HsaINT0095402 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000228315 | GUSBP11
Description
glucuronidase, beta pseudogene 11 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:42325]
Coordinates
chr22:23659865-23683867:-
Coord C1 exon
chr22:23683725-23683867
Coord A exon
chr22:23660001-23683724
Coord C2 exon
chr22:23659865-23660000
Length
23724 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTGAGC
5' ss Score
9.6
3' ss Seq
CTCTTTGCCTTGAATCCCAGGAT
3' ss Score
6.65
Exon sequences
Seq C1 exon
GACCTGCTGAAGCTCACACCCGTGGACCACCCAGACTGCCTGCCGCTACAGGATGCCCTCCGCATCTCCCAGGACTTCTTTCCGGCATCAGTGTGGACATTGACCCCACTGGACTGCAGTCACAGTGGACTCCCAAGGGGCAG
Seq A exon
GTGAGCTCATGGCACAGCAAGGCCTCACGCTCAGGTTGAGGAGCCCAGAGTGGACCAGATCCCCAGTCCCTTCTCTGATGGCACAGGCATCTCTCTGTGCCCCTTGTCTCTGCAACCCTGATTCCCCATTCCCAGCCAAGGAGAGGTCTTCGATCCCTGGTCATGCTGATTTGATTCCCTGTGGCATTGTGGGCCCTAGGCTGAGAGCTTTAAGCCCAGTCTCTCAATAATCCTAAGAATCCAGTGAGCCAGAAGAGGGCACAGGACCAGAGAGTCTCTCCAGGTACGCCACACAGTCTTTGAGCTGTGTCAGAGCTGGATTGTTTACCTGGGGCTGGCTGTTTGGAGGCCCCAGGCATTGTCCCCCACACCAGGGAAGTTGGCCTGTGGGTAACTCGTTCTTGAATGCAGACACCTGCCTATGCCATCAGGGTGACCCAGGAGGGTGAGGGAGCAGGACATCTCAGCCACTTTAGATTGACTTGCATGAGCAAGAGCCAGGAAGGGAGCCCCACAGAGGGAAAGGCTGGTATTAGAGGTGGCCAAGGCCATCCAGGTTGCTGGAACATTCCACATGGGCTCCTGGATGTCAAACAGCAGTTTCCCTGGGGGCCCTTCTTGGTGGAAGGGTGGGGGTTAGTCCAGTGAGGAGAAACAACACTCAGCATGAGAGGCACAATTAACCCCTGTGGGTCGGCAGCCTGGCCCAGATCAAAGGCTTCCTGACCGATAGAGGTTGTTATGTGGCCCTGAGGAGTGAAGACTGCCTGGGTTCATGCTGCTTTGTTACATTTGTGAGTGAGGGGCAGGTCTGGAGAGTGTCTGATGGCGCATAAGGAGCTGTTTCTGTGCAGTTGTTGGTTCTGGTTTGCAAAACCATGGGATATCACTAGTTTGGTTTACTCTGGGGATATCTGAAAAATCTCTGGAAGACTTAGAGTAGCATCAGTTGTAGGTCATCTTAACTGTACGGTTTCAATGCACGCACCTACATCTCGCAGTGTACACAGGTCACACGGTGTGTCATAGAGACAGGAAAGACTGGGACAGATGGTTGCAGCCCCATGGAAGCCCCCCTGACTCTGAGGGTGGCTGAGGGGAAACTCTGGAAATCCTCATGGAGTAGAAACCATCCAGAGCCCAGGTGAGAGGTGGCTGCAGGTCCCCCCAGGACACTTCTGCAGCCCCAACCGAAGGCAGCCCGGGGTCTCCCATCCCCTGGGTATATTTGTTAAAAATGTGTCCATCATATATGAATTTGGGTTTGGTATTTGGTTCCCTCGTTGTGTCTTGTTCTGTATTTTTGTGTTAATGTCAATACCGTATTGTTTGGACCACTATAGCTCTTCTATGTCATTTGTAATCAGGGAGCATAATACATCCATGTACTTTGTATTTCCCAGTGATGAGATTGCTAGATGACATAGTAATTGTATTTTTAGTTTGAGGAGGAACTGCCAACTATTGCTCATAGTGTGTACGCCCATTTACATTCCCACCAGTAGTGTCTAAGAGTTTCCCTCTCTGTAAATTTACACTTGTGATTGCGTTTTAAAAATTCTGTTTTTGCTTTTGGCAACATTCATTTTATGTGGATGGGGACGCTGTCTTAGTGTGATTTGATTTAAATTTTTGTGATGATTAGTGATGTGGGCAAGCTTTTTTTTTTTACCTGTTCATTTCCTGCCTTCTTTTCAGAAATGTCTATCAGTTCTTTGCCCAAGTTTTGTTGGATTAGTTGGTTTTGTGTATTTTCCTACCTTATGTTAGTTTCTGGTATATGTCAGATGAACACCTTCAGCTCCATGATTCCTTATACTTACCGCCTCACAGCATCCTGTGCTCATTCTGTCTCTTCCGCTCAATGACCACTGCCTGTGTCCCATTCTTCTCCCTCCCCAGGGCAGGGCCCAGACCTCCTGCCTCCCATGGAAGCCTGGCCCAATGCGGGGCCAGCCACATGGCACAGTGTCCAGGGCCTTTCTGAGTGGTGGACAGGCCAGTTGGCATGGAAAATGGTGTCTGGGGTTTCTGAGTTGACTGTTGAATGCAGACTCAACCCACTCACAACCAGTCACCACCACTGCCACCCAAGCAAGCCACCTGGGAGCCTGGAAATTGCTCTGCCCACCTCTTGCCATGGGCACAGACACATACCATAGGGAGGACTGCCAACAGACCCAGCCCACCTGCCCCTGGTCCCCAAGGATGACATTCAGGGGCCTGGGGATCACCCCAGCCCACCAACCACAACCTGTGTCCATGCAGGCTCCCACAGGGCCTAAGGACAGGCTGACCCCTCCCAGAGAACCCCCACCCCACAAGTACCCAAGTACTTCACCCAGGGACCTGGGTATAGACCTGCCCTGCCTTCCACTTCTGGCATGTGCTTGCACCAGCAGGGGGCCTAACAACAGGCCAGACCACCTGATGCCAGCATCAGGTCCCATGCCATCGTGGGACCTGGGGATCACCCTGCTCTACCCATGAGCACCATCAGGGGCCCCGGGGCAGGTTCATCCCACCTGGCATATGTATGCATGAACTAGAAATGTGTTTGCCTGCTGGGCATGGTGGCTCACGCCTGTGATCACAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGCTGGCATGTGCCTCTAGTCCCAGCTACTCTGGAGGCTGATGCAGGAGAATCGCTTGAACTCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGGGCCAAGATTGCGCCACTGCTCTTCAGCCTGGGGGATAATCCGATTGAGACTCCATCTCAACAGCAAAAAAAAAAGTGAGAAAGAAAAATGTGTTTGCCGCTGTGATACTTTCAACAACTCAGAGACATGGGGAAGCAGTTGATACGTCATAAAAAAAAGCCCGTGGCAGATCCAGCTGAGAGATGTGATGGCAGTTCTGCTGCTATGAAAGCAGTCTTTCTTTGACATTAAGGTTTGTCACAGCTCTTGAAAATTTGGCAGTGAGGTTGAAGGTCTCTCAGAAATTCCACGGATCCTTGTATTGCGTATGCATGAATAAAGTTAGAAAACTTTTTTTATCTTTCTCTAGAAATGAATATGAACTTGGGTTAACTTTCTGAGTCAGTTCCCTTGGAAACCTGGAAAAGGTGGAATGTCATCTGTGTTGGGTTACCAGACTACAAATAAAAATGGCCCAGAGTTGGTCATCATTATCTGAATTGGGAGAGCTGTGAATGAATTGTAAAACAATGGGGGCATCTCGAGTTAGAGAAGAGTATTTGCAATTTTTGAAGTCTGCCATCAATTGGACTTTGCTATTGTTAGAAATGTTTTGAAGTCTGTGGTCAACTTTTTCGTGGCTGGCTTTGGAGAAAAAATCAAGAGGTAAACCATACTTTGGGTTTCCCTGAGCGCAGTGGTGTTTGTAACTAGGCATGTCCGTTGCTGGGACCCTTGAAAACTTTGACCATGGGACTGTTAAAAGAAATCTCAGTGTCTTTTTGGGACACAGGCTTCTAAGCTTGGTAGCCCTGTGCCCACCCATGTGACCTTGCTGCTTTGCACGTGAGGTGTCACTTGGGGAGCAGGATCCAGAGAATAGCTCCTGGCCTGAAGTGTGGACAGCCGTGAGGATTCCTGCTAAAGACACAGGCAGGATACATCTGCTGGCACACGGTGTTTCGTGTCTTGTATCCTTCTACGTGATACCAATGGCACTATTGGCTTCATGGGGACTATTTTAGTCGTGTGAATGTTAGATGTATAAGTGAACTAAGGCCAGCCGAGGGCACAGTGGTGTGTCAGTGTCACTAATCATCAGAGAAACACAAATCAAAACCACAATGAGATCTCACCCCAGTTAAAATAGGCCTTTGTCAAAAAGACAGGCAATAATGAACACTGGTGAGGACGTGGGGAAAGGGGAGCCCTCAAACACTGTTGGTGGGAATGTAAACTCCCGACCTCAAATGATCCGCCGGACTCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGCTGAGATTACAGATGTGAGCCACCGTGCCTGGCCACAAATGGTATCGTTTTATTTTATATGCAATGGTTCGTTTCAAGTATATTGAATACAGTTCCCTTCTGCCTGTTTGTGTTGTATCACAAAACTCATATTGAAGCTCTAAAACCAGAGCATTTGTAAGCCACTCCTGGATTTTGAATGGGGCATGGATGGACTCAACCTCTTTTAATTCCTCCAAAGAATCCCATGAGATTTAAAAAAAACTTTCACTTTAGATTCAAGGGGTACATGTGCAGGTTTGTTATGTGGGTATATTGTGCAGTGCTAAGGTTTGGGGTATGAATGATCCCCAGCACCCAGATAGGACCCAATATGTAGGTTTTCAGCGCTTGCCCCTCTCCCTCTCAGCCCCTGCGGTTGTCCCCAGTGTCTATTGTTCCATCTTGATGTCCATGTGTACCCAGTGCTTGGCTCCCACTTGAAGTGAGAACGTGGTATATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCCGAGGCGGGCGGATCACAAAAAAAAAGATAAAATAAATAAAGGCTACAAATAAACAGTCAGATGAAGAGATAATATAAGGCAAAGACTGGAAGACTCCCAAGTACAGAAGTTTCTGTCCTAATGGAGTTGGACACATGGATGAGTTGGGTTTTTTTGTTGTTGCCCAGGCTGGAGTACAGTGGCACTATCTCAGCTCACTGCAGCCTCTGCCTCCCATGCTCAAGTGATCGTCCCCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACCACAGGCATATGCCACCATACCCAGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTGTAGAGATGGGGTCTCTCTATATTGCCCAGGCCGGTGGTGAACTCCTGGGTTCAAGCCATTCACCCACCTCGCCCTCTGGAAGTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACTGCGCCTGGCCTTG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Fruitfly
(dm6)
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INCLUSION PATTERN[edit]
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- Autistic and control brains