Special

MmuINT0065129 @ mm9

Intron Retention

Gene
Description
formin-like 2 [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:1918659]
Coordinates
chr2:52932674-52956379:+
Coord C1 exon
chr2:52932674-52932767
Coord A exon
chr2:52932768-52956304
Coord C2 exon
chr2:52956305-52956379
Length
23537 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GAGGTAGGA
5' ss Score
8.24
3' ss Seq
GATAACCACGTGTGTTTCAGGTC
3' ss Score
8.52
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Main Skipping Isoform:


Other Inclusion Isoforms:
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Associated events
Other assemblies
Conservation
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
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GENOMIC CONTEXT[edit]

INCLUSION PATTERN[edit]


SPECIAL DATASETS

  • Pre-implantation embryo development
  • Muscular differentiation time course
  • Spermatogenesis cell types
  • Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
  • Hematopoietic precursors and cell types