GgaINT0124230 @ galGal4
Intron Retention
Gene
ENSGALG00000008475 | ARRDC1
Description
arrestin domain-containing protein 1 [Source:RefSeq peptide;Acc:NP_001026646]
Coordinates
chr17:1955243-1968044:+
Coord C1 exon
chr17:1955243-1955435
Coord A exon
chr17:1955436-1967933
Coord C2 exon
chr17:1967934-1968044
Length
12498 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GAGGTGAGC
5' ss Score
8.7
3' ss Seq
ATGTTGTTTCTCTTTAACAGCCA
3' ss Score
9.7
Exon sequences
Seq C1 exon
AGCGGCACGGTACGGCGCGGTGCGGAGCGGAGCGGCAGGGCAGGTAGCAGCGGGGAGGAACGGGCCGGCGCGGCCATGGGGAAGGTGCAGCTGTTCGAGATCCGCCTGGGAGAGAGCCGCGTCATCTACAGCCCCGGCGAGCCGCTGGCCGGCACCGTCACCGTGCGGCTTTCGGGCTCGCTGCAGTACCGAG
Seq A exon
GTGAGCGCGGGGCCTGCCCGGGAATGGGGACGGGGCTCCCCGGGCGGCGGCGCTGCGCGGCCGGGACGGAGCGGGGTCGGGGCTCGGGGCTGGCAGCCACTCCGCAGCCCTTGGGCCGCGCTGGTCCGGAGCATCCCGCACTCGGCTGCTTTTAAGGGGAGGGGGTCTCGGCCCTGCTCGCTCCGTGCCCCCGGGGTGGGCTGTTGGCCCAGGGGCTGCCCTGGTGCAGAGAAGTCGGCAGCGGTTACACGTGTTGTGCCGGGGAAACGCGAACTGGGTTTTTGCTTTCCTTGAGGTTGCCCTGTTCGCTTCTGCCTCTATGACAAATTACTCGGGGGGTAAGGATGACTAAAGAGCTTAAAATGCAGCCTCCCGTCGCCGGGAGATGGCCGTGCTGCCCCGCCGCGGCGTTCAGTTCCTTTAGCACCTCTCTCAGGTGCCCACGGTGGCTTTTGGGAGCTTCCTCGGGAGGAAAAGCAGCATCTTGGACAAGCGCAGGCTTGTCGGGTGTTCAGCTCCCTCCCAAGCAAAGCGCGTGGGTCTCCTTTGCAGTGCTCCTTCCACCGGAGGCATTGGCAGCAGTGCACGCTGACCTCCAGCCGCCCCGCTCTGTGGGCTCAGCTGTCCTTTGGAAGCGAGCTCAGGGCCTGAGCTGGGCTCTGTGAGAGACACATGCATTGAGCAAAGCTTCAGGAGAGCTGCCTGTGCCGCCTTCTGTTAGAAGTGTTGCGCGTGCTCGTTTTGGGCTGAGGTCACTCCGTGTTGGCTTTGCTGCTGGGATGGCAGCTTGCTGTGGCTGGTGCCTGCACCGGCCCAGATAAGCAGTGCACGTGGGGACGTGGTGCCCATGTCTGTGGGGCGAGGGCGGCTCCTTGCTGTGTGCCCTCCCTGCTGGGCAGGTCTCACCTTCCGGAGAGCAGCAGGAGTGGTGGTTGAAGCATCCTTCTGGGCACAACAGCACGCACTCTGCGGAGCAGGTGGCTGGACCGGATGGTAGTGGGGTCAGACAGCCTCTGCCACGCTGTGCCTTCTGGGCATGTGGGGTTGATAGTGATAGGAGAAGGGGGAATGGTTTTAAACTAAGACGGGAGGTTTAGGTTAGACATTAGGAGGAAGTTTTTCACCCAGAGGGTGGTGACGCACTGAACAGGTTGCCCAAGGAGGTGTGGATGCCCCATCCCTGCAGGCATTCAAGGCCAGGCTGGATGTGGCTCTGGGCAGCCTGGGCTGGTGGTTGGCGACCCTGCACATAGCAGGGGGTTGGAACTGGATGAGCATCGTGGTCCTTTTCAACCCAGGCCATTCTGTGATTCTGCAGTTCTGCTGGGGTGTGGGGGGAGAGGCAGGTGGAAGCTCTGTGGCTTCCCCGTCTTGTGTTCTGTGCTGTGTACACCCACACCTCCCATGACCAGGACTAACGAGCAGCTCGCTGGGGAAGGCGCGTGGTGCGTCCCCTTTGCAGGGTCATGCTACAGCACCCAGGTATGGTGCTTTCTATTTCCTGAACTGGTCTGACGTAGTGTGTGTTTTTTTTGAGACAGCAAACACAAACAAGCTTGCAGACGATTACTTCACACGGTGCCTCGTTTTATGGCTCTTGGAAGTTGCCCCTATCAAAGCATGGTCGGTGCAAGCAAACAAAGCTCGCTCTGCCTCACCAAACATGCTGGAAATCTTGGGTCATAGGAAAGCTTAACTGGAGACACACCTTTTAGGATCATAAATGCTCCCACCTACGCTGGCTTCCTTGCCAGCCCTCTGACTGCAGTAATGGCTGCTCAGTAACACACTGGCCTCTCTGGCTGTGCAGCAGCGTCACAAATGGTGACTCACCTTTCGTGACCCATGTGGACCCTTTGGGGCCACATCAATAGGGCATGCTCACCCTGTGGCCATGCCAGGCCGGAGGTCTTCCTCTGAGAACTTCTGGGCCTCAAGGGAGATCGCTAATGGGAGTGCATATCCCTAATTGTTGTGCCTAACTTGCTGGGTAAATCATCAAGTGCCTGTGTACAAAGAATAATTAATCTAACAGGAAGCTGGCACTGGGACAGCTGGGTATAGAGTTAATTTGGGCGAGGTGGGAGGGAAAGAAGTTCCTCGCAGAGCACAGGCAGCCCTGCTTGCTGGCAGGAGCATGCTGGAGCAATGCTGATGCTGCTCAGGGGTACTGGAGTGCTTTCCTCGCTGTTCTGCAGCATTCAGGGCCATGTGGGTTATTTCAGCCCTGATGCCTATCGCTCAGTGATGCTTCTTGTGGGCAAAAGTGTAACGGTAAAATAACAGCCCTCTCTCCCAGGTCACAGAGAGAAAAGAAACTGAAAGCGCTTTCTGGAGCGGATTTCAGCACGGTGTTCCTCACTCTGTTATTTAGCTGTCCAGGTTTATGTGATGATGACTTGACTTTCAAATCAGTCCCTTGAACTGCATATCTACAGACAAAAATACTGCTGTCTGTTCGTGCTCTAGAAGTACCCAGGTACACAATTCTCATTTCTGCAGAGCCTGGTAATCATCATTTTCTGCTTTAATCTTAAATGTAGTGCGCGGTTTGATTTCTCATCTGGAAAACTGGGAAATCTGGCAGTGGAGAAAGGGGCTGAAGGCAGATCCCGAGCTGTATGCCTAAACGGAAAGGTCACTTCTGTGTACCTGGAAGGGCAGCAGGAAGAAGTTTGGGTTTGGCAATGTGTGATGTGTCTGTAGCCTGTGCCCTGCATGGGGAAAATAGTGACACCTGAGGGTTCTGATAGCCACGATCCTCTGTACAAGTTTGGACTCTGACACAGGAAAATGTTCCCGCAGAAGGGCTGTGGCTTGGGCTGTTCTGTGAAGCAGTGGTGAAAGGATTCATCCTTTCCATGTGCCAATCAGACGGGCAGGAGGGTCCCATGGCTCAGCTCTGCTCTGGATGCAGCCTGGTGAAGGAGTGCGATGCCAGCAGCACACAGCTGAGTGTGATCCTAGGGATTTTGGAAGGTGGGATACAGCAGTGGCTGACAGTGACACACAGGACTGCTCGTATCGCTCCGCAGCATCGCCCCAGCAGGCCGGATGGCTCCAGCAGCAGTGGAAGTGGATTAACTTTCTTTTCTCATTGTCTGGAGCGAGACAGCAGTGAGCTGTGTGGCCAACCCTGTCTGAGACTGGGGAACAAAAGAAGGATTTTTGCTATTGCTGGCTGGCTTGCTGCTGGAACTCAGCTCCTCTGGAGTCAATAACTAATCACAGGGATGTTTGGTGTCTCTTGTCTCTGCAGCATGTGCCGCTCTCTGCTTCTCCCCCCCCCGCCCGCGCACCACTTGTGCTCATCTTGAGAAACTGTTTGCCGCTTTCTTTGGCGAGGAGATGTGCTGCAGCCTTCCCTCTTGTTCAACAAAATGAGAGAACAAGTGGAGTGGAGCTCTGTCAGTCTGATTTGCTTCCAAGTGTGACAAACGGGGTGCGACTGCGCGTTCTCTCCCCCGGGCAGTGTGGAGCTGGCAGGGCCGTAGCTTGTCTTCTGAGCTGCAGTCAGGTAGGCAGGAGGGACGCTCCCTTGCCGGGAGCAAGAAACTCTGGGCTTTCTGGCCCTCTTCCTGAGGCAGCTCCTCATCCCTTGTAGGAGCACTGAAAGCAGGCACCAGCTGGGAGAGAGGGAGCTTACCTCCTTCTGCTTTGGGCAGGTGCTCCTGAAACAGCCTGACAAGCACGCCAGGGGCTGAGCGTTTAGCTTGGTGCCTCTTTACTTGAGGGATCACTCAAGACACTGAGATCTTGCATGTGCAGTCTCCAGTCTACTGGTGTGACCTCTGAAGGCAGCAATTCCTGTGGAAGTGTGTGATTTTTTTTTTTTTTTGTGCTGCTCTTAAAGTTGTCACTCTCAGTGTCTTGCGTGGAAGTGAAAAGTGCTTCGAGGGGAAGGAAAAGGGCAAAGGACATGGATGGCTCGGAGCCTTGTGTGCAGGTGCGCCTGCGTGGCCCTAGTCCCCATTTCATGCCTGCGATCTAAAACTGGAGGTGTAGTAGCTTCAGGCCACAGAGATGGGCAGGTGTCTGTCTGCTTGCAATGCCTTTTGAAAAGCAGCTCCACTTTCCCCAGCACTCTTTGGCTGGTTTAAAATTGCTGGTGGTATGCTTGTGTCAAGTGTGAAGTGCATGTATTTGTTTAGCTACAAGTAAGCTTGTGAATGGAGGCTTTCACCAGGGAATGCTTAGCCGTGGCTGGGTACCACTCTGTCTGGAATCACATATGGCATTCAGAATGGTGCTGAGTGCCACACGGTTGAATAGAACAGGGGAGTGAACTCCCACAGGTGTGTCAGCACCCTGAGAGGATATGGGGGTGTCCCAAGGTGAGGACAGACCCTGCTTTCCACCCCCTGGGCAAGATGAGGGTGGCAAGTTTGTGCCAGTCTGCAGTTGTTCAGAAAACTGGTTTAAAAGTGCCCCGACCTTTGAGCATTTTAGTCTTGATTGAAAACCGGAGCTTATCAGATATCTGCAGCAAAAGGGCTGTTTCCGAGAAACATGAATCATTTCTGGAGTGTTAATGCTTATAACTTCCACTCCTTTGTTCTTGCTGAAGGAGCCACGTTCTTGATGGCTCTGGCTCCAGCTGGAGGTACCGCTGCTGCTGCTCGCTCTTCCTTGTGTGTACCCCTTAACCCCAGGTGTTCCCTGCAGTAAGACTCGGGTCAGCGTGGCAGCATCTATGGGGAGGAAGGCTCACCAGGTAGGTTTGACTGTATGCTTTCTTGGAGGAGGGCATCAGCATGGGGCTGGGTGTCAGGTCCAGAGGGTTGGCTCTGAGCCCCCAGTGCCGTTTGCAGGTGTGCAGCCTGGCTGTGTGGATCATCTTAGGAACCTGTACTCCTCCCAGCATAGTAGGGATTTGTTATGAATCTGATGCTCTGCTAGTAACGAGAACATAAGTTGCCTTTCCAAACCGATGATTCTGCTATAAATAGAGAATCCAGCTGCTTACATTGAATGGCATCAAAGGAAATCATAGGAGCAGCTCTTATGCAGAACGAAGTGGGTTCTGGCTGCTTTCTCCCAAGTTGCTGGGACTGGGGGAGGAGTGTTTCTTGACAGCTGATATGTGTGAAAGCAGTGCTTGGGAGATCAACGTGGTGTGAGAAACCTTCACTGGGGAGCATGTGGCTGTGCTCTGCCATGGCCACCCTGTGCTGCGTAGTGCCTTCGGCCGGGGAGCTGGGCTGCATGTGTATAGGGGAGTCACTGAGTGACTTTACTGGCTATAAATAAGGCTCTTGAGGAAGAGGCACTTGAAACCTCCCCTGCAGGAGGGGTGAGCTGGCAATGGGCTCGTGCCTGGGAGCAGCCAAGCTGAGCTGCGCAGGTCTCGGCACGCTCTGGCTGCTCCTTGAGAGCTGCTGCCTGCAGCTGAGTGGCAGGGCAGGTGGGCTGCAGCACAGAGCTGTGTGGTTGCTTGTCCCCGTTCTGTTGTCTGTTTTCCTTCTAGATGGCTCCAACTGCTCACACCAGGATGTCCAAGCAGCTGTGAGCTTGCTTCTTTGGTCCATCTCAGTGGTGCCGTGGAGACAAGCTCATTCAGGACACCTGGCTGTGACAATATTGTCTGTGTTGCTGCCTCTCAGTGTGTGTGGTAGGGGGCGTTCAGCCTCTAACAGGTCTCTTTCCATCTATCAGTCTGACTTTGTGACTGCTCTTCTCTTGGTGGAATGATTCCTGGAGGCTCTGTGCCCAGGAGCGTCCTTGAGCACTGGGAGGGGAGGGAGGAGTGTCACCTCCACTTCTCAGAACTGACACCATCTGCAGGACTGGCTGTGGGCCTGGAGCCCTGTGTCTGGCAATGCTCTGGAGGGCAGCGAGCAGCAATCAAACAGGTTGCCGGGAGAGGTGGTGGTGCCCCATCCTTGGAGACACCCAAGGTCAGCCTGGATGTGACTCTGAGTACTGAAGGAGCTGTGGGTGTCCCCGTTCATTGCAGGGAGTTGGACCAGATGGCCTTTAAGGTCCCTTCCAACTCAGATGATTCTATGATGCTAGAGGAGCTGCTTGAGCCGTAGATAAGTGTGCCCAGCAGAAAGTGGGGTGACTCAGTCCCTCAGCAGAACCTGGCCCAAAGCAGCCCTCCTGCTTGGGTGTTTCTGTGAGCCTGTTGAGCATGAATTTCCAGAACTCTTTGAAGCCTTTATTTAGAAAGAGCCTGAAAAGGGAGTAGGCTCTGGTGAATCAACCTCTTTGTGGTAAGCAGAGAAACCTGATCAGTCGGCTGATTATTTGCCATACAGAACACAGGGGCTGTGGGGGAGGAGGTCACTAAACCTGCCCAGGGAGTGGGAAGGGCAGAGCTGTGGTGGTCACAGGCTGACCGGTGTTCCCAGGACATCAGAGCTCAGCCTCCTTGCTGTGGGTGAATGGCCGGCTTGTTCTGCTGTTGTGCAGCATGCTGGCAGGGAAGGAACAAGTGTGTTTGACAATGAGTTTAAAGGAGTGGTTTGTTACAGTGTGGACCTGACTGGTCTTCAAGCACCTAGAGAATGCCTCCTGGGACCAGCAGTGTGGTTACTGTGGTGGGGTTTCTTGCCCGGTTCTTCTGTTTTTAGACAAGGAAGTCGTGTGTACTGGAATATCCTAACTGCTTCGGCCCAAAGTAGGGCTAAGTGCTGGGTGGAAACCTCTTTCCATTTGGGCAAGCTATAAAAAAGTGGTTCTTCTTTTCAGTTTCACACGGCTCAGCCCAAGGAAGGTGGCTGTGGTTGGGCTGCAGTGCTGAGTGCTGCTGGTCTTGGCAGCGTTGCTGTGCACCAGGTCAGGCTGCACCAGCTCCGCTCTGCTGCACCTCGGCCATGTGGGTCTTGTATTCCCCTTCCATAGGGCTGTTCAGAGGCCCAACCCTGAAGGTAGAGATGCTCTGGCTGTTTATGCAGTGAGTCTCAAGCACAGCACTGGAGGGCAGGTGTGTCTGTCTGCAGTCAGGTCAGAATTTCCCTCTCTGAACTTATGCTGTGAGAAGCAGAAAGAAAAGAGCTTTCTGAGGCTGACAGCTGCCTTTCTGCACCAGAAGAATGACTCCGCCATCCCCTCTGGCCTTCCTCTCGTCTGTAGCCCCTCTGCATTTCTGATGGATGTGAGGAAGGAGGTTATGAGTGCTGGTGTTGCAGCCAAGGTGGGTGGCTGGCACAAAGATTTCCATGGTGAGCATGACACCTCTGTGCCAGATGCTGCATTTCCTGCAGTGCCTGCGCTGCTGCTGCCCGATCTGGCTGTCTGCAGCACTCAGAGGCTTCTGCCCTCCTATCCTGGGAGGGAGATGCCGGTCCCTCTGCATGCAGCTGGTGGTGCTCAGTCGCTCCTGCACACGAAGACCCATTGTTGTTCCATGTTGCATGGAGCATTGCTCCTGGACCACATGTACAATGGGGTGAGAGCTTGGGCTCCTTGAGCTGGTCTGAGGTGTGACTTTCTTTCTTCCCTGCTTCCTCTGAAGCCATGCTGCTGGCTGCGCCGTGCCCAAGGCTGGTCCTGCAGGCAGCCCATGGGCTGGTGGTTGGCTGTGATGGTGCAGGACCTACACCTTTCTGCAGCCTACAGAAAACTTCTTTTTTGCAAGAGGATGTTTTGAGAAAAGGGGATGCTGGAAGAGTGTGTCTGGTAGCAAGGCAGCTGCAGCAGCACTCCAGGAAGCGAAGTGAGGGCTGAAGTGCAGCCATCAGACTGTGGTATGGGGATGCAGCAGGTTCTGGGCCTGTTGCATCAGGGCTCAGTGGCACATGGCCATCCCCTGTGGTGCCTTGGTGGCCCTACTCACCGGTAAGGTTTCCTCCCGTCCTCCCCTGACGTGGGTGAAGACAGGCTCGTTAAACGTGCTCAGCCAGGGATTTTGTTCCAGATGCTCAAGATGACCCCTTTTCTCCGAGGGCAGCCTGCGTGCTGATAAAACTCTGTGATGCTATAAATAAACCTGTCAGCTCTGTGAGGGAGAAAAGCCTGCAGTTTGTCCTTACCAGGAGCCCAGCAGCTTGCTTTCTTCTCTGGAGTGTGTGCAGAATTCTGATTTTGGACAAGGTCTGGAATCGGCAGGCATTCCTGCTGTGTGCCTGTGATAGAGGAAAGTGCTTGCAAAGGGAGAGGATTGACCTTGTCTGGGAAAAGACATGGCCAGGAGGCACAGCTCTGCCTGGTCTCTCTTCGGAGAAGTCTGCATTTCTGGGATATGAACACCTTTGATGTATTGTTGGGGTGGATTTTGGCTAAAACCAATCACCCTTAGCTTAAGTAACAGCTATGGGTCACTCATATAGCAGAGCCATCTCTGCCCAGTTGTTGCTGCAGGTGGAGTTGTCACTGGCTGTATGCAGGTGATGCTCCAGGCTTCCTGCAGTGGGTGCAGCTGTGGGTTCAAGGTGTGTGCGAGACCCAGCATGGACTCCTGCACCGGTGTGACAGAGCCAGCTCCACCGTGACAGCTGGAGAAGAGATGGGGACACCTCCTTCCCTGGGGCTGAGTCCCCTTTGTGCCCCTGTGCTGAGCTGTGGGGCGGGAGGAGATGGGAACTTCTCTGGGCAGTCCTTCACTCTGCCAGACCCACCGCTGCCTTCAGCTCCATGCCAGCTCTGCTCTTGCCTTGCTGGCTTGCTAAATGCCTGGGGCTGTTTGTGTCTGAAGGAGGACCCAAAAGGATGGAGACGGCTGAGAATTAATTAGGACTCGCTGGTTTAATTAATAGAGTCTTGGTATATTTGTGCGCAATGGTTGGGAGCCCAAGGAGCAGCCTGTCTTGTGAGCTTCCAGCCTTCCTGTGCAGAGGAGGACGTGAGCCCTTTGTGTCAGAGCTTGTACCGGTGAGTTTGTGAAAGCCAACCTGTCTCAGGCCTTGTTGTGCTTCTCTTTGTGGTCTTGGTTTCCTTGGTACTTGTTTTTTCCTTTTTTTTTTTATAGAGCTTTTCTAAGAACCACCGAGTCTCTGCTAACTGCTTGAGAGCTGTGTTTGTGCTGTGTGCATTTCTTGAGTCCCCCAGACTGGCCCCGATGGGGTTGGCAGTTTGTGTGCTGTCAGCTGGGCTTGAGGGAAGGGCTGTGGGCTGCTGTGGGTCTCTTTTCCCCGACCCCAAAGAAGTGCTGCTGTGACAGTTCTTTGATCTGTAGGCGCAGATTCTTCCCACTGCTGTTGATTGGGGTGGTGGTGGCTCTGGGCCATCTGTCTCCTCCCTGTCCCAGGGGCTGGGCTGTGGCTGTGCCTGGGTGCTGCTGGCGGGGCCAGGGAGAGGGGGGAATCTAATTGAAGCATGCTGATAGCTGCCTGCAGCAAATCCGATGGAGAGGGGTGAGGAAAGGGCTCCTCTTGGCTGTTTTCCATGAGATGAAGACTATCTGATGCAGACTCGCTGGGCTCTCACAGCCCTCCTCCCCTCCCTGTTGCTGTTGTTTGGAGCCAGGCACACAGCAGCCCTTCCGCAAGCACCTTTGGGATGTGCTGTGTGTGGTCAGTGAGGATGCTTTGGGGTGGCTTTACAACCTGCCTAGCCCTGTGCTTGTGGGTGCGGACTCACCATTCCCAACTGAATCCCTTTGGCCCATCAGTCCAGATGCTGACTGGCATGGGCTTCAGCTGGCAGAAACCCAAGGCTCTTCAGCTGGGTTCTGGAAATTGGGGTGGGGGCTGCATGCCTTCTGCTCTCCCCTTACCTGCGATGCAGCACCAGCTCTCCGGGAGGGCAGCTGGCTGGATCAACAGAAAAAGTAATCTGAGGTGCATGGCTGCTCTCCTCGCATCACCCTGGGAGAAGGCAGACGTGCCCAGCTCCTGGCATCTCTATTTTTGCTTAGAGCAGAGATGGATATGGCTGAGCTGTCTCCTTTTATTTCCAGCACTTGGCGAGTGCTGCGGTGCGTTGCTAAAGATGCGTCTGGCTGGATGCAAGCTGCCGCTTCTGAGAGTGCTGGGGGATCGTGGGGTGAAGGGCCTCTGCCTTCTGCATCGCTTTGTGATTCGCTTCCCTTCTTCTGGCTGCTCTTTGCTCACCCCTCCACTTTCCCTACAGCTTTTTGCCTTTTTTTCTGTATTTATTTAAAGCAACTTGGGTAAACAGAGAGCAGGATGATGGGAACCGGGGCTGCTGGTACGACTGGATTTAGGAGGCATTTTTTTATGTGTTTCTAACAACCGGAATCGGGCTGTTCTGATGTACGAACTCATTTTCTGTATCTGCTACTTGGCATGGAGATTGCCTGCAGGGAGCTCCTGGAAAGTCTCAGACTGTGCACTTTGCTTCCTGGAGGCCCTGCTGACGAGCTTTGCACCTCGGGTAGCTCCAGTTGCTGCAGCTCTGATGTTGCTGCTTTGCCAAAGCTGTCTCGCTGACCCCACTTTTAGCTCACAGCTGCCCCCAGCACCGCATGCCTGGGTTCTGCCTGTCAGCTGCTGCATGTCCTGGCTCCTCCTTGTGAACAAGAGCCTGTGTGCCCCGGGAGGAGTGACCTTCAGGACCGTGACAGCAGAGGGCCACTCATGGTGAGGACCCAGAGACAGAAGCCTTCTCTCTTGATCATGGCCAAGCCAGTTTAGGTTGTTAGTGGTCAGCCGAGAAGCCTTGGAGCTGACAGCCCTGTGGACGGTCAGAGGAGCCATAGCTAGCTGCAGTAAGGCTGTCAGATGGGGTCTGCGTGTAGCCCTGAGGTTTGTTGCAGAGGAGCCCTGCTTGCTGTGGGAACAGCAGCCAAAGGTTGGCTCTGAGTGCCGGGCTGTAGAAGTATGACAGGGCATGCTGAGTCCCTGTCTCCCATGGGAAGGGAGATGGGGCAGTAATGTCTGTGCAAACGTGCTCACCCACCTGCCTCCAGGAACAGGAATGTCTGAGCACTGCAGTGCAGCAGGCAAGCTCGGATGGAAGACTTCCATCCCCAGCCCAGTGTCTGGGTGTTGCAACAGATGGTAGTTATCTTTAAACTTTTCAGATGGTCGTTATCTTTAAACTCTGTGGCTGAGGGAGGCTGTGGGGAGTCTGTTCCGGGGCGGTTCCTCCTGTTCCTGTTGGGGATTTCTCACATTTCCCATGTGAAAACATGGGAGCAGAGTGGCTGAGCCTGGGCTTGGTGTGAGTGGAGCCAGCCAGGCTGTCTGCATTGGGAGAGCTCCCACCCTGCTAAAGCTGCTCCTTTGCCCTCTGATGGGAGCAGTGTGTTTCCCTGGCAGGTGTCTGTTGGGGTGGGGGCTCAGCACTGCTCTGTGCTCCAGGGGACCCATGCCAGCTCAGCACAGGCATGCTCAGTGCCACGGCTGTGCCAGCCACGCTCTTTGCTTTGTCCCCAGCGTCAGAAGTGCCGGTGTGCCTTGCAGACACAGATAGAGCCAGTGCGTAGTGGTGCTTGATTAATGAGAGTTGGCATCTGCCGCTGTTCATCCCGTGCCCTTGAGGATGAAGCAGTGCTTGGGCTGCAGTGAGCTTGGGTGCTCCAGGTCACAGTGAGGCTGTGACCAGGTGAGCAGGGCTGTGGGTTGGCTGTTCCTCCTTTGGGACTGGAGACTTTGAACCACAGGCAGCCCGTTCAGTCTGAACTCATATGGCAAAGCATAGGGAAGGGGACTGGGATGTAAACACTGCGTTCCTCCTGCAGAGAGAGCTGGGTTTGGGTTTCTTTCCACCCTGATTTGGGCTGGCAGGGCAGGCACTGCACAGAGCGGTGTGGGGTGCTTGTGAGCAGCATTGCTTGCAGCTCAGTGCTTGGGAGGAAGGAGGTGGGGAGCTTGGAGCAGGAAGGCAGCCCCAAAGTCGGGCAGATTGGCTGCCTGCCTCCCGGGGAGAGGCTTCCTGTGAGATGCTTGGGCATAGTGAGCGGGTGGGTGAAATGGGAGGAGAGCCTGTCTGGTGGCTCCTGCTGCCTTTCTGCAGGCAGAAGTGTGCACCCAGCAGGTCCAGCAAGAGAGTTCTGTGGGATCTGTTAAAGCTGTTGCAAAACCTGGTGGGAATCTGGACAGGAGACATTCAGGCTGGAGCAAAGCACTGCAGCTGCCTCTTGCTGTGTAACAAGCAGGACAGGCTCGGGGATGACTTTCCCAAGGCAGGGCACAAACGTAGCTCCAATTCTTTGTTTGCTTTGGGAGGGTCGAATGGCATCCTAAATGCTTCTGGACCTGGCTGTGTGGCTTTGCTGTGAGTCCTGTATCTCTCACAGGAGGAGGAGGTCCTCTCTTAAAGCGGTCTCTGGCTGCTGAGAGGCACTGACAGTCTCAGCTGTCCTGGTGCTGGAGTCACTGCTGGGACCTTTACAGTGCGAGGCGGCCTGCATGAGAACTTACTGGTGCTGACAGCTGCAAGTAGCACTGGGGGAGCAGAGAGAGTGTGGTAGTGCTGAGAGCGAGGGGAAAATGTGCTCTGGGCTGGAGGTGTGACCTAATTCCCCTGCTCCCTTTTTTCACCCTGTGCGTGTTCATGAGGCTCTGTGCCATCGCCACGAGGCCTTGAAGCAAGTCTCAAACTGTGGTTTTGCTTTCTCCCAGTCTTATACATGTTGTTTCTCTTTAACAG
Seq C2 exon
CCATCAAGGTGAGCTGCGTTGGATTCTGTGGGGTGTCAAACAAGATCAATGACACTGCCTGGACCGTGGAGGAGCAGTACTTCAACAGCACGCTATCTTTGGCAGACAAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSGALG00000008475:ENSGALT00000013811:1
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion (1st CDS intron)
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0033924=Arrestin_N=PU(24.8=82.5)
A:
NA
C2:
PF0033924=Arrestin_N=FE(27.8=100)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]