DreINT0095006 @ danRer10
Intron Retention
Gene
ENSDARG00000062686 | megf11
Description
multiple EGF-like-domains 11 [Source:ZFIN;Acc:ZDB-GENE-060503-252]
Coordinates
chr18:19158656-19174242:-
Coord C1 exon
chr18:19174009-19174242
Coord A exon
chr18:19158866-19174008
Coord C2 exon
chr18:19158656-19158865
Length
15143 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CTGGTGAGA
5' ss Score
7.54
3' ss Seq
CTGTTCTGTAATGTGTACAGATT
3' ss Score
6.67
Exon sequences
Seq C1 exon
CGGCTCTAGTGATGGAGGAACTCAACCCGTACACTAAGATCAGCCCCGCTCTGGGTTCAGAACGCCAGTCCGCAGGCGCCGTCATGGGCATCATCTTCCTGCTCCTGATCATCATGGCCATGCTCAGCTTGTTTGTTTGGTTCAGGCAGAGACAGAGAGACAAAGGACAGGAAATGCCCAGTGTTTCGTACACCCCAGCTCTGCGTGTCACCAACACTGACTACTCTCTTTCTG
Seq A exon
GTGAGACTAATCATTAAATATTGAAGAACAACTTCCCAGGTTTCTTGAGTGTGTTTACTAGCATGACTTATACAGTGTGTAGCGCATGTTTGTTTATTCAGTAACTGACAGTAAAAGCAGTCAATCCAGCAGTGAAATAGAGTTTACATGGTGCTTACACACTTTTCGTATGCTGAAATATGTCATTCATATTTTAATCAGGTTAAAATACTGCATATTTATAGTTATTATAATGCCATAGATGCTACTTTTGATGATGTGGCTTTAAAAGACTTGATTAGTTCCATTAAGTGTTATGAATGTCAGTCCACGACTGCACGACTATCTGGGGAAGCTTTTCGTCGCTGTTTTGTTTACACTGCAAGATGGAATGGTGTCAAGGGGTTTCACACTGCATGACTTTACAATAGGACGAATCACTGACAACTTTGTCTCAGTCTGCAAATCACATCTCTCACAACCAAACAAACCAAATTAAATGTATGCGCAAAACAGGAATATCTATGAATATTATTTAAGCCCCTGATGTATTGTCAAAAACACCCCTGATCTTTTGGAATATGTTGCACATTTGTTTTCACAGTATAAAATGTGTGTAGTTTTGGTGAAATAAAAAAACTTCAATCAATAAAATCTGCGTCATATAAATGTAAATACATGCAAATTAGTCAGAAAAATGTAAATTGGGCTTTCTAGATATGATATAAATATCTATACATGTTTATCGAGATATGATATAGCCAGTCACATCTGTTTCTGTAATATTTAAATCACAGTGAGTTCATGCATATTATTTTATAGCTATATTCTACTGTAACATGCTATGTCAGTTAGCATCGAATTATAAATCGACTTTCTTATGAAAATACCTAAGATGGGTGGAAGAACACATATAAACCATTTATTGTCGCAGTCGTGTAAATGATCAGTTAAAGCCTTTTTATGTTTATTCAGATATTATTTTCATTCAACCACAGCAATAGCTTGATGACTTCATCCCGTATTCCCTTCAATGTTCTACTACTTTTCTAAGGCATATATGGAATTTCTGCTCACGTATGAATGAAACAGGCATTACATCCATTTAAAGTGCTACAATGCCCACATCACCCTATTTTTAAGGAAAACTGAAAAGTCTCCCTCTAAAGAAATTTGAAGTACACATATTTCTAGCATATAGATCTTTATTTACATTTTTTGTACTTTTTTTGAAACAATTGTTATTATCCCAAATAGTAGCCTAATAAATAATAATATTTTACAAGGTATTGAATTTAGAAATTCCAGTATCTTGACAACACTACTTTAGTTAATCACTCTGTAAAATGAAAATGTTTGTAGCTTTGTATCACATTGGTTAACAACTCACACTTTAAAATAAATCACACTTCTTTGGGGCTAAGCCCCTTATCCTCTTCGACCTTAGCAACACCAATATGGCAACCTGCGTTTGCGTGTTGTTTGAGGTGGGGCTGGGTGAAAAAGTGTTCTGATTTTGGACTGCAATACCTAGTTCAGCCAGTGGGAGTCAATCTTACAAACTGTACCTTTAAACATACTATTCCCACATATTTATCACAAAAGAAAAACCCTTTCCATTGATTTTTGTCATATACGTAAAGCTTAAAGATCTTATGCAACTGAGTTTTTTAGATGTTAGTATCTGTGTGATATTTTTAAGGATATCTATAAGCTAGTGTTTTCCAAAACAATGACAAAATTTACATTTAGAAGATATAAACCTGAGTGATTTGTATTTATTATGATGTTTATTTTTATCACATCACATTATATTATTTTTATGACATTCTTTTTAGCTTTTTTGTGCTTTATAAATAAATAAATAAAGTGAAATGAAACCCAAAGCTTGCAGTTTGTCACTTGAACTATTATTTTGGCGTCACTTCATACTTTAGTTCCTCATCAAGTCTTTGACCAATCAAATGCTCTCTAGTATCTGACATGTCCTGCTCTCCTCAAGTTGCATCTCATTTCATGCACTTCATCTCTCTTACAGAGCTGTTCAAAAATGAAATGCTGATTGCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGGGAAGGGGCTACCACAATATATGTCCCACCCTGTTTCATGTTTCAGTTGAAATTATGTCAAATTAACATTTCAAAGCACTTCAAGGGACCTTTAAAGAGGAGTAACAAATCACAGATCACAGATTTTTATTAATCTCAAGTTGTACTTCTAGAATTGGAGTTGTACTTGCGCACTTTGATATGCTGACGTTAACACTGCTGTCTTTCTCTCTCCTTCAGAAACGTCTCAGAGCAGCAGCAGTGGCCAGTGCTTCTCCAATCCCAGCTACCACACTGTGGCACAGTGCAACATCTCATCCTCCATAACTAACAACCTGGACGGCACTCTCACTCTGAAGGTGAGCACACTAGGTGAATAGCTACTCCAATGTCCGGTTGGCCGATGAGTAATATTGAAAAACAGCGTTCTTTCAAGCAATATTTTATAACTAGAGTAGCTGCCTAGAATATCACAAACAAGCACAAACTTAGTATATTCACTTCTTTGTATGCATAGACTTATTTGCTGAACAGCAGATTTAGAATTAATTTGCATCAAGAAGGAATAATGATCCAAATTTGGAAATATAGTTGTGAAATAATAATGCTAATGTTCTGGATTTGAATATACATTTATGAAGTCCCATTAAAATGCTAGGTGGTGGTTCAATCTTTTAGGTGCTACTGACCCCCAAATATTCTCATCTTCATGTGAGAGACCCCTATTCTAAAATGATAAAATAGTTTATTGCATATAGATCTAATTAATCTTGTGTAAAGTACAAATTAAGGATGCACCAATATGGGTTTTTTGGCCAATATCAATAACCGATAACTCTTCAGATTTGGAGGCCAATAGTCGATACAGTATATAGGTCAGTAAATATAAATAATTATAAATGTTCTATTTTTCTACAGTAAAAAAACTGATTTTATTTCAAAAACTTCATAAAAGTCTTCAAATCTGATCAAATGAACTGAACAGCCTACTCAAAGCATAAAAAAGCAATAATTTCAAAATTGCAAGGTGATTAAATATATAAAAATTATATAAAAATAAATGATTTCCTTTTCTTCATAGCAAATTAACATGCAGCTTGACTGTTGCATAATAATAGGTTAAATACCAAAAAAGGGATTTAATTAACAAGCAAGTTAAATATATTTAAATAAAATGAAAATTAACGAGCTAAGGACTAAAACCAGCCGAAATGTTCATAAATACAACGTGTTACAGTGATGTACATATGTACAAATATGTCATGTGCGAAAAACATTTTGGGAGGTGTTTGACTGTTCAGAGTCATCGTACAAGTGAAAAGCTAAATACAGATAGTACATTTTAGAAAATGCGGCATAGATTCATCCTATTTGGCGTCAGTCAGACTACGCTTCTATGTTCCTCCTTGCTGTCGATTGCAGGAAAAACGATCAATGAAAGTTTATGATAAACCGCTGTGAGTTTCACTCAACTACAGGCGCTGCGTGATGCGTACACATACGACACGGAGTCACATTTGCCCTCTGAGTCAGATTTTGATACAGCACCTGATCACTGAGCACAGATGACTTTTTGAAAAACACAGAGCATATTATAAAGACAGAATGTTGCAGTGAGTTGAGAACGCCTATGCTGGATTCAGTTACTGGCACACCTCTGCCGCGTGCTACTGTGAAGGCTGTCAGATCAGATATGCGTGCGCTCGTTGTAATAATTTTAATATGCTGATCAAACTGAGTACAATCTTACATCAACAACACATGGTAGTCTATGCGTTGATAATAATAAATAATCATATTAGATTACAAACAACCCAACAAGTTGTTTAGCACATTTGTATTACTGCTATTATGTTTACGCATGTAATGTTTCCCTGACGAGGTTTAAACCAAAATACACAATGACACTCTATTAAACATATCTACAATGATAAGGTTACTTACTGGTTACTTACTGAGTTATTAATGCACAGCAATACATTACAAAGAAAGAATGAACTTTGAAGGAATAAACAATGTAAGGAAAGCTCCATTATAGTGCACTGGACAAGTTCTGCCCATTAAACATTAAAAATAGCGTTTATCGGCAGATAACGATATGCCCGCCAATATATCCATAGTACAAATTATAAAATGGTTTAAAATAATGTTTGTAAAATATTTTGTTTCTAAACGGTTTTAATCCTGCTCATTATAACAGTATTTTATTGTTATTTCATTTTCAATTAAATAGTATTTGCATTCATTTATTTTAATACAATTTTTGAATATTTACTTGAATCCTAATCATATTTTTATATTGTAATCATTGTATAATTTTTAAATGGTCTTTTAAATTACACATATGCTTATTTGTTGATTTTTTTATACTAATGTTGTGTTTATATTATTGATTTTTTTTTTTTATTATTGAAATTATTGCTTTTTTTTTAAACATTTCCATCAACCCCCAGCCCTCTATTGCATCTTCCTGGGAATCCTTGGTCCCCAGAATATTTATTTGTTTATTTGAATACTACATTTGTGGTGACACGGTGGCTCAGTGGTTAGCACTGTCGCCTCACAGCAAGAATGCGGCTGGTTCGAGTACTGGCTTGTTCAGTTGACATTTCTGTGTTTGCATGGGTTTCCTCCAGGTGCTCCAGTTTCCCCCACTGTCAAAAGACATTGCGGTATAGGTGAATTAAATAAACTAAATTGGCAATAGTGTATGTGTGTGAATGAGTGTGTATGGATCTTTCTGGGTTGTAGCTGGAAGGGCATTCCCTGTGTAAAACATATGCTAGATAAGTTAGCAGTTCATTCCGCTGTGGCGACCCCTGATGAAGAATGAACTAAGCCGAAGGAAAATTAATGAATGAATAAATTAATGAATTTGTTTAAGAAGGATGCATTAAATTCATTACAAGTGGCAATAAAGACATTTATATTGTTACCTATATTGTTATCATTTCTTCAAACCATTTATTGCTATTTATTATTATATTTTTTCATCAAATAATTTTGAAATATTTTTCACAAAAATACAAAACTATGAAATTGTATATATTTTTAAATATCTAAAAATAAAAACTATAATTTTGAGTTGTAGTAATATTTCACAATATTACAGTTTCTACTGAATTTTCCATCAAATAAATGCAGCCTAGGTGAGCATAAAACCTTTAAAACACCTTTTTTTTAAACTCAGAGCCCAAAAATTTTAAACATTACTGTATGTTAGACAGGACCAAATGGTGAGTCAATAACAATAATACTGTCTTAATAATAAAAAAGATTCTTAAGAACATAATTTATATATTTACACCTAGAGATAAATTCACTTTAGTTGGTCTTAAATGCATAATGCACGCTGTTGCAAGTTGTTTACATCATAAAAACTGCTAATGCGTAGCGTATCAAAATATGTTCTTCTTTCAATGGTGTCTTTGATGTTTATTTTTGTCTGGTTTTCCCCTCTAGAAAGGCGACAGGAACAGCTCAGAATGGAGAGCATACTGCAATCTCAATGACCTGGGTCAGTGTCCTCACTTAATTTCTTATCTCACCCCCTATTCAAACCATCTTCCATCTGTTCCTGTCAGACAGAGCCTGAAAAGTTACTCATGCAATTTGAAATGGATCAAATACATCATTCTCTTCCCCGCTCAGCCTGTTCCACAAAACAAATAAGACCTTTGTTTTTCATTGAAGCGCCAGAGAATTAAACTACTTACTCATTCCTGGGGGCTGCGGTGAACACCAGACGGCGCTTCTGGCACCGGAGCAAGACCTTCGCCTGCTGTGTTTTTTAATAAGCCCCTACTTTAGGTGGCACCCGCACATGGCGGAAGGTCAGCCTTTGCCTATATTACCCAAGGTCACTCAGAGAGAGTTCATTACCTCTCTGACTCCCCGTCCCACAGCGCTTCACCCCATTATGTCTACCTGCAGGTCTGCTGATAAAGCTTCGGCGAAGCATACGAGACCTCGGAGACTCAGGTTCGAGGTTGGGTATTTCCATCATGCTTATCAAGCCCATGGAGGAAGTGAAATAGGGGCCAGTGACCACAGTTCAAAGTGATTTCACCTTGTTATAGGAAGTTTCACTGAATTCTGGTCACAGTGTTATAGTGTCAAAGCCCAACAAATACACACAGTCGAATGCATACATAGCCTTCCTAAGTAGATTCCTTTGAGTGAATGAACAGTTTTTAATCCCATCACACTAGTATAAGTCAGTGTTGCCGCATATTGCAAAACAGACAAGAAATTATACAATTTATTTCAAATTGTGCAACTGTAACTGTTTGTAGGATACCACTGAATGAGAGAAGTGGTGTAAACTGAACTCAATTGAATTTTCTTTTTTGTATACTACAAAGTATATAGATGTCCAAAATATAATGGAAATCTTGTTGAAAATTAGCCGGGGTTGTAAATTCATAAAACCATAAGGTGTCCATTTTTTTAAGCATAGTAAAGTCTGTAAGTTTGCTGAATTTAAATTACAGTATAATACCTGTGTTGTTGTACATTCAGCTGAAAGGGAATATTGAGTAGGGGGCGGGGCTTTCTTATTATGCATCATTCCCTCATAGATAACTACTGGTAAGAGGGGCGTGGTTAAGAATATTGTGACTGAAGTCAACAAACTGACGTCAGAGAAGTGACACCACTTTAAATATTAACAATTTTTAGTAGATTAACTTGTATGGATGAATTGTTCACCTAAAGAATTTCAATGTGTGATATAAATAAAATAAAATATTGAGTACATTTACATGGACACCAATAATATGATTTTAATATGGTTAAGACAATATACTGATTAAGAGTTTACCATGTAAACAGCGATGTTTGATTACCTTAATTTGATTACAGTCATAATCAAACTAAACAGAAATCAAATTAAGACATGGAGTATGCCTATGTTATTTGCATTATTGAAGTGCAGTACAGACATGTAAACACTGCAATCAAACTATTACCTTCATGAAGGATTTTTGCTGCATTTTGCGACAGGATAGTCTATACACACTGCTGTTTGGCACTATTCTCTGCTCCTACCGAGTCAGTGAAGGACCACAGACACTTGCATCATGAAATGCGTAGGTTTTTTGCCCATACGGCGTGTGCTATCAAATTCCTTTAAAACAACACCCTTCCAGCAGTTTATACAGGCAACCAATATCTCGTTTGTCACAGGGGGCATGCATGAAATGTTCCTAATTGAAAGCGAAAGTGCCAAGCTGAAGCTAAAGTCGACAAATTAAAAATGAAACACCCAAAACTACATAAAACTCTGGAGGAAATGTGGATAGCGTGGTGATGCAATGACATTAACTGAATTATGTGCTATAACACGTAAAACAGGATCATGAAAGGAACATTCAAAAAGCAAATCATGTAAACACCTTAATCATATATCATCTTATTTACAATAAGGCACATACTTCAATTACTGATGATTATGTAAACATAGTCATAGTAATTTGACACATTTTTTTCAGTGAGTTTGATTTCACATATATTTTAATATATATCTTTTCACATATATCTAGTCTTTCATTGACATACAGTATAAAAAAAAAAGTTTGGTCTCCTTCCCTGGACCCTAATGCTGCACATTTTTTGCTTTCTTTAAACAGAATGTGTGAATTTGTTGTCACTTTGAACACTATTTTATTAGGTGGCAATTTGTTTTAAGATGTAGCTTAAAGGTTTCACCCAAAAATGTCAAATTCTATTATTAATTACTCTCATACCATTACAAACCCCTGAGTTCTTCATTCATATGCAAAGCACAAACTATGATATTTTAGATGAAATCTGGAAGCTCTCTGAGTAAAGTTTTTTATAAACTAATTTCGAGAGGATGACATGCTTATGATTGCTTGCTGCTGGTCCCGCATCCCGTATCCCATGTGTGATTCACCAATCAGACGATTCCTTAGCCACTAAAAGTACCCTAAGTTCCATGTCACAACAATCTTCATGAGCTCAAACTCCCCTCTCACCCTGCGAACAGGAGGGAGCCCGGGTTTCGAGGGTCTTTTATACTGAGGGCTCTCTCCCGGGACAGCATGACAAACAAGCTTTATAATCAATCATCAGCTTGGTGTGAACTCTTAAATCATCCATTAACACCAACAGTCACTAGACTTTTAAAGTCCAGAAAATTAATAAAAAAAAATATTGTCAAAACATTCCATATAGCTTCAGTGGATCATCTTTAATCATACGAAGCTTCAAGAATTATTTCTGTGTCAAAAACTGTATAAGCAACTTAGTTTGTCTTTGTCTTCTCTTCAGGGCACTATGTGTGTTTACTACAGTCAATAGTAGTTTGTAAATGTTGTATTACCCATAGTAAGAACACACCCCAATCTGACAGGGAAAACAGGTTAAAAAAGTAGTTTTAAAAAATATTTTGACACAGAAGTGTTCTTGGAGCTTTATATGATTGCAATTAAACCACTGAAGTCACATGGAATGTTTTTGTTGTTTCTTTTCTGGACTTTAAACATCTCATGACTGTTGCTGTTTATGGAGGATGAGAGAGCTCTCAGATCTAATCTGAATATATACATTTCAGTGGATTGTGACAACATAAGGTTAATTAAAAACAGTATTTTCAATTTTGGGTGAACTAACTCTTTTAATATTTGTGGACATGCATAATTTGATCATACTGACACAGAATTTTTATGGTCAGATGAAATAACATTTGCACATGGTAGTATATCATTATAATATGCTAAAAAAACACATGATGTCTTATGTTTGTATACGTACATCCAACATAAATTCCATTAAATATGCAAATATAGCCTCAAATAAGGCAACTTTATTGGATTGTGTTGTTGCTGTCTGTAATAATCCAATTTTATGTTTCATTTAAAGAAAATCACAATCACCATCTATAAGTGCATGAATACTGGTCTGATAAATTTGATACACAGACCATAATATACGCATTAAAAGTGAAGTGTGCTTGGGACTTAGCCAGATGACAGCTGTTTAATATATGAGAGATATCTCAAAGACTGAGCCAAAAGTTGTTACATTTTGATGAAGATTACAAAGATAAAAAGGTCACAGTCTTGATTAATCTTTCACTATAAGACTGTGTTAAAGTAAACGAGGACGGATTTGATTTCCAATCATCCAAGCACAAGCTGTCCTTTTCTTTAAACAGACTAAACAGTGCCACATTTGTATAGAAGAAAAGCCCATTTAAAGAATGAACACGTACTGTAGATCTACTGATATCACAGCATGGAGATAAATCACAGAAACAGTGAGAATGAATATTGCACCAGCTTTATCAGAGTACACTGGTTTGGCATTTTCATTTATTTGTTTATTACATCTTGACGTCACCTTGAAGGCATGTCAGTATCTCTGGCTGGTCAGCTGAGAAACGTGATTTAGAGATGTGATTTGGTTAAAGTTTAACTCAGAATACTCATATGATTGACTAGGCTGGGTGTTGCTTTCACTCTTATACAGTAGGTGTTTGATGGAAAGATTTCTGTGCTGTCATTATTCACTTGGACTTTGGAATTCATCTGGCTTTCCTTCCTACTTTTTTCTGTTTTGTGGCATTTGTGGGCCAGTTGCAGTGACAATCTTCCAAAGCCAAATAATCCAAACATACCCTATAGTAATAATATGTTGTGGGTCTTCCTAGTTTATCAAAGTTTTAAATAATACTTACATATACAGTGATGGAAATAAGTATTGAACACATCGCCATTTTTCTCAGAAAATATATTTCTAAAGGTGCCTTTGATTTGAAATTTTCCCTGAATGTTGGTAACAAAGAAATCCATATATGCAAAGAAAACAAAACTAATTAGTTTACAAATTAAGCTATGCATATTAAAATGAAATGACGCAAGGAAAAATTATTAAACACATGAAGAAAGGAAGGTGTAGAAAGGCAGGGAAAGCCCAGACAGCAGCTGAAATTCCTTAGAAGTTATTCGTCAACCCTATGCCCTTCGTCATTGTAAATCAATATTAACTGCTTCAGTCCAACATTTACATTACCAGAATGATAAAGGTAAAACTAAAGTGAACATTTCAGTAATACAATGATCCAAAACACAGCCAAGAAAACTCTCGAATGGTTTCAAAGAAAGAAAATTAAGCTGTAGAATGGCCCAGCCAATCACATGACTTAAATCCAATAGAAAATACAAAATAAAGATCAGTTATTTTTACAAAATCACATGTGACTTTATTCTCCATTTGAGAGATGTAATTAAGCTGCCATCATTAAAAAAGCCTTTTATATATAGCATAAAATACATTTCAGTTCAGTACTTTCTCCTTGTGTCATTCCATTGTTATTACACGTAACAATTTTTTCAGATTTTTTTTTTTATTTGTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTTATGTCTGTCTTGTTTGAGCTTTTACCAAAATCTGGTTCAATTCCATGTACACAGCTACTTTAGAATATTCCCAGGTAAAAACATGACGTGTTCAATACTTACTTTTCCTGCAGTATATTTGTTTTGTTTGTTTGTTTATTTATGTATCGGTTGATTAAATGTACACTTTTTTTGTGATTACGTTTTTATTGATTTTACATGTAAGTGGGTCACAGCATCTTTACAAATTCTTTCAATAAACAAAACAAGATCCACTCCTCAACACCCCCACACCCACCCACCCAAAAAAAAACTCAAAATTTATTAACTGGTGATTTGGATTTTTTGAAGAACAAAATATGTTTTCCCAAACCGTCTCCCAATCAATCTGGCCCTCAGATAATTCACTAGCCCAAATCATTGGTATTGAGAATTGCTTTTGGTTAGCATCAAGAAGGCGGGAATAGATACCTGAAACAACATTTTGTAGAGAGGTAATAGTAAACCAGCAAAGAATTGGTTTCGAGAGTAGATCCCCAAGGGACTCCATATGCCCTGAGGGCAGAGCGCAATTGCAGAAATAAGAAAAAGTATGATGCTGAATTAAATGTACACTTTAAAAAAATGTTTGGCTGTTTCATTTGCAATATAATTTGGGTCAGTTAAACCCAACCGTTTTTTCATTATCTTAAATTACATTACTTTACTTCAATGGTTGGGTTTGTCGGTGCACTGAAGAAAATGCAGGGTTCCACACAATTCATTCATGTTGTCCCAACACTAATTAATTAAGTTAACATAACACTTTTAACAAATTTATGTGGATTAAACATAAAAAAAATTAAGTAGTCCCAATGAAACCTCAGAAATTGTGTTGTTTCAGCTCAATTTTAATAAGTAGTTTGAACGAACAAAAAATATATATTTTTGAGTGTATGTAATTTTGGGTTGAAAGAAATGACAGCAAATGAAACATAAAATGATTCTTAGAATGTTTATGATGGATTTTACATAAATATTATTATTAGTAGTAGTAATATACAGAAGAAATAGTCACAAAATTCTAAAGGATTATCTAAAACGGCTGAAAATTCTAAATGATATTATGTTTAAAAAAAGAATTTAATTTCAAAACAGTTGTTTTTAAGTGCAATGTTTGTTTGTTTGTTTTTTACTGTTAAAAGTGTACCAACTGTAATTTTTGTTCTGGTACATTACAAGAATAATAATGACTGTTATATACACTACCTGACAAGTCTTGGGGCCTATCCAACAATCAAAAAAATAATAATCCTCACACATGTTCAATAATGTTCAAGTCTGGTGACTGGGCTGGCCATTGACCCTCTTTGCTTTCAAAAACTTTGATGTGGATGAAGTATAAGAAGGAATTCTATCCTGCTGAAGAATTTGCCCTCTCTTGTGGTTTGTAATGTAATAATACGCAACAAATGTCTTGAAATCTCAGGCGGTTAATGTTGCCATCGACTCTGCAGATCTTTCTCATGCCCCCATACTGAATGTAACCCCAAACCATGATTTTTCCTTCACCAAACTTGACTGATTTATGTGAGAATCTTGGGTCCATGTGGGTTCCAATAGGTCTTCTGCCATATTTGCAGTATTTGGGATGCAGTATTTGGGATGCAGTTTAACAGATGATTCCTCAGAAAAATCTACCACTTTCCCAAATAATAAACTAGAAGACAAGTTATTATTTGCTTTTACAACTGGGATTGATGACAAGACTTCTGTCAGGTAGTGTAGATTTATTGTGATTTAGAATCAGTGTAAAATTAATTAATTAACCAGAAAACTTGATCTTTTGTGTATATAAAATGACTTTTGCGAATTTAAATTGTCATGGACTCTGGACATCAAAATGAAATGTTTTGTTGTGATTAAATGATTTTGTCTTTGCTTGAAAGTGCAGTTTATTTGTCCCCTTCCCTTTGTTATTGTAAAGTTTCCGTAGAGCATTACTGTAACCTACATTTATCATGTGCTATTTATAATATTGTTGAGTCATGAATTACTCAGAATGTGTGTTGTTGTGCCTCATTAGGAGTATCAAGAGGAGACACGCTTACACTGAGGGACAACAAAACCACCCGAATGGCCAAAGGTAATGATTATAGTGGACATACACTCATGGAACATGCGGATACCAAAATATACACAAGAGCTTCTTTTCTAGGGTAACCTGTTGTCCCCTTTTTCCCAGTACAGTCATGTATTTTGGCTTTATTTTTAGTGTCTTGAAAAAATATACAGTGCTCAGCATAATTGAGTACACCCCATTTTAAAAATGAATATTTTGATTGATTTCTCTGTGAATATTGGTCATATTATTTTTTGATTAAGTGATCAAACGTCTTTAGAAATAGAAAAATAGCACATTTAAATGCATGTGAAATTTCCACAAAATCTTATATATAAATATTTGTTTATCTTGATTTTTCCTTTTTTTTCTTACATTTTTTTATTTAATATTTTTCCCTAAAATATAAATTTAGGCTACTAGTTTTTAAACCATTTTCTTCAGTAGTTTTGATAGATTAGCTCCAGATTTGGCTTTAGTACTGATTAATCTAACGTATATACACAAATATTATATTTAAATCATCCTATAGAAAATATGAATTTAATAGAGAGATTTGTGAGGGGGGAAAATGGTATAATGGAGAGATCTTTGATACAGTTAAAGGTAAACTTAGCCCTCTCTGAAATTTGATTTCTTTTTAAATATTTCCTAAGTGATTTTTAACAGAGCAAGGACATTTTCACAGAATTTAATATTATACTTTTTCCTCTGGAGAAAGTCTTTTTTCTTTTAATTTGGCTTGATCTATTTTTAAAAGTCCATATTAATATCCTCCTTAAGATATTTTTTTATTACTATTGAATTTTTTTTTAGGTTTTCTACATGGAATATTAATTACAACTTTCATTTTATAATTATGTTGTTACCATTACCCCAATTAAACACTTTCCCCCTTAACAGCCTATAAGTTACCATTGAAAAAGCTAAATAAACATAATAAAAAAGTAATAAATAAATAAATAAGAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAATAAAGAGATTTCGGTCATTTGGGCCACGGGCAGAGCCTTTATAAATAAATGAATGAATGAATGAATGAAATATGCTGTTTTCCAACAAGGCAACCTGGGGTGGTAAAATATAATTGGGTAAAGTGGCATTTGGCGGGTAAATAGACATTTTCAAAGCAGAATAACTGACTTTAGCATTTTTTTCAGAATCAAGAATGTGCACTTAGCATGTTTCTTAAATATCTGCAAACATATTATGGTATTTTTATGCTTTAGATAAGTCAAAAACCTACATACAGCACATTTAAATTGCACTTTAAGCAGATTACTAGTATCTTGCAATGAAAGTAGTCAAATACTAAGTCCAGTTACCATGGCAAAGACAAAAGAAATTAGTTATTAAATAAGTTACTATTTTGTTTAAAAAATGTTAAAAACATATAGAGCAAATCAACCAATTGAATCAAACTACTAAATGAACTAACTTTGAAATCAAATAACTAAATGTTCATAATCACCAACTGAAATAGAAAGCATTCATTAGATAATTAATATAAAATATTCATATCTTAATGCTTAATAATTTGTTTATCCTGTTTTCCACTCTGACAAATCTGTTATAACATTAGCCTAGAAACCTTCCTAAAAGTAAACTTATACCAGAATACATGTTAAATTTTTAATTATTAATTGTTAGTTATTAATAATTATGAATCATACTGTATGATGATTTTAAGAGGTTCGATTAAATCCATATATAAGTTAAACCCTGCAAAAAAACAGTTTTTCTAACTTTTCATCTTTCAAGCAAAATAATCTTCTTTTAAATCGAAAACAAACATTTTTTCCTACCCCATTGGCAAATTATTTTGCTTGTTTAAAGGAAAAACTCACTCAATTTTGACATTATTTCTTAAATCAAGACAATAATTTTAACTTGTCTAAAAAATGCTTATTGATTTAAGAATTTGTTGATATTTGGACTAGAAACAAGACAAAACCTTTAGGTAAGAAAAGCATTTTTTTGCAGTGAATGCATTTAACTTAGATCTTACTTACACATTTTCTCATCAAGTGTGTTTTTATAGATGACAAATGTTGATGCATGGAAAGTGGCATACATACATTTCCGCCTCTGCTTTGTGAATTAAGTGCATTGACATTCACGGTGATCTCACTGACCTGGATGTGCAGGTTCCTCATTCTTAGTAGCAGATTCATAAATAGCCCGTTGTGTGTGTCTTCAATCTATTTATGTGTATTTCTGGATGATGTACATAGATATTAAAGTGACTGTCTATCTTTCACTCTCTCGACAGAAACTCTTCTTCAGCTACATTAGATCTTAACTACTGAAACAAGATTTAACAGTGCAGTCTAACAGGATTTCATTCCCTCCTGGGATGCTCTCTCTAAACAGTAACATAATGGAAAAGTGCATATTTTGCAACTTTGACTACAGATTGTCTGGAGCATAACTTAATTTTCATCTTTCTTTGTAAAAAATAATAGCATTTATTACAGATTTAGTCTGTTTTCTCTCCCGCAGGATGATGTGCGTTGATTGCATTGCGATGAAATATGAATATCTGAGTAATATCTGTTCTGTAATGTGTACAG
Seq C2 exon
ATTACATAAAGGCCTCGATGTGTAGCTCCAGCTCGTGTTCCCTCAATAGTGAGAACCCGTACGCCACCATCCGAGATCCTCCCAGCCTGGCCTGCAAGCACACGGAGAGCAGTTATGTGGAGATGAAGTCTCCCGCTCACAGAGACCTGACCTTCTGCTCCAGCACCAGCACAACCCTCACCACTGCCAGCAGGAACGTCTATGATGTTG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSDARG00000062686:ENSDART00000147902:18
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.038 A=NA C2=0.146
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0005319=Laminin_EGF=PD(14.3=6.3),PF153301=SIT=PU(61.9=65.8)
A:
NA
C2:
PF153301=SIT=PD(51.4=78.9)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Rat
(rn6)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]