MmuINT0110263 @ mm9
Intron Retention
Gene
ENSMUSG00000040998 | Npnt
Description
nephronectin [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:2148811]
Coordinates
chr3:132594546-132611111:-
Coord C1 exon
chr3:132611011-132611111
Coord A exon
chr3:132594597-132611010
Coord C2 exon
chr3:132594546-132594596
Length
16414 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AACGTGAGT
5' ss Score
9.54
3' ss Seq
TTTGGCCATTTGTTTTGCAGCTT
3' ss Score
9.85
Exon sequences
Seq C1 exon
GTGGCCCAGGCAAATAGTTTCTTCAATCGGCCTATGTCGCTATGGAGGCAGGATTGACTGCTGCTGGGGCTGGGCCCGCCAGTCCTGGGGACAGTGCCAAC
Seq A exon
GTGAGTATCGGGGCTGGAGACTCCTGTTCCTTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGATGGTTCTAGACTTTACTCTGCACTTTGGAGGGCTTACCATTACTGAATAAGTCTTAACTGTGCAGATCTGACCCAAATCTTTATTCTGCCCCTTTCTAATCAGAGGTACCTGTGTCACAGTGCCAGCGTTGCCATTTACAGAGAGCCACTTACTGTGTTGTCCAACAACACAATGTATTTTATTCTTTTATGTGTAAGGGTGTTTTGATCGCATGTATGTGCACCACCTGGTGCTGGAGGATAGCCTGGAACTGGAGTTACAGGTGGTTGTGAGCCAACACGATGGTTCTAGGAATTGAACGCGGGGCCTCTGGCAGAACATCAGTCTCTTAACCACTGAGTCATCGCTCCAGCCTCGGTCTGCACACTTAACTTTTGTTTTCAGTTCCTTCCGCTCTAGGCTTCTCATCAGGCTTCCTCCCTCCTTTGCTCCAAGCTCTGAGATGACGGTGAGATAGTGAGTCTAGACACTATTTACACTAAATAAACTGAGAACTTAAGAGTCCCTGTAAAACCACCACTGGAACTGCTGTGTAAGGTGGCCGCTTGCCCTTTCCAAGTCTCTTTCTCCTCCTCTTCCTCTTCCTCCTCCTCTTCTTCCTCTTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCTTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCTTCTTCTCCTTCTTCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTTCCTTCTTTCTTTTCTTTGGGAATTATTTATTTTATGTATATGAGTACACAGTAGCTGTCTTCAGACACCCCAGAAGAGGGCATCAGATCCTACTACAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGAATTTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCATCCCATGCTCTTAACCGCTGAGCCATCTCTCCATCCCCTTCATGTTCTTTTTGATGAAGGGAAGTTATACTGACATCCATATGAGCCAACTGATAGTGTCATAGGAAACTTCTGGAAAACGTCGTTTATAGACTCCATAATTGATCAAAGTCTTATATAGTAGGTGACAAATCAGAACACTAATTTCTGTTTTATTCATGATTGAATTAGATACTTTAATGATACAATTGCTAGTCCTAAACGAAACTTTGATTTGGCAGATTGCTCAGATTTTACTTCGATCTGGACCTACAAACTTCACCCCAGTCTTCCTATTTTCCCTCCAAAAAGAGATACCTCCTACTCCAAATGATCAAGGAGCTTTCTGAGGCATCCGTTGAGATGATGGGGGACTGAGGAGGGCTCTACGGTGGGACTTCCACCTTGTCAGTCATGATGTGTTACAGAGAAGGAGGATCGTAAAGGCCAGAGGGCAATGGAGGAGACTGGCTTACAGATGGACTGGCTAACTGAGGAATCAAAAAGATGAAGAGTCCCCTCAGCTGTTACCAATAATCTGCTACTGTTTAACTTGGTTGAGGAAGGAGAGTGATTGCCACAGGTTGGCTAGTGGACATTCAGGCTATCGTCTTTGGTTGAGGACGGGCAGTGAGTAGTAAAATGGCTTCTTATTACTTGTGCACACTGGCCCCTTGCTCATTCCAACCTTTGCCTCCTCCTTAAGGGAGGTGGAGTTTCTAGTTTCTAGTACACGGAAGGACCAGGCAGTGTTGGCTTTCACTGGTTGGTCAGTTCAGCATTGTTCCTGCAGGAAGATGGTCCAAAATAGGGTTGGCACCTGGTGGAGAGTCGCCTTCTGCCAAACACATGGCACTGTTAGAAATACTGGCAGTCAGGTTGGTGAGCCACCAGGTAAAATAGAGTATAGACTCTCTCTCTTGGCCCGATGGGGAAACAGTCCATCCCAGATAAAAATATGGTGAGCCTCTTTGCAGGAAGGAGTTCATTTTTCTTCTTGCCTGCAGTAACTTTCAAGAAATGGGGGAATTAAACTCTGAAGGGCCTCGAGGTCCACACAGTCTCCCAGCTCTACCCAGGTCAAGGAGGCATGCCCTGGCAGAATGCCCCGGCACAGCAGTGGGCCACACCTTCACACCTGCCCCCGAGACAGAGATTAGGAGAATGTAGGTTCAATGCCAGGTGTGTCGAAATAATTCTAGGGTAAAAACCCCTGGGCTCCTGAGAGGAATTCCCCAAGCAACACTCGGAACTGTTCTATTTTTCTGTACCGAGTAATTAAAATGGCTCAAGTATGCACCAGCTTGGCAAATCTGCATCTGGATAAGTACGGGGGCTCTTTAAGGTTACAGTATATGATAAAATGTAATCAACCAAAAGATTTCCCAGGCTTTTCTGTCTCCCACGCCTTTCCTAACAGACTGGGGACACTGTCAGCTTCAAACCTTCATGTCCTTTTTTACAAGCATGCAACGTAGCGACATTCAGCATTTCCCTTCCCCTCTTTGTTGCCTCCCGAGTAAGGAAAGTGTAACACAGAAACTGAAGACGGGAATGGTCACATTAAGGATGTGTGTTACACAGTCCTGCACGTGTCACAGGTCATCTGGGGTGTGGTAAAGTTGGGGAGCCAGCGTATCTGGGGTGGGGGACATAGACTCTGGTTCTAGACAGCCTGGTTTTAAATTCCAGTTTGACCTTCTTAACTGTGTGACCTTGGCTGAGCAATTTGAGTTGCTGTGCTTCATGTCCTCCGTCTCTAAAATCGGTCTGAAATCTCACGCACCTTCACGACACAGAGCGCTCACACGAGTTATCATTTATAAAGCACAGAGACTTGTTCTTGGCCTAAGCAACGGCTATACAGTTGTACTTGGTCAAGTTCAATTACAATTACAGTTCTGGAGGGCATATATATGCTGTCAGATTCTGAGTTCTTCAATCACGAAAAATCCACACTTGGATCACTACTGGCCAGATTAAAAATGTTCCCAAGCTCCCCTGGTGCAGTGACCTGAAGGCCCTTTAAGTTGAAAGAGCCTCAGCCATTACCACTAAAGATGGGGAGACTGTGGAGATGAATCCAGGGGTAGAAGTATTCTTCTGTTTGTTTTTCTTCTGCCAAGTCTTAGATGGTCCAAATGTCTCCTGTCAGTTGCTGAGTCTGCCTTCCTTTGTTTTGATCTAAGGTAGAGGAATGTGAGGGCAAGAGGTCAGCTGGAAGGGGCAGAACAGTACCAAGAAGTGGCTTGTGGAATGAATGAAGTATCTCTGAACAGCCCCGGCTGTCTCACATGCCTTTACAAATGGGGGGCTTTACAGTCAAAATTCAGTTGAAACAAGTCTGGTAGTCAGTTACCGCTGCAATTTCTGACCTCGTTCCACAAAAGCATAGTGTGAAAAATATTTTGGGCTCTCTGACCCTTAACTAATCTGAGTGTTCTCTTTTTTTTCCCCCATGTCGCTTGCTTAGCAAAGGTGCCGTGGCTCTCTTCTGATTAACTCACTTTGGAATTTTCCTACAAATGGCTAACACTAACCGGAACCACCTGTGCAGCTCAGTTCTCTCTAGGTAGACGCGTTAGTGGGGGAAGGTGGTACCCACATTATGTTGTCTACTGGATTTTATGGCCTCTGAGCAGAGGCCCTTAGGGAGTGTCTACTCTCCTGGGTTGAATATTTGTGACATGTTTTGACCCTACTGTCACCTGAGTCCTATGTTCTATGCAAGACACTCTGCATCTCGCTCCTGTTTGCTCTCCTTTTCCTGAACTTGTTTGGAGAGACTCACATTGCAGGGTCACAGAATCGTCTGACCTCCTGTCTGGCTTACTACCATTAGCTACAAAACCACATTTAACTCAGGGACTTGCTATCTTTCTCTCCAGGGCTATTGAGGGACAGAGTAGAGGAACCGCCCAGTGGGCATGGGGTCTGTCCTCATATTCCCTGCCCGTGCCACCCGGAGTCCACTCTTAGCATTCCTGCCCTGCTGAAAAGGTCTGACAGTTTCCAGAAATAGGCAGGTTGTGTTTTCATAGTTCATTTTTGGGTTAGATCTTTGGCGTCTTTCTATTTCTTTGACTCGTTGTTTTGTGTTCTCGGCTCATAAATAGCTCTCTTCCGCATTGAAAATTCCACACTTGATTTTTCTAATTGTCTTGGGCCTTTAAATGCATTGAATATTTATGGGGCTCATCATTATCCAATGCAGTTCTCTTGCAGTCACCTATGTATTGGTGGCTACATGTTTACGGCTCACAGGCCTCGGTCTCTCAACTATCATCACAACGGGTTTGTTTCTTGCTTGTAATTTCCTGTACTTTAGCTTCCCTGTCAATGGCACATTTCATTTTAATTATGTTAACGTTTTCTCTCCTTCTGCCAAGTAGAGACTTCTGTTGTTGAGGGTTCTTGGGTTTTATGTCACTTTAAAGGCTCACCATGCAGCTGAAGGGGTGTGCAGCCCTATAGGTGGAACAGCAGTATGAACTAACCAGTACCCCCAGAGCTCGTGTCTCTAGCTGCATATGTAGCAGAAGATGGCCTAGTTGGCCATCATTGGGAAGAGAGGCCCCTTGTCTTGCAAACTTTATGTGCCCCAGTACAGGGGAACGCCAGGGCCAAGAAGTGGGAGTGGGTGGGTAGAGGAGCAGGGCCGGGGGAGGGTATAGGGGACTTTCCGGATAGCATTTGAAATGTAAATAAAGAAAATATCTAATAATAAAGGATAAAGGCTCACCATGCAATACACACAAGTAAAAGCACTAGATAAGTGGGGCCTTGAGCTCAGGCCCCCCCTTTTGTACCTGCTTAGCCACTAGCAGATCTCCAAGGAAGGCTGCCTGTAAACGCCACTGGAGAACTTCCATGGTGAGAAAGAGCACAGTGTCTGGTACTAAGCACTACAGCTTCTTCTTGTTATGACCATAGTATTTTCTCTTGACTGCACGCACTTCCTAAAGAGGCAAAGGAAGGTTCAAAGTGCAGCACATCCCAGGTCGCAGCTTCAGAGCCCTTGGGCTCTCAGGGCTCTCAGGCTCTGCTGTGGGCTGATGTGGTTTTGTAGCCTTTATCCTTAAGAGCAGAGCAAATGCAGAATCCTTGTTATGTTTCCACTGGTGGGCTGGGAAAGAGTGAACAACCGCATCCACAGACGGACAGACTGCTATTAGTTCTGAACTCAGTCCTCCTGACATGTTAGCCACAGAAAGCCCACTTGAAGACTTCTCGAGGTTAATAGAGAAGGGACCCACCATGGAAGAGCAAATCTGAAACCATTAGAAGTTATGGAATTATCATAGTTAGGGAATGTGTTCCTGGTCAGTGGTTATGGATACAGGAGAGGTTGATCGTCACAGTATTGAATTGTTTCTGCATTTCAGCTAAGAGGCTGTTTGATAAAGGCACAGGACTTCATGTCAGTAATGGAGATACTTGAATTTTATGATTCCTATTTTCTTTATGTTTTTGCTCAGAAACCGAGTCTTGGAAAAAGAACATGATTTATTAGGGGTTTTTTTTTGGCCCTTGTACAGACCATTAATTGGCTGTCCCCATTCATATAATTTCATAAGCCACATTTTTTAATTTAGGTTTTGATCACCCTCTTTAAGATAGTTATGAGTATCATCTGCAAACACAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTATTGGATGGATCACAGGGCCCCCAATGGAGGAGCTAGAAAAAGTACCCAAGGAGCTGAAGGGATATGCAACCCTATAGGTGGAACAACAATATGAACTAACCAGTACCCCCCGGAGTTCATGTCTCTAGGTGCATATGAATCAGAAGATGGCCTAGTCGGCCATCAGTGGAAAGAGAGGCACATTGGTCTTGCAAACTTTATATGCCTCAGTACAGGGGAACGCCTGGGCCAAAAAGTGGGAGTGGGTGGGTAGGGGGGGTGGGGGGAGTGTATTGGGGACTTTTTGGATAGCATTGGAAATGTAAATGAGGAAAATACCTAATAAAAAATTAATTCTAAAAAAAAAGATAGTTATGAGTAAATTAGACATTTAGAAATTAGAAAATTCGTCCTTTCAGCCCTGACGATAAAACCCCGGGCCTTGCACGTGCTGGGCAAGTACACTGCCACCAAGCAGCACCCTGTGGTCCTTCAATGAGAAGTCATCTTTGGAAAGTTATATATATTCCCCTCACAGCCCTGTGGGCATGGGGTCTGTCCTCATAGTTCCTGCTCATGCCACCCAGAACTGTAAATGTAAACAGTGAAGTAATCCAGCGGCTGAATTTATTTACCCTGTGTTAATCCCCAATAACTTCACAGAGAAACCAAGATTTATTTAAAACTGCACCTCCATAGCTGAGCAGCTAATAATCTATCCTTATTTTCTATGCTAATCTGGCTACCTCCCAGTCCCATCCCGTGATGCTTGCATGCTATCCTTGATCTGGCTCTTTGGGCCCCTTATCAAGGCTCCAATTCATCCTCCTTCTCAGCACATCTGCCCTCCTCCCTCTCACTAGTGGACATCCCGCCCTATCCTCTCTCCTGCCCAGCCATTGGATGGTGAGTGTTTATTGACAAGGCACAGAATAAATGGTGAGAACTGTTTAAACAAACTTAAGACAGGAGATTCTTGCTAGAAACATTGCAATGCCGTATCTGGATTAAAACAAGATGTGAGGACAGAGAAATCTCCATTTGAATAACACAAGGGTAAACTTTACACAGTACACAAAAACATTACGCCTACACAGAATCCAATTCTAACATTACTCCTAGCAAACATCTTTCGATTGGTAGCCAACAAATAAAACAACTTGTGTTGAGCATGGATTATATCTTACAAATAAAACAGTTTATGACTGTTCAATTATGAGTACTCCAGGAATAACCTGGAACCTGGGGTGGGCATGCTATCTGGGGCTATATGAAAGGTTGCTGGCAGGCATCTCTGTCAGCTTCATAGCCCATTGTCCTCAGCTCTCTAGCTTCTTCTCCCAATGATGAGGTTAGATCGTAGAATCTCGCTTGTTTGTTTTTAAGGCAACAAGAGAATAGCAAGGCCATGGATAACTTTAGAATTGCTTATGTCACCAAACCTGCATCTCCAAATCCTTAGGAAGTGACGTTGGGTTTGTTGCTGTTGTAACAAAGGTTTTTCACACACACACACACACACACACACACACACACCACTTCCTGGAAGGTCTATTTAGGAACACCTTGTTCCTTGAGCGACTTTGAGTGGTCCTGGAATGCAAATTCCAAGCACAAAGTAGTGTTGAAGAATCTTGACCTTTCCAAACAGGTAGTTTTTGAGTGCGTGCAGTCTTCAAAGATCAGTTTTAAAGAAATGCCTTCGCTCTTTCCTTTCTTTCCACGAGTGGAAATGATCTTTGAAGTAATACCATTAAAAGCCACTAATTTCCCAAGCTCCTTCCTACAGGTAATTCGGGCAGCTCTTAACCTTTACAGACTAGAAGTTTTAGTACTTCTCAGGCTGAAGGGCCAGCCTAGTGAGAGGGAAGCTCAGTAGACTCCGACTCTTTATCAGCCAAGCCTGTCCTCACACCCCTGGCCTGCCCTCACACCCCGCCACAGGAACACACTGCTGGACACACACAAGCTCTGCACACAGGGACCAAGGAGCAGCGTGGTGGTGTCTGCTACTCAGAAGCTGGCTCATCTGTTCAGAGCAGGTGTGCTTTCTCCCCAGATGCTCTCCCTCTGGTGAGAGTGTCTTGCCCACCTACCGTTCCTACTTGGTGCTTGCTCTCTATCTGCCAGACTCATGCTCTGTACAGTTCAAGTTGAGCCAGCTGCTCTGAGGGTGATCAGTGATGTTGAATATCACCCCCACAGTAAATAAGGGATCTTATTCAACACAGAGATAGGACCTTCTCTGCAGTGGGGGAGGGGTAGGAAAGCAGAGTCTGTTGACCCAGCCTTTCTTACTGTCTCCTCTACAACAGAGAGGTGGCTTTGCCTTTTCTTCATTCAAAACTTACTGCGAGTTTATACATCCACATGAATACAGAAACTGTTGCAAAAAGCTATAAACCGCTTAACAAATTTGTGTGTCATGCTTACACAGGGGCCACGAGCATCTTCCCTGTATTGCTCCAATTTTAGGGAATATGCTACTAAAGAGAGTGCCTTTTCCTAGCAGTTGAAGGTCGGCTTTTACTTTTTGTCCCAACATTTTTTTTAAGGATCTTAAATTTAGAAAGGAAAATGTATTCACATTCTGCGATAACCATTCCTCAGAGGTATAAGTGTTATCAGGTGCCCTATGTAGCTCTCAGAGATATTTTTCATATTCTGGCTAACTTCTCTGTCTCCCCTACCACCTACCTGCTTGGTACAAGTACAACCTAGTAGATAAACGGCCCTGTGCCTTCTTCGAAGAACACCTTAAAGCCATTTTCTTATCATCCGTATGGGAAAAGCCTCCTTCTTATAGGTTCAAAGTATGCTATGGTGTGGCTGTCCTGAAATTAATTAAGCAGTCCTTACTGCTAGATCTGTGTGCTGCTTCTAAAATAACCTTGATCATAATGCTGAGAAACGCTGAGTTGTGGTCTTCTAATATGCAGGCAGATTTCTGTGTGTGTCTGAAAGGCATACGGATTCTTAGCTTTGATCAGTGGGAGAGTGGTTTCTCACTTGGTCACGCTGGATCCAGAGACTGGCCCGTTGCTTGTTGCTTGATCTTAGTATACTTTCCTCTCTACTTTCTTCCAAGGAAGCCTGGCATTAGTCTGATCCTAGTTTAATCCAGGTTTAATGTTTCGCCTTAGCCCAGTGACCTTTGACCGCTGGCGGCAGAATGGACTGAAATGTGTCTGTTTGCCAAAATCTCTTCCTGGCCTGCAGCCATTATATTGTCTAGTTTTATGAATATAGAGTCATTTTCTATTTGTAAGAAAGATTCACATAGTCTTTCAAAAATTGCTCCTATTATCTTTCAACTTCAGCCGTAATTCAGTGTACCTGAGGTGAGCGCTCTGTTACTGGATCCGTGATGTATGGGGGAGGAGTAGAAGCCAAAGCTGGAATGCTATCTGGGGACACGTTATGACAGAAAGACCAAAAGCCCTGATCACAGTGTTTCTAAAGCTGTGGGATGTGGGCTTACATGTTCTATTGCCTATTCTGGTTAAGGCATTTACATAATACATCTTTCATTTAAAAAAAAAAGCTAAGAAATGGATATTTAAGTTAAAAAATTGAGAAGGAGGTGTGGCGAGCCAGAGGGAGGGAGAGAAAGCCCCCTGGAGCTGCAGAAGCGGGTACGGATCTGTTACCTTTCTGTTTTCTCAACACTAAGTTCTAGTCTCCGGTAGACAGTCACTGTTTCTTACTAATCTATGCAGAAGTGTCTACATAGTTTCAAGATTTTCACTTTTTGAGTAGCAATAGCATAAATTGAAGCCCTTCTGTACCCTTTCAAAAGCGTTTAAGGACCATTCCTTACAGGGCCATGTAAACCTGTCTCAGTCTTCTAGATGGCTTCACAGTTTGCTATCATACAGACGTACAGTAATAACCTCCCACTTATATGCATGAAGGTCGTTTTCAGGATTGTGTTTTTACAAGCTATACTACAATGACTTATCTGGATGTCCGTCTGTCATCACTGCTGTCTTATACAACTAAATACAGGAAAACTCTTCAGTGACATCCTGTTTCTACATTGAGAGAGCCTTCATTTTACTCTGCACTTTCTTTATAAAAATGTACTTAAAACAGAATAAATCATGGGTGACTTTATAAGGAGATTTTGTTCCTACTCAGTCACTGTCTACTTTTGGTCCCCCTGAAGATGTGTTAAAACTTAAGTAGATTGATCTCCTTATTCCGATTTGCTTATGTCCTCTCTTGTTTGTAAAATGACGCTTTTTCAAATCCTTTTCAACCATTTTTTAAGAGTAGAAAGTGTTTAAGTAAGAAGTGGGAGACAGAGAGCAGGCGGCTAGCATCGTGGGTGAGTATGGGGAGGTGACCATGGGCTCCACTATAAATAGGTGCTGGGAAGAAATCAGTGGGAAATTCTTACACTAATTTTTACTCATCAGATATGAGCATAGAAACTCATCACCATCTCACTTTGCACCCATATAAATTATGGTTTGGGGTAAAGAGACAAACACAGATATTATACCCAGGCACCATTTACCTGCCTTCTACTACTACATGGTCAATGGCCAGTGAAGCGAGCAACGGTGCTGGTTTCTTCACTAAGCTCCCTTCTTCAAAGCCTCATACAGGAGTTCTAATGAAGCCTACTTGATCTCCTAGTCTGTCTGGACCTTACAGAGGGCTGCTCTGTATAAACTATTTAGGGCTGACTAGACAGAAGCGGAGCATAAAGAATGAGCTGAATATACGATAGTCTGGAATCCAAACTTAGGTCACTGCAGCGTGAGGAGAGGCTGACTCACATGGACCCCTCACCAAGCACCTTTGACAATGGGACCTGAAATCCTGGTGCACATACACCCTATAAGGATTTCTCTTCCCTCCCTCCCTCCCTCCTTCCTCCATGTCTCCTTCCTTCACTCTTTCTGTCTCTCTGAAAACAAACTAACATCATAACTGTGCAAATAATAACGAAAAGATGGTGTGTGTTCTGAGATGAGAGGGCACAAATCCAGGAAGACCGCTGTCCCCTTAGAGAAGCAGAAATTCCTGTTCCCCAGACAGGAAGCAGCAATCTGAGCTGCTTGGATTCTCACCTTGAACAGCCTTGGAGAACGAAGGAGTTAGCATTTTCTTCTTAATGATAGCAATGAAAGATTTGTCCCCCCCAAACAGTAGATAGCAAAGACAGTTTAGATCGGGGGGGAAAGCAGTTGCATTGGTCTAAAGTGGTTGTTAGTCCTTCCCTAGGGACATGTAGGGCAAGAAGAAATGTAATTGTGCTTACTGAAAACGTACATGTTATTAGTATTTGGTTAAGGAATACCAATTTGGTTAAATAATACCAAATATAATTTTCGACTTTCATGTACTATAACATCGTTTTAGGTTTTTTTTATTTCCTTACTTGTTAATATGTAATTAAAGAGACAATTATGGTCATAATGACGTTCTCCTTAAAGCCAGCATAGAGGAATATATTACAGCCCAGATGAGTTATTATGGTGTGTGGTAAATATTCACAGACATCTTCTGTCCGTTCATTCCATATCTTTCTACAAGGAATTTGAGTTTTAATTTGTCCTGATAAAATTCCTAAAGCAATATAATTCTGATGGAGGAAGGTAGACACAAATATCAAGATGGTTTTTGCCTTTAGAATGCGGTAGCTGCATCTGGAGAACGAACAGCCTCGCCTCCCAGCGGGGCTTCTTATACTAAAGTCAGGGCTAGCACTGGTAGGTGCCGAACTCCAGGAAAGGAAAATTTGTAACTAAGGATTTGATATAGATGATTTTTGTCAGTGAAATTTAAAGCCAAGTACTTAATTTGGTAATATCTCTCTACCCATTCTATGGAGTAATGGCGTACATTCCCCAGAATTTTGTCCAGTTTCTCTGGCTGTTTCCCTGCTAAAACGTAATCAGATTCTGTGCTTGGTCAGGATTGCCTTCCATGGTAGATATTATTCATGGACTCTGAATCTTTAGGAACTCTTTCATCACAGTTTAAACTTGTGTCTGTGTAGACAAAAGGAAGAAAAGCACTCAGTAATTCTTAGATTAATAGACACTCTGTGAAGTCAGTGTTATTTTTCCTAGTCATGGGGTTGTGCATCATTGATCCCAGTAATCGAGAAGCAGAAGCAGGCAGCTTTCCAAGAGTTCAAGGCCATCCTGGTCTACAGAGTGAGATCAGGACAGCCAGAGCTATGCAGCAAGACTGCCAAACCAAAACAAAAACCAAAACAACAACAACAAAACCACAAACCTCGACAACCTTCAGTCTTATTTTTATAAATGCTAAATATCAAACCCAATTTCAATGAATTCCATAAATGATAAAAGGTATTTGTTGCTAAACTGACAGTAATTGTCCCATGCATAATTTTTTTCTTTTACTTAATTGAAAAACTTTTTATATAATATATTGTGATCATGTTTTTTCTTCCCCCAATTACTCCCGATCCTTCCTACCTACCCACCCAACTTTATGTTCTTTTATGTTTTCTTTTATAAAAATTAACATTTATTTTTATTATATACATATAATATACATTCACATGTATGATTGTTTTGCATACACATATGACTAGGCAACATGCCCATGACTTGTGTTCATGTAAGCTAGAAGGGGCCATCAGATCACCTGGAACTGGAATAGCAGAAGGTTGTGAGCTGTCATGTAGGTGCTGGGAATCAAACCTGGGTCCTCTAGAAGAACAGCCAGTGCTCTTAATCGATTAGCCATCTTTCCAGCCTCAGTTTTTAATTTTTAAAAGTATGTATGGGGGTGGGGAGAGACAGGGGGTAGGTACATGCATGAGTGTACCTACAATGGCTTGAAAAAAATGCACTGAGTCTTCTGAAACTGCAGTTTCAGGTGGTTCTGGACCACTCTGTGTGGATGTTGTGAGTCCACTAGGTGCTCTTAATCACCGAGCCATCCCTCCAGTTCCTAGACTTTTTAAACATAAGCTTCCCACAACCAAAATTCTTTAGTATCTTCTCTACTGGGATATACTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATTAAACTGGATACTTATGTTTTCTACATTTTATGGTATTCTGAGAGGTTTTTATTTTCAGATTGTTATTAGAATTCATCAATGAATTAAGTTACTCACCTTATCTTAGTATCTATCGACATATGGCTTGATATTAAAATCACGATATGCTGTTTCACTTTTTATTTAAAATTGGGCTTTAAAATGGCGTTATAGGAAAGAAAAGTATAAAATTACAAAGAACAATGTATACATCTGCTAACTGCTCTATTCTCTGCACTAATGAACCCTTTAATAGTCAGGAAGGAGCATCCTGAAAGCTGGGCTCTCCTGGCTTCTTAACTTCCTGTGCTCTGCTGTCTGTCATCCTTCGTGCTTGTGTGTAACTGTGCCAAGTTCACTAATTGACTGTGAAGAGATTTCCCCAGATTAATGCCAAGTCTTTGACAATGAGAACTATACAATTTAAGGTTGGGATCTGGAGAGCTTTTGAGATTGGTAGCCTTTGTGGCTGGTGGTTAGGATTTGGCAGGTAGCTCAAGGATGACATGACATGTCTTCCTTTCCCTCTCATGCTTGCCCCTCACGGTTGTCACTGTGAGGAGTTGGCCCCTGGCCTGTTGGACCACATGTTTAAGGGACTCTGGGCCTCATGTAGTAACTGTACAAGCCATCTCAATGTGTAGTACTTAACTGTTTCTTTCCAAAGGTTTTAAGCAGCCTAACAGTTGAGTAGCTCACAATTCTTTATAGTAAATTAAACTGCAAACAAGCAGATCTGCACCGTGAGTGGAGTTACTACCTTCAGGTTCTGTGCCCTATCCCTCATCTGGCTTCTTCTCACATCTCCCTTCTTCCTGTCCTTACTGTTCCCACCAGGGAGTCAAAGCTGGCCTCAGACTTGTGATCCTTCTATTTATTCCTCCCAAATGCTGCTATTAAAAGTGCATACCATCATGCATGGCTCTGAAGATTGCTTTCCATTGCTGGAGATCAAGCCCAGGGCTCACACACATGCTTTAGGTACACTCTGTACCACCGAAGTACATCTCCCCGTCATCTTTAACACTGTCTGAACCTTGGGACTGTCTCCAAATCCACAAAGCTGTGCTCAGCAGGCAAGAAAAGCTGGTCACTTAATAGTTTATTTAGTGTGCAACAGCTTCATAAACATATCCATGTGCTTATTAATTTTAAGGGTATGTAGGAAAATGTGAATTATCAGAAGTCTCCGATGAATGGAGGCAGGGAAGACTGAGTCCTGCACTACAAACCAGTGGGTTTGCGGGCAATGTTGAATGTATTTGACACCCATGACCATTTTACAATAGCTGTGGAGGACCAGATTATCAGGAGAAAAGTGGGCCAGGTTTTTCTGTATTATGACGAGCTCCAAATGAGCTCCATTCCAGAGCTTCTTACACTGCACTAAGACACAGAGCACATGCAGAAAATGTATTTTTGGCAACTTTTCAAAAAAAAGTGCTATAGGTTGCCTATGAAAATGTCCTTATCCATCAGGAGAGATTAGACCCCAGAAACTGTGAATTTTAGAATGTAGGACATTGGCTGAGATTTAAGCTAGAAGCCTTAAGAGGGTTGCATACTGATACCAATCAACTTACCAAATCAAGTATTTCCAGGTTACCTCATGTTAATTAAGAAAAATGTGACCAAACCTAAAGCTATTATAAGGAAATAGACCATACTGAACTGTTGAGCTGTGTGGTACTGAGACAGCTAGCTTGTAAATAATGATGCTTTCTATCCTTTAATGACTCTTTTTTCTTTCGTTTAAAATAATTTAAAGTATTTTTGCAGGTAAATTATTCAAAGTTGGTTATGGAATGTATTAAAGAAATAGTGTTCGCTTACATTTTCTTTCTTGTGCATAATCATGGCCACAAATCCAATGTCTAAATATGCCACCCGCATGTGCTTTATGCTTTGACTTATTTCCAGAGTTTCTTTAGACAATACTTGATGCATTTCACTATTCTATCTAAACAAATAGGTCTCTGTCAACATATGGTGGATTATTTTAAAATCAAAGGCAATAAAAACAACATGCAAATTATAAACATAAACAACACGGGAAAAAAGCTAGCAAACCTGGGCCGGGAGATAGCTCAGTGGGAGAAGTCCACGCAGGAGGATCTGGGCCGGGAGATAGATGGGTGGGTGAGTCCACGCAGGAGGACCTGGGCTTGAATCCTCAGCACCCATCAAAACAAGAAGCCATGCTTGATGGCAGATTCCTGTAAGTCCAGCATCTTTAGGAGGCGGTGCGGTCCCAGGAGGGACTGTGCTGGCCAGCCAGCCTCACCCAAGGGACCAGTTTCTGTTCAGTAAGAGATTCCATCTCAAGGCAGTCGGGTAAAGAGCAATACAGGAAGACACCCAGTGTCCTCTTCTGGTCTCTGCGTGTGCTTACACTGGCATGCATACCCCCATACTCATGCATACAACACACATGCATGCGTACATGCATGCACAGAAATCACATATAAACAACAAACCAAAAATCCAGCAAACGAATGTAGTGTTTGCCTTTCATAATACTTTGTAATCATTCTGGGTGGATGGCTAAATTATTGCTTTGATTGAGTCAACTCAGCCCTGCAAACTCTTCTTCTGTTACCCCCACCCCCACCCCCCAAAAGACTCCCTTAAATTAGACAAATACACAAAGCGATCATATGTTAAAGTGGATGTTTTGTGTTTTAAAGAGGGAAGGCATTCATCCAAAGAGAGATGTAATCAAGCCATCTCTTCTCCCACCCCAGGACTCTAGACTGGTCCAGCACTGACCATTGTTGGTAGTGTTTTGGGTTTCTTCCTTTACCCTTCATTGAACTGGATATTAATGCATCTCCAAGGGAAATGGCTCGGGTTTTGTGGTTAGTTCTTGTTGCTATTGACGACCACAGCAGCCACGCAAGAAGACAGAGCCACGGAAGGGAAGAAGACAAACTTTAATGTGTTTTTCTCAAAGCTGGAGAGAAAAGGGAACGTGTGGCTTATGAGAAAAAAAGGTAAGTGAATGGTCATGACGTACGAGCTACCAGCCTGGGTACGGATTGAGCCAAAGTTGGTCACTTTTTTTTTTCAGCTGCTTTATCCAAAATTGATTTAAATAAAAGAATACTGACTCTAGAACCCCACAATCAGTGTTTTGAAAATGAAATACTGGAAAAGATACAGTGTTGCAAAAACTCTGAAATATTTCATTAGAACTTGGAATATAGATGGCTGTCCCTGTTGCTCATTGGGTAGATACTTGCTGCTGGTCTCGGGGACTTGAGTTTGATCCCTGAGACCCACATGGCTGAAGGAGAGAACCAACTCCGACAAGTTGACTTCTGATGTCCAAGTGTACACTGTGGTACGCCTGCACATGCCCCTCCCCCAACACACACACTAAAAATGTTTTAAAATGTTTTAAGAAGAACTTGGAGTACAGAAGAATAGCATAGCTTCAATTATTGCTTAATATTTTTGTTATAAAATGTTTTCTAATAACAAAATGATGACTAAAATATTACTATTTTAAACATGTCCTAGATTTTTTTTTGTTGTTTCAGAGAAGCACTGAAAGTTGAATGTGTGTAAGTCTCCCGGAATGTAACAAGTTGGTCATACCCGAGCCCCGCCTCCTTACAGAGAAAAGATCTGGAATTTCTTTTTTTGGCCATTTGTTTTGCAG
Seq C2 exon
CTTTCTACGTCTTAAGGCAGAGACTAGCAAGGATAAGGTGCCAGCTCAAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSMUSG00000040998-Npnt:NM_033525:2
Average complexity
IR-C
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.000 A=NA C2=0.000
Domain overlap (PFAM):
C1:
PF0236314=C_tripleX=PU(22.2=11.4)
A:
NA
C2:
NO
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Associated events
Other assemblies
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Pre-implantation embryo development
- Muscular differentiation time course
- Spermatogenesis cell types
- Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
- Hematopoietic precursors and cell types
Other AS DBs: