GgaINT0090286 @ galGal3
Intron Retention
Gene
ENSGALG00000009158 | CDC42BPA
Description
NA
Coordinates
chr3:13327716-13339867:+
Coord C1 exon
chr3:13327716-13327833
Coord A exon
chr3:13327834-13339749
Coord C2 exon
chr3:13339750-13339867
Length
11916 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
ATGGTAAGT
5' ss Score
11.01
3' ss Seq
GTTGTGTGTCTGCATTGCAGAAT
3' ss Score
8.67
Exon sequences
Seq C1 exon
GGAGATGCTACGCGATCCAGAAATGAGAAATAAATTAATTTCTAACCCAACTAATTTTAACCACATAGCACATATGGGTCCTGGAGATGGTATACAGATTCTCAAAGACCTTCCAATG
Seq A exon
GTAAGTGCAGAAGTATATGTGAGAGTGACTTACTTCAACAGAGTCTGCAAATAAGAAAAAGACAAACAGCTACAATTTTGGGTGTATGTTGAGAGTGTTTGATTTCTTTCACGTCAGTGGCAATGTGCCTAGGTAAATGAAGTGGAATATGCTCAGGTGTTAGTGATTAAATGAAGAAGATGACACTTGAGGGTGAAGGAAGGAATGCCTCCTGGGTTCTAAGACAGATTGGTCTCTCGGTGCTGGTTATTGTTTTTCTAATACATAAGAAGGTACAAAATTAAGAGGATTTGTGCCAGGGTTCTGTATGGAAATGCAAAAAGAGACATTCCTTTCTTCATGAACTATATTACTGTAAGTTCAATTCCTTTCTTCTGTTCTCATCCTTACCTCCAATTGAGCCTCTCCCTTTCCAGCCTCTTCTCTTTAGACAGTGAAACTGTGGGATTTTAACAATGTATAGTAACCAAATTTCTTTCTATGAATAAGATGCTATTTTTTCATTTCCATTCCAAATTAATTAGTATCAGTGAAACAGGACTTCTTACTTGAATACTGACTGTAGTGCACACATATGTTCGTTTCCACAAAGCCTTATTTATTAAATACTCACCTAGAAGTTAGTGTAGTTTTTGCTGAGCTACAGGTGAATTAATACTAGGAGTTTGTCATACAGTTTACTTTTAGCTGTGTTGAGCATCTTGCTTGTGTGTTCTGTATTGCTTTCTAAATTCATTCATGATAGCTGTGATTCAGGATATGATAATGAACTCTGTGACAAAGATCAGATTATATGATACTAGTAGATCATATGAGTACCTCCGTAAGACATAGGCATGTAGCATATTTGTTGACTAAATAGAAGGGAGGGATGCCAACAAGAGAGACGTGAGCATGCTCAAAAAGTGAGCACATGAGAATCTAATGAGGTTTAACAAGGCCACATGCAAAGTGTTGCACTTGGATCAAGGCAATCCCAGATATGAGTACAGACTAGGAAAAGAACTCCTTGAGAGCAGCCCTGCGGAGTAGGACCTGAGCGTTCTGGTGAACAAACAGCTAGACATGAGCAGCAGGCTTCCAACCTGAAAGCCAAACAGTGTCCTGGGCTGCATCAAAAGTGGGGTGGCCAGCATGGGGAGGGAATTGTCCCCCTCTGCTGTGCTCTTTTGAGGCTGCATATGGAGTACTGTGTCTGGGGCCACCACAGCACAGGAAGGATGTTGAAGTAGGTCTAGAGGAGATGATCAGAGGGCTGGAGAAGAGAGATTAATGGAGTCTGGCTTGTTCAGCCTGGAGAAATGAAGGTTCCAGTGAGACCTCAGTGTGGCCTTCCAGTACTTGAAGGGAGCTTACAAACAGGAGGGGGGACTGACTTTTTACACTGTCTGACAGTGATAGGACAAGGGGGAATGATTTTAAACTAAAAGATTTAGGTTAGATGTTAGGAGGAAATTCTTTACTTGGAGGGCAATGAGGCCCTGGCACTGCTGTCCAGAGCTGTGGGTGCCCCATCCCTGGAGGCTCTCAATGCCAAGTTGGATGGGCACAGGGCAGCCTGAGCTGGTGGGGGGCAGCCCTGCCCACAGCTGGGGGTTGGAACTAGATGATATTTAAGGTCCCCTCTAACCTAAGCCATTCTACAGTCAATACGGCAGTGCTGTCTAAAATGATCATCACTACTGCTTGGAGTCAAGGCAGGAAGTAGGAGGGCTTTTCAGTATCTGAAAAACTAAACATAAGTAACAGTAAGACTGGAAAAGAAACCTTGCAACTGCAGTAGTTAATGGGTTTAGGAGCTTACCTTCTGGTTTCCAGGTTCTCGTTTTATCTCACTTCTGCAAAAAAACTGCTTTATGTTACACTGGACTATAAGATCTTCATCTTGTACGTGAATCCTTTTGGCACTAGCTTTTACTTGTATGAGGATAGGCAGAGAAGAGAGAAGATTTCCTTTAAATATCGTGAGAGACACTTAGAAGAGCCGATAAGACTCAATGCAGTTGAGCAATAAGCAGTATTTTGTGTATATGCGTGTGTTTATAAATGAACTAAAAATGAAAAGGAGAGGGCTGGTTCCAGAAAACACAAGACAAATCCAGGGGAAGTTGGCTGACTGTTTTTCTCACCTGGTTGTGTATATGTACGGGTATGCTGTTTAACAAGTAATGATAATTTGCTTCAGGGCAAGAAATCCAAACTTCTTTTTAACTCTTCCTTTTCCACTGGTTTCCTTCAAATACTTCTGGCTTTTCCTTAGCAAAGAAAATAAACTGCTACTGCTAAAGGTAGGGCGAAAGATGTCATATTTCACACAATTGTTTAAAGTTCATGAGAATCAAAAGCCAAGAAGATTCTTAATCAAAACATTGCCCAAATCTGTCAACTGTAAAGTAAGGAATAATGTTACCTTAGATGGAGGTTTTCTAGATTCTCACCTGGATTAATATTTTTTCAGCTGTGTCATCACTAAATGGCTTTTGGCTTTAAATTCATTCCAGTTACACAAGTCTTGTATTGGGTCAAAGGTCATGTTTGGAGATACGACCAGTACTTTGCTTTTTACCCATCAACATGATGTTTTAAAAGAAATTTAAGAGTCACTTTCTACACTTAATATTAATGAGAAGACAATAAAAAATGCTAACAGTATAGAATTGGCTTCTGCACTTGTTCGACTGCTACAGCTTCTTTCTAAAGTTGCTATTGAAAACTCCCTTGTTGCAAGTAGTCTTAATGCTTAGAGAAATCACTGCAGGTAAAGCAAATTTGATGTCTATTATCCCAGTAGCTCTTTGCTGTATCATTGTTTGTATTCCTTCCAGTACAGCACCAACCATGGGACTTAGAAGTAGGTGAACTTGAAAGTGTAACTTGAGATTAGGAAAAAGAAATTCTGTCAAAATTGAATTCTGCCCAGGCAGCTTTCTCTTTTCTACCAATTTCCTGTAAGGTGTATGACTGGACTAAGTCTCAGCTTATTCTGATCCAAGCTGCCTGCTTTGTGTTCCTTGGCATGAAAACAGAGCACAAGGAGCTGTGTTTGCAGCTGACAGTACATTTTGAGTCCAGAGTTTTATTTGAAAGACAAAAAAAAATAGTATAAAAAGAGAGGGTGGATATAGGACATTCTCTGGAAAGTCAGTACATAAGGTAAAGAATACTCATCCAGCCTTACATGCAGCTCATCTGTACAATAGTTTCTTTTCAAAGACATAAAATTATTTCAGTAGATTCAGGCCTTGTTCCAAATGGTGAAGAGATTTTGTGTGTGTTTCTTAGCATGTGTGATTATTTTGCAGTTGGAGTATCTTTATGTATTAAATAGGACATAATTTTTCAGAAGAAAGGGTATTTATCCTTAAAGATATGTGGGAAAAGTTGCAGCATTTTACTTTGGGAATGCTTTGTTTTGTTTGCCCAAAGGGTATGAGGAAATACATTGGAAGGGTGCTGCCACTAGGGGGAACAAGTAGCGCAAGGTCAGTGGTTTTCTCAAAGTGCCATCATCCAACTATTTTAGTCGATGCTGTTTATAGAATGCAGAAAGTGAATGAAAATGGTAGACCAAGCCTTTTTACTTGCTGTTTCTTCTTGACTTATTCAAGCAATTTCAGATTTGGCTGGATATGCTGATAGGAATTTGTTCATCCAGTGTGAGTTTTCATGGAATTTAGTCTGGTATTATGTAGGCAGAAAGGTCCTTATTAATAAGATTTGATAGAGAATGGATATTTTAATCTCTGCTCTGAATGATATTGTCACAAACTAACTGCCTAGCTTTTATCTAGTACCCATGGGTGAACTCTCTAAAGCAAATGACAATTTAAATTTTCATTTATTTATTTTTGTTTATGATATGCACTATATACATAGTGTGTGTATGTATATATAGTGTGTATATATATGCATGTATAATATAGATATAACATACATGTATACATGAAGTGAATCCAATCAAAACTTGTCTCTGCATGTCCCACTAGCCTGCCTCTGCTACCTTTTTCAGGCAAAGCGCCTAGAATTGAACAGAGCATTGCATTAAAAGTGGTATCAGCAGCCCTTGCATGGCAGGCTGCAGTGTACCAGGAGGGCAGGTAACTGCCTGCTGGATGCAGGGCCAACAGGAGTTTGCTGGCTGGCAGCTTACTGCTCTGTTGTGTTTTAGAAGATCAACTTCAGAGAGCTTAATTTGAATTGTAAAAGTACAAAATGAAAATCAGATAAATGGAGAGTTTAAAAGACTACTGTCTGTTTGATGTGCTGTGTACAAAACAGATGCCTCCATATGCACAGCATGGCTGTCTGCATGTGAATGTCCTTGCTGATGCAGCCACTCAAGGGGAAAAGTCGCTTTCTCTGTGTGTTGTTTCCAAAGTGTTGGTATGCAACAGGTACAAGAAATGAGCAGTGAGATGTGTTTATGGCAAATTGCAGCCTGGTCCCATGTCTCTCTGTGATGGGCACTCTTGTCTTCAGCACAGTCCTGTGTTTGCACAGAAATGAATATGCCCAAGGCTCAGAATGAGATCACATTTAAAGGAGAATATATTAGAGGCTATCAGGCAACTTTGCATCCTTCTTTTCTTCATCGCTAGCAGTTACTTAGGAGTCTGGCTTTGACAAGCAAGGATGTGAGCTACAGCATAGCAGAAACTAGAAATTCTTAATTGCTATATGCAGAGCTGTAATCAGTACAGATTTGTATTTTATTGAAATGGATACTCGATTGGGGTCATTGTTTTGCTGTGTAGAATGGTTCGTGTTAGTATATCCCCAAACTTATTTCTGTACGTGTTTTTCTTCCCTAGCAGCCTGTCACCAATTAGCTGGCCGTACAGTCTGGCCTCCCTTCTGCCCTCTTGTCCCTTGAAGCCACTTTATCGTGGATGCTCCTTTGTAGTGAAGATCTGAAATCTGGAACTGCACTAACTGCAGCACAGACCACCTCTCTGTGCACATCAGATTTACAGGATTGATTTTGCTTTCATATTCTGCATGCCTGAGTATTTTACATACAAAAGCTAGTCTCAACTGCCATTATATTTGAACATTATGCTTCAGTTTGATCTCATCATACATGAGCCATTATACTTCCATTACAGATTATGTGTGAAGCTTTGCTTGTTTCAAGTGAGAAACTTTCAGAGTAAATATATACTTGGTATTCTTTAAAGAAAGTGGGAGCCGCATGCATGCATCTAATGGCAGAGTCCGTGGAAAGAGTTCCAAGGATCGTTTTTAAAATGTTGCCATATCGTGGCTTTTTCACATTCATGAATGCTGGCTAAATATCTTCATGGTCTGCAGTTGGCCTACTCTCTGCTTTTCAGCTTGCGATTTTAGACTCTCCCTTTTCTCCCTCATTGGCTTTTAAGAATGTAGCTGGCTTTGCTGCTGGCTCTCTTGGTAGCGGGTGACTCAGCAAAGTCTGCTTTCATGGACCATTATTGGAATGGTGGGTTCTAGTACTCGTATTTAGATGCTGCTAAACTTTCTAATAACAACCTAATGTGTATTATGTCTTACATGCCATAATGTGGTAATTGATGTTTCATTTAACATGCAAAGCCTCATAATACCTGTGCGTTTTTTTTTTTTTTTTAAACAACAAAGTTGGATTTTACCAGCTGAGGGAAATGAAGAACAGTAACAATAATGTTTGCTAATATGTATTGGAATGTTATTTAATGTTCTTTCAAACTTCAATATGTTCCACATACAAAAAGTAGTGCCTTAGGTTTAGTAGAGGGGTAAGCTGAATTTCTACCATGTTGTTTTGTTTGTTTTTAAGTCCTAACATTTCTAATGGTACCCAGATCTGTTTCTTTTAAGGTGATAAAATCAGTTAGACATGGGGGAAGGGAAAATTAGAACTGGTGTTGATTTGCTGGTAGCCTTTGGGCACCCTTCACACATCAGGCTGGCCTGCTGGAAGTGTGCAGATGGCACAGGGAGTGAGACCAAGCCTTGAAACACTTCTGTTAAATCTAGATTTACATGAGTTTTAATAACGAGAGCACTTCTGTCAGCACATCTTGTAGAGATCAATCAGAAATTGTTCCTGTTTAATCTGCAGGGTTAGTTTTCTCCTCCTTTTGTGTCATACTTTGGGAGCACATTGCTCAGTTTACCTGTTAAAAACATTTGAATTTCCCAGCACTTTTGCACCTTATCTGATAAGGACATACACTTCTGCAGCAAGCAGATGGCAAGGCGAAGTCTAAATGCCTCACTAAAGCACTATAAGGCTCAGTGATCACACAGAAGGATGTAGGCCTTGTGTTGTCTGTCTACAACAGAGTAAATTGTCCTCGTTGTCTGACTAACCAGTTCACCTTCCCACCCAGTCTGTGTCCCTATCCTGTTGAAACACTGTTCACTCCCGTTAGAAATACTCTGTGTTTGATGTACAGATGATACTTAACTTTAATGGAACCGCTGGAATGCATGAAAAACAGAAGGAAATCTCTTACAGTCTTTAACTGTTGTGTATTCTCATCTTTTTTTCTCCCCACTCCATCTCACCCGTGTTCACCTTCCTTTGTGTTATGTCTATTTTAGATTGTAAGCTCCTCAAGGCAGGGAACTGATTGCTTCTCAACTGTCTGTAAAGCACCTTCTACAACTGTGGTGCTCTTTGAAATACAAATTATAATAAATATTAGAATCGATTCCCAATGAGTTAAAAGTTTTATTTGTTTTTAATGTTTTAGCAACAGCAAGGGCAGCAGGCCCATGTGATACCGTGTAAGGAAGGTGCTCAGAGGACTGGGGGTGACAATGTAAGAACCCGCGTGCTGACGAGTGAGCAGGGCTGCTGTTCGGCTGTCCGTCAGTGTTTGACTGCTCTTGCAGACTGCTGTTGCTGGTGTAACCTGTACAACCATCCTTCATTGCTTTCTCTCTCTGTTGTCTTTGATAGCAGCGCTCCCCTTATCAATTCCCTCATCATCACTCCCGTCTGATCTCCTCTCCGAGCAACTTTGAACACATCTACCACATGACTGTTAATTCAGCTGAAAAATTCCTCTCTTATGATTCCATAAACACTGCATTTTCCCCGCCTCCGTGCTCTGCCCTGGGTACTCCAAACTTTATGACTCAGAGGGTATGGATGGCTGGGTCAGGTGTTCACTCTACTAACGTTGTGTGGTTTTCCTTTTGCCTGGCTATTAACATGGGAGAAAAACCCTTGAAAAGTGGTTTCCTTCGCCTGTTCACTTTCTTCTATCACAGCTGATTTGTCTTCTGCTGCCAGCTGTGGTCTTTCAACATCTCTGACAAGCTTAAAAACAGATATTTCATGGCTTTAAAAAGAAAAAAATGTTTACCAACTAGGCTGAACCTTTTGCTAAGAAAATGGCATTTTTAGTCACCAGGAAGGTTGTGGGAAATCTGAATAATGCTTGTGTTTCACACTGTACATCTCCAGCAGTCAGTAGCAGAGACAAGGTGCTGTGTATCATGTTGCACTAGGAATAGGATTCTGGATCTGTCTCTGTTGGACCAAAATTTCGAACTCTTTGTTTACAATGAAATAGCGGGAGTGCAGTAATGTTACACAGTACTGTACACAGATGGAGAGTGGCACAGATTGTGCCCAGGTGGTTTCTAGGTTCAGTTAAAAGAAAGTTGGAATGCATACAAGCAGGAAGATCAGAAATTAAAGATATTGGGTATTTGTTCATATAGATCCTCTTAATCCTGGTAGTTTTAAATAGAGACTGAGGTAAGATACTGTGCTGTAAGTATCCTTCCAGTTGGAATGTAAAATATGAGAGATGGAAGTGATGCTTTCTTTTTTCTCGTTATTGCGTATCTTGGCCTGAGTTATGTGTGGTTGCTATATCCTGTGGTAATACAGGCCGTACTAAAACAAGCCCACGTGTACCTCCTGCTCCATTGTAATTGTGTTCTGTGCTGTGGCCTGCAGTTCTGCTTTTGGACAGATTTGCAGATAGATCCTGAATAATCTGTGAAGTGAATGGGTATAAAAGAAAGGTGGCCAGCAGGGCCAAGGAGGCAATTGTTCCCTCTGCTCTGCACTCGTGAGGTCACACCTGCAGTGTTGTGGCCAGTTCTGGGCTCCCCAGTGCAGGAAGGACATGGAGCTGTTAGAGCAGGTCCAGAGCAGGCCACAAAGTTGCTCAGAGGGCTGGAGCACCTCTCCTAAGACAGGCTGAGGGAGCTGGGCTTATTCAGTCTGGGGAAATGAAGGTTGCAGTGAGACCTCACTGTGGCCTTCCAGTACCTGAAGGGAGCTTACAAGCAGGAGGGGGACCAACTTTTTACGTGGTTGGATAGTGATAGGACAACAGGGAATGGCTTTAAACTAAAAGAGGGGAGATTTAGGTTAGCTGTTATGAAGAAATTCTTTACTCAGGGGGTGGTGAGGTCCTGGCACTGCTGCCCAGAGCTGTGGGTGCCCCATCCCTGAAGGTGTTCAAGGCCACGTTGGGTGGGCCTTGGGCAGCCTGAGCTGGTGGGTGATCTGTGGTTCTGTAGTGGTGGATGGTTGCTGAGGGTTTGTGTGTGTCAGAGCTGTGCCTGCAACCGCGATGGAAACACTGCTGTTGGTTTCTGTGGCCTTTTGACACTCTCCAGACACATACAGCGAACCTTCACTGCCAGACTGCTTTGCTGTTGTAGGTCCCTGTCACTGGGAAGGGGTTAGTAATGCATATCTGCATCCAACACTAAAAAGAATTTTAAAATGCAGGAGAAAAATACTTGTCTTTTCTGTAAAGCCCCAGAACAAAATTTCACACCATGAACTTCGACTGGTCATGTGCACACTCATTACTGTTGTGTAGTGGTCACATACACTTATATCCAAAAATGAAATTGCAGGATTTTGGAAAATGCCCTGTGATGACAGGTCTGCATCCACCCTGGCTTTTCTGGAGAAACAGCCTGGAGCATTGAGATTTTGTGCCTCTTTGCCCCTTAGAGCACTGGAGGTTTAGGCTCGTGTGAAGGAAAGCATTTGTCTCTTTTTTGGCTTCAGGGAAGAGATGCTGTAAGCTGTCTCTGGAAGGCAAAGCCGTGGATTTTGCTTTTGTGTCTGCCCATGTCCCTCTCTGTGTTTGGAGTTTTTAGTACAAGAAAGGTAGCAGTCCCTGTGCAGGGGTTGGGGGGACCCAGGGACCAACTGAATATTGAAACCTGCAGTATGTAGCAAGAGTTGAAAATGAACCCTTAAAATAGTCATGTCCTCCCACGTCGTGAAAGAAAAGCCTAGGTTTACATCATAACAAACAGAACCTCAATTAATACAAGAAAACAAACAGCAAGAAGCACCTTGGACAGAGAAATGCAGGCAAGCAGTTCCCTGTGGGTGCTGTGATTGGTGCTGGGCATGAGCTGGGGCTCAGCAGCACTGCCTCCCAGTGGGGCTGCACCCACTGACTGGTCATTCGCTGCTGCATGGCGAGTAACTGCTCAGCAAGCAGCTTCTCTGCTGCTGAGGTTTTTTCTTCCAAGAGAAATCCTGTCACATTTCTCCATTTGGTTCAGCAGCAGGGATGAATTTACCTGCTAGGATTTGGATTGTTACTCCAAATGAGGGGTTTTTGTCTCTAAGTAAAGCAAGCTCGGGTTTCTTTTTTCTTTCTTTTTTTTTCCCCCTCTGTTTTTAATTTGCTGTGTTTGGCTGCTTGATAACTACCGCTAACTGCCATTTATTTTTCTTTGGCTCCCCTTTCTGCATCGTGTGCGTATCATTTTGGGTCCAAAGTGCCAGGGTATCCAGCATGTGCTTTTTTTATTTTAGATCAAAGAACAGGGGAAGATTTGCTTTGTGGAAAAACTTTCTGCAAGGAATTACATGGACTTTGCAAACTGAGGTCACAAAAAATAACTATAAGACTACACAAATAAAATAAATGAGTCTTTTTAATGCACACATTCCTTTCTTCCCCTGATGCCTGTATGTTGCCTGCTCAGTCACTGTTAAGGAGGTCAGTCTCCCTATCATTACATATACTCGCTGTCCCTGCAACATGAAATACTGTCAGTTTCTACAGGTACAAAGCCCCTTCCGTGCAGCTCCAGTATACTGATTAGTGCTGCTGCACTCGGCTCTCCTTTACAGTTCTCAATGCATAGCAGTGAGCCATTCCCTGTCCCCGTGGTTCCTTTTGTATCTACCGTGGGGCCACTGGTGTTGGTACACAGCCAGGCTGCTCACAAGGAGCTGTAATGCAGATCGCTTATGGCATGGTGAGGACACCAGGAGAGAAATTCAGTGCTGCAGAGTGGGTTGTTTGTCCTCATTTGGGAAACAAACAGTAAGCAGGAGGCAGCAGTGTGATCCTCAAGGGATTTTTGAGAGAGACTTGAAAACAGTGCTGCAGTAGCTACAGGGAGAAGTAAACAGGGCTTTTTCACTGATAAGCTCTCATGTATTTTGTTGGTGTTTGAGAGATGTTTAATTCTTCTTTGTTTTTTGCATGCTAAAAATCTGTCATTCCTAGACCACTGGGAGGGTGAAAAGCAAAGAGTTGACTGTGATAGCAAAGAGATCTGTAACAGCAGTGGCACTAAGGGTCATTGTAAAATTGGACTGACAGTAGGTTTTTAACAATTATCTGATAAAGTCTGTACCATCTAATACCTGTTCTTTACAACGCCACTATCTGATTACCCATTTTAGAATACAGCTAGAGAGATGGACGGTATCTGAGGGTCTTTCAGAGTACTCATCCGGGGGTGGAAATTTCTCTTCTGTAACATTTCAGCCTAAACAGGCATTGCAATAGAAAATGTAGGTTTTCATTTGGTTACTTAATCTCAAAGTGAGGGTCGGGAAATAATTACATATGAAAGGGAAGAAATAACCATTATTGCAGCACGAGTGTGGTGAAGTGGAAACAAAGTAATGCTCAGAGGTACCTGCAACTCTTTTCACAGTCTGCAGCTGTAAAGGTTTCCCAAGCCTAATTCTCATTAATGCTCATAGCTTAATAGTGCAAATCACATTTGTCTCTTGTTTAGGCAGAGATGAAACAATAGGCAAAAAAATTTGGGGGTATGAAGGCAGCTCGTATACAAAGAGATGGGCTAAATAAGCTGAGAAGCCTTTTCCCCTAAAGTCAGCTGTAAGTTAACAGAAGCAGAAATAAAATCCCCCAGAAGTTATATCTAAGTATTTTCTTTCTTTTAAAGACATAACCTATGTTTAAGGAGCTGCCATATTTGAATAAAGACACTGTTCTATCTGTTCCCTCAGTATAGAACTGCTTCAATTCAGTGACAATTTTAGAAAATCACACTGGAACTCTTAGGCTGCAAACCTAATGGCAATCCATAGAAAAATCTGTGGTGGGTGCTCTGAGCAGACTGAAACTATGAGGCTGATTCTGGCTTTGGTTCAGCTGGTGTAGGTCTGAAGAAATGCTGTTCATGTCTTTGGAACCACTTCAGTTATCTGACAGACAGATTGATCCTACAGTCCAGTATGTGGCCATAACTCCACAGGCACTGGGGATTCATAGGGTGTCCATACCAAATTACACGTGCAAGCCACAAGTGATGGTATCATGGGGAAGTTTTAACAAAATCCATAGAAGCATGTGCTCAGAAAGAGCGCATTATGCAGTAAATGTGGAATTACATCTGTAGCAGCTTGGGCTTGCAAACCATCCTTTCAAGGAAATTCTTGAATTATTAGACCTACCTTTTCAGTTGTCTGCATATGTCCATGTAATTCAGCACTTCATTGTCAGCTGTGTGTGCTTCCAGTCTCTGCACTAAATTGCAGAATATTACTTTGCAAATTTTGCTGACTTGCTGCTCACATAATTCAGCTCTGGTAAGGTTGGGGATTTGTTGCATTCTGGGACCTTCCTCCATAACGTCCAAGGTTGAGCCAGCAGTCAATAAGAAACATGTTGTTGTGTGTCTGCATTGCAG
Seq C2 exon
AATCTTCGGCCTCAGGAAAGTCGGACCGTATTCAGTGGCTCTGTCAGTATCCCATCGATCACGAAATCCCGCACAGAACCAGGACGATCGATGAGCGCAAGCAGTGGGTTAGCAGCAA
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSGALG00000009158:ENSGALT00000014921:34
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.956 A=NA C2=1.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0078623=PBD=WD(100=47.5)
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]