GgaINT0132816 @ galGal3
Intron Retention
Gene
ENSGALG00000002225 | Q5ZI26_CHICK
Description
NA
Coordinates
chr19:4449792-4463498:+
Coord C1 exon
chr19:4449792-4449822
Coord A exon
chr19:4449823-4463313
Coord C2 exon
chr19:4463314-4463498
Length
13491 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GGGGTGAGA
5' ss Score
4.74
3' ss Seq
ACTGGCTTTTCCCCTTTCAGTTA
3' ss Score
11.18
Exon sequences
Seq C1 exon
GTGAGGAGACGGCAGCGGGGCCCGGAGCGGG
Seq A exon
GTGAGAGGCTGCGGGGGACCGGCGCGTGGGTCTCGGAGCGGTGGCCCGGCTTCCCTGCCCGGGGCTGAGGGGCGCGGATCCCCCTCGGTGTGGTCCCCTGAGGGCTGCGGGCTCGGCGGGCCGCGCTGGCGGCGTGCGGGACGGTGCGGTTTGGGCTCTGCGGCACGGGGAGGTCCGAAACCGGGAGCTGCCGGCCCGCCGGGGGCAGCGCCTTCCTGAGAACCGTTCGCGGCGTTTCCTGGGGGGGTGAGGGCGGCTCTCGGCTCCTTCCCGGCGGCTCTGCCCGCGCGGTGACACCTGTCGGCCCTCCCTCGGGATGTGAGCGGCAGCGCGCCGAGGGCTTCCAGCAGCGCTGCGCGGGTAGCTGTGCCGTTAACGCGGTGTTGTAGCGTTACGGCTCTTTGGTTAAGGTACGTTCGGGGCAACGTGTGCCTGGCCGGGACGTAGGAGCGTTTTCTTTGTGTGTCTCCTCCTCTCGGCCCGGCTGTGGTGCTGTGGGAGGCAGCGCGGGGCTTCGCAGCGCTTCCCCCTTTTCCCACGCCGTGGTACCTCTGCGGAACTTCCAACGCAGCCCTTTGCAGCGCCGGGGTTGGGCTCAGTGTTGGTTATGGGGCCCTTCCAGCTCAGGTTGTGCCATCACTGTGTGTTTCTTTCTCGGTTCTCCTTTGGTTGGGATGGGTGACGGCAGGTGCTGCAGGAGCTGCCGTGTTTTGTGTGTCACAATGTAGCGGGTTGTGCTTAAAAGCTGTGACCCCTATATGTGAAATTAAGGGACAGTTAAGGCGTGTAGGTGACGATGTGGGAAAAGAAATAGCATTTACCCCTTGTTGTCACCTCCACTGCTTTGTGCAGAGCTGGGAAGGGGAACGTGGAGCTGTTGGCTCTGAATGCTCGTTCTTATCCTGTTTGGATCCTGTCGTGCCCCATTGCACAATGCTATCTCTTTAACCCATTTTGCATTCCCAGTGGTTGGGAGGAAGGTCTCTTCGTTCTCAGGGACCTTTGCTTCTGTAAGCGTAATTATGTTCAGTAGAACAATTGGGTCTAATGAAACCTAATGACTTGCTCAGGCTATTGTTGTGTTTTCTATTAGGGGCAATTCTCTCTGCTTGCGTGAGCCCTGCTGCAGCTCCCCAGCTGTAGCCCTCTGTGGTGCAGCCGTCCCCCCGGCTGGTAGCAATTGGGCTTAATTAAAAGCTGATTGCCATCGCGTTGGTGCTCATGGATAAGTGCTTAACAGCTCAAGTTTCTGTTGAATTGGAATAGCTTTAAAGCCATAATTTAGATGCAAACTCTTCAGTCGGGCTAGAGCATGAAACTCCAGTGCTACACATAGAAGGGTTATTAAAAGTGGTGCTTCAGACTCTGCAGCAGCTTGGGCAGGCTGTCAGGTGCTCATCAGTTGCAGTGATCCGTTCGTGCTGCCCTTGCTGACTCACCTGGGGCTGCACCTGATGCACAGCTGTGGTCTGCATCCTCACCTCCAGCTGGGGGAGATGCCGTCCCTGTGCTGTGCCCATTGGTGTTGCTGGAATATGTGGAGGAAAAGACACCTTTTGTTAGGTGTAGGTTACCTTTCCATCTCTTAGAGTGCACTGTTGTATGCATGTAGGGTGTCTTGCAGTGTCTGCTCTCTGAAGCCTTTCAAAGGCCCTGAGGAATATGGAGCCTGATCCAAAGATAAGAAACAAGCAACTCCTGTGCCTTTGAACCGGTGCTTAGGGGTGGAAGGGGGAGAGAGATTAATGTCTGATGAAAGAGAGACAGCGAGATGTGTGCCCATCTTAGGGTGAATGGGGCAGTAACTGCCCTTTAGCTGGATGAGAGGAGCTGCAGCTGTGTGGTAATGAGCATGGGGGAACCTGGTGCTTCTCTGTAGTCTGAGCTGGGATGGGAGCATGGCATGAATTTGCTTCATGCAACCCCCCCCTTCCCCTGTACCCCAGCACCTGTCTGTATCCCCCATGCTCTGCTGGTTTTCCTCTGCTTCCCGGTGAAGGTCATGGCAAGAAGGCAGAGATTAGTGCTTTGAGCTCACACCAGCTGGCACTGAGGAGCCAGAAGGCTCTGCAGGATGAGTAACTGTGGTCTCCATCTCACAGGTGGGGGGGAGAGCCGGAGTGGGAGAGTTGCAGTGCCCTGAATTGATGTCAGAAGCAGCTCTTGTCTGCAGGCTGGGCTCTGTCACCAGATGGTGCATCCCTCTGAAGGTGGTTATTCAGTCTCCAGACAGCACTGCCAGGTTGAAAAACCACAGTTTTCTGTAAGAGACAGAGTATGGCTGTCAAATGGGGATCTTACATCTTTATTTTCTCTTCTTTCTCAGCCAGTTTCTCAGAGCTGAGATAGAGCTCGTTCCAACTTAGAGCCTTTCTTGGCTTTTTAGATCTATGTTCCCATGAGGTACCACTTGCTTTAAAAAGAGCTGTTGCTTCCTGAGGGGCTGTTTGTTCTTCTCTCTATCATCTCTGAGTTCTTCCCATTAGTGGTCCTCGAGGTTCTCACTTCAGCCTCAAGTAGGCTTTGTGCTCCAGCAAAAAAACCCCTTACAGTAAGATCGTTTGCATTGTATTTCCATGTGGGCTCAACTATTAATATCAACTTTCTTTTCCTCTTGACACCTTTTCATATTCAGAATGTTGTGGGAAGTGCTTTGAAGAACATAGATAAGCAGTGCCTTTGTGGTAGCTCTTCCTTCAGTCTCCATGCTAAGGGGGCACATGGGGCTGGGGCTGCTGCTGTGCTGCACGGAGATCCCCCCCATAGGACCACCGGGCTGCGTTTCTAAAAGCTCCATTTTAGAGTATATTCATCGGCTGGATTGCTTTCCTTTCTAGATCATTGCATATGATAACTCTGAGGACAAACAGGCCCTTGGTCTCCAGAACACATTTAAAAATGGCAAATGATCCCCCTAAAGAAACGCTTCCTCTGTTTAGATTACCAAAATCATTTTCCTTCTTGGATCCTCGAACCTCTTCCTATGCACGCCTGGCCTGCCGGGGCGGCTGAGATGTCAGGCATGATAGATGGTCAGAGCTGTTTTTCAGTAGTTAAACAATAATGGAGCTGTAGTGCTGCGGCGGGGGAACACTGCGCTCTGTGTGCGGACTTCGTCCTGCAGAAAGTTTCAATTGTTCCCGGCAGGGCTGCTCTGAAACACAGCTTCTATGGCTGCTCGCACAGCTGTCCAAACTGCGGGCTGCCTTGCGGCCGTCACACAAGCATTACCAAATAGTTGGGAAACAGTTTATTTTTCAGCTTCCATGGAAAGTGTGGATTTCCCGGTCCCTTCTGAGTGTATAGCCCAAAAAATGGGAGTTGAAGGAGGTGTTTATGGAGGTGCTCAGGGCTCGGGTTTCTCCCAGCTGACGCTTGCGTAGCTCACGCTGGCTGTTTCTCAGCACTGGGCTTATTGGTCGCTGCGTGTATTTCTGTGTGGGTTACTCAGATGTGGTCTCTGGTTGCGTATCTCTCCATGCACAGCCTCCCAGGTGAGACGTGTCATGTCCTGTGCAGGAGAAATGTGAGAAGGAGGTGATGCACCGTCACTGAAAATAGACTCAAAGCCCCCAACCTTCTTTTCAATGGCCTTCTTGCTCTTTCTTTTCTTGGTGCTTACCATAGCATCACAGAATGGTTTGAGTTCTAAGGGACTCCTTGAGGCCATCTCATCCCACTGCCTGCAGTGCACAGGGACACCCACAGCTCCGTCAGTGCTCACAGCCCTCCAGCCTGACCCTGGGGCTCTGCAGGGATGGGTGCCATCACTCAGAGCAGCCCGTGCAGTGCCTCAGTGCCCTTACCATTGCTGGTTCTAGCTCCTCTGAGCTGAACGCAGCTCCCAGCCCGATTTTTTTGCAATTGAAATTCTCATTTCAGTTATTTCCTACTTCACTCGGGATGACATTCCTGAAAAGAATTGAGATGTTGTTTAGCTTGCTGCTGGCGTCTCCACGCTGAATTGCAGTGCCTACAAAATGTGCATAGGAAATGCAGCTGGAATTCAAAGCGCCAGTAAATGACTGCTTGTACACAGCAAAGCCGTGCAGTTAAAGCAAAGCGCTTGCAGCATTTCTTGTCTGCCCTGGGAGACAGCTTCAACCTGCAGAGCTTCATCTGATAGCGGCGCTGATAGCATCTCTGAACCTTTCCTCGGTGAAAACCTATTTAAAGAGTTTCAGGCTGCATATTCTAGAGATACAACCATATTAAGCTGTTATTTTGTATGGGTTTTAGTTTCAGTTCACCTTTTTGCTATGTTAGATGTTGTTTCTGTCAGACTTTTAAACAGTGTGTTCAGAAAGGACAGCGAAGCCTTTTCACATCACAAAACATAGGCCAAACCCAAGCCTGGTTCATGAAAGACCTGGCTTTGTGCAGCAAGGTAAGGGGATCGTCCTCAGAACAAACCCTGTCTCCTCGCTGGGTTTTCAGGCTGTGTAACTTGGGAGGGTAACACTATGGGAGCCTGAGCTTGTTCCTTAGTTTGGGATGGGACTCTTAACAATACGAGGTAAGGCTTTTATTGCTCTGCCTGAGTAACAGATGTGAGCTTGAAATTAGATCTGGAATGCGTGGTTGTAGGTCCTAAATTTCTGCTGATTGGAAACAAGCCTGAAGAAAAGGATACCAGCTCTTCCTGTCTGCGTGGTCCATCAGCTGAGTCCTCGTTATGGAGGAAATAGCATGCAAGTATTTAGCAAACCTTCTGAACTTTAAACTGTAAGGAGGTCCTAACTATGTATTCACTGCCAGCATTTCTTCCCAGCAGTGCCTTACTTCTGCAAGCTGTGGTGTTTCTCTGAAAGTATCTAACTCCACTGTGGACGTAGCACTGTCTTGAAGAGATAACGTGAACTTGGTTCTGTTATATGCATTGTGTTGGGGAAACTGAGGCACGAAGCAATGAAGTGACCGCATGCAAAGGTCATCTGCAGTGGAGCTGGAAACTGAAACCAGGAATCCTCACCCCTAATCGTCCCTTGTTGTTTATTCAGTGACTAATCTGAAAGCAGTTTCCTAATGGAGGCTGTTGAACTTTAGGTCCTATTTTTCCTTAAGTAGCAATAAGTGGTGTCTGATTTTGTGTATGTAATCAAAAATGAGGCGGTTCTCATGTCCAGAAGTTCAGCAGCAAAAGAAGGGCTCAGGATGGGAGCGGGAGATGTCTGCTGGGACTGCTATGCTGGGAAGTGATGCTCGGGATCTGGGAGCAGCAGTGAGGATGTTTGGATTTGGTTTTTTTAAGCACTCCTTGTTAACAGGCAGTGTGAAGGCACAAGGCAGCATAATGTCTCAACTTCCATAAGAGCTGGTATGTGTTTTCTTAATGCCCTGACACCAGGTTCCAGTCTAATACAAAAGTCTGATCTCTCATTTTCCAAACAAACCTGGAATGGAAAAAAGTTTGTTTCTTCCCAGTTTCAAGTGAAATGAAAGTGAAATGGAAATGGGACGATGTTTGTGTGCTGCGAAGGCTGGAGGGGAAAAAATGCAAGAAACCTGATTCCAAAGCAAACTTAAAAGCAAAGCGAAGGCCCCATCCCAATAGCTGGAGTGGAGCAGATTTGTTGGTTTATAAAACCCAGTGATCTCTGGAGCACTGACTCAGGATGTCTGAATGCCTGGGCTTGCCAAGAGCCACGAGCTGAAACGTGGACCGAGTCTGTTTATGCCATATATGGGAGACTTCCTCTTGGTGACAAAGGTTTGGGGTCCGAAGGATGTGAGTTCTTAAAGGCTGAATGAAGCTTTTATTACTTATGATCTTCTCAGTCTTTTCTACCTATCTTCCACAGGTAGGATCCAACAACCACTTCATGTTCAACAATCCTGGCTCTGCTTTGGTCGATGTGAATTCCAGCTGTGCCTTAGTGGTGTGCTGCCCTGCGTCTGCTGGCAGTTTGCACAGATGCTTAAAGTGTTTGGCCCGGAGCTTTAATATTCTGCTGTAATACATCAGTAGAGATGTAACAATAAAGGAAGACAGCTTACTTTTTTTGGTCATGAATTTAGCTGCAGGGCAGAGAAATGATTTCTTGTATGGGAGTGGTCTGTGCTGATAGTGTAGGTGAGCTCCCCTGTGAGCTCTACCAGCACTACCACAGGATGTTACCCTTCAATCCACTATCCAGAAATAGTGGGCAATATAGTTGCTGGGTTTATTTTGGTGTTTCAGTTTGAACAAAGCAAGATTTCAGCCCCTGGTGGTTTGGGGTTACAAATCCTTAACGTTCTGCAGGGGTTGAGGCTGAAGGAAGAAGAGAGGCACAGTTCCTTGGCTGCTGCCATTGCTCAGTTGCCAGCTTGAGAACCTTTCTGCCCTAGAAGCAGGTCCTGCAGGCGGTTGGAGATGGGCTGCTTTACATCATCCTTCCTGTTGACTGCTGAAAGTAGTTCCTGTTAGTGCTGCTGGCAGGCATGGGTGGTAAGGCTTGCACTTTCCCTCAGTTTTCAAGCTCTTATACAGGGTTACATGTAAGCAAGTTCCAGTTTCAAATGCTTCAGTGCTAAATGAAGGCAGTTTGGCACAAGAATGATTGTTAATATCTATGGAAATGCTTTAAGAGAAGAACTTCAAAGTATCTCTCAAGCTTTCACCTCTACCAGCTTACCACAAACGAGGGTGGGTACTTCTCTCACTGCCTGCAGATGAGGTGACTAAGCCATAAATGAACTGATTTTTGGGTTTCAACATTTCCTTTGTTGTCTCAATAGCAATACTTGTATTCAGCTTTCTTGTTTTTCAGTGCTGTGGAATACCCTGTGCCCACCTTTCTTTAATTGCTAGCAAACACAGAGGTATTCCAATGAGCTGGAGAACAGAGCTTTCACACTATTCCAGCTGTGATCATAGCTGCGTTCAGGTTGGAAAGGAGCTCTCAGATCCTCAGCTTCCACCCCACCAATGTTGCCCCCTGACCGCATCCCTCAGTGCCACATCTCCATGGCTCTGGAACACCTCCAGGTGATCCCACCACATCCCTGTGCCACCCACTGCTCTTTTGGAGGAGCTTTTCCTTATATCCAACCTGAAAATGTGGCATTTTTCCTATCTCAGCACCTGGTTTCGATTTGAATTCAGGTTAATTTGGAATAAGTATAGTTAAGAAATGAGTAAGTGGTGTTTGTACTTGTTGTGGTGTGCCTAAATTACGTACATTCATATCTTTTTCAGCCTAGCCAAAGAAAAACAGTGTTTTTTCTGGCTGCAGCTGAACAGGTGAGAGGTTGCCTGCCAGTCTGCACACATCTCCGCTGCTATTTTACTGCACAGTCATCCATCTCACACATGGGTTCCTTGGGTTTGTCTTTTCTACCTCCAGGTTTGTGGAGGGAGGGGAAAGGAGTGGGCTTTGTGTGCTGGGAGTTCTGAGGCCGTCTCCTGGTTTCTAAAAAAAGATGTAAAGTGCAGTGCTTCAATAATAAATCTCAAACTTCCCCTGAGAAGTGGTTTAGGAGGCTTCCAACTGGCACTGTAGCTCATCAGTGAGCACTCCTGATCCTGGCTGTCTGAGATGGAGGTAGCAGGTCTTGAGGGCATTTATGCCAATTACAATCCCAATTTCAGACAATGTATTTCTGAATGCTAATGCAGTACCACCTCCAAGAGAAGCTCAGCTGTTGGATGAGTAAAACTGCAAGGCTTGAGATTATGCTTAAAGCTTTCTATTTTGGGAGCAGCTACTCTAGAGTACATCTCTCCAAATCCTTGTACCTGATGCCCTGAGCGGGACAGGCAGTTTGAGTACTCCTCACAGTAATTTATGGTGAGATGCATCTTGCTTGCTGTGCGCCCATCCTGCTAACGTAAGCTGGAGGAGCTCTGCCAGGGGCTATGCCTCGTTCTGTTATCAGCCTCCCCTGCACTGTGGTCCTTCATTCCAAAGATTAACTGTTATGAGCACATCCCTCACGGAGTCAAAATGGAAGGTGATATGCTGCGGGCTTGGCCCAAGAGTTTCAACAGACATAGCTCAATGACTTTTTATTTCAAGTGGGAATTTCAGTGGTATGATGAAGATACACACGCTGTGCCACCCTCTCCTCCGCTTTCTTCTCCAGTTCTGTGTTGCCCCCACCCAGAGGAGCGTCATTAAAGCCATGCAATGATGGTTAGCTTTTTCCTTGTTGGAAGCTGAGGTCATTCAAACCCCTTCCTCTGAACCCATGCAGTTATGTTAAGTTTTCAGATACACTGCTGTGTATTGCCACCCCAATTTGGGCAGCCTGAAAAAAAAGAAAAAAGAGCTGCTTGAAATGAAATCCAAGAAAAACTTGTAATGCTGTGCTCTATCATTTTTTCCTCTTTTCATTCACAAGGCAGCATCAATTCTGTCCTACCGTGAAAAGTACTGGCTGAAATAGTGAGCAGTCATCTTGGGTTTCTGGGCTGTTGACTGCTGCACCTTCCCCTTTTGCTTTCACTTCTGCATGTGAGATAAAGACTACAGACACAGGTACACGCACAAAGGGTGCCAGGCAGGTATGGTAACAAAATGGAGTACTTTGGAGTCTTAACTCTTTCAGAGTTTTCTCTCATCTCCTTCTGACTTGGTTTGTGTTATCTACTGCAGTGCACCGCATCTCAGGGATGTGTATGTTGAGCTGATGTGAGAGTGCACCACGTTTTGTGTTGGAAGGCAGACAGGCTGTCAGATCCATTCCTCTGCCAAATAATTTGAGGTAAAGGAATTTCAGACAAAATAGGTAAGACAAATGCTTGTCTAGAAGTAGTCACATGGTGGTGGTAAGTGCTGGGCTTTGTGCTAACTTGCTGATAGAATGTCATTCCCTTTTTGCAAGGGAAAAAGCAGGCTGTTGTTGTGTTGCTATCTTGGCAGATGTCTGGGATCCTAATTAGAGTTAACAGCAAGGAGAACTGTTACCTAAATATTTTTCAATATGTGCAGTGTGACTTTAGGTCAAAATAAACAGTTTACACTGAAATAACACACAACCCAGGTACCAGTTCCTTTTACAACAAAACAGGATTCCCAAAGTCCTCATGTGGGAACTGGGCAGAGTCATCTCGCACAGCCGGTGCTGTGGAGCAGGGCAGCAGGTGGGTGCTGTGCAGTGTGGGTGCACGCCTCGGAGCTGGGGGACTTCAGGACCACCTTCCTGTGCAGTGCTGCAGAAATCCCTCAGCTTGCTAAGAGCATTCTTGCAGCTTCCCAAGGAAAAGGTTTCAGAGAGGTGCTGGAAGTGCAGGTGCTCATGCTGGTAGCAGTGCTGGGGGTTTGCTGTGGGCATGGGGTGCTCACACTGATGATTTCCCCTTCAACCTTCTAACAGACAGAACAGCAGCACGTGTTGGGCACAGTCAGCTTGCAAACTGTAATGCAAATGCTGATAAGCACTGGTAAAGCTACAAAGTGTTCTTGGACTACCAACTGTATTTTTTACATGTGTTTGAGATCTCTAATTCTTAACTCTTTCTCTCTTTAAGCGATTTTTTTTTAAAGTGTTTACACTGCAGATGATTTACTCCGTTGTAAACTCAGTGGATAGCAATATATAGGGCTCTTTGCCTGCATGATGGTGTTCCTTGTGCAGTGTAACTGGGAAATGCTTTGGTGCTTTACTTCTGGAAGCGGTGATAGTTGAGCATGGCTGTGTTTCAACAGTGGAGCAGTGCTGGGCCTCTCTCTGACTCCTTCCTGCACAGCTCTGTGCTCTGCCCTGATGGGCTGCGCCATTTCCTTTCTGCTCTGCGGTGAATGGATGTCACTTCCTTGATTAAAATGCTGGTGTGCAGCCAAATTGCCTTCCTCTGGGCTCGTGTGTTCTGAGGAACAGCCCTGGGCTGTGCTCCTTTCCCAGCTGAGTGCATTGGGATGAATGTGCCTCTTGCTCCCACCTGCAACAGCCTTCCCACTCGCTCCACTGAGCTGCAGGAGTATGGCTGTGGCTGTTGGAGAAACTGAAGATGGATTACCCAAAAGCACAAGCTATGCTACCAGCCGTGAGCCCTCTGCATCCTATGGAGATGGTGTAGGCTGAGTGCAGGCACAGCAGGTGTGCTCCTTGGTGTGTGGAAGGCTGGCTGAGCCACCACAAAGTAAGGTGGATGCCTGCTTCTCTGAGCTCACTGCAGACTGACTGGAATGCCCCATCCTCTTTGTTGCTGGCTTTCTTAGGCTGACGTCCAGGTGGCCAATCAGACTGGTGAGCAATCGTGTTTGTCTTTATAAAGACTGTCAGTATAGCAGACTTGGATGAGCAGAGATGAGCAGTATTGAGCCCTTCCAGAACAAAATGTCAGTCTCTTCCTCCAAACTGTTGTGTTTCTAGCAGTGATACAGTTCTGATACTTATGTGGCTTTCCAAGGTGGTCATGTTGTCACGCTGTGCACATGTGAACCAGTACCTTTGCTCATAGATACAACTTTCCCATCTGTAGGTAAGAAACTAATGTGCTCAAAGCTGCTGTCCCAGCACTGAATGAGGTAGCTGTGCTTCCCCCTGGCTGGATGGGGCGGCTCCTGCTCTCCTGTTTCCTCTCCTCCATACTGATTCAGGCTCCAGCTCTACAGGTGCTGTGCTCAGAGGACAGCCTGCCTGCTTGCCTTTTGGAAATGCTGCCTTTGACTTCCCCTCCTGCCCCAGTGTATGGTTTCTCCCATTCATCGTAATCCAGGTCTGTGTGCCTGTGACATAGACTGAGTAAATGTCACTTGATAACAGGGCTACAGAATAACCTGCTCAACTAAATGCTAATTTGTGCCCAAGGAAGCAGTGTCTTCACTTTTCGAGTGGTAGGTTATTAGTGGAACTAATTTTAGCAGCACATTCCTTATCAGTGCAGGTTTAGCCTGTGTTGTTTATTTTTTTAATGAGCAATTATGGTCTGCTTTTAATGAGGCACCAACTAGTTAACTCATTGAATACTTCAGCCATTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCTTCATGAAAGTGGGATCTGTTAAATTTTGCAGGGGATACGGCATGGAATAATAACATAAGAATCACAATTTAAAAATGCTGGAGGAAGAGATGAATGTTTTCAGGTCGCAGTGGCCTGTTGGGCTTTCTGAACAGATTTCAGCAGCCAAGCTGCTCTTTGTTTTGCATCCCCCTCCCTTTTTGGCACCCTTTTCTGTTTGCAGGAACTTCAAGGGTTGGCGATGGCTGCAGGACTCCTGGGAGGAGGAGGGCTTATTGGGGCTTCTGCTCATGTGGGAGCAACATCAGCTGCTGAGGGAGAGCTGTTCCTTTTGATCCCTTCCTTCAAGTGCCACTGTGCTCCTTTCCCCACATTCCTGAGCAGCCAAGCACACTCACAGAGAGCTTTATGAAATGGAGCCGAAAGCTCAAAGATTCTGAGAAATGTTGGTTTTGTTTGTTTGGGTCCCTTAAGGTTTGCACTCATAAAAATTCCCTTTCTTTTCCTATTCAAACACAAGGTCATACAGCCAGAGCCCACCTTTTGGGAGAAATCCATGATGCATGTGTAATAAATCCTGCATGTAGACAGTCTGCTCCAGCCAGGAAGGTGTGGGCATTAATACTGCATGTAGAGTAAGAGATATGGTGAGAGCCTGACTTAAAATACTATTATTTGAGTATAGAAAGCATCAAAACCCAGACATGCATTATGAATACCATCTCTGATAGTGTATGGGACAAAAACTTGAACATCAGTGATGTTTCCTCTGGGATGGGGTAGTGCTTGCAGGTCCATACAGAGCTCACAGAGATGTGTAGAGCTGGTTTGCCATGTGGGTGGCAGTGTTTGCGTGCCCAGGCAGGGCTGGTTTTAATCCTGTACCCCCACCCTTGGTTCTCACAGGTCCTGCAGGTGCATGGTGCAGGGCAGCCTGGCTGCCTGCAATTACCTGCTGCTTGCCTATGGTTCAGCTTGCACTTTCCCAAAGGTATGATATGCTGTCATCCTGCAGCTGCATGGGTGAAACATCTGTTTTCTGCCATTGGCCACTGTGAGTGCTGTATCCAGGAGTAACAAAGACTGCTGCTGTTAGTGCTGCCTGCGGTGTTGACCTGCTGGCATGGCTGATATCTTTTCCTTGAGTTGCTGGAGAATTGGTTGTGTGGCTGTCATACATCAGCACAAAGGGATTTCAGTGGAGCATCTGTCAATGCAAGCCCTGTGTGCAGGCAAACTTATTCACAGAGGTTTGTAAGCAATTAAAACCAACATACACTACTGCAGTATGCAGTGCCTGTGTTGTGTGAGTGGCTGTCGTGTTTCCATGTGCTCCTGTAATGATGGAAGGTGTCTTTGGGGAAAGGCCTACAGATCAGAGGCAGTCTGGTCAGTGGCTGTTGTCAGCCTTTCTGTTTCCCAGCAGTGACACAAATCAGCTGAATGTGGAGTTGTCTTATTCCATCCTGCTTTGTGCACTCCCTTGTTTTTCTTCCTGACGTTTGACATGTTGCAGTGTTCCGGAGTGAATTAGTGGGCTTGTTAGGAAAACAAAGTGTTGGGGGTGGGCGGTAGCATTTGTGTGCTTTGCTCTCGTGGGTGGCCTCTGGTTTGTGGGGGTCTTTGAAGCAGGAGCAGCGCCTGCCTGTGCTGCTGCAGGGCCTGGGGATGCTTGTTTCACTGTGCAGGGATCTCTCCTGTGGTTTAGATTTGCAGTTCCTAGGAATAAACCTCCAACAGCACCGTTTAAAGCACAAATTTGGTGCTTTTGCATGATTTTGGGATGTGTTAATGCCTGAGAAGGGCTGATTGCTTGGAAATCAATGTGCAGAAAGTAACTTTATGTGTATGATACATAAAGTATATGTTTTGATTGCAGAGCTCAGACAAATGGGTGATGTGTTATTGCTGTCCATGGAATGTCTCTCTGTGTATTTATCAAGCGATAATTACCTCTGCTTATCCGGGGTGGCAGTGGTGGCATGTGGCAATGAGCACCAGGCTGACACTGCTGCATTGCTGTCGGTGCCTGCAGGGCCGTGTGGCACTCAGAGGTGCACTGCTCCCATTCGTTCTCATGTATGGTTACAAACAACTGCATTTAAACTCATCTTCCAACACTGCAGTGTGAGGCCAGGGGGCTGCAGGGTGAAGGCAGAAGTGCAGAGGAGGCAGTTTGTGCTCTGTTCACCAGGACGTGGTGACGTGGGGTGTGCGCTCTGCAAACGGAATGCCCAAATGGGTTCTAATTTCCTCTGTAACTCCCAAAGCGAATTTCCCAGCAGTGTGTTTCTGGAATACTTTCTCCATGGGTGGTCTAAGAAAGCAAAGCTTGTGTTTTTGTACTGAAGCCTGGTGGGATGTTGGCTGCGTGTTACAATGTCACTGGTTTTGGCCTTGCCAGAAAAAAACAAAANNNNNNNNNNGGTGGGATGTTAGGTTGTGGGTACATGTCACTGTTGGGCTTGCAAGAAAACAAACAAGTAATCATGTGTACAACTGTTCTCCCAAATAAGTTAGGGGAAGTTAATCCCTGACTTTTCTCAAGTTACTGATGCTTACTGGCTTTTCCCCTTTCAG
Seq C2 exon
TTACTATGTGGGCAAGCTGCTGTAACTGGTTTTGCCTGGATGGCTCACCCGAGGAGATGCAGGCACCGCAGGGAGCCCGTGCCCAAGCCTACTCCAACCCCGGGTACAGCTCCTTCCCATCACCCACAGCTTCGGAGCAGAGCTGCAAAGCGTGTGGGCTGCACTTCGACAGCTCCTCGAGGAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSGALG00000002225:ENSGALT00000003484:1
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
5' UTR
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=NA A=NA C2=0.083
Domain overlap (PFAM):
C1:
NA
A:
NA
C2:
PF054587=Siva=PU(52.1=81.7),PF0231811=FYVE_2=PU(32.8=36.7)
Main Inclusion Isoform:
NA
Main Skipping Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Rat
(rn6)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]