MmuINT1023526 @ mm10
Intron Retention
Gene
ENSMUSG00000029267 | Mtf2
Description
metal response element binding transcription factor 2 [Source:MGI Symbol;Acc:MGI:105050]
Coordinates
chr5:108065742-108081023:+
Coord C1 exon
chr5:108065742-108065965
Coord A exon
chr5:108065966-108080824
Coord C2 exon
chr5:108080825-108081023
Length
14859 bp
Sequences
Splice sites
5' ss Seq
GAGGTGAGA
5' ss Score
7.66
3' ss Seq
TTGGTCTATTTCCTGAACAGAGA
3' ss Score
6.84
Exon sequences
Seq C1 exon
GGGCTGTTGCGAAGTGGTCTGTGTTTGAGGCCGGTGTGAGCACGCACATTCTCCTTCCTAACCCTCGTCCCCAAGGAACTCGGTGTGTGTGTGCGTGTGCGCAGGGCTCCCGCTGGGGCGGGTGCCCAGGGAGTGCCCGGACTCGCGGGGGAGCGCCCACGGGAACGAGATTGCTTCTATTTTCCTGTATGAAGCGGTTGGCACCACTTAAGTGACCGAATGAG
Seq A exon
GTGAGAGACCTTGGCCTGGGAACCGACTCTTTGGGAGGAGGTTGGGATGAGGAGAGACGAAAGAAAGGAAGCAAAAGAAAGGGGAAAGATGGAGGCTCCGCTTTGGGCAAGGGAGTCCTGTGTGGGGGTGTTTTTGCATTGATGCATATGTTGAAAGAATGGATCGGGAGGGGTAGTCAGTGAGATGTTGGTAAAAATAGGGACTGGGGGAAGGAGCGGGGCGCCCCGCTCGGGAGTCAGTTGGTGGAATTAGATAAAACGTTGAGACAGGGAAGCTGTGTTTGGAGGGCAGGAAGGAACCTGGGGGCGGGAGACGGTTGGAGGGGCAGGATGAACCTGGTGATGAGGGGGTGGGGAACCGAGGGGAGGAGCCGTCAGAATGCGGGGAGCCTAGTAGAGGGGCTGACTGGCACTTTAAGGGGTGCTAAGGAAAGTAGCAGTTTGGAACCAGAGGGTGCTGGAATTGTGTGGAATTGTGGTAGGGGAATCTAGTGGTGGGCTAGATAGCTAGCGTACGAGGATGAGGAAAATACCCTGGAAAGCAAGCCCTGGAAGCTTAAAGAGAAGAAGTGATAGGTGAATTGATACGGGGAAGAGATAGCTTTTATTTGGAGGCATTTCTTCCGTTCAATTAAAATTTCTTGCCCTGATAATTTGTATTCATCATTACAACTTAGTTACTTACGGCACTAAGGGGTTTAACCAAAATTTTCCAGGATTTCTTAACACATTTCCATAGTGCCAGAACTCTTAACTGTGATTTACAATCTGCAGTCCTTGGTGGTTAATTTTTTCTTTGGCAGAGATGGATTTATTGAGTGGTACGAGAGATTGTGAACAATAGGAAAAGGGGTATGGAATGCTGTTTTATTCTTTAAAACCTTTAACTTTGGTTGAAGATATTACCATGCAACAGTAGTTAGAATTTGAAAACCCAGACAAGCCTGTAATTGACATAGAAAAGTACCTCATGAGATCAAAGTAGAGCTAGAAATATGTTAGTGGTTGGTTGACTCCGTTTTCTCTAGCAGCAAGTACTTTCTCCTTCAAATAGATTCCATGTAATCTTCATAGGAACTTCTGCAGACTGTTTTCAGCCTTTATGTTTTAATTTTTCTTTTGGGAATTTCTTTTTTGGGAGAGAATTGTGGGTAAAAAAACTGATTCTTTTTAGGATGCTGGATAATACTTTAAATGTTTATTTTTTTATTTAATGTATATAAGCACACTATTGCTGTCTTCAGACACATCAGAAGAGGGCATCAGATCCCATTACAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGAATTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAATCGGCACTCTTAACCACTGAGCCATCTCTCCAGCCCCCTGGACAATGCTTTAAGTGGAGGATTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTCCTTTTTAAGTTTTGAAGCAGGGTCTCGTTATATAACTCTGGCCAGCCTGGAACTCACTTTGTATTCCAGACTGGCTTGAAAAGACAGATCTGTCTGCACCTGCACACTGAATGCTGATGGAGATCACTACCATGCTCGGCTGTTATTACTTTACTTGAGTTCACATCAGCAACTATCATTGGGTATGCAACTATATTTAAATGTGTACTGTGGAGATTTCTTTTCCTTTTGTTTTCTCCTTTTCTTATTTATTTATTTATTTATTTACTTACTTATTTATTTATTTTTGGAGACAGGGTTTCTCTGTATAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTATAGACCAGGCTGGCCTTGAACTCAGTAATCCACCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTGAAAAATTGCCTGGCGAATTTTTTTTCCTTATTTGTTCAAAAAGTATATATTGGGGACTTTGTGTCATATGTGGTCTTAAATATTAAAAATACCGTTGTTGAACAATAGACATGTTCAGAGCTCATGTAGAGTATGCAGTTTGATTTTTGAGCAATGAGTAATGATAGAATGAACACACAAACACAAACGTGTACATGGGTGCACAGGCATACGTGGCAAGCACCATTTAACACCTTCAAGTTACACAATTGATATTTGATGGTAGTAATGATGAAAGTACAAAATAGATTCATAATGGAGTATGCAATTGAGATAGCTGAATTCAAGACAGTAATACAGCTGAGATTAAAGAAGACAAACATTCTGTCAAATGAATACACCCTGAATTTTGGGGAAAAATGTATAAGACATTTAAAAATTAAAAAAAAATGCATATGTGGTGGGGGAGGGTTAGGGGGGTATGTGCTACTGTCCATGGAGGCCAGAAGCATGAGAGTCATAGGTGGTTGTGAGCTGCCTAATAAGTGCTGGAAACCAAACTCAGTTCTTCTCCAAGAGTAATATGTGTTTTTAATGGCTGAGACATGTCTCTAGCCCCCATAAAGGATATTTTTCACCAGTTATAGTGGTTTTAAAATTTAACCTGCTGTAATGAATGCATTTTTCATTTTCTGTTTTATTTTAAGACTTAAAAAAAAAAAGATTATGTGTTTGAGTACACTATAGCTGTCTTCAGACACACCAGAAGAGGGTGTCAGATCCCATTACAGATGGTTGTGAGCTACCATGTGGTTGCTGGGAATTGAACTCAGGACCTTTGGAAGAATAGTCAATGCTCTTAACTGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCCAACTTATTTTTATGTATATGAAGATTTTTGCCTGCATGTATATGTGTGCACCACATGGGAGCAGTGCCCACAGAGGCCAAAAGAAGGTGGTTTATTCCTTTGGAACTGGAGTTAGAAATGGTTGTAAGTTGCCATGTTAATGCTGGGAATCAAAGGCCCTGGAGATTGAACTCAGGTCCTCTGGAAGGACAGCCAGTACTCCTACTTCTGAGCCATCTCTACAGTCTAAGAATGAATTTCTTGACAGCAGATAGGGGCAGAAAGATCCAAAGTTCAAGGCTATTCTTAGCTATATATGAATTCGCAGCTAGCCTGGGACACATGAGGCCCCATTTGGGAAAAAAAGTAGAAATGATTACCAGGGGCTAAATAATAATCATAATATAATCATATCATAAAAGTAGGACTTAGACATAAAGTGATGGTTTAACTTCATTGTCAATTTGATTAGATTCAGATTCACCATGGAAATATACCTCTGGATATGCCTATGATTGTTTTCAGAAAGGTTTAACTGAGGAGGGAAGACCCACCCTGACTATGTGAGGCCACCATACCCATGGGCTGGGGTCCTGGATTGAATCAAATGGAGGAAGCAAGCTGAGCATGAACATTGACCTTCCTGACTGCAGATATCAGTGCGATAGCTGTCTCCTGCTTCTTCTACTATGCCTCCCCCTTCCATGATGGACTGTACTCTGAAACTGTGAGCCAAAATATACACTTTTTTTATGTTGTTTTTGTCAGAGTTTTTTACACAGCAATGAGAAAAATACTGAATGCATATATTAATAAAATTTCAAGACATGAAGAACAAAGGACTGTGGCTCAGTAGAGTAAGATTTTTCATCCTAGTGCTGAGTATAGTAAGTGAACAGCACCAGACTTTCTTTACAGAGGGAAATTCTTTACAATGTAAAGTTCTGTGTGTAGGAACTGAATGAGTCAGTTGTTATTTATTGCTTGGCCTCACCTGGCACTCCTGTGTTGAAACTTTGTTCCTTTCCTAGCTAGGACTACAGGTTCCTGCTACTCTACCAGTGAGTTGCAATGAGGACTGAGATATTTGTAGGTCTAGAAGAAGACCTTAGAGAAGCTTTGTGCACATATCCTTTTACTGTATGCCACGTCTCTAGCCAAAGAGTATGTGATCCAGAAAGCTTTGGCGTGGTGTGAACAAGGCCCAGCAATCCCAGATTGATGCAGAAACATTGTGAGCTCTAAAAGCAATGGTTATTCGTGGAAAGGGAAAGAAATTTAAATTATCTTTGACAACTTAAAAATGAAGTGTTAATAGGATATATTAAGGATTCTGGGCAAACAGTTTGTCCTATTCTGGTTTGTTTCTATCTTTTTTTTTTCTTTGATGTGATGCCTGTAATCTCATGAGAAAGATAAAGAGTATGGGTTTTGGTAGTGGGGAGGATCTAGGAGCAGTTGGGGGTAGGGGAAGTCATAATCGGAATATACTGTATGGAAAAAATCTACAATGAAAAAAAGTGTGACTAGAAATAGAGTAAGTACACTTTGTTTGGTTTTAAGAAAGAGTCTCATGTAGCCTAGCCTGGTCATGAACTCCTGATTCTAGAGCTAGGATCGCAGGTTGTATGCCAGTTAATACTACTACTATTAAGTAGTATTTCAGTGGTTAATTTTTTTTTCCTCCCCTTCTCTCTTCTTGCTTATGGTTTTATGGAATGGTCTCCCATCTCTTGCAAAGGGAAGTTTCTTGATGAGGAGTGAGAACTACACTTAACTGGGCATAAGTAAAAATATTTAGGATATAGTTAGGGGTTGATTATGCTGGTTTAGTAAATGATAGTTGTAGGTTCTCCACTAAGATCCCTGACTTCACTAGTCCTAGGTAGTTGACTAGATTTCCATTATTAACACAAGTTTTTTCTCTCTGAGTAGGGTCTTAAGTCCAGTTAGAGTTACTGGTTACCACCAAGGTATGCATTCCACTGCTGCACCATAAAGGTTATTGTGCCAGCTGTTATAGCTGGGTAGGAAGGGCTGTTGCTTCCTTCATTTGGCAGCTTGCATGGCACCTTCTGGAAACATGAAGCTAGTCAGTTCTAGTTTAGGTGTCTCTGGTCCCACTGTCTGAAGTTCATGGTATCATCAGCATTAGGAACTTATCTTCTACCACTTGGGATTGGGTAACCAAAGGCAATAGCAATAGTCTGCAATGTTTTAGGAGTCTCTTGGACAGTCCTGACCAACAACTGAAAGGTGGTATTCTCATGTTTAGTAATGGAGATTTTGTTAAATAGTTAGAGGGGAAATCAGAGGAATTTCAGAGAGTTGTTTCTGTTATGGGCCTCAGGGATAGAACTTACAGCTTATCAGGCTTCACGACAAGCATTTTATCTGCTGAGCTATTTTGCTAGCTCTTGGTTGTTTACATGTACTTGTTTTTATTTTATGTGTATGAATGTTAGGCTTACATGTATGTTCACCATGTGCTTGCTTGGTTTCCATGGAGGCCAGAACAGGATGTTGAGTCCCCTGGAACTCTGTGAGTTGTTAGCTACTGTGTGGGTGCTGGGACACAAAACTGCAAGAGCAGTAAGTACTCCGAGTTGCTAAGCCATCTCTAGATTCTCTATGGAGTTTTAATGAAGTAAAGTAACTCAGTGAGGTAGGGAATGGGAGTTGGAATATGTGGACTACCTTTTATGACAAGAAAGTAGGTCTAGGGGCTGGCTCAGTGGTTAAGAACACTTGTTGCTCCTGCACAAGACCTAGGTTTAGTTCCCAGCACCCACATGGTGGTGGTTCATAACACCAGGGGGTCAAATGCCTTCTTCTGACCTCAAAAGGCACCACCAAGTTGCATGTGGTACATAAGTATACATGCAAGCAAAACAAAGTAAAATGTATAAATCTAAAAATAAATAAAAGAATGTAGGTCTGAAATTGATTAAAGGCAAGTATATAAACACAATCGTTTGGAAATAAATACTGGGATAGGTTGGTGAATCTCTCTCTCTCTCTCAATATGTGTGTGTATGTGTATGAATATGAATGATGCTGGAGAGAAGGCTCAGGATTTAGGAGCACTGGCTGCTTTTCCATAGGACCTTGGTCCTATTCCCAGTTCCTACTTGGTGGCTCACAATTATCTGCAATTCCAAGGGAATCTAGTACCTTCTGGTCTCCCTGGGCACTACATGCAAGTCATATACATATACATATACATGCAGGCAAAACACTGAAACTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAGGAGACAGGGTTTCTGTGTGTAGGCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCGTACTCAGAAATCCTCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGCACCACTGCCCGGCTTGAAACATAAAATTTAAAAATACTTTAATTTTGATTATGTGCCTGTGTGTATATGAATGTAAATGCAGTGCCCAAAAGAGGTCTGAAGGTGTCAGATCTTCTACAGGTTGTTGTGAGTCAAAGCAATGTATGCTTCTAACTGATAAACCATCTCTCTAGCCTCCTTTGCCTATCTTTTCCTTTATTTTTTATTTTATTTTACTTTGTTTTTATTTTTTGAGGCAGGGTCTTTAGATGAGGTTACCTTTAAACACAGATCCTCCTGTGTCCTTCTTGAGTACTGGGATTAAAGGCATACACCACTGTGCCTGGCCATTTCTTACTATTTAATTAAAGAAATTTAATGTATGATAATTTTTTTAATTTCTAAAGCTAAGAAATAGAGTAGAAGTAACTTTTCTAAAATTATTTTTTAAAATGTGTTTTGCCTGTGTAAACATCCTTGTTTGTGTGCCTGGTGCCTATGAAAGCCAAAAAGGGATGGGTGTCAGAGCCCCCTGAGACTATTTGCAAATAGCAATGACCTGTTTTGTAGGTATTGAGAATCTAGCTCAGCTCTACTGGAAGGAATAGCAGCTATTGCTCTTAACAACCACTGAACCATCTCTCCGGTCCTAGAGGTAGCCTTGAATCTGCCTGTGTTATGCCTTCTGGTCTCTGTAGAACTTTGGTTTCTTTGATGTTAGATGTTGGTATATTCGTCAATTAAAAAGAAGACATCCAGGCTCAGATTTTATTTTATCTATCTCAAGAGGTAAGAGAATTACTTTCTCATAGGTTTGGTGCAGGATTGCATCTGAGTCCTGTTGTGACCTTGTGGATTTGACTATATCTGAGTCCACCAAAAGATGCCACCAGAGTGGTTCCCTCATTTGTTGTTAGGTAATATCCTTCCCATCACAGGAAGTAGAAGAAATTCTGGGAGAAAGAATATAGCCACCATGGCAGTTTTGTGCTGTTTAGAAGACCTCTGAATGGTGGCTCATGCCTATAATCCTAGCCCTTTTAAAGCCAACTTGAGCTACAGTGTGGAATCCTGTTTCAAAACATTAAAACCAAAACAAAAAAAATCCAAGAAGATGAGACTTGTTGGTGGGGTTGGTGTCAGGATAGATGAGGTGGGTTTTGTCTTGTTTGCTTTGTTTTGTCCCTTAGCTCTGATTCCTTCCTACCCCCACTATTGCAAGATCCTTTTGCCTTATAGATTGGTGAATCAAGGGCAAGGTGGCGGTGTGAAGTAGGATTAGATTTTCCTTCCTTTTTTCCCTTAGCTGCCGAGTGTTTCATCATGGACTAGAGTAGTGGCAAGGGTACTGGAAACGTGATTGTGGTGGAGGTGTCATGGCTGATTGCTGTTACCAGAGAAGAGGAGGGAAATTGGAGCGGCACAATAGAGGGATGAAAGTTCCTACTAGGGAGGTGAGTCCTATTTGGGGGGTGGTAGCTTTCAGCCCTTAGATTAAACTACCTTTAATCTAGTCTTTAAACAGACAGTTGTTACAAGTAGTTTACTGACTGTGTATTGTTTATCTATGCATTGTGTGTGATAGGTGTACGTGAGGATATGGTAAGCAAGCCCTACAGTTTTCTAAGAACACAGACTGTACGTATACAGGGTGCAGAGTAAAGACTCATTTTTTTATTGAAGAAAAATAATTGAAATTACAGATTACTTTGTTCATTTTTTTTGAGAAATGATACTATGCTAGGTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATCCGCCTGCTTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGCGCCACCACTGCCTGGCCTATGCTAGGTTCTTAAATGTATTTTCACAATCTGTTACTTTTAAAAAAAATTTTTTTTTGAGACTTTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCTTAGAGCTCACTCTGTAGACCAGGTTGGCCTCAAATTCAAGAGCTCCACCTGCCCCTGGCTCCTGAGTACTGGGATTAAAGGCGTGGGCCACTGCCATCAAGCTGATATCTTAGTCATCCCCAACTCTTCTCAGACCACCTCACCTCTAATTCCCCTACTCCCACTTTTGAACTATCCCACTAAGCCTAGATAGATTGTACTGGCTGTGTGCTCCAGAGTGTGAAGGCCGTATGACTTCTGTGTCTTGAAACTGTAGCCTCAGAAAGTACTTTAAATGCATTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTTCAACACAGGGTTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCTTGTAACTGCCTTGAACTCAGAGATCCACCTGCCTCTGCCTCCCCAGTGATAGGATTAAAGACATGTTACACAACTGCCCAGCTACATTTTAAAATGCTTGTTTGTGTGTGTGCAGGTACCTGTGTATCATAGCATGCATGTGGAGGTCAGAGGACAACTTGTTGCAGTTAGTTTTTTCTAGTTTGTGGGTTCTGAGGATCAAACTCATGTTGTCAAATTTGCAGCAAGATCCATTACTTGCTGAGGCATATTACTTACTGGTCCAGAGATTATTTAGATTAAGCTAGCTAGGCTCTAACAATTAATCATCTCCGAGATAAGTAGGGGAAAAAATTGGGAAGGTAGGATGGAGAAACTAGTCTTTTTTCTTTAATCTATATTATTTAAACTATTCAACCAATTACTAAGTTGTCAGGGCCTTATTTATTATAGGCTAGTAAACTAACTAATGAAGAAAGACTTTTTTTAGTCATTTGTTACCATTGGCTCTCAAAGAATTTCTTTTTCTATCTAATTATGTATCCCAGGAGCTGTCAAGATGGCTCAGCAGTTAAGAATGCAAATTGCTTTTGTAGAGTTTGGTTCACAGCACCCATATTGGGCAGTCCCTAGTTGCCTGTAATTCTGGTTATGCAGGGGGATCTGATACCTCTGACCTCCAAGGTCACCTGCACCAATGTGTGCATATCCCTATACAGTATATACATTTAATAAATAAAGATAACAATAAAAAACTTTTAAAAATCCTATTATATTTATTTGTTTTGTTTTGAGACAGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGGACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAAATCCGCCTGCCTCTGCCTCCCAAATGCTGGGATTAAAGGTGTACATTACAACTTTGGCTCTACATATACAATTTTATTGTTAAAAATGTAATATTTTATTAAATATGTTTTGGCACCCTTAATTGGTTTCTTTTTTTAAAAGAAACTGTTCATACTTACTTATACACACACATCCCATGCCATGCCATGCATGCTGAGGTCAGAGGACAGTTGGTAGCAGGACAAGCACAGGCTATTTCTTTTGTTAATAGACACTCTTAACCTACCATGCCATCTTGCTGTACCACATACTCATACTCATCGAGTATGATGTGTATCCATACCATCCTGCATATGGAGGTTAGACGACAACTTGTTAGGTTATATGGGTTTGAGGGGAGTATTTCCCAGATGAGCCATCTTGTGTCCATTTCTCCCCCAACTCTTCATTTTGAGACAGGGTCTCACTAGCTGACCTGAAACTCACTATGTAGCGTGAGCCTTGAACTCAGAAAGCTCTGCCTGCCTTTGCTTCTCAAGGGCTGTGCTTCTTAAAAGCTTTTCTAGGGATTTGGCTTTGGACAGGATGCAAAAAGTGAGGTCAAAGGGTAAAGGTAACTGTTACTAGGATGGGTTCTTGTTCCCAAACGCACATCATCAATTTCAGGAGAAGGGAGAAAAATGACAACGTTTAATGCTTGATCTAAGAATGTGTACTGTGTAATAGAAGTAATACAGTGGAGCATAAGACAAGAACATAACATAACCATCACATAAAAGACAGGGTATGTTGAAATAATAGCAAAGCATATAACTGTGTCTGAGGATGTTTGCCTCTTTGATTGTATGGTTTCCATTCCAGGATTAGAGAGCATTCTGCTGGCTTATTTTTCATAATTATACTATTCAGGTTTGGGTTATTGTAGTGGTTTTTAAGTTTTATTTATTTTATGTGTATGTGTACACTGTAGCTGTACAGATGGTTGTGAGCCTTCTTGTGGTTGTTGGGAGTTGAATTTAGGATCTGTACTTGCTCCAGTTGGCCCTGCTCCCTCCAGAAAAGGGCATCAGATTTCATTATGGGTGGTTGTGAGCTACCAAGTGGTTGCTGGGATTTGAACTCAGGACCTTTGGGAAAGCAGTCAGTGTTCTTACCTGCTGAGCCATTTCACCAGCCCTATTGTAGTGGTTTGAATAGATTTGGCCCCCATAGATTCATGTTTGGAATGCTTAGCCATACAGAGTGGCACTATTAGAAGGTGTGGCCTTATTGGAGGAAGTGAATCACTATGTAGGTGGGCTTTGAGGCACCACATTTGCCTGCATGCTATTGTACTTCCCACCATGATGATAATGGACTAAACCTCTGAAACTGTAAGCTAGCTCTATTTAAATGGTTGCCTTTATAAGAGTTGCCTTGGTCATTTCTTTACAGCAATGGAAATCCAAAGTGAAACAGAAAGTTGGTACCAGGAAGTGAGGTATTGTTGCCATAGGCCTGACCATGCAGCTGTTTTGTTTTTTTGTTTTTGGAGGAATGTGGGTTTTGGGACTTTTGAAAGAGTGGGATTCTTTAATTGGGATCTGATGCTTAATAGGCCTCACTAGTAGAAGCATGGAAGACAGTGGTGCTGAGGGTAATTGAACTGTGAGGGCCTAGCTCAAGAGGTTTTAGAGAAGAATTTTAACGTGTGCCCTAGAAATTGTTCTTAGGGTATTTTATTGAAGAATGTAGCTGCTGTTTGCCCTTGTCTGAAGAGTCGGCTTGAGGCTAAAGTGAAGAGATTTAGATTATTTGCATTGACAAAGGAAATCTCAAAACACCCTCCTTAGACTTTGTCCCTTGGTTTACTCTTTCAGAAGAGCCTTTTGATCAGGTTTAGCAAACTAAGGAAAAGTACAAACTGTGGTTCAAAGGTTAAAGGGGCACCAGGAAGTTTGATGGAGTTAAATCCTGTGTTCAAGGATGTTGAATAGAATTAAGGGATTGGCGGCTTTGAGGCAAGATCCCACCCAGCTAGCTTATTGTTTTAAGTGGTTTGCATTTGAATAAGGGATAGTTATTCTGTTAGGCCTTATTGTGACCTGGCTATTGTTTTTATTTGGACTGAGATCTGATTGTGTGTCACGCTGACAAGGGATAGTTTATGAGGGCAATTCTCGGTTGTTAACTTTATGTGGAGTGAACTATATATAGTCCAGAAATGTAGAGCACATGTGATCCAGACACAGGCTTTTTTGATCCGGATTTTGAGGCATAGTGGTCAAGTGTGGTGGTAGGAGTCTTTAATCCCAGCACTCAGGAGGAGGAGGCATGCAGATCTCTAAGTTCAAGGTCAATCTACAGAGCAAGTTTTAAGGCAGCCAAGCATAGGCAGTAAGGGATTTGGAAAACAGAAAGCTTCTGATAATGTAATAGAAGAAGGGGGCCTTCTTCAGCTCTAGTAAGCAGCAGAACTTGGTTGGCAGCTTAGGCCATGTATGTGGCTCTGGTTTTAGTCAATAGAAGGGACAAGACTACTGGGACAATTGATGCTGGTTAGCTAGAGCTAGGAAGTTCACGGTGATTAAGAAGAGACCAGCATCATTGAAGTGAAATCTGGGAAGTGTTTTCAGAGAGCACAAAGGAGCCTGTGTTCCATTAATAGCCAAGGTTGTAGCTCATGTTTCAGCTGGAATTGGTAGTGTGTAAGAGATACCCAGGTGGACTGATTTTGAAGTTATGAAGGGGTCATGGAGAGCAGCTGAGGTTAGGCACTGTGAGAGGCTAGGAGAGGCCATCGTTGAAGGTACAGCCTTAGTGACATTTGAAGACCCAGGACTGAAAGGACCATGCAAAAGAGTTGAGGCTTGGTATTGTGAAGAGAACCTATTGATGAAGCCTAGTTGCAACGGAAGACACTTGTGTATTGGAGATACCAGTACCATCACCATGATCACCAAGAACAGCAGCAGCTGTGGAGTGAAGTCAGCCATAGCCTACCTAGCATGCTACAAAGATCATGTATGAATCCCAGACATTGGAACAAGAAGCTGTGAAGTTGAAGTTACATTGGAGACCCCAAGATGTTCGAGATGCCAAAGCCATAGGATATCTGCTGAGAAAAACTGTTAACAGGAGTGGGACCAGCCCAGGAGAAAGTGTGTTGTAGTTAACAAAGCTGAAAGGAATTGGACATGCAGATGGAGATGCAGAGTTGAGAGTTTGCCCAGCAGGTTTTTGGTCTTGTTTTGATCCAGTATTTCCAAACTCTTGATATTTTTGAAATGGTAATGTATATCCATTCTTTTGAAATATGCTGTCTGCTTTTTGATTTTATAGGGAACTGCAGTAAAGAGATTGCATGAATCTCAGAAGAGATTTTGAACTTTGAACTTTTAAACATTGTTGTCACTTCAATAGACAGACTTGTGAAGTTGGACTAAATGCATTTTGCATTGTGTTATGGCTATAAGCCTATACGGGCCAGGGAGTGGAATTTAGTGGTTTGAATAGGTTTGGCCCCATAGATTCATGTTTTATTGAGTGGCACTATTGGGTGGTATGGCCTTGTTGGAGGAAGTGTGTCATGGTGTAGGTTGATTTGAGGCTTCCTGTGTATGCTCAAGTCTTCACCCAGTGCAGTAAGTAACTGAGACAGTTACTTACATAGGGATTCAAGATCCCCGAAGTCATCACTGGACTTAGTGTTTGCTTATTTATACAGGGTTAGACATATCCCAGGCTGGTCTTGAACTTTTCAAGCTATCTGTAGTTGAGGATGACCCTGAACTTCTGATCTTCCTATTTCCACCTCCCCAGTAGTGGGATTACAGGTGTGTACCTGTTTTTCTTTTGTTTATTTTTGTCTTGTGTTGGGGATGGAACCAAGGACCTTGTGTATGCTAGGCAAGCATTCAACCAACTGAGCTACATCCCTTGTCTTGTTGGTTTGAAGATTATCTTTCTGATTTTCAGTGATTCTGTTTACAGTTACTATACTCACAGGGTTTTGAGTTTGTTAGATACATAGATTAATATTTTTCACAATTTAGGGGAAAGGTATCAGTTCTTAATTCTTTTTAGGACAATTTTAAAATGTTTTTCTTTTATACCAAAATTCTGTTCCCATAAACATATTTAATCCTTCTCCTACCCCCAGATACTTCTATTTATTTGTCTATGAGCTTAACTCTATCTCAGATAACCAGAATTAAACAGTAGATGTCTGTTTTTTGTTTTTGTTGTTGTTTTTTGAGACAGGGTTTCTCTCTATAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATCCACCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCACACCCGGCTAGATGTCTGTTTTATTTGGATTGTTTTGCTTATGGTAATGTTTTCAAGGCTCCATGTTGTAGCATGGGCATGTTTCCCAGAGTTTGTTATTTTTAGACATTTCAAACAGGTTTCCTTTGTTCTTAGCTAAGTTACTGAGACTTTAATCCCCATTTTCACTTTCTGTTTTTTTACTAAACTTTTATGGTCTCTTATTTATATAGTTTTACATATTCTTGAATGTTAACCAGTAAAATGTCTAAAATTGGAACAATGAAGCCAAACACTTCTTTGTCCTTTAAGAAAGTTGATGTTGGGGCTGGAGACATGACTCAGCAGTTAAGAGAACTGGCAGCTCTTCTAGAGGACTCTGGTGGCTAAGAGATCCAACATCCTTTCTTGATCTCTTGTAACACCAGCCACACACATGCATTCAGACATGCATTCAGGCAAAATACCCATATACATAAACTTTTTAAAAAATTAATTGAAGGTATGCTATATTGTTCACAGTTTTTAATATGTAAGTTATAATGATTTTATAGTTTATTGTTTGGAATCATTTGCTTAAGAAGTAAAATCTTCCAGTTTTCACTTGATTGTAATTTTGTGGAATCTGAAGTTTTAATTTTAATTACATTCATTTTGTGTACTCATGTGTAGGTAGGGGACAACTTACAGGAGTCTATTCTGTTTTTTTGTGAGTACTGGGAATCAAATTCAGGTTGTCAGGCTCGTTGGCCTATACCTTTATCTGCTGAGCTTGTCACCTGATCAATTATCAACTTTAAAAAAAAAATTAAGTCTGTATATTTTGGTTGATTTATTCTCCCCTTTTTGCTTAGTGGTTCTCAGTGGAGGCTTTGTTACTTCCCTCCAGCGAATGTGAACAGTCATATCACCCAGAAGTCATGTGTCTTAATTACCTGTGGTCTAAGCTAAGAAGTTTAAATCTGTTTAAAGGCCAGGGTCCCAGATATAAAGCTTAAGTTGGTCTGGTACTTCTGAGTGGCCTCTGCTGGCCTGGAACTTCCCCTTGGGCTACCCTGCTTAGTGGTTCTTAGCTGTTATTTAGGAGGCAGTTACCCCGATACAGAAATGACTTCTTGAGTCCTGGCTTAGGGTATGCAGTGAGCAAGTATCATGAATTATTGTTCTTTTGTTTTAGTTACATCTACTTAGAAAGTACTTGTCATTTGAGTTATTTGTTGTTTTTTTCACAAATTAAGGATTTTATACCAAAAGTTTGGTTAACATGTGAGATTTATCTGGTATAAAATCTTATACGTCTTCTATTTGGTCTATTTCCTGAACAG
Seq C2 exon
AGACTCTACAGGAGCAGGTAATTCACTGGTCCACAAGCGGTCTCCTTTACGTCGAAACCAAAAGACCTCAGCATCCTTGAACAAGCTGTCTTTACAGGATGGACATAAAGCCAAAAAACCAGCATGTAAATTTGAAGAGGGTCAAGATGTCTTAGCTAGATGGTCAGATGGCTTGTTTTATCTTGGAACTATCAAAAAG
VastDB Features
Vast-tools module Information
Secondary ID
ENSMUSG00000029267:ENSMUST00000081567:1
Average complexity
IR
Mappability confidence:
NA
Protein Impact
ORF disruption upon sequence inclusion (1st CDS intron)
No structure available
Features
Disorder rate (Iupred):
C1=0.457 A=NA C2=0.165
Domain overlap (PFAM):
C1:
NO
A:
NA
C2:
PF150571=DUF4537=PU(31.7=28.4)
Main Inclusion Isoform:
NA
Other Inclusion Isoforms:
NA
Other Skipping Isoforms:
Associated events
Conservation
Fruitfly
(dm6)
No conservation detected
Primers PCR
Suggestions for RT-PCR validation
F:
No suggested primer sequences
R:
No suggested primer sequences
Band lengths:
Functional annotations
There are 0 annotated functions for this event
GENOMIC CONTEXT[edit]
INCLUSION PATTERN[edit]
SPECIAL DATASETS
- Ribosome-engaged transcriptomes of neuronal types
- Neural differentiation time course
- Muscular differentiation time course
- Spermatogenesis cell types
- Reprogramming of fibroblasts to iPSCs
- Hematopoietic precursors and cell types