HsaINT0052531 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000151914 | DST
Description
dystonin [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:1090]
Coordinates
chr6:56600069-56610562:-
Coord C1 exon
chr6:56610427-56610562
Coord A exon
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Coord C2 exon
chr6:56600069-56600221
Length
10205 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTAATA
5' ss Score
8.49
3' ss Seq
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3' ss Score
8.42
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq C2 exon
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VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000151914:ENST00000370788:35
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.249 A=NA C2=0.052
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Genotype-Tissue Expression Project (GTEx)
- Autistic and control brains
- Pre-implantation embryo development