GgaINT0068424 @ galGal4
Intron Retention
Gene
ENSGALG00000015538 | KIAA0232
Description
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Coordinates
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Coord C1 exon
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Length
9376 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
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Seq C2 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSGALG00000015538:ENSGALT00000025047:5
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.317 A=NA C2=0.189
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF153761=DUF4603=FE(85.5=100)
A:
NA
C2:
PF153761=DUF4603=PD(2.6=91.9)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]