MmuINT0058030 @ mm10
Intron Retention
Gene
ENSMUSG00000024240 | Epc1
Description
enhancer of polycomb homolog 1 (Drosophila) [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:1278322]
Coordinates
chr18:6462832-6516108:-
Coord C1 exon
chr18:6515865-6516108
Coord A exon
chr18:6462992-6515864
Coord C2 exon
chr18:6462832-6462991
Length
52873 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
ATGGTAAGT
5' ss Score
11.01
3' ss Seq
TGTATTTTCTTTGTTTTTAGGAA
3' ss Score
11.3
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Protein Impact
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Features
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NA
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Other Inclusion Isoforms:
NA
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NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Pre-implantation embryo development
- Ribosome-engaged transcriptomes of neuronal types
- Neural differentiation time course
- Muscular differentiation time course
- Spermatogenesis cell types
- Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
- Hematopoietic precursors and cell types