HsaINT0127095 @ hg19
Intron Retention
Gene
ENSG00000178209 | PLEC
Description
plectin [Source:HGNC Symbol;Acc:9069]
Coordinates
chr8:145012799-145025044:-
Coord C1 exon
chr8:145024352-145025044
Coord A exon
chr8:145012861-145024351
Coord C2 exon
chr8:145012799-145012860
Length
11491 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTCAGC
5' ss Score
7.16
3' ss Seq
GCTGGTCTTGTCTCCCCCAGATG
3' ss Score
10.35
Exon sequences
Seq C1 exon
GAGCCCGCGCCCTCACGCTCAGCACCCCAGCCTGCCTGCCCGCCCGCCTGCCCTGCCGCTGCCCGCTGTCACACCCTGTAGCGCGGGAGCTTCTCGCAGCGCCCCGGGCCTTCTCGTGGTACCCTGCCTGCTGCCTTTGCCCCCGCACTGACTGCCCGGCTCCAGCAGCCATGGTGGCCGGCATGCTCATGCCACGGGACCAGCTGCGGGCCATCTATGAGGTGCTCTTCCGCGAGGGCGTGATGGTGGCCAAGAAGGACCGGCGGCCCCGCAGCTTGCACCCCCATGTGCCCGGCGTCACCAACCTGCAGGTCATGCGTGCCATGGCGTCCCTGCGGGCACGGGGCCTGGTCCGCGAGACCTTTGCCTGGTGCCACTTTTACTGGTACCTCACCAATGAAGGCATCGCCCACCTCCGCCAGTACCTGCACCTGCCGCCAGAGATCGTGCCCGCCTCTCTGCAGCGCGTGCGCCGCCCCGTCGCCATGGTGATGCCCGCACGCCGCACCCCCCACGTGCAGGCTGTGCAGGGTCCCCTGGGCTCCCCACCCAAGCGGGGGCCGCTGCCGACGGAGGAGCAGCGGGTCTACCGTCGGAAGGAGCTTGAGGAGGTGTCACCTGAGACCCCTGTGGTGCCTGCTACCACCCAGCGGACCCTGGCCAGGCCAGGCCCGGAGCCTGCCCCAGCCACAG
Seq A exon
GTCAGCTGCACCCTGACCCCAAGTCATGATGGGTGGCAAGTAGGGGTCTGGTTGTCGGGTCTTGGGCCTGGGCCTGGGCTGGAGTGGTTGGAGTGGTCAGCCGGCTTGCGGAGCGTCGCTCACACCAGCAGGTGGCCCCCCCTAGCCGAGGGTCAGGGGGTGCGCTTGCTGATGGGCCCATGTGGCCCCTCCTCCTCGGCTGGGGACCTTCGGGTGTGTAGGCCAAGGAGGAGCCTGTGGCCCAGGCACACCCCGGGGCGCCCCCTCCCCTCTCTCCAACACTGCCCTTGCCTTCGCCCCCTCCGCCTCCTCTCCTGTCCCAGTGACCTGTCTTCCCCGAGGCTCCTCGGCACTGAGGTGGGGGTGTGCGAGGAGGTGCTGGCGCCGGTTGGGTGTGGCCCTCCTCCAGCACATGGCCTGGCCGCCTCCCTTGCCGCGGGGGTTGATGGGTGAGGCTTGGTGCCGCACAGAGTGCCCGGTGTGACCGGTAACTGAGTGCTTGGCCAGCTTGGACTTGGTGGTGGCTGGGGACGGCCCTGGGCGGGATGGGGAGAAGCGCAGGGTCCAGGCAGGAGGCTCCTCCGGCAGGGCAGAGGCCAGGCTGTGGTGTGGTGTCTGCTGGCCCAGCCTGGGGCCTAGATAGGCCTTTCCCGGTACGAACCAGGTCGCACAGGACAGGACGGGTCCTGTCATCCCAGAGGCTTCCAGAGACCCTTTGCTCTGCCCCTTCTCTGTGGCCTCCCTCTGTCCACAAGCACCTGTACCAGCAGGACCCAGGTGGGCAGATGTGTCCCCTGCAGCCCGAGGCTCACACACACACTGTGGAGCACTCTGCCCTCCGTGCTGGCTCCGGATGGCCCGGTCCCCCAGCACCTGGCCCCACCTCCCTCTTTGGGGCTGGCACCTGGGAGCAGCTTGCTCTCTCAGGCTGAAGAAGGGGGCCTGGGGTGGGGCTCTCAGGGTGGGCAGGATTTGCCAGGGTGTGGGGGAGGGGGCCCAGGGGAGGCCCAAGTTTAGGGCGCAGCTGCCCGTGTGGGATGCTGGGCGGAGCCCTGGTGCTGGCTGGCCTGGGGTGAGTTGGACTTGTTAGGGGCTTGCCTTGGGCCCATCTGGGAGGATCAGTGAGGCTGTGGGGTGGAGGCTGGCCTCCCCTCCTGGCTCTCTCTGCGGCTTTGGACAGGTTTAGTGGCCTCTCCAGCTCCTCTCTAAATGGACGACATGTCTCCCGACAGGAGGCATGAGACAAAGACTGCTTGGCCAGGCATGTAGTCCAGGCCCCGGCCCATGTGGCCTTCCTGCTGTCCTCTCCCACCCGGCACCCCTGCCCACCCACTCCCCGGTCATTTGGCAGCCCAGCTTCCCCATGCTCAACTCCTAGCTGTGGTGACTGGGAGTCCCTCCCCTCCTTTTTCTCCTTCCTTGTCCGTGGCTGGGCTGGGCCTGCAGGGCGGGCAGCTGGCGGCAGGGCCAAGAGTGGGGTGTGCTGGGTGTGGCTGCAGCAGGCAGAGCGGAGGGCACCCCTCCCCGATGGAGGTGACTCAGTCCCCCCAAAGCCACAGCCGCCAGCAGCAGCTCAGAGTTTCCAACAGGAAGCGAGCCACAGCTCCGGGATGAGTCAGGGCCAGCAGGCTCAAACCCCTCTCTGCCCTGGACCTCACGGGCTGAGCTTGGGATGGGAAGCTAGGGGAAGGAGGCGGCTCGGATGTGGGGTGTGGCAGAGGGCCAGGGCTGGGCCTCAGGCAGTGACAGGGGTCCGGATGGCCCTGCATACAGCCCGGGGCAGTTCTGATGATACCTGAGACCAGGCACTTCTTGGAGTTTTTAAGTGACCAAGCAGTGAGCTGCCCTGCCCTTCCCCACTGCACAGCCGCTCCGTGGGTTGGCAGAAGGGCAAGGTCAGAGCTCGTGGGCCAACTGTGCTGGTCCAGGATGGCCCTGTTGGATGGGCTGCCCCTCTCCACCCAGCCCTGGCTAGGGAGCACCAGCTGTACCCCTGCAGTGAGGCCCCTGCCCTCCCTGTGCCCTGGTGGTCTGCTTGTCCCTGGGTGGGGCCCATGGGGGCCTGCCAGCAACACATCTGTGTGGGAAGCCATCCGTCCACCTGCTTGTTTAGCCATGCACAGGCCAGGGCCAGACCCAGATGGAGCCCCTGCCCCAGGGGGCTCCAGATATGTGGGGTGAACTGGGTGAGGAGAGCGTGATGGGAAGGTGGCTTCAGAAGCAATCAGGGAGGGCTCTGAGGAGGTGCCTACCCTGCCAGGAGCAGCCCAGAGAGAGGGACAGAGGGAGGCCGGAAGGCCAGAGGGAGAGGACCCATGGGAAGGCCCTGGGCCTGTGGCAGAGTTTCAGTTGCTTGGTGTGGTGGGAAGCTGTAGGAATGTGTTTTTATATGTGAGTTTCATTTACGTTTCATTTTTATTTTACTTATTGTTTTGAGATGGAGTCCCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATAGCACAGTCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTGAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTTTTTTTTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAAGTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGCTACCGCCCAGCCCTAATTTACATTGCAAATGGCGATGCTTTGCCTGGCTCAAAATTCTGAAGGAACCGAGGATTGTGTGGAGGAGACGCCAGCTGAGCGCTGTCCATGCACCAGCAACGGGCAGGGGCCAGGTAGCCGCCACCACGGTGAGCGCTGTACACGCACAGCACCTAGAGCTGCTTCCCACAGCAAAGGGCAGGGGTTGGGTAGCCACCATGACTTCCCCTCTACACGGAGGACACGCCTGTGCCTTGACCTCCCCCCTTGACCCTCTGTGGCCCTGCGTCAAGGAGGAAGCCTGGAGGTGGCCTGGCTGCCTTGCCCTTCTTCCCAGCCACAGGGTGCTCTAGGTGGAGGGACTATGGCCCGGCCAGCTTTCCACAGGGATCACTGGCTTGGCCGAGTCACCCGTTTGCGGGATTTCTGTAGATCGCCGGCAGGCTTCTAAGGGGTAGTTACGATGGGATTTGATTTGCACTTCACTGGTCAGCAAGCACCTGGGTGGAGAGGTATGGAGAGGGGAGGCAGGTGTCACCATTGCCCCTGGACAGATGCCTGGGGCTGTGCTGGTTGGGGAGGACTCAGGTGGAGGAAGAGACCACCTTTGGGGCTGAGGAATGTGAGTCTCAAGGAGTGGGGTGTGGTGGGCAGTTTGGGGCTCTGCTCCCGCCTGGCTCCTGAAATACCGCTGGGCACATGGATGCCTGGAATGTGGGTGGGAGGGTGGGAGGGCAGGGCTGGGCTGGTGGGGCCTGCAGCGGGAAGGGGAGGCTACAGGGTGGGGTCTGCTGGGCGGGGGGTCTGCTGGGCGGGGCAGGAACAGTAGGGAAGACCCGTGGGCTGGGGCCGGAGGGCTCTCTGGGATTGCAGGCAGGCCAGTCCCCTGCACCCCCAGGCAGGTCTGCTGGGCTGGTCTGACCCGTCAGTCGGCTGGGCTTCATCTCTGCTTACTGACTAAGGGGTGGCTGCGAGGAGGAGCCGCTGCTACCAGGGCATGAGTGGGCCCTCCCTCTGCCTCCCACCCCTTCCCTCCTTCCTGCCTCGCCTTCCTCCCTGCCGGCTCTCGGAGCAGCCTGGCCTGTGTGGCAGCCATGGACAGGTACAGCATGGAGGAGCTGATTCAGCTGGGCCAAGGTAGGGCAGGCAGAGCTGGGGGCTGTGGGAGGCAGAGGAGAGGGCCGGGGCCGCCTCTGGCAGACCTGTCTCTTCCCGTTGTCCACCGTTCTGTGCCGTCAGACCTGGGATGCAGGGATAGGCACAGCCCCCTCTCGGAGCTGCCCCAGGGGTGTGTGTGATGTGTGTCCCGGAAGCACAGGCCTGTCCGGACCTCCGTGGAGTGGTAGAAGAACTGCCCGCTGCCAGCCTGGGGCACTCCTCCCGCCAGGAGCTGGTTCTCACCCAGGCCATTGAGTCAGGCTCCTCTGAGGCTTCCCCAGCACGTGGCAGGGAGTGGGCTGAAACGTCCGGCCTGTCGGCCCCTGCCCACTGCTGGCCAGATGCTGTCCTGGGCTCAGCTGGGAGTTGGGCCCTTTCTGGCATGCCTGGGTATCCCTGACCCTCAGGGCTGCCTGGGCCCGCCCGACCCCTGGCCGCCCAGAGTGGGCCACTGCAGGCATTTCCCTCGGCCGCACGTTTTTGAGGTGTGGGGCTGGAGAGCAGGAGGCTGGGGTGGGCCCGGCCCTCTTGTTGTCCGCGGGCTTCCCAGCATGGACCTGGGTGGCCTGCCCAGTGGCCCGGGGCCAGGCTGGTTCACTGTGCCTTGCTGTGGGCTGAGGTAACTACACTGGAGGCCACCTGGGCTCAGATGGCAGCGTGCGGGACAGCAGGCGGCGCCTCAGGCTCCTGGTCTGTATGAGGCCTTCATGGTATAGGACTTCATGGGGTTTGCTGAGGGTTCCATGTGGTGCCAGGAGCGACGCTGTGGAATGGGGTATACCGTCAACGTGCATTCTCCTGGGCCTGAGGGGTGCGCCCAGCAGACAGGGGTCCCAGGAAGAGGAGCAGGACTGTGCGTGTCCCACGTCCTGTTTCCCCGGCTGCATTGGGATCTGATCTGCATAGGATATGCTGTGGGCCTGCCTGTGGCCCGGCTCTCTGACCCAGGCCTTCCACAGAGCAGGGCTTCGGGACTCCTGGGTGGAGCCAGGCCAGTCTCCTGCCGTGGCCCAGGAGAGGCGTCTCCATCCCAGATCCCTGGGACCCCAGGAGAGGCTGTGCTGTGGGGCAGGCGCAGGCCTGAGCCCTGGTTTCGGGCTGCCTGGGTCTCTGGCCTGCGCGTGACTTTGGGGTGGCTGTCCCGGCCACCGGTGGGGCCAGGTGCTGTGTTGAGTGACCTGCGCAGGGCCCTCTGGGAGAATGGGCGGCCTCTTCTCTTGGCCCCTGTGGCCTTTCCAAGAGCACCCCCTGGCTTGGCAGGGCAGGTGGGTGGGGACTGCACCGCCTCCTGCAGGGACGTGAGCCCGCACCTCCCGCGCCCTGCTCTATTATATTAGAACCCCCTGTGGGAGCTGGGGGACCGAGGTGTCGGGTGGCACCGTCCAGCCAGACCTGACTGCAGCGGGGCCTGGGTGCCCTGGCGCCGTGCGTCATGTTCCAAGTCTGGGTGGTGACGGTCCTTGCGCGCCCTCCTCGGATATTTATATCCCCTGGGCCCCTGCCCACTGCTCCCCTCCCCCACAAGCTGCTGCTGACAGCAGCACGGCCGTGCCCTCCTCCCACCCGACGCTGCCGCCAGTGGCTTGTGCCTCCTCCGAGGGGCCTGTGACCTCCCACACCCCTGGCCCGCTCCGTCTGCCCCGTGGGCTCCTGCCACCGTCCCCGATGAAGATCGTGCCCGGTAGGTGGGCAGCCCTTGAAAGCCTTGTGAAATCCTGGCCCCTTGCTGGGGACAGGGGCCAGAGGGCTGGGGCTGAGGCTGGAGGCCAGGGGCGCTGTCCCTCGCCCTGCACACAGCCTGCCTCATGTGCCCTCACCCAGACCCCCTCAGCCCTGGTCTGCAGTCTCACTTTTGGGGTGTTGGGGCTGGTGAGGAGGGCGAAGTTGAAGGAGTGCAGTGGGTTCAGCTGCAGGCTTGAGGTGGGGGCTCTGGCATCCCTCCATGCCTGCCAGCTGTCCCCAGAGGGCAGCCTTGGAGGCAGAGTGGGCTGCTCGGGCCCCTCTTCTGGTGGGGACAGCAGGGGGAGGCTGGGAGGGAGGGAGGGTGTGTGCCGAGGCCGCGGGCAGTGCTGGGGGGCTGCGGCTTGGCCAGGCGTGCGGCTGGCCCCTCCTCCCGGCGGGTGTGGCCGCGGGGACGCAGGGGTTAAGGCCAACTAACCTTGAGCGTCAGTAGCCCTGCGCAGGGACAGCTGAGCCGGCCGGGTGGGGAGCGAGGGTGGGGAGGCGCCGAGGGCCGGACCCGCGGAGGGAGGAGGAGAGGAGGCGGGCGGGAGCTGTTGTGGGGCTGCCGCCGCGTATGGGGCGGTCCTGCGGGCAGGGCAGGCTCCGGTCCCGGCGCTCCCCCTCGCTCGCCCTGCACGCAGGGAGGGGGCTGTCTAGCCTGGAGCAGCCGGTTCCCAGCGCAGGAAGGGCAGCCCTGGCGGCTCCGCGTGGCGGCTATGGAGCCCTCGGGCAGCCTGTTTCCCTCCCTGGTGGTTGTGGGTCACGTTGTCACCCTGGCCGCTGTGTGGCACTGGCGCAGGGGACGTCGGTGGGCGCAGGACGAGCAAGGTAAGCCCCGCTGGTGGCTGCCAGGGACTCGAGGCGGGGCAGAGGGGCCGCCTGCCTCCCGCCCCTTCATTCCCTGCGCCCTCCCCTTCCTGTTTCCAAGCTGAATGTCAGTGAAAGCAGTGTTGCCCCTCCACCCCACCCTGCAGTGTAGACCCTGACCCTGCTGCAGTCCCAGGGCGGGGCGGGCTCTGCAGTGGCCCTCAGCCTGCAGCCTGTGCGGGACAGGTGGGTGGAAGCGGAGGCCGGCAGGGCAGGAGCGTCCCCCACACGAAGGGAGGCCTGTGGCAGCCGCCGTGGCAGGGACAAGTGGGCAGGTGCCTGTCCGGCCAGCACTGAGGTGGAGGTGGCTCCCTGCACACACAGCAGGGGGTGGAGCCACACGCAGGTGAGGCAGGTGCCCTCATGCCCTCGGGCCGCACAGGGGGCGGGGGCAGCCAGGCTGTGCCCTGCCCTCCCTGCTCAAAGTCACCAGCTCCTGGGCTGTGGTCCCAGGTGGCAACCGTGCCCAGCACAGGATGGGGCGGGGCCCTGGGGATTGGGCAGCCTCAATTATGGGCTTCTGGCCAGAGGGACTGCCTATCGGGGACCTGGCTGGCCAGACCTCTCCTGCAGTGAGGGCGCTGCCTGGCTCAGCTCCTCTGCTGGATCCCCGGACTTGAGATGAGTCAAGATGGGGCTTCTAGGCGTGGCGCTGGGGACGCCCGGAGCTGCCGGGGACTCAGCTGCCAGGATGGGACTTGGGCTGAGGGCTTCTTCCCCATCCATGTTTTTGGCTGGGGACCAGACACTGTCCCTGCCTCCCCACCTCAGCCCACAATTGCCCCCTTCGGCCACGGTCCTGGCTCACAGGATGCCTCTACTCCCTGGTGGTGCCAGACGCGGCTCAGCTCCTCGGTTCTGCCTCCAGCGTTGTCTGCCCACCACCTGGCCCCATGCCCTGCCTTCCTCCCTGGGCCCTGCAGTCCCCACCGCACATCCTGCTGGGAGGCCCCCTCCCATGCCGCTTCAGTCCCAGGGCAGCCTCCCAGCCCGGCCCGTGGGTTGGGGCGCGGCTTCCTGGCTGCGCTGGGCGGGGCTGCGCGCCAGGGGCAGGTTCTTTGGGTCTGGGCCTCGCTCCCGCAGTGGGCGGATTGTGGGGGGGAGGTGGAAGAGGTGGAGAGCGAAGCCGGCAGCCTCGCAGCGTGGGCTGGAAGCAGAGGCGCCGCCGCGGTCCAGCTCCCCGCACTGTCCGTGGGCCGAACCAGGGCTCCGGCCGTGGCCGGCATGTCGGGGGCGGGGGGCGCCTTTGCCTCGCCGAGGGAGGTCTTGCTGGAGCGGCCGTGCTGGCTGGACGGGGGCTGCGAGCCGGCCCGCAGGGGCTACCTCTACCAGCAGCTGTGCTGCGTAGGTGGGTGCAGTGGCGTGGCCGGTGGCACAGAAGGGGCCACCATCGCTCTCACCTAGTGGGGCTGGGTCTCTGCTGGGAACCGCCGCCTGGGCTGGGATGGGGGTGGCGCCTTGGCCCGGTGCAGCCTTGCCCCCGAGCTCCGGAAACACCTGGGGAGGAAGGCGGGGTGATGTTCCCCTACCCCCATTTGTTTGTCTCTAGAGAAGGGGCTGGAGGGGGCGGGGCTGGAGGGGGCGGGGCTGGCCCACCCCCGGCTGTTCCACGTCAGCCTGGGCTTTGGCCTGGGTTTCCAGGACACGGGGGAGGGAGGAGGTGCTGAAGGCGGGGCTCCAGGCCTTCTGTGGACTTGCTGCAGTCCTGGGCCAGTGGGATTCCCTTCCCAGTCTTGGGGTTTCCATCCTAGGACCGTCTCCACTAGCTGCGGGACCTCAGCCATAGGGTCCACACCTGTAAAACGGGGGCGATACTCCTCAGAGGGCCACGGCAGTGCCTGTCGTGAGGGACCCTGGGCTGGCGGCCGAGGGTCAGCAGCCCTGGACAGCACAGGTGTCAGGCAGGTGTGCAGAGGCACCTGAGCTGGGGGTGTTCTGGGTGCGTCCCAGGTGGGAGAGCCAGCTGAGCTGCAGCTGTAGAGGGTGGGTGTAGCCTGGCTGGGTGGGGCGGGTGTGTCTGTTGGTTTTAGGGTCAGAATAGGATTGGATGGGGCGGGGCAGGCTGGGCTGGGAGGGAGGGGAGGTGATGAGGAGGGAAGAGCTCAGAGCAAAGAGGCACCCAGAGGCAGGAAGTAGGGAAGGGGAGCTTGAGCCAGGCTTGGGAGGTGGAGGCCCCTGACCGAGCCCCCAGCCCACCTGGTCCCAGCCCTGCCCCGCCCCAGCCCTTCTCCTCACCCGGTCCCAGCCTTGCCCGAGTCCGTGTCTGGAGTCCCCACCGTGCCCCTTCCCTTCCCTGAGCCCCTGCCCCATTCCTGACCCTGGCCCGGCCCAGGGCGGCATCTTTGGAGGCCTGTTAGTGGCAGGGAGAAGGCTGGAACAGGGGCCTGGCTGGGGTGGGCTCCACGTGGGTCCTGGACCTTGGCCCCGGCTCCCAGTTTCCAGCTGTCGTGGACTCCCTGTGCCCACCTCCCTGGCTGTTCCGGGATCTCACACTGTGCCTCAGCAGAGTGGCAGCCCCGTTCCTGCAGGCAGGAGCCACCTGGTCACGGCCGGGCCCCCAGAGCCCATACCCAGCAGGCGCGGGGCTTGGCCTCAGGGTAGCTGCTGGCCCAGGGCTTCTGAAGAGGCGACAGTGTTTCCAGAGGCTTTGGACCCAGGGAGGGGCGGCAGAGGTGTGGGGTCCGGGGTGCCCTTGGGCACAAGACTGGAGGTGCTGACCAGTGCGGGGTCAGATTTTGATTTGGGGGCTTCTGGTGACTCCTGAGGTTCTGGAGGCTGCTGGGCCGGACAGGCAGAGCAAGAGGGTCACCCTGAATCTCATGCCAGGCTCAGAGACCATGCATGGAGACCAAGGGGTGTCTTCGTTGGGCGGCGTGTACGATGTGGCAGAGCCCTAGGGGCTGGCTGTGCCCCTTGGCGTGGAGTGGGGGCTTCCCCACCTCTGAGGGGTTTGGGCACCCCCCATTGTGAGGGTTCTGGTGCCCCCTCACGGCCTCAGGGGCAGTAGGAATGAGGTGGGGTGAGCTCTTCCCAGAACTGAGGCCGAGTGCAGCTCCCAGCTGGACCGAATCTGCCTGATGTGCGGCTGGAACATTCTTGTGGTTGGGGCAGCGCATTCTTTCCTATGGTGGTCGGGTGGGCTGGGCAGGCCCAGAAGCTGGCCAGAGGCAGCTCCGCCCCGGACCCCAGGGAGCCGGAGGCCCCAGCCAGCGCAGGCCCTTTGCCCTTTGCCCTTTACAGCATGAGACTGCTTCCCTTGAGCCCCACCCAGCTGCAAACAGCACCCCCCACCCCTGGGGTCGCCCAGGTCCTGCCTCAGGTGTGGCTTCCCCTCTGTGAGTCACAGGCTTGGGCCCCCTCCCCATCCCTGACTCACTGGCGAGGCCCCTCCTGGGGCTTCCCGATGCTCCATTCCCCCATGAGGCCCGGCCTCCGTGAGTCAGCCCTCAGCTACGCGCCTCCGACGTGAGGTGTCTGCCTGGGGCAGGGTGGGCTCCGCAGGTGGGCACTGCTCCAGGATGTGCCAGGTGGGCAGCTTGGGAGGGGCCAGGCCTGGGGTGGGACCCCACTGGCCCCAGGGCCAGGGCAGGCACCATGGGGCAGGGTGTGCTCCCCGCTTCATGCAGGTCTGTGAAGAGGTGTGATTGGGGGGCTGCAAGAGCTGACAGGCAGCAGGTCCCCTCCCCTCGCCAGGTATCAGCGGCTTCTTGAGTCCGCCCTGGCAGGGTGGGTGGGCAGAGGCTGAAGCAGGGCCTGGCCCAGGCCTGGAGGGAGCTCCAAAGAGAGGCGTGGCCTCAGAGCCCCTCCCGTCGGGGGAGCCCTTCAGTCTGTTGGGGGGTCCTTCTGGGTGGCTGTGGGGACGGCCTGTGTTCCTCTGCGGTCCTGGCACCATTTGGTGTGCAGTGAAGTGCCAGCTCCCCGTGTCCCCAGGTCCCCCTAGGGGGCTGCAGTGGTCGGGGTGGGTGAGGAAACCCCGGTTTCCTGTTTCTGGCGGGCCGAGGGCGTGTCTGTGGGGGAGGGGGCTGCTTGCTCCTTCCCGCCGGGACACTCCCCTCCCTGGCGGCGGCCTGGGCAGGGTGGGGCCTCGGGGGCGGGCCGGCCTCGCCGGGGAGTACAGCAGGCAGGGAGTGGCCGCACCGACTGGGGCTCTGAGCTGAGCCTGTGCCGAGTGAGCGTCTCGTGGGGCCGCCAGCCTTCAGCTGCCTGTGTGCCACACGGGGCTGCCCAGAGCACCGTGCCTGAGGCCGAGGGTCCGGGCGACGAAGGTGTGGGGGCAGCATGTCTCAGCACCAGCTCCGCGTGCCGCAGCCCGAGGGCCTGGGCCGAAAGAGAACCAGCTCGGAGGACAACCTGTACCTGGCTGTGCTCAGGGCCTCTGAGGGCAAGAAAGGTAGCAGGGCTCCCCTCGGGCACCCCCGCCAGGCAGGGCGGGCCCCTGCGGGAGGAAGGCCCACTTCCTGTGGCAGGAAAGCCTTGGCACCGCTGGGGGGCTGGTCTTGGAGATGGGGGTCGGGGGCCAGCCATCCCCACCCAACACGGAGTGGGCCGACAGGCGCCCGCGAGGCTGACGGGGGCCTCCGAGCGTCAGATGTCGGGCCTGGAAGGGCGAGGAACTCTGCGCTCTGGGGAAGGTTCGCTGCCCTGTCAGCAGCACACGCGGCTTCCCTTCCAACACCCCAGCGGGCCCGGGCCCTGGCTCTGCCACACCCCTGCTTGGGTCTCAGTCTGTAGAGGCCGGGGGGGACTGCAGGACGGGACTTGTGTGCCCTGGGCTCAGGGTGCGCCCAGGACCCTCCCATTTCCTCGGGGGAAGAGTCCGGGGTGGGGTGGCTGCACCTGGTGGCGCCTGGGCCCCTGGCACCTGGGTCTCTGCTGTGTGGCTGGGCTGCGGGTGAGGGCGCCTGGGTCTCAGTGTGTGATCTGAGGGAGGCTTTGGGGCTCCCCAGGCAGGACCTGGCCAGCCAGGCTGCTGTGTCTGCACGGTGGTCACCTGAGGGCCCCCGGGGCTTCTCCCAGGCCCCAGGTAAGCTGGTCTTGTCTCCCCCAG
Seq C2 exon
ATGAGCGGGATCGTGTGCAGAAGAAAACCTTCACCAAGTGGGTCAACAAGCACCTCATCAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000178209-PLEC:NM_201380:1
Average complexity
IR-C
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
No protein impact description available
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.459 A=NA C2=0.139
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0350110=S10_plectin=WD(100=56.0)
A:
NA
C2:
PF0030726=CH=PU(12.9=61.9)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Rat
(rn6)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
Other AS DBs:
FasterDB (Includes CLIP-seq data)
AS-ALPS (AS-induced ALteration of Protein Structure, links to PINs)
APPRIS (Selection of principal isoform)
DEU primates (Only for human)