MmuINT1007148 @ mm10
Intron Retention
Gene
ENSMUSG00000056486 | Chn1
Description
chimerin 1 [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:1915674]
Coordinates
chr2:73631746-73659757:-
Coord C1 exon
chr2:73659680-73659757
Coord A exon
chr2:73631831-73659679
Coord C2 exon
chr2:73631746-73631830
Length
27849 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
AAGGTAAGA
5' ss Score
10.57
3' ss Seq
CCACTTTGCCCATTTTTCAGGTG
3' ss Score
9.22
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Ribosome-engaged transcriptomes of neuronal types
- Neural differentiation time course
- Muscular differentiation time course
- Spermatogenesis cell types
- Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
- Hematopoietic precursors and cell types