HsaINT0035518 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000122966 | CIT
Description
citron rho-interacting serine/threonine kinase [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:1985]
Coordinates
chr12:119784960-119803389:-
Coord C1 exon
chr12:119803206-119803389
Coord A exon
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Length
18140 bp
Sequences
Splice sites
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Seq C2 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
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Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
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Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0043319=Pkinase_C=WD(100=75.8)
A:
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C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
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Other Inclusion Isoforms:
NA
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Conservation
Fruitfly
(dm6)
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F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development