HsaINT0014175 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000119787 | ATL2
Description
atlastin GTPase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:24047]
Coordinates
chr2:38343268-38377273:-
Coord C1 exon
chr2:38377143-38377273
Coord A exon
chr2:38343513-38377142
Coord C2 exon
chr2:38343268-38343512
Length
33630 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
TAGGTACGG
5' ss Score
7.82
3' ss Seq
TCTTTCTTTTTAAATTCTAGGTG
3' ss Score
11.92
Exon sequences
Seq C1 exon
AAATCGGTACAAGATGGCGGAGGGGGACGAGGCAGCGCGAGGGCAGCAACCGCACCAGGGGCTGTGGCGCCGGCGACGGACCAGCGACCCAAGCGCCGCGGTTAACCACGTCTCGTCCACGACCTCCCTAG
Seq A exon
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Vast-tools module Information
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Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Genotype-Tissue Expression Project (GTEx)
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development