HsaINT1025703 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000079156 | OSBPL6
Description
oxysterol binding protein like 6 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:16388]
Coordinates
chr2:178306030-178324269:+
Coord C1 exon
chr2:178306030-178306286
Coord A exon
chr2:178306287-178324176
Coord C2 exon
chr2:178324177-178324269
Length
17890 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAAGA
5' ss Score
10.77
3' ss Seq
ATGTTTTCATTTATTTTCAGAGT
3' ss Score
9.44
Exon sequences
Seq C1 exon
GTGGTTTGGACACCCTCAATATTGCCTGCTCTTTTCTAGTCAAACCTGATTCATGAAATGGAATGAAGCTGAAAAATCATCTACTTCTTTGTTTGTGGATTTGAGAGAAGATTGGGATGGTCTTAAGTGCATAAAACGAGACTCTAACTGCAGCGATGAGTTCAGATGAGAAGGGCATTTCCCCTGCTCATAAAACATCCACTCCAACCCATAGAAGTGCCTCCTCTTCAACATCCTCCCAAAGGGACAGTAGGCAG
Seq A exon
GTAAGAGAAGAGCATTAAGTGCCTTTGGTTGTTTTATGCAAATGCAATACCACTGAGATAGGATGGGGTTGCTAATTAATTCTGAAATTTTGTTGTAAAGTCTTTTATTCCAAGTGAAAAATCGTCATTTTCTGTAGGTACGTTCATTGATGTCATGAAGCTCCCACTCTTGCTTCTCTGTGATTTAGGACTCTTTTTTAGAAGGCAGACACAGAAGGCTGGTAGGGTGGCTATGAGAAGCCCTGCCGTCTTTTCCTCCCTGCACCTGGAGGGGGAGCCAGCATCAAGAACTTGAACACTCTTCTCTTCGTTCATGGAGGTGGAAAGGGAACTGTGAACCCTGCAAAGGACGTCTTCCTATAAGGCTGTCACTGGGCTGCCAAGCCCTAACTCTGTTTGGTATTTTGTGGAATCTGGTAACAGCTAGATTCAGGAATTAGGTTACAGATAAAATTGTAATACCAGGAATTAAGAGCTGTGAGAACCCAAACAATGTTTACAGGCAACAGAGAAAGTAAATGGTTATTACTTAATCATGGTAGAAAACGCCCATGGTCCCATTTGAGCCAGTTTTGCAAGTTATTTTTGTTATGTCATTACTGTTGAAGTGGCGATTCTGCTGGCAGGGTTATGTGAGCCTTCATCGTATGAATGTTCTTCACTGTCAGAACAGGTTGTTATTTCAGCCAGCACAGGTCTGAGCATGATTATTTTCCATCATAATTTGTCTTGTGATAGTATCTTGGTTGTGTAACTGGAAATTCCCAATAAGTAGGTGTTATTACCTTTTTATAAAAGTTTTCCGTTTTGGCAACTTTCAATTAGTGAGCATCATGCAGGTTCTCCTTCACCCCCTCCACCCCTCACCCCCTGTTTTATGTTTTCAGAGCATATTACCTAGATTCTAGGAGTGTGAGCATCAGTTATTTGATTGGCCATCATATAGACATGGGTCTTGAGACAGCCACTTCCAAAAATGAATTCATTTTCGATAGTGCAAGTACACTGCTGGGGATGCTTTTTAGGAAACCCTCCCAACACTCTCTCTCCCTTTTTAGCAAGAAATTCCAGGAGAATCTGTAAGAATCCAGGGGTGCTAATGTATATATCTTTCACAGATCCTAAGGCAGGTGTTTCTACTCCAGGGTCTTGGGGAACTTTTGATACTGGTGTCTTTTGTTATTGAGTTCAAAGACGACACCTATATTCGGTTCTTTAGAAGTAGTCATGCCATTAAATCTGTGATTACACACAGTTATAATATTTATTGTATTGCACTTACAGAGTCAAAGAAAGTAAGAGTACCAGGAATGGAAGCACTTTTATATTAAATAACTACTATATTCTGAGATGCTTTCTAAGTTTGCAAATTTAGTCTACCTTTGCCTGCCCTGCTGTTCTTTCTTGTTATGGCTCTTCCATTTTTCCCTTCCCTGGGCATTTAAACAGAGAGAGAGTCATTGTAAGCAGCATGACCTTCCTGACTGCTGGGAAGAAGGAAGCAGTTGACCCGGCTCACCCTGGAGAATTGTGGCAAATGGTAAAGACGGATGACTCCTGTAGAAACATCTATCATGCGTTGTTATTCTGCCTGTTGCACCCGAGCTCCAGGACGGGCACGCAAAGCAATAGGGAAACACTGAGACCCTGGTGTGCCGGAGGGAGCATGAAGGTGGAATGTGTGACTCCTCACTGGCTTGTGAATGAAAAGTTTTATGATGGGAATGAAAGGAGCATGTCTGTACATGGATAATGAGTTCTAGAAAAGTAAGAGACGCTTTTCAAAGGGTTATTATTCTTTAAGGAGAGAGTTTATTTTTACTCCTATTTATCTCAGCAGGTGGAAACGCTCCCAAAAACTTTCTTCCCTGGTTCCTTCCTGACTCCTGTTTTGTGTCTGTCTACCTCCCTAAGGGGAGAGAAGAATAGAAGAGATCAATTACAGTTCTGTTTTTCCTTCCTTATCTCAATCACTGCCTAAACCTCAGAATTAACTTAGGGAACTCAGATATTTTGACTGATCATGTGATGTGATGTAGTGTTTTTTATATGCATCTATTTTTGTGTGATAACTGTTTTCATAGTGAAGGGACATAGAGAAAGTGTGATAAATTTGGCTTCATTGAATCCTTTCCATTCTCCTGATTTGACTGACATCTATGCAGATGGTGCCAAATTGCAAACTCCAGCCCCATTTCTCTCCTAAATTAGGATCTAGCACATAGCTGAGAATACAGTGGTATCTTAATGCACATTATTTGCCTTTCCTTCTCAAGTTCTAATCGTAGGTAACTAATGAATGATTGAGCATTTCTACTTAAATGCACTGCCGCTTGAGTGGTACCACTGTGTCTTAAATCAATATGTATAAACCAATTTGCTATCAGGATAACCATTCTCTTAGAGATCCAGGGTCAATGTCTGTCTTTCTCCTTTGCTTCTCCCACATTCAATAGGTTAACAAGTCCTATTGATCATTTCCTCCTTCATAATATTATAATTTCCTTCTATTCCCACTGTCAGCTCCCTCTCACAGCTCTCATCACCTCTACCCAGGATCCTGCAGAGTGCGCTTGCCTCACTATCTCACTTATGGCCTCACCATTTCAAATGTCCTGAGTAGGGCAGATTCATGCTCAAAATCCATCAGACTCATTGTTACCTACACAATTAAGGCCACAGTTTCTTACTTGGAACCCCATGTCTAGCATGATCTGGTCCAGGCTTGTGTTCCATTTTCCTCCCAACCTCAACAGTCTTGTCTGATCATAGTCCTGAACTGCCCTGTCTTTATCTCTACTTGCCTTTCCTGCATGGAATTCCCACCACCCTCCTCTCAACCAGATGCCTCCCTATGCCTCAAAGACCGGCTCATATGACACTCCCACTGGCCACGCAAACCCACTTTACCCTCTCCTTCCTCTGAACTTTTATAGACCTTTTTGACAATATTTGACGGTTCTATATTGCTTATCTTTTTATGTACTGATCTCCTCATCTGTATTGTGAGCTCTCGTATACAGACTATGTACTCTTAAGTCTTCAGAGACCAGCCTTGAACCTCAAATGTTTTAATATATCCTGGAGGATATATTTTAAAGACCTGCAACAACATTAGTTTTGTATTTTTATTACAAATTTTCCATTCCTGATTTATTTGTCCTTCTCTTCTTCCTTCCTCATGGATAAGTAAAACAAAGAACATCTGTGCATAATAGTAATTACCTGTCCTTCCTGTCACTACATTAGATAGCATAATTGGTAAAGAAGGGAGAGGAGCTACGAAATAAAATGACTCAGTGCCCCTGTGATCTCAGTAAGTGTTTCTTCACCAATGATAGCATCAAGCCTCCTCTTAGTTATTTAACAAGTTAGAAGGCTTTAATAATTGTTCCATTTGCATTTCACTAAATCTGATATGAGCTGTTAGAACATCTAGCAAAACTGGCTCTTTGTGTGTGTGATCAACTATGACTCATTAAGCTGCAATAAACATATTAATATATGCCCTAAAACATTCCAAGAGGGAGCATAAGGGTTGTTGATGAAACACCTAGGACTTACCAATAAACCAGCATTCCCCAAAGTGTGTGCCGAGGAATGCTTGCCACTTGAGATGTTGTATTAAAAGAGAGTTCTTCTGTCAAATAAGTTAGAGAAGTGCTAAACAAAATATCTTTTGCAATGTGCATTACAAAATTAAGGACACCGATAAGTCCCGAAGTAAGAACTTTTTATTTAACTGAGTAATTCTAGAATGTAGTAGACTGTGGAACTTTTTCCCCTGTAAGATTTGATTGTTACAAATTTAGATTCTTCCTTCTATGAAAAAATTGGAAGGTCTAGGGACATTGATCCCAGATTTCTGATGACAACAGTAGACTGGGCTCAATAATGCCTTCCAGTGTAGTTGGGATATTTACTCTTTGATCAGCTACAGTCTTCACCTGCCCTCAATACTTATTTATGTTGACTGACTTGCCCTTTAAAGCATTTGGATTTGTAATTTCTGATCCTGGATGTCAGTAGGTCAGTCAGTAGGTCAGTAATATTTAACTTACCAAGGGTGATTTCAACTTGGATTTTAAGAAAGCACCTTAAGTTTAACATGCCCAAAACTGAACTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGACTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCCGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCGCCACCGCACCCGGCTAATTTTTTGAATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCGGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCAGCCTCAAAACTGAACTCTTAATTGCCCTCTCAAATCTACTCCTGCCCAGCTTACACTGCCTCCATAAATGACAACTCCATTCTTTCATTTGGTGAGAAATCCAGGAATCCAGGAATCATCCTTTTGGTTCTACCTTCAGGATATACCTGGAATCTGATGACTGCTTGCCACCTCCTCCCCCTCCACCTTGGTCTGAGCCACCGTCATTTCTCACCTGGACTATCGTCACAGTTTTCCAGTGGGTCTCCCTGCTTCTGTCCTTGCCCAACATACAGGTCATTCTTTACAGAGCAGTTGGAGTAGTACCTTCACAACCTAAGTCAGAGTGAGCCACTCTTCTGCACCAAGCCCTCCAGTGACTTCCCATCTCTGTCCAAATAATATTGAATTGCTGACCACTGTCTACGATGCCATTCATAATCTGGTTCTGCCTGGCCCTCTGAGCGCATACCATGTTCCCTTTAAGTGGTTCTCTCCAGTACATTCCTCAGATGTGCTAAGAACACACCCACCTCAGGGCCTTTGCACTTCTGGTCCCCTCACCCTCACCTGCTTTTCATCTAGCCATCCCCCGGTTTGTCATACACTTGGCTCAGTCTCCAAATATACCCTCCTTGGGCAGCCTTCTCTGCCCTTCCCTGCATGTACCCATCTCTCCTTGTCCACTTAGCTGGTTTGATTTTTCTTTAAAGCATTGACTACCACCTGGCATGTTATCTATTTGGTTTTGTATTTGTTTCCTGTTTATGTCTGTATCCCCTTCCTGTATTCCCTAACACTGAAATGTAAGCCCTATGAAAACAGGGTTTTATTTCACTCAATAATGTATTCCTAGCACCTTGTACAGCGCCTCACATTTGGTATGCTCAAGATGTATTAGAAGCAATAAATGAATGAATGAGAAGTCAGGATGGAGAGAAGATTGGGAGCTCGGCTCCAGAGGTCTTGATAGCTGCAAAGGAATAATCATGAGGTCAGGAGATGACAACAGGGAGAGATGATATTGTTTGGAGTTCCAAGTCCCACAAGAGTGGATTTTGAGAGTAAATGAAGGATAGCCCAAAGGCAGCAGAGAGGACCTAAGAGAGCACAGTCCCTTCCTCTTGCTCCTGAGAGTGGACGTGTGATGGAATAAGTGGAATCATGTGAAGGACAAAAGCAGACAAAAGCAGAGAGTTGGGAGCATTCTTCTGCACAGGTGTTAAACATATTGGTGGAGGTGGGAGGTATCTCTTTATTTTATTTAATTAAATTGAAATGGCGTCAAATTAAATTGAAATTAAATTGAAATGGCGTCTTAGTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCCATCTCAGCTCACTGGAGCCTTTGCCACCTGGGCTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGACTACAGGCGAGCACCACCACGCCCAGCTGATTTTTGTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTTTTGCCCAGGCTGGAGTGTAATGGCACAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCACCACCACGCCTGGCTAACTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCTGGTGATCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGCATGAACGACCATGCCCAGATAATTTTGGTTATTTTTGAGACAGAGTTTCGCTTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCTTTGCAACCTCCGCCTCCCAGGTTCAAGTAATTCTGACACCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTACGTTTGCCAGGCTAGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTTCAGGCATGAGCCACCACACCCAGCCTCTCTTTATTTTAAAACGAAGGTTATTGCTTCCTGATCAGTATATATTTTATGGTCACATTATATAATAAGGTCACTCAGTTTGTGACCCACTGACTGGATTTTGTTTCCATAATTACTTTTATGCTTACATTTCTTTCCTTCTTTCTTTTTTTTTGGAGACAGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAATGGTGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCACCCAGGTTCAAGCAATTATCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAACTGGGATTACAGGCGCCCAACACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTGGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTAAATTCCTGATCTCAGGAGGTCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAAGCATGAGCCACCACGCCTGGCCTATGCTTACATATTTTAGAGAATTTTAACAAAATATATGTTTCTGAGGCATTTTCAGTAGTTCTGGGATTATGCCCAAGGATCTGCATTTTCAAAAGCAAGTCCTGTATTTGGAGCCAATGATTATTTTTATTTGTATTATTTTCAAGTCATATCAGAAAATCAGACACTATGGCTCTGAGAATGTAGGGTTTGGAATGCATAATTTTCAGGTGATAGCATCTGTTATGGGTGAATTCTTATATGTATCTCCACCAGGTTAGACCTTGTAAATCCTTAAATGAGTCAATTTTTTTGTTCAATGAAAAATCAAAGAAGAAAAAGCCAGCCAGCCCTCGTAATGACTCAAAGTTTGCTGAAGCTCAGAGATAATAAAATAAAGAACATTTTAAGGAAAAAATATAAATAATAAAAAATAAATAAGTCATAAGAGGCTAGAAGTTCATCTTCTTACCAGTTTTTATGAAATCTATATTCCGTATAATGGTCCATCTTTTAACAACTATATATTTCAATTACATGAGTATCTAAAATGTTTCCTATGTATTATCAACAGCAATGCATTTCAAAACCAACAGTGGCCTATTCATTCAAAGCCCACTGGTGACATATTAAGGCCATCCCCAGCAGTGACTCAGTGGGACCATGTGCTGGTGTAACCATGGGATAGTGGCATGGCCATTCACAGCAGATTTCAGCAGCATCTGTTATACAGGAAACTCATTATAAGTAAAGAAGGTGCCTGGAAAACCAGACAGTAAAAATGTCTCTCATCAACATCTATCCTTTATGTGCAAAGTTTTCATAACAAGTTTTCTTGTTGAACAAACAGGCTAATAAAAAGATCCCCCAGCATATACGTGAACTGAATTGGAATGTGTCTCCTCCGACTGAGCCTCTGTAGCATCTTCAAATCGCTCTGTTGAATGAAATAACTAAATCACTACTTTGAAACATAGTGTCAAATCTTCTAAATAGGAAATGGATTTCCTTGAGTTGTGAAAAGTAGCATGTTATCTCAAACAAAAATGTTCTAATTTCTAAAGAAAAGAAAGTCAAGCATCCCTGATTTGATACCTAACCTCCAATTACAATCACCTCCAGTGTTACCAGTAAGGAGGAATATAACCTGAATTATTAGCTCTGTGTAGAATTCCACTGGACCCAGGGATTTGCAGGATGACCCTGGAACCCAGCTGTCAGTTCAGAGAGAAACACTAACCTGATCTGAAAATCTGCAGTGTCCTCTCTGGAGTGCTAGGTATATTTAAATTATTGAGTTGATTCAAATTTCAGTTTAGCCTTTTTGGGAATCCACTCATCCCATGGAATCAACTTTTTGGGACTTAGGACCAGTGTCAGTGAGAAAATAATATTTGTTTGCAAAAGCTCAGACTGGGACCAATTTTTGTTACTTGGATGCAAACTGGGTATTTTGAAGAGTCTAAATATTAGGCAAAGTTTATGAACAAACCAATAGAATAACACCAGCAATAGCTAATATTTCACGAGCTCTCACTGTGGAAGGCTGGAAGTGTCATCACTTTGTTCAAAGAACAAAGTGTGGCCAAAGTGGTGAAATGTCTTGCCAACAGCTAATGAGCAGTGGAGACAGGATTTGCTCCCTGGAACCCAGTTTCTGGAGCCCTTGTTCTTGGCCCCTCCACTATTAGATGTTGTAATGCTTGCCAAGCTGGATGTCCAGGCCTCCTGTATACTTTGAAGTGAACCTTGTAGGCAGCATTTGTCAATCATTTTTTAGTTAGGTATTGCCTCCTCATTTTTTTCCTTGAGCAATAATAGTAATTTTTCACATCCTTGATGGCTTGGGAAACTGTAAATCAAATGGTACATAGACTAAAATGTTAATAGTTATTATGAACTGTTGCCATCATAGGTGAGTTCTATGCTATCTGTGCTTTTCTCAATTTTTTGCATTTTTACTACACGTATTGCTTTTGGAATGAGAAGTTTTGATCATCTTTTTGCAATGAGAAGTTTTATTGACAACTGCTGTTAACCTTTCAACGAGCAGCTCCACAGCTTTCTTGGCATCGCCACCTTTTGGAGATCTCTGTCACTGTTGCATGGTGTTTACGGTACATGTTCAGTCCATGTCAAATGTGCTGAAATTGAGACCACTAGAAAGAGATTTGTTACCTGCAATGTGTTTTCCTAAAGGTCATATTTTATGAGTTTGTGTGTGTGTAGCTTTAAGACAGTATTTGGAATGTAGTAAATATGACAAAAGTGTCAGCAAATATTAAATATCATTATCTATTATATAATGGCACACAGATACTCATTACCCACAGATGATTCAGAACCCAGTGCTACTTGGTTAGGAGTCTGTTCACTGCTTTCCCTGGTGTGCCTGCCAAAGCCTTTCAGCTCTCTAGGCCTGCCTTTATCAGGTTTTTACTTTGGAGGTTATCTCTTGTTACCTTGAGATGACTGGTTTTGGGTGACATTTTTATAGCAGCAAATTCGTCTGTCAGATCCAAGATTAGCACTGCCTGTTCGGTTCTCAGGCATCACACCAAATAGACAGGGCCACAGTATCATGAGTTAATGAAGCCCAGAGGGTCTCATTCAGTAGGCCCTTGAAAAGGCCTGAGAATCTGTTGTTTACAGAAGCCACCCCAGGAGACTGTTATTCACTCAGTTTTGGAAATGATCACTTTACAGAGAACATTTTTAGGTGTTTCATTAGAACTATAAAAACGTCATCCCAAAGGACCATAGGTCTACAAAACTGCTTTATTTGATTTTCAACTTGGACAAACAGAAAATCTTACCTCCCTTTGTCCAGTATCCACTGTAACTCTCCTGGACTGGAAGTGAAATATTCTTACAAAGGTAAAGGAAAGTTCTGCACATACTGTATGTTTTATATTTCAAGTGCCAGACTTCCTGACCTCAACTCCCAATTAAGAGCTGATTTCTCAAAAATTTTAATAGCCAGCACTGGTGAGGCTTCAAGGAAATAGATACTCTCCTGCACTACTGCTAAGCATGTTAATTGATTTAGCTTTTTTGGAGTGAAATTTAGTGATATGTATCTAAAGTCTTTTTAAAAAGTCATACCATGGGACCCAGTAACTCAGCTTCTAAAAACATGTATTCTAAGGAAACAAAGATACATGTTAAAGATTTCAGTTAAAAAAATGTTTATCAAAGTATTTTTATAGTGGTAAAAAAATTAGAAACAGTCTAATGTTCAACAGGAGATATTTAAATAACCTCTCTCATAGCCACACAGTGAAATATTGCACAGCTGCTAAAAATGCTTTTGAATATTTAATGCTGTGGGAACCTTTTACTTTTAAAACCTCTGTAGCCACAGTTTCCAGATCCGTGGATTGAACCAGCCATTGTTGAGCCATATGAAGAGTTACATACATAACATGGTTTATGTAACTGCCGTGGATTGAAAATATCCCCCCTGCTACAACACAACAATCAAAATAATGCAAATAAAAAACAATACAGTATAACAACTACTTACATCGCATTTACATAGTATTAGGTATCACAAGTAATATGGAGATGATTTAAAGTATATGGAAAGATGTGCATAGGTTATATGCAAATACTATGGCATTATGTATAAGGGACTTGAGGATTTGTGGATTTTGGTATCTGCAGAAGGTCCTGGAGTCAGTCCCCCAAGGATACCAAGGGAGGACTGTATTGCTAATTGAAACCAAAAAACAAACAAACAAAAAGGCTATTAAATTGAAAAAATAGTACAATTTTTATTTTGTTTTTAAGAATTGAGTGTGTATATGCATTGAAAAAAAGCTGAAAGAAGATATATCAAAATATTGAAAAAGTTTATTGCTGGTTATGGGTGGTTTTAATTTCTATTTTTCTGTTTTCCCCCCAAAATTTCTGCAAAGAATGTGTTTCTCTAAAGGTCATATTATATGAGTTTGTGTGTGTATATCTTTAAAACAGTATTTGGAATGTAGTAAATATGATAAAATTGTCAGCAAATATTAAATATCATTATGTATTATATTAAAATATAATGAAATTGCAAACCCTACCTCGATAAGAATAAAATTAGAAGTTAAATGAGTATGAAGGATATTATGCCACATAGGAAGCTTGGCACAAGTTTTTCAAACCACTTTGAGGTGCTGAGGCATGAGGTGGGTCACCTTTTGTCTTCTTTCCTGCTTACATTTGATCTCACGGTAATTTAACTTAATTATGTCGCAGCAGAAACTTAGACACCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGAATAATTATTCATTCATTCAGCAAACATTTATGAGAACATATTGTATATGATGAATATTTGCTGAATGAAAGAACATATATTCTCATAAATATAAGATCTGATATCAATACATGTTCTTATAAATATTTGCTGAAAGAATGAATATGATATATATATGAATGATATGCTCTCAGTTTATAAGGGTGATCAAAACAGTCCAACTTTCTGTCTCAAATGAACCTACATAAATATTAAAAAGATGTATATGGACTTTTTTTTTTTTGCTTGTATTGTTAGCAAAATCACGTAAGTGATTATCATACTAAAAAATCCTTACCCTGGGTAATTTTAAAAGCCTTTTAGAAAATTACAGATTAACTTTAGTATTATTTTCAGGTCACAGTTTTCCTGCCTTTAAACTGACTCTACATGTTCCAGAGCGTTAGCTCTTGATATGCCCTGGTATTTGTCTATGTGATTTGCCATTTGTTTATAATTGCCGTAATGAAGCATGATCCGTATGTGCTTATACTCTGGTTGCTGTGGTTTCCTCTGATTTAGTTATGCTGTTGAGTGTTATGAGTACAGAATAAGGAGGAAGTTCACCAGTAAGCTCTGGTTCTATTTCTACTTAAAGGCAACTGTGGGAATTAAAAAGCTGTTTATTCCCATACCTTTTATCTCTTTCATAGTCAATATTGCTGAACTACTCTTTGCTATCAATGGACCACTTGATGGGTCCACATGGTATTTCTTACAATACAGGGTGTCTTAAAACAGGCCAGTTCAATGGTGAGGCTATAGTGGTTGATTCATAATTCTGTGCAGGAAGGGATGGGACTGTGCTCACTTTGCTTTTCTCCCTTCAGAATTTCCCAGGTGTGCTGTGTAGACTTTTTTCAGCCACTGTTTCTAAAATTTTCTACTTTCATTCATTTTAAGGGTGCTTATATAGAGACCTACTGTTAATGCACTTCTGCATCTTTCAGTGAAGGCCAGATAATGGAGAAAGTAGTATAATTGCTACTTCTTCAGCCATGGCCTTTTGGCTTTGGTGATTTTAATATTTTATGCTAGTGCAAAGAAAAAACTGTTTTGAAGGAAAATCCACATGCATCTTCTGCTGCAGGCATTCAGAAGGATGCAATCTATGCCGCCATCACTGCTGTTGCCTTCCCATTAGAGAATATCTAGGCCATCTCTCTCAACTCACGTTGACAGCTCTCTCACCAAATTTTGATGTCCTGATCATGAGGTGATGCTGACCATGGTTACTGGGTTTGCTGGGTAACGTGATGGTCATGGAAGGCACGGCTTCCTCACTTCCAAAAGGGCTCCCAGGTGTCAGACACCAGCAAAGTGTTTGAAAGTCATCTTTCTGTGGCATGGGAATGCGTAAGATTCCTAGATATTTATTCCTGTAATGTTTATAACTGAGATGATAGCTGCTATTTATTGGGTGCCTACTGTGTGCCAGCCTTTGGGCAGCACTGTGCATACACTGGATGCCTACCCTGTGACTTGCAGTGTCTTGTAAGGTAGATATTATTATCCTCATTTTACAGATAGAGGACACTGAGGTTGAAAGAGGTTAATGGTTTGTCTACGTGTCATAGTAAATAGCAGATGAGGGTTGGTATGCTGGTCTGTAGAGCTGCAAAATTTATGTTCTTTTGTCTGCACCATACACCATACCCCCAAAGTAAAAGCTAGCTGACTTGCTCTCAGTTCTGGAAAATTACAAATTGTCTGGTTTGAGTGTGTTTTTGAAAATAAAATAAAATTAGAAATTGGAAATTAACTTGAGTGTGCTGTAAGGGTAACAAAGAAATTATCCCTAAGATTGTACCATATTTAAGAGTGCTATAATTTTTTCTTTTTTATTTCACTCATTTCTACTTCTCTATATCCACAGAAGATTGTGGTAAAGAATGCTTTGTGATATGTTCATTTATCAATTTGAAATTTCTGTTATTTTTGTCATTTGACATTAGCTTTCATGTTAATTCAGAAGGCCATATATACAAGCTTGACTCGAGTAAAATCTTGTCACCTTCCAACTCCAACCCTTAGTGACTGTGTGCCTCTCTTAATCTCTATATCCCTTTATCTGGTCAGTCAGGCAGATCATTAAATAGTCATTATTCAAAGGCTTGTGAAGATGGAATGCAATAATTCATGTAAAGCATAGAGATAGGAATGTAAAAACCAGTAACTATTAACTGCCATTGTCATCATTATCATCAACACTATCCTACAGAAGTTACTAGTACCACTGAAATAGTGTTGCTACGTTCAAAGTAGCAGCTATAACTAGAAGAGATACATGCGAGATAGCTGAAAGCTTGAAGAACGTACTTTAGAAATTCCTAAATTATTTTGGATATTTTTCTTTGAAAATATTTTGGGTAATCTGTGAATATAAAAATAGCTTAGCTAAGATAGTTAGGTGAACAATTTCAATGGAGTTAACATTCAGAGAGCAGTGGACCAATTCTCTTTACTACTGTCCTAAATTTATAGAAAAAGTGAGTCTGTAAAGAAATTTGTAGCCTCAGTCTAAAACATTTCCAGCAATGTCTTTATATCTTTGTAATGAAATTTAAGTAAGTAAATGACAAGATCCCTATTCAACAGATCTCCTGGACTCTCATTTTGAGAATCACGTTTCTCTCCGCGTGAGTTGCACCAAACCATTCAGCTATTATTAAGTGTCTCATTGTCTGTCTGTTTACCTATGTCTTTGATACCAAGTAAACTAGACTACAGTCATGTTGGCACATTTCCACTTGCTGCTCAGGAGGTATTGAGATCAATGAACACTAACCTGAGGAGCATATTTTTACCAAATTAAAGAGCTACAGTGAAATATGTGTTCCAGGTTCCTGGTTTTAAGCTAAATATGCATCAGTTATCTCTGATCAGGGGAAACAGAGGGCGGGTAAGTACTTCCACCTTCTCTGTGTGTTCTAAGTTCCTTAAAAAACTGACCTGGAAATTAACTTATAATTTTAGCATTTGAGAGGAAACTTGATTTTAGAAGAATAATTAACTGGTTTACATAACCCTTTATTTAACTTGCTTACATAATGTGTGTAACACCTTGAAAGTAGTGGCATGTGTTTCCAATTCACTCTGAAAGAATATGAAAACAGCTATCTTGTGAAGAAAAGTACAAAAATTATACCACAAATTATGATCTTAAAGGAAGCCTTATGAAAAGAACTGATTTTTATAACTGAAGATGTCATGAAATTAAATTTGATGTGTTCCCTAATGACTACTCATAGCTTTAAATTGAATAAGTAAGAGTTCTGTGATTAATCCGCTAGATTTTCCTGTTTTAAAACTTAGGCTTTTTAACTGTTTTCAAAAGTTCTATCCTATTGGAGCATGATTTTTATAATTCCAAGATAGGCTGGGTGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACAAAGTCAAGAGATCGAGACCATCCTGGCCAACATTGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAACCGGGCGTGGTGGCACGCACCTGTAATCCCAACTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGTAGTGAGCTGAGATTGTGTCACTGCACTCCAGCCTGGCGATGGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAATAATAATAATAATTCCAAGATAAAGCTGGAAGGTAATTGATTGCTGAAGGACTGTTCTCTGCAAATTAGCACTAAAAAATTCCACACATTTTTGACTGGCTTCAGTGTGCAGATTGTTGTGCTAGGATGGGGTGGATTACGGGTAGAGAAGATGGAATTCCAGGATGAAGATGAGCTTGTCCCCACCTTCAAGGAGCACTCAATCTAGCTAGAGGCCAGGACTGGGTATGGTCAGTTTAAACTGTCTTCTTTATAGCTGCTGGTGTAAAAAAATACAACATTCAATTACTTAGATATTTCATTTAAAATAACAAATTGCTTGGTATATAATTACATAACTTTAGGGTTATGCTTTTTTTAAAACCATGAGTTTGGAGAAAATTCAAGGTAGTGGATTAATTTTTTATTATTGAATAGACAATGATAGGTTCTAGACTCGTGAGTTTCTACAAGAGCTGTTGGCTTCTTCATTGTCATCCTGGAGGTTACATGGAATAGCTTATTTTTTGAAGCTAGTTACAATTACAATAATGGGTAGCAGCTGGTAGTTTTCTAAATTGTCCTTTAACTTTTTCAGTAACAAATACATACATTAGTGATAATAAAAATATTCATTTACTTGCTATGTCTCACTAAATGTTTTTTATGATTCTCTGGGCTTTGACAAATCAACAGAATTTAGGGTTTAGATATATTGTGCTATATTTGAAGTGATTGAACTTCTTATTTTTCTTCCATAATATAAACTGTTTTGTAACATCAAATGGAGAAGAGACTAATATTGTTTTCTTTGTGCTAGGTACTGTGGTAGGTATTTTACAGTTGTGGGTCCTGGTTTGTGTGGTTGCTAACTAACCCTTCTGACCCACATAATTCTGGCAACATCTTAAGTATCCCCTCGTATCTATACAGGAAAAATTTATTTCCATCACACTTCAAATATACCACATTGATTTCTATATCTATGGCTTGACTTGGAAGTTAGGGGATTTAATTTCCTTTCCCTAGCTTAGTTACTTTATTTCCTGCCTACATAGTTACTAAGGTCAAGTTTCTTTCCAGGTTTTGTTTTTCTTACCACGTTTTTTTGGAGGTGGGGGAAACAGTTGGTGATGTATCTGTGTTTTATTGCCCAGCAACCTGAAAGGATGGGGATCGGGGAGAGTCGTTAAAGAGAAGCTCAGATCAGAGATACCTGACTGGAAGATTAAAGTAAGCAAAAGCAGTAGCCACATGAAACAAGGTTAATATGTGGGCTTACAAAGAAGTCCTAACCATGATTTGGTCTTTTGTATGATAAGAACTCTTTCTAGAATATAAGCATCATAAGAGTAGTTCTCTTGTCTGTTTTGTTCTCTGTGGCCCTGTCATCTGTGCCTGGCAAAGTGTAGGTGCCTAATAATGACATGTTGATAAATTGAACTATGAATGAATAAATAACGTATTTCACTGGTAGTTTCTGGTCTTGTACTTTATTATATTTATTTGAATGAAGTTTTTTGTTGATATTCTATTAAATAGTGAGGGAGAAACTTGCTACTAAAGTGTGTAATTTCTAAATGGTTATTTCAAAAATTACGTTGGAAACTTCTTTTCCTATGGAAAATTATCTCAAAGTATAAGGTAATTTATTTGTTGGTGGGGGAAGCATTTTATATCTCTGTAATACAGTGACACTTGTATCTTTGATCTTTACAGTGACACTCGTATCTTTGATCTTTATTAGCCATGGTTCTTTTTTAGAAAAATCACCTCATGCATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTTTAAAAAAAATCTTTGTAGTCTTTACAGTAGGGAAGTTTCGCTCTCATGTATTTGAAGAGTGCATGAAACAAGATTTGTTTCCTTCTTTTATGCTTTCATAATGTGCCAAGATAGTGAAGTATTCTTAATGAGTAGATTTATGTAATTTAGGTTAAGGCATGTACTTTTTTTCCCCCGCAAGGGCTTTAATATAATTGCAAAATTCCGCTTTAGAAAGATCATATCTAATTTATATTTTCTTTCTTCCAACCCCACTTCATTCTTGAATCTGATGGGTAAAAGAAATTATTATTTTGATTCTCTTTTTGAATACTTCTAAGTTAGAACATCTTTTCAAATGTTTTACATGTGTTAACTATTCGTGTACTTCACCCATTTTTCTGTTGAAATTTTATCTTGCTAATATATAAATGCTCTTTGTAAAAGACACCTACCGTTTATGGTATTTGGTGAATTGTTTTCTTCTCTGTGCGTTTTTGTAAGAAACTTTAGAGACTGAAGGGTGTGAAGGCTCTGGATTTTTATTTATTTATTTATTTTTGTGATGGAGTTTCCTTCTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCATTGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGTCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCTTGCTTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGAATTGCAGGCTTCCATCACCATGCCGGGCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGACAGGGTTTCACCAAGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCGTCTGCCCCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAAGCATGAGCCACCATGCCTGGCCGCCACTGGATTTTTTAAGGTAGACCTTTCTTTTTGTCTGTTGCTATTCCCAGTTGGAGAGATGAGCAAATATTTCTATGTAAGCCTGATTAGTCTAAGTAGAAGGTGTGTCTTTGTCATAAAGTTGTAAGTTTTCTTGTGTGTATCATAAAATTTTTCGAGAGATATTCCTCTGACTCTCCAAGACTGAAACCGGCACTGCAGCAGCAGTTCAGCAGCAAATCTAGAAGAGGAGGGGAAAATCCTGTGCCGACATATTTTTCTGTCTGTTGCTGCTATCTTTGGTCTTTTCAGGAACTTGCCATTTTTAACATAGCTCACTGTTTTGACTGTGTTGTGTATGATTTCATCCCCATGCACATTCACATGAAAAGTGAGTTGTCTAACCCTGGGCTATGTTTTCATTTATTTTCAG
Seq C2 exon
AGTATTCACATACTGGAGAGGACTGCTTCCTCTAGCACCGAGCCCTCTGTAAGTCGGCAATTGCTAGAACCGGAGCCAGTCCCCCTCTCCAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000079156:ENST00000190611:3
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion (1st CDS intron)
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=1.000 A=NA C2=0.781
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
Associated events
Conservation
Zebrafish
(danRer10)
No conservation detected
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains