HsaINT1047218 @ hg38
Intron Retention
Gene
ENSG00000067646 | ZFY
Description
zinc finger protein, Y-linked [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:12870]
Coordinates
chrY:2961074-2975244:+
Coord C1 exon
chrY:2961074-2961646
Coord A exon
chrY:2961647-2975094
Coord C2 exon
chrY:2975095-2975244
Length
13448 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CGTGTAAGT
5' ss Score
8.58
3' ss Seq
TATATTTTCTGCCTTTTCAGTGG
3' ss Score
8.8
Exon sequences
Seq C1 exon
GAGCTGATGCTACACACATGGATGGTGATCAGATTGTTGTGGAAATACAAGAAGCAGTTTTTGTTTCTAATATTGTGGATTCTGACATAACTGTGCATAACTTTGTTCCTGATGACCCAGACTCAGTTGTAATCCAAGATGTTGTTGAAGATGTTGTCATAGAGGAGGATGTTCAGTGCTCAGATATCTTAGAAGAGGCAGATGTATCTGAAAATGTCATCATTCCTGAGCAAGTGCTGGACTCAGATGTAACTGAAGAAGTTTCTTTACCACACTGCACAGTCCCAGATGATGTTTTAGCTTCTGACATTACTTCAACCTCAATGTCTATGCCAGAACATGTTTTAACGAGTGAATCCATGCATGTGTGTGACATTGGACATGTTGAACATATGGTGCATGATAGTGTAGTGGAAGCAGAAATCATTACTGATCCTCTGACGAGTGACATAGTTTCAGAAGAAGTATTGGTAGCAGACTGTGCCCCTGAAGCAGTCATAGATGCCAGCGGGATCTCAGTGGACCAGCAAGATAATGACAAAGCCAGCTGTGAGGACTACCTAATGATTTCGT
Seq A exon
GTAAGTCATGGGGTACAGTGATTTTAAGCAATGTTTTTGAAACCTGTGTTTTCTAACATAAATAATGGTGAAATTTTATTGAGTTTAACTTCTGTAAAGTTAAAGTAGAAATGATAAACCTACATGCATTGTTGCTTAGTTTGCATCCCAGAAGATAAACCGTAATTAAGTGACATGGTGCAGAAGAGAGTTATTTCTATATTAGGATAGAACATAAGGATGAAAGAATAAGAAATGAAAATAACAGAATTGAGTCTTATGAAATCATACAAAGTATGATTGGTCTGTTACTCACCTTCAGATTTATCCCTGAGACTTGTAATCAGTTTTTTTAAAGTCTTTTTATTATGTAGTCATTTCACTTTCCCCTTTTTTTCTACCTTATTGTCCGTTTTCTCTTTAAGTAATGATTTTTTGTTGTTGTTTAATTCATTACTGGCTTTGGAGTTAAATCTAGTGAATTCTCTGAAATACAGTGGTCTCACCAAGACCATCAACCACTAATTTATTTAGGTTTGAAATTGATTTCAAATTTTACATTGTACTAGTTTTATGTTTTGCTCACTAATCCTCATGGGATGCTGGCTTTGTTGATTGTGTTTATAACTTTGTCAACCAGAACATGACTGGACATACTTTTGCTTATGCAGCAGCTGCTGTAGTCATTCTGTTACTAAAATCCCTGACTCTGTGTCTCTAATATTTTTAACTTCAATATCTAGGTATATTTTCTACGTTAATATGGTTACAACTTACGGAATCATTGTGTCATTTACCTGCTGATTTAAATAATTTAGTTATCCTAATTGACCAGTTCATTACTACGGTCTTTGGAATGAAGTTTTATAGTGTAGATTTAGTTTAGAGCATTCCCATTAATATTAAATACCGCCTACACTCCTCTTCCTGTGTCTTTGAGCATAGCACAGCAAAAGAGTTGTGCAGGCATTTTCGTGGGCACAGGGAGAGTAGGCATTTACCTCTTATATGATCAAGTGTACCATTATGGCCTAGTTTTCTGATAATGATAATTTTCTACCTCCCTCTGAACCTGCTTAATGATTTTAAACAGCCTCATTCAACTGATTTAATAAACATTTATTTCTGTGTGTAAAAACTTATTCTATGAAGTGTTTAAATATTTAAGATTAATAATTTACAGTTTTTGACCTTCGGTTTATAACCTGGTGTGCCCAAAAAAAGGGGGAGTAAGGTGGTGTTTAGCTCTTTGAAAATGTAATAATAAATATTTTTATATGCTGAATTTATCTAGCTATTTCAATTTTTTTTTTGCTAGCTCTTGTTTCTTCCAGAAGAAATATCTACTCTCATGCTGCATTTGTAATTAAAAATCCTGTAGGGCTGAGGGTAAGGGGACATATTTAGGGTTGACAGGTTTTTCTTAAAGTATATAAAGGAAGTACGGTCTGATTTTATATTAATATAGAGAATACTGAGAATACTGTCATTGACAGTAAGCTTTAATGCTTTCCATAATGTTATGAGAGTTGGTAATATCTTTTACATTCTTTAATATAGTTATTTAATACATAGATTAAAGGTTTTAAAACATTGTTTAAGTACACTTTACAATCTAAAATATGTTACTGGATTTAAGAGCTTATTTCTGTCTTTAGTAGCAGGTTTTTCTCCTCTGAATATCTCATTTAAAATGATGAGAGAGTCCTCTATGGTATCACAGTAGTATATCTGCACAAAAGTGCTCACTGTTACACCCTAAGTGCTATTGAGATCAACATGACCTCTTTATATACTCTTTACAGTATAGATGTTACTATTGGCTTTTAAGTTGATTATATCATCTTTAAGGACAGGTCCCCCTCAAACCTGTGCATATTTGGTATAAAATATTTGTTGAGTGAACACTTAGGTGAACTTTATAGCTGAACGTTTGTGCATATCATGTCTCATCCAAAGGGCATCTAGTTAGTTGTTTTAGCAATCTACCTGGTGTTTCTAATAAATTATGACTTTGGTCATAGTGAACATTCAGTGATTAAATGAATAAATGAAGCCCAATCCTCATATCTAAAGCAGAAAGCCTATGGATCAATACAGTTTGATGATTTGTTTAATGATTCTAGTGGCTATTAGAGCAGAATAGGGCTGGTAAAGTAGTTGTTTATTGTAATTATTTTATATTTTTTGTATATACACATTGCATATATTAATTTTGCTTATCCTTCTGTTCTATAACTCATTATTAGACGTATATATCTAAATATATATATATATGTTTTAAGCTACCTACTAGTTTTGCTTTGTTTTGTAAAACCATTTGGCAAAATGGTACCAAATGCAAGAATTTTAAAAATGTATATCTACAAGGGATGATTTCTGAAAAGTGAATAAAGATATTTTAGGGAGATAGGTTGTTTTAAGTTTTGATAAATTTCTGAAACGTGTTTTTTCATAAGACTTTCAAAAACTAATGATTTTTATGTAGGAACTCTAAAATGTATTTAGAAAATCTTAAAGCACATGCGCAGTGTTTCAAAGGAGATAAGCTAATCAAAGGAGATAGAAATCAAACGGTTGGAATTTAGGAAAGAAGCTGAACAGAGAAATAACATTATCAAGGTAAAAGAGACTATAAAAGCAGCAATTAAAATAAATGTGGATTAGTATTAATATGACTGGAGACCTTCTGATTGGGCTTTAGAAAATTGCCAAAATGAAATGATGAAAAAACAGACGTAAAAATGATTATGGACAAGATTAGCAGACATGAGAAACAGAAGGCAAACTTAGATACAGAAAAGAAGAAAACAATTAATATGACAGAAAGTTATGGAAGAAAGCTTTCCTGAAATTAGGAATGATTAGAGTACAGCAATGAAAATGGCAGAGTAAAGAACACTGAAAAACTTCTCTTTTATAAAAATAATGAGAACAATGGTTAAAAAATTATCAGAGTAACATTTTTCAGCACTCTGAAAACTAAATGATTGTAGCAATAGAGGGGGTACTGGATATTGGTGAGATTGTGCCCTTTTAATTTGCTGTTTACATCCACTCCTCCCAAGCTGTACGTTAGCCTTAAAAACTGACATCTGACAAATATAAAAAAAGGAGCAGTCACGGAAGATAACAGCAGCTCATGCCTGTAATCCTAGTGGTTTGGGAGGCTTGGCCAGGAGGATCACTTGGGGCCAGGAGTTTGAGACCATCCTGGTCAACATAGTGAGACCCTATCTCTAAAAAAGTTAAAAAATTATGTGAGCATGGTGGTATGCACCTGTAGTCCCAACTACTTGAGGCTGAGGTGGGAGTATCCTTTGAACTCAGGAGATCACGATTGCAGTGAGTTATGATTATGCTACTGCACTTCAACCAAGAGCAACACTCTGACTCAAAAATTTTTTTTTCTTTTAAACAGTAGTCTGGCAGTTACTGGAGGAGGAAGAAAGGCCCATTTTTAGAGAACTGATATTATTTGACCTGTTGGTGGTGACCTGCAAGACCCACCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCCCTTTTACCCAGGCTGGACCCCAGTGCTGTGATCTCAGCTCACCGCAGCTGCCAACTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTGTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCTGCGCCACCACAGCCCAGCTAATTTTTTTTTAATTTTTTTTTAATTTTTGGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGCCTGTCTGGTCTCTAACTCCTAGCCCCAAGTGATATACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGTTGGAATTACAGGTGTAAGCCACTGCACCCAAGACCTCACTTAGACTATTGACTTAGACTCTGAACTTCTGTAGTATGATCAGCCTTCTCCTTTGGGTTGTTGGTTGAAAATTGTAGAGACAGCTGTTGAACATACTGGTTTTTAAGGCAATTGATACAGTTAGGGCAAACAATAGATACACTAAAGCTTAAAAGGAAAGAAAAGTCCAGTAGTGGAATGAAGAGTCCAGAGGGCTTTGAAAAACTGGGACATATTCCTGATAATCTTGAATGTGATAATGCCAGGTCTGTGGCCCTGCTAAGGAAAGGCTTGGCAAGGCCTTAGGCTCACACTTCGGGTAATCTTCAAGGGCTGCCCAAATAAATAAAAGCCAGTGTAGAACTATAAACAGCCTGAATGAATATTTCAACATGCATGTGGAGCCAAAAACTGCTGGTTCTACACATCTCTGTCAAGTCATAAGCTGAATATGTATTTTATGTAATTAGATAGACTTTTAAATTGCTGCATATGACAAAACACACACACACTTTATAGGATTAGTTTAGGAAAGTCACAGTACTGTTGTTTACTAAGCAACAGTAACCAATCATAACACACATTAGGAAAATGAAGAATCTGATTTTCACAGTTGCCAAATTATATTATTTTAAATGTTCAGTTTTCAACAACAACAAAAAATGAGACAGGCACAAAACCAAAAAAAAAGTACAGCCTATACGCAAGAAAAAGCACAGCCAACAGAAATTCATTCTAAGGAAGTCCAGACACAGTAACTAGAGTAGCTTATAAATCAGTTATATTACATTGTTCAAAGGCCTAATTAGGAAGTCATGTGTGAAGAAATAAAGGAAAGTAGGAGAATGATGTCTCATTAAGTGGAGAATATCAATAATCAGAAATTAAAAAGAACTAAATAGAATCTGGGGTGGAAAATTATGACAACTGAAATGAAGATTTCACCAGATGAACTCAAAAGTAGATTTAAACAGGCAGAAGAAAGAATCAGCAAACTTGTAGGAACTTCAATTAAGATTATCTCGTCTGAAGAGAAAGAAAAATAAGACAAATTAATATAGTCTTATATAATCTATGGAACGCCATGAAGTAAGCATACCAAGATATACTGTACCAGGAGTGAGAGGGAAGAAAGAAATTGGCTTAAAGAATAGTTTAATAATAGCTGAAAACTTCACAAATTTGATGAAAAACTGTAATCTTCACT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Seq C2 exon
TGGATGATGCTGGCAAAATAGAACATGATGGTTCCACTGGAGTGACCATCGATGCAGAATCAGAAATGGATCCTTGTAAAGTGGATAGCACTTGTCCTGAAGTCATCAAGGTGTACATTTTTAAAGCTGACCCTGGAGAAGATGACTTAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSG00000067646:ENST00000383052:3
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.132 A=NA C2=0.456
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF047048=Zfx_Zfy_act=PU(42.1=74.0)
A:
NA
C2:
PF047048=Zfx_Zfy_act=FE(14.8=100)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Autistic and control brains