MmuINT1020204 @ mm10
Intron Retention
Gene
ENSMUSG00000036890 | Gtdc1
Description
glycosyltransferase-like domain containing 1 [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:2444269]
Coordinates
chr2:44756268-44825543:-
Coord C1 exon
chr2:44825351-44825543
Coord A exon
chr2:44756436-44825350
Coord C2 exon
chr2:44756268-44756435
Length
68915 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
CAGGTAATG
5' ss Score
9.43
3' ss Seq
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3' ss Score
10.92
Exon sequences
Seq C1 exon
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Seq A exon
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NA
C2:
PF120383=DUF3524=PU(51.9=98.2)
Main Inclusion Isoform:
NA
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Ribosome-engaged transcriptomes of neuronal types
- Neural differentiation time course
- Muscular differentiation time course
- Spermatogenesis cell types
- Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
- Hematopoietic precursors and cell types