HsaINT0045722 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000188215 | DCUN1D3
Description
defective in cullin neddylation 1 domain containing 3 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:28734]
Coordinates
chr16:20862108-20900384:-
Coord C1 exon
chr16:20900204-20900384
Coord A exon
chr16:20862644-20900203
Coord C2 exon
chr16:20862108-20862643
Length
37560 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GCTGTGAGT
5' ss Score
7.39
3' ss Seq
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3' ss Score
10.15
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Seq C2 exon
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Vast-tools module Information
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Average complexity
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Mappability confidence:
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Protein Impact
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No structure available
Features
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Domain overlap (PFAM):
C1:
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A:
NA
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NO
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NA
Main Skipping Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development