HsaINT0048179 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000151240 | DIP2C
Description
disco interacting protein 2 homolog C [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:29150]
Coordinates
chr10:422824-440996:-
Coord C1 exon
chr10:440871-440996
Coord A exon
chr10:423034-440870
Coord C2 exon
chr10:422824-423033
Length
17837 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAAGG
5' ss Score
11.08
3' ss Seq
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3' ss Score
10.35
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq C2 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000151240:ENST00000280886:4
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=1.000 A=NA C2=1.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF064646=DMAP_binding=PD(26.3=69.8)
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA

Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development