGTGGGTCCAGTGAGGATGGCAGAGAGTCTTTCAGATGTACCAGGACCAACCGCTCGAACACTTCTCGATGATGGGTGTGAGTGCTATAGGGCGGTAGTCATTCAGGCATGTTGGGCTGGAGTGTTTAAGCACTGGCACAATAGAGGTGGTTTTAAAGCATGTTGGCATAGCTGCTAGGTTAAGCGACAGGTTAAAAATGTCTGTAAATACCCCAGCGAGCTGTTCTGCACATGCTTTGAGGACACGCCCAGGAATATCGTCTGCTCCCGCAGCCTTATGCACATTGATTCGGCTCAGTGAGGTACAGACTTCTGAGGTGGTGAGTGTGATAGGTGAGCGGTCGGTTGAGGATGTGATCCTGGTGTAGGGTTCTTTATTGTCTCTTTCAAAGTGGGCATAAAAGTCATTTAGCTCGTTCAGGAACAGTTTATATACAGTTGAAGTGAGAATTATAAGCCCCCCTTTGATTTTTTTTTTTTCTTAAATATTTCGCAAATTATATTTAACCGAGCAAAGAAATTTTCACAGTAAGTCTGATAATATTTTTTTCTTCTGGAAAAAGTCTTATTTATTTTATTTTGGCTAGAATAAAAACAGTTTTAAATTTTTTAAACACCATTTTAATGACAAAACTATTAGCCTCTTTAAGCAATTTTTTTTTTTTTTGCGATAGTCTACAGAACAAACCATCATTATACAATAACTCGCTTTATACCCTAACCTGCCTAGTTAACCCAATTAACTAGTTAAGCATTTAAATGTCACTTTAAGCTGTATAGAAGTGTCTTGAAAAAAATATCTAGTAAGAATTATTTACTTTCATCAAGGCCAAGACAAATAAATCAGTTTTTAGAGATGAGTTATTAAAACTATTGTTTAGAAATGTGTTAAAAAAATCTTGTCTCCGATAAACAGAAATTGTGGAAAAAATAAACAGGGGGGCTAATTATTTAGGGGGGGTTAATAATTCTGACTTTAACTGTATATGACTATCAACATCTCAAAAATGTGTTTTGGTGTTTCGTGACCCTTTAACTTCAAGCACAAATAGATCTGTTTTCTTGCCTGTGAAGTGGTCAATTTTTCCCACTTACAAAATCTCGCCATGTAAATAGCGAATGCACCATAGTGTAACCACAACTTGCTCTTAAAAGGAATAGGAGATGAGACTCTGATTGGTGCAATGCACATTACATAACACACGCATATAACTCATTAAGAGAACGGCAACTTTTAGACTATGCGCTGGGCATGTCAATGGTTTTTCTCGTCCTTAAAATAGCAAAAGTGCATTTAGACATGCCCTAAATGCACCTGCGCTGTGAGCTTCAGATCATGTTCTTAGATTTTAAAATAGAGCACTAAATATCTCATTTTAGTTTTCGATCTAGTCCAAACCATTCAAACTACAAGCAGGAACACATTCTTGCACACTAGAGCCTGAAATGAATAGTCAGCATCAAACATGCATTTACACTTTTACAACATCCTGAACTCAAACACACCTGCAGGGAGTGAAAAAGACAAAGTATGAGAAGCTTGTTATGCAAATGAGGTCATGTGGAAAGTGGAAATGGGGGTTACAACCACAAAACAGTTGCCTTAAATTTGGTGCAATGCCAAATGCAGAGCAGTATAGAGCGAGAGTTTAAGAGAGAAAACCTCGCGCATGAATCTCACCACTTGATGCTCAGTGGCAACAGGATGCAAATGTGGAAATGAGTCTCTTTTTACATTTTTACACTACTCTGTATATGAAGTGCGGCTTTTTTTTTTTTTTTTGCTCTTTTGCAGGAAGTGTCATTTTTTCATTCGCTGAGAGGTGCGGAGTATGTGTTCTGACAGCTGCAAACAGAAGCTCATTGTCTGTGCAAAAACACACTTCCTCTCAGTGAAGTGTGTGTAAGGCTGGAATAGCCACATGCTTCAAGCGGAAAAATGATACCTCTAAACCACATGACACACTCTGTTTGTATTTATTGACAGACTTATGCAACTGAGTATTTGTGTTTGGAAAGATGGCATAAATAATAATCGTGTGATTATATTCATGTGCTGCTGAGCAGAGGGATGATATTTAGAATAGATGCGCCTTGGGCAACATGCCGTCACGATGCTTCCCGTTTCTTTCTGTTCTCTGTTGAAATGTCTCTCATCTACTGTATGCCATAAAGTTAATTGTATAAAAAGTATAAATTGTAAAAATAAAAAAAAATTCTTAATTACCTAAAAGCAGGACATAAATAATCTATGGAAATTTTATGGGTTTTTAGATTCATAATTAAATTGCAACTTCAGAAACATTTTGTTTGCACTTACTTTAATTGACCTTTTATTATAGTTGTACTTGATACCTTTGAAGCAATGAGCCATTAAATGCTGTATTGCTTGTATTGTTTATAATAAAGGTATTTTGTAATATAAGACTTAATCATAAACAATGTAGATATTATATTAAAAAAAATCCACAATTTTTGTTGAACAATGAAGCAAACATTTGCAGCACATTTTTATTTGACAATTTCATATATATATTATTGCTCAGCTTAAGAATCAGGTGTTAGCCAGCAGATAAAATAGCCAGCAGAAAAAGTGGTGCCACACCTTGTCAAAGGTCTTTGTAGAACCAGTAAGTAATAGTGATTTACTATATTTTTAATCTGATTTTAGTATTTTTTTTTAAGTATTAGTATTAGTTTACTTTAGCATTAGTTTATTTTAGCATTACTTGTACTATAATAGTATTGATTTAATATTATTTTTCTGCTGCTCTCAGATGATTTGCAGCACATCTTTATTAGTTTTATTTTAGCATTAATTATTAGTTTTAGTTTAGCATCTTCTGCTCTGTGAAGATTCAGAGTGCTTATTTTATCCTCACTTACATGGTGGCTCAGTGGTTAGCACCAGTGGCGGATTTAGGCATGGGCAATGTGTGCGATTGCCCTGAGGTACTTTTCCCGAAAACCATCGTTAGCCAACTAAGGTCGCGAGTTCTGTCGTTGGTTGATTTGGTGTTTTCCAAATCCATCGTTCCAATTAACATTCGCAAGTCCGTCGCAAACTTGTAAACCATTTCTCTTACATGTAATTTGCTTTTAATTTTATTTACTGTTCAGTTTGAGTGATCTTCATATTGACAATTGCATCCTCTTTGTAGGGCACTTTGGAATCATTTTTGGCATTTTGAACGCAGCCGTGGCTCATTAAAGAGCCCATATTATACATGAAATAGGGTCATATCTTGGTTGTAAGAGTCTCCAACAACAGTCTAATATGCATGCAAGGTCAAAAAACACTTTCATGGTCTTATAATCTGCATTTATTTTTACCTAAGTATCCCAGCGACTCCTGTATGAATCGTCCAGTGATTCATTTGTTCCCAAACCCCTCCTTAGCGCGGAGCTAATCTGCGCTGATTGGACCGATGACAGTCTGTCGCGATTGGTCGACTGCCTTCAGTCAGAGAGGGAAATGGCCAATAGCTAATCAGCAATTTAAAAAGTAATCACAGTTCATACACGCTCGATAGTGTAGGCGTGGATTTTAGCTGCCACACTATGGCGAGTGGATAGTGCCACGGATAACCGAACGAAGGAGACAGTCGTGTACTCGCCATACCACACACACACAAAAACACACACACACCTCCGGATGACAACGCTCCCGCTTCCGCCCGCACGCGCCAGGTTTTAGCCTGAGAACCCGCTCCGTTTTCTGCCCGCCGCGCCCGGTCCCGCTAGAGCGGAGAACACAACCAAAAATCACCCAGTATACAGTCCAGACAGCCAAGCTGTCTGTATAAACACATACACACAGCACAAAGCTCGTTCGTTCGTTCTCTCTCTCTCGCTCTCTCTCTCTCGCTCTCTCTCATACGCTCTCTCATACCAAGCAGACTCTCTCTTTCTAATTCACATAGCAATATCCGTGATATTGCTAGACAGCCCGCTCCCGTCCCAAATTAAACCCGTTACCGACCGCTCCCGCGATTTATTCGGAAATTTATTCCCACGGCTGTCCCCGCGCCAGATTTCTGCGGCGCGGGAATAAATTTCCGAATAAATCGCGGGAGCAGAACTCTAGCACGGAGCTCCATAAACAAACAGCACGCGTCGCGTTTTTAACGTGACTTTGCACGCGATAAGATAAAATATCCAGTTAACCTGATACAGTACACGCGGTTACAAGTAACAAATCACAACTAAATACATTTGCAAGCTAGAGTCAACGAGGCAACAACTTTAACCGCACGTACTTACACTTGAGAAATGGAAGAAACCCATCCTGACGTCCATCAGTTACTCTTTACTGATCCTTCCTTTAACAAACTCAGATGAAGTATTCTTTGTAGCATGTAGCTTCCAGAAGTTTCCAACTGCTTGGTTATAATGCTGAGGTTTCATCTTTGGGTAGAGACTCAATATATCCATCTGCAGTGTGACTTCAATCAACCGGCATGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGGGTGTGTTTGTGTGTCTGGGTTTCTGCGTCAGAGGGCGGGGCCTCAGGTTTGAAATCTCCCGGGTTTGCGCGTGCACGTGAATAACTTGGTTTCGTTCGTACGTCATGGCGAAACACCTAATGAATCGTGATCAAGGCGACTCGTTTGAAGCACTATGAGTCGACTCTTTTATAGATGAATCAACAGTTTTAAACACTGTATTCTTACAGATTTAAGCCTTAGCTGGATACTTCACTTCACTTAGAGCTGTGTTACACACTACATGGAGGGGAATTTTCAAAAACCCATAATATGGGCTCTTTAAGAAAGTTACAGGTGACCTATGGAAAGCGGAATCTGTCTCCAGAGCTTGTGAAAACAAAAATATATAGCATATATTAATGGTTTTAATTTATATTAGCCTTGGCTATTTTTTAAGAAATGTACAGTTGCAATCAAAATCATTAAACTCCCTTATATATATTTTTTTTCTTTTCTAAATATTTAAAAAATGATGTTTAACAGAGCACAAGAAACTTTCACAGTATGTCTGATAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACAGTTGAAGTCAGAATTATTAGCCCCCTGTATTATTAGCACCCCTGTTTATTTTTTTCCCCAATTTCTGTTTAATGGAGGGAAGATTGTTTCAGCACATTTCTAAGCATAATAGTTTTAAAAACCTATTTCTAATAACAGATTTATTTTGTCTTTGTCATGATGACAGTAAATAATATTTTACTTGAAATTTTTCAAGACACTTCTATACAGCTTAAAGTGACATTTAAAGGCTTAACTAGGGTAATAACGTGCACTAGGCAGGTTGGGGTAATTAGTCAAATTATTGTATGATGATGGTTTGTTTTGTAGACTATCCAAAAAAGAATTAGCTTAAAGGGGCTAATAATTGTGTCCCAAAAATGTTTTTAAAAAAATTAATAACTACTTTTATTCTAGCCGAAATAAAACAAATAAGACTTTCTCCAGAATAAAAAATATTATCAGACATACTGTAAAAATGTCATTGCTCTGTTAAACATCATTTGGGAAATATTTAAAAAAGAAAATCAAAATCAAAAGGGGGCTAATAATTCTGACTTCAACTGTATATATATATATATATATATATATTTTTTTTTTTTCTTCTGGAGAAAGTTTTATTTGTTTTATTTTGGTTTTATTTATTTTGTTTTTAACTTTTTAAAAACCATTTTACGGTCAAAATTATTAGCCCCTTTAAGCTATATTTTTTTTTTTGATAGTCAGAACAGAACAAACCATCATTACACAATAACTTGCCTAATTACCCTACGCTGCCTAGTTAACCTAATTAACCTAGTTAAGCCTTTAAATGTCACTTTAAGCTGTACAGAAGTGTCTTGAAAAATATCTAGTCAAATATTATTTACTGTCAAGATGGCAAAGATAAAATAAACCAATTATTCGAAATGAGTTATTAAATGTCTTATGTTTAGAAATGTGTTGGAAAAAAAAAATCTTATCTCTGTTCAACAGAAAATGGGGGGGGGAAATAAACAAAGGGCCTAATAATTTAGTGGGGTTAATAAATCTGACTTCAACTGTACATGTACCGCATTGGGCCTGCTAGAACATTTCTGCAGTGGTTTAAATGCGTCAAAGCTGTAAAAGTTGACATAAAAAAAAAAAAAAAACAATAGACTACTTAAAAATTATACATACATATAACTTTTACGTAGTCTCTTGTTTTGTATTAATTTTATTATTATGTAGTAAAATGTTTTTTTTTTAATTTCTTGATAAAGATTCTAGTATAAATTAAAACCATAAATGTGATGATTTATATGAGATTAGCATACCTTAGCTTTTTTGTAAGTGGTTTTTAGTTTTAGAATAGAATATGGAATATTCTCAATAATATTTGTAAAGAAAACATAGGCCCTGTATGTGCCATTTACAAATATTTCAATTAAAATCTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTAAAACAATTTGCACAAAAACGTTCTGGGGATATTCTCTTTAAAGTTATTACTCCACTACCTTTAGAACATCATTAAGGAGGTTTTATGTTATAACAAATGTGGTTCAAACGATGGATCTGCAACAGAAACTACGGTTTAGGGAAATACTCATTACTATATTGCTCTTTTCCCAAATTATGTATGCATCGCACAATGATTGTTTAACCACGAGTTATGTGTTTTTTTGGGGAAACACACCCCAGGGCAGCATCTTGCTGGGGGAGGCACGGGTTGTCGGTGTAAAAAAATAAATAAATAAAATATGTGGCCCAGTAAAAATTAACAGTGCCCCAGTAAATTTGACAAACAATTTACTGTATGCAAGTGTATTAATTTAGAGTGGTAATCCCAAAATAATTATGTTTGGGGCCATTCACATTTGACATTTTTGGACATGCAAGTTTGTTATTGTCTATGTGCAGCTGAAACAACAGTTTTGGCAAAAAAAAAAAAAACATTCCCGTGCACCTTACACACACACTCCCGGTGTGAATCCCGGTTGCAAGTCAACAAAACTAAAGTTCATAAAATATGATGTTATTAAGTCGGGTCTAAGACAACAGATAATTCTAGAAAACTGTCACAATTAATATTCATGCCAATGACTTCTTAAATGATCTAAACGTACCACTCCAGTTGTGTCTTTAAATTGTTTTCCAATTACATTTAGGATTGATAGCTTGTATATTGGGTGGTTCGCCTAAGGTGCCATTTAAACTAGAAACGCAACTGGTTAGCACTGTCACCTCACAGCAAGTAGGTCGCTGGCTCGAGTCACGACTGGGTCACTAGGCATTTCTGTGAGGAATTTGCATGTTCTCTCCGTGTTGGCATGAGTTACCTCAGGGTGCTCCAGTTTCCCCCACAGTCCAAAGACATGCTCTATAAGTGAATAGGGTGAACTAAATTGGCTGTGGTTTATGAGTGTGAATGTGTGTGTGATTGGGGTTTTTCCAGTGATGGGTTGCAGCTAGAAGGGCATCCACTGTGTAAAACATATGCTGGAATAGTTGGCGGTTCTTTCCAGTGTGGTAACCCCTGATAAATAAAGGACTAAGCCATTTCTACAAGCCCTATTACTACAACATAACATTGTTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTAGAAAAGTTTTAGTTAAGGGTTTTGGTTTTAGTTAACTATAATGGCCATGATTCAGCGGCTAAAAATATATATTTCCAGTTATATATCGACTGCTTCTGAACTAAATTAGCATGAGCAAAAATCTCCTTTTGACAATTCACCTCAGGAAATTAATGGAGTTTCATCACCCATGTCTGCTCCCGTGTAGAAAAACATCTGCATGGCGAGGCCTCTAACAGTCAATCCCTTTGGAGAAGCAGCGGAAACAAGCACACCGCAGAGTTCATCATGTAGTTCAGCAGTAACGAACGGGGTGTTGACCTTTCTTAACCGAAAACAGCTAATAAGATGCCTGTTTCACAGCAGTGCATGTGCTAAATCTGTGCACTTGAAGAAAAAAAAACTATTATGCTGTACATATGTGAGAATGTAACCTTTGATACATACCATCTGCTTGAAAAAAGAGCTGAAAACAGATGGAAATCTATAATTATTCACAGAGAAAAGCCTTTAATATTTTATAAGAATGTTTTTGAATATACAAAATAATTTGAATTAAACAGGTATATTAATATTTAGGATAAAAAAAATATATGTATTTTAATTTTAAATGGATTTAAATGCAGGATTATTAACAAGAATGGTCAGACTAGCAATGGTCAACAGGGTCAAAACAGGTACAGGTGCAGGGAAATCCTGAGTCGTGATTATAAACAGGCGGATGGTCTAAACGCAGGCAGCAGACAGGAATAAACAGTAAAACAAACTAAACAAAGCTTTCACAAATATTTAACTCAAACTAGCCCTCTAAAAATGAGCTGACTTCATTGTTGGTTTTTAGGTGAAGTGTAGAGTATCTGAGTGAAAAGTGTCTGATATATGTTCTGTTTTCTGGGCACATCGTTCATGTGAAGCTTCTTCTCTGTTGTCTGCAG
Seq C2 exon
CAATGAAAGACTTTAAGGTGACAGTGAGGCGATCGGAGGCTTCTGAGAGATGCAGTCTGAAGGGAGTAGTACTTTTACGGACTGATACTGATAGCCTTCTTCTCAAAGACCCGAAGACAGGAGAGGTCCTGTACTCCTGGCCCTACCGTTTCCTCCGCAGGTTCGGACGAGACAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSDARG00000075818:ENSDART00000135238:4
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.457 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF154131=PH_11=FE(26.6=100)
A:
NA
C2:
PF154131=PH_11=PD(28.1=60.0),PF0217412=IRS=PU(86.6=96.7)
Main Inclusion Isoform:
NA

Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Chicken
(galGal3)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]