GgaINT0054021 @ galGal4
Intron Retention
Gene
ENSGALG00000011858 | KCNH5
Description
Uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:E1BXK7]
Coordinates
chr5:53505222-53516987:+
Coord C1 exon
chr5:53505222-53505421
Coord A exon
chr5:53505422-53516734
Coord C2 exon
chr5:53516735-53516987
Length
11313 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTATGA
5' ss Score
9.11
3' ss Seq
TTTGTCTTTCTTTCATTCAGGTT
3' ss Score
11.93
Exon sequences
Seq C1 exon
CTCTTCTTTATGCAACTATTTTTGGAAATGTCACCACTATTTTCCAGCAGATGTATGCCAACACCAACCGATACCATGAAATGCTGAACAATGTGAGAGATTTCCTAAAATTATATCAAGTCCCAAAAGGCCTTAGTGAAAGAGTCATGGATTATATTGTCTCAACCTGGTCCATGTCGAAAGGAATTGACACAGAGAAG
Seq A exon
GTATGAGTACGTGAGGTAACAATTTAGATAGAGTTTGTGTATTTTATGCTTTCTTTGAATTAGAACTGTGTAACAGCATGTAACTTACTAACAAATTCTTAACTGCATGCTACTCCTTTATTGTGGTTGTGGTTGGACCAAAAATTGAATGTTGTCAAAAGTGATGATTGTGCCACTTTGGAAATACGCCTTTCTTCATTATGGTAAATGTTTTCTGCTTTCTGGTCTTACTTTACCAAAATGCTAAACAATTTTAATTTACTGAATTATTGAAATCAACGGGAAATTAATCTTCAAATTATGTCTGAAGACAGAATTTAATGTCAAATCTATACTAATCGGTATTTTCTGAAAAGTATTGGCATCTGTGAGTTGCAATGAAATGAGTTTGATAGGCTTGGACCTTCTGCTGATGCCCAGGACATCGACATACCATCAGCCTAATTAGTATAGGATTTAATGGCAGTAGGGATTGATCTTGAGCTGAAATCTCTCAGCTAGAACTTAAGGCCTTTGGTTGCTAGGGAGATGCAGAAAATGTGGTAGTGTTGGCAGCTGTGCTGGGTGGAAGTCCTATCTGACTTTTGCCCTCAGAAAGGAGTGGTTATTCAGCTGTCTTCAAAGGTCTGTTAAGGAAAAGGTTGTCTACAGAGTGTTTCATCCATTTTCAGGTTGGACCGAGTGAACTGTCCTCCGAGCTTCTCTCTCTAAGATATGTGTAGTGGAGTCTGTCTAGCTTTGGGCTGGATATTTTAGAGGGTTGAAATCAGATGGGAGGGTTTCCACCTGCAGTGCCTAGAATGAAGGTTTTAAGATATAGAATTTCTGGAGACTGGTGATGCTCCTTTGACATCTGTGGAGCTGATACACATCAGCTGAAATTAGGCTCTCAGTCTCCAATTTCCATGAAGATTTGCTGTCTGAGAACTTAGAAAGCAATTTTCTGAGGGAAGGCAAGGAATTGTCATGGCAGATTAATGTCCTAAAATGTATAGTGTTTACAGAGCTTTGAAGTTCTTGCTTTGTCTAAATCTATTGTGTAGTACGGGATGATGATGCAGTTTGTTCAGACATGCAAAATTAAAGTTGCTACACTGACAAATTTAGTTTTACATCATGCTGGTGCAACAACAGTTATCATACTCATTTTCTGCAATGAAATTCAGCTTACCATACCAAATAAAACAATATTAATTAGTACAGATTTTGATTTTTTGGTTCAGTATGCCTCATTCTTTAATATGTTTATTTCTTATACACTAATACCCTAACTTCCAAATGCTGATTCATACAATGTTAGAAGTGAGCTTTTCTATTGTAAACTACTAAGAATACATTCAGTCTTACAATGTAAACTCAAAAACATGTAAAAATGGCATTTTCATTTGCATTTATTTCCTTGTAGCTAAGCCAGAATACTGTATTATTCTGCCACAGTTTCATTAGATTTTAATGATGCTCTGCAGTTAATGAGGAAAACCTATGCTTTAATTACTGAAATTTCCTTCCATAGTTTCCACATGTCCGGTTTTATAGCTTATAAAAATGCAGTTAGAGCTATAATCTTCAGCTCATGGTAAGCAGTGTTCTCTGGTCTGTAAGACAGTAATGGCTGCTTAGCTAGATAATTAATATGGCTGTAAAATCTGTGACTTAGGTTTTTAACAATTTTCCCTTGGTAAAGACTTGCCTAAACTTAGGCCTGGATCCAAAACCTATTTATAACAGTGGAAGGATTTCAGGAACCTCTGCATCTGGACATCAGTATTTGGATCTAATCGAACTTCCCAGAAAAGCCAGTGTTGCAGAAGAACAGAGACGAGATAAACGTAAGAACTTGAGCATCGGTTTGAATATGTTGGTATTTTGTATCCCCTACAGCCTGCAAGTCTGCAAAAGCAACAGCACCAGCAGCCCTTAGTGCCCACACTGAGCATCCCTGAGTCTGTATGAGTTTAAGGCAGTTTGCTTTTGGCTTCAGGACCTTAACTGAAAATTGATGTCGTGAAGTGCAGATTGGTTTTGGGGAAGGGTAGAAATCTGTTTCATAACAAAACAGCTTTTCTACCTCTAATTCCACTCAGGACAGTGTTGTGATATGCTTCACCAAGACAAATTAGAAAATATAAATCCCAGCTGAGAGTTGAGGGGAACAGTGGTACAGTTCCAGAGACTAGTCTTGTAGGGCTGAGCATTCCTCTTCCATTAGTTCCATCTTTATCCCTTCAAGTCCATTTTAAGGCACTCTGCATTTAAATTGAATCCATCTGTGCTAATCCCAGAGCATCAAGTGGATGGGAGTACGCTATAGAGACCTCCAAGGTACACAGGCTTAGATTTATTACCATAGGAACAGTGAGGTTAGCAGGACTACGCTGCACCTGCAGCTGAGCTGCTAAATCCAGGCACTGCTCCAGTGTACGTTGGGATAGTATCTTGACTAGCTTCGCTTGCTTAGCTTAGCAGCCTGGACACGGCCTTAGGAGCTCCTTCCAGTCTGGATTTCAGAGCTCCAATAGTGAGATCCTAACCAGTCTGTAGTTCATACATTTTTGCATCAAATGATTTCCCATTCCTGTTCTTTTTAAGAGTCTTTCAATAAGCTTATCCTGTATGCTCACAACACGTGGAAATTAGAGAAGAGTTTCTAAACTTTCCAGTTTCCGTCAGACAGTTTCCGTCATCCACAGCTGTTTTTAAACCTAACATACATTATTACATCCTAAACTGTTCCAAATATATCTACACTGTCACACTGGAATGTGTTTTGCAACATCATTTGCCACAGATTTACAATACATTTCATTCAGTCACTCAACGTGTTGAAATGGCTTTGTTTTGAAATCTAAATTCAGAGGACAAGAAGATTAATATATGTAAGAAGTGTTACAGTAGGTTCCTATGGTGATAAACCACCCTAGCAATTTGAGGTACTAAAAATAAGCATGTGTATGTGTTTCTTTGAAAACTAAAGATTTTAACTTCATATACTTGAAATTGAAGTACACTTCATGGCTTGATTGGAATTACTACCATTTAACATGTGTAGATGTGTTGTGTCAGAACTCACGAATCTACCTTTGAATGACACTTCTCTAAATAAGGTCTTAGCTAAAACCAGTAAGGATGAGTCCATTATCAGACACGCAGCAAAGACGAAGTGGAGGTTAGCATGGAGAAAAATTAATGAAGGTCTAATCGTTGCTCCTTGTGGGAAATGTCTGTCTCAAACAGAACTTTGTTTTAAAGCCTCCATTGATTGTGTTTACACGTGGGAGAGGCCTTGTTCTCCCACACCGAAGCGATGGTGCCTTAAGCACACAGATTAGACTTCACTGTTCTCCTCGGGGATAGCTCATCTTCGAATCCCATCTTCAAACCACAGCACTTCAACCCATCTCTGAGTGTTCACAAATGAGGAATTAACAATGACACTAAAAGCATTAGTGTATTTATTATTATTACTTAAGGGGAAGCAAGTGGCCTATGATCTATAATCTTAAATCACTTAAATGTTAAAGCCCTGCTCTGACAGCTGGGATGATGTATGTAGTACATGCACACGGGCTCTGTCTGCTGGAGTAACACTGGCTCAGACGAGATGGAATTTATTCTTACATTTAATACTGTATGTTTTGGGGTTATTCATCTAATAGTGACCAAAACCATCAAAAAACTAATAAACCCTTATATACTTAAACAGTATTTCTGACACAGTAGAATGTGGTCTTGGGGTTTTTTTTGAGAGAGAGAGTTATAAACAGGCCAGTGCATTCTCTGCATATGGTTACTTTTAAGCAGCTGAAAAAAATCCTTAGAGCACTAATCTATGAAACACACACTGAATTCAAACCTCTTAAGTTTTTATTGAAATCTACTAGGCAGCAAATGAAAAATTTATAGATATTAGCTCTTCTATGAGAAATAGGGCATTATACATGAAAGCAGAACAGCCATTAACTTACACACAGATGTCTCAAGGTCTCATCTAATGATAACGTTCTGAAATGTCAGAGATTTTCTGTTCTTGACCTCCATGCTGTTGTATGGCTTAGGATTTGCTCAGAAAGCAATTAAATAAATGTCTATCATGTTTTAACAGTCAGTTTGTTCAGAAAAGCTGTAATGCTTCTATTTAGTCTGAACGTAGGCATCAGTGGCAATTCAAATGAATGCCAATTCCACATTGAAATGACTGAAAAGGAAATCATGGGAAAGTAGTATCAAAACTATTCATTGCTGGCCCACTAAGCTTTCATTTAGGAGAGATAGGTTTATGGTAAATAGACACAATTTGTAACTTTATTAAACATTAGTCTACGAAAGTACAGCGCAGCTTAGTTATGTTTGTTCTTAATAAGATCTTCAAGAGCTACAGTAGGAATTAGCAATACCCAGAGAAAAATAGGGAAAACAGGCTGCCATTCCTACGGTTCCCCATTACATAGAGGTGTCTGTAATTGCTGGCTGGATTTTCCCTGGATGACTGATGTAGAAGGCTTCTGAGCTTCGTGGCCAAAGAGATCTACAAAATTAGGTGTGACAGCTGCCCACAATCCCATGCTGAAGAGGGAAGGTAAAAACCATTTGGACAAGTATTTTTGTTTCGTTGTAGAGGCGAGGTTGTTGGTCGTTCCTTGCAGATCGGGACGAGGTGAACAAGAAGTCTCCCCTCACCTCAGAGAGCTGAGCTAGGACCAGGTACAGTTGCAATCCACGGTTCTTCGGAGAGCGGGCTGCAGGAGAGATGGTCAGGGTCTCACTGTTCTTCGCAGAGGTCCAAGCACGGGGCCTGTGCACCAGTGGGGCTTTCTGTTTCACCTTAATGAATGGTATGGATGATTCACCTCCAGTATGCAATGTGCAGAGCCAGGAAAGATTGTCCACAATTACCTTTGTCTCTTGGATGTGCTGACTTTGGGTTGATACAGGTTAAACTATATGAACCTCTCATACTTGAGGAAATGCCAGTTCCATAAATGATGGCTGTAGGGCAGCTCATGAACTCTTTGCCTGGGGGGTAGAATCACCTGTTGTGGATGGGCTGAGTGTTTTCCCGAGCACTGTCACCAAGGGGATGTTGCTGACAGAGGGACTGTCAGTTCTAGAGACCACACCTTGGGGAATGATCACATCTCAGGGACCTCCAGAGGTCCCTCTTTGACTCTGTCTTCTTCAGATCTGTTTTCTTATTACTTTCCCCCTTGACTGATATTTTTACAAAATGCTGCATGTTAAAAAATTGAGCCACTTCCAGCAGAAGCATGAAATAAAAACTGTTGATCAATTCCATTCTTCCAAGGGTGACCTTTGTGCCAAAAGTTGTCAATCTAAACAGTGTTATGACTTGAGAGATTCTTTGATGTGAGCTGTATTATTTCTGTTGTTTGTTTTTCTTTCTGTCACCTAAAAAAGCATAACTGTAATGATGAAATTCCCTGTACTGTGCTACCTTCTGCCTCATCAGAAAGTCATGATTGTGCCTGGGACAGAGCTTATTGCAAAACCGAACTCAATAAAGCCTGTAACTGTACTGAAATTTAGACAAGTTGTGATCCATTACTTTTGCCCATCAGTGGATGTTTTTAGTGTGGTTCTTGCTACGTTTTCCTGTATGTTAGACAACTCAACATGCTCTGTACTGAAGAACCAGTTCAATCCTTACAGCAAATTGTGATACTTCTTATCTTTCTGCAGTTTTCCAGACCTTTAGCCAGATCCCATTGTGTTTGACCATACTGAATTTAATGTAGAGATCTACAGATAATTTAATGTCTCTAACGTGTCAGTTAAAAGTGGTTAGTTTTGGTATTATACTACTAAACTTTACCATTGTGATCACTATTTCAGGTCACGTATCATTAATAAGAAAACAATTCAAGCTCAGCTTACTAGACTTGATTTTTCAGATCTGAGCATTTAAATCCAAGTGACTTTGGAATTTAGACAATTAGTGCCAAGATATGCAGTGATGTATTACAGATTACCCTAATGCATGCAGGGTTAATAACTGCTCAGTTTCATACATCACCTTTGAGCTACTTCCAAAATTATCTGCTTATTACAGGAAAATGCTCTGCGATTTGCCCATCAGCTGCTTTCTTCCCTTTGTCTCTTTGGCTCCAGACCAGTGCAAAATGTAACACTTGCAGCTTGGTCTGCAAAAGAATTCAACACTCAAATGAGCCAAAACCTTCTAAAAATCTGAATAATTTGGTCAGGTGCCTAGAAGGTGGTGTGTTTTTTGGAAAGATTTGACCTCATTTACTGCCAGATATGTCTGAAAGCCCAGAGTGGCCTTTCTCCAGAAAATAAAAGGACCGATCTGAACTATGGCAGGTTAGAAGCCGTAGGAGTTCATTTATTATTGAAGTTGACGTTACTGAAGATCTCCAATACTTGCTTCAGTTATTCATTTAAAAAACAGTCCTTGTTATTCCTCTGGTAAGACTGTCTAAGCTCTTCATTTGAACGTTAATCAATATATGCTCAAGTACAACCCTGAGAAAGTGAGAATTTTGTGTGCTGAAAGAGAATTACAGACAGATACCATTTGTGATTCACTGGCCTCTGTCCTCTTTGTTAACAAGCCTTAACAGATTCTATAATATTTGCTAAGCCATTCCACAGTGTTTTATAGCTGGCAAAGATTTTTTTTGAAGTACTTAAACCCTTCCTAAAAGCTATTATTTGGACACATTCTTAATCTGTACAGTTTTTGTTTCAATTCATTTGCTTTTCTTTGAGTTCTCTATAATCTCTGCTCCCTGTAGAGCACTTTGAACTGTGCAAGGGGCTTATCTTAAACTGCCTGAGCACGTCAAGGAGATGGATGGGAGAGGGAAAAAATCAGATTGGACCTCCTTGGGAATTTTATTTCCCCCTTTCCAGATCTTAAGTGGAAAAGATAGCAAAGTATTTTATGCCAATTCCCTGGGAGTCTTCCAGAGCTCTTCCCAATCTCTAGCAGCAACCATGAGCTTTTCACTTACCACCAGTGTTTCGGATATGCCATAGGGTGTTATAGAGATAACGGCAGTGCTGAGTCTCTGCACTGAGTACACTTTGCTTTGTGTCAGCTGAGTGCCATGGAGCAGAGAGTGCTTAGGGCAGAGCTCAGCAATTGCTTTATAGTGACTTTGAGGAGTTTTAATTTCCTACAAAAAGAAGGTAGATGATAAATGTTATTCTATGCTGTACTTTCTCTTCTCTCAGCTTTATAGTGGTTCAGATCTTTGTGGATGCATGTGCACTGTTCACGTGTGGCATGGATCCCAGCTTCTTCTAGTTAGAAATGCCACTTACACAGTCAGGTTTTCTTCTGGGGAGGCCTCAGTTTTCTCCTTCAATTTTGCATCGAAACTATCAGATTCTATTAGGTTTTTTTTAATGATGTTTGGATGACTGTGAAGTCTGCGGCTACAGACTTGTTATGGAGCAGCTTCTGTAGCAGCACAGGCATCAGGTCCCTGGGGTCAGCTGCTCTAAGCTGTGTGCTCCAAAGCCATCAGTTAGTAAAGCATTGCAGTCAGCAACCTTAATATCCTGCCTTACTTATAAACTGCAGATTTCACCAAGAAAGGTCTTGAATCCTCTAAGGAAATTTCCTCTTCAAAAGCTTGTCTTGGTGGTTTCTAGATATACTGCTGAAACAAGGATTCAAACAAATGTCCTGGCTGAACTTTCACTCTGCTAACAAAAGTGCTGAAGGCATTTCACTAAAAAAGAAAAGACAGATTGAGCTTTACAGGTTATCTTCTTCCTTAAAGTGAATTTCTTTTTCCAACCATGTAAGTGCATCTGAACGACCATAGGACCCACCTACAACTGTGCTGCTACCTTTTTAGCTGCATGCTACCTTGAAAGCGCTGAGGTCTCAGTTAAGAGCCTTTCACAAGAGGAATGTCTAATTCTTGTGTTATCCAACCAATAAAGGATCTTTTTGAGAAGTTCTCAAGTTGAGGTGCTCATTTTATCATTTTCTGCTCTTATTGTGGAAACAGGAAAATTACTCCCACTCTGTGTTGCCAACAAACCCTTTTAACAGTAGAGCTAAAAGTGATATCAGAGAAACTGATGGTTTCTTTGAGACTCCTCCTGAATTCCTGATGTTGGTATTTGTAAACACAAAAGGTATTGCTGCAGTCAGCTTGGGGCTCATGAACACTTGTCCTTGCAGCATACACTAAATGCATACCTTGATATTGAGATATCTTTTACTTCCCTCCCCCCCGTGTATGTCTGCATTTGTCTTGATTAGTCAAAGCCTTTTTACCAAATCTTTCAGTACTAAGTAGTTCTTTTAATATTGTTATCTATTTCATTCTCTGATCTCAGTACTAGCAGAGTAGCAGGCAATAAAACTGAAGTAAAGAATATTCATCCCTGGCTAACTCTTGGATCATTACTCATTTACTGCTGTACTTGTTGATAAATGATATCTCCATATATCTCCATACAGTAATATGTCATTAGGAGAATCACGTTATCACAACATCAGCAAATTCCTGCATTATGCTAAGACTGTCTTTTTGTGTGCAGTGGTATTTTTTTCTGGCTCTTTATTTGACGAAGTGTGATGATAGATATGTTTGTTTTGACTACAAGAAGAGTAACGCTTTGAGCTCTCATATTTAATAACCTGTATTTAACTCTGTATTTGTGAGGAAACAATATGCTTCTTTGCATCCACGTTGCATTTTGACCAGCTCAGTTTGTTTACCCTTCAAAAGACAAAGGGTCCTAGAATGTACCTGAGTCTTACAGTGACATCTTCTGCAACAGTTTAATCAATTTTGGATGCATGTAAGGCATCATGCAGCTATTGTTCCTGCATTTTGGAAGCTTAAAAGATAGAATTTGGAAATCAAAATCATGTGTGAATATGCACATTTTTCTTAAGAGCAGTGTTGGAGAATTCACAGCCCATGGCCTTGTTAAGTCAAAAGCAGTTATACTAGTGGAAACATTAGAGACATGAAAAGTTCCTAACAATGATTTAGACCCAACAGGAGATAAAAATGTTAAAAATCATCAGTCACGATGCCAAAGAAAGCAGAATTTTTTCATGCAGTTATTATTGAGAACAAAGGTGGCATGCTGCTATTTTAAAATAAAGACGAGCTTTCTGTTTGATCCAGAAGTATCCAAATGTAGTTTTTAAACCAGAGAAATGAAGGTGTCTTCATATTTCTATTGGTAAATGAGATAACTCAGGTGAGCGTAAATTTGTAAAACTGACATTTGCTCCTCATAAAACTATGGAAAAAGTGATACAGGATCTGTTCACCATTGACTCAGACAAGACATTATTACTGATGCAAATGATGGCTTATGGAGCATATGTCTTGTCAAATGTGTTTTTGATTAATTTTTATGATAAAACAGACTTAGGGTTTTTGAACCTGTTCTGTAGAACACTTTGTTACAGAAAAATAGCATTAAGCAAAATTAACCTAGTATCTATCAAATCAAATATAAATTGATTACCTGCTATATCTGGGAGGGTTGTTATAAGTGAGACAAGTAAGTTTCCAAGGGGAAAGGTGCATGGTAGACATAAGAAGCATCATCTTTGTTTTTTATTCAAGTTGAGACTGAAAGTTGACACAATCGTATTTTATAAACACCAAGGTGTGGAAGAGATTGCTGATGATTGCAGGTCTTCTATCAGAGCAAGATGATGAGAACCTCTGGCTATTAGATGAAAGCCAAACAAAACAGATTTCAGAAACAGCATGTTTTAGAAGAGAGTTGTCCATTGGTACGACTAACCTATATAATTTGGAAGCATTAAATCAAGGCTTTCTAGACTATAATTTTACCAGATATTTTGGGACTGATATGACAAGTATGAATGAGCTGACCCATAATGGAAGAGGTTACTACATATGGTTGCATAACCCCTTGTAGACTGGGAAAGTATATATCCATGTGCAAACTTGCTGTCATAGTACAGAGAATAAGAGAATGAACTCCTCTTTCAGCCTTTTACATTCATTTTGTGTTTGACAGCAAAACACTTCGATCTATTGAGACAAGAAAGGAACTAGTTTATTAATCAAACTAGAAAATCATCATTATTGTTTTCCCATTCTATGCTTTCGGATCTTTTAGTAATACTTTACAATAACTTGTTTTATACCTCTTCTGCATTAAACAAAAATGAAAGTCATGGGTTTACTTCTGAATTAATATGACCATTTGCCTCTAAGTCTATTCAGGGTTTCCAGAGTCTCCCTCTGTTTGCTAATTTTCAATGCTAGTCAGCACCTTGACCCAGGATCCCTCTCTCACCAACTGTCTGCAGAGCAAGCTGCCAGATAAATTCCATACAATGAGGAATTACTAAGTGCTACTGATCTGCATTCTTCTTTACATGACTCTTACAGAGTGCTCTTCATCTTCTTCCTTTTTTCATTATTTATCCTGGCAAAACATTACAAGGTTTTGTATGTTTCTGAGCGCAGTTAGCTTCCACGCAGAGAGACATGCATTTCAGAATTACAGGAATGCTGGTGTGTTAAGGAGGATGTGTAAATATTAAACATTTTATACCTAATAACATCCACAGGTTTTCATTTTTTTCTTCAGGTGTATTTATTTTACTGTTTCAATAGGGAAAGCTATTGAAGGTAAGGACTTAATTAAAGGCCTTATTTAATTGATCTGCAGTAAATACATCTTCACCTTTGCTGGGCAGTTTTCATTCACCTTTACTTTACATTTCATAACGTTTCCTAGTACTTTCTTTTTGCTCTAATCTCAAACTCTTTGGGTTTTCTAGCCTGTAAGCCCTCCAGGGCAGGTTACTTACTGTATGTCTGTACAGTGCTGAAACGAAACCCTAGGTGTGTTTGGATACGTGTTGGTAAGTGGTCATCTCCATCAACACTTTTGAAGATTAGGTTTCCAGATGTGACTAAATCTGTCGGTTTGGATTGTGAATGGTCTCCTTTGCACATCTTCAAGCTTCTTCAGCTCTGAGTGTCCATCCTGTGCTCCTGCAGGGGCTGAGCATAGCAGTGGGCGGATGGTCTAGGCACCAAGTATGGAGGGACAGAGACAAAGCAGTGTCACCTGCAATTATGGAAAACAAGTGTGAAAGGGTAACAGAATAGCACCACCCTTTCACCTTTGTTTCTTGAAGCAATAGATGGGTAGAAAATTAATGCTACCTCATTTCAAGATAAAACTCCCACCAGAAGCTTAAGATCCACCCAGACGAAACTACCAATTCGCTTATTTCATACAGCGCACGCTGTCGCACTGCCACGTTCCCAGCTGATTATTTTTTGTCTTTCTTTCATTCAG
Seq C2 exon
GTTCTCTCGATTTGCCCAAAGGACATGAGAGCAGATATTTGTGTGCACCTAAACCGAAAAGTTTTTAATGAGCACCCTGCCTTCCGGCTGGCCAGCGATGGCTGCCTGCGAGCCCTGGCCGTGGAGTTTCAGACGATCCATTGCGCCCCGGGGGACCTCATCTATCACGCTGGGGAGAGTGTTGATGCTCTTTGCTTTGTGGTCTCAGGATCCCTAGAAGTCATCCAGGACGACGAGGTGGTGGCTATTTTAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSGALG00000011858:ENSGALT00000019345:8
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.021
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0052026=Ion_trans=PD(4.5=14.9)
A:
NA
C2:
PF078836=Cupin_2=PU(65.1=48.2),PF0002724=cNMP_binding=PU(45.5=47.1)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]