DreINT0114242 @ danRer10
Intron Retention
Gene
ENSDARG00000086927 | pik3c2b
Description
phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase, catalytic subunit type 2 beta [Source:ZFIN;Acc:ZDB-GENE-050309-145]
Coordinates
chr11:23422062-23436184:-
Coord C1 exon
chr11:23436064-23436184
Coord A exon
chr11:23422174-23436063
Coord C2 exon
chr11:23422062-23422173
Length
13890 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAAGTAAGA
5' ss Score
6.91
3' ss Seq
TATAAGTCTTTTCTGTGAAGTAC
3' ss Score
1.51
Exon sequences
Seq C1 exon
GATCCTCAACAATCGACCTGCTGATCTATCAGACCCTCTGCTATGCTCACGATGACCTGGATATGATTGACGTGGACGATTATCTGCTCAAAATCTGCAGCCAGGCAGAGTTCCTTAAAAA
Seq A exon
GTAAGAACATCAAATCAACAGTGACTTGACAAACTGATGCATGAAATGTTTATAGTCTTGCAGAACAACCACAACCACAACTTCTCTTATATAATAGTCATATGACTATTATATTTAGTAATATATAATAGTCAAATACTTTATCAAACCAATGTTTTGGAGAATAACTTTTAGGCAAGGTGTGCTTATTTAATAATAAAAAATCGCATGTGGAACATCTAAAACTTGATTTTGGAACGTTTGAACAACAGGAGACTTTATTATTTTATTATTATTATTATTATTATTATTAGTTTATTGGTTTTAATATACAAAATAGAACTACAATAACAAAACAATTGACACACAAACCAAATACAGTAACCCAGCAAACAACTTTGTGTTTAATAGATGTCTAATAGACATCTAAATGTAGTCTGCTTGGCTAAAACAAGGCTAAACATGGGCTGTTACTGAAAATCTAATAGACATTTAATGCCGAGTTAAGACTGCACGATTTTCAAAGTAGTCGTGTCACAGGTGTTTTCACACTGCATGGCTATCTGGGGTTGCCTTTCGTCGCTGCTTTATTTACGCTTTAGGATAGATCAGTGACGGGGGGTGTCATACTGCATGACTTTGCAGTAGGAAGAATTGCCGACAACTTTGTCTCGGTCTGAAAACTACATCACTCACAACCAAACAAGCGAGAAGTGACATAGAAACAATGAGAGTTCACGTAGTATATCTTTTGTTATTAACTACATAATGAGAAAGAAGCCTTTAGTCGGGTAGAAAATGAACTTATTTTGCTCACCTGGGTTTTGAGGGGAGTTAGCAATTTCTCTTCAACTTTATTCCTTTTTGACCTGGTTGTGGTATTGCTCAGATGACACTTCAAACAGACACAGGTGCTCCTGCTAAATTTCCACTAGTTTTTCACTCCATTTCTTGGGTCCAAGTAGACTGAGAAGTGCTTTTAAATTGTCCCCCAACCCCCCGCTGGCCTGAAGATACCCACACTAGTGGATGCTGCTCAGACGTTATATGTGTAGTCATTCATTTCTGTTCATTCAATGACTAGTCTAGTTTTGGCCTATTAGACGTCTGTTAGATTTTCACTGACAGCCTAAATTTAGCCCTTATTTTAGCCAAGATGATTATGTTTAGACATCTTTTAAAAACAAAAATGCTTGCCTGGAAAAAACATATCCAATGTTTATATGCAATAAGCTGGTAAGAGGTACCATCCAAGTGCACTGACTAGAGGAAAAAAAAGATTTCAATAAATAAACTAGACAGTAAAGTTCGTCGAGACAAACTTTGAGGCTGGCTTGACAAAGCCTGTTGGTAATAGTTTATTTAGTTTAAAAACAGTTTGAAAAAGTATAAGTAGCATGTTATTAGCATGATTCTAGCATAGATTAGCATGTTATTAGCATGAATTAGCATCTTATTAGTACGATTCTAGCATGGATTAGCATGTTATTAGCATGAATTAGCATGATTCTAGCACGATTTAGCATGTTACTAGCATAGTTCTAGCATGAATTAGTGTGTAATTAGCATGATTGTAGTAAAAATAGCATGTTACTACCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTTATTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTTATTAGCAAGATTCTAGTATGAACTAGCATGTCACTAGCATGATTCTAGTATGAATTAGCATGTCACTAGCATGAGTCTAGTATGAATTAGCATGTTACTAGCATGATTCTAGTATAAATTAGCATGTTATTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTTATTAGCATGATTCTAGTATGAATTAGCATGTCACTAGCATGAGTCTAGTATGAAATAGCATGTTACTAGCATGATTCTAGTCTAAATTAGCATGTTATTAGCATGATTCTAGCATGAATAAGCATGTTACTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTTACTAGCATGATTCTAGTATGAATTAGCATGATTCTAGTGTGAATTAGCATGTTATTAGCATGATTCTAGTATGAGTTAGCATGTTATTAGCATGATTCTAGCATGAGTTAGCATGTTACTAGCATGATTCTAGCATAAATTAGCATGTTACTAGCATGATTATAGGATGAACTAGCATGTTACTAGCATGATTCCAGTATGAATTAGCATGTTATTAGCATGATTCTAGCATAAATTAGCATGTTACTAGCATGATTCCAGTATGAATTAGCATGTTACTAGCATGAGTCTAGTATGAATTAGCATGTCATTAGGTTGATTCTAGTATGAATTAGCATGTTATTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTTACTAGCATGATTCCAGTATGAATTAGCATGTTATTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTTACTAGCATGATTCCAGTATGAATTAGCATGTTACTAGCATGATTCTAACATGAATTAGCATGTTACTAGCACGATTTTAGCATGAATTAGCATGATTCTAGCATGAAGTTAGCATGTTGTTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTTGTTTGCATGATTCTAGCACGAATTAGCATGTGCTAAGGTGTTGCTAGGTGGTTGCTAAGGTGTTGATAGATGGTTGCTAGGGTGTCCTAAGTGGTTGCTAGGTGGTTGCTAAGGTGTTGCTAGGCAGTTGCTAGGGTGTTTTGAGTGGTTGCTAGGTGGTTGCTAAGGTGTTGCTAGGTGGTTGCTAAGGTGTCCTAAGTAGTTGATAGATGGTTGCTAGGGTATTCTGAGTGGTTGCTAAGGCGTTGCTAGGTGGTTGCTAGGGTGTTCGGAGTGGTTGCTAGGTGGTTGCTAAGGTATTGCTAGGTGGTTGCTAGGGTACCCTGGGTAGTTACTAGGCAAGCCTCACATACATGCTTGATAAAACATTTAAACTAAGTAAGCATGTCTAGCAAGTTACAGTACTTGGCTAGTCAATATTAGCATGTAGCTAATCACTGCTAGCATGTGTAGCATATAGGAAGTTCCGTTTGCTAGCATGAGTCAAACGAGCCAATCTCCAAGTCTCTACGATGTTCGGATGCTGAGATATAGCTGTTGATGAATGGTTGCTAGGGTACTTTGTTTTGTTGCTATGGGCGAGGTTACAGAGTGCACTTGAATGTGGTTGGCTGTCTAAGTCAAATGAACCAACCCCCATGTCTCTATGACACTGCTATGCAAAGATATGCATCTTGGCCTATTTTAATGGAAGTCTATGGAATCAATTTGGGGGCGTGGCTTGTGAGCTTCATTATCATATTGAGATGCTCATTGGTTGTCTGAGTCAGATGAGCCATCCCCCAAGTCAATAGGACACTGCTATGCAAAGATATGCATGTAGGCCAGTTATTAACATGAGTCTAGTATGAATTAGCATGTTACTAGCATGATTCTAGTACAAATTAGCATGTCATTAGCATGTTTCCAGTATGAGTTAGCATGTCATTAGCATGATTAGCATATGAGTAGCATGTTGCTAGCATGATTGGCATGTCATTAGCATGTTAGAATTATAAGCATTTGAAAGCACAGCTAATTACTGTCTATAGGACAGTTGCTAGGGTGCAGTATGTGGTAGTTAGGGGTGTGGCTAGAAAGTTAAAAGGCCATCAGTGATTGGCTGCTGGCTAGACTGAGTTAAATGAGCTTAGCCATTAGTCTCTATGACAGTCTGATGCTGAGTTATGAGCTCACAAAGTTTGATCCCATGTTAAGTCAATGAGAGTCTTTTGTAATGGAAGTCTACCGGACAGTTGCTAGGGTGCAGTATGTGGTAGTTAGGGGTGTGGCTACAAAGTTAAAAGCTCATCAGTTATTGGCAGATTGGTATTCAGAGTTAAATGAGCTCAGCCATTAGTCTGTAGGATAGTCTGTTTCAGAGTTATGAGCTCACAAAGTTTGATACCATGTAAAGTCAATGAGAGTCTTTGTAATGGAAGTCTATGGGACAGTTGCTAGGGTGCAGTATGTGGTAGTTAGGGGTGTGGCTACAAAGTTAAAAGCTCATCAGTTATTGGCAGATTGGTATTCAGAGTTAAATGAGCTCAGCCATTAGTCTGTAGGATAGTCTGTTTCAGAGTTATGAGCTCACAAAGTTTGATCCCATGTTAAGTCAATGAGAGTCTTTTGAATGGAAGTCTATGGGACAGTTTCTAGGGTCCAAAAGTGGTTGCTAGGGCGTGGCTAGAAAGTTTAAAGGTGATCAGTCATTGGCAGTTTGATAGTCTGAGTTAAATGAGCCCAGTTAGAGTTCTGTGCGACAGTCTGACGCAGAGTTACGAGGTCACAAAGTTTGGTCCAATGTTAAGTCTATGGGATTTTTCCAACAGTCCCGGGACGTTTTTCGGAAAACCGAAAGTCCAATCAGTCTGAGGAGATATAGCATACCGAGTCAGAATAGTTTGGAGGTCTGGTGTGAGTTTGGTGGTAATAGTTCGAAAGTTCAAGGAGGAGATAGATTTTGATTTTTAGAGTCAGAAGAAGAATAACTAGATTCTTAAAGTTTGAGAACAAACTTTGAGGCTGGCTTGTGAAAGCCTGACGGTAATTGTTTATTTAGTTTAAACAGTTTTAAAAAGTATGAAAAGATAGATAGATAGATAGATTAGCATGTTATTAGCATGATTCTAGCGTGAAATAGCATGTTGTTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATTTTACTAGCATCATTTTAGCATGAATTAGAATGTTGTTAACATGAATTAGCATGTTACTAGCATGATTTTAGCATGAATTAGCATGTTGTTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTTTTAGCACGATTCCATTATGAATTAGCATGTTACTAGCATGATTTTAGCATGAATTAGCACAATTCTAGCATGAATTAACATGTTGTTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTTGTTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTTACTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTTACTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTTGTTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTGACTAGCATGATTCTAGTATGAATTAGCATGATTCTAGTATGAATTAGCATGATATTAGCATGATTCTAGTATGAGTTAGCATGTTATTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTTACTAGCATGATTCCAGTATGAATTAGCATGTTATTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTTACTAGCATGATTCCAGTATGAATTAGCATGTTACTAGCATGATTTTAGCATAAATTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTTGTTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTGACTAGCATGATTTTAGCATGAATTAGCATGTTACTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTTGTTAGCACGATGCTAGCATGAATTAGCATGATATTAGCATGATTCTAGCATGAGTTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTTGTTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTGACTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTAACTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCACGTTGTTCGCATGATGGATGGATAGATAGAGTGAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGCTAGAGATAGATAAATACATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATCGATAGATAGATAGATAGATAGAGGCAGATCGATGCATCGCTCGATTCATGGACAGATCGATAGATCGCTAGATAGTTATATAGATCGTCAGACACAGGTAGGTGGTCATATCCAAAGCCATATGGCCTGGTCGCCAGAGACACCTATGAGGATTTACATATATATAAAATTAATAAATAAACACACTCATGATGACTTTAAATAAAACAAAACAGCTTAAAACGAACTGAGAGTACTAATAAAATGATATAGTTAAGTATTCATACAAGCATTGATATAACTGAGATGATTTACCAGTGAGTTTAACAGAATTGAGGTACAGAAATTGAAATATCAAACCTAATGTGATAACAATGCATAATATATGACGCATGTGATCTCTAATATTCCCTTTCATTGGTAGATTGACATAAATAACATAACAGGTAAGGTTGCTGTCTCTTTAAGACCGAATACATAGATCCCATATAATGTCACTACAGACGTTGTGACAGTGGATGATGCTCGCTAACATAAAAAGTTGAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATGGATGGATGGATGGATGGATGATTGATGGATGGATAGAGACAGACGGACGGACGGACAGATAGATATATCCGATAGATGGATTGATGGATGGATGGATGGATAGATAGAGACTGAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGACAGATAGACAGACAGACAGACAGACAGATAGACAGATAGATAGATAGATAGATAGACAGATAGACAGATAGATAGATGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACGATGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAAAAACAGTTTATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAAAAACAGTTTATAGATAGATAGATAGATAGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATACAGTTTATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAGATAGATTAAAGCAGTTTATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGATGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAAAAACAGTTTATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACGATGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAAAAACAGTTTATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAAAAACAGTTTATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAAAAACAGTTGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAAAAACAGTTTATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAAAAACAGTTGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATTAAAGCAGTTTATAGATAGATAGATAGATAGATAGATATATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAAAAACAGTTTATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATATAGATAGATTAAAGCAGTTTATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGACAGATAGACAGACAGACAGATAGACAGATAGACAGATAGATAGATAGATAGATAGACAGATAGACAGATAGATAGATGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGACAGACAGACAGACAGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTTACTAGCATGATTCTAGCATGAACTAGCATGTTGTTAGCATGATTCTAACATGAATTAGCATGCTACTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTTGTTAGCATGATTCTAACATGAATTAGCATGTTACTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTTGTTAGCATGAATTGGCATGTGACTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTTGTTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTGACTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCATGTGACTAGCATGATTCTAGCATGAATTAGCACGTAACTAGCATGTTTCTAGCATGAATTAGCATGTTGTTAGCGTGATGGATAGATAGATAGATAGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAGATAGATTAAAGCAGTTTATAGATAGATAGATAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGACAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATTAAAGCAGTTTATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATTAATGCAGTTTGAAAAAGTATAGATAGTTTTGAGGTCACAAAGTTAGATCTATTGTTAAGTCAATGACAGTCTTTTGCAATAAAAGTCTATGGGGCAGTTGTTGCTAGGGTGCAGTATCTGGTAGTTAGGGTGTGGCTAGAAAGTTTAAAGCTCATCAGTTATTGGCAGTTTGGTAGTCTGAGTTAAATGAGTCCAGCTATTAGTCTGTAAGACAGTCTAATGCAGAGTTATGAGCTCACAAAGTTTGATCCCATGTTAAGTCAATGAGAGTCTTTTGAATGGAAGTCTATGGGACAGTTTCTAGGGTCCAAAAGTGGTTGCTAGGGCGTGGCCAGAAAGTTAAAACCTCATCAGTTATTGGCAGTTAGATAGTTTGAGTAAAATGAGCCCAGTTAGAAGTCTGTATGACAGTCTGATGCAGAGTTATGAGGTCACAAAGTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAGGGGAGTTAGCAATTTCTCTTCAACTTTATTCCTTTTTGACCTGGTTGTGGTATTGCTCAGATGACACTTCAAACAAAAATTTCCACTAGTTTTTCCCCTCCATTTCTTGGGTCTAAGTGCTTTTAAATTGTCCCCCAACCCCCCGCTGGCCTGAAGATACCCACACTAGTGTATGCTGCTCAGACGTTATGTGTATAGTCATTCATTTCTGTTCATTCAATGACTAGTCTAGTTTTGGGCTATTAGACGTCTGTTAGATTTTCACTGACAGCCTAAATTTAGCCCTTATTTTAGCCAAGATGATTATGTTTAGACATCTGTTAGACATCTTTTAAAAACAAAAAATGCTTGCCTGGAAAAAACATATCCAATGTTTATATGCAATAAGCTGGTAAGAGGTACCATCCAAGTGCACTGACTAGAGGAAAAAAAAGATTTCAATAAATAAATAAAGAGAAAAAGGTATAGAAATAAATAATATTACTTAAAGAAGGGAAGTCACATTAATATCAGGCTTGATTTTGTTTTTAAACATTCTATTTCTTCCACAAAATAATTCCAAAACCACGTGTTTGCAATTAAAATTTAAAAAATAAAGTTGCACGTGATACTTCTGTGGTATTTCTGTGAGGGTAGTTTGCTTTAGAAGTTACATAATTTAGTCTTGACCTTGCAAAAAAAGGGCAATTAGCAATCTTAAGATGAAGCTTGCTATGAAACTTGTACTCACTCCAAGCTTTTTAAAGGCTTAATCTACTTTCGCTTTCAGCCTTCTTGTAGAAAAATGATTAGCCTGATCATCTTGTTTGGCTGTCGTTCATAATACAGGCCTCTGCTTGTAAATACTCACTGTTGACAACAGTTGTAGAAATTTTTTGGATGTTTGCAAGGGGATTCAGTCACACAGGCTGTCAGATTTTGCCCATAATGCCTTATGACCAAAAACTGGCGACTACTGAAAAGCTAAAAAAAAAAAAAAAAGTTCCTACCCAACAGCATACCCGATTTCGTGTTCAAGCACATGTCCATTTGAGTTGTGTGCTGAAATGGGGTGTTTCCAGAGAAACTGGCTGAACTGGAGATCTGCGGTTTGTGGTCTCCTCGTCATATAACTGTGGCCCTTCAATTGTGGTCACACATAAACAAGCTGTGCTAATGTCTGTGGACTGTTTTAACCACATTGGGTTTTCCCATGGCAAGACCACCGTAGCAAGACCAACTTAAACGTGCAAGACCACTCATACGTGTGCTCTTCCTGTTTTTCATTTTTAAAGGCCACTTGACATTTTTGACAACACATTCTGTTATTTTATTTCTCTTAAAGGGCAAAACAGACACAGCTAAGACTTTTTTTTTATCTCTGTGAGTCAAAAACCGCAGGTGTGATTCTGTTAAAGTGTGTGTTGGTGGTTTTTGCTGTGTGTGCAGCTGTGTGATAGGAAGTGTGTCTTTTCCTGATAACTGTATGCTTGTGCAGGGCTGTGAAAAGAAGGGATGTTGTGTGTATGACTTTTAAATTAGATATATAAGCATCAGTTTCAAAACAACAATGAGCTTTAGTCGTTGAGGGGCTTTTTGGGTGCTGAGACGATGAAACAATAAGCCACAATGCCAACGGTGCAGCGGAAACATGCTTTAGCGCAGTATTTTCAGTTTTTGTGCAGCTGTAACAGTGTCGGTTGTTGTTATTTTCTGGCCTGTTCACTCCATTGTTTTTACTTTCAGGCTACCAAAATGCTATTGTTTTATAAATGGACAGCCAGATTCTAAAAAGCTTTACAGTTTAAAAAACATAATGTAATGTTGAATGTTTTTAATTTTTATGTTTGGTTCTTTAAATACGCACAAGCTGCAGTTCTGAAGTCTTGGGTTGGTAGGATTTTCATTTACATAAAAAGTACTTTTTTTTTCTTTTGATCAAAAATAGAAATCATTTGATATAATAAACTGCTCCACAGTGTTCCTCATTTGTGGAACTTGTCATAGCTAAAAGCATTAACCAAACTAATGCATTTGGAGCGCTGATAAAATGTCTTATTTTTATGAATTTTAAAAACAGTTGTGCTGTTTGATATGTGGAAATGTAGTGTGTTTTTCTTGAACTTTAAAACAACAACATAGAATTAGATTTTTTTTAACATGATCAATTAGTTTTAATGAATTGAAAGGTGCAGTATGCAACTTTGAAACCCAGTGGTTGAACTTGGTATTGCACTCCTGGATCAAAACAAACGCAAGCGCAGGTTGTCAAATTGAGGACAGGAGCGAGTGGTTCAGACTGTGTTCTAAATAAAAGCAACGACACGTAATAGAAGGAATATTTTCCATATCAAAAGGAGTTTTTGTACTAACCGACACCCTGAATTGATATATTAGCAACGGCTTCTATTTCTCACAGGTGAACAACAGAAAATTATGACAATGATCACCTCAAGTAAACCTTGTGTGCTTTATTCAGTGTTAAATGCTAACAATGAGTTTGAATGCCATTTTATATGACATTTATTGCCACATACTGAAAGCAGCAGCAGGGAGTTTCAGATCTTGAAAATAAAATAAACCATTTAAAACTGAACTTTAGAATATGAATGATTCAGTATTTACTTTTAATAATGTTAATGAGGTTTAATATAAATTAATTAGATCATAAACCTTACAATTTTGTGAGTGCATATTATGTGCTTCTGAATGGCTGTATTTAAATTTCTGTCGTGTTCTGTCTGATACAAACAATCAGATTGCTTATCGCTGCATATCTCATCACAAAGCGTGTTGTTAGGTAAAGTGGTTACAATGTAACCTGCTCAACTAATGTCGCATTTCGGTCACGAGCACATGCTTTTAGAGCCTTTCTGAATGACCGAATAATGAAATATGAAGTTTTCCACCAATATAATTAATCAAACTGGCGTTGTGCAGGTTAAAATGACCAAAACAAACACAGCGTTCCGGCACGGAAAACACATTTTCAAAGCAGAATACCTGACTTCAGAATTGTTTTTCAGATACAAGTATGTTCACTTGGCTTGTTTCTTTAAAAGTCTGCAAACATATTATGGTATTTTTATGCTTTAGAAAAGTCAAAATCTTACATACAGCACCTTTATTGTTTATGGGGTAAATTAGCCAAAGCTATGAAAAGTTGTGTGTCTCAGTGTGTGTCTCAGTGTGTGTCTCAGTGTGTGTCTCAGTGTGTGTCTCAGTGTGTGTCTCAGTGTGTGTCTCACTGTGTGTCTCACTGTGTGTCTCACTGTGTGTCTCACTGTGTGTCTCACTGTGTGTCTCACTGTGTGTCTCACTGTGTCTATGTGTGTTATAAATATATAACGTGTAATATAAGTCTTTTCTGTGAAG
Seq C2 exon
TACTCAGACTCTGGCGAGCTTTGAGTACATCCAGCAGTGTCTGAAGTTCGACTGGGACATTCGCCTCATTCTCACCAAAAGGAGTTCTGTCAACATGGAGCTCGCCCGAACG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSDARG00000086927:ENSDART00000124810:5
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.105
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0079413=PI3K_rbd=FE(38.8=100)
A:
NA
C2:
PF0079413=PI3K_rbd=PD(28.2=76.3)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]